3HJMA

Crystal structure of human glutathione transferase pi y108v mutant
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
208
structure length
208
Chain Sequence
b'PYTVVYFPVRGRCAALRMLLADQGQSWKEEVVTVETWQEGSLKASCLYGQLPKFQDGDLTLYQSNTILRHLGRTLGLYGKDQQEAALVDMVNDGVEDLRCKYISLIVTNYEAGKDDYVKALPGQLKPFETLLSQNQGGKTFIVGDQISFADYNLLDLLLIHEVLAPGCLDAFPLLSAYVGRLSARPKLKAFLASPEYVNLPINGNGKQ'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Influence of the H-site residue 108 on human glutathione transferase P1-1 ligand binding: structure-thermodynamic relationships and thermal stability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase P
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 82
structure length 208
sequence length 208
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2009-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3hjmA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3hjmA01
2IPAA 3AY8A 2P0GA 20GSA 1FAAA 1VF1A 1PGTA 6GSUA 2E7PA 2MZCA 5IMFA 2K8VA 2YWOA 5DBQA 4L5OA 1OC9A 5L71A 1HQOA 2HRKA 1OC9B 4ULXA 5KN3A 3LGCA 19GSA 2HRKB 1TDIA 5AGYA 2I81A 1MEKA 3ZIVA 1GSEA 2MMOA 3RHBA 2KP2A 5ABRA 2B6MA 2VL3A 4MCUA 1XOBA 2PGTA 2Z9SA 3IBHA 2FY6A 4BWQA 1O73A 2RIIA 2TRXA 3W8SA 1HD2A 2MBSA 2PVOC 3E3EA 3TKPA 4CHSA 5B6NA 2GT5A 4ECBA 4L8EA 2VD1A 3QR6A 4ML1A 5DQSA 1FW1A 4MF6A 1YZXA 1J9BA 4JBBA 13GSA 1NSWA 5ECHB 1JFUA 1USBA 1GUHA 4OFTA 3H93A 5EY6A 3IAS2 2FWFA 5IMDA 3Q18A 4EL1A 1PKZA 1WJKA 1U88A 5EL8A 1GTIA 1A0RP 2H6XA 4D73A 2YN1A 4NXIA 3F4RA 4D73B 2CVKA 1F6MC 4L0UA 1XPVA 2X99A 4JR6A 4XCSA 5LCZA 2R4VA 2B7JA 4Q5QA 1Z3EA 2IIYA 3LXZA 1DSBA 1U6TA 2AYTA 3M3MA 3HVSA 4IP6A 3RDWA 3UIWA 3EURA 3EYTA 3I69A 5IMCA 3DVXA 4BA7A 4BPYA 4IP1A 17GSA 3GA4A 