1USBA

Rational design of a novel enzyme - efficient thioester hydrolysis enabled by the incorporation of a single his residue into human glutathione transferase a1-1
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
219
structure length
219
Chain Sequence
AEKPKLHYFNARGRMESTRWLLAAAGVEFEEKFIKSAEDLDKLRNDGYLMFQQVPMVEIDGMKLVQTRAILNYIASKYNLYGKDIKERALIDMYIEGIADLGEMILLLPVCPPEEKDAKLALIKEKIKNRYFPAFEKVLKSHGQDYLVGNKLSRADIHLVELLYYVEELDSSLISSFPLLKALKTRISNLPTVKKFLQPGSPRKPPMDEKSLEEHRKIF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords GLUTATHIONE S-TRANSFERASE A1
publication title Incorporation of a Single His Residue by Rational Design Enables Thiol-Ester Hydrolysis by Human Glutathione Transferase A1-1
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 76
structure length 219
sequence length 219
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2003-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 1usbA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1usbA01
1BYEA 3KM6A 1WWJA 4NWYA 1G7EA 3EVIA 3FZ4A 3RAZA 4XS6A 1PX7A 1QMVA 1YKAA 2B6MA 2DBCA 2I1UA 2P5QA 2GT6A 4O7HA 2H30A 5J41A 3F6FA 2N5AA 4F2IA 1A2MA 4TR1A 1AIUA 1Z6MA 2JZTA 4WETA 3KMNA 1BAYA 2DJJA 2C3TA 5AIXA 5ECRB 2DSAA 3H79A 3PR8A 2IIYA 3BJ5A 2X64A 2B7JA 4G10A 3APSA 3M9KA 2M46A 1MEKA 2H8LA 3QOUA 1W4VA 4XS4B 2WGRA 4ZBBA 3ED3A 5IQYA 5D9VA 4EVMA 4Q5RA 3KXOA 3ISOA 1K3LA 1ACVA 2OE0A 5AGYA 4AJ6A 2VLVA 4XIHA 4H86A 2RUEA 4EXJA 2LUSA 2B5EA 2A2RA 1ABAA 2C1YA 3N9JA 1BEDA 2G0FA 4JEDA 4MPGA 4HS1A 3MSZA 3DD3A 1UC7A 1OKTA 3FHKA 1GH2A 5E4WA 1GSSA 3QAWA 3K8NA 4PUAA 3IHQA 3BCKA 3F6DA 2PN8A 4HDEA 2FWEA 4RUVA 3ZIJA 2KP1A 2FCHA 4TXOB 5F8BA 2LS5A 3KCMA 4I2TA 5IMFA 4BVXA 2VLTA 4O92A 2O8VB 4PQHA 4KDXA 2DMLA 