4F0BA

Crystal structure of the glutathione transferase ure2p1 from phanerochaete chrysosporium.
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
220
structure length
220
Chain Sequence
TDKPVVHYTAPTPNGWVPAILLEELKAVYGGPDYETVKMSIRDADIGKVHNQVKSDWFLKICPNGRIPAITHEGFPVFETSAILLYLAQHFDKENAFSRDPVKDPKGYSEELQWLFFAHGGIGPMQGQANHFNLYAPEKIPYAINRYLNESKRLYRVLDDRLKGREYILGTYGIADIKIFGWARIAPRTGLDLDEFPNVKAWVERIEKRPAVQAGINSCN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords THIOL TRANSFERASE
publication title Atypical features of a Ure2p glutathione transferase from Phanerochaete chrysosporium.
pubmed doi rcsb
source organism Phanerochaete chrysosporium
molecule tags Transferase
total genus 85
structure length 220
sequence length 220
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00043 GST_C Glutathione S-transferase, C-terminal domain
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4f0bA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4f0bA01
1AQWA 1DSBA 1AIUA 3IPZA 1NM3A 2CV4A 2VL3A 5DAKA 4Q5RA 1SJ6A 3IE3A 4BVYA 4IN0A 2GS3A 1M2AA 5ECIB 1SKRB 4XRDA 1QXHA 4MF7A 1H75A 2R6KA 1XW9A 5KEJA 3EYTA 2C4JA 3WD6A 5FHIA 5A4WA 5CNWA 5B8BA 2CVBA 1SKWB 2CAIA 2H1GA 2ZCTA 2LUSA 4KCEA 5B8AA 4KUNA 1MD4A 2HRFA 5DQYA 3DRNA 3TKQA 2ZNMA 1KEBA 4AJ8A 4IELA 2C0FA 2X8GA 3QAWA 4ECJA 2PU9C 5AIVA 1FVJA 1THXA 3ZYWA 3FR9A 1ACVA 3BCKA 1TW9A 3AY8A 3IA1A 4RQXA 4F9ZA 3LEFA 1Z9HA 3P8WA 4HEA2 3KGKA 3M1GA 3UL3A 2REMA 5DCGA 9GSSA 1W89A 1FW1A 1TK8B 2O7KA 3HJOA 3R2QA 4POBA 2GSQA 3KP8A 2HSYA 3C1SA 2ON5A 1GSSA 2JADA 14GSA 2YZHA 2H71A 2AHEA 4K1FA 3QAGA 3EMXA 2IN3A 1ZCPA 3ED3A 2NTOA 3KM6A 2H0IA 3G7YA 1ST9A 1B4QA 1R4WA 3L9SA 3KTBA 1XVQA 3D0ZA 4ML6A 3ZITA 1T1VA 2GT5A 4MZWA 1SL2B 1QFNA 