3V0A | Genus

Total Genus 408

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	408
sequence length	1295
structure length	1280
Chain Sequence	MPFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNAGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHQLIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNAKTFLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRGILNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGAKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Toxin
source organism	Clostridium botulinum
publication title	Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex. pubmed doi rcsb
molecule keywords	BoNT/A
total genus	408
structure length	1280
sequence length	1295
ec nomenclature	ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date	2011-12-07

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1120.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain	Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain	3v0aA02
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	3v0aA03
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	3v0aA04
3.90.1240.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Zincin-like	Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like	3v0aA01

1I1EA 1N1VA 3P53A 1S0IA 2WT1A 1BFGA 5T5OA 1SR4C 3IM7A 3H6SE 5F5QA 1VAVA 3Q7WA 1LCLA 1G82A 2MC2A 2VY0A 2WJSA 2GN3A 3EF2A 4ITCA 5T5LA 2CNAA 1QNYA 2NN8A 3WMUA 4GA9A 2D24A 3LSDA 5DZFA 1APNA 3OJVA 5DXDA 1Q8OA 3BRFA 1AFCA 1LHVA 1EYLA 2ZGNA 4X38A 4BMBA 1N3PA 3VWCA 1Z78A 1R8NA 2ZABA 1FNYA 4XJUA 2A6YA 5DUXA 1ZB7A 4YM2A 3APBA 3ZC9A 3R4UA 3AKHA 1W6NA 3AJYA 6I1BA 1FN0A 1QKQA 3AP7A 4CTEA 2F2FC 2KI6B 1YTOA 4EL4A 3IN9A 2CTVA 1CPNA 2Q3NB 2A3WA 4TYSA 3B00A 4R9DA 3ZSJA 2ZGTA 4OWLA 3SNVA 2KH2A 5DVHA 1FATA 2DU0A 1GYKA 5I1BA 1V6LA 1JY0A 2DVDA 3V0BA 2WKKA 4BLJA 2GNBA 2GNMA 4F34A 3ZUQA 1ISVA 1HQLA 1JT4A 1WW7A 4XILA 2DUQA 5D62A 3D4KA 5GAQA 