1ISXA

Crystal structure of xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86 complexed with xylotriose
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
436
structure length
436
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGSSTPPPSGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structures of the sugar complexes of Streptomyces olivaceoviridis E-86 xylanase: sugar binding structure of the family 13 carbohydrate binding module.
pubmed doi rcsb
molecule keywords endo-1,4-beta-D-xylanase
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
total genus 168
structure length 436
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2001-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1isxA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1isxA02
2WMKA 3A21A 1O7AA 1HX0A 1SYTA 2FH6A 2FH8A 1D0HA 1ZBCA 4CCCA 1KBBA 1V6UA 1KXHA 4DWSB 1V03A 4JAWA 3SCSA 3CA3A 1I1XA 1EGZA 3ZT5A 3MSGA 3VT2A 2VRQA 4WKHA 3BAWA 3VIKA 4CD7A 1FN0A 4PCTA 4P7LA 4ZGRB 3ZSTA 1J0YA 2WC3A 4ZFYB 2EPOA 1C91A 2VRJA 1YQ2A 3IAGC 1MW0A 1VFMA 4M56A 2JF7A 3B9UA 5JIPA 2XFYA 2WW5A 3MS8A 4W88A 3WD1A 5I0DA 2F8XC 2V5DA 1X1NA 2V3GA 2WMJA 3NBEA 3OGSA 1CIUA 1D3CA 2Q9XA 3BAOA 3THDA 6CGTA 3OGGA 4MNLA 4UFJA 2FFVA 5IHRA 4PSRA 3ZJ8A 3RPMA 1QBBA 4G1RA 1TVNA 1LG2A 2D44A 2J25A 4RL3A 4KEJA 1G01A 3II1A 1EDTA 1EDGA 4CJMA 3AICA 5A2AA 2OYKA 4UR9A 4D6DA 3VD4A 3NSXA 4JZ5A 3NJ3A 3SUSA 3VEQA 3FFZA 3IJ7A 4G6JA 3M07A 3PZOA 4P8UA 3ZX7A 2F2FA 1VEMA 2YL6A 4D6JA 2DREA 4ZFUB 4WBCA 1JDDA 3GXMA 3WH7A 4MDOA 2DGAA 4ZA3B 1B3ZA 4GINA 1YBIA 3WMSA 1UKTA 2BEAA 5E6YA 3FGMA 1TA3A 2OSXA 5EBAA 3VUOA 5IDIA 2WNWA 2UY5A 2B31A 2X0HA 1B2YA 1WNOA 5CZKA 1NWTA 4QO3A 3EF2A 1C3FA 1ESWA 1CGYA 5IHSA 2ZOXA 1DEDA 1PX4A 4P6AA 1E0VA 3GBDA 2I1BA 3VNZA 2ZE0A 1TP0A 4HPHA 3AIWA 1D2KA 1PUMB 2V3DA 3RIKA 2VZVA 5BCAA 2FO1A 2X05A 3T0AA 1M53A 5HBFA 1UD3A 3G6MA 2WBCA 3WUFA 4DENA 2EPLX 3WMCA 1CVSA 3U7VA 1JFXA 3ARSA 5A6LA 4AIEA 4HOWA 4GOVA 5DVHA 1UKQA 4YHGA 2XGIA 7CGTA 2X2SA 3W38A 1ITXA 4ZE4A 2E8ZA 2UWFA 4W5UA 2BXYA 5A6JA 