3WD6A

Crystal structure of bombyx mori omega-class glutathione transferase in complex with gsh
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
242
structure length
242
Chain Sequence
NINFNTKHLRKGDPLPPFNGKLRVYNMRYCPYAQRTILALNAKQIDYEVVNIDLIDKPEWLTTKSAFAKVPAIEIAEDVTIYESLVTVEYLDEVYPKRPLLPQDPLKKALDKIIVEASAPIQSLFIKILKFSDTVNEEHVAAYHKALDFIQEQLKNRGTVFLDGSEPGYADYMIWPWFERLRAFAHDERVRLEPSKYSLLLEYIDNMLKDSAVSQYLIPLEILAKFHEAYTKKERPNYELLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Three-dimensional structure of a Bombyx mori Omega-class glutathione transferase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Transferase
source organism Bombyx mori
molecule keywords Omega-class glutathione S-transferase
total genus 94
structure length 242
sequence length 242
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-06-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3wd6A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3wd6A01
2A4VA 2LJAA 1R4WA 3VLNA 2OKAA 3UVTA 1A8YA 2L57A 2GSSA 2HSMA 1BG5A 4EL1A 2H71A 4NAXA 2B7JA 1IYHA 3KJYA 4GSTA 1GP1A 2PMTA 1F37A 2H01A 2JU5A 5G2ZA 5D9VA 2HFDA 2XC2A 4K1FA 1O73A 3HCZA 5C00A 5EY6A 3ZZXA 1SYXA 5H5RA 4IP1A 2ZNMA 5CO3A 2JSYA 3U5RE 4BL7A 4BVYA 3QDNA 4WBJA 3ZRDA 2YWOA 3CRTA 5KEJA 1PX6A 2M72A 3WYWA 3IPZA 1YY7A 3RHBA 4K0GA 2P0GA 1X5EA 5ENUA 1O8WA 2C8UA 1X9SB 1A2MA 1ILOA 3D0ZA 4KSMA 2V2GA 5EL8A 2JADA 3CMIA 1THOA 1FAAA 1GTUA 1YJ6A 5J9CA 4MP4A 5AN1A 4MJAA 1ABAA 4YAPA 2R2JA 2B6MA 1SJ6A 3TUEA 1HQOA 5ECQB 2WB9A 3GKNA 2B7KA 3L9VA 1SK0A 4V1Ag 1TJDA 1GNEA 4OCFA 2IFQB 2HZEA 4NXIA 3E0UA 6GSTA 4TOPA 2C1YA 5EPFA 3US3A 1GTIA 3GSTA 3F4RA 2RIIA 1F2EA 3KP9A 3IV4A 3GH6A 3VWWA 1E2YA 3G7IA 1JLVA 1N8JA 3KZQA 1DSBA 1Z7PA 4YH2A 3HKRA 