2LIEA 5BOWA 4KC3A 2DURA 1HWNB 2P3IA 3O5SA 4DQAA 3RQ0A 2KLLA 1ENRA 2D6KA 2K43A 1AXKA 2QN0A 1KITA 3OYWA 2AR6A 5DZUA 1W6MA 2WSVA 3FJ9A 1Q8PA 1FYUA 4XMIA 3A0NA 1W6OA 3ILNA 1NXD1 1ZM1A 4U2AA 5L73A 3BA4A 4Y1UA 2A75A 3NBNA 1SR4A 4DS0A 5F90A 4FPYA 1LHNA 1AX1A 1C1LA 2OVUA 3PUBA 4D0ZA 1AXMA 1GGPB 3FJFA 4XMAA 3A07A 5DUVA 3DS9A 5T5PA 1JYCA 1W6PB 4EB2B 3CA6A 3BOKA 1CN1A 4G1RA 3AX4A 4JQ0A 3O5WB 1ZKWA 4I96A 1ZL5A 2DVFA 1W3FA 1Z7HA 2ZR1B 2X2SA 1MS8A 2PELA 5BVPI 2CYFA 2DVBA 1YYNA 1Q1UA 4D0TA 1DZCA 1PC8B 2A3YA 3K1XA 1IS4A 5JOZA 4FPEA 4F83A 4YZ1A 3UJOA 1ZA4A 3BA7A 4Y22B 3W59A 2F2FA 2H0BA 3D7WB 3SISA 1LULA 4QBCA 1AJOA 4I4YA 1SFYA 1PZZA 4FVVA 3I2AA 3VV1A 3BTAA 2DTWA 1DQ2A 3BONA 1AVUA 1SLAA 1WLWA 3H6QA 3IAGC 4GAIA 4G9NA 3WUDA 2GNTA 1R1ZA 1T9FA 1TTUA 1HWMB 5GLVA 1DQ4A 3O4CA 4EFQA 3O49A 5F8YA 2E4MC 3ATGA 1H9WA 1B09A 1XTGA 1DQOA 2ZGPA 1TIEA 2LTNA 4YFZA 5H9PA 1QOTA 2VU9A 2CY6A 4DFSA 4LO2C 4YOLA 4FPKA 1VLNA 4G6MA 1D2SA 4YW4A 2D20A 3OY8B 1TEIA 1FWVA 1V6VA 1DHKB 4YW3A 3I4IA 3O3QA 4AVVA 1S0BA 1G8WA 3AKFA 4M3CE 4QKSA 1F9KA 3B3QE 4IHZA 4X39A 3ZUSA 1ISYA 1GBGA 1SCSA 1Q56A 5GZDA 1P63A 3CA1A 3O0VA 4Q2FA 1WW5A 3FJ8A 4KBBA 1SCRA 1DYPA 1HLCA 1YBIA 4YZ2A 4XHXA 1YXWA 2VXRA 2XG3A 3IPVA 4LO7C 1PUUB 1FWUA 4DRVA 4Q9GA 3NBDA 3USUB 1MVQA 3VKNA 4Q9PA 1BYHA 3RS6A 4JPZA 5T5JA 4I4VA 1C1FA 2CL2A 3BRGC 3POSA 5F9TA 2LALA 2ZA9A 5FRAA 5GM0A 4YG3A 4RA0A 1WBFA 2ET2A 1HDKA 4K20A 4I4QA 2Z48A 1VALA 3P6JA 3AXEA 4LO0A 1LOAA 1TFMB 1F82A 1ISWA 3CU1B 4I6IA 1I3HA 4ZGRB 3UJQA 4Q8LA 2DUOA 1IRPA 2Y9WC 1W3GA 3F62B 2R16A 1DYKA 4M01A 1A78A 4K1YA 2DUPA 4XJAA 3BA5A 5JOYA 5H9RA 1JQZA 2ARXA 1DLLA 3SH5A 3CRIA 1Y7BA 2W2DA 1LEDA 4DCKC 1V6WA 1GICA 4DPNA 3O44A 5GZCA 3C8AA 2ISHA 4LBOA 4HR6C 4Z8SB 4QC4A 2AGSA 5E8AA 4AWDA 2GZBA 1S0LA 5EXOA 2HZ9A 3QW7A 4KEJA 4JKQA 4LBQA 2VSAA 2ZGRA 3AH1A 3NV4A 2ZGKA 2P23A 1AJKA 4XJ8A 1DJSB 4I1BA 4OW4A 3AJZA 3JUUA 2E4MA 2YV8A 3FJHA 1U0AA 3A0KA 2J3PA 3O0WA 2HWMA 4I4SA 1ONAA 4IYBA 