3AZWA

Crystal structure of the receptor binding domain
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
427
structure length
418
Chain Sequence
NEYFNSINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYWFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural and mutational analyses of the receptor binding domain of botulinum D/C mosaic neurotoxin: insight into the ganglioside binding mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords D/C mosaic neurotoxin
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 86
structure length 418
sequence length 427
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3azwA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3azwA02
1ZM1A 4MYEA 4FPLA 1KQRA 1KDKA 1BQPA 2ZACA 4XHXA 4USOA 1N3PA 3O5SA 3WDXA 2K8RA 2BFHA 3W9TA 3P6JA 3AJ5A 4YM0A 2ZABA 4Y1ZA 1FV3A 1IS4A 2ZHNA 5KXDA 1VIWB 3VUOA 4R9AA 4I0YA 2D7RA 2D23A 5BP5C 5IUQA 2A6XA 1U0AA 1W6OB 4YW2A 5KXCA 1YXWA 2VXTI 4FOWA 1KNMA 3BAOA 1BZWA 1BFBA 3P6IA 2Y9XE 2XOAA 1WLWA 1C1FA 4QD2C 2P39A 1LOEA 4XKIA 2HYKA 2UWCA 1TP0A 2D3PA 2YV8A 1G8WA 1V6WA 1UX6A 4DEPA 3H6RA 1SBDA 3BAGA 4AN6A 1TTUA 3QLQA 5H9RA 3JRRA 2XG3A 1JBCA 2A7AA 1CE7B 3F1RA 2DV9A 3A23A 5DZFA 3WG2A 4D8HA 4YG6A 3R05A 5DXDA 2D44A 3OJ2A 1UPSA 2WSVA 3B00A 3FJDA 1G82A 2VW0A 4M3CE 1PZ7A 1NUNA 2HWMA 1AX2A 3O4OA 2MC2A 3D5OA 1HQLA 4HL0A 4IYBA 3S8JA 3BAQA 3PJQA 4XIKA 4Y20A 2D6KA 2P23A 2V73A 1SFYA 5FZZA 2D1ZA 5HCBA 1EV2A 2QN4A 4P14A 3O44A 1IRPA 3UD7A 1DHKB 3FJKA 4P9XA 1W6QB 2AAIB 1DZQA 1JYCA 3FLPA 3WO2A 1IOAA 1UMZA 4GP0A 3UDAA 3CNAA 4AVTA 2DYCA 3N3HA 4I2SA 3ILFA 4TLPA 4FPHA 4ZGRB 3VKNA 2VW1A 9ILBA 4Y1VA 4WVVA 2B7YA 1XHBA 1BLDA 3R4SA 3IN9A 3IPVA 3O4CA 3VEQA 5GZGA 4XJWA 1ENSA 3RSJA 3Q7WA 4GA9A 5B2HA 1QQLA 2PHTA 5IK7A 3NV3A 3HALA 2LALA 1CVSA 2DS0A 2ZGNA 3FJIA 2E51A 5H9PA 1ENQA 2GDFA 3IMNA 5T5PA 4GAIA 1Q8VA 3FLTA 4F83A 5JOZA 1JT5A 1Q8SA 4YGBA 4IZEA 2AQZA 4LO2C 3NBNA 2EXJA 2JJ6A 3WO4A 4GXLA 4PF5A 4YZ4A 1WLDA 2DTWA 3USUA 2Z49A 2VSEA 1AVUA 2A3XA 2A71A 4LBLA 5D63A 1T9FA 3OBTA 1VALA 