3V0AA

2.7 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 408
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
408
sequence length
1295
structure length
1280
Chain Sequence
MPFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNAGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHQLIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNAKTFLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRGILNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGAKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BoNT/A
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 408
structure length 1280
sequence length 1295
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-12-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0aA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0aA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0aA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0aA01
5FZZA 1FX5A 3V65A 4NOTA 3IPVB 5HCFA 5GM0A 1FMZA 3POYA 4Q1PA 2E4MA 1JOJA 3NBEA 2DRZA 4JKQA 4D69A 2I1BA 4QD2B 4ZJXA 4FPKA 1FAYA 5KXBA 4USOA 1UN1A 3WUDA 2HYKA 5JDBA 2MIBA 1MS1A 5FNWA 4WV8A 1R8OA 2K8RA 1GNHA 3SH4A 2ERMA 1V6MA 4YLZA 4LO3A 3FJEA 3BAHA 2LTNA 1V6IA 5JOXA 3AK0A 1RINA 3VSZA 4D8HA 1H30A 3H6SE 1AX2A 3ZVXA 5D62A 4FOWA 1Q8OA 4QALA 1WW6A 4OWKA 1FQ9A 2DVGA 4P9XA 3O49A 1VLNA 3WMVA 3O3QA 1W6NA 3W58A 1UKGA 2D6MA 3AH2A 2NN8A 3QR5A 2WJSA 1W6QB 2D7RA 3QW8A 4PBPA 2Z42A 2YY1A 2LALA 4TLPA 2KKIA 2E51A 2D6LX 3NV1A 2D6OX 2AXMA 3FUQA 1UZYA 4TZDA 1W3AA 1N1VA 5E24E 31BIA 3CA6A 4YZ5A 3N3HA 1HLCA 5FZUA 2YZ4A 1S0GA 5GLUA 2R49A 4Q2FA 4HA2A 2ENRA 2ZGKA 3POKA 1LTEA 2EIGA 1IKPA 4I6IA 4XBQA 3UJQA 1S0JA 1BFBA 1JQZA 1DZQA 1WW7A 4JAWA 2VXRA 5T5JA 1AXMA 2FPQA 4XTPA 3ZSJA 3A0NA 1CPMA 2K4AB 5CBLA 5BP5C 4X39A 1L2HA 1JBCA 4I2SA 3ZXJA 1G8WA 1N1YA 3VKFC 4F83A 4Z9WB 3WO3A 1ZB7A 4ZOTA 2D6KA 3FJIA 2R16A 4KC3A 4LBQA 3MW2A 5CB7A 3ZUQA 4AVSA 1DFCA 3WUCA 1G7YA 1V6UA 4UW4A 4LO2C 4YGBA 4ATFA 4YG0A 4YGEA 4WVVA 1RMLA 3O4AA 3FLRA 3L2YA 4IONA 1JYIA 5DUVA 1CE7B 3AXEA 1GNZA 2DUQA 4BLJA 3WMUA 1DQGA 1JXNA 2AREA 