3LQ7A

Crystal structure of glutathione s-transferase from agrobacterium tumefaciens str. c58
Total Genus 68
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
68
sequence length
213
structure length
202
Chain Sequence
PNPTITVFERSPDGGRGLARDMPVRWALEEVGQPYHVRRLSFQPFGQIPSYEQGDLILFESGAIVMHIAQHHSGLLPEDQLRRARTVAWMFAALNTIEPSILNFTTVWLFERNEPWHEARLARTKEQLLKRLDELSAWLGDREWLEGSFSAADILMICVLRRLESSGILKDYGNLLAYVERGKARPAFKRAFDAQLAVFTAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Glutathione S-transferase
publication title Crystal Structure of Glutathione S-Transferase from Agrobacterium Tumefaciens
rcsb
source organism Agrobacterium tumefaciens
total genus 68
structure length 202
sequence length 213
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-02-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3lq7A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3lq7A01
2VAFA 2GQMA 1LJRA 2VL3A 3Q6OA 5AGYA 9GSSA 2H8LA 1TU8A 2OBKA 5G5EA 5HFGA 4KCAA 1XBSA 1WWJA 2KHPA 1S3DA 1VF3A 2WDUA 1PMTA 4PXOA 4QQ7A 1USBA 1O8XA 3IXRA 3RPNA 5JCUA 4XS4A 1XFLA 4GSTA 20GSA 1SJ6A 3U5RE 2VUPA 2FUG2 2LUSA 4KSOA 3HXSA 4MK3A 2DJ0A 2IIYA 5A5KA 2DJKA 2RM5A 2XPDA 4TR0A 1YQ1A 2HZEB 2LJRA 2IL3A 1AQXA 1AQWA 3F3RA 3GIXA 2GGTA 3BBYA 4OCEA 3KH7A 4J2FA 5IMZA 1RQMA 1SL2B 2C1YA 3CRUA 3KH9A 2VCXA 5D9XA 2P5QA 2KLXA 2VCVA 1V98A 1J0FA 4WEYA 6GSUA 1EP7A 5J9BA 5IMCA 4K0GA 3DGQA 1J9BA 2X8HA 3C1RA 3UVTA 1U3IA 5AIVA 2QKEA 4L8EA 4Q5RA 3VFIA 5IMFA 1OC3A 2VCWA 2VD1A 1GTIA 3GL3A 2UZ8A 3QPMA 5ELGA 3KP8A 2CAQA 3GSSA 2CT6A 3DVXA 1EWXA 1PL2A 5ELAA 4I8BA 1A0FA 3EWLA 1EV4A 3GTUB 3TKSE 5J5NA 2GSTA 4MJCA 5L71A 1O7UA 3TJGA 3G7JA 1SK1A 4DVCA 4FO5A 2QC7A 4L0WA 4EUYA 3HZ8A 3CXGA 3LXZA 4KDXA 5IO0A 