1FNYA 3ILAA 4G1RA 2DU1A 2R49A 4BQ1A 1R8NA 1I3HA 4IY9A 3ZXGA 3HN1A 1ITBA 3RTJB 2DRZA 4CJMA 1BARA 4ASMB 2EF6A 1Z2VA 2HWAA 1V00A 1JQZA 4FVVA 3A4UA 1ISWA 4XXAA 1Z78A 3V79C 4L4IA 1CIWA 4I37A 3O4AA 2WKKA 1Q8QA 4BPZA 3OGGA 1QU0A 3ZVXA 1QMJA 4GOVA 3T2TA 1ILR1 1QF3A 1Z4SA 1HKNA 1BXHA 2E7QA 2ZGSA 1Q04A 1A78A 1V6IA 1YRZA 2VH9A 4FQ4A 5GZEA 5EYXA 3WDTA 5GLVA 3BAHA 1N4KA 3RS6A 5JOXA 3M3EA 4QKSA 3VKFC 2GZBA 4Q2FA 3A0NA 3M2MA 2VW2A 1UN1A 1HLCA 1KITA 1S0EA 3AX4A 4I4UA 3H6RB 4YLZA 1HWNB 1N1YA 3I4IA 2OUHA 1BASA 2DUOA 2YZ4A 3AZYA 3A22A 4UW3A 2WJSA 2LIQA 3OBRA 4AVSA 4FP2A 2P37A 4FPOB 1SR4C 4I4OA 3M3QA 41BIA 2R1BA 1R1ZA 1LCLA 3ILNA 4XJZA 2GNMA 3W59A 2A6WA 2NM1A 3WDUA 1F31A 2W68A 1ULFA 1XQNA 2ES3A 4A7ZA 1HCDA 1IS3A 1CQ9A 3V64A 2FMDA 1BYHA 2WT0A 3ZPYA 4LBKA 2A6VA 4Y22B 1Q1UA 2UUSA 5GJ6A 3ZYRA 3PHZA 5F90A 3PVOA 4LO8B 1NXD1 4A7KA 1DQOA 4Z8BA 1EPWA 2EALA 2A70A 5FNXA 3N7LA 5HCFA 1DGLA 1BKZA 3O3QA 5T5LA 2CWSA 4WZFA 2D6MA 2VSAA 3RMYA 1G9DA 3B3QE 4D0TA 4P0JA 4QALA 5KXEA 1LU2A 1UAIA 4EFRA 4XOGA 2YROA 5DSSB 5H9QA 3FLRA 3MEPA 3UJ4A 4JCKA 5T5OA 1TWMA 5KXBA 4R9CA 3AYDA 5JVVA 4XBQA 4C1XA 1ISYA 4H55A 1LHUA 4FPJA 1LGBA 3POWA 5EWSA 3IM6A 2HZ9A 3SNMA 2ZMNA 2GALA 4YG3A 3FFZA 2YY1A 1IRAX 1SCRA 2NMOA 1DQGA 3FJ9A 2WSUA 4XXPA 4Q26A 1FMZA 1CONA 2PHWA 5FREA 2SBAA 2ZAAA 1QXMA 1D0HA 1ULCA 4XFTA 4AYUA 1T4QA 1W6QA 3USUB 4D69A 3Q7XA 1V6MA 2NTDA 3VT1A 3FJCA 2AH2A 5EHAA 3IM5A 2FFUA 3SH3A 4Y1XA 1IJTA 4KEKA 3AKHA 2Z42A 2ZQNA 2NYYA 3SH5A 3CA0A 1RG8A 2UWAA 1BLAA 3SISA 3WZ1A 2DVDA 3BA7A 1YIFA 1SLCA 4PQ9A 1IOBA 2ET2A 4XIOA 4DRRA 1N47A 4LBOA 1GZCA 1BFFA 2IHOA 1DZDA 2AFGA 2F2FA 1LOCA 2ZBJA 1KJRA 1XG6A 1YF8B 4I3NA 2JDZA 5T50A 2CY6A 5EYYA 5DUUA 4AWDA 1J1TA 1SACA 3BX1C 3D7WB 4ISQA 4IY8A 2PELA 3WOGA 5IK5A 1CPMA 1QGLA 1QOOA 1II4A 2GNDA 4NOTA 3ZXLA 3EF2A 1V6OA 3SH4A 5JLVA 3NBEA 3ZXKA 1W6NA 1WBFA 2WT2A 4KEIA 1WUVA 1V6KA 4JQ0A 2AREA 2EIGA 1JYIA 3RRDA 2AENA 4AGVA 4M3CF 2NP0A 4P0LA 4YW3A 1ZA4A 2JKBA 1PC8B 1WBAA 1AJKA 1DQ4A 3E8LC 3WINC 3WV6A 1PZZA 3M3OA 1FMMS 5E24E 5L73A 1LOFA 1VAMA 3PUBA 2X2SA 