2FNOA

Crystal structure of a glutathione s-transferase (atu5508) from agrobacterium tumefaciens str. c58 at 2.00 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
239
structure length
239
Chain Sequence
HHHMEDGMNTFDLYYWPVPFRGQLIRGILAHCGCSWDEHDVDAIEGLMDCGAEKQPVAFMGPPVLIDRERNFAISQMPAIAIYLGERLDILPATVEGRTLSAKIVNDANDVLDELTLNGGREMWTPEKWQEFVPRLQKWIRIFADTGARNGLSAASGFMLGTEKIGVADIVTAILWTTVADRFPAIKGIIEDTSPIIWGLSRRVVATAPLAALNSKSFEEYGNAYCGGEIEKSLRKVAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Agrobacterium tumefaciens
publication title Comparative structural analysis of a novel glutathioneS-transferase (ATU5508) from Agrobacterium tumefaciens at 2.0 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords AGR_pAT_752p
total genus 82
structure length 239
sequence length 239
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-01-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 2fnoA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2fnoA01
4NV5A 2V6KA 5LD0A 3FZAA 3ERFA 1UVZA 4POKA 2HE3A 2OE0A 2MMNA 6GSYA 2IJYA 1EZKA 2LSTA 4IP6A 2R4VA 2HZFA 4X43A 2H0GA 4E8HA 4MLYA 3RPNA 2H8LA 1AQXA 2FHEA 3KM6A 4IKHA 2LJRA 1B9YC 14GSA 1O6JA 4JRRA 1YZXA 3GH6A 2GVPA 2P5RA 3TRXA 1I9DA 3N9JA 4TOPA 1X9MB 3VK9A 2YWOA 4KX4A 4HEA2 3GX0A 5G1KA 4J56E 1K3YA 3ZFBA 2M80A 1OVNA 4ZL7A 2H75A 1SL1B 3R2QA 3GYKA 3QDNA 3O3TA 2F51A 3FW2A 4NMUA 2VL9A 3RHCA 3D22A 1ML6A 2QGVA 1PL1A 2JZRA 4KA0A 2IL3A 2H6YA 3RDWA 2NBSA 2EIOA 3WGDA 3KXOA 1T4YA 2HRAA 2FA8A 1THOA 3HYPA 2L4CA 1ZYEA 2K9FA 3AY8A 1U3AA 4IJIA 2FY6A 2O85A 2YPMA 3D6IA 4L0WA 5ABRA 3G9BA 4GSTA 4EKZA 2IPAA 4WBRD 3WT2A 4ZB8A 4MF7A 1ERWA 2EIRA 4K8MA 3UVTA 16GSA 5KN3A 2GTUA 4O92A 2C0DA 4YQMA 1O85A 1S3AA 1HYUA 2DIYA 5ECKB 5CRWA 