2PBJA

Gsh-heme bound microsomal prostaglandin e synthase
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
274
structure length
274
Chain Sequence
LQLTLYQYKTCPFCSKVRAFLDFHALPYQVVEVNPVLRAEIKFSSYRKVPILVAQEGESSQQLNDSSVIISALKTYLVSGQPLEEIITYYPAMKAVNDQGKEVTEFGNKYWLMLNEKEAQQVYSGKEARTEEMKWRQWADDWLVHLISPNVYRTPTEALASFDYIVREGKFGAVEGAVAKYMGAAAMYLISKRLKSRHRLQDNVREDLYEAADKWVAAVGKDRPFMGGQKPNLADLAVYGVLRVMEGLDAFDDLMQHTHIQPWYLRVERAITEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Prostaglandin E synthase 2
publication title PGH2 degradation pathway catalyzed by GSH-heme complex bound microsomal prostaglandin E2 synthase type 2: the first example of a dual-function enzyme.
pubmed doi rcsb
source organism Macaca fascicularis
molecule tags Isomerase, lyase
total genus 97
structure length 274
sequence length 274
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.3.99.3: Prostaglandin-E synthase.
pdb deposition date 2007-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 2pbjA03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2pbjA01
5ENUA 1SKWB 3GL3A 3U6VA 2H1DA 2BMXA 3KM6A 2AJQB 2R6KA 3TOTA 2LEGA 3NOFA 2HZEA 3TKSE 2GQKA 4MDCA 1ERWA 3KMOA 4ZIJA 4Q5FA 5G31A 2N5FA 4YQUA 2CT6A 4IP6A 5CRGA 1OKTA 2PBJA 2NDOA 6GSVA 5B8AA 4GXZA 5IO2A 17GSA 4K2DA 4L0WA 4BWQA 3F4SA 4MZBA 4DVCA 18GSA 3TKQA 1TU8A 3PGTA 5HFGA 2NVLA 2VCVA 4CHSA 4PGTA 4TR1A 4JU5A 4P3YB 2LQOA 1X5EA 2YZHA 3HZ4A 4EDYA 1TI3A 1B4QA 3KTBA 5CREA 2O7KA 2FD3A 1SK1A 4V1Ap 1S3CA 2CZ3A 2VLVA 4MA9A 3J7Yb 2JSZA 1TU7A 4Q5NA 2FNOA 3IC8A 1PX6A 2H72A 3F63A 5INYA 4GSNA 4BVXA 1XWAA 1TXXA 5B8BA 3FHKA 4MABA 4KA0A 4O5RA 1PKWA 1U88A 4N0VA 2C0GA 2I4AA 2DMMA 1NM3A 4N30A 2DSAA 5EVOA 4CDOA 2DMLA 1R7HA 3FR3A 4EF0A 2IMKA 2YP6A 2GZZA 