2IHOA

Crystal structure of moa, a lectin from the mushroom marasmius oreades in complex with the trisaccharide gal(1,3)gal(1,4)glcnac
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
292
structure length
292
Chain Sequence
SLRRGIYHIENAGVPSAIDLKDGSSSDGTPIVGWQFTPDTINWHQLWLAEPIPNVADTFTLCNLFSGTYMDLYNGSSEAGTAVNGWQGTAFTTNPHQLWTIKKSSDGTSYKIQNYGSKTFVDLVNGDSSDGAKIAGWTGTWDEGNPHQKWYFNRMSVSSAEAQAAIARNPHIHGTYRGYILDGEYLVLPNATFTQIWKDSGLPGSKWREQIYDCDDFAIAMKAAVGKWGADSWKANGFAIFCGVMLGVNKAGDAAHAYNFTLTKDHADIVFFEPQNGGYLNDIGYDSYMAFY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the marasmius oreades mushroom lectin in complex with a xenotransplantation epitope.
pubmed doi rcsb
molecule tags Sugar binding protein
source organism Marasmius oreades
molecule keywords Lectin
total genus 87
structure length 292
sequence length 292
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-09-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF14200 RicinB_lectin_2 Ricin-type beta-trefoil lectin domain-like
A PF18021 Agglutinin_C Agglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2ihoA01
3.30.460.70 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Beta Polymerase; domain 2 Beta Polymerase; domain 2 2ihoA02
5EC5A 1VCLA 21BIA 3OJ2A 3O3QA 4QO3A 2AQZA 3UD7A 5D61A 3AH1A 3ZC8A 2D20A 4I4PA 2K4AB 1SR4C 3FJDA 1PZZA 4I37A 2D7RA 4A7ZA 3HBWA 2LIQA 1AFCA 4LO1A 1I1BA 3OGGA 3CAHA 3WA1A 1JLYA 4H9WA 1BARA 1ISWA 5HPZA 3FUOA 1RG8A 3IIRA 3AJ5A 1YF8B 4D0TA 7I1BA 1JQZA 5EG6C 2DREA 1Z0HA 2K43A 2X2TA 3NBDA 3JUTA 4I4OA 3NBCA 1T4QA 1RZOB 1N4KA 1V6UA 5DUYA 2KKIA 5D63A 1RMLA 3PHZA 4DENA 1MD6A 3UD8A 4J2YA 3VEQA 4ISRA 1G9DA 3H6RB 5FZYA 3BADA 1SZ6B 3FFZA 3ZXGA 3ZXDA 2DRZA 3V0BB 1Q04A 4HJJA 1BLDA 2BFHA 