5CAXA 2JZTA 2PERA 4O92A 1PQNA 3KH9A 4D73A 4RI6A 3MAKA 4K7NA 1TK5B 2F9SA 3H4KA 1J0FA 1S3DA 2JZSA 1GSEA 3GUSA 4KNDA 4DVCA 3EMPA 3L78A 2O89A 2YP6A 3APQA 1G7EA 2H1DA 1T3BA 4KE3A 1GSDA 1HYUA 4WXTA 4KGIA 1A2JA 3GYKA 4TR4A 5CRWA 3D4TA 2AHEA 5ECRB 5DJLA 3ERFA 1R5PA 5E59A 4N10A 1KEBA 5LNKe 4E8HA 1XIYA 4MJCA 1V57A 5DDLA 3TRQA 3PH9A 4KAEA 3UARA 3KCMA 4TR1B 4WEYA 1EGRA 4O7HA 1K3YA 4DEJA 4XS6A 5HR3A 2H0GA 3CSIA 4O5RA 2WS2A 1AQVA 2M46A 2XBIA 4F0CA 5ECOB 3D6IA 2H75A 1Z3EA 1SENA 2KLXA 3HJOA 4TR0A 1TW9A 6GSUA 2GQLA 1Q98A 1OVNA 3G9BA 3A5WA 1G7OA 1SKWB 3DIEA 1O85A 4MF6A 2HI7A 2HLSA 3DD3A 3UBLA 2DIZA 1SD9A 2GQKA 3F3RA 5DBQA 1FOVA 1FG4A 3RAZA 5C04A 1GWCA 2VM1A 1Y6EA 2JZRA 1T4ZA 3WGXA 2A2RA 5AIVA 2DJ0A 1PL2A 4BPYA 4MH2A 5F07A 1HNBA 2G2QA 22GSA 2R4VA 3FZ9A 2CT6A 1SL2B 4YQUA 1I9DA 2VCVA 4XRAA 2RM5A 5IMVA 4XS4A 5H5QA 3LSZA 2TRCP 11GSA 5CYYA 4TN8A 2L4QA 4XCSA 3EVIA 2K18A 5J3RA 2YN1A 2B3SA 1N2AA 2O85A 1PN9A 2LRTA 4EDZA 2HXKA 3ZFBA 1M2DA 4ACSA 2CQ9A 5B8BA 2J23A 2R37A 4AJ7A 1TK8B 2VL2A 2F8FA 3IR4A 5ECHB 4JRRA 1NW2A 1I5GA 3GMFA 4F9ZA 2YWIA 1XBSA 3DXBA 3QPMA 5HFKA 5HR2A 4IJIA 5DALA 1V2AA 2IPAA 5IOWA 1GSFA 1HD2A 4NPBA 1M2BA 1TTZA 1CQHA 1U6TA 3VI7A 2RUEA 2YPMA 3M1GA 5INYA 4HU7A 4CW9A 4GQCA 2GSRA 4Q5QA 5ABRA 3P8WA 3HHVA 4IP6A 3VI5A 3TJGA 3F3QA 2KP1A 3GX0A 3ISOA 2I81A 1M9BA 1UA5A 3GIXA 3DEXA 4L5OA 1H75A 4FO5A 3MWHA 3ERGA 2H76A 5G1LA 3HY2A 1FO5A 1E6BA 1A24A 2CA8A 1M9AA 2FD3A 1OYJA 1Z7RA 5D9TA 1GUKA 1ST9A 4JU5A 3LG6A 1QUWA 4IHUA 1XWAA 1QXHA 4TW5A 3EU3A 4NHZA 2EIRA 1MTCA 1VGLA 4K8MA 2DJ3A 1TP9A 4LMVA 3L4NA 4F2IA 17GSA 1YKAA 1M2AA 2YV9A 4ZB8A 1F9MA 4RUVA 5JWRB 4ECBA 3M8NA 2NPBA 4ZL8A 4POBA 4MDCA 2H30A 5ECKB 1FB6A 4EDYA 5COHA 4OFMA 4DSRA 1T00A 2H6YA 2C0FA 3ZVJA 1H4OA 1XWKA 5F0GA 