2HNLA

Structure of the prostaglandin d synthase from the parasitic nematode onchocerca volvulus
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
202
structure length
202
Chain Sequence
QMEKYTLTYFNGRGRAEVIRLLFALANVSYEDNRITRDEWKYLKPRTPFGHVPMLNVSGNVLGESHAIELLLGGRFGLLGTNDWEEAKIMAVVLNIDELFQKLIPWTHEKNTTKKAELFRNLSESDVMPFLGRYEKFLKESTTGHIVGNKVSVADLTVFNMLMTLDDEVKLEEYPQLASFVNKIGQMPGIKEWIKKRPKTYF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Glutathione S-transferase 1
publication title Structure of the extracellular glutathione S-transferase OvGST1 from the human pathogenic parasite Onchocerca volvulus.
pubmed doi rcsb
source organism Onchocerca volvulus
total genus 71
structure length 202
sequence length 202
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2006-07-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 2hnlA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2hnlA01
5AGYA 1U6TA 2YPMA 2PERA 2OE1A 4OFTA 4IQ1A 2CX3A 2TRXA 1S3DA 2DLXA 4PTSA 2LJKA 2EIRA 2PN8A 2LRCA 4PGTA 2PPTA 2GQMA 4O5RA 3TKRA 3L4NA 1MD4A 2PUKC 2H6XA 1FHEA 5J4UA 4IELA 3UL3A 1NM3A 2LJRA 4FIWA 2VL9A 3A2VA 2C1YA 4F0CA 1GTBA 1VF3A 3GN3A 1A8LA 5J9CA 4EVMA 1X0RA 4ZL9A 1ZGNA 12GSA 4EDZA 3A5WA 3L9UA 4POBA 5DVBA 3G7JA 3TKQA 1JLWA 1JHBA 3ZLPA 2FCHA 5DBQA 2ON5A 1ACVA 4TR3A 3ZIVA 4X43A 2C0GA 4IW9A 3L78A 3H1NA 3HCZA 5CO3A 1YKAA 3F9UA 4GSTA 1B8XA 5IMZA 5C04A 5IMCA 1R5AA 3S9FA 3J7Yb 4K2DA 3TRQA 1GSQA 2YP6A 2DJ1A 3UVTA 4NMUA 1ML6A 4XIHA 1PGTA 2B7KA 2PGTA 2REMA 1N2AA 1M99A 1GSFA 1U3AA 4GSSA 4IKHA 4FO5A 2HQTA 2V6KA 1YEPA 2N5FA 4X0XA 4PUFC 3AY8A 2IMIA 4TN8A 3MSZA 4MPFA 2F8AA 5JWOB 5IO2A 3CTFA 4N0ZA 1WRYA 1URMA 2DJKA 3ERGA 1THOA 1UVZA 1JZOA 3SWLA 5EPFA 1NHYA 3KTLA 2PVOC 