2B7KA 3P7XA 3DD3A 2AYTA 3GTUA 1Q4JA 1NHYA 1X5CA 1UA5A 3TJFA 3DWVA 1LJRA 5JWOB 2YJHA 3CSIA 4KB3A 3QFBC 2NPBA 3GRXA 3A5WA 1XWCA 2L5LA 1X5DA 3KH7A 11GSA 1KNGA 2HYXA 4EXJA 1YEPA 1V98A 3FR3A 1K3YA 4K6XA 4ZBBA 1IYHA 1YJ6A 3TKSE 1U87A 4K0GA 2XBQA 2QSIA 2O89A 1PL1A 4MLYA 2LJKA 3A2WA 4Q5FA 6GSXA 1NHOA 3D4TA 1XWAA 4JR6A 2B1KA 3RAZA 3D21A 4ZB6A 2B5XA 2LTKA 3N9JA 1T4YA 3GSSA 4LMVA 1PRXA 16GSA 3TOTA 1LU4A 8GSSA 4GSSA 20GSA 1B8XA 5ECMB 2IFQB 4MJAA 2H19A 1MDKA 2C80A 5FWGA 4GCIA 4D73B 4YH2A 2GQMA 4OCEA 3HKRA 3IR4A 2FGXA 3M0FA 6GSUA 4G19A 3OR5A 4FH8A 2C0GA 4IJIA 2HXKA 2JZSA 3VWUA 3RPPA 1A2MA 3F6DA 3EMPA 1TI3A 1XXUA 3W8JA 2GQLA 3C71A 2VLUA 3WGDA 1G6YA 3HJPA 3MAKA 1EOHA 1BQ7A 4AF2A 3UAPA 3C7MA 1CQGA 5EVOA 4GTUA 4HDEA 1R5PA 3M3MA 1PKZA 1S3DA 1N2AA 2VM2A 3TJJA 4GF0A 2DSAA 4L5OA 5DCHA 4MPFA 3ZIVA 3EWLA 2ALBA 2FHEA 3R3EA 4ISDA 3QDNA 5B7CA 1YQ1A 2HE3A 1A0RP 4NAXA 1OC9A 1X9SB 4JE1A 4WXTA 4HZ4A 4EKZA 3TUEA 4MJCA 4PQ1A 4X0XA 2MMNA 3MSZA 2YWIA 3H79A 4F82A 4BL7B 2GZYA 4HQSA 2QKEA 3CBUA 4G0KA 1U88A 2AUVA 5IQYA 5D9XA 2VUPA 1YKCA 4PNFA 3BJ5A 2JSYA 3I6AA 2P0GA 1M2DA 4USSA 2V6KA 4XS4B 4YQMA 1SL0B 1THOA 2IL3A 2TRXA 2L4QA 3VFIA 2WRTA 2WDUA 2OKAA 5HFIA 5CYYA 4IJ3A 4ZB9A 5J41A 2WULA 1SL1B 1PQNA 3IC4A 3NOFA 1S3CA 5CREA 3J7Yb 4ZXGA 4KGIA 4EC0A 3EE2A 1XWGA 5C04A 3KMOA 2CZ2A 2EIOA 2HFDA 3O3TA 1ZMAA 3EURA 1Y6EA 4HS1A 3LXTA 4OWYA 1V2AA 2FWEA 1PMTA 1RW1A 3IAM2 4WF5A 5EPFA 1QGVA 2YANA 4ACSA 5G1KA 3CMIA 2PVOC 5KN2A 1XZOA 2WJUA 2MZCA 5AISA 2HLSA 1GNWA 4KDYA 1XOAA 5GAND 1ZGNA 1JHBA 5ABRA 3D5JA 1AAZA 3C73A 4N30A 2X64A 2FY6A 3F9UA 2C1YA 3HVXA 1X5EA 4IVFA 3E9JB 2IJYA 3GUSA 3TOUA 5GSTA 5IMCA 1J0FA 5G5FA 3DVXA 5GAPD 3UMAA 4I8BA 1XIYA 4POLA 1XOBA 5F8BA 5JWRB 2IMEA 2PUKC 1XCCA 1Z6MA 3TKSA 4MCUA 2HZEA 