2A2RA 3TCOA 3APQA 1MDIA 4KCAA 4HI7A 2V6OA 3ZMKA 1GTUA 2B6MA 2K18A 3TJJA 5ECMB 3UJ1A 3F0IA 4OFMA 4G0KA 2ZUPA 1J9BA 1SJZA 3BD2A 1ABAA 1IYIA 1JZWA 1NSWA 2ON7A 4JBBA 4FYBA 4GRFA 4MCUA 4HDEA 2WGRA 4TXOA 4LL1B 1U3IA 4BVXA 5F8BA 4KGIA 3DXBA 3QCPA 3C1SA 3HXSA 4N0VA 1VRSD 4MJAA 2CV4A 11GSA 3HY2A 5F0GA 3BCKA 3P8WA 1WE0A 4TVEA 1ACVA 1EEMA 1PX7A 3UVHA 2IMIA 2DJKA 1F3AA 4PURA 4J2FA 4ZB9A 4ZL9A 1LU4A 4OD7A 1K0AA 1OKDA 3KTLA 4ULXA 1K0BA 2H30A 2VL2C 3TKRA 1NHOA 1QQ2A 2WFCA 2I3YA 2HXKA 3MSZA 4WEYA 5D9WA 1PSQA 3W6GA 3MWHA 2GSTA 1XWKA 18GSA 5A5KA 3TOTA 4WETA 3P7XA 4KE3A 3CSJA 1FAAA 2GZYA 5IMAA 4XRDA 1XBSA 5ECSA 4G19A 2OA7A 3D0ZA 1XCCA 2YP6A 5CRGA 2L59A 1FB6A 2JADA 4ZL8A 2IFQA 3HJPA 2ON5A 3IC4A 4NAXA 5GSSA 5ECLB 2KUCA 4Q5NA 3UBLA 4HZ4A 4WR4A 1A8YA 5HQPA 3CSHA 6GSWA 3ZITA 1SKRB 4DSQA 5DQYA 3LYPA 2IWTA 3S9FA 1QK8A 2GT6A 3V1WA 4NV2A 2JL4A 2HYXA 4J57E 9GSSA 1GP1A 1U88A 2AJQB 3DEXA 2DJ0A 2HZEA 2O7KA 1YF0A 5IM9A 3GKKA 2E7PA 1MD4A 4PQIA 1KEBA 1QGVA 5F07A 2P31A 2P0GA 4BPYA 2MBTA 4XS1A 2H6XA 3BBYA 1TW9A 2O89A 2PGTA 3A2WA 4I8BA 5IPHA 4K7IA 2M72A 2LJKA 4EXJA 1GUMA 4F0BA 4BA7A 2N5BA 4TR1B 4N30A 2AAWA 3MAKA 4IS0A 3W8JA 1VF2A 4JU5A 3H4KA 2VD0A 5G31A 2VCZA 4IN0A 4XS4A 2DBCA 4MH3A 5GZZB 5CYYA 1TI1A 1THXA 2BJXA 4F82A 4WR5A 4JE1A 5ECPB 4YQVA 1TU8A 3RPPA 5DVBA 4OWYA 4ZBAA 3EMXA 3GTUA 2H1DA 3M9JA 3I6AA 2RM5A 4PXOA 5JCGA 5G5EA 4CHSA 19GSA 2DIZA 3DRNA 2CA8A 2GZPA 4V2MA 4D73A 2JSYA 4IW9A 4EUYA 4IELA 4IBPA 3LEFA 4OFNA 1XOAA 1JLWA 3TKSC 1XOBA 3VWXA 1A8LA 2VLUA 3DVXA 1DUGA 4MZCA 3EYTA 5JCWA 3RHBA 3RBTA 6GSVA 1GULA 4RI6A 2CVDA 1ZL9A 2LV3A 1XXUA 1OC8A 5FT3A 4K2DA 1EOHA 3DIEA 4P3YB 3WGEA 3U6VA 3IV4A 1G7OA 3FZ4A 1RW1A 3F6FA 5C04A 2FGXA 2LJAA 3LG6A 1H75A 1M9BA 2YOIA 3L78A 4LMVA 5B8AA 1XZOA 1C72A 