1PRXA 5ECIB 3TGZA 4ECIA 2DIYA 3UAPA 1HYUA 4F0BA 3TJKA 1AIUA 1B8XA 3A2VA 2E2GA 4KSOA 1AXDA 1H75A 5DBQA 4BA7A 3ZTLA 3LXZA 4RQRA 4ECJA 4KE3A 4N0ZA 4TR3A 4MK3A 1M99A 1JHBA 1S3AA 3ME7A 1Q98A 3L0HA 1W89A 3LYKA 1BYEA 1GNEA 2YWMA 3ZMLA 1J08A 3ZMKA 4ZL7A 3ZREA 2AB6A 3I69A 4O32A 4KW6A 2GQMA 4LMVA 5E4WA 4TXOA 2GLRA 1MTCA 3WT1A 3VI7A 1G0TA 3CRTA 3GH9A 1O85A 3HZ8A 4OFNA 2VL9A 3DRNA 1EP8A 3TDGA 3LFLA 5G5EA 1WJKA 4IJ3A 1LU4A 2CAIA 4DSRA 1ACVA 2X64A 2WULA 5ECHB 5IOXA 2I1UA 4BWSA 1X9WB 2LNTA 3GN3A 4YH2A 4FO5A 1ZZYA 3TKSC 1T00A 1LBKA 1IYIA 4IHUA 4BL7B 3F6DA 4I2UA 4IP1A 5GAPD 3P8WA 1GUHA 3F0IA 1WE0A 3QD9A 1G6YA 5CP1A 1C72A 3IAM2 2F8FA 1GLQA 2AAWA 1SYRA 3UARA 4KX4A 4YAPA 1A0FA 2J23A 1SKSB 1PX7A 2DJ1A 1XWCA 1XVQA 3P7XA 5HFIA 4FYCA 2D2ZA 2FWGA 4ISDA 3IC4A 1JLWA 2XHFA 3CSJA 7GSSA 1A0RP 3RHBA 5J9CA 3LWAA 4ID0A 4D73A 2VCWA 1ERUA 1XCCA 3C7MA 1R5PA 2GDRA 1USBA 1V9WA 1EOGA 4HJ2A 2K9FA 1YDKA 3CXGA 2VLUA 6GSUA 3EMPA 4TKYA 3A2WA 5A4VA 2F9SA 2LQQA 1CQHA 2KP1A 2JZTA 3HD5A 3D0ZA 4L8EA 2PWJA 3D6IA 5FHIA 5CRHA 4F0CA 2H71A 2GTUA 2MMNA 4FYUA 1YEPA 3DVWA 4NAXA 3EWLA 2C4JA 4ECCA 5EPFA 4IQAA 2BTOT 2B6MA 1BEDA 3KMNA 4LL4B 2HSMB 2YWIA 4XS1A 1GTAA 1I9DA 2FWHA 3I9V2 5HFKA 2E0QA 16GSA 3DIEA 3EYTA 1PL1A 3HCZA 1FW1A 1GRXA 4AJ8A 5CRWA 5D9WA 1YY7A 3GA4A 1K0CA 1K0BA 4NWYA 5EL8A 2H66A 3LORA 4OFTA 1AQXA 4HUAA 4IVFA 2OE3A 19GSA 5J5NA 4IGJA 3MSZA 1BG5A 2RUEA 3MNGA 4E8HA 5AISA 3FZAA 3KH9A 2VD1A 3ERWA 1GWCA 4F9ZA 1DE1A 4HQSA 4GLTA 4HQZA 3TKPA 5HR2A 3NIVA 4GQFA 3HDCA 2ON7A 1U87A 3VWXA 2MMAA 3F6FA 2ZCTA 1R5AA 2HRFA 2VIMA 1Z9HA 1NHOA 3E3EA 5A4UA 5G30A 3ZIVA 1F3AA 2QC7A 4MF6A 3APOA 1GL8A 1Z7RA 2N5AA 5FT3A 4IELA 1O8WA 3GNJA 3UBLA 5ECMB 5HR0A 4KH7A 2L59A 3C1SA 5ID2A 3QMXA 5IM9A 2LRTA 2FA8A 2R2JA 1AQWA 2PPTA 5D96A 2MMZA 