1XWKA 4HU9A 3UJ1A 1W4VA 1BX9A 1MEKA 3F63A 3FY7A 3LXTA 2MZCA 4NHZA 4MDCA 1SK0A 2L5LA 2IMFA 2PBJA 4PGTA 2PN8A 3F9UA 2ZUPA 2A2RA 2R6KA 1LBKA 3HVSA 1G7EA 1XW9A 3QDNA 2YV9A 1T4YA 3VI5A 2AV4A 4FYBA 5LNKe 1V57A 3M8NA 1UC7A 2WS2A 3KMOA 4JBBA 4GWRA 4JRRA 5HR2A 3M0FA 2I81A 1HYUA 1OAZA 1CQHA 3TKPA 1GLPA 5HR0A 2VCTA 3CTGA 2PMTA 1PA3A 5LD0A 3D4MA 3FZ9A 1M99A 3HVXA 1XIYA 3CRTA 2LV3A 4MLYA 2HSYA 3FRCA 5LCZA 2N5BA 1GUHA 1XXUA 2TIRA 1B9XC 2JL4A 2JSYA 4DSQA 3RBTA 1EEMA 1Y25A 2E2GA 2WGRA 1SD9A 2CA8A 3OR5A 1PD21 4GSSA 5D8IA 5DBQA 2H72A 1QMVA 3A3TA 4LMWA 3F0IA 3GTUA 3TKRA 4BVYA 4EE0A 1F9MA 3LGCA 4GXZA 3TB2A 3L0HA 4IJ3A 4HS1A 4F9ZA 2VL9A 1A2LA 4OFMA 5B8AA 4I2TA 1GWCA 4TR3A 4ILFA 1V2AA 3FHKA 1B8XA 1ML6A 2O89A 5E59A 2I1UA 3ZIJA 4YQMA 3GH9A 2M80A 4MF5A 1GTUA 4WETA 4BL7B 5JWRB 3EMPA 3O6TA 5IOXA 5IMDA 3QAGA 5B6MA 1XZOA 4ML1A 1PL1A 3FZAA 3D21A 1WPIA 5IPGA 2RUEA 3VI7A 5HQPA 3W6GA 3ZVJA 4OFTA 2C80A 2BTOT 5KN3A 3JCML 2MMOA 3P2AA 2QGVA 3EU4A 2XHFA 3IHQA 3M9JA 1SKWB 4Q5NA 5A4UA 2V6KA 3A2WA 5J9CA 3ME8A 3TUEA 2K9FA 2H66A 1QUWA 5IPHA 2KUCA 3E3EA 2AAWA 4KSMA 4IQAA 3RHBA 2BMXA 1ZYEA 4YH2A 2H74A 4HJMA 3GMFA 3WGEA 3Q74A 2K18A 2OE1A 1TXXA 1GNEA 5EY6A 3E0UA 1ERWA 2CVDA 3TDGA 2DC5A 2GQKA 2H1GA 1MD3A 2YJHA 2PUKC 5GSTA 4BWSA 2DJ3A 3F6FA 5ECQB 1N8JA 2LNSA 1JZDA 8GSSA 2F9SA 1SYXA 3DD3A 1XVWA 2CZ2A 1GUMA 4IVFA 1T1VA 2FCHA 3KTLA 3P7XA 3V1WA 2OE3A 4K7NA 1XOBA 2VLVA 2ES7A 1VF1A 1I5GA 2YZUA 3L9VA 4E8HA 4P3YB 1O81A 2GSQA 1T3BA 4K8MA 4V2NA 3TCOA 4WXTA 2V1MA 5COHA 2DIZA 1S3CA 1Z9HA 3ZL5A 1YEXA 4X0XA 2HSMB 4AF2A 4JE1A 5G1LA 2OBIA 1NHYA 4F0CA 1O8WA 2YZHA 4N0ZA 3NZNA 1G6YA 5HR3A 5KEJA 1M9BA 3R2QA 4BL7A 1Z3EA 3D6IA 1B9YC 1R5PA 1A0RP 2IPAA 3ZFLA 1OE7A 3WGDA 4N10A 3U6VA 5AIXA 3MDKA 3PGTA 