2GZYA 1PD21 4EE0A 2H6ZA 4ID0A 4TR1B 4AJ7A 5IMZA 2NTOA 3G9BA 1G6WA 3PPUA 1AC1A 2PUKC 2N5FA 2J9HA 3SBCA 5HFKA 5B8AA 4F82A 4HOJA 1FG4A 5IMVA 2FWHA 3TKQA 4RI6A 1M99A 3CRUA 2JU5A 3BD2A 5D9TA 1V98A 3FZAA 2AAWA 3FY7A 1KTEA 8GSSA 4HEA2 1R5PA 2RLIA 4XS1A 1SKRB 1K0BA 4IBPA 3DYRA 4X1UA 3UMAA 2O7KA 1T8EB 3H4KA 2OE1A 1XWKA 1TDIA 1SD9A 5G1LA 4EL1A 2VCZA 4Q5FA 1XIYA 2L4CA 4KA0A 4NHZA 3EYTA 4NAXA 1G7OA 1X5EA 1DE2A 4ILFA 2GDRA 3GIXA 2HRFA 2P0GA 3C1RA 2CV4A 2H75A 2GGTA 2EC4A 4K7IA 3UAPA 3VLNA 3MAKA 2IPAA 3VWVA 3I43A 1UN2A 2WB9A 2A2SA 5IIZA 4MZCA 3LFLA 2GS3A 1OKDA 5G5EA 5G5FA 4BVXB 3SWLA 1K0CA 2B5YA 1TRVA 3TB2A 2F8AA 4AGSA 1QQ2A 5B6MA 1T4YA 4TOPA 1SL1B 3KTBA 3G7IA 4RI7A 2NVLA 3FW2A 1TI1A 3D6IA 1YF1A 1Z5YE 2MMAA 1SYXA 1GRXA 2QKEA 3E9JB 3GSSA 3IC8A 2KOKA 2PPTA 5ECOB 2AJQB 1T7PB 4TXVA 4AF2A 1YKCA 14GSA 5GZZB 2AHEA 4XTSA 3U5RE 4DVCA 2YV9A 3EMPA 3PINA 2R37A 2FY6A 2WDUA 1TRUA 1GWCA 5JWRB 3D4MA 4MLYA 5B8BA 3IAS2 2JL4A 2FHEA 3HA9A 3EU4A 3P8WA 4GRFA 2XHFA 1SJ6A 3IA1A 3VURA 5DCGA 5HQPA 1A2LA 3GFKA 1Z7RA 2LQOA 3KP9A 2K18A 4ECCA 4WR4A 5A4VA 5DAKA 1PA3A 2H70A 3FRCA 4L5LA 1XWAA 2C3NA 2X8HA 3O3TA 2B5XA 1JZDA 4TRXA 1ST9A 3H8QA 2GZZA 1JHBA 3KP8A 2LNSA 1ERVA 5HR1A 3KH9A 3E0UA 1XWCA 5A4UA 4ZXGA 3A2XA 4N0VA 1OYJA 3FR6A 3FZ9A 2H0IA 3TUEA 2VUPA 2YWOA 3LG6A 3DVWA 2M80A 3L78A 4IJ3A 1PQNA 2VL9A 3ZIVA 4I8BA 3I69A 4G0LA 3QFAC 1K3OA 2LKUA 1V57A 3WGXA 1EGOA 2H72A 1M2AA 2GT5A 1MD4A 2LQQA 20GSA 4MABA 2YN1A 2VM2A 1PRXA 1A0FA 3KEBA 1YZXA 3ZMLA 2L59A 3LJRA 4GWRA 1M2BA 1V2AA 1XVQA 1XCCA 4FIWA 2JSYA 3Q6OA 4OMVA 3W8JA 3NZNA 2VLUA 4K6XA 4LA1A 4MA9A 4GF0A 5EPFA 3CSIA 3TJJA 3CRTA 3TGZA 1GP1A 2B1LA 1H75A 5KN2A 3DVXA 4Q5QA 1DE1A 3M9JA 3A5WA 1K0NA 3EMXA 4KE3A 22GSA 2AUVA 1EGRA 4YQVA 1EEMA 2RUFA 1SYRA 3LSZA 