5CAXA 2B1LA 3P90A 4MZCA 3S9FA 2EIRA 4IQAA 1I5GA 2YWMA 5AIXA 2HT9A 3HZ4A 1WOUA 3E3EA 3TKRA 2C3NA 1DE2A 2WFCA 1F3BA 4PGTA 2X8HA 4KX4A 3TJBA 4IP1A 3CRTA 2KP1A 1PX6A 1O8XA 4G0IA 3GX8A 1URMA 3FZAA 2DIYA 1HYUA 3HY2A 4YQVA 4BVXA 3F3QA 4TR4A 1OVNA 2L59A 5B6MA 1JFUA 1A8LA 3BCIA 5G31A 1EP7A 5CO3A 2A2RA 2V1MA 3VPTA 2XPEA 1ZYQB 4LMWA 1K0BA 4OFTA 5DQSA 2C0EA 1M2BA 1BG5A 4K7NA 2HZFA 1OAZA 3GV1A 4N11A 2K6VA 1PGTA 2WZ9A 2VCWA 5G5EA 3CTGA 1TKDB 2C0DA 3ZLPA 3TJGA 1X9MB 3RPNA 4OO5A 1I9DA 5H5QA 4MH2A 1Z5YE 2L4CA 1GNEA 3SWLA 2IMIA 1QK8A 1SK1A 3LWAA 2HRNA 3HYPA 4JU5A 1TRVA 3TB2A 1EEMA 3Q18A 5D9TA 5LCZA 1TRWA 2YNXA 1OC8A 17GSA 3GH9A 4KE3A 2H72A 2CZ3A 2C8UA 1KBNA 2YWOA 5A4VA 2BJXA 1GTBA 4EO3A 1QUWA 3Q19A 2VL2C 4OCFA 1PD21 1GUKA 5HR2A 4K2DA 2MBTA 4ZBAA 2OA7A 1M0UA 2K9FA 1WMJA 4AJ7A 5IO0A 5GZZB 5HR0A 2WS2A 5ECHB 2VCQA 3FZ5A 3IOSA 4PUFC 3BD2A 1EP8A 2O8VB 3HA9A 1O85A 1C72A 4KF9A 4J57E 1PSQA 4XCSA 4TXOA 2NDOA 2GTUA 4NV2A 2VO4A 2RLIA 2LQOA 4P3YB 2H75A 3L4NA 2N5FA 1X0RA 2F9SA 4KSOA 3IK7A 2X99A 2JL4A 1F37A 4ZL8A 1GTAA 2DJ0A 5IM9A 3L0HA 1JZWA 2YV7A 4TR0A 4ZL7A 4TR1B 1EV4A 4ECBA 5F05A 2FWHA 2DJ1A 1A23A 3ZRDA 4GXZA 2DBCA 3GFKA 2JZRA 3UVTA 2IIYA 4WKWA 3DYRA 5ECSA 5H5SA 3G9BA 4L0UA 5AGYA 2NVLA 3HZ8A 2GDRA 2X8CA 5IIZA 5DALA 5ECNB 3KCMA 4I97A 1SJZA 2FCHA 5LNKe 5DJMA 1K3LA 4TR3A 3UEMA 2HSMA 1GP1A 1Z7RA 4BWQA 1SYRA 2R3XA 2FA4A 1WP0A 3FZ4A 3QFAC 5ID2A 2LRTA 3APOA 1FB0A 2CT6A 3GX0A 2LNSA 5CRDA 4EF0A 1BAYA 1PA3A 2LEGA 3M9JA 4QL7A 4G2EA 1UN2A 2TRCP 4KDUA 3MWHA 3VURA 1FAAA 3P2AA 3RDWA 5F07A 2I3YA 2QC7A 3IDVA 4BPYA 2NBSA 22GSA 3ZMKA 6GSWA 3LFLA 1F3AA 1GTUA 3CXGA 4JBBA 5E4WA 1GL8A 3ME8A 1PKWA 5A5KA 1V9WA 4V1Ap 4MK3A 3NZNA 4MZBA 1B9YC 1VF3A 5GSSA 5HFGA 4WR4A 1O7UA 1BJXA 4EUYA 3UARA 3F8UA 