5EL8 | Genus

Total Genus 59

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	59
sequence length	213
structure length	213
Chain Sequence	ALEICVKAAVGAPDHLGDCPFSQRALLTLEEKSLTYKIHLINLSDKPQWFLDISPQGKVPVLKIDDKWVTDSDVIVGILEEKYPDPPLKTPAEFASVGSNIFGTFGTFLKSKDSNDGSEHALLVELEALENHLKSHDGPFIAGERVSAVDLSLAPKLYHLQVALGHFKSWSVPESFPHVHNYMKTLFSLDSFEKTKTEEKYVISGWAPKVNPV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Arabidopsis thaliana DHAR1 apo structure rcsb
molecule keywords	Glutathione S-transferase DHAR1, mitochondrial
molecule tags	Transferase
source organism	Arabidopsis thaliana
total genus	59
structure length	213
sequence length	213
ec nomenclature	ec 1.8.5.1: Glutathione dehydrogenase (ascorbate).
pdb deposition date	2015-11-04

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF13410	GST_C_2	Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A	PF13417	GST_N_3	Glutathione S-transferase, N-terminal domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1050.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	5el8A02
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	5el8A01

1YZXA 2P0GA 2C8UA 4ZXGA 1WP0A 1ZOFA 4KF9A 2HI7A 4OWYA 1Y25A 3A3TA 3TKQA 1ZL9A 1YY7A 5ECQB 4Q5QA 1YKCA 1DE1A 2YWNA 2GLRA 3E9JB 3GSTA 5GSTA 1EZKA 1GSSA 3DEXA 5G2ZA 3U5RE 3ME7A 2WFCA 3DRNA 3P2AA 1YDKA 3ZITA 3KM6A 1SK0A 1X0RA 4WKWA 1K3LA 3K8NA 4O92A 3HZ4A 2VM2A 5IIZA 4LMWA 4ZL8A 3VWVA 4BWSA 1K0BA 2FUG2 1AC1A 3UMAA 4OO5A 3ZIJA 2BJXA 4L5OA 2IMIA 1GTBA 5D73A 4OO4A 5F07A 4ECIA 5J3RA 1E2YA 2VCZA 4IGJA 5ECIB 2LJRA 3EU3A 2L6CA 2YOIA 3QDNA 1MD4A 3G7JA 3O3TA 1AAZA 4V2LA 4TXOB 2WS2A 3FZAA 1JZWA 4RI7A 6GSXA 5ELAA 3SBCA 2X8CA 2B6MA 3IDVA 4EO3A 3GKMA 1Y6EA 5IMFA 3ZFBA 5A4UA 4Q5NA 1AQWA 5AISA 4HEA2 5DVBA 2HSHA 2M72A 