4PGTA

Crystal structure of hgstp1-1[v104] complexed with the gsh conjugate of (+)-anti-bpde
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
210
structure length
209
Chain Sequence
MPPYTVVYFPVRGRCAALRMLLADQGQSWKEEVVTVETWQEGSLKASCLYGQLPKFQDGDLTLYQSNTILRHLGRTLGLYGKDQQEAALVDMVNDGVEDLRKYVSLIYTNYEAGKDDYVKALPGQLKPFETLLSQNQGGKTFIVGDQISFADYNLLDLLLIHEVLAPGCLDAFPLLSAYVGRLSARPKLKAFLASPEYVNLPINGNGKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and function of residue 104 and water molecules in the xenobiotic substrate-binding site in human glutathione S-transferase P1-1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (GLUTATHIONE S-TRANSFERASE)
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 209
sequence length 210
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 1999-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4pgtA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4pgtA01
1O73A 1TRSA 5D9WA 4V2MA 1TXXA 3ZL5A 2YWNA 4G10A 1A2LA 1MDJA 4HJMA 4XS1A 1VF2A 3DWVA 3L9SA 5D96A 2PVOC 3IK9A 4HU7A 4K1FA 1ON4A 3KP8A 5AISA 2H73A 5G1LA 1ILOA 4OO4A 2LSTA 4K9ZA 4DSSA 4TVEA 2L6DA 3LFLA 2LTKA 5FWGA 1BQ7A 2H1BA 4ID0A 4OCEA 2JSZA 3IA1A 1V98A 2I9HA 1Z3EA 4G9HA 3ZIJA 3EYTA 4TOPA 4RI6A 4JR4A 4YH2A 2WZ9A 5FT3A 1GSDA 1GUHA 1XXUA 3BD2A 3VPTA 3H79A 3DIEA 2L4QA 4I2TA 4DVCA 4KGIA 3EC3A 4MDCA 1WMJA 2FWHA 3TKPA 1GTIA 3WD6A 1F2EA 2HSNB 5D8IA 2YNXA 2FY6A 2WDUA 2WB9A 1Z5YE 1YKCA 2P5QA 2FA4A 4PNFA 4K6XA 1SK1A 3QAGA 3JCML 2JZTA 2M72A 2PUKC 2EIOA 2E2GA 3EE2A 2CVKA 1SU9A 2IWTA 2ZUPA 2OA7A 5IOXA 2LNTA 2H74A 1SL2B 3G7YA 2VOCA 4WF5A 5IMVA 4Q5FA 3F4TA 1TDIA 2JSYA 4EVMA 2MZCA 3GX0A 1EP8A 2QGVA 1WOUA 4OFTA 3ZFLA 3V1WA 3M1GA 3HZ4A 3IXRA 5ECOB 3F4RA 2KLXA 