4LO2A 1FNZA 4RL7A 1IOAA 2DVAA 3AH2A 4WV8A 5T50A 1ULDA 1EVTA 3BRDA 2AUYA 2ES3A 3MW3A 3BAQA 3C9ZA 4R9BA 3B69A 4UW5A 2D7FA 1OQ1A 4FQ4A 3H6RA 1GLHA 3UJ0A 1V6OA 1GZCA 3BAVA 4XFTA 1FMMS 1LU1A 3C88A 1V6JA 1FMZA 3VSZA 3POWA 1G86A 2HW9A 3PVOA 1DIWA 3AFKA 4YW1A 4XJWA 2AFGA 3N7KA 4ZFYB 3ZXDA 4XXPA 4FP2A 3INAA 4H55A 1IILA 1WD3A 1N1YA 3GALA 1ITBA 1UAIA 2Q9XA 3WDTA 4LBMA 1NZKA 4GALA 4KEIA 4GAFA 2UUSA 2WT0A 4XOGA 2HYKA 2P2KA 3A23A 3M3CA 3QCWA 4JAWA 1GNZA 2VW0A 3WCRA 2YZ4A 5IK4A 5BYNA 1VAMA 4QD2C 2D43A 4OWKA 1HIBA 1MZ6A 1E0OA 2OW4A 2A5ZA 4HJJA 1M2TB 1BFBA 1CPMA 3FUQA 1Z4SA 1WLDA 3CA5A 3UDAA 5BQMB 1WLCA 1KDMA 1ULFA 2NZ9A 3WNXA 2Q5TA 3WOGA 2JE9A 1RINA 4Y26A 5DUUA 4QKRA 2D6OX 1QOSA 4J2KA 4U36A 4CJMA 1C57A 3VKOA 4BLIA 3UK9A 3FUOA 2E53A 3JU9A 1UX6A 2ZQOA 2R0FA 4Z8BA 2DWRA 4KUFA 3FLTA 3BOOA 1J0SA 4Y24A 2OUHA 4XBNA 5GLUA 2FMDA 1V6NA 4YGBA 4XE9A 4P9YA 3ZVXA 4KS6A 2A70A 4GWNA 2JE7A 4XYXA 2UWCA 2P34A 1BKZA 4BOWA 3M1HA 3MW2A 2ZMLA 4NO4A 1BFCA 3N0KA 3I2XA 4QBVA 4I4PA 2DREA 3QYDA 1BXHA 1K5VA 1GZWB 3SITA 1F31A 1AXZA 5DG2A 4XKIA 1HKNA 1G7YA 1DQ0A 4BMEA 1IS6A 3AZVA 1N1SA 3A22A 4LO3C 3KM5A 4K21A 5DUWA 4EEEB 4HL0A 1DFCA 1CJPA 4ISRA 1MS9A 2I2SA 1MS0A 5CBLA 4Y1YA 1LTEA 1LGBA 4FOVA 3KQRA 1UN1A 5HCBA 3HR9A 2FFUA 1W0OA 4XFUA 2ENRA 1W6QB 3ILRA 3NBEA 4PBOA 3WHUA 4ENDA 1MVEA 3WO3A 4NOTA 2C9AA 1QGLA 3R4SA 4G6JA 3AH4A 3GNEA 4I37A 3M3EA 1JTCA 4ZJXA 2FDBM 2ZMNA 1W0PA 3FIIA 1SLIA 2C5DA 4JP0A 4K1ZA 1XYFA 4FPLA 3TAYA 3WCSA 4ATFA 5HCAA 1H9PA 5FZZA 4Q27A 3A21A 1KNMA 3ZXGA 5AVAA 1IJTA 3Q7XA 3FJKA 4IQPA 2KKIA 1WBAA 1YF8B 2G4IA 2OUJA 1KJRA 1ULCA 4Q1RA 4R9CA 1KQRA 1TWEA 2EALA 2ZGLA 2EF6A 3IMNA 2AAIB 4AGRA 4DEPA 4X37A 2AXMA 1QMJA 1G9FA 1W6NB 4IY9A 2DVGA 4YG6A 3AK0A 4YG0A 3CRGA 1QU0A 2UU8A 3BAGA 3IM0A 4FPFA 1FGAA 2P37A 2IMBA 3FJIA 1N1TA 4DRRA 1CR7A 3WO4A 4ATEA 3UL2A 2NTDA 2D1ZA 2JECA 1ONKB 3V0BB 1C4RA 2DYCA 3O12A 1PWAA 3ZXEA 1LOEA 3O4DA 2GMPA 4USOA 4YZ4A 4AN6A 5F8WA 1MS5A 1V6IA 4XTPA 2P3JA 