4KDUA

Crystal structure of a glutathione transferase family member from burkholderia graminis, target efi-507264, no gsh, ordered domains, space group p21, form(1)
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
207
structure length
207
Chain Sequence
MLQILGKPTSINVRKVLWTCAELGLAFEREDWGAGFRPTNVPEFLALNPNAMVPVIRDGDFVLWESNSIIRYLAGRYGGEWLYPADARERARCDQWIDWQASELNRSWSYAFLALVRQSPAHRDAQQIEASRANWAKHMAIVEGQLQRTGAFIAGDAFSLADIPIALSINRWLETPIARDDLPAVDAYMTRLASRDAYREYCRNGTP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Glutathione S-transferase domain
publication title Crystal structure of a glutathione transferase family member from Burkholderia graminis, target efi-507264, no gsh, ordered domains, space group P21, form(1)
rcsb
source organism Burkholderia graminis
molecule tags Transferase
total genus 72
structure length 207
sequence length 207
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF13417 GST_N_3 Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4kduA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4kduA01
2ZCTA 3KXOA 2HZFA 1R5PA 4N11A 3VWWA 3I6AA 4OFTA 1GTUA 2RLIA 2F51A 3ZVJD 3F4SA 2HLSA 3CSIA 5DQYA 4N10A 5E59A 5HR2A 4PQ1A 4AJ8A 1SJIA 4EVMA 3TKSC 1AXDA 1AAZA 3PINA 1U3AA 4MMMA 4V1Ag 1TK8B 2LQOA 3C1SA 2ZNMA 3QAGA 4OWYA 3EU3A 4BVYB 1C72A 1GUHA 1WMJA 3SBCA 2LRTA 4ZXGA 3E9JB 2L6CA 5DBQA 3U6VA 5DQSA 1TRWA 4D73B 1SD8A 3KD0A 1X0RA 3R3EA 4MF6A 1UC7A 1E6BA 2UZ8A 2VL9A 2MMAA 1K0MA 3TJGA 2DJ2A 4ZL9A 3H4KA 1K0DA 2R4VA 2VIMA 4N30A 3TDGA 2B7KA 4JEDA 2JZTA 1H75A 3A3TA 3QAWA 4KE3A 3IDVA 5IMZA 4OCFA 3E0UA 2AHEA 1BAYA 2KOKA 4MH2A 1HD2A 1AQWA 1PKZA 3CXGA 2EIQA 4LLRA 3L9SA 5DCHA 4JE1A 3M9KA 1SJZA 1U88A 2MMZA 1Z7PA 1W4VA 1O8XA 2R2JA 4XS1A 5IPGA 4XS4A 4P3YB 