1BQ7A 4MPGA 1YKAA 2CZ2A 2F8FA 3F4SA 3HZ4A 4FQUA 3QD9A 2C0EA 3ISOA 5A4UA 4EE0A 1KTEA 3TUEA 2C3NA 2R2JA 5EVOA 5IQYA 1X5EA 2GS3A 5G30A 1T1VA 1WOUA 2L6CA 4EL1A 5DQSA 1FOVA 4WKWA 1ZMAA 3F4RA 3Q18A 2QSIA 1Z9HA 3H8QA 1A2JA 4GSNA 4OO4A 4I2UA 2OKAA 5IMZA 4L5LA 4GLTA 2HSMA 2DJJA 4MZWA 1Q98A 1UC7A 1F9MA 4OCFA 2DJ3A 1WJKA 2YZHA 5D9TA 2X8GA 3C1RA 4I2TA 8GSSA 2IMEA 5ECIB 5ELGA 3LYKA 3QAVA 3PPUA 5H5SA 4RI7A 5JWOB 1SYRA 2LQOA 4G10A 2HNLA 4BWSA 3KP8A 4LLRA 1F6MC 3ERWA 4KUNA 2LNSA 22GSA 4ZBDA 5HFGA 3M9KA 5KEJA 7GSSA 2F3MA 2LTKA 4IHUA 1G7EA 2GSQA 2WB9A 3IXRA 4RQRA 3ZREA 1Z6MA 3LXZA 3SWLA 3QFBC 5J9CA 3BOAA 4AGSA 3GHAA 2OE1A 1V98A 2PU9C 4LL4B 1J08A 2V1MA 6GSTA 4BWQA 4PQHA 1A0FA 1ZYQB 2O87A 2CX3A 5AISA 5AIXA 3IRAA 1VF1A 1OC9B 5GAND 3F6DA 3TDGA 3G7JA 5DAKA 2PBJA 3TKPA 3FKFA 2DJ2A 3D4MA 5BMUA 3TRPA 2VM2A 4ACSA 1J0FA 1V9WA 1YEXA 2LEGA 2J23A 2OBKA 1UA5A 4QL9A 4DSSB 2C3QA 1XWCA 3ZVJA 4HS1A 1YF1A 3CSIA 4K1FA 2N5AA 1HD2A 1MDKA 4ZXGA 2J9HA 4GXZA 3LQ7A 2KHPA 3FEUA 4GWRA 4ISDA 2MMZA 1ERUA 2F8AA 3UARA 3WD6A 2H1AA 3DD3A 1SJIA 1PA3A 1A2MA 4BVYB 3U5RE 1O8XA 2CVKA 4O32A 4TRXA 2AUVA 2DMLA 3TRQA 1K0NA 2RLIA 13GSA 4EDZA 3EWLA 3QAWA 3UBKA 5IMDA 4CDOA 1SL0B 3QR6A 10GSA 1OYJA 2RIIA 4IVFA 3LWAA 2WS2A 2YWIA 5IMCA 2CQ9A 2FUG2 3N5OA 1O73A 5B6MA 1W4VA 3L9SA 5A4WA 3J7Yk 3GURA 2G0FA 2I81A 3HHVA 1SKWB 2IIYA 1S3CA 4PUAA 5JWRB 2B1LA 3CMIA 4GF0A 1X9SB 2YV9A 4Q5FA 3H93A 3UEMA 1GH2A 2LKUA 2PUKC 3PH9A 4WF5A 3M8NA 3CTGA 2XHFA 2C4JA 4KF9A 1WIKA 2FWEA 3HVSA 5HR3A 5IMFA 5CRHA 4G0IA 2PVOC 3FY7A 5H5QA 4E8EA 2IMDA 2H74A 1PGTA 3GSSA 3UOMA 3GNJA 1A2LA 2Z9SA 3D4TA 1TI3A 2GQKA 4Q5QA 6GSXA 5DCHA 4EVMA 2WJUA 3HJOA 2H0IA 5D9XA 2V2GA 1A24A 3KMNA 4BL7B 3F3QA 1TRWA 1FW1A 3NIVA 2L6DA 3JCML 3WT1A 3CBUA 3FK8A 4FH8A 