1TXXA 3GH6A 2GGTA 2E2MA 3PGTA 5ID2A 3WT1A 3RPNA 2ES7A 2NDOA 2YP6A 5JCWA 1EZKA 2H1DA 5ID2B 1I9DA 3GFKA 1W89A 3F3QA 3LXTA 4HEA2 2LTKA 4LL4B 4K0GA 3HJPA 3TKSA 3FK8A 1R5PA 4K2DA 3HZ4A 2EC4A 5C00A 5D9TA 2LS5A 2QC7A 2L4QA 3F63A 1TRWA 3TDGA 2VUPA 1T4YA 1WIKA 2JACA 3PPUA 1A8YA 3HJOA 3DVWA 2HRFA 1SL2B 1TU7A 1MDJA 2DLXA 2XHFA 5JWOB 1QXHA 5F06A 2HRNA 2GVPA 4ECIA 2LV3A 2V32A 3C71A 4OCFA 1EP8A 4PTSA 1R5AA 1V57A 3P8WA 4XIHA 1CQHA 16GSA 4WEYA 5CO3A 2AJQB 1MD3A 1TOFA 3PINA 4HQZA 3UOMA 1PA3A 2OBKA 4I8BA 2QKEA 4DSSA 2CZ3A 2JADA 4K6XA 2L4CA 4IKHA 4DSSB 1TKDB 5ELGA 4IJIA 1PX6A 4HU7A 4IELA 4OO4A 4GSTA 6GSXA 1M99A 4WR4A 4IHUA 2CA8A 1GWCA 5HR3A 1GP1A 3D22A 4DSQA 4MDCA 3BJ5A 3ZTLA 2XPDA 3UARA 4EKZA 4EDYA 2O89A 3M9KA 4JEDA 1B9XC 4G10A 4FO5A 1UVZA 4ZL7A 2IJYA 2GZPA 3VWWA 3UEMA 1ACVA 2V41A 1ML6A 3L9UA 1ZYEA 5AN1A 3GX0A 1YF0A 4PQHA 1GLQA 2VCQA 5DCHA 1M9AA 3OR5A 2XBQA 1SK0A 3O76A 4NMUA 4OMVA 4KSOA 2IFQA 2N5AA 4WF5A 1GUKA 1OVNA 2IFQB 2J9HA 4MZWA 2B3SA 3M9JA 1TK5B 1PRXA 4ECJA 1TK0B 22GSA 2H1GA 2F3MA 3ZZXA 3VI7A 2HFDA 2R5GA 4ZL9A 14GSA 2QGVA 1ERUA 2C1YA 4AF2A 3ZVJD 5DALA 11GSA 3F4SA 2L5LA 4YQMA 1GL8A 2OA7A 5DALB 1FO5A 5GZZB 3L4NA 1ERWA 2K8SA 4TR3A 4EE0A 4KDYA 2OE0A 1M2AA 5D9WA 4GQCA 4O32A 1XVWA 4YAPA 1V98A 1FVJA 1U3AA 3WYWA 1OC8A 3TUEA 2I1UA 3L9VA 1M2BA 4MJCA 5DAKA 1R26A 2C3QA 1KBNA 3FW2A 2WGRA 3Q19A 2HSHA 2C0GA 3DWVA 4KCAA 4QL9A 4Q5RA 2GT6A 4EUYA 2O85A 3KZQA 2VCWA 4PGTA 4K7OA 1GTAA 2V6OA 5G5EA 3KM6A 1F3AA 3IC8A 3WD6A 2IWTA 3P2AA 3LG6A 3KTLA 1SD8A 2H6YA 2HSMA 1A0FA 3SWLA 5J3RA 3H8QA 2HSMB 1QFNA 1YKCA 1T4ZA 3QMXA 1O81A 1UN2A 4HQSA 4POMA 1W4VA 3NZNA 1SL1B 2I3YA 4MABA 4AGSA 4GRFA 4GSNA 5ELAA 1GSYA 4PQIA 4BVXA 4BL7A 3ZMLA 3EWLA 2GDRA 4BVXB 4F0CA 4BL7B 5A5KA 1SYRA 2L57A 