1IT0A

Crystal structure of xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86 complexed with lactose
Total Genus 161
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
161
sequence length
436
structure length
427
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
publication title Crystal structures of the sugar complexes of Streptomyces olivaceoviridis E-86 xylanase: sugar binding structure of the family 13 carbohydrate binding module.
pubmed doi rcsb
molecule keywords endo-1,4-beta-D-xylanase
total genus 161
structure length 427
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2001-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1it0A01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1it0A02
4LYQA 2PBOA 4HZ6A 3OBRA 1BAGA 2EPOA 4X38A 3CZEA 2QHAA 1V3JA 2ESUA 3AZVA 4E2OA 3VNYA 2XGBA 3WQ4A 1TVNA 3MUIA 2DT2A 4PTXA 1HJVA 1G9BA 1BA7A 2DRYA 2WMKA 5CLTA 2GK1B 4LO1C 1TZ7A 2FDMA 1EPWA 1EGZA 1VENA 5A6JA 1MFVA 4MPKA 1XHBA 4TVCA 2EXOA 1TTUA 4GXPA 1J0KA 4GZJA 1L0PA 2IXVA 4W89A 3WBAA 4FLQA 1JL8A 4W87A 2CKRA 1AVAA 4D6EA 5IXEA 2WM0A 4XV0A 4D6JA 3OBTA 1KR1A 1FWUA 1C93A 2A3EA 2XFRA 2AAIB 5CPSA 1PZ3A 4HPHA 1OINA 2W66A 3P6IA 1UWIA 4H8UA 3NYDA 5ABEA 1XV8A 1S0FA 4TLPA 4AZGA 4D6IA 3VUOA 1MW3A 3RM8A 3BRDA 3W25A 2XG9A 1MYRA 4H9WA 1BLIA 1ZL1A 4UR9A 2YDQA 1G0CA 1BQCA 5IFTA 3WF2A 1GGPB 1SMAA 4AW7A 1V3MA 2VURA 3ZJ8A 2C7FA 3QR5A 3H6RB 3MKKA 1W2VA 2K43A 1HF6A 3AS2A 2CBVA 1RPKA 3AI0A 3WD3A 3AMDA 5JIPA 5M17A 3OGGA 1OT1A 4J3SA 5BRPA 1HWNB 2P39A 3B9DA 3NSMA 2OSWA 3KWXA 3VDBA 4IZEA 1XCXA 2EPNA 1ILR1 3AIWA 2FGFA 4ZKTB 2XFYA 4ZEPA 3BMWA 1W1YA 4GO8A 1GUVA 2D7RA 1CYGA 3CA6A 1LG1A 4UOZA 1B9ZA 3N9KA 1HN1A 3WIJA 4A7YA 4JZ5A 2W91A 3WENA 1BHGA 1FHLA 1EA9C 1V3KA 5A6LA 4KGJA 3F4VA 3UG4A 5I78A 1S0LA 1KFWA 1GOIA 1V6YA 2W5FA 1EYLA 1CIUA 1ZU8A 3CTTA 1ZBVA 2G3IA 1U30A 2ZR1B 3UD7A 2V38A 3R4UA 1B90A 4I4PA 3JRRA 3L2MA 8CGTA 2WVVB 5EMYA 1XD1A 1E71M 1HXJA 3UD8A 4CUCA 1GJUA 3U5UA 5LA0A 1KGXA 1WPCA 5EBAA 2FHCA 3SCTA 5I5RA 1CLXA 4W88A 4CKQA 2NT1A 4Q9PA 