4ZBBA 5KN1A 2YWNA 1B4QA 2HSYA 2O8VB 5B6NA 3Q19A 4O5RA 1HNAA 3FR3A 1CQHA 2P5QA 2VL3A 3TOUA 2HRKA 3MNGA 1XFLA 2LS5A 5DALA 3IR4A 4ECIA 1DSBA 3M3MA 4USSA 1EWXA 1GSFA 1HNCA 1O81A 5IIZA 2GSRA 5D8IA 4HUAA 1PRXA 5FHIA 3ME7A 1XW9A 1AXDA 1O8WA 4RQXA 4PGTA 2PPTA 3EC3A 3KP9A 1PD21 3IA1A 3TGZA 4F9ZA 1YDKA 3VWUA 1TOFA 1MTCA 1X0RA 2K8SA 2C0FA 1A23A 5ECOB 1TK8B 3E9JB 2FWHA 2VD1A 2D2ZA 4OO5A 1I5GA 4HOJA 4CW9A 3TKSA 3EU4A 2DSAA 1K0DA 1W89A 4F03A 1TK0B 3L4NA 1AQWA 5D96A 2I9HA 3BCIA 1SYXA 2REMA 2HLSA 1Y6EA 2F9SA 3KH7A 2DC5A 4KH7A 4FYCA 4AF2A 4GCIA 5J5NA 3DKSA 5JWQB 1K0MA 1GTAA 3LJRA 4KCEA 2OACA 5IOXA 2X8HA 4NHWA 2VCVA 2CAIA 3OR5A 2H1BA 1SK0A 4JR6A 1Z5YE 3VWVA 3GKNA 3IE3A 4MF6A 4MA9A 1F3BA 4TR4A 4MMMA 1FVKA 3GRXA 2GQMA 2H73A 3LXTA 3EINA 1ZGNA 3GN3A 4IP1A 5INYA 17GSA 2B5EA 3QPMA 3Q74A 2NPBA 1OKTA 3EVIA 2OBIA 3KCMA 4OCEA 4FYUA 2CZ3A 1B4PA 3TJBA 4PNGA 1BYEA 3C7MA 2WULA 2FWFA 1FVJA 1EV9A 3ZIJA 1MD3A 12GSA 2DJ1A 2HQTA 3C71A 4KDXA 2N5FA 1OC3A 1TTZA 4XCSA 1K0CA 4EDYA 2E0QA 3E0UA 2M46A 3GKMA 1E2YA 4HU9A 1Z7PA 4JEDA 1FO5A 4IQAA 4XS6A 4TKYA 1MEKA 1PKZA 3VPTA 2UZ8A 1OE8A 3WYWA 5DJMA 3KZQA 2ZNMA 2OADA 2NDOA 4K0GA 1ZCPA 1T8EB 2C1YA 1YY7A 1XW5A 4MPFA 4PNFA 3NZNA 2A2SA 3P90A 1AAZA 2C3TA 4L5OA 2IMFA 2X8CA 3ZTLA 3GUSA 3FR9A 3ZMLA 1XIYA 1GL8A 4DEJA 3UL3A 2I1UA 1G6WA 1X9WB 4NHZA 1TRVA 1BAYA 3GX8A 5D73A 2YANA 2HRNA 2HI7A 1PL2A 2LRCA 2R5GA 1XWGA 4MJEA 5CREA 4N0ZA 1BJXA 3LGCA 4HJMA 3A2VA 3ZZXA 2MYGA 1URMA 5J9BA 2YV7A 1AIUA 4LA1A 1LBKA 3VPQA 4POMA 5CO3A 4K9ZA 2AHEA 1TU7A 2GT5A 2HSHA 3TKQA 2TRXA 4TR3A 2VAFA 1KBNA 4X1UA 3GL3A 2B5XA 1V58A 5G5FA 4TXOB 4BVXB 2C0GA 3L9VA 2RUFA 3KIJA 1PMTA 1U87A 2H0HA 4MZBA 4PUFC 4WBJA 1AUCA 4HQZA 3QFAC 2CX4A 5CRDA 4O7HA 2L4QA 3VWWA 1BEDA 4K6XA 3J7Yb 4V2LA 5HR1A 