1UVZA 3GKKA 2MBTA 3CSHA 3GL3A 4V2MA 1AW9A 4MZBA 4J57E 1MDJA 1KNGA 1QK8A 5J5NA 4MCUA 2FA4A 2IMIA 2E0QA 1ERUA 1A8LA 2L5OA 1SK2A 3UOMA 4MLYA 3WT2A 5JCGA 4ECCA 6GSWA 3L9UA 2PUKC 4TKYA 2OJLA 1BAYA 1QFNA 3IBHA 2CZ3A 1UN2A 3Q74A 1YDKA 2R5GA 2H8LA 4KF9A 5ID2B 3FY7A 5D8IA 2H1AA 3FR3A 4G10A 3GTUB 2K9FA 3TCOA 1FW1A 4G0IA 2HRKB 1ERVA 3ZYWA 2G0FA 3PINA 1QGVA 2K8VA 4ZB6A 2ZCTA 5IMCA 4CDOA 2AJQB 2OADA 2DMLA 5DQSA 2FWGA 2A2SA 1WPIA 1VF3A 3KP8A 1GRXA 2PPTA 1PSQA 5J41A 3WD6A 4AGSA 4X1UA 3WGDA 3U6VA 4HUAA 1T7PB 3F8UA 4OFNA 5CRHA 2VLUA 2IFQA 5IPGA 2DJ2A 5D73A 4PX1A 1YF0A 3BJ5A 1EV4A 5L71A 4KW6A 1K0AA 2B5EA 4F82A 1KBNA 4I6XA 1G0TA 2WRTA 4IQAA 18GSA 1AUCA 4ILFA 1XCCA 2X64A 5A4VA 2I9HA 2V41A 1AC1A 5IQYA 1YEPA 3EC3A 2DBCA 3TOUA 1EOGA 4HQSA 4OO4A 4X0XA 2LQQA 5IOXA 1B9YC 2VCQA 3LORA 1TRWA 4FIWA 1M7TA 1MEKA 3NZNA 3H8QA 2E2GA 2K6VA 2GTUA 2VM2A 2L6CA 1GH2A 1XOAA 3Q18A 3FHKA 1ZMAA 2FLSA 2HNLA 2CV4A 4PURA 2F8AA 1M0UA 3GHAA 3VPQA 3C1SA 4HQZA 1UC7A 2HSHA 1GUMA 3HJPA 4PQHA 4RQRA 1EP8A 5DCHA 1GLQA 4ECJA 3C7MA 1XW9A 4LLRA 2EIQA 1OC3A 2DJKA 2V1MA 4OD7A 5LCZA 3M9KA 4HEA2 5DVBA 4EC0A 1YF1A 2GDRA 4EKZA 3FR6A 3QD9A 3KTBA 3TKQA 3BCKA 1SYRA 1ZGNA 2H1BA 2OBIA 1R5AA 3APOA 3ZIJA 1OAZA 2LNSA 3UBKA 3HA9A 4GWRA 2QSIA 1OE8A 4L5LA 5ECLB 1O8XA 2LJRA 1TXXA 1BYEA 5FHIA 2H72A 1TOFA 3BCIA 1JZOA 3RHCA 5A4WA 1EOHA 2PU9C 4I5QA 4AF2A 5LD0A 4LMWA 5KN1A 1PL1A 1S3CA 2QC7A 3KD0A 1V98A 3G7YA 3VWUA 5GAPD 1S3AA 2O8VB 4DSSB 1TRUA 4KDUA 3TJBA 4MMMA 4MJBA 3QCPA 3R2QA 3BOAA 3DKSA 1SD8A 3PPUA 2IJYA 1GSSA 4WETA 1RK4A 5DJMA 3PR8A 4HU9A 1A0FA 2B1KA 2YNXA 3F4SA 2GZZA 5DAKB 2CVDA 2PBJA 4OCEA 2M80A 2KHPA 3NIVA 4K0NA 1PKZA 5F8BA 1AIUA 4XIHA 1ML6A 5G5FA 1XWGA 3M3MA 1OKDA 1ERTA 1ZZYA 4V1Ap 3G7JA 3TKRA 5CP1A 3TOTA 3TKSC 