2PWGA 3MO4A 2WVTA 2GDVA 4L4OA 3S8KA 1I75A 2WBKA 1E40A 4EKJA 3AYRA 4CD7A 3T0DA 4Q9GA 2O9TA 3WELA 1WKYA 1PX3A 1GOWA 3HMYA 1PZZA 1BYAA 3TTOA 1QHPA 3AH4A 3EMQA 6TAAA 4KBBA 4FF5A 2FFVA 1JXJA 2VUYA 4GINA 2J74A 1DHKA 1OGBA 1ABRB 5AY7A 3ZMRA 3VMNA 2RQ9A 4PRWA 1BYBA 1V03A 1CXHA 2DH2A 3BSHA 5F8SA 3N04A 4TTUA 1SYTA 3N1AA 3BGAA 2D7IA 2UY4A 5BQUC 4B9ZA 4JCMA 3S2CA 1AQMA 1UG6A 5A6KA 4UFJA 1TVPA 4AY1A 3ZXDA 1EHNA 3EYPA 4FGFA 1AMYA 4ATWA 3WH5A 4GAIA 1FA2A 1E5NA 4HOWA 4DCKC 1KCKA 4HA2A 3VIHA 5I77A 2OLHA 2XVPA 4QCEA 4X3AA 1J18A 5C8BB 5A8NA 5A69A 4U5IA 4J2KA 4AC1X 6I1BA 2YIHA 3VIOA 3Q7WA 1NWRA 3CPUA 3N17A 1W91A 4J3XA 3AHXA 5EFFA 3WMSA 1YXWA 2ESCA 2O9OA 1RD6A 1UA7A 2YDSA 4DM2A 2E8YA 4ZFUB 2E8ZA 2VVNA 3QHNA 4UQCA 2DEPA 1PC8B 3WF4A 1QNQA 1HKJA 3HBWA 3VD3A 1QXMA 3VMOA 2X0HA 3HN3A 3MV01 3V79C 3BSGA 4HJJA 2JIEA 1FH8A 3GH7A 1XSIA 1V3HA 1B3YA 2EPKX 1BF2A 1UR4A 3HN1A 5DEZA 3AS0A 4JKLA 5CXPA 3FJIA 4KGLA 3T08A 4FLOA 1CPUA 5CSUA 4GPNA 1BLAA 1FOBA 4Z2KA 1ITXA 1LWHA 1UHVA 3S8JA 4WSJA 4JL2A 1OB0A 3RMXA 2NVHA 3ARTA 2YL9A 3QR3A 3KMVA 4DM1A 1A8DA 3CHFA 3N11A 3UG5A 1Q1UA 5CJ5A 4PTWA 1CE7B 1TIEA 4M56A 1BGGA 4PMUA 2J79A 1GQKA 3DECA 3WA1A 4LO3A 4KEIA 5TD4A 4JPZA 4ZFYB 4P7RA 4IQPA 3AXHA 3WD1A 2NP0A 5I6SA 2YBTA 1XH0A 1V0LA 1HJWA 2CCRA 1H09A 3VSFA 1LLOA 4DUVA 3JUTA 1MD6A 2G4FA 4DWSA 2WHLA 1SMDA 3RTJB 4N0RA 4I4SA 1CXEA 3DHUA 5BCAA 5FZZA 5E6ZA 1H49A 3AKGA 4U2ZA 7A3HA 3MSDA 3O4AA 2OYMA 4GQQA 3EDJA 4RE3A 4HZ8A 4C7FA 5E70A 1QQKA 1B3ZA 3T8SA 1TA3B 3BAQA 4I0YA 2VXRA 3K4DA 3EDFA 4LYPA 4OBSA 2XGIA 4WK9A 4I8MA 4F9JA 1OQLB 3ECQA 3SURA 5M03A 4IZXA 1QNPA 1P63A 2QYIB 2HWAA 1ZBCA 3BA7A 1UR2A 5D63A 3PZGA 3GH5A 2KI6B 1YBIA 2DIEA 1PX8A 3CRGA 4LQ1A 1CXLA 2R9KB 4I4VA 5FNXA 1DLLA 4Z2IA 2KKIA 3K46A 1BG9A 1VAHA 4TX6A 4H8HA 4LYRA 4PMVA 3LTQA 4J3VA 4ACYA 1HCDA 2JF6A 4TOQA 4USOA 2YL5A 4RE2A 3U7VA 3FJBA 1PIGA 5M3WA 3E1F1 3BAJA 1UKQA 1YYNA 1ISXA 3O44A 2WLYA 3AXXA 2Y8VA 1V6VA 5CPTA 3UD9A 3AKHA 1QBAA 3WNOA 4KC3A 4QO3A 3BXWA 2Q9XA 4QBCA 3UJ0A 3AMKA 4OOZA 5DT5A 3HMCA 1FHDA 1KWGA 3PHAA 2W92A 