2LRNA 3VK9A 3D0ZA 2ES7A 1WE0A 1B4PA 4BWQA 2XPDA 2YV7A 4CHSA 1Z9HA 4POKA 2OA7A 2GSQA 5DJLA 5CRHA 1GTAA 1M9AA 3P90A 2VAFA 1SK1A 1V9WA 1XZOA 4KGIA 1O8XA 3UJ1A 4KCEA 2ON7A 1ERUA 1J0FA 5D73A 1Z3EA 4MCUA 2DJKA 2HXKA 2QC7A 3A2WA 3WD6A 3GX8A 3G7JA 2YANA 3ERFA 3ZREA 3VFIA 4YAVA 6GSWA 5ID2A 1RK4A 2RIIA 1AQXA 1HD2A 2R2JA 4NV2A 5C00A 4USSA 1SL2B 2H1AA 3IDVA 4RQXA 3J7Yk 4EDZA 2H19A 4KSOA 5J9BA 3QFBC 2J23A 4KX4A 1XBSA 3FEUA 4IQAA 2ALBA 4PUFC 2HZEB 3W8SA 1Z6NA 1YDKA 1ZCPA 4Q5NA 4GQFA 1U6TA 2KLXA 2XC2A 3GKXA 2CX3A 4TXOA 1KNGA 4KB3A 2MMNA 2QGVA 1VF1A 3TRXA 1CQGA 1OC8A 3LORA 4QL7A 5ELAA 2CT6A 1ON4A 2IMDA 3KTLA 1XXUA 4MDCA 3TRPA 2HSYA 5CYYA 2HFDA 1HNCA 1R4WA 4ACSA 4K1FA 4P3YB 4WR5A 3VI7A 2KUCA 4ML1A 2JZRA 4N0ZA 2OACA 2PERA 1QXHA 1GNWA 4EDYA 4WEYA 3IR4A 1MDJA 1X9SB 3DEXA 2OBKA 4XRDA 1XFLA 3UIWA 3UARA 2B3SA 2GZPA 2CZ3A 2E2GA 4J2FA 3ZITA 3C8EA 3NIVA 5AIVA 4F0CA 3M3MA 2E2MA 2IWTA 1PKWA 3TJKA 4V1Ap 1DUGA 4FYBA 4PQ1A 5ID2B 1AQWA 4WF4A 1TXXA 3UOMA 2H73A 2H0GA 1FB0A 1S3DA 4BL7A 1BQ7A 2CVBA 2HRNA 5CO3A 3ZLPA 5B6NA 1E2YA 2F8FA 5ECSA 1T00A 3R2QA 3ZVJD 3DRNA 3P2AA 4K8MA 3CTFA 2XBIA 1A0RP 5KN3A 3QAGA 3FZ5A 1M9BA 4HZ2A 5G1KA 2V2GA 1EV4A 4ML6A 2YNXA 4F03A 1OC3A 1FHEA 5JWOB 5AN1A 2L5OA 3IXRA 4ZB6A 3UL3A 5GSTA 3ZMKA 3C71A 1XWBA 3FKFA 2JSZA 1YY7A 3EE2A 1ML6A 3CBUA 9GSSA 3UEMA 1EWXA 2H6YA 4RQRA 1GSUA 2VD0A 5DJMA 1EOGA 3GURA 1VF3A 3GKMA 3IK7A 4YH2A 2FD3A 1HNAA 1XVWA 3RPNA 2LRTA 3TOUA 4MMMA 2YJ7A 5J4UA 3JCML 1Y6EA 4HQSA 1OAZA 4L8EA 4BWSA 1VRSD 3PGTA 3LXZA 3QPMA 3D21A 1TU8A 3IRAA 4JZQA 5IMDA 3ZTLA 5ECHB 1SKSB 2K9FA 3ME7A 4ECIA 1FAAA 4V1Ag 4KUNA 3RBTA 3HJMA 3WYWA 2MMZA 2WFCA 4IQ1A 4PURA 3TJFA 1A8YA 1AXDA 2VCTA 4MPFA 4N30A 2CZ2A 4PX1A 4OO5A 3HY2A 5B7CA 3AY8A 4WBJA 1JFUA 4BL7B 1LU4A 5DALA 