2ZHLA 3O0XA 3FJDA 1LOGA 1AX0A 3N36A 3LTQA 2ZGSA 5GZGA 3B9UA 1AVBA 2A6VA 1V00A 3QIYA 2E7TA 2ZKNA 2IHOA 1DBNA 1YO8A 2GMEA 1DGLA 3OYWB 4XDQA 1Z0HA 4A7KA 4I4XA 3NWKA 4AVSA 1W6MB 3NBCA 1ENSA 2VH9A 2W52A 4PBPA 1W6OB 4EFRA 3LCPA 1Q04A 2ZGQA 4GWMA 4M3CF 1SLCA 2LIQA 3C2UA 3ASIA 1CONA 2A6XA 1O4ZA 5BQUC 3QJ0A 1HCDA 4OEFA 4AGGA 5JOXA 2IWTB 3IKWA 3SH3A 5IK7A 2TEPA 3I8TA 2XOAA 3AZYA 3M3QA 4HANA 2WLQA 3FJBA 4JKXB 5GLZA 3D5OA 5CA6A 1ENQA 2YY1A 1IOBA 3V0AA 2D44A 4AN7B 2XHLA 1JT5A 2ZZJA 4ISQA 2D7IA 3AYAA 1SZ6B 1H30A 1S0EA 3AYCA 2FO1A 4XXAA 5DUYA 5GZEA 3BIWE 1MZ5A 2DTYA 1SLBA 4LBLA 5HPZA 5T54A 5B2HA 3POKA 4P6AA 2ISEA 3KMVA 3WHTA 3QW6A 3TC2A 2P3KA 4D8HA 2MIBA 2GDFA 2D6LX 1LODA 4ASMB 1V6XA 2ZHKA 1YRZA 4I1EA 4J2XA 4EKXB 4JCKA 1LHOA 3RRDA 1GZ9A 1LESA 4R6UB 5JMCA 1RG8A 3AP6A 2JJ6A 1V6MA 4P9WA 5DZEA 1VIWB 4JC1A 1TOOA 4Y20A 1YVGA 1WCSA 1NUNA 3ZXJA 2NYYA 3FIEA 3MALA 3ZX7A 4R9AA 5FZUA 3WO2A 1T3AA 1Z2VA 3WA1A 3W9TA 5EHAA 1FQ9A 4ZA3B 3UD8A 4ELCA 2WT2A 1AVXB 3F1RA 1S0JA 2RG9B 4PQ9A 4C1XA 3I29B 1T3CA 2D6PA 2X2TA 2W08A 4P0KA 2KM2A 2AQZA 1PZ7A 1HWOB 2Y9GA 3HN1A 4OWJA 4M3CA 1DQ6A 1FX5A 4ZXKA 1GNHA 5BQUA 3RTIB 3IPVB 3ZYRA 1PZ8A 2Z49A 4G9MA 3LSEA 5CNAA 2QN4A 3WINC 3S8KA 5KXBA 4CRQA 5EWSA 5IUQA 3OGGA 3BADA 1RIRA 2SBAA 1LHWA 1WBLA 3CA4A 4MYEA 1URXA 2ZBJA 5E24E 1G9CA 1LEMA 4IONA 2A71A 4AYUA 3AJ6A 3RSJA 1KRIA 1BA7A 3RTJB 3WG4A 1AF9A 3NV1A 5T55A 1SBEA 3PMEA 4Q91A 5H9SA 3BX1C 3PG0A 4BPZA 3ILFA 3V79C 1OKQA 2NM1A 4J2SA 4M00A 3V65A 1UPSA 3O4AA 4I4OA 2ZHMA 4J23B 5IK5A 4YGCA 2W2DB 1N3OA 3JUTA 5FNXA 1WBCA 4FPGA 5GLWA 2NMNA 1QDOA 2Z42A 4L4IA 2D3SA 4J1LA 3D6EA 5JLVA 2YXSA 4I30A 1IHKA 2JKBA 5BXPA 1G9AA 2R1BA 8I1BA 3N35A 1K5UA 2ESUA 3NV3A 4FPCA 1ILR1 4H9WA 2GALA 2VXTI 1YIFA 4LBQB 2BQPA 3OBTA 3ZC8A 2WSUA 2CWMA 3QIZA 4YM0A 2AREA 1XZZA 2IMCA 1V6KA 3OJBA 3BB2A 1A8DA 1D0HA 1XHBA 3E8LC 3R05A 3N3HA 2D22A 4QO3A 5FNWA 1S0FA 4YZ3A 1S0CA 1ULEA 4YW5A 3WDXA 5BXTA 4Y1ZA 1DQ1A 3AP9A 2GN7A 2JDZA 