4ULXA 1GLQA 3P90A 5ECRB 4ZIJA 2H0HA 2H1BA 2VLVA 2AYTA 4DSSA 1THOA 3MSZA 9GSSA 3UJ1A 2JZSA 1MDJA 1XBSA 5H5QA 1F37A 1A24A 3M0FA 2X8GA 3J7Yk 1GSEA 3GH9A 5G5FA 4GSSA 3O3TA 3ZIVA 5AGYA 2GVPA 5CP1A 2YP6A 1HYUA 4ILFA 4L0UA 4EKZA 4OMVA 2I81A 3GUSA 4JRRA 5AIVA 3HZ4A 3FEUA 2HRNA 2HSMA 4G0LA 3LYPA 1XFLA 1XW5A 1M2AA 5D8IA 1XWAA 2GZPA 3D5JA 4XS4B 3UOMA 2OKAA 2PUKC 1EOGA 2JSYA 3F4RA 1M2BA 4DSSB 2PMTA 1A2MA 3A5WA 2N5FA 3LJRA 2YWIA 5EY6A 4OFMA 3HVSA 3KM6A 2O7KA 2CX4A 5ECQB 4YQUA 2GT5A 3C7MA 5IM9A 1TU8A 1ML6A 4FO5A 5CRGA 2OBIA 1N2AA 3FRCA 5CREA 5HQPA 3MWHA 1GP1A 2IJYA 3I9V2 1AQVA 4MZBA 3Q18A 3CSHA 5G5EA 4EDYA 4F2IA 1NHOA 3VFIA 4L5LA 4ECIA 1JHBA 3P2AA 1V40A 1GTBA 4EL1A 1UA5A 1YJ6A 5JWRB 5ECMB 4L8EA 3ED3A 4KDXA 2HSMB 2HNLA 2VL3A 2F9SA 6GSWA 2E2GA 2YV7A 4O92A 1YKCA 4Q5QA 4JBBA 4AJ7A 1YY7A 2V6OA 3GKMA 3KZQA 4LL1B 4Z7XA 4MLYA 4IKHA 4MK3A 1S3CA 3GURA 2CZ3A 3G7JA 2FUG2 3F63A 2A4VA 4Q5FA 1T3BA 2FA8A 4L5OA 5IO0A 1W89A 2LV3A 4Q5NA 1GUMA 4YAPA 2WGRA 5CRDA 2FHEA 2GTUA 5ELGA 1ZYQB 4PX1A 6GSYA 5LCZA 4KDUA 1ZYEA 4HDEA 1GTIA 2QSIA 4MJCA 4ZL7A 2FD3A 3DMLA 19GSA 3DVXA 2YANA 1AUCA 3BOAA 3ERGA 3VWXA 2ES7A 3TCOA 4JR4A 1TI3A 3IHQA 3GTUA 4BVXA 2YJHA 2NBSA 2N5AA 4HQZA 4LL4B 2GDRA 1JZDA 1ACVA 1KBNA 2GSSA 2M72A 1WRYA 1Q4JA 2JACA 1Z6NA 3HKRA 3WT2A 4KSMA 2HFDA 4I2TA 1R5AA 2ON5A 3L0HA 1Q98A 4DSRA 4NXIA 3RHBA 3KIJA 4FQUA 4LA1A 3DKSA 5KEJA 2I9HA 3KP8A 4TN8A 2WDUA 2HRFA 5KN2A 4POMA 4EXJA 2OBKA 2C3TA 16GSA 3ZZXA 3W8SA 3BJ5A 3BCIA 1MD3A 3DYRA 1ABAA 3D0ZA 1V98A 2VAFA 3TJKA 3F3RA 1QQ2A 2TIRA 3GKXA 1X5EA 8GSSA 1FHEA 4ML1A 2HSYA 3GTUB 3F9UA 2I1UA 4WF4A 5IMDA 2H1GA 4WXTA 4OFNA 1Y6EA 3N9JA 4MF5A 3VURA 1ZOFA 2V1MA 2REMA 5DAKA 4Q5RA 2OA7A 2GQLA 4KGIA 3LXZA 2WB9A 4AGSA 3UVHA 3GYKA 4KAEA 4RI6A 1OC3A 1VGLA 5CNWA 5J4UA 