3C8EA

Crystal structure analysis of yghu from e. coli
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
284
structure length
284
Chain Sequence
TYQPAKVWTWDKSAGGAFANINRPVSGPTHEKTLPVGKHPLQLYSLGTPNGQKVTIMLEELLALGVTGAEYDAWLIRIGDGDQFSSGFVEVNPNSKIPALRDHTHNPPIRVFESGSILLYLAEKFGYFLPQDLAKRTETMNWLFWLQGAAPFLGGGFGHFYHYAPVKIEYAINRFTMEAKRLLDVLDKQLAQHKFVAGDEYTIADMAIWPWFGNVVLGGVYDAAEFLDAGSYKHVQRWAKEVGERPAVKRGRIVNRTNGPLNEQLHERHDASDFETNTEDKRQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords yghU, glutathione S-transferase homologue
publication title Structure and Function of YghU, a Nu-Class Glutathione Transferase Related to YfcG from Escherichia coli.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Transferase
total genus 105
structure length 284
sequence length 284
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF13410 GST_C_2 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3c8eA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3c8eA01
4GSTA 2DLXA 3HA9A 4JBBA 5ELAA 2E7PA 3MWHA 1TTZA 2YZUA 4I5QA 1ML6A 20GSA 1JLWA 3F6FA 3GFKA 1M2AA 1HNAA 5H5RA 1V2AA 2P0GA 1ZZYA 2AV4A 1U6TA 1SJZA 5F06A 3HZ4A 2HQTA 1ERUA 2YN1A 5CRGA 3ZFBA 3EE2A 4LL4B 3CRUA 4MJCA 4HZ4A 5BMUA 3FKFA 1T1VA 1USBA 4NPBA 5E59A 4JEDA 2I3YA 1DSBA 4AF2A 4D73B 1GSUA 1S3DA 4GF0A 1B9XC 1BAYA 3DGQA 4G10A 2X8GA 3D0ZA 1ERTA 2WJUA 4DSQA 1QUWA 5EL8A 1XPVA 3OR5A 3TCOA 5JCGA 4GSNA 1GTAA 2IMDA 3F8UA 3WGDA 1V9WA 3S9FA 3J7Yk 3DKSA 5GAND 4EO3A 3DMLA 3EWLA 2O7KA 3FHKA 1Z9HA 4I6XA 2XBIA 4GCIA 1ZGNA 4TXOA 3F9UA 4JU5A 4NAXA 2HZEA 5KN3A 3CSJA 4DSSA 2FA8A 2JZRA 1BG5A 1JHBA 2PERA 1F6MC 3HHVA 3ZIVA 1TRWA 4WKWA 3L4NA 1ERWA 1NSWA 3NZNA 2B1LA 1SYRA 5CRDA 3E0UA 3UL3A 3FW2A 2FLSA 2VL3A 2VUPA 2JZTA 3A2VA 