1SL1B 3IAS2 1X9MB 1B9YC 3WT2A 1M2DA 2GZZA 2FWHA 1GWCA 3CRUA 5DQYA 2WB9A 3H79A 1GSYA 1ERVA 1BYEA 5DCHA 4HDEA 2H0IA 1W4VA 2YWMA 2WJUA 2DIZA 5INYA 2V41A 3VWVA 5CP1A 2CX4A 4I6XA 3JCML 4BWSA 1XOBA 4G0IA 1FOVA 1GTIA 2C3TA 3QMXA 3FW2A 2FA8A 2H01A 1AQVA 2X8GA 3VI7A 3FZAA 1J0FA 1UC7A 3HZ4A 3P2AA 1TTZA 4MABA 1BAYA 3NZNA 4BVXA 4HQZA 2RUFA 3KH9A 2PMTA 3RPPA 1AAZA 4HQSA 4MCUA 3CYNA 4KW6A 1EGOA 1O8XA 1GNWA 3HY2A 2YJHA 3DKSA 3BJ5A 2LRNA 2B7JA 1VF2A 2VLTA 3F8UA 3TJBA 5FT3A 4MK3A 4MMMA 4AJ8A 2VCZA 3E3EA 3KIJA 1BQ7A 3HVXA 2NBSA 2VCQA 3L0HA 2I3YA 4OCFA 4JE1A 1PX7A 2VCWA 2C3NA 3PINA 4N0VA 1XW6A 4ZBDA 4WF4A 2JL4A 1IYIA 4GRFA 1GSUA 4F0BA 4Q5NA 3C1RA 4GLTA 5J5NA 3IXRA 6GSVA 1EV9A 3CSJA 2B6MA 5IMDA 4KF9A 1GP1A 3APSA 5CRGA 4BA7A 3GMFA 5CREA 5CNWA 3KH7A 1TXXA 2HE3A 5A4VA 3LJRA 4LA1A 4J56E 1USBA 2G2QA 3QD9A 5HFKA 5LD0A 1X5CA 3KEBA 5ECOB 3GKXA 1TRVA 4E8HA 3QDNA 4XCSA 2BJXA 1Y25A 4LLRA 3UIWA 3U5RE 4MJEA 7GSSA 2YWNA 1TK5B 1ZMAA 1WJKA 2DJ2A 4HU7A 3C73A 5AN1A 3DEXA 1YF1A 3DYRA 1Q98A 2GTUA 4KCEA 5IO0A 2GSSA 5D93A 3RHBA 1VGLA 3LORA 5F06A 3M9KA 1XIYA 1V57A 2AYTA 2CAIA 3GKMA 4XTSA 4L0WA 2H1DA 1GL8A 4J57E 3HD5A 3LXZA 1QFNA 4PQIA 2AB6A 3HA9A 2ZNMA 4H86A 1R7HA 3HXSA 1GUHA 3WT1A 3SBCA 2IPAA 2VO4A 4I5QA 3FEUA 3C71A 5ID2A 5IOXA 2VM1A 2WDUA 4RI6A 4NXIA 5ENUA 3DVWA 1SD9A 1SJ6A 1V98A 5B7CA 4V1Ag 4KA0A 3A2WA 2HLSA 3PH9A 1GLPA 4BVXB 3GNJA 2NTOA 1N8JA 2HSNB 1G0TA 19GSA 1EGRA 4ECBA 2VOCA 3LG6A 4EKZA 2XBIA 1C72A 5JCWA 3IOSA 4CW9A 4MZWA 2GZYA 3F3QA 4HU9A 2F9SA 4JR4A 3GRXA 3FR6A 3Q18A 2BMXA 4BPYA 2I9HA 3DMLA 4FH8A 2VCXA 1K3OA 4MP4A 3HVVA 5A4WA 1EP7A 3UJ1A 3EYTA 2R3XA 1S3AA 1TOFA 3KMNA 2M72A 1Z9HA 4OCEA 3VK9A 1M0UA 2A2RA 3KXOA 4DEJA 3ZFBA 3BD2A 5D9WA 4K0NA 1AC1A 2B5XA 4ULXA 2C3QA 3EU3A 