5G5FA

Crystallographic structure of the tau class glutathione s-transferase migstu in complex with reduced glutathione.
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
KSDVKLLGAWPSPYVMRARITLNVKSVDYELLEETLGSKSDLLLKSNPVHKKIPVLIHNDKPICESLIIVHYIDEFWSSGPSILPSDPYDRAIARFWAAYLDEKWYPSLKGIASAQGEEAKKAAVDQVGESLALIEDTYVKLSKGKPFFGGEKIGYLDIAFGCFLGWLRVTEKTSGVKFLNEAKTPHLAKWAVRFCADPAVKDVMPETEKLAEFAKLLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords TAU CLASS GLUTATHIONE S-TRANSFERASE
publication title Insights Into Ligand Binding to a Glutathione S-Transferase from Mango: Structure, Thermodynamics and Kinetics
pubmed doi rcsb
source organism Mangifera indica
molecule tags Transferase
total genus 71
structure length 219
sequence length 219
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2016-05-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 5g5fA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5g5fA01
4JZQA 5ECQB 3TJBA 1FW1A 2EIOA 4OWYA 2RM6A 5CNWA 2ES7A 3EMXA 4CW9A 1GSSA 2VIMA 4BVYB 1VF2A 3KMNA 3KZQA 3KGKA 3PGTA 4XTSA 2O7KA 3W6GA 5D9XA 1K0CA 3CYNA 2I4AA 3IR4A 2LKUA 2HQTA 1GUHA 1DUGA 3TCOA 1A2LA 2IIYA 12GSA 1S3CA 1T4YA 3D0ZA 4PQHA 1DE1A 3S9FA 3RAZA 4MZBA 1U3IA 5D9WA 5J41A 3VFIA 4K7IA 2YWOA 1GULA 2H6XA 1ABAA 2L59A 5HFKA 1K0AA 4G0IA 2HNLA 2VM1A 2H0IA 1R5PA 3NIVA 1M9BA 4OO5A 1X9SB 3FK8A 1S3DA 4L8EA 4G2EA 4BVYA 4MDCA 2AAWA 2R4VA 4RUVA 3QFBC 5CREA 1MDKA 3IDVA 1T7PB 1AUCA 2VUPA 3F8UA 4L5LA 2GZZA 2ALBA 4LMVA 5ID2B 2RM5A 4TXOB 3HA9A 4MA9A 2CT6A 1HNBA 4POMA 4WF4A 4MZCA 1FVJA 4EDZA 2E0QA 2LUSA 4ZILA 6GSXA 3DKSA 3VWWA 2X8CA 2V41A 3GTUB 3FHKA 2F3MA 2R6KA 1J08A 1THOA 3WGEA 1ZOFA 1X5EA 3L0HA 2UZ8A 2FGXA 1UA5A 1FO5A 4XS1A 1K3YA 3L9SA 2L57A 