3O76A 2C3QA 2MBTA 4OWYA 2FWGA 1NHYA 2VL3A 2K8VA 3HCZA 3KJYA 2HI7A 2DIYA 3G7YA 5J5NA 2FLSA 1SKWB 4HQZA 4PNGA 2HLSA 1XOBA 4OCEA 5AISA 4L0WA 4IGJA 1XWGA 2P5RA 1JZOA 2OKAA 3EU3A 1KBNA 4CDOA 5FWGA 3VPQA 1ERWA 3EWLA 3VWUA 2KHPA 1OE7A 5G31A 2B1KA 2TRCP 5CAXA 1MDKA 2I9HA 4JU5A 2H01A 3A3TA 3RDWA 3HD5A 3F63A 2V41A 4PNFA 3TCOA 2X8CA 7GSSA 1O73A 3A2VA 3HDCA 2H66A 2GQMA 1XW9A 1MD3A 4HJ2A 2N5BA 3EINA 3GUSA 2PGTA 1GSYA 4J57E 2JZSA 3W6GA 2L6CA 4WXTA 3ZVJA 5COHA 1W89A 5D8IA 3DIEA 3MWHA 3LWAA 1GUMA 1WPIA 3ERWA 1S3AA 2MZCA 1ZL9A 1RQMA 5EVOA 4IW9A 4ZBDA 3HYPA 2EIOA 4MF7A 1YEPA 2GSSA 1SENA 2IL3A 5DALB 4GTUA 1OC9A 1ZYQB 1WJKA 3CYNA 3TRQA 3US3A 2YOIA 4YAPA 4MK3A 1F3BA 1TP9A 4ECBA 2LJKA 2R4VA 4MH2A 2ZCTA 2CQ9A 2O89A 3VWXA 1K0AA 2YWNA 1PKZA 4G9HA 5ECNB 5KN0A 1QGVA 1R5AA 4HU9A 4KSMA 2JACA 4X43A 4IJIA 2H74A 1T3BA 12GSA 1KEBA 1GTIA 3F8UA 1A8LA 4GQCA 1AUCA 6GSSA 2HRAA 4KW6A 4L0UA 2EIRA 1ERTA 1EP8A 1EEJA 3CSHA 3E3EA 3UVTA 3FYGA 5CRDA 2H1DA 3ME8A 1GTUA 2I4AA 4EF0A 2GSRA 6GSVA 2NDOA 2IJYA 4KDYA 3TKRA 4PQIA 3L9SA 3IAM2 2G2QA 1U3AA 2HSHA 3F4TA 1RW1A 4IP1A 1B9XC 6GSTA 3DKSA 1FOVA 1OC9B 1O6JA 4EUYA 2GQKA 2F9SA 2QSIA 2HZEA 4MJBA 6GSXA 3DMLA 5BMUA 3GV1A 3C73A 1PL1A 4FQUA 4ZB8A 4OFMA 3QMXA 1XPVA 5DQYA 1TJDA 1VF2A 1ZGNA 1AAZA 4NPBA 4DSQA 5KEJA 2LV3A 5JCUA 2C4JA 1ZYEA 4LL4B 2PMTA 2LJRA 1GSEA 1U87A 2PVOC 3FR3A 3HJPA 4N11A 3L9UA 3GHAA 4BPYA 4LMVA 4I5QA 6GSYA 4GLTA 1HNBA 4G0KA 3GX0A 4ECJA 3ZRDA 2GQLA 4I97A 1YF0A 2C80A 4E8HA 3DWVA 3QCPA 3DXBA 1H4OA 3S9FA 4OO4A 5ABRA 5FHIA 1I5GA 2DJ1A 2B7KA 5GAND 2F3MA 5DDLA 3BCIA 2DJ2A 1M0UA 2LTKA 2AYTA 4YQUA 2IN3A 4TR0A 4KH7A 5F05A 4PXOA 2I3YA 4BVYA 3P7XA 5IO0A 2GSTA 1PN9A 4PTSA 5IO2A 2YZHA 2HRKA 2X99A 2Z9SA 2L4QA 4MZWA 1F37A 1M2DA 3GA4A 1WOUA 4CW9A 3GSTA 3BBYA 