1EP7A 4POMA 1VF4A 3SWLA 4F03A 1E6BA 1SD9A 3R2QA 3IOSA 2K6VA 3D5JA 1U3AA 3A2VA 1XVQA 2H70A 4N30A 2DLXA 4XHMA 2M80A 2IIYA 2A4VA 4N11A 1G7OA 2H8LA 3L0HA 1JZWA 2GZPA 6GSYA 1ZGNA 1V57A 2I81A 1PKZA 1G0TA 3WYWA 4G0IA 2YPMA 2C3QA 4FYCA 1T4ZA 3GURA 4YQVA 3GX8A 3L9UA 4K7OA 3QOUA 2R4VA 3EU4A 1HNAA 3F8UA 4IKHA 4PQHA 3J7Yb 5CREA 4EDYA 3FZAA 1GTBA 1XIYA 5G5FA 5IPGA 2HT9A 2GZZA 2VM1A 2E0QA 2VD0A 1TTZA 2HZEB 2QKEA 1OE8A 2H19A 1Y6EA 2VAFA 2A2RA 3EINA 3LXTA 3G9BA 4OCFA 2WFCA 1GSQA 3VWUA 4PGTA 3TRXA 14GSA 1ST9A 3Q18A 5D9VA 2P5RA 1PA3A 3QFAC 2QC7A 1XVWA 1EGRA 1G6WA 3ZMKA 1W89A 3SBCA 6GSSA 3FKFA 3QCPA 1TU7A 5JCGA 4ZL7A 1DUGA 4K7NA 3HJOA 3WGEA 2R5GA 2CZ3A 5LD0A 5J4UA 5JWRB 3FZ9A 2IPAA 1PRXA 4TXOA 2H6XA 4G19A 1PN9A 2AAWA 1DE1A 2RUFA 2ES7A 1XBSA 2V32A 4GXZA 3HDCA 1HYUA 3APOA 2H66A 1AQXA 4IN0A 1R26A 4NHWA 4MJAA 3C73A 3TOTA 2HSYA 1AAZA 2YOIA 1TRWA 1BG5A 5HR0A 1RW1A 4I2UA 1ZYEA 3ED3A 4HZ4A 4I6XA 1W4VA 3ZZXA 1S3CA 1GTAA 1J0FA 5CRGA 3DRNA 4AGSA 2G0FA 3APSA 1O81A 4ILFA 1B8XA 13GSA 2YN1A 4GSSA 4L0WA 1EV9A 2MBSA 3A2XA 3FR6A 4WBRD 4IELA 5ECHB 1TJDA 2HXKA 1GULA 3FW2A 3EU3A 4OFNA 1SJIA 1PD21 3GKNA 1RQMA 4QQ7A 1O8WA 2XC2A 4ZIJA 4D73B 1QGVA 1SYXA 5F07A 4BVYB 3A3TA 4RQRA 5DVBA 1XWKA 5DJLA 2R6KA 2JU5A 4GSTA 22GSA 1AC1A 4IP1A 4KF9A 2VCWA 1ABAA 3LORA 2LRNA 2L4CA 2R2JA 1Q4JA 4ML6A 5D9XA 3DVXA 4TR3A 1CQHA 3I9V2 3C71A 4BA7A 1SK0A 1TI3A 2CVBA 4JE1A 2C0EA 3I69A 2NTOA 3UAPA 4PQ1A 3GTUA 4ZL8A 1OC9A 2DIZA 4XIHA 3EMPA 11GSA 4N10A 1ZOFA 3FEUA 2D2ZA 3TKSC 3QR6A 2K9FA 4J56E 4AJ8A 3TOUA 2PN8A 2OACA 1A0RP 2F8FA 1O85A 1BX9A 1YY7A 4MH2A 4KDUA 3E9JB 4Q5NA 3ZRDA 3GN3A 1PSQA 2L5OA 3D4TA 1K0OA 5D73A 4F0CA 2VCVA 3C1SA 5CRHA 4MLYA 5CAXA 1BYEA 1MD4A 2HNLA 2GGTA 4KUNA 1YEPA 3WT1A 2AV4A 2X64A 3UEMA 