4PUFC 1GSDA 2RLIA 1PMTA 5J9CA 2I4AA 4KDXA 3A5WA 3LQ7A 2FNOA 2DJ1A 5A4VA 3BCIA 2YANA 4RUVA 2CQ9A 3CSHA 3KMNA 10GSA 4WBRD 4BVYA 2OE1A 1V58A 2MYGA 1ZOFA 3GYKA 1XWGA 4POKA 4PQ1A 3F8UA 1OYJA 2GZYA 3O3TA 4KW6A 4Q5FA 2REMA 5ECMB 2LSTA 3N5OA 5H5QA 3ZFLA 1K0DA 1TI3A 3H1NA 1R7HA 3G7JA 5F0GA 3CRTA 4YQUA 4DEJA 1WOUA 5ECNB 4EVMA 3DGQA 5CYYA 2NVLA 3ZLPA 3ZIJA 5AIXA 2C80A 5D8IA 4J2FA 2HZEA 1X9SB 5CRHA 2LNTA 2HZEB 3DEXA 5CRWA 3C8EA 1AC1A 5IPGA 4MMMA 1M7TA 3ME7A 4G9HA 2AHEA 1KNGA 4IS0A 5HR1A 3IDVA 3KXOA 3L0HA 4K9ZA 4USSA 3FR6A 3VK9A 4XRDA 3KH9A 3FRCA 5IM9A 3ZMKA 4Z7XA 2C8UA 2R3XA 4JZQA 1C72A 1TRUA 2LNSA 4N11A 1Y6EA 4K7NA 1LJRA 4KNDA 1SJ6A 4O5RA 3TRQA 5E4WA 3HYPA 4OO5A 4NV5A 4KE3A 5H5RA 3C1SA 3TGZA 2A2SA 4TVEA 3TKSE 4J56E 3IC4A 1Z5YE 3A2VA 1JZWA 5COHA 1N2AA 2MMAA 2I9HA 3UBKA 1BX9A 2H01A 2HT9A 3D4TA 3IK9A 1AXDA 3HCZA 3RHCA 1JZOA 2CVBA 3HVVA 1XWKA 2NBSA 2C0DA 9GSSA 5DCGA 5HR2A 3L78A 5B7CA 1JZRA 4K7IA 3FR3A 5A4UA 1NW2A 2GQKA 2OADA 5CRGA 4EXJA 5ECIB 2OBIA 3TKRA 4GLTA 4ZBDA 3HHVA 5CNWA 4L5LA 4F03A 3MSZA 6GSWA 4G2EA 1NHOA 5H5SA 2F9SA 2GZZA 2R37A 2H0GA 1TI1A 4MZCA 4IQAA 3ZFBA 2JSZA 1HYUA 4O7HA 3SBCA 4KCEA 5A4WA 1UA5A 1MTCA 4RI6A 1T8EB 2B1KA 2L59A 1K0BA 4KX4A 3GV1A 3UMAA 3BCKA 2VL2A 3VWUA 3U5RE 5ECSA 1VGLA 2H1BA 3I43A 1XW6A 1K3LA 3HDCA 3G7YA 3P7XA 3FR9A 4MF7A 3DRNA 4MPFA 3I9V2 2X64A 1SK2A 3GSSA 1T00A 5CP1A 3KP8A 1BQ7A 3G7IA 2MBTA 3FYGA 4HS1A 3BD2A 4GSSA 1K0MA 4PUAA 1YF1A 2GQMA 5D93A 1TJDA 2VL2C 1ZYQB 5ECKB 4L0WA 1VF2A 2M46A 2YV7A 2OE3A 1FG4A 2LKUA 2CV4A 4ZXGA 4J57E 3KJYA 2M72A 4FQUA 4KSMA 2X8CA 1B4PA 3E0UA 2EIOA 3UVHA 2RUFA 2PBJA 2KUCA 2HRAA 2YOIA 1GSSA 2K18A 3GKMA 4LLRA 2BJXA 1Y25A 4HJMA 1EV9A 2UZ8A 5C04A 2B7KA 2VCVA 5ECRB 18GSA 2DC5A 3FZ5A 3LYKA 3GKNA 2TRCP 