4KA0A 2XPDA 4ZB9A 2GVPA 2PPTA 1J08A 4BL7A 4PNGA 1WMJA 2C4JA 3LJRA 1UC7A 3HJOA 1MEKA 1U88A 1AUCA 2H74A 4EF0A 4PQHA 1XW5A 5DBQA 1CQGA 4J57E 4KCEA 2HRFA 3EMXA 5G1KA 1X5CA 3UEMA 4G0KA 4K7NA 5J9BA 1ZCPA 1MD4A 1ILOA 2MBTA 2C80A 3PH9A 3BBYA 5J4UA 2L6DA 1T7PB 4ECIA 1X9WB 3C1RA 4L5LA 4MF6A 5KN1A 5DDLA 2LSTA 1VF1A 3P2AA 6GSVA 3EC3A 3C7MA 4O7HA 3TKQA 4L0UA 3P7XA 2OBKA 2VL2A 1F2EA 2VL2C 4TKYA 4POMA 2FNOA 1XZOA 3E3EA 3FY7A 3HJMA 4V2MA 1TXXA 1K3YA 3DEXA 3RDWA 3KJYA 4FYUA 5C00A 5EVOA 2JL4A 2DBCA 3FZ4A 1EOGA 2WULA 2CX4A 4HU7A 4ECJA 3HJPA 3SWLA 1XWGA 2A2SA 4GSSA 4F0CA 3ERFA 13GSA 1K0AA 3DD3A 3F63A 4IVFA 1XXUA 3TGZA 1B8XA 4KDYA 1AAZA 1AW9A 3ZIJA 1V58A 4JR4A 3KXOA 1OC9A 3F6DA 1BJXA 5D93A 4AJ8A 3P90A 1EZKA 2PVQA 3TUEA 1OE7A 2V41A 4K7IA 2V1MA 3FK8A 2DJ2A 1H75A 3AY8A 1TK8B 3GX0A 2MMAA 2BMXA 2DJ0A 4KH7A 3FZ9A 2X8CA 1XVQA 3QOUA 4XS4A 5F05A 2NDOA 1O6JA 2GSTA 3IBHA 4FQUA 2K18A 3ZTLA 2LKUA 1LU4A 2DSAA 1J0FA 4O92A 2N5AA 1J9BA 4QL7A 2E2MA 3D22A 3KH7A 2C0FA 1YQ1A 1FOVA 2CVDA 5HR2A 3IR4A 4E8EA 2JU5A 4F03A 1GSEA 1WPIA 2AYTA 2ZUPA 2LJKA 3CMIA 2RLIA 4MH2A 5IPHA 3HCZA 2CV4A 4ZBAA 3QAWA 1Q98A 2GZYA 3ZLPA 3KMOA 6GSYA 5DAKB 4YQUA 2LRCA 2NTOA 2C0DA 3KTBA 3GHAA 5C04A 17GSA 2FGXA 18GSA 4TOPA 2LEGA 9GSSA 3H4KA 4HJ2A 1A0FA 2H01A 2WGRA 3QAVA 2HYXA 4OCEA 4ZBBA 3IAM2 1C72A 2R37A 1TI1A 2O89A 1XWBA 4K7OA 4MZBA 3LSZA 1WWJA 3JCML 1VF3A 3QMXA 1WJKA 2VCWA 1EP8A 4TRXA 2JACA 2XBQA 2H1DA 4J2FA 2VIMA 4LLRA 1O85A 4N0ZA 3IC8A 4MJEA 1AQVA 1LBKA 3WD6A 3FR6A 1WOUA 5H5SA 1A2MA 3I9V2 5AIVA 2OACA 1XOBA 2V32A 2XHFA 1ZOFA 1SK2A 2B5XA 2VCQA 1EGOA 4ZBDA 2ON7A 2K6VA 2GTUA 3NIVA 3CSIA 1X9MB 1OVNA 1SL0B 2XC2A 1EGRA 1JFUA 4ML1A 4KAEA 2XPEA 1GUKA 1R4WA 4MF7A 4BVXA 4MMMA 1FB6A 2DMLA 2YWIA 5COHA 3D21A 1H4OA 3IHQA 1N8JA 