1QI4A 4LXFA 4F79A 1C8XA 1Z32X 1DQGA 2Y2WA 1T4QA 1XCWA 1CXIA 1Q03A 4FK9A 3KWXA 4XZWA 3VM5A 1XCXA 4HOXA 2FHFA 2NZ9A 4JRAA 1H5VA 1WD4A 3D3AA 4N0RA 4GXPA 2EPKX 3W82A 1HVXA 4LYQA 3TTOA 2WRYA 1E6SM 3GZAA 3FJ9A 1ABRB 1JY0A 4CCEA 5AC5A 2PWFA 3W24A 3UJ4A 4IZXA 1I75A 3CIVA 5HPOA 2OWWA 2DIJA 4RE2A 1AMYA 5JIWA 1YXWA 3Q7YA 1QI3A 4PTVA 5LA0A 4EFQA 4I4PA 3VILA 3AIEA 4KRTA 2J3PA 4IISA 4P8VA 3CA6A 1W3FA 3WQVA 1CTNA 4LX4A 3WL0A 2Q3NB 4B9ZA 1JAEA 1H11A 5CQ1A 3A4WA 3VUPA 2JFEX 3PZTA 1ISXA 4W7VA 1E6XM 1FMZA 5C70A 2JEQA 1ZS2A 1FP9A 2NT1A 3K4DA 1V02A 2YBTA 5BOWA 3AMKA 8A3HA 3AZTA 1MWOA 3TTSA 3BTAA 1JAKA 1E9LA 1OD8A 1UZ4A 4FLOA 4JPZA 1W1VA 4UZUA 2WVUA 1V6YA 3GM8A 5I23A 1QOXA 2J79A 1WDRA 4W89A 1QW9A 2D3NA 4FLQA 2KKIA 4NRRA 4UQCA 3PN8A 3AZWA 2OLHA 2ZIDA 3VTRA 4PC4A 1V0MA 4AZ7A 1WCGA 3W28A 4ACZB 3WF1A 1PBGA 3OLEA 1FHDA 4GKLA 4PMUA 4B15A 3WO2A 2JALA 2O9PA 1ISZA 1BHGA 1C92A 2Y9FA 3L4YA 2XIBA 3AKIA 4W86A 4JL1A 2JF6A 1VB9A 4MB3A 2PBOA 4I4OA 4ATWA 4TVDA 1IT0A 3MPPG 3PTMA 4P0KA 2CBUA 1Q1UA 1FV2A 2PF0A 3PZNA 3N18A 2BFGA 3HN3A 1DWGM 3F5LA 1L2HA 3CRGA 1UWTA 3OGFA 2CBIA 2DH3A 4MJ4A 1WKYA 1AQMA 4USOA 2ZUNA 3CQAA 1R85A 3GXIA 1LL6A 3CUGA 1NUNA 1B1YA 1CLXA 1J9YA 3RJXA 2JIWA 4ISRA 2WZEA 2J78A 5DFAA 4U33A 3VX1A 1FH9A 3I2AA 3PZVA 3VDBA 2DSZA 1H2JA 4CN4A 3HJEA 2QPUA 2XOAA 1OT1A 3B9DA 4LPCA 1OBAA 2JIEA 3SCTA 1KBKA 3UG3A 3V0AA 2EO7A 2W5FA 3OLIA 5FNWA 3CPUA 3FJHA 5A95A 5A6KA 2Y8VA 5DSSB 2E9BA 2WMIA 4Q9PA 4IYBA 1UH2A 2CNCA 4LO3C 4EEEB 2D1ZA 1CXKA 4YN5A 4AISA 4TTGA 5A8PA 3I2XA 2G3NA 3MUAA 3OBAA 3N11A 5BWFA 1YHTA 2DH2A 2WXDM 1SMAA 4OEEA 4MAZA 4D1IA 1G5AA 1JGIA 3IIRA 2J7HA 3MO4A 1RZOB 4MPKA 4LO7B 3MV11 5BXRA 1OINA 3JUTA 3OJ2A 3BCDA 3VMNA 1P63A 1IOBA 2DSKA 3ZJKA 1ODUA 4E4PA 1TTUA 4IY8A 1JD7A 2OYMA 1EPWA 3EMQA 4AY1A 1FV3A 4ZENA 1K9DA 3PZ9A 4OWKA 1B3XA 4UFLA 4ZBVB 4EFRA 3OB8A 3F5JA 4LO1A 1IRPA 2WMGA 3VIFA 4ISQA 1TVPA 3IAQA 2WBKA 1V3LA 1UKPA 4JFSA 4U31A 2C7FA 4NF7A 4XX6A 1BLAA 4PBGA 3MSDA 3QHMA 4QC4A 1MXGA 2DT0A 1OGGA 1J10A 1BFNA 1HP4A 1QPKA 2D23A 3GTNA 4H41A 2QMJA 5A8NA 4X0NA 2CBVA 