3PPUA 1XPVA 5IQYA 1PX6A 4DSRA 2VO4A 2HE3A 2V41A 1F37A 5GAND 4PUAA 1FAAA 4MPFA 3Q18A 4GCIA 2L6CA 4I5QA 2IMIA 3TJFA 1RK4A 1J08A 1YZXA 1GSUA 4IP1A 3UOMA 4RQXA 5ECOB 2C3TA 5DVBA 2VOCA 1T4ZA 4V2LA 1KNGA 2LJKA 3H79A 2B7KA 3FR6A 4WBRD 2B5XA 3MNGA 1EZKA 4F0BA 2H6ZA 2EIOA 3HA9A 5G31A 3P8WA 2AYTA 4IGJA 3ZTLA 4NV2A 4BA7A 3RHCA 3GURA 2YWMA 4HDEA 4L0UA 1ON4A 1QFNA 1Y6EA 3D4TA 4ZBDA 1HNAA 3TRQA 4V2MA 4TXVA 4G2EA 2M72A 4ZL9A 4TN8A 2X99A 2B3SA 2GSSA 2HSMA 1DBYA 5HR1A 3RDWA 1M2BA 1TTZA 1GUKA 5CYYA 4IW9A 4GLTA 5H5RA 4KF9A 4HEA2 4CW9A 5EVOA 2JADA 2GS3A 1SJIA 1F3BA 3C8EA 4OO4A 4LLRA 4X43A 4HZ2A 2G0FA 4POBA 1R26A 4KH7A 4GQCA 4YQUA 2WCIA 3TKQA 2PVOC 1GSEA 1GLQA 3WT2A 2B1LA 3HD5A 2RIIA 2XBIA 4K1FA 2C4JA 3RPPA 1MDIA 1X5CA 1SKSB 2OA7A 1FB6A 2P0GA 1ERVA 5DQSA 2V6OA 1YY7A 4HOJA 3DRNA 1VF4A 3APOA 4LMVA 4I6XA 3VK9A 4ECJA 1GL8A 3D5JA 3A5WA 2LRCA 2F8AA 3I69A 2D2ZA 6GSYA 1A23A 4GF0A 1TRVA 2OE0A 2B1KA 2R3XA 3DYRA 5ECNB 4FYUA 2R37A 3G9BA 3LFLA 5INYA 4KCEA 1U6TA 1SL0B 4BVXB 4PNGA 1NW2A 2LNTA 2MMAA 3DKSA 5FWGA 2VL2A 1KBNA 3ZLPA 3IAS2 1AC1A 3F4RA 1TOFA 4MCUA 2J23A 1XWBA 4E8EA 2GSRA 2E0QA 2CZ3A 2GT6A 2YN1A 1NSWA 2H6YA 1SL1B 2EC4A 3CTFA 3LEFA 4KA0A 1HQOA 2GDRA 4XCSA 5ID2B 2MMNA 2HQTA 5ECRB 2C3QA 4O32A 2DMMA 1C72A 2HSNB 4RQRA 2NPBA 3A2VA 4BPYA 3H1NA 4MZBA 2LSTA 2L4QA 1K0CA 1A2MA 4XS1A 4DEJA 4RI7A 3EE2A 1VGLA 13GSA 5IMAA 1SENA 4ZL8A 3LSZA 4LL1B 3BJ5A 3ZVJD 4O7HA 3EC3A 2XPEA 4X1UA 4KW6A 2H0IA 5IO2A 1THOA 2VD0A 1WRYA 1JFUA 1HD2A 4HJ2A 4J57E 2TRCP 3KZQA 4KE3A 1FW1A 7GSSA 19GSA 2H19A 4MH2A 4GSNA 4OD7A 2GQLA 3N5OA 1M2DA 1MTCA 1ZL9A 4HI7A 1X0RA 2HZFA 3ED3A 2VCZA 5DJLA 3HYPA 2JZSA 1ZOFA 4N30A 1Q98A 1AQVA 1YJ6A 2HZEA 1WOUA 4MZWA 1UA5A 1B48A 2AB6A 1QQ2A 4BVXA 4PQHA 3LYPA 4KAEA 3EURA 