2XPEA 5IMCA 1PRXA 2H6XA 5CRGA 1OKTA 4V2NA 4BVYA 3WGDA 2GQMA 2CZ2A 3Q18A 2ZUPA 3M0FA 5B8BA 4HS1A 2TIRA 4EVMA 4I2TA 3FW2A 1XOAA 4MZBA 4MK3A 3Q6OA 4ZL7A 1T00A 4G19A 5KN0A 2CX4A 1Z6MA 2JSYA 1TRSA 2WZ9A 3LWAA 3FR6A 3P8WA 4X0XA 1DBYA 1B9XC 1U3AA 4GSNA 1EOGA 1K0OA 3QMXA 2DJ1A 2HFDA 1YQ1A 1JFUA 3WGEA 1SJ6A 4ZIJA 3ZIVA 4D73B 2E0QA 2V6OA 3C1RA 2BMXA 5B8AA 2JL4A 5CP1A 1X5EA 3PR8A 4RI6A 2I9HA 2YP6A 1SD8A 3QPMA 3HVVA 3UL3A 3F6DA 3ZRDA 4ZB8A 3GTUB 5ELGA 2YN1A 3IXRA 4AJ8A 3VWUA 4HJ2A 1EOHA 1THOA 1BAYA 2PVQA 2B3SA 2QGVA 1SK1A 2MMOA 1GNEA 11GSA 3APSA 3BCKA 3L0HA 3EU4A 4I8BA 4J57E 2RUEA 4XTSA 3GA4A 3ERGA 2HRAA 3DD3A 1PL1A 2VM1A 3LXZA 1UA5A 2V32A 4GXZA 2CVDA 1S3DA 3I69A 1TTZA 4FO5A 3A2VA 1B8XA 4TKYA 4WBRD 4MMMA 5KN3A 2H8LA 5CNWA 4K7NA 1QXHA 2YNXA 4RUVA 1A8YA 2E2MA 2OACA 2HNLA 2JADA 2V1MA 1FG4A 1TK0B 4N0ZA 1VF3A 4JEDA 3O76A 2QKEA 1DE2A 1XW6A 2RM5A 2O85A 1LJRA 3LEFA 1O8WA 4EKZA 1G7EA 3KTLA 4K7IA 4DEJA 4K7OA 1LBKA 13GSA 5B6NA 4WEYA 3EURA 1GWCA 4TR1B 3TCOA 2YV9A 2IPAA 4P3YB 3GN3A 1WE0A 4PXOA 3HXSA 2CX3A 3IHQA 3I43A 3FEUA 4OD7A 1TU7A 1I9DA 2VIMA 2K8SA 3PPUA 1PD21 1AQVA 1K0MA 5H5QA 1ZYQB 4E8HA 2C0EA 4J2FA 4EC0A 1TK5B 4MA9A 2FD3A 3LFLA 1G0TA 2LEGA 3RBTA 1Q4JA 2H1DA 3TDGA 2FA8A 4NHWA 1V57A 3QFAC 19GSA 4FQUA 2WB9A 1R4WA 2DLXA 4IQAA 3HCZA 3VPTA 1ERWA 3W8JA 2R2JA 2OE0A 2L4QA 2LTKA 3VWWA 2H01A 1YJ6A 2WJUA 4IP1A 2FWGA 2KHPA 2LSTA 3L9SA 5ECHB 1XIYA 1Z6NA 2BTOT 1K3YA 4TR0A 18GSA 1O7UA 5IM9A 4GRFA 2QC7A 4PQ1A 2GSTA 4MJEA 4PUFC 1SL0B 2NBSA 3KH7A 3HVXA 3Q74A 2C1YA 12GSA 3D4TA 1K0CA 1PQNA 1TRVA 4MH3A 1GNWA 2HQTA 1FW1A 4GTUA 3HJOA 4LL4B 2H6YA 5DCHA 4WF5A 1HQOA 5A5KA 5E59A 3MDKA 4ML1A 5DALA 2OBKA 1OC9A 5F06A 1BQ7A 2H70A 2B1KA 1TI3A 3KEBA 1GRXA 3C73A 2YWIA 3GHAA 2VLTA 5JWRB 3HD5A 2XHFA 3D6IA 3W6GA 4BVYB 2RIIA 5FWGA 