2YV9A 2YWOA 4PUAA 1YF1A 1TOFA 4N10A 4ZB9A 4GQCA 1FB6A 1XFLA 2B7KA 1GUMA 2GT5A 4G2EA 3O3TA 5IMZA 5ECOB 3EU3A 4AJ7A 2VOCA 2FHEA 1T4ZA 4BVYA 1K3YA 4TOPA 4L5OA 3DVXA 2IMIA 2PVQA 1ZCPA 4I97A 2LKUA 3APQA 2HLSA 2IMEA 2TRXA 3UMAA 4TR1B 2GZYA 4XRAA 4XIHA 3I6AA 3ZFBA 1F37A 3LYPA 2C0FA 3ZIJA 4ACSA 1FVKA 12GSA 2DC5A 4GF0A 5D93A 1J0FA 1QFNA 4LL1B 2GSSA 1BAYA 2FLSA 4EL1A 1V57A 2B5EA 4JZQA 1X0RA 3L78A 3G7JA 5DCHA 3RHCA 1TKDB 5DJLA 2LNSA 2H6YA 1TJDA 4BVXB 2CAQA 3MWHA 4KNDA 2G0FA 1XIYA 3U5RE 4XS4A 3DKSA 5COHA 1JZDA 3GMFA 4KB3A 3E0UA 2VD0A 2E2MA 1ERVA 4X43A 1PA3A 4X0XA 4IS0A 2H0HA 2MBSA 2DJKA 4TR0A 1TTZA 1FVJA 2JZRA 5CYYA 2VCXA 4EDZA 2OE0A 5GSSA 1RQMA 2YJ7A 4G0IA 2H1GA 2LRNA 4POKA 4PUFC 4YAVA 6GSWA 2HYXA 3ZYWA 5HQPA 2PGTA 3GKMA 4HEA2 1M9AA 1A8YA 3QCPA 1PQNA 5IOWA 3LEFA 3TJGA 2WGRA 4ZBAA 1TRSA 1Z3EA 4TVEA 5CAXA 1M7TA 2HFDA 3VI5A 3GSTA 3Q19A 4RI6A 3TUEA 1PN9A 3KP9A 2IN3A 3BCIA 3O76A 2VM2A 3ZFLA 2H0IA 2IIYA 1SJ6A 3WT2A 1EWXA 1YEXA 4TXOB 1URMA 5KN2A 1SD9A 3HJMA 3EE2A 1OKDA 2CQ9A 1T3BA 3VWWA 2J9HA 5IMCA 3FRCA 3IR4A 1N2AA 1ERTA 4Q5QA 3FEUA 3HY2A 3QAWA 2ZUPA 3M1GA 2TRCP 4K0GA 5IIZA 3KIJA 2A2RA 20GSA 2PUKC 5DAKA 3ZITA 2LJAA 3HKRA 1EEMA 2WJUA 2XBQA 4PQIA 2JADA 1QUWA 4TRXA 1VGLA 4MPFA 1R26A 2JU5A 3QOUA 1GSSA 3WGDA 5JWRB 3GRXA 1WMJA 2VCQA 4HJMA 3UVTA 4JE1A 2YWNA 4K1FA 2OJLA 4E8EA 4FH8A 1U3IA 1UVZA 2GSRA 1UN2A 3RDWA 3TCOA 2AV4A 2OBKA 2OA7A 2RLIA 3G9BA 5AN1A 2XBIA 1VF1A 5H5SA 3PR8A 4WETA 5CO3A 2KOKA 2A4VA 5HR1A 2NTOA 4D73B 1DBYA 1BQ7A 3KGKA 3Q74A 2MYGA 4F2IA 1MEKA 3SWLA 2IWTA 1KNGA 2N5BA 3TB2A 3QDNA 4POMA 2L57A 1XWKA 5G5FA 1GSDA 4AGSA 2DJ2A 1AW9A 1WP0A 3A3TA 1GUKA 2DJ3A 2FWEA 2CZ2A 4ZL8A 3VFIA 2L5LA 2DJ0A 1CQGA 1O7UA 2YV7A 3BOAA 3L9SA 2WFCA 2B1KA 1Z6MA 4RUVA 1TW9A 3GL5A 4L0UA 3UEMA 2VLTA 