2DJ1A 3F9UA 3GNJA 5D9XA 2EC4A 3IE3A 4GTUA 1TI3A 3P7XA 3GX8A 1ZYEA 2RM6A 2L59A 2YZUA 4G0LA 8GSSA 1WWJA 4YAVA 2DC5A 3CRUA 4PQIA 3LWAA 4BWSA 3FZAA 2IMEA 3ED3A 2YWNA 2LKUA 1GSQA 1XW6A 1XOBA 4XRDA 2FA8A 2MMOA 2VLTA 4WR5A 1B8XA 4IJ3A 1OC9B 2YZHA 4PTSA 9GSSA 5D9WA 5JWOB 3LXTA 2CAQA 4PGTA 3A3TA 5J4UA 1T8EB 1RQMA 3I69A 1F6MC 1HNCA 3C1RA 1MD3A 2GZPA 4ULXA 3UL3A 1AXDA 3WGEA 1U3IA 2BMXA 3WT1A 2H73A 1ZYQB 4USSA 1EWXA 2IL3A 2V6OA 4MPFA 3DWVA 4BWQA 3QR6A 1JLWA 4D73B 1EEMA 3FW2A 1Z5YE 4KDYA 2K8SA 2YJ7A 3UIWA 1EV9A 4ZBAA 2GT5A 4ML6A 1O7UA 3HZ8A 2C3NA 2VL3A 4EXJA 1Y25A 3QMXA 4LL1B 5JCUA 2H6XA 3M9JA 3VWVA 3BBYA 3UJ1A 4I8BA 2PN8A 4FQUA 3IC4A 5D93A 4JR6A 2IIYA 16GSA 5DCGA 3LGCA 3TJJA 5CRGA 4G0KA 4GCIA 1XVWA 3ZVJD 1K0NA 1WJKA 1PMTA 2VO4A 2YOIA 2GZYA 1SL0B 2CX4A 2HRAA 4ZB9A 19GSA 1Q4JA 3DMLA 1K0MA 4TXVA 1FHEA 4P3YB 1THXA 2VCTA 2TIRA 3DVWA 5ECIB 4MABA 2LRCA 1PRXA 2YCDA 3APSA 3TKSE 4BVXB 2H0HA 3LYKA 5G1KA 3LYPA 2UZ8A 1X5CA 2D2ZA 2C80A 2KOKA 1WE0A 2KP2A 1XWCA 1GUHA 1EZKA 2H66A 1MDIA 4EO3A 3VPTA 4MF5A 4QQ7A 4ZIJA 2O87A 4NV2A 2H0IA 4RQXA 3FEUA 1K3OA 2N5AA 1FVKA 4I97A 5ID2A 3D21A 1YZXA 5ECSA 4K9ZA 1J9BA 2B5XA 3GTUA 1SK1A 4V2NA 3KTLA 2RLIA 1XWBA 3C73A 4V2LA 1YEXA 4KX4A 2LS5A 1K0OA 2OACA 4XS4B 2HRKA 4WF4A 2DLXA 4K7IA 2VL9A 2GS3A 5KN3A 2ZUPA 3CBUA 1SJIA 4MJEA 1O81A 1FB0A 2Z9SA 6GSSA 2XBQA 3GKXA 3IXRA 2HRNA 3F4TA 4POKA 4NWYA 3RDWA 3D22A 5IPHA 2AUVA 3EMXA 4GQFA 1B4PA 4EF0A 1XW5A 2V6KA 2E2MA 2MZCA 2LRNA 4IQ1A 3F6FA 3GSSA 2C0GA 1R26A 1VRSD 1JFUA 1PGTA 4PUFC 4ECIA 3EU4A 3O3TA 4EUYA 1JZRA 3DYRA 2AV4A 5GAND 3LXZA 1U88A 2JL4A 4I2TA 3HVXA 1HNAA 2CX3A 2WCIA 4KA0A 20GSA 1BJXA 1M99A 3PGTA 2LEGA 3RBTA 3DGQA 4LA1A 5EVOA 1B9XC 5F05A 5IMZA 3CTFA 1W4VA 4CHSA 3FYGA 1GSUA 3ZL5A 2MMZA 3ME8A 