3N7KA 1II4A 1J0SA 3VSFA 1YTOA 3FJHA 2Y9XE 1IJTA 1FMZA 3FJ8A 5F90A 5BVPI 1EV2A 4PC4A 5FNWA 1ABRB 4QKRA 3CA3A 4OWLA 3VT1A 1QQKA 4I7IA 1ISYA 1G9AA 3LLPA 4JKQA 2Y9FA 1I1EA 1YBIA 2HZ9A 1S0BA 2VXTI 5JLVA 4I8MA 3H6QA 2F2FC 4KBBA 5BP5C 5F8SA 3VT2A 4P0JA 3MALA 3AZWA 1YXWA 1GGPB 4IZXA 3VSZA 1HCDA 4USOA 4ZKTB 1S0FA 3IM6A 1YYNA 4OW4A 3VWCA 2D44A 1ISVA 1BASA 4A7YA 2HWAA 4IONA 4L4IA 41BIA 1HIBA 3HOMA 3AKIA 4Z9WB 1XYFA 3LTQA 4IYBA 1F31A 3CRHA 4J23B 4F83A 2Y9GA 1G82A 1PUUB 1CE7B 3CA6A 1FV2A 4OEGA 1Z4SA 5F8YA 5I1BA 2GZBA 4IZEA 3BAVA 1G9BA 4P6AA 3O49A 4ZBVB 1M16A 2E4MA 3BAQA 3A22A 4F34A 3CA5A 1TWMA 2VUAA 4IY9A 1JT7A 3B9UA 2DRYA 1XHBA 3K1XA 4OEFA 4G9MA 1AVUA 4LO0C 3AH4A 2MLLB 3N7MA 1V6XA 4ZFWB 3HMYA 2QN4A 3HALA 4LO3A 2WBCA 4LO2A 1AVAC 1TP0A 2D1ZA 1DLLA 1K5VA 3A23A 4LO1C 5BXTA 4EFRA 3FJFA 3NJ5A 3C9ZA 3TC2A 4ZFYB 1BFCA 3OGFA 3AH2A 4J2KA 5GAQA 3EF2A 4EEEB 1RY7A 3HSMA 1WBAA 3AZVA 4GP3A 4WBCA 2VLCA 3RSJA 1S0GA 3PMEA 4ENDA 4X37A 2FDBM 3CRIA 1AF9A 2NVHA 2D7IA 3SNVA 5DZUA 4I6IA 1DQGA 4J2XA 3PUBA 2R9KB 3V79C 3MPPG 4Q91A 1NZKA 5D62A 4KC3A 4TLPA 3WO2A 3I29B 3Q7WA 2AXMA 4OEEA 1S0LA 4JPZA 1AXMA 3BRDA 1WBCA 1FN0A 1BFFA 1W3GA 1JY0A 4QD2C 1DZCA 1HKNA 3FJIA 2FGFA 2NM1A 4L4HA 4OWKA 2HWMA 1IOBA 2X2SA 4KEJA 2MIBA 2ESUA 3Q7YA 4I4UA 3O4DA 4ZFUB 3FJJA 4J2SA 3O4BA 4QALA 3H6SE 5BXSA 3BRGC 3R4SA 1ITBA 3RTIB 3A07A 2M49A 9ILBA 3V0AB 2VXRA 4JRAA 4ZGRB 1S0EA 1S0CA 1HCEA 3O4CA 3IM7A 2Z49A 3IAGC 3FGMA 4EKXB 1A8DA 2KLLA 1L2HA 4HR6C 3AKGA 1FWVA 4JAWA 3UJ0A 4QBVA 4I4VA 1DFCA 2GO2A 2Q3NB 5JMCA 4I1EA 2UUSA 4XKIA 2BEBA 3E8LC 1PC8B 2KI6B 4LO3C 4G6JA 1DIWA 4LO2C 1DZDA 3QR5A 1DJSB 1P63A 2LIEA 3O44A 3OJVA 3I2XA 2ZQNA 3UJ4A 1DQOA 2D22A 1CVSA 8I1BA 2FO1A 3BA5A 4I4YA 4GOYA 3WMVA 3UD9A 3BTAA 4I4RA 4EB2B 1TFMB 2K8RA 31BIA 