4OMVA 1ACVA 2DJ3A 3TJFA 1SD8A 3F6FA 3FW2A 5AISA 2KHPA 3ERGA 3KTBA 2XBQA 1SKSB 2ZUPA 9GSSA 5CP1A 5ID2A 5C00A 4TXOA 3LG6A 4DSSB 5HFGA 1JZOA 3CTFA 2JU5A 4GRFA 4POBA 3L4NA 1KTEA 3GTUA 3V1WA 5B6NA 3DYRA 4KCAA 4GCIA 3TRPA 5ECHB 2HXKA 2OA7A 1N2AA 2PVQA 5D8IA 5G1LA 2JACA 14GSA 4XS4B 3HJMA 1HQOA 3IAS2 1SJZA 3UL3A 4YH2A 5IPGA 3UAPA 1O8XA 3HD5A 2N5FA 3ZIJA 3BCIA 4KDYA 2RIIA 1K0NA 3IC4A 2MMZA 1TRWA 4OFNA 1EV9A 3QFAC 2HE3A 2VLVA 2GQMA 5B8BA 4DSSA 2GSTA 1ZL9A 3D5JA 2A4VA 2DMMA 1Z6MA 4MLYA 3GV1A 5KN2A 2EIQA 4IGJA 2MMOA 4F2IA 2V2GA 3DVXA 5JWOB 1ZZYA 3O6TA 4PGTA 1USBA 3UARA 3DRNA 3LXTA 4KCEA 2M80A 1DE2A 1TDIA 5ECIB 3F3QA 2XHFA 1WJKA 4LL1B 1A8YA 5AN1A 3TDGA 3F4SA 2PUKC 4Q5RA 4XS4A 1YJ6A 4WBRD 3QAVA 2JZRA 3KMOA 4RQXA 3U6VA 3ZMLA 4ZB8A 1X0RA 4EE0A 3LWAA 2NBSA 1AQXA 4GXZA 2LTKA 5J9CA 4JR4A 2H1BA 1GSQA 4LMWA 2VL9A 4OFTA 4I5QA 1IYHA 3TB2A 3LGCA 3F4RA 4IBPA 1V2AA 3GMFA 3KP8A 4K6XA 1K3OA 3RDWA 4BWSA 1ZMAA 2HZEB 3BJ5A 1XWBA 1HNAA 2PVOC 1QK8A 4ML1A 3M8NA 1A2MA 1WWJA 4LLRA 2JL4A 3DWVA 3CBUA 1F3AA 3VWVA 2DJJA 2WRTA 5GSSA 2TRCP 3EURA 3CSIA 1QUWA 3NOFA 1MTCA 4I97A 3GL5A 1B48A 4GSNA 1AAZA 5IMZA 1B9YC 2YWNA 2FA8A 1WOUA 2MBTA 2OE3A 1AXDA 3UMAA 4EC0A 2FLSA 2H1DA 3GA4A 1M9AA 1J0FA 1GUKA 4TXVA 3TKRA 1PL2A 4K0GA 2MZCA 3I69A 4G0LA 3MNGA 2M46A 5IMAA 1DSBA 4F9ZA 2HZEA 3VLNA 4JRRA 3K8NA 1RQMA 4Z7XA 2G0FA 5JWRB 4ZL9A 1GH2A 4GF0A 4GQCA 4OO4A 2H70A 4NV5A 1T3BA 2O85A 1ILOA 4XHMA 1ZGNA 1LBKA 3C8EA 2HZFA 1OYJA 2GSSA 3CSJA 2FWEA 2IMFA 1SL0B 3HJPA 3AY8A 3QOUA 2DIZA 6GSTA 3FR9A 4PQIA 2ON7A 3GKNA 2N5AA 4IN0A 4TVEA 3LORA 3ZFBA 4TW5A 4L0WA 4HEA2 3TGZA 2K9FA 2A2SA 1F37A 4KSOA 1ERTA 1G0TA 2CZ2A 4AJ8A 1QQ2A 3FY7A 2YZUA 2LJRA 3F63A 3IAM2 1TRUA 4EUYA 1TXXA 3IK7A 1EWXA 1VF1A 4E8EA 4J57E 1BG5A 2P31A 