2CA8A 2HT9A 4KSOA 1OVNA 3WGEA 2ON7A 3M3MA 4K0GA 1TP9A 2B1LA 3IE3A 5A4WA 3FZ5A 1YKAA 1TDIA 2DJ1A 4XHMA 4EUYA 1SKRB 2GLRA 1GSSA 2CZ2A 1GSFA 1M7TA 2HSHA 4MPGA 3GKKA 4POKA 3HZ8A 2D2ZA 1XVQA 5H5SA 1XPVA 5C00A 1PRXA 1PL2A 1QXHA 4FYCA 1BQ7A 3VLNA 4LMWA 3G7YA 3ZMKA 1G0TA 4RI7A 4YH2A 2TRCP 3KMOA 3EE2A 2MZCA 3TJJA 5IMAA 2QGVA 2PWJA 1XOAA 3A2VA 1HQOA 3FY7A 4ECJA 1G6YA 3EMPA 4PXOA 1V2AA 3ZFBA 4K7IA 5ABRA 1X5DA 2WRTA 4I2UA 3A2XA 3ZVJA 1H4OA 4HU9A 5F05A 3TRXA 2B1KA 2C0FA 4K6XA 3IOSA 3LORA 2L4QA 4F82A 1K0BA 3FK8A 5COHA 5GAPD 4MJEA 4FYBA 2RIIA 2GSQA 3FYGA 4ECCA 1U6TA 2DBCA 4O7HA 4EO3A 3IC8A 4PUAA 5KN1A 5IIZA 4IW9A 4IGJA 2P5QA 2MYGA 3ZTLA 4O5RA 2FNOA 3WGDA 2B6MA 4XRDA 3DEXA 2H72A 3HVVA 1TTZA 1T7PB 3K8NA 4HJMA 2OE1A 3IV4A 2AV4A 2K9FA 1X9MB 2PVOC 1PGTA 2DJ0A 1M99A 4IJIA 3VI5A 1SD9A 3HCZA 1GH2A 3H93A 1O85A 3OR5A 2V32A 1EOHA 4GQCA 1GRXA 12GSA 5KN0A 3RPPA 5CRWA 2JL4A 3ME8A 5CO3A 1A0RP 4E8HA 2VCVA 1MDIA 3F4TA 2VLTA 1FVKA 1N8JA 2O87A 3IR4A 3KMNA 2H0GA 3TKQA 3QMXA 1SK1A 4OD7A 2FY6A 2XBIA 1B4PA 4HEA2 1K0CA 4WEYA 1XOBA 5HR0A 5F8BA 3CYNA 5A4UA 2FWEA 2GSTA 1J08A 2P5RA 1ERTA 2WULA 1U3IA 1WPIA 1OE8A 3EC3A 3IBHA 3GNJA 1DUGA 2DC5A 18GSA 3HJMA 1NM3A 1ILOA 1M0UA 2LS5A 2DMLA 2H66A 2VCXA 1JZOA 3ZREA 1O8WA 3F0IA 1V57A 1ON4A 2YOIA 1VF2A 2C0EA 5G30A 1FG4A 2VO4A 4GWRA 1T4YA 2WJUA 1A2JA 2L6DA 4IS0A 4F9ZA 2KP1A 2J9HA 3APQA 1F3BA 2B5YA 4BWSA 5H5RA 5ENUA 5D93A 2H30A 2X8CA 4TW5A 2I3YA 2DLXA 2FGXA 2MMOA 3TKSA 1SJ6A 4KF9A 3G9BA 3EVIA 1WE0A 3DRNA 2JSZA 2VL2C 2HSNB 1E2YA 4KW6A 5LNKe 1JZWA 3A2WA 4GSNA 2VOCA 3WT1A 2XPEA 4NPBA 3N5OA 4G0KA 2PU9C 1B9XC 6GSVA 2A2SA 3EYTA 3UBKA 2OE0A 2DMMA 2J23A 1ERUA 4BPYA 3EINA 2YPMA 5AN1A 2VCWA 2O85A 3CMIA 3UMAA 2EIOA 22GSA 2CVDA 1DBYA 5D73A 3P7XA 1TU7A 5L71A 3HJOA 4X1UA 2C3QA 