2D24A 1BFBA 5EHAA 1QXMA 1HWOB 4I4SA 2MC2A 5BOWA 1JT4A 1NUNA 3OJMA 4AN7B 1E0OA 4FGFA 4OWJA 1IT0A 1EPWA 4I3NA 3O4AA 3Q7XA 4I2SA 1BLAA 3ILAA 1W3AA 5BP5A 3H6RA 4HA2A 3WINA 4XFSA 3FJEA 1G9CA 2AAIB 3V0BA 4P0LA 1D0HA 3FJ9A 3A21A 4IY8A 4YOLA 3BAGA 2ZQOA 2L5XA 3BAHA 4QD2B 4G6MA 3FJBA 1V6VA 4JKXB 4XFUA 1HWNB 1JTCA 1EYLA 4ISQA 3IM5A 4II0A 5G00A 4A7KA 4IHZA 2AFGA 3CA4A 3FJAA 3W9TA 4DCKC 1BFGA 3FJCA 1BA7A 1R8OA 2NZ9A 3QYDA 4I1BA 1AVXB 6I1BA 4IQPA 1M2TB 3O5WB 3OBTA 5BQUA 1JLXA 3P6IA 1EVTA 4LO0A 4QC4A 1Q1UA 1S0DA 4G9NA 2J3PA 4JP0A 2VU9A 2Z48A 2IWTB 2FFUA 4D8HA 1IILA 1W3FA 3BAOA 4ZA3B 1TTUA 4XFTA 1ONKB 3RMYA 3VUOA 1WD3A 2RG9B 4H04A 5DSSB 1ISZA 1ISXA 4JQ0A 1HWMB 4GAFA 4QKSA 3ZX7A 2Y9WC 1FQ9A 3ZC9A 4I4QA 2VSAA 4Q9PA 1JT5A 1JT3A 4FVVA 3NBNA 2HW9A 2NYYA 5BXPA 3OBRA 1T9FA 4ZLBB 4D0ZA 5DVHA 3BA7A 1OQLB 1SR4A 2P23A 2KH2A 4LO7B 1HWPB 1QQLA 2F8XC 4AN6A 3AKHA 5B2HA 4CJMA 1PWAA 3F1RA 2D43A 5FNXA 3UDAA 3POKA 2D23A 3RTJB 2E4MC 4X39A 1DFQA 1FV3A 3CU1B 4I4XA 4ZOTA 3S8KA 2ZR1B 4G1RA 4R6UB 5FZZA 3FJKA 4X38A 3WO3A 1KNMA 3CRGA 3WMUA 2FFVA 4Q9GA 3R4UA 2WRYA 4LO8B 3N0KA 3WO4A 1MC9A 2XOAA 4DEPA 3CA0A 4LO7C 5F8WA 3KMVA 2Q9XA 3BA4A 4KEKA 2VSEA 1V6WA 3BX1C 3I2AA 3CA1A 3WINC 4QBCA 2DS0A 3PG0A 1XG6A 4X3AA 3T8SA 3P6JA 3AJ6A 4EFPA 4OUJA 1TOOA 2QYIB 3AKFA 4P0KA 5BXRA 1IRPA 2RQ9A 1PUMB 1FGAA 3BB2A 4GOVA 3HN1A 3NBEA 3N7JA 5FZUA 5E24E 2ET2A 2YUGA 2F2FA 4Z8SB 3FUQA 2NTDA 1TIEA 3P53A 4I96A 1IRAX 2NP0A 5BQUC 1R8NA 1ILR1 1WD4A 3RMXA 3CQAA 1IHKA 3D7WB 1TWEA 2RSTA 1XZZA 4EFQA 3N7LA 3V0AA 2IHOA 1FWUA 2ERMA 4GP0A 3F62B 3S8JA 2KI4A 4KEIA 2I1BA 3BAUA 1Q03A 4GAIA 2P39A 1AVWB 3JRRA 4I0YA 1Z2VA 4USPA 3BRFA 1FMMS 1UPSA 2BEAA 3VT0A 1K5UA 3O4OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EC5A 4MF2A 1ZQTA 5CR0A 