1SLLA 1MS4A 3SLIA 5KXEA 4WVVA 1Q8QA 2ZGMA 3PJQA 3IM5A 3T1LA 2RHPA 1LU2A 1N47A 2EAKA 1AVWB 4UW4A 2P39A 3BWIA 1S0DA 2EXHA 3H6RB 1DQGA 2R9KB 2ARBA 5IT6A 4P14A 1JHNA 5GLTA 2ZAAA 3BOPA 3DUIA 5GZFA 3WV6A 3CA0A 2VW2A 2YUGA 3AZWA 5CAZA 2VUAA 4FGFA 4LO7B 3IM6A 1SBFA 3WINA 2Y9XE 3FFZA 3W58A 2ERMA 1EV2A 4JRAA 3DDBA 4FOQA 3AP5A 4I7IA 1WW6A 4FPHA 5DG1A 2HWAA 2JD4A 5BXSA 3ZSLA 1LOFC 4I3NA 3QW8A 5E89A 2DRZA 5BP5C 1LENA 3WLUA 5H9QA 2W39A 3S8JA 1BLDA 2KI4A 4XBQA 2E51A 1V6UA 4LBKA 1IKQA 1BZWA 1W6PA 1WUVA 4WVWA 3BAUA 4GKYA 3FJEA 4C1WA 4GKXA 5D61A 4LBNA 4LO1C 1S1AA 1ISXA 3OJMA 3L2YA 2ERFA 3ZYPA 1QDCA 2A3XA 3VUOA 1QQKA 4YGEA 1ULGA 2F8XC 2DRYA 1UMZA 4ZLBB 5T52A 4Q8KA 4TLPA 3VT2A 1IT0A 1CVSA 1ISZA 4XJZA 2WNEA 4FP3A 4YFWA 3FJAA 3DGTA 3ENRA 1HCEA 2EXIA 1QOOA 3VEQA 2L5XA 2SLIA 1JYIA 1JLYA 2XB6C 4Y22A 3AZZA 1LGCA 3VT0A 4UW6A 7I1BA 3C8BA 2D23A 2G7KA 4ZFWB 3IIRA 4XZPA 5GJ6A 5HCFA 4PC4A 1VCLA 4XHBA 2DU1A 1N3QA 1JW6A 4IZEA 4XTMA 4KTXA 3CRHA 1UZYA 3N7JA 1GSLA 2WRYA 5CB7A 5KXCA 3QR5A 1RITA 3T2TA 1NLSA 3HMYA 4X3AA 2PHTA 3BODA 4PF5A 1JOJA 2A6WA 1LOBA 1II4A 1QQLA 2W68A 3M2MA 4LBQD 3VKFC 2VLCA 1FV2A 4YM1A 1X50A 1G9BA 3SNMA 3OY8A 2ZACA 1GKBA 3ZXFA 3WG2A 3AKGA 3WUCA 2PHUA 4TZDA 4GP3A 2D3PA 2ZGOA 3SH4A 4AGVA 3DDAA 3CQAA 1BJQA 5EG6C 2ZGUA 1ZKXA 4I0YA 1N4KA 5E88A 1LOFA 2FPQA 1XQNA 5BP5A 2AYHA 4LO0C 5FZYA 1WD4A 1S0GA 2UURA 3USUA 4I4RA 3QIXA 3Q7YA 2E7QA 2FHRA 4LO3A 1LGNA 1AZDA 2G7NA 1R8OA 4LBJA 1I1BA 4EFPA 1SBDA 2GMMA 5G00A 4QD2B 2YROA 4EJ5A 4I8MA 2FGFA 3MPPG 2QYIB 1T4QA 4LO1A 3AYEA 1G9DA 1BFFA 3MW4A 1BLAA 21BIA 2R49A 1OFSA 2NVHA 2UWAA 2V73A 4GOVA 3M3OA 4L4HA 2EXKA 3WG3A 3AKIA 1MS1A 2D6NA 1IRAX 4P9XA 4W65A 4Z9WB 4XIKA 3ILAA 3QLQA 3WDWA 3PHZA 2A6ZA 3ZSKA 1PZ9A 2UWBA 1JUIA 5EYXA 4FPJA 3P6IA 4YM3A 3ZXKA 1TWMA 1DQ5A 5BXRA 2M49A 4WBCA 3NF3A 4II0A 4SLIA 1SACA 4BM8A 2EIGA 1XTFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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