3JCML 2NDOA 2FWHA 1XCCA 2M80A 2YV9A 2IMDA 3GKNA 1GL8A 2YZUA 4POBA 2IL3A 5IO2A 3J7Yb 4AJ6A 5G31A 4KX4A 4IELA 1B9YC 3GA4A 2IN3A 5IOWA 4HOJA 1TW9A 2H8LA 1SKSB 5A5KA 3GSSA 3W6GA 2VM1A 2FCHA 3D4MA 4TR1A 2CVBA 1F9MA 5INYA 5FHIA 2K6VA 1XWCA 3CTFA 2GQMA 5HFIA 2VL2A 3UL3A 3QCPA 1CQGA 2NVLA 2LQQA 4FIWA 3VWUA 2P0GA 2NTOA 2PVQA 3HJPA 4JU5A 3IRAA 4DEJA 1PMTA 3C8EA 3ZITA 3GFKA 3O6TA 1PKWA 4OO5A 4G10A 1ZMAA 2LRCA 3H1NA 1R7HA 2NPBA 5EPFA 1ST9A 3DXBA 2HQTA 3FR9A 3QD9A 1F2EA 2K18A 4XS6A 3TKSE 1YQ1A 3NZNA 1J0FA 2GSRA 4XCSA 1PX7A 1QGVA 1TJDA 2V6KA 3FZAA 1LU4A 1V9WA 3BCKA 2PPTA 4XTSA 1R4WA 2L5OA 4ML6A 4V2LA 4GLTA 3GX8A 3RDWA 2B7JA 5D9WA 5D9XA 3F6DA 1YDKA 3UIWA 1JLVA 6GSTA 1WWJA 4HS1A 4TR1B 2GZZA 4X0XA 4F0BA 5B8BA 1PX6A 2AAWA 2LSTA 3LFLA 2KHPA 3Q6OA 1WJKA 3ERFA 1F6MC 4N0VA 4NHWA 3LG6A 5AISA 2MBSA 2KUCA 2RM6A 1Z5YE 3EWLA 2RUEA 1QFNA 5FWGA 2XC2A 2VUPA 4ZBDA 1M2DA 4KB3A 2JZRA 1QUWA 2L57A 1U87A 1MD4A 3QPMA 2H6XA 5B6MA 3CRTA 2YWNA 4RQXA 2CT6A 2YCDA 4GXZA 5D9TA 5IPHA 1AC1A 1URMA 4PTSA 1Z9HA 4I5QA 3CTGA 2Z9SA 3TB2A 4WBJA 5CRHA 4MABA 4GF0A 1KTEA 5IQYA 1SL0B 3I43A 3RBTA 3EMXA 2C0DA 4CDOA 2DJJA 3LEFA 3GX0A 2G2QA 2ALBA 3W8JA 4MDCA 3F3QA 2ZUPA 5DVBA 1K3OA 2LUSA 3PR8A 3DWVA 3GSTA 5E4WA 4ZB8A 2WZ9A 3V1WA 2BTOT 1QMVA 3UBLA 1VRSD 6GSUA 4ZB6A 1TRUA 1USBA 4POLA 2P31A 2GT6A 1Z7RA 1O73A 1TXXA 3HDCA 1M9BA 3VI7A 2LNSA 2VCZA 4TRXA 4BVXB 3E3EA 1O6JA 1DE2A 2FLSA 3PPUA 3TKRA 3GIXA 1K0NA 4YQMA 1PN9A 3VK9A 1A23A 2GQKA 3PH9A 4EDZA 1CQHA 2X8HA 3US3A 3ISOA 1ERWA 4RUVA 7GSSA 3CRUA 3TJFA 1MEKA 3FZ4A 1QK8A 4MA9A 2LNTA 1I9DA 3KH7A 1T4ZA 2CVKA 3C73A 1SYRA 2VLUA 2C1YA 1TRVA 5J3RA 4I97A 5HR1A 2DSAA 5B6NA 1S3AA 4HU7A 1JLWA 2PN8A 4WKWA 3KEBA 4MZCA 2H71A 3O76A 2K8VA 1LBKA 4ZBBA 2H1AA 2H73A 2G0FA 1GSQA 1SL1B 1ZL9A 4IQ1A 