3TKPA 1SL2B 3C8EA 1LJRA 2LSTA 16GSA 4ISDA 1WP0A 5JCUA 2H30A 3TKSA 3GL3A 1PN9A 5AIVA 2B5YA 3ZVJA 2CZ2A 1ILOA 2VD1A 3HHVA 3FZ4A 2MMZA 1GUMA 1QGVA 3IV4A 5G31A 4POLA 2IJYA 1RK4A 2FWGA 5DALA 5GAPD 1KTEA 2L57A 4XRDA 1V2AA 1XWGA 2YZUA 3US3A 1BG5A 1OE7A 1TI1A 4MF6A 3KP9A 3PPUA 4MJBA 2H75A 5B8BA 3MDKA 4KH7A 2MMNA 5KN1A 2HI7A 5ECKB 1M2AA 1OC8A 1FG4A 1TDIA 5HR2A 1MTCA 1VF4A 3C1SA 1TJDA 3HJPA 4MPGA 4EUYA 1GH2A 1S3CA 3D4TA 4FQUA 3P90A 1A0RP 5ECRB 1GSSA 2LRTA 3UMAA 1SD8A 2LNSA 4MZCA 4KSMA 5ID2B 5BMUA 4ZL7A 1BJXA 4WBRD 1BX9A 3K8NA 5CRHA 4YAPA 1RW1A 3RPNA 4EO3A 3IE3A 4YAVA 1HQOA 3EU4A 3RBTA 4TOPA 4DSQA 1X9SB 2L6CA 4AJ6A 4N10A 1ZL9A 2JZRA 1R5PA 3V1WA 5CRWA 4IS0A 4XHMA 2H19A 4X1UA 3MNGA 1K0CA 2WFCA 3KGKA 2ALBA 1WOUA 4HEA2 2NDOA 4V2LA 1O6JA 4KDYA 4EL1A 5E4WA 1A0FA 4ZBBA 2PWJA 3NIVA 4HUAA 3IK9A 4Q5QA 1HNBA 2GQLA 3D4MA 5EL8A 1FO5A 1TU8A 2GQKA 3TRPA 2GS3A 4NHWA 4OFNA 20GSA 5HR3A 2H1AA 4EC0A 1CQGA 3LQ7A 4PX1A 4NV2A 1G7EA 5IPHA 2N5AA 2NVLA 4V2MA 2XBQA 2MBSA 2OE0A 1TK0B 3ZMKA 3A3TA 1ERWA 1XWBA 2RIIA 2GSRA 2H8LA 5CRDA 1EV4A 3QFAC 5ECSA 4PNFA 3IDVA 3FZ9A 1YEXA 5ECLB 2WRTA 4PURA 2H76A 3VPQA 2M80A 2OKAA 1TRWA 2JSYA 4WF5A 5FWGA 3GUSA 2K8SA 3IHQA 4MLYA 3KZQA 3UBLA 1SYXA 3DVXA 1SL0B 3W8SA 3IPZA 4TR1B 3LYPA 5DALB 5ELAA 5DJMA 1FAAA 1G7OA 2F8FA 14GSA 2IMFA 2TIRA 2H66A 1KNGA 1SU9A 3ISOA 4IN0A 2XHFA 5IMAA 3Q74A 1QXHA 4KSOA 2QKEA 3F3RA 3H8QA 1Y6EA 1SKWB 3ZFLA 1VF1A 2P5QA 2Z9SA 3HDCA 1PL1A 4POMA 4JZQA 3CSHA 2K6VA 1MEKA 1U88A 8GSSA 2LKUA 4PQHA 1ZZYA 2P31A 1SKSB 1A2JA 3M3MA 1OYJA 5ECMB 1JLVA 4FYBA 3BCKA 1PL2A 4K0GA 4JEDA 2E0QA 4IVFA 1TKDB 2H74A 1ZOFA 4WBJA 2MMOA 1ZCPA 6GSTA 4CDOA 2KP2A 3RAZA 2AHEA 4I8BA 2CV4A 1PKZA 4IGJA 1Z3EA 2H1GA 3BBYA 3ZRDA 4ECJA 3QR6A 1MDIA 11GSA 1T4ZA 