3RPPA 4KF9A 1TP9A 1TK5B 1PA3A 2KP1A 1QQ2A 2YZHA 4EUYA 2IMFA 2YJHA 1UN2A 4PTSA 5IQYA 2VD1A 4NXIA 2GGTA 1OE8A 4HZ2A 1I5GA 1QK8A 3TOUA 1RW1A 2X8HA 1Z3EA 2B7KA 3M8NA 3A2WA 5IM9A 4YQMA 4OWYA 1PGTA 2R4VA 2CA8A 3QD9A 3TJFA 2FWFA 1R5PA 4PGTA 4NV2A 4NWYA 1EWXA 1TKDB 4USSA 2CZ3A 2VLTA 2TRCP 22GSA 2DJ1A 1IYHA 1EOHA 1F3AA 2FA4A 2DJ3A 3TRPA 8GSSA 4DVCA 4NV5A 3G7IA 3F3RA 1YZXA 2MBSA 4YQVA 4LL1B 3CXGA 1XBSA 3KGKA 1TU7A 1ACVA 2HRNA 2DIYA 2LJAA 2WCIA 3GMFA 1X5DA 3TJJA 3F3QA 5ECRB 3ZVJA 3APSA 1K0BA 4MPFA 1EEJA 1QFNA 1K0MA 2ON5A 5CRHA 2OA7A 3HDCA 2OE3A 4IKHA 1KBNA 2O87A 2GZPA 3W6GA 2VCTA 2LQQA 3FZAA 5G2ZA 1PMTA 2G0FA 4DSSB 5GSTA 5HR0A 4BWQA 3LXTA 4F2IA 5E4WA 2YV9A 2L57A 1BX9A 3DIEA 5G5EA 3L9VA 1URMA 1BEDA 4V2LA 2CAQA 4G0LA 2GZZA 3Q6OA 3H93A 1Z7PA 5CYYA 3LGCA 1QMVA 4E8HA 1XIYA 1A2JA 3KEBA 5B8AA 1EV4A 3ME8A 3TKSA 3TKSC 2I4AA 1SYXA 1V40A 4HOJA 1GNWA 1Z5YE 3EMPA 3F4SA 1X0RA 3KCMA 4IP6A 1GL8A 2H75A 1TJDA 2AAWA 2CT6A 5D96A 5CO3A 1OAZA 2JSYA 3FYGA 3L78A 4GQCA 2AJQB 3KM6A 5AGYA 1ZYEA 2LRNA 1HQOA 3PR8A 1OKDA 3L0HA 1XOAA 5JWOB 3Q74A 2E0QA 4ZL8A 3DVWA 3WGXA 2GDRA 2PMTA 1YF0A 3GKMA 4RI7A 4KNDA 1EV9A 1VF2A 4JRRA 2M72A 2R2JA 4I2TA 3C1SA 5JWRB 3GKXA 1V57A 2IPAA 5J5NA 1U87A 3ZRDA 1XWKA 2HRKA 2IMIA 3GX8A 2C0GA 1Z7RA 2VO4A 5D9WA 1HYUA 2E2GA 4HI7A 4O32A 4OO5A 4ZILA 4Z7XA 4MK3A 2A2RA 4IQ1A 1M2DA 1FVKA 4WF4A 3UMAA 2TRXA 4FO5A 6GSUA 2H1AA 1FAAA 2IL3A 1OC9B 2DJKA 3HD5A 4XCSA 2VCXA 4P3YB 3GTUA 2QC7A 2AB6A 1NW2A 5D73A 3G7JA 3IDVA 5B8BA 1ZL9A 4GLTA 4GWRA 2NVLA 1R26A 2HI7A 1FHEA 2C3TA 1XVWA 3ZL5A 3QFBC 4BPYA 1KEBA 1FVJA 2HZFA 4WEYA 5G1LA 1GUHA 3TKRA 4WBRD 3GL5A 4AJ6A 1SL1B 4HU9A 3P8WA 2LNSA 1ST9A 3KH9A 5HR1A 1WP0A 2GSSA 4Q5QA 2KHPA 3H1NA 2LJRA 3US3A 1GSSA 1JZWA 5CNWA 4FH8A 3UVHA 2NPBA 