3IOSA 1VF3A 4F0CA 5EY6A 1XVQA 4TN8A 1M2DA 4KDYA 2FWGA 4N11A 4NXIA 3RAZA 4KSOA 4L8EA 5B8BA 2H72A 3UMAA 20GSA 1VGLA 1F2EA 2TRCP 1CQGA 3GH9A 2K8VA 4MJBA 1QXHA 4IGJA 1WRYA 5DBQA 1EP8A 3IK7A 2H76A 5LCZA 1JFUA 1KNGA 4KDUA 2WRTA 2KOKA 1SKSB 2IFQB 4V2NA 1EOGA 1SL2B 1GNWA 3FZ5A 1WPIA 1V40A 2XC2A 3IC8A 1AC1A 1GLQA 1B48A 3VI7A 2JU5A 2B7JA 2FLSA 3DGQA 4MABA 4MDCA 3FR6A 2JACA 1V2AA 2HZEB 4LMWA 4FIWA 5ECNB 2KLXA 3ZFLA 3E3EA 2C80A 5CP1A 5H5RA 4EF0A 4KAEA 2LUSA 1HNBA 1ST9A 1M2BA 3EURA 1FB0A 1WWJA 2VCXA 4MF5A 2JSZA 2IMKA 3IHQA 2LNTA 1FHEA 2ALBA 4MK3A 4TR1A 1N8JA 1WMJA 1ON4A 5HFIA 3O76A 1RQMA 3HD5A 2AYTA 3GKXA 1HQOA 4GQFA 4IJ3A 2H1GA 1GSUA 2HT9A 2KP1A 4K0NA 2PWJA 5ID2A 1JZOA 3ZVJD 1DE1A 2YNXA 2XPDA 3P2AA 2GZZA 1VF4A 1U6TA 4L0UA 3HDCA 4XS4B 4DVCA 4X0XA 4ILFA 1NW2A 4ZILA 4POLA 4AJ6A 2CVBA 3KJYA 1QUWA 1SENA 3ED3A 4KSMA 2YJ7A 4I97A 3GTUB 2MMOA 1NHYA 1USBA 3NOFA 1F37A 2VL2A 4AJ8A 3A5WA 3EU3A 4D73B 1PKWA 2XPEA 4NWYA 1GTIA 3L9UA 1O7UA 2AB6A 2JZSA 3DVWA 3HVXA 4WF4A 4FO5A 3ZL5A 1GLPA 3GMFA 3ERGA 2VUPA 5EL8A 3TJFA 4PX1A 3KEBA 1BX9A 1TRSA 4OMVA 5LNKe 3M1GA 3TJKA 4G2EA 4MJCA 5HR0A 1JLVA 2ZCTA 3IAS2 2NTOA 4EO3A 4JR4A 4AJ7A 2DLXA 1TRUA 1ILOA 2GSSA 4K7NA 3LSZA 1UN2A 4F2IA 2HRFA 3QMXA 1XVWA 3APSA 2H70A 1ZOFA 3ZLPA 1T7PB 5CAXA 1XWAA 4ML1A 1Y25A 2MZCA 4GSSA 1YQ1A 2H19A 3HCZA 3H79A 3HJMA 1QFNA 5ECRB 5IO2A 3HA9A 3FRCA 1GSYA 3DWVA 1FG4A 5D93A 1K0OA 3LFLA 5B7CA 2QKEA 6GSSA 4YAPA 5EPFA 3CRTA 1Z6NA 5A4VA 1R26A 3L0HA 2YJHA 4RUVA 3BJ5A 2RUEA 2HFDA 2C8UA 1IYHA 3Q6OA 1XPVA 1R5PA 3D21A 4KW6A 3CTFA 1T00A 1K3LA 2X64A 1EEJA 2H71A 2GGTA 1GRXA 1JHBA 4TW5A 2OE3A 4GQCA 1S3DA 2AV4A 4I6XA 2B5YA 2YWMA 5ECHB 5ECQB 2VOCA 2VCQA 3R3EA 2X99A 3IPZA 1YEPA 2HSMB 5F05A 2ES7A 3WGXA 1AQVA 4HZ2A 5HR2A 3EMPA 1X5DA 