2DJ2A 1O73A 4GSNA 2H6YA 1ZYEA 3E0UA 4MH3A 3A2XA 2FLSA 2HZEB 3EC3A 4Q5QA 1A0FA 2O85A 4RUVA 3LSZA 3TRPA 2YV9A 1B9XC 2HRKA 1F6MC 1O8WA 1KTEA 4IW9A 4NXIA 4OD7A 2A4VA 4IGJA 3QR6A 2H8LA 3GURA 1EOGA 4FYUA 2JU5A 5KN0A 1PN9A 2B6MA 1XWBA 1M7TA 1GUMA 3GNJA 3VPQA 1YY7A 3GL3A 3JCML 1Z7PA 3PR8A 2LNTA 3M8NA 3KH9A 4MABA 4PXOA 3HJMA 2OE3A 5EY6A 3IC8A 1GUHA 3FEUA 3H4KA 2V2GA 3UJ1A 3U6VA 4XIHA 2I1UA 4MPGA 4I2UA 5D96A 3SBCA 4PUAA 5L71A 3ZTLA 5IOWA 3UVHA 2GT6A 1OC3A 1ZL9A 1V58A 2DMMA 4X1UA 1K0CA 1AC1A 1SYXA 5AN1A 3F4RA 2PVQA 4K8MA 2CAQA 4YAVA 2VIMA 3M9KA 4FYCA 1TRSA 4JRRA 4POKA 3G7JA 2PWJA 4ULXA 3D22A 3GKXA 2MMZA 1FVKA 1FB6A 2H76A 1AXDA 4YQUA 4ZL9A 4ZILA 4F0BA 1ERUA 4ILFA 4XRAA 5IMAA 3A3TA 4DSSB 3PH9A 2TIRA 1X9WB 3WT1A 3TCOA 1F2EA 3I69A 4KA0A 2PBJA 6GSSA 3ISOA 2GSSA 3HVSA 2K8SA 2H74A 3FYGA 1TXXA 5HR1A 4HOJA 4GSTA 2H0HA 2CVKA 4PQIA 5CRGA 3GA4A 3RHCA 3VLNA 10GSA 1TTZA 2OBIA 2XBIA 2PGTA 3H93A 4MDCA 2PERA 3KD0A 2E7PA 3UBLA 1V57A 1CQHA 1GSFA 1GWCA 5DAKB 2FUG2 4XTSA 3H1NA 4BVYB 5J4UA 2C3TA 3LJRA 4MJEA 3QCPA 1HD2A 2YCDA 3IXRA 4ID0A 5LD0A 2AV4A 4DEJA 2XHFA 5J3RA 1GSDA 3G7IA 2AJQB 2V6OA 5FT3A 3DIEA 4OFNA 3GH6A 4JEDA 4O7HA 3MDKA 3BBYA 5CP1A 2PMTA 2B3SA 3DMLA 2PN8A 4TVEA 4V2LA 1Q98A 4LA1A 2AB6A 4AGSA 4LL4B 2R37A 1W4VA 2L6DA 4L0WA 1XBSA 3LQ7A 4JR4A 5JCUA 4Q5NA 3WGXA 3ZREA 3ZFLA 3TDGA 1WIKA 2BTOT 3F4SA 4NWYA 3DGQA 5IMDA 4O92A 1WJKA 2B5EA 1AQVA 3PINA 2IFQA 1DBYA 3FK8A 4IBPA 1IYIA 3ZFBA 4E8HA 5DVBA 3ZZXA 1V40A 2DLXA 2OACA 3ZMLA 4PNGA 1K3OA 1A2LA 2LS5A 2MMOA 3GTUB 3W6GA 2HSHA 3W8SA 4KAEA 1A8YA 1ABAA 4G9HA 3K8NA 4TXVA 4HJ2A 2J9HA 1OYJA 2VCVA 1USBA 2HNLA 2VLTA 2IMFA 5IMFA 2GSRA 1EV9A 3VWXA 4I5QA 2G0FA 4FYBA 4TKYA 2F3MA 3HD5A 2E2GA 2YZUA 3CTFA 4LL1B 2H66A 3ERWA 5IOXA 3US3A 4WETA 3ERFA 