3VIHA 3SNVA 1U2YA 5EC5A 3PTQA 3WDQA 3MUZ1 1S46A 4LO0C 1QNSA 4G9MA 1B0IA 1DWAM 2G3JA 3PHZA 4JKMA 5F8SA 4NSBA 1JZ2A 4QFUA 4IQPA 3VIPA 5DEZA 1GOIA 2GJXA 3NCOA 4L4PA 2ZWZA 1SFSA 1DZDA 1UKOA 1JDCA 2AAAA 1BF2A 3POHA 1LF1A 4QLJA 1J12A 4ZOTA 2BY3A 3VD9A 3H6SE 1GOKA 2VJXA 3SUTA 1MYRA 3RMXA 3POCA 4Z2LA 2V5CA 3CRIA 3N7LA 3O4OA 3THCA 4B9YA 2AAIB 4D6HA 3VOCA 4HPGA 3BC9A 4ENDA 4H7VA 4ML4A 1WDQA 1M04A 2NT0A 2OWCA 2ZUWA 3OZOA 1OWQA 3NSMA 3WD3A 1LLOA 4D6EA 1EYLA 4DEPA 3RMEA 3P6JA 3FJAA 4X9YA 4UQEA 3VGGA 3WQ8A 4P0JA 4B16A 5FIPA 5FOOA 4AWEA 1HJXA 3ZO9A 2VX4A 1JXJA 3DYOA 1R7OA 1QI5A 1DFCA 4CN6A 4JHZA 2W91A 3O9NA 1UD4A 2P23A 4UFMA 2CKRA 3Q7XA 2DS0A 2WMFA 2YKKA 1JZ5A 1K5UA 4M1RA 2LIQA 4M82A 2WWCA 4G9NA 1VJZA 1UH4A 2ZUUA 4AEFA 1EA9C 1OT2A 3N13A 4ZE5A 1TG7A 3HMCA 1LWHA 1TUXA 3K46A 8CGTA 3WFZA 1CENA 2GFTA 3PZUA 2IUZA 2CERA 2Y8KA 1Z0HA 1LL7A 3BSGA 4KGLA 3L4VA 4J2YA 1KGWA 2XIIA 1WBAA 4UZSA 5IFPA 2VVNA 3WDPP 4CU6A 1J0ZA 4CD5A 1EXPA 3HALA 4CCDA 1LL4A 1NM9A 5BXPA 4UOJA 2ZUVA 1ZJAA 2DT2A 3FY1A 3VGEA 5I3DA 3CBWA 1W9XA 1G9AA 4U2YA 3KE0A 3VM7A 1CNVA 2D3LA 4DWSD 5I2UA 4P7NA 3TTYA 1V6VA 2VOTA 3BAKA 3BA7A 7I1BA 1BYAA 1CYGA 4ZEPA 2XM1A 1GW1A 3WEOA 2FGFA 1HJWA 4QD2C 1KB3A 5I78A 4TVUA 1II4A 1Q6EA 2EJ1A 1T9FA 1UD8A 1Z4SA 4UQ9A 1BQCA 3TOPA 3WH5A 3WBAA 3WN6A 3WNNA 3Q7WA 2J75A 3L2MA 1JF6A 1XSJA 1JIBA 1BAGA 1CXLA 3IANA 3ZJ6A 2D20A 2YA1A 2FFUA 2DT1A 5GQBA 5JUVA 5D61A 2Y24A 1BSIA 3KL3A 3WF3A 4EE9A 2VRKA 5EFDA 4J23B 4CU7A 1UOKA 2OWXA 5LA2A 2WHJA 3BA5A 1C8QA 1QHPA 4LO8B 2J7CA 4GP0A 4R27A 1UKSA 1FMMS 3KL5A 1WZMA 2PWHA 3SUWA 3BAXA 2J4GA 5EG6C 2VXRA 2Z48A 2TAAA 4II0A 2UY2A 1V0LA 3WEZA 4DM1A 1G94A 2A3EA 2XVPA 4LYPA 4LGXA 3WBEA 3WKZA 3CH9A 1K5VA 1G9HA 3AZSA 3ARWA 4AMCA 2OSWA 1B31A 2OSYA 4NZCA 2DSVA 2XSAA 3AISA 4C7DA 3WNKA 2V3FA 1S0CA 1JTCA 2WVSA 2WCAA 1US2A 2E9MA 2PB1A 2ZXAA 1W3JA 4AZBA 1CGXA 1DWIM 1KR0A 4CUCA 5FNXA 1B3VA 4DUVA 4HTYA 1A8DA 5D8WA 3T2PA 1UHVA 3UDAA 1GQJA 2DIEA 1W9BM 3MMWA 2QPSA 4FLSA 3ZMRA 1XH0A 1M03A 1RG8A 2VT0A 3IJ9A 3V0AB 4V27A 3CA4A 4TVCA 1E4NA 3H6RA 3IM5A 2XVNA 2EBNA 