4QO3A 4M9HA 3UD7A 5D61A 3ZC8A 2D20A 4I4PA 4I37A 4A7ZA 4P4MA 3NYBA 1AFCA 2GWSA 1VJ7A 4H9WA 1ISWA 3IIRA 4X5VA 3MDCA 7I1BA 2ZH3A 4P4PA 3NBDA 5HRKA 3NBCA 4KLHA 8ICAA 5J2FA 3UQ0A 1G9DA 3BADA 3ZXGA 4FHXA 2DRZA 1Q04A 3AUOA 1II4A 3VSFA 1FMZA 4LEZA 2VANA 5FNWA 4NM1A 1MIWA 4K4HA 7ICOA 4JKQA 4Z6CA 3RJGA 2FMPA 3OGUA 1S0BA 5JLVA 5F2VO 4I8MA 3H6QA 2F2FC 4NXUA 2BCUA 4IZXA 3VSZA 1S0FA 1BASA 4A7YA 4IONA 41BIA 1HIBA 2ZH9A 1F31A 4J23B 4F83A 5B3PA 4OEGA 1Z4SA 3UXPA 2O1PA 4P6AA 2E4MA 3A22A 2VUAA 1JT7A 2DRYA 1XHBA 1AVUA 1R8CA 3N7MA 3HMYA 1ZQNA 4LO3A 4O5KA 2P66A 1DLLA 4LO1C 7ICRA 4O9MA 3FJFA 3TC2A 4ZFYB 5IIMA 3EF2A 4EEEB 2ZH4A 4QZGA 3V72A 4FHWA 4RQ2A 4KLUA 1AF9A 3SNVA 5DZUA 4PGQA 1DQGA 4XQ7A 3MPPG 9ICMA 4KC3A 3Q7WA 1S0LA 1AXMA 2PXIA 8ICBA 4NXWA 1FN0A 4WC6A 4XQ8A 4K4GA 2NM1A 3OWGA 2X2SA 2MIBA 7ICSA 4ZFUB 4R65A 3MDAA 5BXSA 5HRFA 4ZGRB 1S0EA 1S0CA 4DOBA 2Z49A 3FGMA 1XSLA 9ICPA 4NXXA 3UJ0A 4EBJA 4AT8A 1DFCA 5JMCA 2ISOA 3E8LC 1PC8B 4K97A 2KI6B 4NM2A 4G6JA 4LO2C 1DZDA 4UD5A 2PFQA 3OJVA 5J2IA 1ZQJA 1DQOA 4E8FA 2M2UA 3BA5A 4EB2B 3NWIA 4M5DA 4WC5A 1BPBA 3ER9B 5BOWA 4KLQA 4AN7B 1Q78A 4OWJA 1EPWA 4I27A 3Q7XA 1BLAA 5DDMA 4PHDA 1W3AA 5BP5A 3FJEA 4P0LA 3RH5A 1D0HA 5HC9A 4IY8A 4O6AA 4GXIA 2L5XA 4QD2B 4I2GA 4YD2A 2IUBA 4JKXB 5BPCA 8ICKA 4XFUA 1HWNB 3IM5A 4YMMA 5G00A 3FJAA 4WC2A 4IQPA 4M9NA 1JLXA 3ER8C 1EVTA 4QC4A 2Z48A 2FFUA 4KLLA 4KLIA 2RG9B 5CWRA 1HWMB 4GAFA 3H39A 2Y9WC 1BPZA 5BXPA 3OBRA 7ICJA 4PHAA 3C2LA 8ICUA 4Z6DA 4AN6A 2D43A 5IINA 2ZH2A 2D23A 2E4MC 5CFSA 3AU6A 3FJKA 3WMUA 4Q9GA 3H3AA 4WC0A 4DEPA 3JYYA 3OVBA 2VSEA 1V6WA 3I2AA 3CA1A 3WINC 4QBCA 5J2AA 2ZHAA 3JPNA 1R89A 3T8SA 3P6JA 3ERCC 1NO5A 8ICTA 1IRPA 4UY4A 3OV7A 2DR5A 4GOVA 3HN1A 5FZUA 2F2FA 4XRHA 4I96A 5BQUC 1WD4A 3RMXA 4UB5A 4FHYA 2ZH8A 