2X2SA 3ZXGA 1IHKA 1VEPA 2ZUVA 1IRPA 5D9MA 1TWMA 2BXYA 4D6DA 1DQGA 2FH8A 5EB8A 2F61A 1TR1A 1BASA 2MIBA 1UKOA 1CECA 4J3UA 4MNKA 2ZUNA 1QHZA 1RZOB 3AHYA 1S0GA 5BROA 4W5UA 4D6GA 3AXIA 3AIRA 2EPMX 3BAVA 3VIFA 4YHEA 1PX4A 4EK7A 4DEPA 1XRVA 3PUBA 4W7UA 3ZJKA 3WMVA 4G6JA 1I1EA 3D5HA 5B2HA 2VSEA 2DH3A 3GXFA 3W82A 3U5YA 3VINA 1CGTA 4JFUA 3VDAA 4HMDA 4QC4A 5BOWA 3PZIA 1QHOA 1RG8A 3AHVA 1QNSA 4V2XA 2DDXA 4JFSA 2VMFA 3PZTA 4D1IA 2ZQOA 2NYYA 5CQ1A 3VEQA 5JBFA 3UG3A 4D6CA 2E3ZA 4BQ5A 1UD8A 4QALA 1G5AA 2EJ1A 3OLGA 1H0IA 5HDRA 2Y5EA 2OWWA 4WSKA 3FY1A 3KE0A 2E4MC 2XVKA 1XD0A 1G9AA 2YUGA 1QQLA 3VGBA 1W9XA 1BSIA 4DWSD 1E72M 2D0GA 2W4XA 3N15A 3FN9A 3QGVA 4AYSA 2W62A 5ABFB 3WUGA 4AD0A 4F9DA 2VR4A 4OEFA 2GSJA 4Q22A 4V28A 4YN5A 1XZZA 2CKSA 4Z9WB 1NUNA 1GOOA 1LG2A 1H41A 1TA3A 1LL4A 1C8YA 3VDCA 4V27A 4LO0C 3ZX7A 1C7TA 4IONA 1HWOB 1K5UA 2XM2A 4PMDA 3VM5A 1JDAA 1YTOA 1NOWA 3SEPA 1IZJA 3QYDA 3HOMA 5A8OA 3K4AA 2VL4A 4IM4A 2WXDM 1GHRA 3WUEA 1EV2A 3LPFA 2PI6A 3J7HA 1JT3A 2D0FA 1HIBA 1D3CA 3GBDA 3RIKA 2XFFA 1OIMA 1E4LA 1WZAA 3T2PA 1CGUA 3BA5A 3N13A 3EDDA 1BFGA 3AYSA 2XSAA 1W3FA 3WL1A 1JYXA 3BB2A 2VT0A 5IHSA 3WINC 2ZX7A 2QF8A 3GM8A 3SCQA 1C91A 4AEEA 2A3AA 3CUIA 1TOOA 3W28A 5I2UA 1H2JA 4OZOA 3AZTA 3CRHA 3OA5A 4UZSA 4E4PA 1WP6A 3N18A 4L4HA 3A23A 4UFHA 1PWAA 3RSJA 4I4QA 4TTGA 4P8VA 3FFZA 3BC9A 2JALA 3CZLA 3PZOA 1S0EA 4J7RA 4YOLA 3VVGA 4ACZB 1QI2A 5GNYA 5KZ6A 1V3IA 3CHEA 2F8QA 4H04A 4LO2C 4WIWA 1NZKA 4W8LA 4NZCA 2AMGA 3BRGC 3WD0A 4JP0A 3HJEA 4AN7B 3WQ5A 2ZQNA 1OD0A 3ZT6A 1IT0A 4GZEA 2VCBA 1R8NA 1K5VA 1QI0A 4MNJA 3WEOA 1V02E 1EQCA 1CNVA 3BAGA 4PTMA 4I1EA 3VGHA 3IM7A 1OSEA 1OIFA 5G00A 3N7LA 2QLYA 1WD4A 2J62A 1BARA 2D2OA 2VOTA 4BF7A 5A2BA 2WMHA 2ZXQA 3A3HA 2GJXB 8A3HA 2DREA 2VRKA 4ZA3B 1ISYA 3GNOA 3GXIA 4MJ4A 5IDIA 4XZBA 3VMPA 3ILAA 1JXKA 4EB2B 2CESA 2QV4A 3O4DA 4Z2HA 1SR4C 4JAWA 4NSBA 3E8LC 4ATDA 2O9RA 1JNDA 5E0FA 4I2SA 1US3A 1E6ZA 4FLRA 2J8FA 4AZCA 1BVZA 1UR1A 3M6DA 1J11A 4D8HA 1P6WA 3OJMA 2ERMA 1HVQA 1GJWA 4R27A 4MDPA 2PB1A 4UNIA 2ZUWA 1JZ7A 3N0KA 2NSXA 