2EQDA 3WNPA 5ABGA 3N15A 3OLDA 4I1EA 1B9ZA 4OUEA 2MANA 4HA2A 1UYQA 2NM1A 2Y9WC 4D0TA 5A6BA 1Q04A 1TFVA 1V6XA 4Q91A 1KQZA 3WFLA 1JDAA 1XYZA 3ZOAA 1FWUA 4WKAA 1OIFA 4HZ7A 4WSKA 3LPOA 1VCLA 1J0SA 2BFHA 4AIOA 3CUFA 2J7EA 7A3HA 1QI0A 2MC2A 3ALFA 4UQDA 2J7GA 3WQ5A 1CECA 1PUUB 3MMUA 5BQUA 5BXSA 1ISYA 4C7FA 3NJ5A 4GOYA 1AQ0A 4OEGA 1PIGA 3U5YA 4MNMA 4I7IA 4GO8A 5HDRA 5FZYA 2ESCA 5JBFA 2DRZA 5FL0A 1H0IA 3ZT6A 1JZ6A 4LO1C 1BGGA 3WENA 4Z2IA 1IV8A 1WAWA 5DUYA 3P53A 1F31A 3MUY1 5CGTA 2Z1SA 3SUVA 3BX1C 4LO0A 2NP0A 2GO2A 1UD6A 2VCCA 1JI2A 1ILR1 5FZUA 1OD0A 4K68A 4WJXA 2CPUA 4X3AA 2QMKA 1XHGA 1AVAA 2ZXQA 3NBDA 3AIRA 1DWJM 2ZUSA 1E1EA 4LO2A 1W3GA 1W3KA 3AKFA 3VSFA 3WF2A 4AC1X 4UQBA 1M7XA 1NOWA 3VMOA 3BAVA 5E0CA 4R5EA 3BRFA 1J11A 3BLPX 4I4XA 4PN2A 1QQKA 4GZIA 1GQKA 1NWRA 4FVVA 3OG2A 4GI6A 5EHAA 1WDPA 1BG4A 3AIUA 5EMYA 2RG9B 2G3IA 3AYRA 1I1EA 2O9TA 3JRRA 4GAFA 4AN7B 1E6QM 3CUIA 4TX6A 3VGBA 4OZOA 41BIA 2GDVA 1BTCA 3ZT7A 3C9ZA 1AVXB 1EH9A 1HL9A 3FNDA 1KFWA 3AHYA 3WO3A 1TZ7A 1VBUA 3EDDA 4P7RA 1PEZA 1ZB5A 2VX6A 9CGTA 3BAGA 1J0KA 2C8NA 1GQIA 4PSPA 4J3XA 4ACYA 3SEPA 4LQ1A 1W2PA 4XV0A 5E09A 3WUGA 3OBTA 1GUVA 1EHNA 1F4HA 3OLGA 1BA7A 1JT7A 4JL2A 1ITCA 5D4YA 2F8QA 2WLYA 2K4AB 4I8MA 4CD8A 5CG0A 4J3TA 4XZBA 2W4XA 1UR1A 1DJSB 4YOLA 1KGUA 4PEEA 3OA5A 4F34A 1O6IA 3VD3A 2ET2A 1VIWA 3D7WB 1UZ1A 1RMLA 2GK1A 5A3HA 3OGRA 1XZZA 1CGWA 1RY7A 3TP4A 4Q7NA 2ZUMA 2W66A 3O4BA 2HZ9A 3W27A 2E4MC 4TLPA 2YLLA 3UEQA 3MUIA 2YL8A 4AZ6A 1JYXA 5A8OA 4M8UA 5E9AA 4X0VA 3CZKA 2KH2A 1QXMA 1QNOA 3LLPA 4IZEA 2YA2A 5LYRA 1MQRA 4U5KA 3MALA 4D1JA 4QP0A 1V08A 1BVNP 1VRXA 2DPEA 3MV01 3W26A 2VO5A 4IY9A 5HXMA 1HF6A 1UUQA 3AROA 4MAVA 4F9JA 3ARPA 1VEPA 3S6TA 1U30A 2X2TA 5A6MA 1JF5A 3K4AA 4L4IA 2VR4A 4W84A 3S2CA 5ABFA 2YL9A 3BH4A 3F1RA 2CESA 2XWEA 3WUEA 1E40A 2WSPA 3RMYA 3NIYA 4NRSA 3WDHA 4TTUA 1FFRA 4M81A 3WNLA 3FHAA 4X38A 4D6GA 1E6RA 1GZJA 4LYRA 3ILAA 1YF8B 3T09A 4Z8SB 2O92A 4AYSA 4GI8A 1EDQA 1GNXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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