3R2QA 3IXRA 1SENA 1YZXA 4WR4A 2DJ3A 11GSA 2LKUA 1XVWA 2R6KA 1HNAA 4LMVA 4MPFA 4I8BA 3CSJA 4IQAA 3GH6A 3D4TA 3WGXA 3M9JA 1X5CA 4WR5A 3TUEA 4K0NA 5DAKB 3P8WA 2O8VB 3L9VA 2VD0A 1EZKA 1F3AA 2PGTA 2WS2A 5D96A 3APSA 3F8UA 4I6XA 1B4QA 2H74A 1O7UA 3FHKA 6GSXA 3EURA 4MJAA 1GWCA 1HNCA 4PQIA 1K0AA 3NIVA 3BD2A 3IPZA 4TOPA 2B3SA 3NOFA 1TK0B 3GN3A 3ZMLA 3EU4A 2L59A 2XHFA 5GSTA 1TKDB 5DJLA 4OO4A 1OKTA 4PURA 4JZQA 4BL7A 2R37A 3GHAA 4K8MA 4G19A 1YEXA 1TI1A 2V2GA 3HHVA 1EP8A 1FOVA 1JZRA 1S3DA 2XBQA 3BBYA 1O81A 3DGQA 2H0IA 20GSA 1M9AA 4DSQA 5A4VA 1BYEA 2WCIA 4N0ZA 4BWQA 3HYPA 1PA3A 5FT3A 3HA9A 4EC0A 3TGZA 3UARA 5JCUA 2CAIA 2CQ9A 2H6ZA 1Z6MA 2YZHA 2R5GA 4ZBAA 4K2DA 5KN3A 5IOXA 1BJXA 4DVCA 1RQMA 1THXA 4KDYA 2IPAA 1VF4A 4NHZA 2MBTA 5BMUA 1Z3EA 2LJAA 1Y25A 4WBRD 3HD5A 5IMVA 2HRKA 2H6YA 5IMFA 3VWVA 1KNGA 2L5LA 2EIRA 2C80A 4NWYA 3ZLPA 1EV4A 2CV4A 2HZEA 2R3XA 4G9HA 3LYKA 4IJ3A 1DE1A 4BL7B 5JWQB 4G0IA 2LEGA 4TR4A 1UVZA 2IWTA 2C8UA 5ID2A 1T1VA 4PGTA 1AIUA 2C4JA 1G7OA 5JCWA 3KGKA 3QDNA 4FYUA 1TK5B 3KJYA 5F07A 5G1LA 2HI7A 1XXUA 1MTCA 1ZGNA 3IAM2 3UEMA 3LXTA 5JWOB 2VCTA 3TRQA 1K3YA 2PERA 2DJKA 2X64A 2H19A 10GSA 4ZL8A 1A8YA 13GSA 4ZB9A 2F8FA 2N5BA 1IYHA 1K0OA 5ECIB 1SK0A 1RK4A 2GZYA 3ERWA 5DDLA 3S9FA 4KCAA 2OJLA 5F0GA 1XWBA 2HRKB 2YJ7A 3F6FA 1YEPA 2B5EA 4JR6A 2YWOA 2CX3A 1SL2B 4J2FA 5J9BA 1YF0A 2HZEB 1SKWB 3ME7A 4GCIA 1GTAA 2E7PA 1OYJA 1A2LA 4IP1A 1XW6A 1XWKA 2AJQB 2OACA 4F03A 5G2ZA 2OE3A 5ID2B 1BEDA 5EL8A 14GSA 4MCUA 1NHYA 3FZ9A 4HQSA 1NSWA 2V41A 2CAQA 1VF1A 4HUAA 3WD6A 2AUVA 5DALA 4OCEA 1ZCPA 1GSUA 1GNWA 4J56E 3GL5A 4ZILA 1EWXA 2B5XA 4GQFA 1JFUA 1HNBA 1WP0A 4KA0A 17GSA 3TOUA 1FW1A 5B7CA 1EP7A 4KUNA 2E0QA 3KTLA 1XW9A 4X43A 3L9UA 4TKYA 5G1KA 4V2MA 5ELAA 4E8EA 5GAND 5CYYA 4K9ZA 3D6IA 4PQHA 