4E8HA 1AC1A 3EVIA 1OKDA 3IHQA 3FR3A 1JZDA 2HSHA 3GX8A 4TR3A 17GSA 1NW2A 5IM9A 2KLXA 2GTUA 4K0NA 3KH7A 1R7HA 1XW9A 1XW6A 3HJOA 3C1SA 2R2JA 1Q98A 2FNOA 3LEFA 4KW6A 4ECCA 3C7MA 4QQ7A 4TKYA 5B7CA 5FT3A 1NHYA 4QL7A 4MMMA 1XCCA 1SK0A 3GH6A 2B7JA 3H93A 3R3EA 1JFUA 2PPTA 4ULXA 2AYTA 5KN1A 3QD9A 4HQSA 5HR1A 4ID0A 1FOVA 5F07A 3TKQA 3I6AA 5JCWA 2OE0A 2QC7A 3UBKA 4EXJA 1SYRA 2KP2A 3D6IA 4ZIJA 3HVSA 2VD1A 2HSNB 2AJQB 1EZKA 2PU9C 1EOHA 4Q5NA 3F0IA 4XCSA 3IV4A 4WBJA 3SWLA 3TKSE 13GSA 4CHSA 2BMXA 3KD0A 3UEMA 2LEGA 1MDJA 1TKDB 1BJXA 4G19A 1SJ6A 4N11A 2YZHA 4HOJA 3QAWA 3TKPA 1GTUA 1GRXA 2EIRA 2CA8A 1TOFA 3HVXA 5CYYA 3JCML 3VI5A 2H73A 4NWYA 3G7YA 1ON4A 2IJYA 2R37A 2FY6A 3UBLA 4MZWA 3GIXA 3C73A 2YJHA 2YANA 1NHOA 6GSSA 1V9WA 2H0GA 4PNGA 5ABRA 2XC2A 3J7Yk 3GNJA 3MAKA 5IO0A 3EU4A 3A5WA 4V1Ap 1FHEA 4MJEA 3WYWA 1YKCA 4DEJA 5A5KA 4EVMA 4EKZA 2K8VA 3Q18A 2LNSA 2I9HA 6GSVA 3F9UA 1NSWA 2ON5A 2HT9A 3HCZA 3LSZA 1F2EA 3ZIVA 4BPYA 3GFKA 3EU3A 2LJAA 1UVZA 4MH2A 3R2QA 1TTZA 4MJCA 3G9BA 3FZAA 4XS6A 4ZXGA 1SENA 4WXTA 4HU7A 5L71A 2B6MA 2VL2A 4DSQA 1WMJA 2DJ0A 2WJUA 4PX1A 3KH9A 1A0RP 1O85A 3FZ5A 2VOCA 1CQGA 2HSMB 5D96A 3TJGA 4MPFA 3ZLPA 3GKXA 3FZ4A 3UVHA 1A0FA 1SJIA 3LYKA 5IPHA 2GS3A 2PN8A 4G0KA 1SK2A 2AHEA 2LRCA 4V2MA 3DIEA 2P5QA 2P0GA 5IO2A 3IBHA 4K2DA 1A2JA 3WGDA 4P3YB 1SD9A 3TOUA 2VCXA 1R5AA 1YKAA 1UC7A 2I81A 1KNGA 3EWLA 5LNKe 1ML6A 2V6OA 3VI7A 2HSMA 1OC3A 1FB6A 3MWHA 3D4TA 3WD6A 22GSA 2YWMA 1TP9A 4PTSA 2GSRA 1TK5B 3GUSA 4XRAA 5AIVA 4ECJA 1ST9A 3D22A 2RLIA 2PERA 4MF7A 5DVBA 1GSDA 4BVXB 1Z7RA 3US3A 2H1AA 1PL1A 1TK8B 3I9V2 1U87A 2X8GA 2IL3A 4ZBBA 3G7JA 3M9JA 2FWFA 2REMA 2H75A 3FR6A 2LV3A 3QCPA 3ERWA 2BJXA 3C1RA 2IFQB 2LJKA 2DJ1A 5DDLA 1XIYA 1GLQA 4DSRA 3I43A 2NDOA 1PD21 