1Q4JA 1SU9A 2YWIA 2CVDA 3I6AA 11GSA 1IYHA 2O87A 4HI7A 5JCWA 3U6VA 4BA7A 4DSSB 3RHBA 2YP6A 2KP2A 1NSWA 4WKWA 2VIMA 2V32A 3UVHA 2VO4A 1URMA 4WF5A 3GKKA 2TRXA 1A2JA 3KMOA 1JZWA 2E7PA 5CREA 5LD0A 4MF5A 3QDNA 3NOFA 1WRYA 4KAEA 17GSA 1SD8A 5L71A 2HYXA 2D2ZA 3ERGA 4HUAA 2FA8A 3C1SA 5H5SA 1PGTA 4JRRA 4IKHA 2ON5A 2WZ9A 1Z7PA 3H1NA 2VL2A 3TDGA 1U88A 3TKSC 4V2NA 2HSNB 1QFNA 3GL3A 4TKYA 3GYKA 4NMUA 3CTGA 3TKSA 3IOSA 3L9VA 4MP4A 3GH9A 1V58A 4WBRD 2OBIA 3HVVA 1I9DA 3GKNA 1XW5A 2HE3A 4BVYB 1O81A 2GVPA 4F0BA 4XHMA 2E0QA 1TI3A 4FYUA 3IC4A 4IELA 2HRKB 1FVKA 2PBJA 2C0FA 3TJGA 1TW9A 4ZIJA 3VI5A 1K3YA 5J3RA 1T1VA 2LSTA 5IMCA 1TK8B 1A23A 3WGEA 1K0DA 4NXIA 4ZL9A 2GTUA 1TU7A 4EKZA 3M8NA 1QK8A 1LJRA 3QD9A 1PX6A 2PVQA 3FR9A 1EZKA 3TKPA 2VCVA 3CXGA 1Y25A 4MJCA 3MNGA 3GN3A 4XRAA 2OE3A 5J9CA 5HFGA 1GLQA 2WS2A 1F6MC 3HZ8A 1JLVA 2V6OA 5ECIB 4FO5A 3D22A 2VM1A 2PU9C 5F07A 2LRCA 1GSQA 3GH6A 4TVEA 5EY6A 3GL5A 2WJUA 3F4SA 1VF4A 5F0GA 1F2EA 1TRWA 1VGLA 3TOTA 2HZFA 1YJ6A 3F3RA 4G19A 3GNJA 4TW5A 2RM5A 4XCSA 1TK0B 5E59A 4I2UA 1J9BA 4O5RA 5HR2A 1JLWA 4POMA 4AJ8A 4POLA 3APQA 2ZUPA 4GSTA 2DIZA 3F3QA 4D73A 1THXA 1R26A 4ZILA 2H1GA 1E6BA 1GNEA 3D4TA 3HHVA 3WT2A 3ZYWA 3IE3A 3L0HA 5D9WA 1EV9A 3GTUA 4FYCA 5ELGA 3PH9A 1F3AA 1X9MB 1X5CA 4K2DA 3HZ4A 5KN1A 4MJAA 4EC0A 2RM6A 4OFNA 3HVXA 1GULA 4JR6A 2BMXA 2ZNMA 4IVFA 3HVSA 4G2EA 1FW1A 18GSA 5ECLB 4ULXA 3L4NA 3ZFLA 2VCQA 2V6KA 3Q18A 1Q98A 1DSBA 3Q74A 2L6DA 3VPTA 1B8XA 4IS0A 4LMWA 4TR3A 2IMEA 4MZBA 4HJMA 4O32A 2DC5A 3M1GA 2CAIA 2MMOA 1GUHA 2F51A 5A5KA 4ZB9A 5IOWA 3IBHA 1ZOFA 1K0MA 2YZUA 1NW2A 1GSDA 5G2ZA 3LEFA 1LBKA 4L5OA 5LCZA 1SK2A 3F9UA 5D93A 2YWMA 3H93A 4MH3A 5A4WA 1A24A 1THOA 2JADA 4IHUA 2EIQA 4ZL7A 1GL8A 4DEJA 2A4VA 2V1MA 1O85A 1J08A 4F9ZA 1G0TA 