3H8QA 4H86A 3IK9A 1A8LA 1ERVA 3TRPA 2WFCA 2VCQA 5DCGA 4J57E 4V2NA 4TR3A 5LD0A 4EE0A 1WOUA 5ECLB 5DALB 3LGCA 1X9WB 6GSSA 1YF1A 3KH9A 4PNGA 4YAVA 2I4AA 1PD21 2FWFA 1G7EA 4YQVA 2FA4A 2F8AA 1FB0A 1B48A 5ECKB 2GS3A 2LRNA 4RQRA 2X99A 1EGRA 4FH8A 4ISDA 1FAAA 3DIEA 4PUFC 3LQ7A 3FKFA 5GZZB 3I69A 3QR6A 1GULA 4IP6A 5CAXA 2K8SA 3LSZA 4MP4A 2IMIA 3TOTA 5HR3A 3U5RE 1DSBA 2IFQA 3IAS2 2IIYA 2HE3A 4GRFA 4HZ4A 5ECOB 2BJXA 1T00A 5J41A 2VM2A 2HRAA 3MAKA 2RUFA 1A0FA 3QAVA 1TOFA 1OC8A 2H70A 4F0CA 2F3MA 4K7OA 4GTUA 2IMFA 4MH3A 2L4CA 3KCMA 1EGOA 3DD3A 2LTKA 4XRAA 5C04A 2PBJA 1SK2A 3IC4A 4IHUA 3RAZA 4K1FA 3HVXA 4TVEA 2QC7A 3APOA 3FW2A 1MDKA 4EF0A 3MNGA 2JADA 1PQNA 5ECNB 3QFAC 3GV1A 4PNFA 4TXOA 2H01A 5J5NA 4KNDA 2C0GA 3D21A 2HYXA 2DIZA 4O32A 3RPNA 2H1DA 2IFQB 3CBUA 1OC9A 4IVFA 1OAZA 5ECSA 4ACSA 3LWAA 3ZFLA 3L78A 1AQXA 3RHCA 4GSTA 1BG5A 3WYWA 1TRSA 4WETA 4QQ7A 2HXKA 3GMFA 3DVWA 1GSDA 4QL9A 1LJRA 2LJKA 1SU9A 5ECHB 1SYXA 3AY8A 3QFBC 4K7NA 2RM5A 4IN0A 2GGTA 5EVOA 4NV5A 2OADA 1VF3A 2H75A 4USSA 1OKDA 5HFGA 4WF5A 3GL3A 2YN1A 1PL1A 2A2RA 4AF2A 2IMKA 3UAPA 3Q74A 3VPQA 2FWGA 4IBPA 4L0WA 5F06A 2O89A 5AIXA 1GUKA 3C1RA 1X9SB 3FR6A 5GSSA 3IK7A 2YWMA 3G7IA 4TXOB 1B8XA 4MJBA 2KLXA 4QL7A 2JU5A 1AW9A 1KEBA 1OC9B 1FO5A 4KH7A 1NW2A 4CW9A 4NAXA 4TR0A 1EEMA 3QOUA 1UN2A 3HXSA 1EV9A 1XWGA 3Q19A 2H76A 3KTBA 3UVTA 5J9CA 2MMNA 1IYIA 3TJBA 4HJ2A 2YNXA 1I5GA 2BMXA 4CHSA 2KP2A 1PSQA 2EC4A 3M8NA 3SWLA 5JCGA 4MZWA 5D9VA 1EEJA 1XIYA 1J9BA 3VPTA 1WIKA 3MDKA 4HI7A 1FVJA 4BA7A 1R26A 3C71A 3M1GA 4MF7A 3ZL5A 3GRXA 1GLPA 4XIHA 1G6WA 3ZYWA 4KCEA 1RW1A 1OE7A 3H79A 5B8AA 4V1Ap 1FB6A 2TRXA 3HY2A 3PGTA 1GNEA 3ZRDA 5ECPB 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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