4NV2A 4TRXA 2MMZA 2JU5A 1PKWA 2LJRA 4PXOA 4OFMA 1SU9A 1OKTA 2P5RA 4KA0A 2OKAA 2YNXA 3GNJA 4JE1A 2YWIA 2FCHA 12GSA 3TJKA 1XFLA 5JCUA 4KUNA 2VLUA 2H30A 2VIMA 5HR0A 5FWGA 2H19A 1ZZYA 1MDKA 3TKSC 3ZL5A 1BYEA 5D9XA 4YQVA 1SJIA 1A2JA 2H1AA 3VFIA 3A3TA 2GSQA 1G7OA 1PSQA 2PPTA 2GS3A 2DIZA 1YDKA 1TU8A 5J41A 2VD0A 1Z9HA 2F8FA 1YY7A 4I2UA 1N8JA 2G0FA 2OJLA 3APQA 4N0VA 4MLYA 4V1Ap 5GAPD 4V2LA 2IN3A 1T7PB 3BBYA 3FY7A 4HU9A 1XOAA 4ZBBA 1SK1A 1UC7A 1E6BA 1VRSD 5INYA 2K9FA 3IA1A 3EU4A 4WR5A 1XVQA 4ZB8A 3IAM2 1K0OA 2WFCA 2V1MA 1B9YC 1EP7A 3GMFA 2B5EA 5EVOA 3GUSA 2F51A 1SYXA 4MZBA 4I6XA 3IRAA 4PX1A 4OCEA 2C3TA 4I97A 3MDKA 2YCDA 3CXGA 1GULA 1EEJA 4ISDA 4GXZA 2B1LA 2LQQA 4WF4A 1THXA 3E9JB 4FYBA 3ZYWA 4LL1B 1YEXA 5KN0A 2RM5A 1IYIA 3ED3A 1XWCA 3LFLA 1THOA 5J4UA 5E59A 1RQMA 4KAEA 1RK4A 3HD5A 4HDEA 1S3DA 3ZREA 3UVTA 4FYCA 4X1UA 3ERFA 3NOFA 5G1LA 4YH2A 4G19A 4GTUA 1S3CA 2XBIA 1X5DA 1GTBA 1V40A 3Q74A 4XHMA 3F9UA 2FA4A 1F3BA 1IYHA 4ACSA 3GH9A 2C4JA 2IMEA 2B5XA 4FH8A 5CRDA 3LSZA 3IK7A 3MAKA 4I5QA 2XC2A 1AIUA 1XCCA 2G2QA 2ZNMA 4NHWA 5JWRB 5F05A 5DAKB 3RAZA 2H75A 2EIQA 2ON7A 1X0RA 4NPBA 2CAIA 2IMDA 3KP9A 4ML6A 4KB3A 4NHZA 1AQWA 5J5NA 3KH7A 3HA9A 4XTSA 2D2ZA 2GSTA 4E8HA 5KN1A 6GSVA 3D21A 5KN2A 4K8MA 5IMZA 1OKDA 4IW9A 1SD9A 3M8NA 2V6KA 2YJ7A 3NIVA 1X9MB 3GL5A 3VWVA 4PNFA 5JCGA 2FWEA 4TR1A 3CRUA 2DJJA 4ZILA 4POLA 3I6AA 2LQOA 4TR1B 3EINA 1Q4JA 5CREA 2GLRA 2R6KA 2JL4A 2WZ9A 4EDZA 4KGIA 4X43A 3LYPA 2DMLA 3LWAA 2C3NA 4V2NA 3IOSA 1JHBA 3U6VA 3W8JA 3TRPA 2K6VA 4HUAA 3C73A 4G0LA 1ON4A 8GSSA 1H75A 1WP0A 3KD0A 2GTUA 3EMXA 2FWHA 2FGXA 4MPGA 3LJRA 3CSJA 1O8XA 3ZRDA 4AJ8A 4BVYB 4XS4A 1M2DA 2IL3A 2A4VA 3F0IA 1EOHA 4XS6A 3L9SA 2L6DA 2HE3A 2JZSA 3GRXA 1U3IA 3KGKA 1Z6NA 3QCPA 3PH9A 1X5CA 