2DJ3A 1O6JA 4K9ZA 4BL7A 2OADA 5A4UA 5H5RA 4F0CA 1A2JA 1M9AA 3LYKA 2UZ8A 3KEBA 2BMXA 2HRKB 4CDOA 4L8EA 1BEDA 3FHKA 2Z9SA 3GMFA 4XS4A 4BWSA 2F8AA 3CYNA 4K7IA 5COHA 2L57A 1G0TA 3QMXA 3GIXA 2E0QA 2HQTA 3GKNA 4RI6A 2XC2A 2H70A 2MYGA 5ECRB 2VM1A 4XS1A 3KZQA 2YN1A 1TDIA 3DXBA 4KNDA 2FWFA 1SU9A 13GSA 1U3IA 2N5BA 3F0IA 3F63A 12GSA 2L6CA 1GLQA 4ECIA 6GSYA 2LRNA 2ON7A 1GSUA 2JZTA 2OJLA 5HQPA 3L78A 1VF1A 2H73A 3TRXA 2VCZA 1T7PB 1JZDA 1TU8A 4MA9A 1OC9B 2KUCA 3J7Yk 3ZL5A 2H6XA 1GTIA 7GSSA 2OBKA 2GZZA 1AQXA 1HNBA 3EINA 2D2ZA 2RUFA 2J23A 2IWTA 1PL2A 3D6IA 3RBTA 3DKSA 5CRHA 2AAWA 3I9V2 4V1Ag 3CSJA 1AUCA 5ECPB 2G2QA 4EVMA 2GSTA 4WF4A 4OO4A 2XPDA 1OKDA 1OE7A 5D9WA 5G2ZA 1UC7A 1ERTA 3IV4A 1EEJA 4TW5A 1HQOA 4QL9A 1JZRA 5D73A 4TRXA 1J9BA 1UVZA 3TKPA 2VCXA 5JCGA 4LLRA 4JZQA 6GSTA 1TU7A 1TP9A 3TGZA 2KOKA 5ECOB 1R5AA 2I4AA 3KTLA 1ERVA 2DC5A 2K18A 1K0OA 1SKSB 3EU3A 1YDKA 2F8FA 2WGRA 4G0LA 1FG4A 1U6TA 3DVWA 5CRWA 4F03A 3V1WA 3H8QA 3QAVA 3UIWA 1U3AA 1XW6A 2QGVA 1K0MA 1SK2A 1XW5A 1YF0A 4O5RA 2O87A 2LQQA 1F9MA 1GSYA 3CSHA 4QQ7A 4FIWA 3KIJA 1HNCA 1S3AA 4GRFA 1YF1A 5E59A 1A24A 5ELAA 3FKFA 3FY7A 1QQ2A 2HRAA 4XS6A 2M80A 5B6NA 1R26A 1EWXA 1T00A 3QPMA 2MBSA 2VL2A 4KDXA 2PPTA 4N10A 1VF2A 1Z3EA 2YPMA 1ILOA 1HNAA 1QMVA 4GQFA 1MTCA 4XHMA 2H0GA 4WBRD 1WPIA 4CW9A 1YKAA 4DSQA 5IPHA 2LSTA 1SD8A 4N0VA 4KH7A 1K0DA 1NW2A 2B7JA 3ZVJA 3LYPA 3GN3A 2RM5A 3F4TA 1T8EB 5JCWA 2IPAA 3HHVA 3O76A 1VRSD 2H6ZA 4PX1A 2IMDA 3IAS2 2ZUPA 3GYKA 1AW9A 2YP6A 5ECQB 4IQ1A 3IK9A 1ZZYA 2CQ9A 2KP2A 2H30A 1JLWA 1GLPA 6GSVA 4WR5A 1G7EA 4GLTA 5IPGA 2R2JA 2FWGA 4ML1A 5INYA 2LKUA 2L5OA 3GKKA 2DIZA 3D4MA 3I43A 4BVXB 3FR6A 2YOIA 5ENUA 1E6BA 5BMUA 4NPBA 4CHSA 4AJ6A 1B4PA 3TKSC 2VLVA 1R7HA 3WYWA 2I9HA 1O81A 1GSEA 2FA8A 4RI7A 