3C2KA 7ICIA 3RJHA 3AQKA 3OVAA 3BAUA 2P39A 1AVWB 3JRRA 9ICTA 3LQCB 4Z6EA 3O4OA 4I2JA 3H37A 4NXZA 4I2CA 2RFFA 3UXNA 21BIA 4YCXA 1SR4C 1ZQYA 2D7RA 3TFRA 5EOZA 2LIQA 4LO1A 1I1BA 3OGGA 3CAHA 3WA1A 3AU2A 1ZJNA 1RG8A 3MGIA 3AJ5A 4D0TA 4YN4A 1JQZA 2DREA 4QZBA 3C2MA 9ICNA 9ICFA 1Z0HA 2X2TA 3MGHA 1RZOB 5DUYA 1MD6A 3UD8A 4FO1A 4J2YA 3RH4A 1KNYA 2ZH7A 4ISRA 3H6RB 4HJJA 1BLDA 2FMSA 4E80A 8ICHA 1YTOA 1IJTA 3FJ8A 5F90A 1EV2A 1ABRB 5HRIA 1XSPA 4OWLA 2BBJA 4S3NA 1G9AA 5DEDA 1I1EA 9ICWA 4KBBA 5BP5C 4FO6A 1GGPB 4OAIZ 1YYNA 4OW4A 2HWAA 3HOMA 4RQ8A 4IYBA 2Y9GA 5J0UA 5JTGA 4X4NA 2BE3A 4K9AA 4PHPA 2GZBA 3BAVA 1G9BA 4KLFA 3CA5A 1TWMA 4M2YA 3B9UA 1TFYA 7ICVA 3K1XA 9ICBA 3AH4A 2MLLB 2HN1A 3ISDA 2WBCA 4LO2A 1TP0A 4XUSA 1K5VA 4AT9B 3A23A 5J0QA 3C9ZA 2PFNA 1BFCA 5J0OA 5BOLA 3OGFA 3AH2A 4WQKA 1RY7A 4AT7B 4GP3A 3RSJA 1ZQQA 3V7JA 5HREA 3CRIA 1ZQHA 3AQMA 4LEWA 3JCFA 4LZDA 1NZKA 3WO2A 5J0TA 5J2GA 1ZQZA 4MZGB 9ICGA 4M47A 4JPZA 8ICSA 5J2KA 3WFRE 1PX5A 1W3GA 1JY0A 4NKTA 4K98A 3FJIA 4KEJA 3O4BA 1MIYA 3R4SA 4EGWA 1JMSA 3RTIB 4F5PA 4JRAA 1HCEA 2M2TA 2ZH5A 8ICEA 3IAGC 3JPOA 1A8DA 2KLLA 3AKGA 4JAWA 4E7XA 4QBVA 4F5RA 4I2EA 2DRAA 2BEBA 4F5OA 1DIWA 1P63A 5DB8A 3O44A 5J2BA 4WQLA 2D22A 5DB6A 5CFTA 4QZHA 3UD9A 3BTAA 4I4RA 8ICJA 4ATBA 2K8RA 4DO9A 4NLZA 4F5QA 1BPXA 4DOAA 5J2CA 8ICPA 5J0WA 7ICPA 1BFBA 5EHAA 4I4SA 4UBBA 5CP2A 3B0XA 4HA2A 3WINA 1G9CA 3V0BA 3A21A 3UPQA 4YOLA 1OU5A 4WOYA 4G6MA 3JPTA 1ZQXA 5HRDA 1EYLA 4ISQA 1JN3A 1UETA 4A7KA 2AFGA 4DCKC 3FJCA 2NZ9A 7ICHA 1GPJA 3V7LA 5BQUA 4RQ6A 3P6IA 2Q66A 8ICVA 1S0DA 2BCSA 4MFAA 1IILA 1Q79A 1ONKB 3RMYA 3VUOA 5DKWA 1ISZA 4UD4A 1ISXA 4JWNA 4UB2A 4R64A 4I4QA 1RZTA 1JT3A 4FVVA 2HW9A 9ICHA 2NYYA 4IG8A 7ICMA 3BA7A 1SR4A 2DR8A 4LZGA 3AQNA 1HWPB 1QQLA 5B2HA 4TUQA 1HUZA 