4ISRA 4P0JA 1W3FA 4KEKA 3AZVA 2Y9FA 3VKNA 1KNMA 3I4IA 3SITA 4YG3A 3OY8B 1IS6A 1CPNA 1TFMB 1V6JA 21BIA 2D24A 4XTMA 1WBFA 1N3PA 5BXRA 1AF9A 4LO2A 2EXIA 1SLCA 1Q03A 1XTGA 2A3XA 3R05A 4P0LA 1JT3A 2HWAA 2W68A 3BONA 3ZPYA 1CONA 3DEBA 2E6VA 4AGGA 1HDKA 3T1LA 4WBCA 3N0KA 2P34A 2EXKA 2WSVA 3N7MA 3FJKA 3WHTA 4KS6A 4Q8KA 2DVAA 1BLDA 2WT1A 1W0OA 4LO1C 3OYWB 2ZGPA 4XHBA 3TC2A 4LBKA 3BIWE 5BXPA 4G6JA 5BQNA 3BRGC 1S0BA 5DG1A 3ENRA 1H9WA 1BXHA 4Z8BA 3DDBA 1BFFA 1FN0A 1SBDA 1G9AA 5DZGA 4GWNA 3AH1A 1QGLA 3WDTA 1A8DA 5F5QA 3BAOA 2ZGRA 4H55A 4JKXB 3JRRA 3BWIA 1IKQA 5JOWA 4P9YA 4EB2B 2WT2A 1UX6A 5T5PA 3BB2A 5F9TA 3V0AB 3HSMA 3OGFA 4LO1A 2Y9GA 1IS5A 5DZUA 3USUB 1G86A 3FJJA 4D0ZA 1NLSA 1S0EA 4M3CE 1ENRA 2DYCA 4M00A 3F1RA 4BQ1A 3F62B 3ZXDA 1YI7A 2Z48A 5BOWA 4BLIA 1CVSA 4JPZA 4JRAA 2A3WA 1ZKXA 3OJBA 4ELCA 1GANA 2R9KB 3C2UA 3UD7A 3FJBA 1LHVA 1ISXA 1QOTA 3BOKA 1LOCA 3VWCA 1GGPB 2ZR1B 1PWAA 2QN4A 2KM2A 3NWKA 3QJ0A 5H9PA 5CA6A 4J23B 1Q04A 3BODA 4AVVA 2P37A 2QN0A 1W6MA 3AZYA 5JLVA 1QDCA 3BAUA 4EFQA 3ZUSA 5GZFA 2P23A 3AKGA 3FJCA 3P53A 1SLBA 5DSSB 3BAQA 3FLPA 1FNYA 1DLLA 2D6NA 4CTEA 5BQMB 1CESA 2ZHKA 3UD9A 2UWCA 3AP9A 3FJAA 4YZ3A 2VSEA 1AXZA 1ULEA 2JJ6A 2DVDA 4GALA 1QKQA 3GALA 3KMVA 4C1XA 1HQWA 4R9BA 2CL2A 1S0IA 2VXTI 4G1RA 2RQ9A 4YGDA 3CRHA 4PF5A 4CRQA 3HMYA 2DTWA 3ZXEA 4I8MA 3INAA 1UL9A 1GZWB 3Q9OA 3HN1A 2A71A 5BXSA 4BMBA 3M1HA 1IOAA 2X2TA 4Q9GA 1K5UA 1U0AA 4LBNA 5EWSA 5GAQA 1DHKB 5GZCA 1LOFC 1OQ1A 1GKBA 2G7KA 4IQPA 1BASA 4GOVA 3CU1B 4YZ4A 4M3CB 1YRZA 4J2XA 1VAVA 2VSAA 4QBCA 1W6PA 4JC1A 3ILAA 1JYCA 2RHPA 1QMJA 2A75A 2LIEA 4EKXB 3HR9A 2ZMNA 2Q9XA 1DZDA 3VKOA 4Q91A 4I96A 2G7PA 2NP0A 4I4YA 4J2YA 2G4IA 5EXOA 5HPZA 2P2KA 3O5SA 2ZMLA 4YGCA 2F8XC 2D22A 3T1MA 1BQPA 5DZFA 5DXDA 4GXLA 5GZDA 5T50A 1DJSB 3BOPA 1LOFA 3S8JA 3PHZA 3V79C 1PUMB 1WD3A 2D3RA 2JD4A 4M3CF 1XG6A 2FFUA 1ONAA 2ISEA 4CJMA 3UK9A 2DV9A 1ZKWA 2JE7A 3BA5A 2R1BA 1JT4A 1MVQA 4I1BA 3ZC8A 2UWAA 4YW4A 1W3GA 3TB0A 4ATEA 1LGNA 3SISA 4XXPA 1WW5A 4YZ2A 5F8SA 2XOAA 2DVBA 4GA9A 3IPVA 1E0OA 3WOGA 1LODA 3BA4A 2A6YA 4J1LA 5GLVA 1RZOB 1BYHA 4I4SA 1V6LA 