3O6TA 5ELGA 4OO5A 5A5KA 4JBBA 1ON4A 5BMUA 5G5EA 5JCWA 2GQMA 3K8NA 1X9WB 3HJMA 2RUFA 4HS1A 4Z7XA 2BJXA 2HE3A 3LEFA 3HDCA 2GLRA 4QL7A 4DSQA 3IAS2 2PGTA 4MZCA 4NV5A 2FNOA 1MDKA 2NBSA 5AGYA 2LNTA 2VCXA 1WOUA 1XXUA 3IDVA 5H5SA 5DQYA 2MBSA 4FYBA 3GKMA 5GSSA 1PX7A 5IMAA 3OR5A 4IBPA 4MF7A 4K2DA 10GSA 1LJRA 2X8CA 3L0HA 1V58A 3GRXA 1U3AA 5B7CA 1XZOA 2DJJA 3C71A 1WMJA 5AIXA 3IK9A 14GSA 3CSJA 2R3XA 3H1NA 2WGRA 5IMFA 2JACA 3HXSA 2C4JA 3J7Yb 3IHQA 2AB6A 1T4YA 4F0BA 2XPEA 1Z6NA 4N30A 6GSVA 4EVMA 2OE1A 1SKSB 1Z6MA 3E9JB 3FK8A 5D96A 1A0RP 5JWQB 4DSSA 1ERWA 2L4CA 5G30A 5FWGA 2IMFA 3O76A 1AQXA 3KH7A 1G6WA 4FYCA 3C8EA 2YWMA 3KXOA 2FWFA 4HZ2A 1OKTA 4FYUA 2X99A 2HQTA 4ZL9A 4K7OA 1TRVA 4JEDA 2H6ZA 1K0CA 2PWJA 4WR4A 1A2LA 4KH7A 1IYIA 5DAKA 2LQOA 1BEDA 3ZMLA 3LQ7A 5J9BA 2FY6A 4OWYA 3VFIA 4ID0A 2AAWA 4TR1A 3ME7A 13GSA 4IELA 4Q5RA 4TXOB 4XTSA 1FVJA 4IS0A 4ZBBA 1X0RA 3FRCA 4KCAA 3QAWA 2I3YA 4N0ZA 5B6NA 1ZCPA 3L9SA 4HOJA 3QAVA 1WIKA 1TDIA 3NOFA 1K0DA 2WULA 5IO2A 2C3QA 4WF5A 2OE0A 1NM3A 1A23A 3SWLA 2HRFA 4MH3A 4G19A 5G31A 3KGKA 2DIYA 3FKFA 1VF4A 2OBKA 1URMA 4ML1A 4OMVA 1YKCA 2GSQA 3R3EA 4NHWA 1F3AA 1OC9A 1GTBA 4GXZA 3IAM2 3FZ5A 3EWLA 2HSMB 3UVHA 3M0FA 2DMMA 3IA1A 1V9WA 3VK9A 2NVLA 3EURA 2GVPA 3VWXA 4LL4B 1U87A 1WP0A 1ACVA 4JR4A 4KSOA 2IMKA 3SBCA 2P5RA 2GT6A 3TRXA 3A2XA 1TKDB 1ZOFA 2F3MA 4BL7B 4BVYB 3ZIVA 2OA7A 3QFAC 5CNWA 4MK3A 2FWHA 2L6DA 1OE7A 3EYTA 3BD2A 4G2EA 1TU7A 3FZ4A 3RPNA 3LJRA 1BX9A 3V1WA 3W6GA 2IMDA 3S9FA 2VL2C 1EP7A 4POMA 5CRDA 4IN0A 1AQWA 6GSXA 1LBKA 3GURA 3TRPA 4Q5FA 4QL9A 3IOSA 1SKRB 3IK7A 2B1LA 3EE2A 3GFKA 3CYNA 3UAPA 2H70A 1GTAA 2LUSA 4KUNA 4BVXA 5E4WA 2CZ2A 1O6JA 1K0BA 2O7KA 3KEBA 3F0IA 2VD1A 2MMNA 5KN0A 2HZEB 1KTEA 1ZL9A 3MNGA 4XHMA 4HJMA 3KIJA 1AAZA 