1DFQA 5HHHA 3S8KA 5IILA 3RJEA 4TUSA 4O69A 3ISCA 4XJEA 3C66A 4WC4A 4LO8B 5D46A 4LO7C 3KMVA 2Q9XA 2PFPA 3K75D 5D49A 2DS0A 1ZQKA 4X3AA 2B56A 4O68A 3AJ6A 4OUJA 4O5EA 2QYIB 5J0PA 4P0KA 2RQ9A 1FGAA 2ZH1A 3NBEA 3N7JA 5E24E 2ET2A 2YUGA 3P53A 2NP0A 1R8NA 4KLTA 3CQAA 3RJJA 3D7WB 1TWEA 4I2IA 4R66A 4EFQA 3V0AA 9ICOA 4EEDA 1VFGA 4RQ5A 1ZQGA 7ICUA 2KI4A 1Q03A 4GAIA 2PBEA 4RT2A 1Z2VA 3BRFA 4II0A 4WC7A 4AT8B 8ICQA 3OJ2A 4K99A 4X4RA 3O3QA 2AQZA 5HRBA 5TZVA 3HW8A 4TUPA 2K4AB 3FJDA 3JPRA 4M9GA 1JLYA 1BARA 4H75A 9ICRA 4UAZA 1FA0A 4WC1A 4F5NA 2K43A 3JUTA 4MFFA 1RMLA 3UPSA 4RPXA 9ICJA 4RWPA 1SZ6B 3FFZA 3ZXDA 4OAGA 2BCVA 3N7KA 2Y9XE 4M04A 4RWOA 1QQKA 4I7IA 1ISYA 3WFOA 3LLPA 5CB1A 2VXTI 5J0YA 4RQ7A 9ICUA 2IHMA 3VT2A 3MALA 2PFOA 3AZWA 4I2DA 1HCDA 4USOA 3JPSA 4UBCA 3VWCA 3JPQA 1JAJA 4L4IA 3AKIA 3HJ1A 4Z9WB 7ICGA 3CRHA 1G82A 4X0AA 4KLJA 3CA6A 4IZEA 1WOTA 3O49A 1M16A 4F34A 5J0XA 2GA9D 1V6XA 2QN4A 4YMNA 1F5AA 2I9GA 3NJ5A 4J2KA 5GAQA 1WBAA 8ICWA 3C5FA 4WBCA 1S0GA 1ZQLA 4JLXA 4X37A 2FDBM 4TURA 1MIVA 1UEVA 2NVHA 9ICAA 2W9MA 4J2XA 3PUBA 3PMLA 3OUYA 1ZQWA 8ICIA 4TLPA 3I29B 3HIYA 4FHVA 3BRDA 3C5GA 2FCLA 2HHPA 7ICLA 4QD2C 1DZCA 1HKNA 4YMOA 3B0YA 2BPFA 7ICNA 4OWKA 1IOBA 2ESUA 3MCRA 3Q7YA 4QZ9A 3H6SE 3BRGC 4KLOA 1ITBA 9ILBA 2VXRA 3LK9A 2GAFD 3CK6A 4EV6A 1ZQPA 2BCRA 2DRBA 1KEJA 5J2HA 1ZQCA 4KLMA 4I1EA 2UUSA 4XKIA 9ICEA 4RQ3A 3RJFA 4X0BA 1DJSB 2LIEA 3I2XA 2ZQNA 3UJ4A 3PMNA 1CVSA 2FO1A 3WMVA 31BIA 4X4QA 2D24A 1QXMA 1HWOB 1JT4A 9ICCA 1ZQIA 3HX0A 4FGFA 4I29A 3ILAA 4WBYA 4XFSA 3ISBA 2AAIB 3FJ9A 3BAGA 4LVSA 2ZQOA 3BAHA 1HUOA 3FJBA 4RWQA 1JQRA 4IHZA 4NXTA 3CA4A 3W9TA 1BA7A 3QYDA 4I1BA 3HWTA 3O5WB 3OBTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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