4K7OA 2V41A 3ZYWA 2A4VA 3FHKA 3GL5A 2VLTA 1M7TA 4ZIJA 3C73A 3F3RA 5E59A 5C00A 1E6BA 3F8UA 4POBA 4TXVA 2PVQA 3MDKA 2TIRA 1XWBA 2KP2A 2CAQA 4ID0A 4WXTA 3HZ8A 2H66A 2GLRA 3CRUA 4KNDA 2LRTA 3PR8A 3GSTA 5L71A 1PX6A 5J4UA 5HFKA 1AW9A 1OC9A 3HKRA 4JZQA 4I5QA 1TKDB 3ZIVA 1H4OA 3CXGA 5G2ZA 2L5OA 1GWCA 1R4WA 5AGYA 5ENUA 3TKSE 1M2AA 5DAKB 3ZRDA 3H1NA 4DSSA 1GUHA 5JCUA 2V32A 1GSDA 3IBHA 4H86A 5COHA 3IDVA 2FCHA 1OE7A 2B1KA 5IPGA 4PTSA 5IOWA 4V1Ap 3UIWA 1GSEA 2VLVA 2E2MA 1K3OA 2VO4A 2GQLA 2WZ9A 1TK5B 1LJRA 1OAZA 3KTBA 1Z3EA 4XHMA 2PN8A 1NM3A 3K8NA 4XRAA 3W8SA 2VM1A 2R6KA 3M0FA 1GTBA 2FD3A 3APOA 2CT6A 3GV1A 2B7KA 3QAGA 4BVYA 2XBIA 5ID2B 1N2AA 3GA4A 1GUKA 2EIQA 1SD8A 5GAPD 2H6ZA 4QL7A 1TP9A 4Z7XA 5J3RA 3QOUA 2L5LA 5F06A 5CNWA 3LORA 2GDRA 2IN3A 3SBCA 1QMVA 3FZ9A 4GTUA 1ERTA 1GNEA 4V1Ag 3ME8A 5DCGA 1PN9A 3CYNA 3HVVA 4Q5RA 3EE2A 2LQQA 5G1LA 3VLNA 4ML6A 1JZRA 3D5JA 6GSUA 1G6YA 4NPBA 1R5AA 2XBQA 3G7IA 1EV4A 1M9AA 4HU7A 2E2GA 4ECCA 2YZUA 1M99A 1EGOA 4XIHA 1DE2A 3UAPA 5D9VA 3PINA 2VCTA 3A2XA 3IK9A 1V57A 3I9V2 5IMVA 3TJGA 1RK4A 2I4AA 4ZB6A 1SJ6A 2QC7A 3F4TA 4BL7A 1BG5A 3IAM2 2H01A 2BTOT 1WP0A 3GFKA 2DMMA 2OJLA 1GSSA 3O6TA 2YN1A 4EC0A 1ZZYA 1B9XC 5KN2A 5DDLA 1M0UA 2PERA 4YQUA 3PGTA 4ECBA 1DBYA 2L57A 1XW6A 5ELAA 2HSNB 3US3A 1TXXA 1G0TA 3F63A 4N10A 3VI5A 2FNOA 1GSQA 2MMAA 4XTSA 2HRKB 3DMLA 3KD0A 1R7HA 1Q4JA 1A0RP 4TR0A 2VIMA 2RM6A 2FA4A 4KB3A 1YKCA 2LRNA 2WDUA 5DALB 2JZTA 3KMOA 2EC4A 3F9UA 1TDIA 2WCIA 2MBSA 3VURA 3KH9A 5E4WA 3I69A 1SU9A 1SK2A 2B3SA 3C8EA 3FYGA 1MDJA 1SD9A 1ERVA 1Z7RA 4G0LA 3G7YA 1T3BA 2YCDA 2NVLA 5DJLA 2VCWA 4OFTA 5GSTA 3A3TA 1X5CA 3VFIA 3DYRA 4DSRA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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