1N2AA 4HQZA 3QCPA 2OJLA 4KGIA 1TU7A 2O8VB 4O92A 2EIQA 3KM6A 2JSZA 2HFDA 2H1AA 2WB9A 3R3EA 2WFCA 2IMDA 1OKDA 5F8BA 5FT3A 1AW9A 3GH6A 5CRDA 2P31A 2FWHA 3VWVA 5ID2A 4Q5FA 2E2MA 2O7KA 4GTUA 3ZZXA 2B6MA 1X9SB 1V40A 3VWUA 1ZMAA 2VLUA 5AISA 4IHUA 1OYJA 1V58A 2ON7A 1IYIA 1JLVA 3FZ4A 3SWLA 4KX4A 2N5FA 1SKRB 1PGTA 2X8GA 3HY2A 3UBKA 2GTUA 3QAWA 3M1GA 3J7Yk 5ECMB 4WR4A 3CBUA 4NWYA 4EF0A 1Q4JA 4XS6A 1A24A 3Q19A 1TK8B 3GX8A 5CAXA 2C3NA 4TR1B 4OMVA 5DJMA 2IMEA 3LYKA 1HNBA 3QFAC 2G2QA 2YOIA 4QL7A 5A4VA 5D9WA 2DJ1A 1A8LA 4I97A 2LKUA 2F3MA 2VL2C 3IA1A 3FR9A 4EO3A 2PU9C 3GN3A 4FIWA 3ZYWA 4I2UA 1BJXA 1DE1A 4BWQA 3IC4A 2AHEA 1ZCPA 2K8VA 1FHEA 3GL5A 4JZQA 1TI3A 5H5QA 3KEBA 2WRTA 5CP1A 1TRSA 1R4WA 3DWVA 3AY8A 4KDYA 5ECLB 1SYRA 4ZXGA 2C0EA 3I43A 2HT9A 16GSA 2KOKA 2REMA 1M2AA 5HFIA 6GSXA 1EGRA 4XTSA 4WBJA 1Z6MA 4N11A 4DSSB 1TJDA 2DIYA 5ECHB 3K8NA 4PNFA 2CV4A 2KP2A 2MBTA 5C00A 1Z7RA 3NOFA 3PH9A 4H86A 2BJXA 3N9JA 3UMAA 4NHWA 2DSAA 1GP1A 4ECCA 1ST9A 3KIJA 1O6JA 1XWCA 4D73B 1GNWA 2A2SA 2X8CA 14GSA 3FYGA 2MMZA 3BD2A 1EOHA 4XIHA 4EKZA 1K0MA 1XOAA 4AJ7A 2L59A 1U87A 4PURA 1X5DA 1KTEA 4TR1A 1K0NA 1RW1A 4ML6A 2YP6A 4WR5A 6GSVA 1PSQA 2GZPA 4G10A 2HRAA 2HSHA 2H01A 2IN3A 1ILOA 4KDUA 2L57A 2HRKB 4IELA 3TOTA 3WD6A 3UL3A 3EYTA 4OCFA 6GSWA 4G0IA 3TOUA 4EC0A 3GV1A 2H70A 2B5YA 3GKNA 5J3RA 4TR4A 4MPGA 4MZCA 5H5SA 2JU5A 2YJ7A 3VPQA 1WJKA 2YWIA 1FVJA 5F07A 1F2EA 12GSA 1FOVA 4EVMA 4ZBAA 1BG5A 5IOWA 4K9ZA 3RAZA 3ERWA 1GSFA 1KEBA 5DQYA 3EU3A 4FQUA 1E2YA 3IBHA 4G0KA 2NVLA 4WKWA 1ERTA 4Z7XA 5G30A 4TXOB 2RUFA 2O85A 3F4TA 4DSSA 4MF6A 2R2JA 3L9SA 2YV7A 2HLSA 1G6WA 4IQ1A 2LEGA 2HRFA 5AN1A 1GULA 4JEDA 4RI6A 4AJ6A 1ABAA 5D9TA 5IMVA 1FO5A 5A4WA 3CYNA 2K6VA 10GSA 2LS5A 4ZIJA 1F6MC 3O3TA 