4ILFA 1AW9A 6GSYA 5JWQB 2WRTA 3H4KA 4MJBA 3DXBA 3UJ1A 1XIYA 3K8NA 1GSUA 1A2LA 1EGRA 3HJMA 1QQ2A 1FOVA 1QGVA 3Q6OA 2L5OA 1ZGNA 3R2QA 3FKFA 1FHEA 2ALBA 4X0XA 4RI7A 1A23A 4IVFA 3VWXA 2CT6A 3FZ9A 4CW9A 1V9WA 4XRAA 1EEMA 1PL1A 1XBSA 1GSQA 2CAQA 3QAGA 1Q98A 3IE3A 2DMMA 4V2MA 3ISOA 3F3RA 4TN8A 1M9BA 1GH2A 1J0FA 1AAZA 1GUMA 1K3OA 3APSA 5FHIA 4GCIA 3DYRA 3KIJA 3F6DA 4G0IA 4WETA 2X8HA 1QUWA 5G5FA 1TK8B 2CX3A 3HY2A 2E0QA 1B48A 4NAXA 2YJHA 2DSAA 5IIZA 2RUEA 1FVKA 2IMFA 1QMVA 5G30A 1YQ1A 2H8LA 3A2XA 5ECLB 1YKAA 4E8EA 5G2ZA 1XW9A 4EF0A 3APOA 1O85A 2WCIA 5BMUA 1BEDA 3DMLA 3WT2A 4DSRA 1NHYA 3FHKA 3ME8A 1OAZA 3WGEA 1HNCA 3VI5A 1GLPA 4ZBAA 3IV4A 2WULA 3S9FA 2FWGA 2DBCA 1AQXA 4TR4A 3VURA 2H70A 3CSIA 4LMWA 3C1RA 1HNAA 2YWMA 1TRVA 5GSTA 3TKQA 1X5EA 2VOCA 2F8AA 1SKRB 4K1FA 5DJLA 2H72A 4V1Ag 4PURA 1LBKA 3TB2A 4MA9A 1V2AA 3CBUA 4MJAA 4TXVA 4YAVA 4ECCA 4I2TA 2OACA 3QPMA 5KEJA 1M0UA 3GKXA 2IMKA 1O7UA 4GQFA 1DE2A 1QK8A 3GL3A 2C0EA 1I5GA 4TKYA 4MH3A 3WGXA 2DJ2A 3O6TA 2VCZA 4ZIJA 2VAFA 4GWRA 3G9BA 2YZHA 4MJEA 2IMIA 5D73A 5HFKA 3TJGA 5AIVA 2HZFA 4EO3A 3TJFA 3J7Yk 3MWHA 4TXOA 2PVQA 2H73A 1WMJA 2H71A 3ERGA 2LJKA 2FUG2 3LEFA 1Z7RA 3QFBC 2BMXA 4QL7A 4TXOB 2XPEA 4F9ZA 1XXUA 2JZTA 2DIYA 1KEBA 3EMPA 5B8BA 3GURA 2HYXA 2A2RA 2DJKA 5B6MA 2VM1A 1FB0A 2BTOT 2GSRA 3UBLA 3VLNA 1E2YA 2CVDA 2P5QA 1GSFA 2O87A 1RW1A 1PX7A 3FZ4A 1A8LA 2QSIA 3UL3A 4IBPA 3W6GA 4ZB9A 3DKSA 4LA1A 2FA8A 3IHQA 4HOJA 2NTOA 4BWSA 2YWNA 1KTEA 1MDIA 3V1WA 2LEGA 5IO0A 1WPIA 2WJUA 2PUKC 2FLSA 2H74A 2HSNB 3D0ZA 2LRTA 3EVIA 2H0IA 1XWAA 1JZDA 1Z7PA 5LNKe 5AISA 1FB6A 2R2JA 2EIRA 4OWYA 4WXTA 3TCOA 2DJ3A 2H6ZA 2AAWA 2PU9C 1S3AA 3HXSA 1ST9A 3HVXA 2H76A 2LRCA 1HNBA 1ZCPA 1DE1A 1A2MA 2N5BA 1JLWA 5DQYA 2VO4A 6GSTA 1SENA 