4ZFUB 3N7LA 3BOOA 1FWUA 5LK5A 3SH5A 1C1FA 1V00A 4AYUA 4FGFA 3CA0A 3BTAA 1KJLA 2ET2A 3VV1A 1V6XA 1Q8VA 4K21A 4KUFA 3B9UA 2W08A 4J2KA 1HWPB 1JLXA 3AP7A 1QXMA 4FP3A 3WVJA 4A7KA 3BRDA 2DRYA 3UD8A 4F34A 2NMOA 4ISQA 3FJ8A 3WV6A 3ZXFA 1MVEA 5EHAA 4SLIA 1KQRA 1FV2A 4IZEA 1EYLA 4X38A 1W6QA 1N1TA 1DQ0A 4YW2A 3VT2A 1C57A 5FREA 3AKHA 1LULA 4G6MA 4NO4A 2FDBM 2VLCA 4XBNA 4U36A 2CY6A 3IM7A 3O4DA 3IM0A 4XJAA 4OWLA 1G9CA 1SACA 1MS3A 4JP0A 2HW9A 1II4A 5H9QA 3A0KA 4Q27A 2YXSA 2NVHA 2GMPA 4I4QA 4DENA 1Q8SA 4YM2A 1SLIA 2PHXA 4R9DA 1SLAA 3BADA 1R8NA 1ZA4A 4DPNA 3ILNA 4Y22B 1JTCA 2DUPA 3ZX7A 4OZXA 4K1YA 2D7IA 3O12A 1BKZA 1O4YA 3C9ZA 2WQZC 1WBCA 3WG1A 2D7FA 1MS0A 3H6RB 1LCLA 1S0CA 3IM6A 1WUVA 1SZ6B 1G9FA 2FFVA 4ZFWB 1G9DA 2NYYA 2X2SA 4HANA 1AVWB 1WLWA 1LGCA 3AP6A 3M2MA 4GWMA 4FOYA 2GN7A 3ZYPA 3OGGA 1GSLA 4AWDA 3ILRA 3MEPA 2ILPA 3FLTA 1S0LA 3PVEA 1MS5A 3D3XA 2PHFA 3LTQA 5D63A 1AVXB 3WG2A 3U4XA 1ZL5A 2ZBJA 2NM1A 4OEEA 2PHRA 1FV3A 2ZGUA 2UU8A 1EV2A 2I2SA 1ZL6A 4WZFA 4X37A 4XZPA 1I3HA 2P3KA 1DIWA 4P9WA 5JMCA 2ZGNA 2ETFA 1DYKA 2ZGMA 1IJTA 1RG8A 3ZXLA 4BM8A 2NZ9A 4DEPA 4DS0A 1K5VA 1CJPA 1G82A 1ZN3A 1D2SA 1T3CA 5BYNA 3WZ1A 3BRFA 4I30A 4R9CA 1ULDA 3FIEA 3IM5A 2GMMA 1NXD1 1KRIA 2DU0A 5H9RA 2P39A 4XFTA 3OY8A 3QIZA 2YROA 5KXEA 5BP5A 3LSEA 2GO2A 4G9NA 3A4UA 3AP5A 2ISGA 1IHKA 1MD6A 3VKLA 1AJOA 3MALA 4XXAA 4PBOA 1ISWA 1LENA 1RITA 4C1WA 1ENSA 3OPZA 3ATGA 3DDAA 4AGRA 4ZGRB 5DG2A 1J1TA 4HR6C 2EXJA 2ZAAA 2WLQA 3BAVA 4ZFYB 3OYWA 3P6IA 2ISHA 2ZHMA 4EFRA 1QNYA 1APNA 5EG6C 4FPFA 3AFKA 3O0WA 3K3QB 2CYFA 1W6OB 4Y1XA 1IOBA 2AYHA 4XBLA 2WNEA 4OW4A 5FZYA 3RG0A 3AH4A 4AVTA 1KDKA 4L4HA 3QW6A 2A5ZA 3ZYRA 3WA1A 3OJMA 1DBNA 1CN1A 1KITA 5DZEA 1FNZA 2WSUA 3UJOA 1ZM1A 4I4RA 2A8AA 3V0AA 3N36A 4OEFA 1M16A 1N3QA 4LO0C 3USUA 3M3EA 3CA3A 2VW1A 1ULFA 4Y24A 1QNWA 4LBJA 1W0PA 3AJZA 1CQ9A 1IT0A 3FBYA 1SCSA 2GZBA 2C5DA 3IIRA 2AH2A 2A97A 4XIKA 3QIXA 5BQUC 3WDVA 1V6OA 3B69A 3QCWA 1DQ4A 1H9PA 2B7YA 2VW0A 3AJ5A 2F2FC 4RL7A 3UJ0A 3RMXA 1F5FA 2ARXA 3ILFA 1IS4A 3PVOA 1ITBA 3WDUA 4Z8SB 3RS6A 5KXDA 5EC5A 3VT0A 3MPPG 3PG0A 2ZABA 3CQAA 5F8YA 