2FY6A 1URMA 1I9DA 4POLA 4PQ1A 3UEMA 3HHVA 3HJOA 4K0NA 4ID0A 3W8JA 3GNJA 4K2DA 4IS0A 5ECIB 3VWXA 3H8QA 5D93A 1PKWA 4GQFA 3KD0A 2KP1A 3M9KA 2HRKA 2Z9SA 4CHSA 3ERFA 1B4PA 2FWGA 5CREA 4G19A 5DCGA 1DE2A 2CX3A 2DJ2A 3IOSA 1F3AA 2HNLA 3ZREA 3GUSA 6GSTA 1JZRA 3VPTA 5DCHA 2XC2A 4MJBA 1HNCA 3MAKA 4MP4A 3F8UA 5KN1A 2QSIA 3CMIA 1ZYQB 3UAPA 3IE3A 3VWWA 1FB0A 4JR4A 2PERA 5CNWA 2C0GA 2H0GA 5B7CA 1YF1A 4HUAA 4PX1A 1QGVA 4POKA 1DSBA 3C71A 4TXOA 3J7Yb 3GX0A 3HVVA 3KXOA 2V2GA 1FG4A 3HJPA 3G7IA 4YAVA 1SD8A 2HI7A 4N0VA 2HRNA 2TRXA 4YQVA 3HKRA 1X9MB 1QK8A 1R5AA 4JR6A 3DEXA 4ZB8A 4ZB9A 5F06A 1BEDA 5ECPB 1GSSA 18GSA 2VIMA 2J9HA 5JWQB 1MDKA 2FNOA 5EL8A 2FA8A 3TJJA 6GSSA 3ME7A 2V32A 1GTBA 3C1SA 5ECSA 1WMJA 5ENUA 3EMXA 3UBLA 1EP8A 4V1Ag 2L4CA 4NPBA 1ERUA 1XW6A 1K3YA 2PWJA 5F0GA 1Z5YE 4ACSA 4L5LA 1R7HA 5GZZB 4MJAA 1CQGA 3QR6A 1K0BA 3L4NA 22GSA 3ZMLA 2H1BA 2L5OA 2LQQA 4OFNA 5G2ZA 2YNXA 3LQ7A 2C0DA 3KMNA 1A2JA 4IJIA 5D9VA 5HFKA 1TI1A 2FLSA 3WT1A 1K3LA 4G0LA 1XWAA 2H73A 1GH2A 4NAXA 1GSDA 2PPTA 4EXJA 2WZ9A 2OACA 1UVZA 4IKHA 2ON5A 2F8FA 3I6AA 4HQSA 3S9FA 5C04A 1XWGA 3TRXA 4BVYB 2YWOA 1PRXA 1WP0A 2FHEA 4KB3A 3IR4A 2LJAA 1M9AA 5JWOB 1SK2A 3IDVA 4ZB6A 5ECKB 1XCCA 1SJZA 1XVQA 2LQOA 3KCMA 1OE8A 2DMLA 3LWAA 3C7MA 3BCKA 4TVEA 4NXIA 4J56E 2VM2A 4F82A 2GVPA 4XRDA 4Q5QA 2XBQA 2FA4A 1TK5B 4G9HA 4TRXA 3ERGA 1LU4A 3ZFBA 2ALBA 2X64A 5J41A 1AAZA 3KGKA 2WJUA 2EIRA 4F2IA 3UVHA 5J4UA 3GYKA 1JZOA 2LTKA 3DVWA 1AIUA 4HZ4A 1MD4A 2VCQA 2YWNA 3PINA 1EGOA 2DJJA 4K6XA 2GZZA 4KNDA 4POMA 2CVBA 2H0HA 1TDIA 3QD9A 4MA9A 3LJRA 3L9UA 3DMLA 1YKCA 2YPMA 3EINA 2RM6A 5DALB 3MWHA 3ZIVA 4OO5A 1EEJA 2IWTA 1BAYA 4F03A 3IV4A 5GAPD 3KP9A 11GSA 3GKKA 2IFQB 3HCZA 3IC8A 1ACVA 1TRWA 4FH8A 4XHMA 2O87A 5ABRA 