1AXDA 1BEDA 4MPFA 4EDZA 4KX4A 2MMAA 5D9TA 2XBIA 3F6FA 1EWXA 3OR5A 4NHZA 3RHCA 2F9SA 3GNJA 3U6VA 4ECJA 2GSRA 4HJ2A 4OO5A 4CDOA 2C3TA 2BJXA 5ELAA 2H6YA 1VRSD 2MMOA 1RK4A 4XS4A 5J5NA 1GSFA 2L57A 1EV4A 4DSSB 1JZDA 3ISOA 5H5RA 1ZYQB 1M2AA 5ECMB 2FLSA 3IDVA 3D21A 4KE3A 2FNOA 4YAPA 1A8YA 1JHBA 4IBPA 3NOFA 3EURA 2YJ7A 4EE0A 1UA5A 4L8EA 2L6CA 2O8VB 1U87A 3AY8A 1OAZA 2GSQA 2KP2A 5G2ZA 4ZL9A 5ECLB 2DMMA 1Q98A 1I9DA 4NPBA 2ALBA 4KSOA 3P7XA 1K0DA 4O32A 4DEJA 1F3AA 2OE3A 4EUYA 4USSA 3F9UA 4KCAA 3VFIA 3KP9A 4IW9A 2HRKA 4K2DA 2LV3A 4BPYA 1TOFA 3P8WA 3TRPA 3M3MA 1ERWA 1ACVA 1PX6A 2FWFA 1DSBA 3QPMA 4KA0A 5DQYA 1JLWA 3FYGA 1U88A 4X1UA 3KTBA 2V6KA 2C8UA 3LJRA 1T3BA 1GUKA 3KD0A 2B7KA 4MJBA 3UJ1A 2FHEA 3HVXA 3ZITA 2HSHA 3APQA 1GSSA 2HLSA 2YANA 4EC0A 5LCZA 2H1GA 3ZREA 2DJJA 3EVIA 3IE3A 1F6MC 3DKSA 3KIJA 3ZVJA 3DD3A 2VL2C 2AYTA 4POBA 4POKA 3TKSA 5DAKA 5INYA 1WRYA 1WWJA 3TJBA 4GCIA 4MZBA 2VLTA 3DYRA 3HA9A 3BCIA 1KEBA 3Q19A 4L5LA 2MMNA 2AHEA 1K0NA 2K8SA 4WEYA 2O87A 2HSMA 1V58A 5GAPD 3RAZA 1WE0A 3L4NA 4KDXA 5DBQA 5AIXA 1Z7RA 1JLVA 3G7JA 3UBKA 3GFKA 1DBYA 5IMFA 5GSTA 3MNGA 2ZNMA 5IM9A 1GSYA 3F6DA 2CX4A 2RM5A 3IHQA 4NWYA 4EF0A 2C1YA 3PR8A 1V9WA 1R5PA 5KN1A 3M9JA 2WCIA 1C72A 2NVLA 3KGKA 4MZWA 3DGQA 3CYNA 2QSIA 4MCUA 2CAQA 3D6IA 3KJYA 5DCGA 4Q5RA 1HQOA 1GNEA 2M46A 2CV4A 2JACA 3GH6A 1YEXA 3CSHA 5DJMA 1AIUA 1GWCA 4ECIA 3N9JA 1M2DA 1M99A 1WIKA 2ZCTA 1XPVA 5B7CA 5G31A 1IYHA 4TXOB 3LYPA 4MPGA 1T00A 4HDEA 2DJ3A 1B9XC 2PERA 2LRTA 5DQSA 1B4QA 2B3SA 2HQTA 5A4WA 2OBKA 3VWWA 2I1UA 4BVXA 3C8EA 2GTUA 3TRQA 2V1MA 4FO5A 3KM6A 5G30A 19GSA 3S9FA 3UBLA 2J23A 3ERWA 1SKRB 4IHUA 2F51A 5DALB 12GSA 4H86A 5IIZA 2EC4A 2H75A 4HU9A 4K8MA 1J08A 4ACSA 3FZ5A 2CAIA 3GRXA 4L5OA 4ML1A 3IK7A 4AJ7A 4ZBBA 