1T4ZA 5ECLB 4ECBA 2WULA 2OKAA 2VL2C 1GSYA 2V32A 3GURA 3IK9A 3BOAA 5J3RA 6GSUA 1GNWA 1FVKA 4BVXA 2JADA 5KEJA 1QXHA 4HQZA 2GZYA 2OBKA 3H79A 1E2YA 3TRXA 3UOMA 5J9BA 3QPMA 5ECRB 1WE0A 1T8EB 1SKWB 4ZBDA 2XPEA 2GQKA 1OKTA 2DC5A 1M0UA 3ZFLA 4L5OA 2C80A 3LYPA 4X0XA 2YPMA 3UVTA 5IQYA 2E2GA 1WRYA 4ML6A 3EC3A 2H30A 4PNFA 1J9BA 2MYGA 2IFQA 2YN1A 5J4UA 5B8AA 5ELAA 3N9JA 3FKFA 5IOXA 4L0UA 3ZMKA 1YEPA 2KP1A 2JSYA 1PX6A 3F3RA 2H19A 2NTOA 5E4WA 4N0VA 2VD0A 1YQ1A 4X43A 4I6XA 3P8WA 2JZTA 4TR0A 2K18A 2GQLA 4O32A 3N5OA 4PQ1A 2IPAA 4KDXA 2MMAA 5EPFA 1XPVA 5FHIA 4HJ2A 1XOBA 5HR3A 1EOGA 4N30A 1EP8A 4AJ7A 4HS1A 4MABA 1GWCA 4N10A 1RW1A 1XVWA 2IWTA 3QAGA 3DGQA 1V57A 1URMA 5DALB 3D4MA 1M99A 3PPUA 4K8MA 3C71A 3HYPA 5CRDA 4HZ2A 4TR4A 3M9KA 1F3BA 4OFMA 3WGXA 2DBCA 4K9ZA 1GNEA 2FWGA 2Z9SA 4MP4A 5D9VA 4CDOA 1E6BA 5EY6A 2HRAA 2DSAA 3ZTLA 1LU4A 5AIXA 2HRNA 3ISOA 4EL1A 3E3EA 4N0ZA 3FYGA 1YEXA 1ERVA 3IPZA 5G1KA 4GWRA 4I2UA 3HXSA 3EYTA 1GTAA 1OE8A 5DAKB 1ERWA 2DJKA 3KIJA 1AIUA 1ZCPA 5DALA 4EF0A 4MPGA 3PH9A 3HY2A 4IJ3A 2RUEA 3CTGA 8GSSA 1VF3A 2VO4A 3CRTA 4POLA 2B3SA 4PUFC 1XXUA 5E59A 4D73B 1B9XC 5AGYA 4I2TA 3VWUA 1PSQA 3IRAA 2L6DA 4KB3A 4FYCA 3W8JA 2FCHA 3APSA 3P2AA 5COHA 5DQYA 4TRXA 2K6VA 4JR6A 3DD3A 3M1GA 4LA1A 3DVWA 3GRXA 1O7UA 1ZYQB 4ZB9A 4K7NA 3TJKA 4TOPA 2QGVA 5J5NA 1TW9A 2CVDA 1PGTA 2A2RA 4G9HA 3CRUA 5DAKA 2HRKB 3RPPA 3MSZA 4WEYA 2PMTA 4HU9A 4PURA 5F8BA 1TRSA 2AUVA 1MD4A 3HZ4A 4Q5FA 4F0BA 2C8UA 1K0MA 4D73A 1Q4JA 1HD2A 4HZ4A 5A4WA 5JCUA 1XVQA 4NV2A 4GSTA 1Z9HA 3GKKA 1R4WA 3CSHA 3RHCA 1Y6EA 5G30A 2DJ2A 1EGRA 2F8FA 2J23A 3Q74A 5CRGA 4NPBA 4RI6A 4GSSA 2NPBA 3EE2A 2C0DA 2MMNA 4O7HA 2E2MA 1EGOA 1G6YA 2HRKA 4MH3A 1LJRA 5DJLA 1H4OA 4YQVA 1QMVA 1A23A 1GL8A 4WR5A 3OR5A 3VPQA 5IMCA 