4I1EA 3VWCA 2BQPA 1G7YA 5GALA 4D0ZA 2D43A 4AGGA 2DURA 4YZ5A 3WMVA 5GZCA 3NBCA 2P3JA 3FJ8A 4IQPA 1MS4A 4XJ8A 1AVBA 1AX0A 3Q9OA 2NVHA 3N35A 2ZHKA 4H04A 1LEDA 1LU1A 3LCPA 2ZGRA 2ZGMA 4Q8KA 3INAA 2SLIA 3BRFA 4P9YA 1V6VA 3SITA 4G6JA 3UD8A 3N0KA 1LESA 1LODA 1Q8PA 5DUVA 4LO7B 3C9ZA 3WG1A 2D6PA 4LBJA 4X3AA 5FNWA 1MACA 3AKFA 1TEIA 3CRIA 3T1MA 1K5UA 3VKLA 3UD9A 5DUXA 4QBVA 3I29B 1S0GA 3AKGA 1LOBA 3ILRA 4EFQA 1HIBA 3NV4A 2WLQA 1A8DA 3CA5A 2JECA 3AK0A 1FGAA 1XYFA 4X38A 4FGFA 3BAUA 3POSA 1GZ9A 2R9KB 5BXPA 4WV8A 4YGCA 5DG2A 4DENA 2ARXA 2A6YA 4FPKA 1LOAA 4M3CB 4ZFWB 3AXEA 4PBOA 3O5WB 2ZA9A 4YZ3A 2ZGTA 4Y22A 5CAZA 1AF9A 1Q03A 2ZQOA 3WHTA 4EKXB 1NLSA 1JW6A 1GANA 4FOYA 4I1BA 1DJSB 2NZ9A 2PHXA 5AVAA 5DZEA 1G9BA 1APNA 4ZBVB 1DQ2A 4LO1A 2A75A 2LTNA 5JOYA 5JOWA 4I4QA 4FOQA 3MALA 1MS9A 2EXKA 3M3CA 2FDBM 4UW6A 5E89A 1G86A 3HMYA 1OQLB 1AVAC 2ZGPA 1YI7A 3IM0A 5FZUA 2A5ZA 1G9FA 3FJEA 4LBNA 1DFCA 3A07A 4LO3A 1LOGA 2E53A 3L2YA 2Q3NB 2A6ZA 4ENDA 2D6OX 1WD3A 2AUYA 3FJJA 3UJ0A 4DRVA 3V0BB 1IILA 3AH1A 1LULA 4A7YA 1S0LA 3VT0A 3ZYPA 4R9BA 4LO0A 5CNAA 3Q7YA 4BM8A 3AYAA 4I4RA 3NV1A 1W0OA 4ZFUB 3AP9A 4ATEA 1W6NB 2JD4A 3I8TA 5FRAA 1HKDA 2VLCA 4LBQD 1HWOB 4ATFA 4WVWA 4Q9GA 2DUQA 1WW5A 4XE9A 1SCSA 3LSEA 4YM3A 4XJAA 1J0SA 4OZXA 1JY0A 1PZ8A 4XZPA 4HJJA 3APBA 1JT3A 3BA4A 1OKQA 1ULDA 1N3QA 3O0WA 3UJOA 3MW3A 2AGSA 2D7FA 1DLLA 2GMEA 4YZ2A 2DVBA 4FPFA 3QCWA 5GLTA 2A3WA 4ZLBB 1AX1A 4PBPA 4PC4A 1LEMA 1IHKA 4XTPA 3TAYA 3BOPA 3AZXA 1UKGA 1VLNA 1YBIA 3UJQA 1JT4A 1N1TA 1BA7A 2MIBA 1FAYA 1UL9A 4G6MA 5BXTA 4AN7B 5BQUA 2W39A 1ULGA 4GALA 6I1BA 1I1BA 4OWKA 3LTQA 31BIA 2WNEA 3H6QA 1M2TB 2GMPA 4AGRA 1O4YA 1BJQA 4XTMA 1MZ5A 4DS0A 5HPZA 1QDCA 3VT2A 4ZOTA 1ONKB 3BADA 2X2TA 2VXRA 1SLTA 3IAGC 3BRDA 5GLZA 5DUYA 2FGFA 5LK5A 4IZXA 4DFSA 1GV9A 4P0KA 3CA4A 3V0AB 3N7MA 5T55A 3BAVA 1CN1A 3CRGA 3SNVA 1FN0A 8I1BA 3KQRA 4BMEA 3RTIB 4I4XA 1LGCA 4QD2B 4K21A 5IK8A 4CRQA 4XMAA 4OW4A 2Z48A 3ZXEA 1GNHA 4YW5A 1HWMB 3HSMA 1PZ9A 3OJBA 3A0KA 1CJPA 3O4BA 1TFMB 1MVEA 4LBQA 1BFGA 3KM5A 1AXKA 3UL2A 4M00A 