3Q6OA 3CSIA 4MJCA 2MZCA 2ES7A 3FZ9A 3EURA 4XCSA 1Z7PA 1N8JA 2VM1A 3F4TA 2V6OA 3HA9A 4G19A 2EIQA 1A2MA 2HT9A 2RM5A 2KLXA 2YZUA 4POLA 2XC2A 3N5OA 1FOVA 3GKXA 2QGVA 3RAZA 1SJIA 1B4PA 4USSA 4DSQA 1EP7A 2V1MA 3IV4A 1A24A 1VF2A 2XPDA 2RIIA 2CVDA 1HQOA 2AUVA 10GSA 1HNAA 1GTBA 4MJAA 5ELAA 2H8LA 2MBTA 1A23A 4MH3A 3P90A 1F2EA 1QXHA 2GSTA 1M0UA 3LXTA 3DYRA 1Y6EA 3GFKA 2K18A 4WXTA 2WCIA 3IE3A 2M72A 2C80A 1GNWA 4EVMA 2VO4A 4MF7A 1VRSD 3D4MA 5A4WA 4EUYA 3D22A 1ABAA 1Y25A 4K6XA 5AGYA 2K8SA 4RQXA 4GTUA 2QKEA 3C8EA 3G7IA 4XTSA 5H5RA 2A2SA 5ID2B 3C73A 4NHWA 2YPMA 3KJYA 4L5LA 1MDKA 3TKSA 1OVNA 4I5QA 4WKWA 3LSZA 3TJBA 3HJOA 4IQ1A 3VWVA 4V2MA 3M9JA 4MMMA 2NBSA 3RPNA 5D9XA 4GCIA 3NZNA 3P2AA 1EV9A 2O8VB 4PXOA 1Z5YE 5GZZB 4MPGA 14GSA 2LJKA 4FIWA 1FHEA 1RK4A 3DGQA 4BVYB 1XVWA 4N11A 4ZL9A 4KDYA 3CSHA 2G2QA 3IA1A 2ZNMA 1NHYA 4KDXA 1SJZA 2OACA 3H93A 4NXIA 5F05A 3CYNA 2HRKA 3MDKA 4WBRD 1V98A 3IK9A 2ALBA 2P5RA 1EV4A 2HQTA 3FW2A 2H01A 4NHZA 2UZ8A 5LNKe 2OKAA 2H6XA 3IAS2 2YJHA 1MDJA 1YF0A 2LS5A 3R3EA 1SL1B 4ZB6A 3HVVA 5ECSA 4PTSA 5ECLB 4JR6A 2H76A 3GHAA 3H1NA 2GQLA 4NV5A 5IMAA 3QAGA 3LG6A 2VL2C 2JZSA 1XBSA 3Q18A 3K8NA 3VLNA 4XS4B 8GSSA 2OADA 2C1YA 3W8JA 3KCMA 3GURA 3EINA 3M8NA 1OE8A 5LCZA 2GGTA 3A2XA 6GSXA 4GWRA 1S3DA 5JWQB 1LJRA 3FR6A 5E59A 2M80A 22GSA 2F51A 1DSBA 1YJ6A 3ZL5A 1H4OA 4JR4A 4PX1A 4WBJA 4PURA 2P0GA 4K7NA 3KEBA 2WS2A 1XOAA 3R2QA 3W8SA 2FGXA 5JCGA 1X9MB 1MD4A 2HE3A 1K0OA 2IL3A 3D4TA 2RM6A 1K0MA 2B7JA 5F0GA 1MDIA 4AF2A 5ECPB 4OO4A 4OCFA 4HZ4A 1GSFA 1T1VA 3JCML 4LA1A 4NPBA 1FB0A 2H1AA 4XRDA 4HU7A 3WGEA 1A2JA 5F06A 3DD3A 2L4CA 1K3OA 4EXJA 2CVBA 5IMFA 3TRXA 3GYKA 3A5WA 5B6NA 2DIZA 3S9FA 1O81A 1K0AA 4WR5A 3I43A 1X5CA 1EOHA 2OE1A 3DXBA 3CTGA 5DVBA 2JSYA 1ML6A 1UC7A 4ZB8A 2C0DA 4DSSB 