4MF5A 5F06A 3KXOA 3HHVA 5DBQA 4YQUA 2YJ7A 4IW9A 1YY7A 1G7EA 4KNDA 2YWIA 2GGTA 3ZYWA 4IHUA 2LRNA 4OD7A 2LS5A 4RQRA 4GLTA 5F05A 1BEDA 1SL2B 4O92A 2HLSA 3KJYA 5A4UA 2FWHA 4ZB6A 2H72A 2C4JA 4ZBAA 3TRQA 3A2VA 4V1Ag 1HYUA 5ECOB 1TI3A 3FZ9A 2L5OA 4XRDA 1GTIA 3CXGA 1TI1A 2VCVA 2PGTA 3FRCA 2CVKA 2WCIA 3MDKA 3IE3A 2H71A 11GSA 2C1YA 2AV4A 1ZYEA 3EINA 2OE1A 1OVNA 3RBTA 4FYUA 4XIHA 2VCTA 3H8QA 3GSSA 4MF6A 1T1VA 1SK1A 2L5LA 4AGSA 2CX3A 3LQ7A 2HYXA 4IP6A 1X9MB 5HR2A 1BYEA 2CV4A 1GUMA 2V1MA 3UJ1A 2XPDA 2RUFA 1GTBA 1X9WB 5IMFA 4BL7B 3GHAA 1KBNA 1YF0A 1O8WA 3QR6A 3ZZXA 2GT5A 2C0GA 16GSA 4NMUA 1WP0A 5KN3A 1A24A 4I8BA 4KX4A 1OC8A 1Z6NA 4ECIA 3LXZA 3H1NA 1C72A 5CRWA 4AJ6A 2L4CA 2B1KA 1XBSA 1M2AA 4IQAA 1WIKA 2E7PA 2I1UA 4NAXA 1OC9B 4X1UA 2QSIA 4QL9A 5G31A 4NXIA 4IQ1A 2YCDA 4BL7A 4RI7A 2G2QA 4TN8A 6GSWA 4JBBA 2ZCTA 1JZWA 1NM3A 20GSA 5F0GA 3A2XA 5ENUA 4K1FA 1XWGA 3TOTA 1YZXA 1V58A 4KGIA 1KEBA 4H86A 1EEMA 3ERFA 1XWAA 2H6ZA 3M0FA 4EO3A 4PXOA 2DMLA 5INYA 4HUAA 5CO3A 2C3NA 5H5RA 4F0CA 3L78A 18GSA 1OC9A 2C0FA 2VM2A 3KM6A 5H5SA 2O87A 2JSZA 2IMIA 3VURA 5EL8A 2H6YA 3GH9A 2GLRA 5G5EA 2JZSA 1CQHA 2LQOA 4V2LA 4ISDA 3TUEA 1XW5A 3DMLA 2H74A 1EEJA 3W8SA 2R3XA 2IMKA 2OBIA 2C3TA 2VL3A 2ZNMA 2P5RA 2IN3A 2DLXA 2PBJA 5HQPA 2J9HA 1T00A 2H66A 2BTOT 3ED3A 1RK4A 1W4VA 3FEUA 1K3LA 1I9DA 1XWKA 1GSEA 4ZL8A 2B7KA 1OE7A 1R26A 3GSTA 1TU8A 2VCQA 2YP6A 1F9MA 1PKWA 5ELGA 3D21A 2GDRA 3ZRDA 3Q6OA 4FH8A 4ZL7A 4TR1B 1VRSD 5B6MA 4YQMA 3H4KA 1PA3A 3SBCA 4KH7A 3KCMA 2H76A 5BMUA 19GSA 1FG4A 2FA4A 3HKRA 4IS0A 2WZ9A 3TJJA 3ME7A 2PWJA 4IVFA 3WT1A 2TRXA 2X8HA 1X5CA 5GSTA 3L9VA 2DIYA 2GSQA 5DCGA 1PRXA 3ZL5A 2H1GA 4HDEA 2VCZA 1MD3A 5HFIA 3IOSA 3P90A 10GSA 5D93A 1Z5YE 3BD2A 1EV4A 3QDNA 5A4VA 3M3MA 4MK3A 2GVPA 