2FHBA 1W9VA 3N7JA 1A47A 3GH4A 3CA3A 3ZSSA 2VX7A 3KEHA 3VGFA 2A3BA 4IPLA 2V3GA 3BADA 2XIBA 2CPUA 1Y7VA 1FP9A 3OB8A 3O5WB 1PAMA 4HU0A 3NBNA 1WDSA 3AIQA 5GQBA 1V3LA 1HP5A 3QOKA 4AMCA 1ESWA 3OZOA 3CU1B 5F90A 5E24E 2K8RA 5HOSA 4M24A 3BAHA 3WNLA 2QMJA 3ARPA 1HL8A 2V3DA 1XH2A 3IAQA 3NIYA 4KH2A 3WDJA 2E4TA 2X8RA 3CA5A 3M46A 3IJ7A 1GOQA 4M29A 1T4QA 1HKIA 1OGSA 3VX0A 5JUVA 4J27A 4NRSA 3VD5A 3T2OA 3CA1A 2D44A 1E0VA 3ALFA 1AVWB 3CBWA 4OWKA 2WHMA 1MQPA 1MW2A 1E55A 3CUGA 4QLLA 2XOAA 3O3QA 1J01A 1S0BA 2YLLA 1UD2A 4AISA 1JZ6A 4NI3A 1TFVA 1UD6A 3F5LA 5D61A 4QD2C 1QPKA 1RH9A 2OSXA 3F5KA 5BXRA 4CN4A 3VILA 1JZ5A 4ACZA 1UWUA 1V02A 3SCPA 3THCA 5BXSA 2W63A 4A3YA 3CZ8A 4F34A 1CENA 2MLLB 2UWFA 2AOSA 3VIMA 1EHAA 1R85A 2Z48A 1K9TA 1ZJBA 4AIOA 4D71A 4P0KA 1M04A 1S0CA 5BRQA 5AYBA 4W93A 1WCGA 3VTRA 1GPFA 9ILBA 4CN6A 1D7FA 3SCWA 3MMUA 3LPPA 1G1YA 4HU8A 3PZNA 3AJ6A 1JNEA 1I1WA 5A2CA 2FO1A 2CXGA 2GJXA 3DYPA 1VIWA 3SUUA 6A3HA 2G3JA 4OEEA 1IZKA 4J2SA 4P0JA 3KZSA 1R7OA 1H5VA 1FV3A 4C7DA 1XG6A 5BWFA 2ZOXA 2I1BA 3KL5A 1MW1A 4MB3A 2L5XA 1IOBA 3A21A 1HL9A 1V0NA 3TTYA 1J10A 3OLIA 2PWFA 3RM9A 3O6AA 4JKKA 4QKSA 2AQZA 4UQAA 1Q6CA 2Y9FA 1E3ZA 3L4ZA 1V08A 1E0OA 1W3JA 3AJ7A 5A6BA 3Q7XA 1DFQA 5A8PA 2BNJA 5I24A 4UOJA 3WFLA 3VGGA 3VSZA 4PMOA 4G1RA 5A2AA 1X6NA 1E0WA 5FD0A 3WH9A 1GOMA 4ML4A 3POHA 2VU9A 4H7VA 1D0HA 1TUXA 5HXMA 3WEMA 2VX5A 2GO2A 2G8ZA 3UR7A 4EEEB 3B8SA 1OD8A 3MUAA 4GI9A 2WZHA 2HVMA 4D0ZA 2OYLA 4NF7A 2J7CA 2E0PA 2ZX5A 5D9NA 4PMNA 5CPQA 1DWAM 2WB5A 1GQIA 2BEBA 2GK1A 21BIA 3WMUA 4OBRA 1NWTA 1F31A 3TTQA 1RP8A 4BQ4A 1KNMA 3NJ3A 3WF3A 1UA3A 3W6MA 3CQAA 1N82A 1MVYA 3RPMA 1I1XA 3WQWA 1B3WA 4AWEA 4UFMA 1E6SM 4BA0A 3OGFA 4AD4A 1B30A 1TWEA 1WZLA 1HJQA 1KXTA 1Q4NX 2BFGA 3VIIA 1G82A 1JI2A 1WD3A 4HMEA 3VNZA 1WO2A 5FNWA 3ZSTA 1KB3A 1B1YA 2DS0A 3WDQA 3HU7A 3NSXA 4RL3A 4PC4A 3WFZA 1UWSA 1DWFM 3PTQA 5C71A 1GHSA 3GYCA 5A6SA 3WO3A 3WQ6A 5ECUA 1AXMA 1IV8A 3AIBA 2WANA 3VIKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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