2PN8A 1E2YA 1XW9A 3KD0A 4V1Ap 3A2XA 2HFDA 5D9XA 4D73A 1PX7A 1A8YA 4KCAA 4ACSA 2C3NA 1K0OA 2HLSA 2WB9A 1TK0B 3BD2A 1SKWB 5DJMA 3CBUA 4HDEA 2L59A 4OO4A 1TRVA 5ENUA 1ABAA 2YWMA 1YJ6A 4HQZA 1JZOA 3D4MA 2HXKA 2UZ8A 1AIUA 6GSWA 3EYTA 1NHYA 3EVIA 1R5AA 2YOIA 3F0IA 1G6YA 4ULXA 3TKSE 1OYJA 1K0CA 3MSZA 1PL2A 3LORA 4EDZA 4KSOA 3GN3A 1WRYA 3UARA 3M1GA 1E6BA 3ZMKA 2HSYA 5ECLB 4KUNA 1F37A 1SK0A 3A3TA 5IMDA 3GSTA 2FHEA 4MH3A 2H6YA 4KGIA 3KTLA 3IK7A 3GNJA 3KIJA 3UBKA 2H1BA 4ID0A 1M9AA 4EDYA 5CAXA 4PURA 2IFQB 1Q4JA 2I9HA 1SJ6A 5DALB 5ECIB 1S3AA 4POLA 3EINA 4GQFA 1SU9A 4Q5RA 3ERWA 5JCWA 4FYCA 1QXHA 1GULA 4QL9A 4K2DA 1K3LA 3GH6A 2VLVA 3ZZXA 4BVYB 3WT2A 2VM2A 4YAVA 1NM3A 4ML6A 4IQAA 3TJBA 3KP8A 2H70A 1RK4A 3GYKA 4IGJA 2RIIA 2OADA 1PL1A 1XWCA 3LXZA 4G9HA 2MYGA 3TJKA 1GSYA 1GLQA 4PQIA 5F07A 1G0TA 3H8QA 1Y6EA 5EPFA 4PX1A 2GSRA 3HVVA 2YCDA 1VRSD 1JLVA 4ECBA 1GLPA 1GTIA 1O81A 4IW9A 2H8LA 4PUAA 1ZYQB 4XS1A 2PUKC 1UVZA 3PGTA 2VLUA 2LTKA 2G2QA 3U6VA 5HFKA 1Y25A 3IAS2 4MP4A 5FT3A 1THXA 1DUGA 3GSSA 4O5RA 4MPGA 4TW5A 4HJMA 2JZSA 3LYPA 1GRXA 5KN2A 3VFIA 2EC4A 4IJIA 4OCFA 2HE3A 2LRTA 3TRXA 2N5FA 2ZCTA 3O6TA 2RUFA 4WXTA 1THOA 1ZMAA 3GUSA 1KNGA 1GSFA 2PVOC 1A24A 3KZQA 5F8BA 2QGVA 12GSA 1AXDA 4XS6A 1A23A 3W8JA 1FO5A 5DCHA 5CRWA 4CHSA 1GSDA 4I97A 3C71A 1FB0A 1SKSB 2YNXA 2DJJA 1NHOA 4IHUA 4AGSA 1PSQA 1B48A 2O85A 3CTFA 2L4QA 2NBSA 2B5EA 3VWUA 2X64A 1GUMA 2R3XA 5F0GA 1T4YA 3TKPA 5ID2B 2WRTA 3Q18A 3HKRA 2F8FA 4L0WA 1X9SB 3QAGA 3FEUA 3IXRA 5D9TA 4G0IA 4RQXA 4EXJA 2RM5A 5DAKA 4POKA 5IMFA 3FR9A 4L8EA 2B1KA 4N30A 2CVBA 2H71A 2WZ9A 4WBJA 2WS2A 4K0NA 1B4PA 5LD0A 4KSMA 4MZWA 2ZNMA 2IMKA 2CQ9A 2J9HA 4EVMA 4LA1A 4OD7A 4F0BA 1BYEA 3L9UA 3DVXA 4LMWA 1CQHA 1M99A 2GSQA 4TR1A 2YP6A 3LWAA 4GRFA 2MMOA 