1K0OA 4OWYA 1YDKA 4JU5A 3FZ5A 1TW9A 1B4QA 1GSYA 4PQIA 3KJYA 2YCDA 1GSQA 3TKSA 1UN2A 1WIKA 2B7JA 1NM3A 2RLIA 2NBSA 2FD3A 1VF2A 1Z7PA 3FKFA 3F3QA 1K3OA 1BYEA 1TKDB 4AGSA 1W89A 4MMMA 2OADA 2CVKA 2ZNMA 4LL4B 4USSA 3W8SA 1DUGA 5DDLA 2IJYA 1QXHA 1YEPA 3IPZA 4EDZA 3FR3A 2AJQB 3FEUA 1XW5A 2N5AA 3ZRDA 2A4VA 3MSZA 1YF0A 2FWFA 3VURA 3GSTA 3TGZA 3US3A 3IRAA 3PR8A 4XRAA 1X9WB 5F05A 1TK0B 2F51A 5JCWA 5E4WA 2AUVA 1TP9A 3L78A 3CSIA 3D0ZA 4TOPA 4ECBA 2NTOA 2IMKA 1T7PB 4WF4A 4MF7A 3LG6A 4ECIA 1JLWA 3UARA 3HDCA 1BQ7A 2LRNA 4ISDA 2VM1A 1X5EA 1U88A 2H76A 4PTSA 4ZBBA 2LRTA 5DALA 3ISOA 3FK8A 5FHIA 3DXBA 3LORA 2B5EA 3H4KA 5KN2A 1G0TA 2NDOA 3IK7A 3M3MA 4K7IA 5GSSA 3ZITA 3IK9A 4KUNA 5BMUA 1H4OA 2WULA 1E6BA 2IFQA 2E7PA 1OKTA 4ULXA 5JCGA 4O5RA 1V9WA 1OVNA 2CX4A 2HXKA 1AXDA 3QAVA 3EVIA 1SU9A 5B6NA 4AJ8A 3UIWA 4ZILA 2P5RA 3WGXA 4GRFA 3TJKA 2K8SA 3HZ4A 3H93A 4WF5A 1PX7A 3CSHA 3GHAA 4RUVA 4LA1A 1K0DA 2MBSA 4PUFC 2JZRA 17GSA 1T00A 2CAIA 3BOAA 4K7OA 4TKYA 5KN0A 3GKMA 4IN0A 3BCIA 3TRPA 3GA4A 2GLRA 5CRGA 5DAKB 3F4SA 2PVQA 5EPFA 1OC9B 1NHOA 2H30A 2YANA 1TRUA 2DLXA 4MJEA 3IAM2 4NV5A 1JHBA 1GRXA 1MDJA 1O73A 4QL9A 2HYXA 2GT5A 2I4AA 5B8BA 5IM9A 4NMUA 4HU7A 3QOUA 1M7TA 1VRSD 3CSJA 3HJMA 3NIVA 2MYGA 2DBCA 1EV9A 2M46A 3P90A 2L6DA 2I9HA 1GTAA 5CRHA 1H75A 2FWEA 1WE0A 3FW2A 2JACA 3SBCA 1FVKA 3F6DA 2FGXA 1OC8A 3GRXA 3QMXA 3QFBC 1U3AA 4YAPA 5IIZA 3DIEA 1AUCA 4MH3A 2PGTA 3TKSC 2H6XA 4IBPA 5G1KA 2GZYA 4XS4B 1K0AA 1O85A 2I3YA 1JZWA 1PQNA 3WYWA 3APQA 5CRWA 4D73A 1PKZA 2H1DA 5CO3A 3E9JB 1A8YA 1T8EB 2ZCTA 1M0UA 4FYCA 3KTBA 4TW5A 5G5FA 2H75A 3I9V2 1PN9A 2VLTA 5D96A 3GKXA 2JZTA 3O76A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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