2PUKC 1CQGA 2HZFA 3DVXA 2IFQA 3I6AA 2JZTA 3TKPA 4DVCA 2OJLA 3IAS2 2PVOC 3UBLA 3PH9A 3LORA 3QAVA 5GAND 1A0RP 1PSQA 3IC4A 1TXXA 1SKWB 1JLVA 2LUSA 5JWQB 5CREA 2GSRA 3CRTA 5B6MA 1IYIA 2PGTA 5ECMB 3EMPA 1C72A 17GSA 3HYPA 2D2ZA 4V1Ap 5F8BA 1F6MC 4JZQA 3KJYA 3IPZA 3UAPA 1VGLA 5IQYA 4KDXA 4E8EA 1F37A 2FWEA 3FRCA 5HR1A 5J9CA 4L5LA 4ZBDA 3A5WA 2GSSA 5ECOB 4OMVA 5DAKA 1PL2A 1THXA 1M7TA 3IAM2 1O73A 1GTIA 4KW6A 4L8EA 5J9BA 4GCIA 1JLWA 4GQFA 2FLSA 1HYUA 2IWTA 3TGZA 3LGCA 1GTAA 1TRWA 2VD0A 2VCQA 3F63A 4MDCA 4TRXA 5EY6A 4YQUA 3FR9A 4J56E 5CO3A 3E3EA 3F0IA 3EINA 1AIUA 2GZZA 3NOFA 2YV7A 2H1BA 1T4ZA 4KX4A 2M46A 1OAZA 2VCVA 3C1SA 1KNGA 3M1GA 2HXKA 1HNBA 4JU5A 1A2LA 3W8SA 2F3MA 1Q98A 2GGTA 5D96A 3CTFA 4MJBA 1ERVA 4ECCA 1IYHA 3KMOA 2HT9A 2AJQB 5ECRB 1JZDA 3GSSA 4KSOA 5EVOA 4EUYA 1M2BA 3LSZA 1Z7PA 1GL8A 4MZWA 3TKRA 5D9XA 3TUEA 3GUSA 1URMA 4YAPA 3CSJA 3M8NA 4DSQA 5LNKe 2MMNA 2WULA 1N2AA 4ULXA 4L0WA 2C3TA 4NXIA 5GZZB 3UBKA 2QSIA 2AYTA 3QD9A 2FWHA 4TVEA 2K18A 5DQSA 3OR5A 3EYTA 5JWOB 4F82A 4ZBBA 3RPNA 4GSTA 1MTCA 1HD2A 2FA4A 4MZCA 3J7Yk 5C04A 5IOWA 1R5AA 3ZYWA 3FHKA 3HZ8A 5CYYA 1ON4A 1SYRA 1RQMA 5COHA 3GH6A 4XRDA 4Q5RA 2DC5A 4PURA 3IA1A 5ENUA 1NHOA 4JBBA 1S3AA 4XS4A 3L4NA 5JCUA 4N10A 2CAQA 4JR4A 2H71A 1OC3A 2LS5A 1JZRA 3LQ7A 1QGVA 1PMTA 2VAFA 1V98A 1R7HA 1RW1A 1YF1A 2KP1A 1XFLA 1GLPA 1Z7RA 1EGOA 3HJMA 5D8IA 3TRPA 3ZL5A 4N11A 4OCEA 1Z3EA 1DSBA 3Q19A 3G7YA 4LA1A 2J9HA 5IOXA 2CV4A 2I1UA 2P5RA 2VL2C 4ZB9A 3GNJA 2HRFA 1JZOA 3MAKA 1XW9A 4IW9A 1FB6A 4TXVA 3KGKA 1SL1B 4WETA 3ZTLA 2CQ9A 2PBJA 2MYGA 3RHBA 2H75A 2KP2A 4I97A 3A2WA 2DBCA 4MP4A 1LU4A 1EEMA 3SWLA 5E4WA 4KCAA 1GSQA 3BBYA 3DWVA 4KCEA 1M2AA 1WMJA 1EV9A 1T3BA 4ZB6A 1SYXA 4PQIA 3LJRA 3HDCA 2LRNA 3QFBC 3FYGA 3QAGA 2GVPA 1ERUA 1OC9B 2L6DA 2MZCA 1OVNA 4V1Ag 