3O76A 1B9YC 4I2UA 2YWNA 2IIYA 4ZIJA 2DC5A 2MMNA 3BCIA 3VWWA 3LEFA 4XHMA 1PQNA 3UAPA 4TR3A 3N5OA 4EKZA 4DSRA 1EEMA 1A2LA 5FHIA 2TIRA 5IO2A 4LMVA 3KMNA 3LFLA 2YPMA 3ZITA 4N0VA 3LYKA 2B5YA 2GQLA 1R7HA 4EE0A 4HS1A 3ZVJD 4BWSA 2R6KA 1AQXA 3FRCA 2CVKA 3VURA 4TXOB 1YKAA 2HZEB 2I81A 5HFGA 4ECCA 4WR5A 5ECKB 2VL9A 2H72A 4J56E 4V2NA 2OKAA 4IBPA 1T00A 2A4VA 1ERVA 5CREA 1GTUA 5G5FA 1MDKA 3LQ7A 2KUCA 1U3AA 2H0IA 2OJLA 4MJBA 1MTCA 2VCVA 3ISOA 1SK1A 3BCKA 1TDIA 3VPTA 3UOMA 5GAPD 1SKRB 2QSIA 4PXOA 4JR6A 4BL7B 1YEPA 5D9VA 2WDUA 1M0UA 3VWVA 6GSSA 2P31A 4H86A 3H79A 2M80A 1M7TA 3DWVA 4NMUA 1YDKA 3QFAC 3DYRA 2H6ZA 2HSMA 3HZ8A 2GT5A 1BQ7A 2F8AA 1GSQA 2LNTA 2CZ2A 4MA9A 1PKWA 4PNFA 1AC1A 3IOSA 4X1UA 4NHZA 2YJ7A 2VM1A 3O3TA 2L4CA 2H76A 2BJXA 3RBTA 3VLNA 2IJYA 3HYPA 3RAZA 3BOAA 3VI7A 3QPMA 16GSA 1T3BA 4GXZA 5ECHB 3CTGA 14GSA 3FZ5A 3GIXA 1OC3A 4F82A 3TRQA 1XWAA 1V98A 5D8IA 1F9MA 2N5BA 1JZDA 2VCZA 2X99A 1SL2B 4TVEA 5ECMB 3QCPA 1X5EA 2IN3A 4OMVA 2OE0A 4CW9A 1PRXA 4Q5NA 4L5OA 2MMZA 2K9FA 3GKKA 1GTBA 1O73A 2FD3A 2H6XA 4IJ3A 4PQ1A 3IA1A 3G9BA 5CP1A 4JZQA 5IOWA 4K6XA 2HNLA 3GV1A 4GTUA 4MLYA 5ABRA 2GT6A 1TRUA 2B6MA 4MJAA 2GLRA 1FG4A 4ZXGA 3CSHA 4ZL7A 4G19A 1PKZA 5FWGA 2H66A 5A4WA 3I6AA 2PWJA 3TOTA 4MF5A 3UIWA 1XFLA 1M2BA 2L6CA 1YF1A 5IPGA 5ECQB 2Z9SA 2GQMA 2YV7A 2K8VA 1F3BA 1SENA 3RHBA 2PU9C 2AHEA 4HUAA 5IIZA 3F4RA 2RM6A 4XS4B 1HNCA 3D6IA 2C0EA 2FY6A 4ZL9A 2V6KA 3EURA 2H0HA 5DVBA 3ME7A 5ECPB 5J3RA 7GSSA 2IWTA 1T4ZA 1PX6A 2R5GA 4QQ7A 1IYIA 1AQWA 4MDCA 4AJ7A 1W4VA 2ALBA 1JZRA 2O8VB 3G7YA 5DQSA 4RI6A 2P5RA 3M0FA 2ES7A 3IV4A 3L9SA 5AISA 5IMAA 5J41A 3DXBA 3K8NA 3IRAA 4IELA 3A5WA 1T8EB 2M46A 5IMZA 3GURA 2L5OA 1TRSA 2VOCA 1PN9A 1TI3A 3RPNA 1A8LA 1HNBA 3J7Yb 3IK9A 5GSSA 1XW6A 1WE0A 3R2QA 