4L0WA 3KM6A 1GNWA 2WFCA 1B48A 4TR3A 1T1VA 5IMDA 2FUG2 3AY8A 2KUCA 1SU9A 4Q5NA 5GSTA 2CVKA 3P90A 2JSZA 4IKHA 5IO0A 4G9HA 1SL1B 3TDGA 2QGVA 3ZFLA 1USBA 3W8SA 4KB3A 3P2AA 2LSTA 2WZ9A 3ZTLA 1SJZA 4JE1A 1X9MB 2ON5A 4GSNA 2VLVA 3A2VA 4AJ8A 2IN3A 2WDUA 3I9V2 5HQPA 2NDOA 4RI7A 1LU4A 1WRYA 4EE0A 5FT3A 4E8EA 2MYGA 3UEMA 4I2UA 3TKSA 5ELAA 1YQ1A 5ECNB 4IVFA 4KCEA 2I1UA 2HSNB 3DVXA 2CAIA 2N5BA 2IWTA 4AJ6A 3QFBC 2X8GA 5CREA 5A4UA 5HFGA 2VAFA 1X5DA 4PXOA 5ECPB 2J9HA 4L0UA 4HJ2A 1XVQA 1CQGA 5ECMB 1JZDA 5IM9A 2H19A 4GRFA 1DUGA 12GSA 1NHYA 4N11A 4N0VA 5GZZB 1J08A 1TRSA 2ON7A 1GULA 3LFLA 4TVEA 4MPGA 4PUAA 2L5LA 4KDXA 3H93A 3A2WA 2DSAA 4ISDA 3TKPA 3ZITA 2XPDA 1OC8A 1G6YA 1PKWA 4PQ1A 3Q6OA 1PA3A 2F51A 2P31A 4ZILA 2H1GA 3IRAA 3HVSA 1GLPA 1XFLA 3HZ4A 4POLA 1EGOA 1K3LA 2WJUA 4NMUA 2N5FA 4ZBDA 3KMOA 1QQ2A 2AYTA 3D5JA 4X43A 5AISA 3TGZA 3JCML 3HD5A 6GSYA 5HR1A 2GSTA 2FHEA 4ZL7A 3EINA 1F3BA 4HZ4A 2LV3A 2HSYA 1QMVA 1DE2A 2XHFA 1MD4A 2P5QA 2FGXA 3I6AA 3GH9A 4WKWA 1JZWA 2R6KA 4ZXGA 4OFTA 4TRXA 3H79A 4MA9A 1VF1A 4GF0A 3Q19A 3N5OA 4IW9A 5IIZA 5DALB 1RW1A 2B5YA 1V40A 4YQMA 2C0EA 2FCHA 4GSSA 3CXGA 3J7Yk 3F6DA 2PVOC 2VIMA 2YJHA 1Z9HA 1PD21 2HZFA 2H74A 3VURA 2VUPA 2LJKA 2C0DA 3ZREA 2V32A 3KMNA 4HDEA 4FH8A 1GSYA 3HVVA 3QOUA 5KN2A 1B4QA 2BTOT 1VF2A 2X8HA 2HT9A 1R7HA 5B8AA 2HYXA 4BA7A 2QKEA 2VOCA 1XPVA 2TRXA 4PNFA 2REMA 4MZWA 2YANA 4XS1A 4PNGA 2C3TA 4JZQA 1TI1A 4WBRD 1JHBA 5B6MA 2GGTA 4HI7A 3QAGA 1NHOA 2I4AA 3GN3A 2ALBA 3GA4A 5HFIA 3ERWA 3RPPA 3TJFA 3W8JA 2VD0A 4GLTA 4IGJA 4J2FA 3ZMKA 1EEJA 3FR9A 4TXOA 4J56E 3I43A 3ZLPA 3MSZA 3N9JA 2MMAA 1BQ7A 2OE3A 2ES7A 4L8EA 2YV7A 4YQVA 1NSWA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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