3CRGA 2G7NA 3NJ5A 4Y20B 4DRVA 1F82A 2YV8A 1TWEA 4IY8A 5HCBA 4AGVA 3C8AA 3CA1A 3ZSLA 4YG6A 1SBFA 3O5WB 2AENA 1A78A 4Y1UA 1GLHA 3LLPA 5BQMA 1ULCA 2XHLB 4I4PA 2W2DB 1LGBA 4I37A 9ILBA 5IK7A 4XFUA 1OFSA 2ESUA 1YXWA 3T2TA 3SH3A 3B01A 4QC4A 2H0BA 4LBQD 2FGFA 2AAIB 2E7TA 2TEPA 1PZ7A 3JU9A 3UL2A 4BMEA 2ZGTA 1SR4C 1GZWA 2D20A 2BEAA 5SV8A 3A23A 2MLLB 2IMCA 4I0YA 1DGLA 4XJZA 2WKKA 4DFSA 1AVUA 1BARA 3VT1A 4AN7B 3FIIA 1SLTA 5L73A 3SLIA 3BX1C 3AZWA 3ZSKA 5DUUA 1TP0A 3APBA 2KLLA 3OBTA 1IRPA 1IS3A 3AKFA 4M3CA 4Q9PA 3O0VA 2QYIB 3RMYA 4K1ZA 3DSEA 3S8KA 2D1ZA 1BLAA 1ISVA 1HWNB 4DQAA 1M2TB 1SR4A 4BOWA 4XMAA 2GN3A 2KI4A 1WCSA 2D3SA 4H9WA 1XHBA 4A7YA 4I4OA 3V0BB 3WO4A 5BXTA 3ZURA 1BZWA 3NBDA 3O44A 3MW3A 4ASMB 1IRAX 1LESA 2DS0A 1DFQA 5HCAA 1YTOA 1KDMA 1LOBA 1NUNA 1S0FA 7I1BA 3RSJA 1HKNA 2AR6A 1AXKA 6I1BA 4ZKTB 2VU9A 3KM5A 4QBVA 4PC4A 4HL0A 1GBGA 2ZGOA 3R4UA 3WINC 2D23A 1G9BA 3B00A 5E88A 2ZQNA 4IY9A 4HEVA 1TIEA 1YO8A 4XJWA 1PZ8A 1DQOA 2D3PA 2ES3A 5AVAA 1DQ1A 3NBNA 5IUQA 3WO2A 1FWVA 3CA5A 3EF2A 1ENQA 1MZ6A 3SNVA 2GNTA 4XDQA 3WDYA 1JT7A 2A3YA 2ARBA 2ZQOA 5G00A 1AX0A 1CR7A 3ZC9A 3NV4A 1YF8B 2R1DA 1V6KA 1WW4A 2GNMA 4J2SA 3ZXKA 3ZSMA 1BJQA 2Q3NB 3HOMA 4YW3A 2EALA 5I1BA 1MS8A 3O4OA 2PHTA 1ONKB 2LIQA 3O0XA 5GZEA 3MW4A 1LHWA 3CAHA 1C4RA 4FPYA 1OQLB 3PJQA 3QW5A 4ZLBB 4R6UB 1V6WA 3NV2A 1AVBA 2E4MC 1KJRA 2NMNA 3AX4A 2GNBA 4P6AA 3T8SA 4IZXA 2DTYA 3B9CA 3HBWA 4I4VA 5GLTA 2ZGSA 3C89A 1C1LA 1F31A 1EVTA 4XILA 1UAIA 3AYCA 2DREA 1LHNA 4LO3C 2A6WA 3VUOA 3WLUA 2IMBA 4GAFA 2R0FA 1LEMA 2AUYA 5JOZA 2CNAA 5DUYA 4Y22A 4I4UA 4WVWA 4EEEB 2ZGQA 3DUIA 8I1BA 2V73A 3WDXA 4BPZA 3UJ4A 1T4QA 3H6RA 1YBIA 3UDAA 4A7ZA 4FPHA 1FMMS 3C88A 4XFSA 4LBLA 5T5LA 1Z4SA 3BA7A 4KTXA 4Y1ZA 3V64A 3AJYA 1BFCA 4FPGA 5D61A 5GZGA 4XOGA 1TWMA 3BAGA 1HCDA 2ZKNA 2FMDA 3D4KA 1I1BA 4HJJA 1FATA 2BQPA 4W65A 3C8BA 2DU1A 2W39A 1Z7HA 2GDFA 5EYXA 1LOGA 2ZA9A 3FUOA 1QQKA 3D7WB 5IT6A 3P6JA 3QW7A 3RQ0A 1PC8B 4YFZA 4ZA3B 1Z0HA 2HWMA 1MZ5A 1T9FA 4EL4A 4II0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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