2CX3A 2WRTA 4JEDA 1PGTA 5DAKB 3IRAA 1DE2A 5F8BA 5IQYA 3UJ1A 3V1WA 2O87A 3VURA 1O8XA 3TJFA 2WB9A 1F3BA 5DALB 3H4KA 1KTEA 2H0GA 5G1KA 1PL2A 13GSA 2X8GA 4MZCA 2RUFA 4I6XA 2H70A 1YKCA 5ECQB 1GH2A 2FWFA 2H6ZA 5C04A 4NV2A 3GTUA 3O6TA 4MLYA 1PSQA 4KDUA 4K8MA 3UOMA 1T4YA 2R3XA 4POBA 5L71A 5D73A 1HD2A 1E2YA 2C0EA 1V40A 5C00A 4ML6A 1A2LA 2B5XA 3UL3A 4HOJA 1GLPA 2EIOA 4QL7A 1AC1A 3ZVJA 4KSMA 5H5QA 2XPEA 2KUCA 3HVSA 1XW6A 1R4WA 1T7PB 2LUSA 1PD21 4K0NA 5JCWA 1GSUA 1SL2B 3M9KA 1QK8A 3FK8A 3UIWA 2L4QA 3VK9A 4MH2A 4TN8A 5D9TA 4TR4A 1SKRB 2HI7A 2CV4A 1ST9A 2LJRA 5KN1A 3M3MA 4LMWA 3FYGA 4WR4A 1YZXA 4KF9A 3OR5A 2HRNA 4FYBA 2H73A 3CBUA 2CA8A 2GT6A 3MAKA 5A5KA 3EC3A 1JLVA 5G2ZA 3TKRA 2HXKA 3BD2A 3IBHA 3ISOA 1WRYA 1TK5B 1ZGNA 2X99A 5G1LA 4PNGA 4FQUA 3F4RA 1ZMAA 1GTUA 3GH6A 4IW9A 4NMUA 4WF5A 1TRWA 3N9JA 3IPZA 4DSSA 2I3YA 1XW5A 2IPAA 4HS1A 2IJYA 4WEYA 4Q5RA 1AUCA 5IO0A 1M2BA 1ZYQB 1OC8A 2X8CA 4HZ2A 1YQ1A 5DCGA 5DALA 11GSA 2AHEA 3EMXA 1BJXA 2H1BA 3BCKA 4JBBA 4V2LA 2H74A 2HSYA 2P31A 1AAZA 3DEXA 4XS6A 2ON5A 3H79A 4ML1A 1MD3A 1ILOA 2E7PA 2EIRA 1GULA 3GSSA 4J2FA 4PNFA 2VAFA 5IMDA 2R37A 1JZWA 4V1Ag 1Q4JA 2VL3A 3FR9A 5HR3A 1OAZA 4IBPA 1XWBA 2M46A 3KD0A 1T8EB 5KN3A 4HDEA 1TDIA 1OYJA 1M9BA 3GV1A 1IYHA 2DJJA 4OWYA 5GSTA 1SENA 3BJ5A 2C3QA 1JZRA 4KUNA 3TOUA 2PMTA 5FWGA 4BPYA 2V41A 3ED3A 1Z6NA 2EC4A 1G6WA 2PN8A 4YQVA 3HVXA 1VF4A 4O92A 3KZQA 2TIRA 2LRCA 1XWGA 4G0LA 5DDLA 9GSSA 3ERFA 3D21A 4O7HA 3DMLA 4LLRA 3VWUA 2LSTA 4I8BA 5AIXA 3VPQA 1J9BA 1XOBA 2MMOA 3VPTA 1TK0B 1HNBA 2F3MA 4K7IA 4PQ1A 2AYTA 4ILFA 1KBNA 3W6GA 2IMDA 5ABRA 1OC3A 4OO5A 3TJJA 3F3RA 1TRVA 3IXRA 1QMVA 2YNXA 1XZOA 3RBTA 6GSTA 2YANA 2HRKB 5AIVA 1F6MC 4Z7XA 3D5JA 3UBKA 2YCDA 1A8LA 1U3AA 1KEBA 2BJXA 4J57E 4GSTA 3DWVA 3GX8A 2GS3A 1ON4A 