2B5EA 1PN9A 4TR1A 1B4PA 2O89A 3GL3A 4Q5QA 2F8AA 4FQUA 1H75A 5IMVA 5C04A 3CMIA 1M2DA 2KUCA 1U88A 2L6CA 2O8VB 4HI7A 1WPIA 3Q19A 3TKSA 1SYXA 2YV9A 1U3AA 3APOA 3E0UA 2LNTA 2YV7A 2VCWA 4IP1A 4BWQA 1MDIA 2X99A 3ZVJD 2VLUA 7GSSA 1Z7PA 3HVVA 2HSYA 3PINA 4J56E 5ECMB 3G7IA 3ME8A 2CAIA 1TK0B 1IYIA 3VWXA 4KDUA 1M2BA 4MCUA 2C3QA 4WR4A 4KAEA 3P7XA 5JWQB 3UIWA 3F4TA 1YDKA 5EVOA 3IC8A 3LJRA 4DVCA 2CVBA 2IMEA 3ZREA 5ECKB 2F9SA 4WF5A 3KP9A 3ZVJA 2YOIA 4YAPA 1F6MC 1JLVA 2FD3A 1W89A 2WGRA 2B5YA 2F51A 3A3TA 4OCFA 1PMTA 5HR0A 1A8LA 4V2NA 5GAPD 5D9TA 1U6TA 4PUAA 1N8JA 2B5XA 3BBYA 1JHBA 1THXA 2CQ9A 3EMPA 2H01A 1JLWA 2EC4A 3DEXA 4J2FA 2X64A 1PQNA 1OAZA 5LCZA 4BA7A 1HNCA 5DJMA 2OADA 4USSA 4FYBA 1UN2A 1B4QA 2B1LA 5GAND 3QMXA 1XOAA 2GT6A 1Z3EA 3IXRA 2WB9A 4ACSA 3PR8A 1XZOA 1AQVA 2WDUA 2IMDA 2NVLA 5IMDA 1O81A 3NZNA 1K0OA 4KSMA 4K7OA 4MJBA 2LRTA 5H5QA 1TRVA 2MBSA 1PKZA 4IKHA 5ECSA 1I5GA 2LSTA 1VGLA 2XBIA 3APQA 3VK9A 4OCEA 3ZITA 3GX0A 1S3AA 5ECNB 4YAVA 1VF4A 2OACA 3O76A 4FO5A 3TKSC 1O6JA 2QKEA 3O3TA 4G10A 5D73A 4O5RA 1BAYA 4KE3A 2VLTA 1V98A 2FHEA 4EDYA 2FUG2 2LQQA 1GLPA 1BQ7A 4HJMA 5G2ZA 1Y25A 2HI7A 4FIWA 2OJLA 1QGVA 4KF9A 2YNXA 1TU7A 2HRFA 1ERUA 5IIZA 1SKRB 3GN3A 3U5RE 5DCHA 2CAQA 2C0EA 2R5GA 3F6DA 5LD0A 1PX7A 2CX4A 1K0DA 3L9UA 5JCGA 1SL1B 3J7Yb 4JE1A 1XFLA 1B8XA 4IJIA 2WFCA 4NHWA 1AQWA 5CAXA 3IA1A 1G7OA 4IELA 1GSUA 1X5DA 4POKA 2H8LA 1AW9A 2K8SA 1GP1A 1XWCA 2HFDA 5G5FA 3KEBA 3VPTA 2WS2A 3HZ8A 1EP7A 4JU5A 1O73A 4WETA 1V40A 5CRHA 3WT2A 2H0HA 3RPNA 3E9JB 3LFLA 4JEDA 2TIRA 4KUNA 3RHBA 2CZ3A 4GTUA 1FB0A 3KTLA 2N5BA 4ILFA 1G6WA 5GZZB 1QFNA 2L4QA 1DBYA 6GSYA 4AF2A 3BCKA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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