4BWSA 2HE3A 2VUPA 2J9HA 5CP1A 3RDWA 1K3OA 2E2MA 4PNGA 5AN1A 2HRAA 4ECCA 2B1LA 3CRUA 3GH9A 4I97A 4V2NA 2VL2A 4OMVA 2PPTA 4JRRA 3KMNA 5HFGA 1YF1A 4V1Ag 6GSTA 3K8NA 1ML6A 1X9MB 1PKWA 4LMWA 2ON5A 4PXOA 1PL1A 2V2GA 3LSZA 2I3YA 2TRXA 3MAKA 3QAVA 3LEFA 2B5XA 2B1KA 2IFQA 2GSTA 1A8LA 1MTCA 4OD7A 2GQLA 4YAVA 5HR3A 1TU8A 3TDGA 1AUCA 3TB2A 3ERGA 2VCTA 5IO2A 1TRUA 3H4KA 1MEKA 3ERFA 1WPIA 2L59A 1TK5B 4G0KA 4XRAA 2X8CA 4LA1A 4V2LA 5LNKe 5CRDA 3N5OA 1UVZA 3GV1A 3GA4A 1EOGA 5J9BA 2FUG2 1VF1A 3HCZA 3VI5A 4MJEA 5D93A 2UZ8A 5L71A 1GL8A 1SYRA 3KH7A 3WGDA 4PURA 5AIVA 4DSRA 5IPHA 1SL1B 2DJ2A 1YQ1A 1T8EB 3HHVA 2HZFA 4QL9A 4HUAA 5COHA 1KBNA 5KN2A 1PMTA 4JZQA 2GDRA 3Q6OA 4HEA2 1SENA 3EWLA 1LBKA 3TKSE 2C4JA 2MMZA 4XS4B 4DSQA 4MA9A 1M7TA 3GHAA 2LUSA 2GT6A 3IR4A 3C7MA 4KB3A 1A2JA 4LL1B 3VI7A 5CRWA 4J2FA 2DSAA 2YWOA 1U6TA 1YF0A 3GKKA 4ECBA 5ECNB 16GSA 2C0FA 2RUEA 4HQZA 3MWHA 2V6OA 3IAM2 4BL7B 3HYPA 4EXJA 1ZZYA 2CQ9A 3BJ5A 3KH9A 1AQVA 4IJ3A 1OYJA 3I43A 4HI7A 2GZYA 3UARA 1ERVA 3G7IA 3FR9A 3H1NA 3O76A 3FZ4A 1OKTA 3EMXA 1TW9A 5CO3A 2O85A 7GSSA 1SL0B 3IC4A 3LYKA 1SK2A 4E8EA 4EO3A 3GSSA 3BOAA 2KHPA 3PH9A 3VLNA 2H0GA 5EL8A 4TR4A 1USBA 1S3DA 1HNBA 2FWEA 3O6TA 4NMUA 2VIMA 2VCQA 4O92A 2YV7A 4PTSA 1Y25A 2V41A 2HZEA 1QMVA 1LU4A 5EY6A 1THOA 1FAAA 4GQFA 2P31A 4F2IA 4ZBDA 5DAKB 2LRCA 4TR1B 5E4WA 3UMAA 5ID2B 4I5QA 4JBBA 1N8JA 3LWAA 3HKRA 1KNGA 1URMA 5CNWA 1B48A 4G0LA 2HSMB 2WULA 2YP6A 2LEGA 4NV5A 4FQUA 3MDKA 4TRXA 3VURA 5IOWA 4TKYA 4MK3A 17GSA 1GSUA 4XRDA 4MMMA 3GUSA 4Q5QA 2DIYA 3TJGA 1OC8A 3MSZA 2IMKA 1G6YA 4MF7A 3H8QA 3F4SA 2IJYA 5FHIA 3DXBA 3L78A 1GLQA 3ZFBA 4BWQA 5EVOA 2DJKA 1YDKA 3KMOA 1ERTA 2CVDA 1XWAA 1XZOA 3BCKA 1PQNA 1X0RA 2B5EA 1EEMA 1JZRA 2ON7A 3CSJA 3UOMA 5F8BA 4HS1A 