3EU4A 2H75A 2O85A 3ZRDA 1EGOA 2C3TA 4F03A 1XW9A 2YOIA 5JCUA 3E9JB 2I9HA 3QR6A 1XPVA 5ECRB 1JZOA 3FZ5A 4HI7A 2FY6A 3IK7A 1FO5A 2NPBA 1B9XC 2HRAA 3HYPA 5LD0A 4GRFA 4QQ7A 4ECBA 2OBIA 3ZZXA 4F82A 3KTLA 2H19A 4IKHA 2PERA 1DUGA 1HNCA 2FA4A 1VF3A 2VCTA 2L5OA 4EO3A 1SK0A 1V2AA 5J9BA 3F8UA 1FAAA 3KP8A 3HXSA 2WZ9A 3FKFA 4H86A 4ULXA 2LTKA 1GP1A 5B6MA 5KEJA 1B9YC 2V2GA 3QAVA 1SD8A 2FUG2 2DLXA 1GSEA 4G10A 4EE0A 4AJ6A 1GSQA 4V2NA 3GUSA 1SYXA 3PPUA 1OC9B 1O6JA 2DBCA 1TI1A 1ZL9A 4MZWA 5EY6A 3HHVA 2B5YA 4WF4A 5F07A 3GKKA 1OE7A 5CRDA 3QFBC 1F9MA 1G7EA 2R5GA 1WOUA 2FCHA 3L9UA 3FZ4A 2IFQB 5DQYA 1EEJA 2PVOC 4OFMA 2HSNB 3IOSA 3WYWA 3RPPA 2C8UA 3GX0A 4OMVA 1YKAA 1UA5A 3IDVA 1SU9A 1SK2A 4X1UA 4KCAA 1WPIA 4BL7A 1K0DA 1SL0B 1K3LA 2VUPA 4G0KA 1TRUA 1PKZA 1M2DA 2JACA 3EVIA 4MCUA 3F9UA 1O73A 4MP4A 1THXA 3ZVJD 3IHQA 4CW9A 3J7Yk 3QPMA 1M2AA 5IMVA 1V58A 5BMUA 1GSYA 1G7OA 2HSHA 2I81A 3APSA 3HJPA 4I2TA 5ELGA 2GVPA 5IPHA 2HNLA 4ZILA 4QL9A 1RW1A 1PMTA 3ME8A 1JFUA 2WDUA 4KGIA 4ZBBA 3ERGA 3GTUB 4XHMA 1NSWA 3US3A 4MJEA 2C3NA 3SBCA 2IMFA 2K6VA 1XXUA 2PU9C 4DEJA 3UVHA 2H30A 2V32A 3LQ7A 4KAEA 5D9VA 1EZKA 4YQMA 2KHPA 1QQ2A 2B1LA 3AY8A 3KH7A 5DJMA 1WIKA 3CTFA 3ZLPA 3TRPA 3WD6A 1OC9A 4K7OA 2F8AA 3H8QA 3QFAC 5J41A 3G7YA 2B3SA 3LGCA 2HZEB 3L4NA 1W4VA 1QGVA 2HZFA 2REMA 1EGRA 1NW2A 2GZPA 4JRRA 1FG4A 2HSMA 3C1RA 3WGXA 5GAND 2IFQA 5CNWA 3PINA 4ZXGA 3CRUA 2VL2A 4KCEA 5JWOB 4RI7A 1THOA 2L6CA 5KN0A 1AQVA 2YN1A 3KXOA 3F3QA 6GSSA 2QSIA 5ECKB 3FY7A 6GSYA 2R4VA 2CX4A 3BBYA 5J4UA 4G9HA 3LJRA 1X5DA 1TP9A 3TRQA 5DQSA 2P5QA 1I5GA 4IN0A 1X9SB 2L6DA 4J56E 4GSSA 3L9VA 1TK8B 3C71A 2O89A 4PQHA 1BX9A 2Z9SA 4TW5A 5J3RA 1K0NA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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