5HQPA 1AIUA 2DMLA 1Z7RA 1QMVA 4MDCA 3ZREA 2FD3A 3KP8A 2C0DA 4RQRA 5G5FA 1GSDA 1K0MA 3DGQA 1JZDA 2F51A 3HVSA 3GURA 1XW9A 1XZOA 3I9V2 1RQMA 2B3SA 2HZFA 1VRSD 4YQUA 2C4JA 2LQQA 1UA5A 2ZUPA 2QGVA 3L9VA 4KAEA 5GSSA 2JADA 1IYHA 4JU5A 2V1MA 2MBTA 5C00A 3DXBA 1PRXA 3G9BA 2GVPA 4K7OA 3LFLA 1O8WA 1PA3A 5D9XA 5JWQB 3EURA 4BWQA 1F37A 5G1LA 4WR5A 5DCGA 1MD3A 4OO5A 2EIQA 1SKRB 1Z7PA 3ZITA 2O89A 2PBJA 1T00A 2RLIA 1HNAA 1OC9A 3IC4A 3ZYWA 3IR4A 2J23A 2VD0A 5AIXA 3FYGA 4ECIA 3R3EA 2VAFA 3Q6OA 4EF0A 3IBHA 1WE0A 2L4CA 1K3LA 4GXZA 1O81A 4ZB9A 1V58A 3GX8A 1XVWA 1XWKA 2YANA 4HJMA 2GLRA 3O6TA 2MZCA 2R37A 3CMIA 2B1KA 1GULA 2DMMA 2X64A 2VUPA 5HR1A 3GYKA 1BEDA 4TR4A 4EXJA 4PNGA 3GKNA 3KTBA 3I43A 4BL7A 1DE1A 1SENA 5JWRB 2CVKA 2B5EA 2VL2C 1U87A 1F3BA 2OBIA 4BVYA 5D8IA 2FA4A 1TRSA 4O7HA 2WCIA 3GH9A 4NWYA 2YNXA 2EIOA 1DE2A 2H6ZA 4ECCA 5D9TA 1XW5A 3W8JA 3L9SA 4ML6A 1GSEA 2A2SA 3VWXA 2IIYA 2AUVA 2HZEA 3VWWA 2ON7A 4NPBA 3DIEA 5ECHB 1T3BA 3QFBC 4WEYA 2HNLA 3TUEA 2O7KA 1A8YA 2AV4A 3QAWA 2DBCA 5COHA 5B6MA 2L6DA 3WGEA 2GSQA 1OAZA 3G7YA 1T7PB 1A2LA 1GTUA 5JCGA 1B48A 2C80A 2LQOA 5FHIA 4I97A 2WS2A 2VL3A 3CBUA 17GSA 5ABRA 1FB0A 3TDGA 1X9WB 2M46A 4MF7A 3FY7A 3QAVA 1G6WA 2YN1A 1OC9B 4AGSA 2JZTA 3UVHA 3EE2A 3VLNA 5EVOA 2CQ9A 4I2UA 1A23A 5ECIB 1QQ2A 3N9JA 1F3AA 1X5DA 3HYPA 3FRCA 4NAXA 2K18A 2CZ3A 3QAGA 4DSSA 4Q5RA 3QCPA 18GSA 2NPBA 3D0ZA 2IMKA 1O7UA 4KB3A 3UAPA 4ZIJA 5KEJA 1TU7A 3EWLA 1DSBA 4BL7B 2HT9A 3ZL5A 5F05A 5D96A 3E9JB 1Z5YE 1YF0A 4TR1A 3FKFA 3GKKA 4BVYB 1FVKA 6GSSA 2FHEA 3VPTA 1O85A 4PQ1A 1B9XC 3FK8A 4YQMA 1YQ1A 1PMTA 3KJYA 2RM6A 2H6YA 1XWAA 2H1BA 4V2NA 5D73A 5A4UA 3D21A 2EC4A 4LMWA 4OMVA 1EWXA 3GX0A 2GSTA 3ZZXA 4K6XA 4POKA 2DJ3A 2KOKA 2HXKA 2HZEB 2XC2A 5H5RA 1ST9A 1XFLA 