4FIWA 4K1FA 4NMUA 5IO0A 4HUAA 3GYKA 1G7OA 3P90A 3J7Yb 4TOPA 4V2MA 1YEXA 4HZ2A 1SK2A 5D9TA 2L57A 1TDIA 2IFQB 3APOA 2X8HA 3CYNA 1HNCA 3WD6A 1MDJA 5F0GA 1GSUA 4XIHA 2GQLA 2VCXA 1T1VA 1NM3A 4XRAA 3ZFLA 3DVWA 1XXUA 4KA0A 3M9KA 1ML6A 4OFNA 1MDIA 4WXTA 5ECPB 2OA7A 5DQYA 3HKRA 1X9SB 1XCCA 2LRCA 3APQA 5G1KA 2AB6A 3F8UA 3RAZA 3WT1A 1TK8B 1W89A 3FY7A 3DKSA 1QFNA 4HDEA 2OE3A 3WYWA 1KTEA 1EWXA 1TKDB 1M9AA 3WGXA 1BG5A 4TR4A 5DAKB 2VUPA 2LRTA 3V1WA 1PX6A 1ILOA 4K0GA 1CQHA 2XC2A 4XHMA 1USBA 2C0GA 3CMIA 2HSMA 5H5SA 4AGSA 4K6XA 1V40A 3BCIA 1GLQA 4WBJA 1MDKA 4YH2A 5D93A 3C8EA 1ERTA 4JE1A 5IMVA 5HFKA 4GSSA 2H1GA 1VF4A 1WRYA 1TW9A 1FB0A 1FVJA 2I4AA 1SJZA 2LNSA 3H4KA 3FZ9A 3VLNA 2JU5A 5IPHA 2HRNA 1SD9A 4I6XA 2CA8A 3NZNA 1SKRB 2KUCA 4ID0A 5JCWA 3TJJA 4PNGA 1TJDA 4CW9A 4KDYA 3KTBA 1B4PA 3ZVJA 1UC7A 2LV3A 1WPIA 1M0UA 2LQQA 1XWBA 1YKAA 3IE3A 3QOUA 4G9HA 3TJGA 5A4WA 2C4JA 4EF0A 4WR4A 4ZILA 2K6VA 1T4YA 2YCDA 2RUFA 5ECSA 4DSRA 2O7KA 4O5RA 5B7CA 14GSA 2F51A 4JR6A 4K8MA 2YJHA 2AUVA 2HSYA 4MJCA 1AXDA 4KDUA 3DGQA 3VURA 5LCZA 3LXTA 5IMAA 1GUMA 4HU7A 3TKSC 5H5RA 5ECKB 4IKHA 3FK8A 1I5GA 2CVBA 3S9FA 4WF4A 10GSA 1V9WA 5JCGA 3US3A 3ISOA 5DJLA 3GV1A 3R2QA 3HA9A 3F6FA 3G9BA 1PKWA 3EE2A 2MMZA 5INYA 2JZRA 2H6ZA 2F9SA 1UVZA 4IQ1A 2B1LA 1BYEA 5DDLA 5G31A 2O89A 4F0BA 4XS4B 5GAPD 2I3YA 1V58A 3KIJA 2RLIA 3HY2A 1J0FA 4N0VA 2EIRA 4IP6A 3RHCA 5EL8A 3BJ5A 4LL1B 2E2GA 2IJYA 4KE3A 4H86A 1BX9A 4LLRA 4XS6A 2DIYA 3D21A 4PNFA 4MABA 4EDZA 3KXOA 2IMFA 4KSMA 3EC3A 3TJBA 4GF0A 1H75A 3U6VA 1R26A 2AV4A 3M3MA 2MBSA 4POMA 5F05A 5IPGA 1GULA 1A0FA 2RM6A 4I5QA 6GSTA 2YWMA 2R6KA 1AW9A 2PERA 4F2IA 1ZCPA 3UEMA 1ZYEA 2H66A 3P7XA 1FAAA 2GZYA 3UARA 1X5CA 4XCSA 2WCIA 3UJ1A 2I81A 4OFTA 4K2DA 7GSSA 2OADA 2YJ7A 3H79A 4QL7A 2VL9A 2ES7A 5IMZA 1HNAA 2J23A 3GH9A 