2ZGLA 2ZZJA 2YMZA 2P3IA 4FPGA 1G9AA 3U4XA 1RY7A 4J23B 1VCLA 3JUUA 2ERMA 1WBLA 4K1ZA 1RZOB 4Z9WB 1JTCA 2CL2A 3RMXA 1KJLA 1YTOA 5F8WA 4YM1A 1R8OA 3FUOA 2Y9WC 3AZZA 4P6AA 1N3OA 4XMIA 1LHNA 1EVTA 3ZC9A 1QDOA 1LENA 2UU8A 1K5VA 3RQ0A 2Q9XA 4OUJA 4JRAA 2EXHA 1H30A 4W65A 3MW4A 4Q1PA 2W08A 1IS6A 1SBFA 3C2UA 4P9WA 3TC2A 1C1LA 4Y1YA 3WDWA 1DQ6A 4TYSA 2BEAA 1YYNA 4M3CA 1JN2P 4I8MA 4XJ9A 1Q8OA 2F8XC 1AVXB 4Z8SB 2EXIA 4QC4A 1MS3A 2E4MA 2IWTB 2JE7A 2DU0A 1DQ5A 2WQZC 4YZ1A 1C4RA 3WCSA 1WBCA 3JUTA 1Q56A 1DBNA 1SLAA 3AP5A 2TEPA 3N36A 1GNZA 3AJ6A 1KDMA 3JU9A 4J2YA 1CVNA 2VY0A 1B09A 2Q5TA 1QNYA 3V65A 2RSTA 4JPZA 2W52A 4Y26A 3IKWA 4YOLA 1VAVA 4GOYA 3UK9A 2F2FC 2GNBA 3CA6A 4HR6C 1W6PB 4K1YA 4I7IA 1QQKA 3FJHA 1AVWB 1V6UA 4ZKTB 1LTEA 3AYCA 3VKOA 3I2XA 4X39A 1SBEA 4XFUA 1YO8A 4G9NA 1SLBA 3V0BA 4R9DA 2ZGOA 2UWBA 4XDQA 2ZGKA 4XYXA 1UZZA 2J3PA 1MS1A 3CA1A 1NZKA 1MC9A 2ZHMA 1LECA 3ZXDA 1Y7BA 3F62B 1G9CA 1ULEA 3WUCA 4XFSA 1TWEA 5IT6A 1WW4A 1AFCA 5T54A 2R0FA 2Y9GA 1V6JA 5SV8A 2K4AB 3AZVA 1GSLA 2D6LX 1LOFC 2CYFA 4DCKC 3FJAA 1UZYA 4AVVA 4BLIA 1KRIA 2C9AA 4TZDA 1OFSA 3CRHA 4Y24A 2V5YA 3RG0A 1RITA 3N7KA 3AJYA 4GAFA 3OGFA 4YFZA 3BTAA 3CU1B 1W0PA 4EFPA 1WD4A 2EAKA 3CAHA 4IONA 4FPCA 2R1DA 4BMBA 4NO4A 1N1SA 4GP3A 3AXDA 4KBBA 1JOJA 3AZWA 3WHUA 2E7TA 1HWPB 2A3YA 3WINA 4LBQB 4YGEA 3K1XA 1LHWA 3CQAA 2UURA 1JLXA 4ISRA 1DIWA 2GO2A 7I1BA 1S1AA 3BODA 1DQ1A 3FJFA 1H9WA 3OJVA 4JC1A 5GAQA 2AXMA 4YG0A 4HANA 5DG1A 2P2KA 2ZMKA 2PHRA 4UW4A 3WVJA 4L8QA 1MS8A 2R0HA 2D20A 4QBCA 2WT1A 5BP5A 2KLLA 3CA3A 4FP3A 1I1EA 5EG6C 4Y1UA 2AYHA 3WLUA 4BLJA 3FGMA 3V0AA 4FPYA 1E0OA 1ISZA 2DWRA 2NN8A 1DYKA 3D6EA 3OYWA 1W6MA 4YM2A 3LSDA 1AXMA 1EYLA 5F5QA 4Q91A 4I4VA 2DVAA 4J2XA 3POYA 3R4UA 2GMMA 2DREA 3WO3A 1ENRA 1H9PA 4HA2A 1CPNA 1JUIA 1URXA 3T1LA 4OEEA 5BXSA 2NMNA 4M01A 1L2HA 2QYIB 2ERFA 1BFCA 1PUMB 2AR6A 4RA0A 4OWLA 2KH2A 4DQAA 3AP6A 3WMUA 5IK4A 1AZDA 2PHUA 3H6SE 3O0XA 5GLUA 1W3AA 2ENRA 4I4YA 5G00A 4C1WA 4LO1C 5GM0A 5FZYA 4J2SA 3OY8A 4OEFA 4L4HA 3BA5A 1FYUA 1SLIA 4LO3C 2KI6B 3ZXFA 3BIWE 3B9UA 