4LL1B 4D73B 3IV4A 5GSSA 3LYKA 3LQ7A 4KDUA 1B9YC 1AW9A 4JBBA 2H71A 1EOHA 2IMIA 2LNTA 3QAVA 2VCWA 3HJOA 3GTUB 3R3EA 5CRWA 1X9WB 3ZFBA 1GLPA 5HR0A 1ZZYA 3F4RA 1UVZA 2OADA 3Q19A 1WMJA 4N10A 2K8SA 5CRGA 5IPGA 1TK5B 1TKDB 2R5GA 2TIRA 2X8GA 2NBSA 4FH8A 4OFTA 5DBQA 1OVNA 3KGKA 5JCGA 5IPHA 4DSRA 1SK0A 3RPPA 1PL2A 3LXTA 2OJLA 4IN0A 16GSA 3D5JA 4JR4A 1SJZA 5H5RA 5F06A 4GSNA 4NHWA 5EL8A 5FT3A 3KZQA 4OD7A 5D9XA 3LYPA 2IFQA 2UZ8A 2FA4A 4NV5A 3OR5A 3IK9A 1TTZA 1MTCA 1BJXA 3KIJA 1SL0B 2DLXA 3CSJA 5CNWA 2HQTA 2R3XA 3EC3A 4GCIA 4PGTA 1FO5A 2YPMA 1ZMAA 1DBYA 2WCIA 1UA5A 1XOAA 3O6TA 5D96A 2CVKA 1EP7A 1SJIA 6GSUA 4QQ7A 3V1WA 2DMMA 2C0GA 2GLRA 4JE1A 4Z7XA 3KH7A 1M7TA 4ZL8A 5ECKB 2CX4A 4MF6A 2FNOA 3HXSA 2HSMA 1X0RA 1K0OA 1TOFA 5ECMB 2NPBA 4KCAA 2H6XA 4GSSA 5ENUA 5IM9A 2REMA 3FK8A 1MDIA 5IMAA 3KD0A 3C7MA 4HU7A 5G30A 1U3IA 3EURA 3TJBA 4DSSA 1ILOA 4K0NA 1OE8A 4J56E 5DQSA 2WRTA 2C0DA 1T4ZA 2CAQA 5ECQB 5DCHA 4YQMA 3BOAA 4LLRA 4TN8A 2VD1A 2VCXA 1GTBA 4POBA 5GAPD 1PSQA 3APOA 1YEXA 2LEGA 1PMTA 1O7UA 2C8UA 3IPZA 3UBKA 4I6XA 3HKRA 1HQOA 1JZRA 1YQ1A 4GXZA 2VOCA 2H76A 4OCFA 5DAKB 3RHCA 1R7HA 2DJ3A 4ISDA 2YJHA 2MBSA 2CA8A 1O8WA 4IP6A 4KNDA 2LJAA 2DJ0A 2PWJA 2FUG2 1HYUA 2IFQB 3MDKA 3DGQA 1QUWA 1NHOA 4HZ4A 1C72A 2AB6A 4K7NA 2C0EA 4G0IA 2MYGA 2XPEA 5HR3A 2M72A 2P31A 5H5QA 5JWQB 3CMIA 4EO3A 1S3CA 2BJXA 2BTOT 5DVBA 1FB6A 3GMFA 5C04A 4V2MA 4X0XA 3ZL5A 4KF9A 1USBA 1XW6A 4K7OA 3N5OA 3TKSE 4XS4A 2YCDA 4QL9A 4MJEA 2HNLA 5INYA 1B48A 3J7Yb 2WULA 4TR4A 2L57A 1GSFA 2HSMB 2K6VA 4K9ZA 4V2LA 2AV4A 1CQHA 2R6KA 1FVJA 2IMKA 1N2AA 1NM3A 3F0IA 1V40A 3QR6A 5ECPB 4K0GA 2I81A 3VWWA 3WGDA 2L5LA 19GSA 3UBLA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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