5HFGA 4G10A 5HFIA 2QSIA 1SJIA 2LV3A 2WZ9A 1ON4A 5F8BA 3TOTA 1K0BA 2E2MA 1GUKA 1MDKA 1WWJA 3FZ5A 3QPMA 3ERWA 3VWUA 4EDYA 1OVNA 4N30A 4TXVA 3ME7A 4TXOA 5G30A 4OFMA 4V1Ap 4MH2A 4K7IA 1AQWA 4ZB6A 4WETA 2V2GA 1WMJA 2YV7A 2X8HA 4ZB8A 4D73A 2H71A 2VCVA 1T1VA 4K9ZA 2X8CA 4EE0A 3TJGA 2GZPA 4G0LA 5KN3A 3EVIA 3IRAA 4TRXA 2H70A 1JFUA 3LWAA 4DSRA 1GRXA 2I81A 3F6DA 5CAXA 4XS6A 3C7MA 2OADA 1FVJA 3IAM2 2HSYA 2IWTA 2L4QA 4KDXA 4GQFA 1G6YA 5ECPB 3VI5A 3TKSC 1K0DA 4HS1A 2MMAA 2OA7A 3APQA 2KUCA 2FUG2 4GCIA 3DRNA 4DSSB 4QL9A 5F0GA 3ME8A 3BCIA 3U6VA 2FY6A 3TCOA 2CAQA 1SJZA 1R4WA 2ES7A 2JU5A 13GSA 1K0AA 2L5OA 2YZHA 5DAKA 1OKDA 2IMDA 6GSUA 2I4AA 1LU4A 2DIYA 3M0FA 3GFKA 3KM6A 1TW9A 2L5LA 3E0UA 5IMFA 4MZBA 1M2BA 4K8MA 3D5JA 5ECQB 5J3RA 1OKTA 1DUGA 2DSAA 3DD3A 5D9VA 2HRKA 3M9JA 2CA8A 1AXDA 2H0HA 3I69A 1ERUA 1XOAA 3RHCA 4QQ7A 2OACA 4XS4A 3F4SA 2FNOA 2IFQB 3P7XA 1FB6A 2V6OA 2LEGA 2B1LA 2MYGA 3TJFA 2LS5A 4WR4A 2V32A 5IQYA 3CXGA 5H5SA 1QUWA 1OE8A 1HYUA 4P3YB 2J9HA 5IMVA 4KCAA 3FR9A 2FWFA 4KE3A 4F03A 1WIKA 3EINA 1ERTA 4TXOB 4L5OA 3F63A 3MAKA 3TB2A 1WPIA 1EEMA 2VLUA 2P5RA 3GA4A 2BTOT 5A5KA 1AUCA 4G2EA 4MA9A 4D73B 10GSA 2YWIA 1GLQA 2O87A 2P0GA 4HJ2A 2JZSA 2IL3A 9GSSA 4IJ3A 4RI7A 4ACSA 2VL2A 2H72A 4G9HA 1ZYQB 2RM5A 1ABAA 5G5EA 4JR6A 3IK7A 3TJJA 4MF5A 4TKYA 4DVCA 2VLVA 3GTUA 1TI3A 4K7NA 3CRTA 2LTKA 2WGRA 2HYXA 4AF2A 4AJ7A 2WULA 3TRXA 3W6GA 1XWCA 2YOIA 1QK8A 2C0EA 3P8WA 1DBYA 2N5BA 3APOA 5DDLA 1AW9A 3TOUA 3GSSA 1F2EA 2XPEA 2GGTA 1A2MA 5IIZA 2YV9A 4GTUA 1AQXA 5DAKB 1XPVA 2A4VA 5LCZA 3TGZA 5G2ZA 2FGXA 5GSTA 4QL7A 2FLSA 3OR5A 1HD2A 1O73A 4ZL8A 2F3MA 2GDRA 3TKSE 2LNTA 3KD0A 4FYCA 3ZIJA 1V40A 2UZ8A 4CHSA 4I2TA 4IBPA 2OE3A 5CYYA 3HKRA 4GSNA 2HRKB 3MWHA 5J9BA 5L71A 5EY6A 1SK2A 