1AXZA 1P63A 2Y9FA 4UW5A 2KM2A 4LO0C 3MW2A 4YW4A 2VU9A 2E6VA 4JAWA 1IT0A 4CTEA 4Q8LA 4EB2B 1GYKA 3B01A 1WW7A 3ASIA 3DUIA 1ONAA 4FPEA 4ZFYB 1N1VA 5T5JA 3WG4A 2D6NA 3KMVA 4ITCA 2HW9A 2K43A 1QOSA 2CWMA 3AFKA 2D7IA 4Q27A 4GKXA 4PCRA 1MR5A 1M16A 2DTYA 3SLIA 1DFQA 1GZWB 4QO3A 4YFWA 3WDYA 3WDVA 1MS5A 5BXRA 3MPPG 5H9SA 4Q9PA 1W6PA 1W3GA 4JKQA 2P34A 1X50A 4LO2A 4OWJA 4FOVA 1RIRA 3AYEA 5F8SA 3AH2A 1FX5A 3VV1A 4I96A 1GKBA 5BQUC 3GNEA 1GLHA 3PG0A 4K20A 1JT7A 4QKRA 5BYNA 3PVNA 4XJUA 3HBWA 1AXYA 4YW1A 2GN7A 3ENRA 3B9CA 2VUAA 4I4PA 3NBDA 2P3KA 5E88A 4Q1RA 1FATA 1QOTA 3ZSKA 3NJ5A 1PUUB 1QNWA 1WW6A 1WLCA 3TB0A 5CA6A 5GZFA 3AP4A 2FHRA 1SZ6B 1DZCA 1RINA 1W3FA 1S0BA 2OW4A 1JLYA 1PWAA 1ISVA 3AJZA 5DZGA 4RL7A 2RG9B 4OEGA 1V6XA 3ZSJA 2ZGQA 3QR5A 4KC3A 3WCRA 3AKIA 2H0BA 1HDKA 3ZSLA 1Z0HA 1GBGA 3ZX7A 3P53A 1LHOA 3OYWB 3WUDA 5BVPI 1W6MB 4I6IA 4XBNA 3BRGC 3NWKA 5DZUA 1LJ7A 4XHBA 1JXNA 1O4ZA 1GICA 2FFVA 3HOMA 4GWMA 1AJOA 1ABRB 3GALA 4XBLA 4R6UB 2G4IA 2LIEA 1S0JA 1IKQA 1F5FA 5DVHA 21BIA 3O0VA 4LO7C 1SR4A 1SLLA 5EC5A 4ZXKA 3DGTA 5GLWA 2WBCA 3T8SA 5GZDA 4Y20B 3N7JA 5E8AA 4FQZA 1W6OA 1JHNA 2RQ9A 2L5XA 4ZA3B 1S0DA 2PHFA 4USPA 3OY8B 2GN3A 2CNAA 3I2AA 3NV2A 4LBMA 3ATGA 1FWUA 1HCEA 3B69A 2ZMLA 4WBCA 5DUWA 2OUJA 4XILA 3PMEA 2ZGUA 1V6LA 4I4SA 2YXSA 2ZHLA 2ZKNA 2I2SA 1GGPB 2R16A 4EEEB 2MLLB 3WG3A 3OJMA 3OPZA 2RHPA 2D22A 3M1HA 3HR9A 3FUQA 2E4MC 2M49A 2FO1A 2YUGA 2D3SA 2C5DA 5I1BA 1S0FA 3IPVB 5F8YA 5HCAA 1WCSA 1DQ0A 2I1BA 4U36A 1OQ1A 1FQ9A 5EXOA 4GWNA 3O12A 4JKXB 4CZSA 5T52A 3ZXJA 3VSFA 3D4KA 1MS0A 5F9TA 3PVEA 5CBLA 3AH4A 2BEBA 4DPNA 4G9MA 2ZR1B 3LLPA 3S8KA 1FWVA 1LGNA 2XB6C 1QKQA 3O4DA 1DYPA 2KKIA 1IS5A 2DVGA 4KEJA 1ISXA 1V6NA 3QYDA 2CTVA 3IIRA 3VKMA 3BB2A 3FJBA 2WRYA 5D62A 1CESA 3H0OA 3VSZA 2D3RA 3ZSMA 4H9WA 1MVQA 1D2SA 4U2AA 4GKYA 1LHVA 3FBYA 4J2KA 5JDBA 1F9KA 4II0A 1C57A 2DUPA 2DRYA 3IM7A 5CB7A 4YGDA 5JMCA 3POKA 3A21A 2D24A 4F34A 1S0IA 1FV2A 5BOWA 4BOWA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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