2N5AA 3I6AA 4LLRA 3VPQA 3KCMA 3WGXA 1JZOA 6GSXA 1E2YA 1MDKA 3IV4A 1GH2A 1S3AA 1Z6MA 4N0ZA 1F37A 1X5DA 3M8NA 4NV2A 2FD3A 2P0GA 3FR3A 1XOAA 3GKXA 5C00A 4IS0A 4CW9A 1PL2A 1OC3A 1XWCA 1B4PA 3TUEA 3DEXA 2VD1A 3HVSA 4OFMA 3ME7A 4D73A 4BVYA 3HZ8A 2PBJA 1B9YC 3ZLPA 1K0CA 1O8XA 5JWQB 2B5YA 20GSA 2G2QA 4NAXA 1K0MA 2LS5A 1FOVA 5F0GA 3WT2A 5H5SA 3W6GA 2XPDA 2GT5A 3RPNA 1XW6A 3IRAA 4GTUA 1F9MA 4FYBA 1M0UA 4TN8A 3ZYWA 2K18A 4G2EA 3GKMA 4X0XA 1K3YA 3CMIA 3TGZA 3LQ7A 2X8GA 2FGXA 4ZB9A 5KN0A 5ECRB 4KSMA 5ELGA 3UIWA 2CT6A 5IO0A 3LGCA 5HR2A 4KH7A 2OJLA 2OBIA 4YQMA 3TKRA 1QK8A 3QAWA 1R4WA 3ZMLA 1EZKA 2E7PA 3PINA 1TK0B 10GSA 4O7HA 6GSUA 2VL9A 4ZBAA 2RM6A 1UN2A 5CYYA 2LJRA 1NM3A 3ME8A 1GNWA 2IFQB 1TRVA 3GSTA 1MDIA 5HFKA 1DE2A 1EEJA 5HFIA 3GIXA 5IMAA 3A5WA 2BMXA 3M9KA 2NBSA 4JU5A 2YWMA 4RUVA 2VL3A 8GSSA 2XBQA 2PGTA 4K0GA 1O6JA 2GVPA 2WGRA 1WP0A 2XPEA 2X8HA 5A4UA 1QQ2A 1ZCPA 4JEDA 4GQCA 2NPBA 3QFBC 5B6NA 4EKZA 1N2AA 4IVFA 9GSSA 1TK8B 1NHYA 2B7JA 2H0HA 3UL3A 3CXGA 3W8JA 1XW9A 5E59A 3GMFA 1J9BA 2CX3A 2RLIA 4K0NA 4FIWA 3ZTLA 5GAND 3D4MA 3NIVA 1FW1A 2YJHA 3IC8A 4AF2A 2K8VA 3FRCA 2OADA 1XOBA 3P90A 3QMXA 3IBHA 3QDNA 3UVHA 4HQSA 4LMVA 2H01A 5H5QA 1UC7A 3ZIVA 1BAYA 5JCWA 1V40A 4FYUA 1X9WB 3HY2A 1X5EA 4KDYA 1SKWB 1KTEA 18GSA 2GQKA 5G1KA 4CHSA 2JADA 2DC5A 2OKAA 4MJCA 5JCUA 4ISDA 1QXHA 1GP1A 2GQMA 3TKQA 1PGTA 4WR5A 2FCHA 4JR6A 4PUFC 1FHEA 1U3IA 2PWJA 2EIQA 1QFNA 2KOKA 1VGLA 2AJQB 1LJRA 4TR0A 2EIRA 2YZUA 3VWXA 3TJFA 2LQQA 3C1RA 3KEBA 3CBUA 4X43A 1YJ6A 1M9BA 4ULXA 2HRFA 1FB6A 2WJUA 4GWRA 3VK9A 1OVNA 1A23A 1XCCA 2FWGA 4PX1A 2VLUA 5DDLA 1THXA 5HQPA 5F06A 4V1Ap 2IN3A 1JFUA 2F8AA 4IJIA 4P3YB 3H93A 4J57E 3F3RA 4IQ1A 3GTUB 5ENUA 4QL7A 1FG4A 1OC9B 2TRCP 5G5EA 5IMCA 2B6MA 5ECQB 