5B6NA 1TU8A 1O8XA 2YANA 5A4UA 4OFNA 3MDKA 5GZZB 4OFTA 1N2AA 3CRTA 4JE1A 5DQYA 1GWCA 4YAPA 3BJ5A 1A0RP 1MDJA 4KB3A 5ECOB 2PBJA 4N11A 3TJGA 2VD0A 4HQSA 3IC4A 6GSTA 2K8SA 4XTSA 4Q5FA 3QDNA 4ISDA 1SD9A 1YY7A 2KP2A 5KN0A 3IE3A 2QKEA 6GSXA 1GP1A 2GS3A 4ZB8A 2FCHA 3HVSA 3APQA 3ERGA 1G7OA 3D5JA 1O8WA 4RUVA 1SJIA 2JADA 1DE2A 2P5QA 4X0XA 1M9BA 3MNGA 1KTEA 4X43A 1WIKA 2HT9A 2C3QA 1B4QA 5IO0A 2H73A 2OE1A 4BVXB 1QGVA 2B7JA 2J23A 2DIZA 1MD3A 3WYWA 1VF4A 3LG6A 2YWOA 2H30A 3GRXA 5IMVA 2RUEA 1OC8A 3GH9A 4XIHA 1PD21 2LV3A 2H19A 1W89A 1K0NA 5H5QA 4RQRA 1K0DA 5HFIA 4FIWA 1OKTA 3GL3A 2FUG2 4KX4A 4XRDA 4IN0A 4WR4A 3ZMLA 3U5RE 1TW9A 4V1Ag 5A5KA 3SBCA 4EL1A 5DJLA 2PGTA 5IOXA 3V1WA 4PUFC 2V6OA 4TR1B 2HRAA 4TN8A 10GSA 4FYBA 2OBIA 2H0GA 1HD2A 4TR0A 3I43A 2IFQA 3N9JA 5DALA 3ZFLA 2FWHA 1I9DA 3VWXA 1VGLA 2MZCA 3D4TA 2B3SA 4K0GA 4BA7A 3WGEA 5B7CA 4IP1A 3PPUA 4EC0A 5LNKe 2VAFA 4BVYA 1GNEA 3WT1A 5ECNB 1G7EA 3ZREA 1GH2A 4K9ZA 4YH2A 2V2GA 3DRNA 2BTOT 1MDIA 4NHWA 1UA5A 3VI5A 4DEJA 2L5LA 4KDUA 4I8BA 4G2EA 3E9JB 3VK9A 3TDGA 4IS0A 3VPQA 2IMEA 3F4TA 3HVXA 4TR4A 3UBLA 5JWQB 1ON4A 2CAIA 5HR3A 5HQPA 3HY2A 3C73A 2REMA 2CX3A 5LCZA 4HEA2 5JCUA 2D2ZA 5G31A 2HSMB 1Z6MA 1LJRA 4MABA 5AN1A 3GKNA 4N10A 1DBYA 3R3EA 3FR3A 3KP9A 1U3IA 1TOFA 3HXSA 5INYA 4POBA 3APOA 3EU3A 2C1YA 4MCUA 2C8UA 2EIOA 1XCCA 2KOKA 4ZB6A 2EIRA 2HSNB 5AIXA 3UJ1A 3C8EA 3CYNA 3RHCA 3M9KA 4F9ZA 2AUVA 2FWEA 4K8MA 1FW1A 2F3MA 3MAKA 5EY6A 3EU4A 3QR6A 3NOFA 3TB2A 2KLXA 4XRAA 4WETA 5A4VA 4WF5A 4MZCA 4KW6A 2HRKB 19GSA 5J9CA 2F51A 3W8SA 3IPZA 5B6MA 3GA4A 3M9JA 4ILFA 5KEJA 2LQOA 1DE1A 11GSA 2HSHA 2GQKA 5IMCA 4K1FA 3I69A 4KDXA 1K3OA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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