2H01A 1SJIA 2LJAA 4PURA 4OMVA 2CX3A 4V2MA 2P5QA 3VI5A 3L9VA 1M9BA 1DE1A 4HJMA 3PPUA 2LRCA 4ECCA 3KMNA 2B5YA 4MF6A 3PGTA 1EZKA 3QD9A 2HSNB 5ECLB 4PQHA 4HUAA 4EDZA 1XFLA 2M72A 2KHPA 1FO5A 3WT2A 5IMZA 3HXSA 4ZIJA 2H1BA 3IRAA 3HCZA 1TK0B 3QOUA 2GVPA 4GWRA 1G7OA 4TR1A 5D8IA 1XWKA 3VWVA 4WBJA 2R4VA 1J08A 3KJYA 4X43A 3LG6A 3FW2A 2ES7A 5JWQB 2LV3A 4NHWA 3GSTA 5ECKB 5ELGA 4HI7A 2VCTA 1ML6A 4ZBDA 2GGTA 2VL9A 1TRUA 1GULA 2N5AA 5HFKA 4I2TA 2FNOA 3F3RA 1ERWA 1TK5B 5D9VA 1OKTA 2GLRA 5EL8A 2I81A 5D93A 3IHQA 1EGRA 1MD3A 3BOAA 1WRYA 3EVIA 4TXOB 2K8VA 3CRUA 1JLVA 1OE8A 1WE0A 3VK9A 2JSZA 4MJBA 3APSA 5HR3A 1K0NA 2C3QA 2M46A 3GHAA 3C8EA 3HVVA 5G1LA 4HU7A 1MDIA 19GSA 3APQA 1SD9A 3MNGA 4IS0A 3Q6OA 4J56E 1JZOA 4NV5A 3WGEA 3ZVJD 4EE0A 2VD0A 2P31A 1TJDA 3O6TA 4HQZA 1YEXA 2E2MA 4EDYA 4WEYA 1SK0A 2VAFA 2OE0A 4DVCA 4IKHA 2RUEA 4KSMA 4L5LA 3GKMA 5IMVA 5DALB 2EC4A 2KLXA 2WB9A 2DJJA 3ME7A 4J2FA 2R5GA 4TN8A 1DUGA 1NSWA 3TRQA 1K0AA 4EL1A 1Z6NA 3ERGA 3ZIJA 1H4OA 4RQRA 3A2VA 2F51A 2HSMB 5C00A 4N0ZA 1FHEA 4DSRA 3C1RA 4V2NA 1T4ZA 2LJRA 2OE1A 5ID2B 3LXZA 4MF5A 1SENA 5G30A 1WWJA 3UBKA 1N8JA 2YWNA 2EIQA 4TOPA 2VD1A 4D73A 1XPVA 2V41A 4FQUA 1TI1A 1ZOFA 3GL5A 5J9BA 3VI7A 1TOFA 3IBHA 3Q74A 1LBKA 1GRXA 4ZB8A 4IP6A 3VWWA 1T3BA 3L9UA 5DDLA 2FD3A 1GSQA 3TJKA 1MEKA 1VF4A 4BA7A 4FO5A 1RK4A 1YZXA 4G10A 1G6WA 2DMLA 1B48A 4E8EA 2DJKA 4GQCA 1BX9A 2P5RA 2RIIA 1E2YA 4OFMA 5DBQA 4MP4A 2YJ7A 4HU9A 1ON4A 4POMA 2MMAA 5J5NA 1XVWA 4KW6A 2WCIA 5F06A 3U5RE 5IO2A 2V32A 5DJLA 4YAPA 4Z7XA 4K0NA 3KP9A 5KN3A 3FRCA 4F2IA 4HZ2A 1EGOA 3LGCA 3DEXA 2HI7A 2H1AA 1BYEA 4MMMA 2GQKA 3UOMA 4H86A 2VOCA 4KCAA 4PTSA 1VGLA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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