3TCOA 2MBTA 3TJKA 1I5GA 2LNSA 4KCEA 4WR4A 2VCZA 1PX7A 3E3EA 4WBJA 4RI7A 4YQUA 2WRTA 1K3LA 4XCSA 5KN3A 1VF3A 2YCDA 1G7EA 2DMLA 5JWOB 4TW5A 2FA8A 1OKDA 3ZVJD 3GL3A 2IMEA 2H1AA 2N5FA 2MYGA 2PVQA 4KAEA 3QD9A 3DMLA 1TP9A 3LG6A 3A2WA 1YKAA 4GLTA 4GSNA 3VWVA 3CTFA 1EGOA 4ZB8A 4MZCA 4IQAA 3LXZA 5A4VA 1FB0A 1GRXA 1X5CA 3CTGA 4E8HA 1M9AA 4OWYA 1BJXA 1QUWA 3CRTA 3J7Yk 2F3MA 3HVVA 2PU9C 5DALA 3RPPA 3W8SA 4KNDA 3FHKA 1M2BA 1YZXA 3HJMA 5GZZB 4O5RA 2GLRA 1XFLA 2VLVA 3O3TA 5ECPB 3P2AA 2CA8A 2H30A 3NZNA 1AQWA 1SKSB 2HFDA 1SD8A 2VCXA 1NSWA 2IMIA 2HRKB 5ECKB 5A5KA 2AB6A 1HD2A 3UVTA 2YZHA 1GSEA 1K0AA 3US3A 2VM2A 2IMFA 2H76A 2HI7A 4Z7XA 2H1DA 1F3BA 3PGTA 4F0BA 5IQYA 2YWIA 2C3NA 1EOHA 1FVJA 2CZ2A 1MD3A 2HYXA 4K7IA 1WJKA 1V2AA 4RQXA 1A2MA 1ZMAA 2JZSA 4HOJA 2C0DA 3KZQA 5ECIB 5B6MA 3F0IA 2WS2A 2R3XA 4WXTA 4MH3A 1R5AA 2O89A 4PQIA 3HD5A 4ZB6A 5HR1A 5ECSA 5BMUA 2HRNA 5IMDA 3R3EA 1AW9A 4KW6A 2C80A 4PUAA 2OE1A 2H71A 4I8BA 4F82A 2VO4A 3PPUA 4IGJA 3FK8A 3D0ZA 2AUVA 3D22A 3IPZA 1Z9HA 3KXOA 5AGYA 4MF5A 1NHOA 1TKDB 1T4YA 2DJ0A 3CSIA 4TXVA 4EL1A 3HXSA 4GRFA 1GTUA 5J3RA 2GS3A 4NXIA 3FY7A 1CQGA 2OE0A 2L5LA 6GSVA 5KEJA 2H72A 3E0UA 1Z6NA 2C0GA 5C04A 2O7KA 1XWGA 2KUCA 2X99A 2LQOA 5J41A 2DJ1A 3M0FA 2DBCA 6GSWA 2A2SA 4IP6A 3GL5A 3U5RE 4AJ6A 2LJKA 5J9CA 4XS6A 2RIIA 1IYIA 1K0BA 4GF0A 1A0FA 4HZ2A 1T7PB 2H0IA 3RBTA 4MABA 5DCHA 4XTSA 4BL7A 1H75A 1ZL9A 3GYKA 4WF4A 1FVKA 1FO5A 2IL3A 4BVXB 1XWBA 2LKUA 2XHFA 2JL4A 2NDOA 2IMDA 1R7HA 2LJAA 2REMA 4WETA 1X9SB 2BTOT 1XW5A 1Z7PA 1GLPA 1TI1A 2TIRA 1T1VA 4FH8A 1HNCA 2N5BA 1H4OA 3RHBA 1SJ6A 3DVWA 5IMZA 2GSSA 1ERUA 4LL4B 1OE7A 1A24A 4L0UA 4MP4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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