1S3CA 3CSIA 3F3QA 2GZPA 2H0GA 4Q5FA 1E6BA 5CRHA 1V2AA 3MSZA 3UVHA 3GURA 1XZOA 4K9ZA 5J5NA 3ZVJD 2ZCTA 5HQPA 2FCHA 3D0ZA 3NIVA 3UVTA 3LYPA 4G0KA 5AN1A 2VOCA 4OCFA 4GWRA 3DIEA 3GMFA 4HQSA 2HRKA 2IIYA 2H0IA 4HU9A 4IJIA 2X99A 2GQKA 1VRSD 3HVSA 2GS3A 2B7JA 4POKA 2VL3A 3KMNA 2K9FA 1GSEA 4HZ4A 4NV2A 3ERWA 3IV4A 5C00A 3DXBA 2HYXA 5ID2A 5D9VA 1GH2A 1EV4A 4MF6A 4USSA 4ISDA 3GKKA 3LYKA 2FY6A 5BMUA 1ZGNA 3H8QA 2F8AA 2KLXA 1ABAA 2P31A 3H93A 3I9V2 1K0NA 2JZSA 3ME8A 3KCMA 2L5OA 3FZ4A 4WR5A 2L4CA 3IK7A 5GSSA 1N8JA 2A4VA 2GTUA 3TOUA 2HE3A 16GSA 2KOKA 5CRWA 1XPVA 2JACA 2NDOA 4ZBAA 3QCPA 2HSMB 6GSYA 3RPPA 4NPBA 2GDRA 4G10A 2LJAA 2XBQA 1XWKA 3TJKA 2C3NA 4BVXA 1XWGA 1EGRA 3TJFA 1EEJA 4YQVA 5LD0A 5HR0A 4BL7A 4CDOA 1UN2A 1OKDA 1YF0A 3GRXA 3BD2A 1O85A 5HR3A 2C80A 2NVLA 1XVWA 4QQ7A 1XBSA 3G7IA 5AIXA 9GSSA 3KP9A 2A2RA 4KH7A 1GUKA 1A8LA 4PGTA 2FWFA 5L71A 1X5DA 5J41A 4AJ6A 2ALBA 5DJMA 4NHZA 5D9WA 2CT6A 1ACVA 1R5PA 3TRQA 3IRAA 1B9YC 1EP7A 3CTGA 3VWXA 1GP1A 1J08A 5DBQA 1OE7A 4MF7A 1U3IA 3VPQA 2PU9C 3HHVA 3F4TA 5A4VA 4MH2A 4BA7A 2F8FA 3TOTA 4ML6A 2FNOA 4BPYA 5G5FA 4AF2A 4MPGA 2MBTA 1NHYA 3GL5A 4O7HA 1RK4A 1WJKA 1GSYA 1GUHA 1FVKA 1A24A 1XVQA 2H73A 2VL2A 5G30A 1PGTA 2C3QA 4QL9A 5G1LA 4IELA 5HFGA 4POBA 2V41A 1H4OA 1G6WA 1WWJA 3N9JA 4NV5A 1W4VA 4LMVA 4NAXA 3GL3A 3ZMLA 4CHSA 3D4MA 4DSSA 1X9MB 2CAIA 3ERFA 2B5YA 3MNGA 4TR3A 3C7MA 3FZ5A 4G0LA 4FYUA 4MPFA 3KZQA 2XBIA 4POLA 4ACSA 2PN8A 1OC8A 4O32A 3ZZXA 2UZ8A 3F4SA 2YZHA 3ED3A 2B7KA 3QAWA 3H1NA 5KN1A 3PINA 6GSUA 1PKZA 4I2UA 4G0IA 2YPMA 5DALB 1QUWA 2DJKA 5FHIA 3RDWA 2IMEA 4KUNA 1GSFA 2DSAA 3GX8A 3L78A 3DMLA 2G2QA 1WIKA 5DCGA 2WGRA 3L9VA 2V2GA 4KAEA 1J9BA 4F03A 1G6YA 2Z9SA 4FYBA 2TRXA 2WDUA 4EXJA 3BOAA 3GX0A 1TRUA 2OKAA 2DMLA 5IO2A 2AHEA 2M80A 3N5OA 1WOUA 1F2EA 2DJJA 