5J41A 1B4QA 3KCMA 4KGIA 4J2FA 1XCCA 3UOMA 3LEFA 4ML1A 4IHUA 4XS4B 3UEMA 5F07A 5AISA 1NW2A 4F9ZA 1EZKA 2VM2A 4LMVA 1KEBA 5KN2A 5ECNB 1EP8A 3ED3A 3F4RA 3H93A 1Q4JA 1U3IA 1E6BA 4FYUA 2R5GA 4RUVA 1LBKA 2G0FA 1J08A 2OJLA 4F82A 1YDKA 1T4YA 22GSA 3I6AA 2JACA 3H4KA 3RDWA 3WYWA 2ZCTA 1EOHA 2HRFA 1A24A 1F9MA 4IQAA 5LNKe 1K3YA 1PX6A 4Q5FA 4RQXA 3F0IA 1K0NA 3KMOA 2R6KA 3ZVJD 1NHOA 1YJ6A 3HZ8A 1XXUA 2O8VB 2LJAA 2DJJA 4KDUA 2VCTA 5B6NA 4JRRA 1MDJA 2CVDA 3FHKA 3GTUB 3DWVA 2FWEA 2IMEA 1PSQA 2E7PA 1XBSA 4HI7A 2OBKA 4MJAA 2YWOA 1CQHA 3FR3A 3J7Yk 3PGTA 2AAWA 4XS1A 5DQSA 1FW1A 2O85A 3GSTA 3O3TA 4MH3A 4O92A 3WGXA 3O76A 6GSWA 3ERFA 3UARA 2KHPA 4IJIA 4USSA 1R26A 2X99A 4LL1B 3CSIA 2KLXA 3UBKA 1SK0A 4IP1A 3F4TA 5GAND 3GL5A 3R2QA 2AJQB 1M9AA 4N11A 2L59A 4PXOA 3PR8A 2GT6A 1YY7A 2QC7A 5ELGA 3CTGA 3IC8A 2K9FA 3LSZA 4XRAA 4KUNA 4G0KA 2C0FA 2HSMA 3A2XA 1JZWA 3LGCA 4WKWA 3G7IA 4GF0A 3Q19A 3LYKA 3D22A 3ZTLA 4L0UA 4KX4A 1K0OA 2XPDA 3EMPA 1PD21 3VURA 1EOGA 3GHAA 1Z6NA 2I1UA 1ZYEA 4GWRA 1H4OA 3WGDA 1V9WA 1M7TA 1EEJA 2PVQA 1THXA 4KNDA 4TW5A 3N5OA 2GT5A 3F6FA 4HZ4A 4LL4B 4G19A 4PUAA 4YH2A 1GTAA 1M9BA 1TRUA 1B4PA 1JZRA 5HR0A 2HRAA 2LUSA 4K1FA 2HRNA 2HSHA 1W89A 2TRCP 4L8EA 2DC5A 4JBBA 1J9BA 1KBNA 4Z7XA 3EMXA 3GV1A 1OC3A 6GSYA 6GSXA 2YJ7A 4YQVA 4HZ2A 3GIXA 4O32A 1E2YA 1SYRA 2HFDA 3EC3A 2CT6A 2R4VA 4MJCA 4TVEA 4ILFA 5IPGA 4HOJA 5G1KA 1NSWA 3HJMA 1H75A 2IFQA 4NHZA 3M8NA 1T8EB 3QOUA 4F2IA 4OD7A 1YKCA 4ZXGA 5IOWA 1HNCA 4WXTA 1PKWA 1I5GA 3D6IA 2E2GA 1TP9A 1F6MC 2DJ0A 1Z6MA 1I9DA 2KP1A 3WD6A 4IP6A 1TK8B 2RUEA 2YCDA 4GQCA 1X5EA 4L5LA 4ID0A 1PQNA 2C8UA 2D2ZA 1UN2A 3GH6A 3TJKA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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