3GN3A 3DD3A 2AUVA 1WWJA 3ZITA 1NM3A 1BJXA 1URMA 3VPQA 1EWXA 2KP1A 3EU3A 5DDLA 2VCXA 2C0FA 5G1KA 2ZUPA 3KEBA 4H86A 5ECPB 1EV4A 2WB9A 3TOTA 4MH2A 4HZ2A 1ABAA 3KTBA 1YEPA 3FZAA 2JZRA 4JU5A 4N10A 2HSYA 1OC3A 2YZUA 5IMVA 3PR8A 5IPHA 4G0KA 1CQGA 1O8WA 1EOGA 1AQVA 2VLTA 1AUCA 4TR0A 1PN9A 2FHEA 2VL9A 4FIWA 4POBA 4Q5NA 2O7KA 5EPFA 2L6CA 3GTUA 4IGJA 3QAWA 2FD3A 2O8VB 3GTUB 4HI7A 1TW9A 5DVBA 2CZ2A 6GSSA 2GQLA 2RM6A 3IR4A 2VM2A 5ENUA 3CMIA 4N0ZA 5F8BA 2V2GA 3QD9A 4QQ7A 3FEUA 1G6WA 2MMNA 3HKRA 5FT3A 4K0NA 5D9VA 2NPBA 3QFAC 5IOXA 4PNGA 4O92A 1F2EA 2DJ0A 1GNWA 1PQNA 1ERTA 2N5FA 7GSSA 1SKWB 5ECOB 1U87A 5DJMA 3EE2A 5B8AA 4JRRA 4RQRA 1J08A 2HI7A 2B5YA 4OFNA 3GKKA 2H66A 2ZCTA 4AJ6A 4MF5A 1DBYA 3TRXA 1VF4A 3MNGA 1X9WB 1JLVA 2VCTA 3US3A 2E2GA 4TOPA 5G31A 4OD7A 5HFIA 4JR4A 1H4OA 4MP4A 4LMVA 5IOWA 2X8GA 4DVCA 3ZVJA 4MK3A 4N30A 4TW5A 2P31A 4GF0A 1LU4A 3P90A 2WS2A 1GRXA 3BOAA 3N9JA 4F0BA 4CDOA 1GNEA 1PD21 3D5JA 2CX4A 3QAVA 2KLXA 5GSSA 1WE0A 3M1GA 3VPTA 4KDUA 2KHPA 4F82A 1G7EA 3CTGA 1TRSA 4HJ2A 1WRYA 2AV4A 3GSTA 4ZB6A 1Z6MA 3KCMA 2HQTA 5F07A 3IPZA 1MD4A 1B8XA 2LRNA 1PL2A 3M0FA 2TIRA 3ERWA 4P3YB 1K3YA 1YJ6A 3JCML 1TP9A 1R4WA 1ZL9A 1EGOA 4EC0A 1XW5A 1GTUA 1G6YA 2YPMA 4IJ3A 2GSSA 1TTZA 1ILOA 1K0CA 4XS4B 3F6FA 2HNLA 1OE8A 3D6IA 5CAXA 4RQXA 1ZMAA 5HQPA 3TJBA 4FYUA 2PWJA 3WGDA 3F4TA 5D96A 3R3EA 3A2WA 4NWYA 3TJJA 4HZ4A 1VF3A 3QDNA 3EC3A 2H0HA 5LD0A 2M80A 4WKWA 3IXRA 5ECQB 5GAND 2LUSA 1F37A 1SJZA 4IN0A 4WBJA 1T1VA 5IO2A 3CYNA 1B4QA 1SKSB 1T3BA 4ZL8A 1O6JA 1K0NA 3RPPA 2PERA 2AB6A 3TOUA 1OE7A 3LORA 3RBTA 2HLSA 3GX8A 1BG5A 1BAYA 1DUGA 5IMAA 3H79A 1G0TA 4KF9A 5J9BA 3GIXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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