3PGTA 1YEPA 2GT5A 3ZREA 5G5EA 1VF1A 1O81A 3GKXA 3IOSA 4MF5A 1GSDA 3QR6A 5ECNB 1TI1A 2NTOA 1BJXA 2HRKB 4ILFA 2O87A 1A23A 4RQRA 5ABRA 1KBNA 2MMAA 2NPBA 4IJ3A 2DJ0A 2R37A 2V6KA 2R4VA 2HZEA 4EE0A 5ECLB 4F0CA 3ZMKA 2AAWA 3GKNA 2JSZA 3HJPA 4FH8A 5ID2B 1Z5YE 4HI7A 1BEDA 8GSSA 1K0AA 1AUCA 1OYJA 6GSWA 2YZUA 3IK9A 2K8VA 4HQZA 3EWLA 2IMDA 2WRTA 3LG6A 2GT6A 4G2EA 1ST9A 3KP8A 2TRCP 3AY8A 5HFIA 3VFIA 5KN2A 2VCWA 5FT3A 20GSA 2EIQA 1SL2B 3E0UA 1QMVA 3CBUA 2N5AA 2H19A 1PN9A 1F3BA 2H0HA 4PX1A 3KD0A 3EMXA 5HR2A 4HOJA 3CRUA 1KEBA 2CZ3A 1NW2A 5CRDA 2REMA 4BVXB 1U87A 4IN0A 2H76A 1JHBA 2FHEA 1T7PB 2HLSA 3TKSA 2VO4A 3ZLPA 4BL7B 1M2DA 1VF2A 4TXOA 4ECBA 3A2XA 2OBIA 3TB2A 2PMTA 3IC8A 1U6TA 3CXGA 3CSHA 1U88A 1SKSB 2R5GA 3VK9A 1T8EB 1DUGA 4IHUA 3TRXA 1X9WB 3F3RA 2C0FA 4IBPA 2VLVA 1B4QA 4IS0A 2VD1A 2H30A 2N5BA 3L9UA 1ZMAA 2VCTA 2ZNMA 2XPDA 1M99A 2L5LA 4MLYA 4NWYA 1O8XA 3M9JA 4BWQA 1XOBA 3TKSE 2E7PA 3VI5A 5AIVA 4PTSA 3GIXA 2B5EA 4JRRA 2LKUA 4GLTA 1SU9A 1QQ2A 2ON7A 4D73A 2R3XA 3UIWA 2DJ3A 2VLUA 4IVFA 1GTUA 2O8VB 4XS1A 5AGYA 6GSSA 1AQXA 4FYCA 3FKFA 2L59A 2IMKA 2IN3A 4DSSB 2X64A 3GTUA 3JCML 1F3AA 3F9UA 3FR3A 1FHEA 1XWCA 1SENA 2DJ2A 1M9BA 3EVIA 1OE8A 3D5JA 1K3OA 2LQOA 2EIOA 4ECJA 3UOMA 2YWOA 2PPTA 1B48A 4K0NA 2IL3A 4ZL9A 4L0UA 1EP8A 4N30A 5EPFA 1Z9HA 2H1AA 4EDYA 3MWHA 3F4RA 1A2MA 2H72A 1PX7A 4X1UA 2ON5A 2G0FA 2H74A 2DIZA 2B5XA 4Z7XA 4F9ZA 3C71A 2HSNB 4GQCA 5CAXA 1NSWA 1PA3A 4MJAA 4EL1A 2N5FA 2P5QA 1K0DA 1F9MA 5J4UA 1TP9A 5IMDA 3IR4A 1TU8A 2EC4A 4RQXA 1SJIA 3WT2A 1ZZYA 5KEJA 2FGXA 22GSA 4YQMA 3VI7A 4X43A 3R3EA 1QK8A 2A2SA 1TOFA 4KGIA 1FO5A 2X8GA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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5EL8A

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations