3AZWA

Crystal structure of the receptor binding domain
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
427
structure length
418
Chain Sequence
NEYFNSINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYWFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural and mutational analyses of the receptor binding domain of botulinum D/C mosaic neurotoxin: insight into the ganglioside binding mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords D/C mosaic neurotoxin
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 86
structure length 418
sequence length 427
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3azwA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3azwA02
3V0AA 4R9DA 2BEAA 1A8DA 1WW6A 2DUQA 4Q91A 4Q1RA 1G86A 3O5WB 3ZX7A 4YG3A 3WG3A 4G1RA 1W0PA 1NLSA 2A6YA 2DS0A 3WCRA 3UD8A 5CB7A 4M00A 2NM1A 1RG8A 1HWPB 1EPWA 2PHWA 1R8NA 3UJ4A 4I4SA 1I1BA 3PHZA 2ZKNA 1IRPA 1LHOA 2FFUA 4ZKTB 4J23B 2AREA 4HANA 3FJAA 1S0FA 4K21A 1GNHA 4JC1A 5G00A 3GNEA 3W9TA 1V6KA 1WW4A 2DVGA 4FQ4A 3IMNA 2XB6C 5DSSB 3UJQA 4LO7C 4H55A 1BLAA 1PZ8A 2ZHMA 4Y1YA 3CRIA 4K1YA 2ZGQA 1SR4A 1F31A 1JLYA 1QNYA 2AGSA 1W6OA 3IPVA 1G82A 5DZFA 3OGGA 1PUMB 3AXEA 3FJDA 2FHRA 1FNYA 4NOTA 3AP4A 2SBAA 1LOAA 3N36A 4FPJA 1JW6A 1AX0A 2AR6A 1DZDA 5BQUC 1CVSA 3EF2A 2NP0A 3PVOA 3H6SE 3USUA 5T5JA 5DUVA 2YZ4A 3RQ0A 1W3GA 5GLWA 2DVBA 1IOBA 1CJPA 4YOLA 3AYAA 1WBLA 1SFYA 1BFCA 1Z2VA 1WCSA 4F83A 1BASA 3A0NA 4LBLA 4R9AA 3TB0A 4TYSA 3OY8B 1WLWA 2ZBJA 3GALA 1IS3A 1VIWB 3B3QE 3WVJA 1WLDA 3CA1A 3ZXDA 2FDBM 3UD7A 3NJ5A 1WD3A 3FLPA 3O0XA 2ZGRA 4KBBA 3T2TA 1QOSA 1TTUA 2VXRA 4OW4A 3WMUA 1AXZA 1LESA 4FPHA 4XXAA 1C57A 5IK5A 3UK9A 3SNVA 4Y1VA 3BRDA 1HCDA 1XHBA 1Z78A 3ZXKA 4ZFYB 1AJKA 1CVNA 3WINC 2YXSA 4FPFA 1QU0A 1JLXA 2P34A 2EXKA 5H9SA 1VALA 1NUNA 3WG4A 4YM3A 1GANA 2P23A 2F8XC 2K43A 3RSJA 1QDCA 2GNBA 5EC5A 2GO2A 4LO3C 5DVHA 1N1YA 2D6MA 1HWOB 4GWMA 1YBIA 1QNWA 3HBWA 3FLRA 1Q8SA 4X39A 4XFTA 2DTWA 1TP0A 2UU8A 5F8YA 5JVVA 4LBJA 4Q26A 2H0BA 1W6PA 2DWRA 3N7MA 2WT2A 1AVWB 1W6NB 1HDKA 3ZXLA 3ILAA 4LO8B 1SACA 5BP5A 4LBQA 1G7YA 5BYNA 3CA6A 2NTDA 1IT0A 1LODA 4FPLA 1O4YA 1AJOA 4P0KA 2R0FA 4XJWA 2FGFA 2LTNA 4ISQA 5E88A 3CRHA 5IK4A 3AXDA 3KQRA 2AQZA 4BMEA 3M3OA 4DRRA 2ZGSA 4YGEA 3NBDA 3CA0A 4Q9PA 1QDOA 2AAIB 4HR6C 3APBA 1W6QA 4FPCA 1AVUA 2E7TA 4YM0A 5GJ6A 3B01A 4BM8A 2ZABA 2A3YA 1GZWB 4WZFA 4AN7B 1YTOA 5EG6C 1MVQA 5H9QA 4G6JA 1BFGA 5E24E 2D3PA 4LO1A 4HL0A 1UL9A 2ZQNA 2W08A 1N3PA 5JMCA 1UAIA 1D0HA 1Q8PA 1RY7A 1IKPA 1IS4A 2ZGUA 5T50A 3IKWA 2D6PA 3HSMA 4LO0C 1SZ6B 3Q9OA 4EFQA 2PHFA 1PZ7A 5H9RA 2V73A 1ITBA 4YG6A 3AZYA 2F2FA 4I4VA 3AJ6A 1SBEA 1FWVA 4AGGA 4Q9GA 4JRAA 2X2SA 4F34A 5T52A 4XMIA 1ULFA 5SV8A 3NBCA 3SITA 3NV3A 5IK7A 3FFZA 3RRDA 2K4AB 2GNMA 1F5FA 2EXHA 3VKOA 4AN6A 1OFSA 3BRGC 2R9KB 3M3CA 4FPEA 2YUGA 1F9KA 3AKGA 4AYUA 1APNA 3CA4A 3OJVA 2MLLB 1V6UA 3ZC9A 2D6OX 4PC4A 2D20A 3BODA 4M3CA 1D2SA 3FJIA 1IKQA 3T8SA 5BQUA 4YZ5A 4GWNA 3C9ZA 2LIQA 4YM2A 4EKXB 1KDKA 2ESUA 3CA5A 2XOAA 4M3CF 4OZXA 2BQPA 4GKXA 4I30A 2ZMKA 1AXMA 3I2XA 1W6MA 2AFGA 3ZXEA 2CY6A 1EYLA 1ONKB 4H9WA 4QD2C 3E8LC 3W58A 3BRFA 2UUSA 1JYCA 5JOWA 4P0LA 3AK0A 1Q56A 4BLIA 4IONA 4FP2A 3HR9A 1DZQA 4W65A 5D63A 3WV6A 3AP7A 3RMXA 3OGFA 5KXEA 1MS1A 3ZVXA 1O4ZA 4G6MA 2OVUA 5GALA 3CRGA 3JUUA 4Z8BA 5T5OA 3F1RA 1DQ0A 2JECA 1FX5A 5GAQA 3WHTA 2E4MC 4D69A 1TOOA 4L4HA 1WUVA 1DYKA 3O0VA 2AENA 4FOQA 3WNXA 2V5YA 1I1EA 3N0KA 3WDWA 2GNTA 4I0YA 3FJCA 2GN7A 4PF5A 4LO2C 4C1WA 2CWMA 2K8RA 3FJKA 4I3NA 1G9DA 2X2TA 4BMBA 2GNDA 3N7KA 3R4SA 3WLUA 3WDUA 4YW1A 1DBNA 2SLIA 4ZFWB 1X50A 3OJMA 1UN1A 5B2HA 3C2UA 1UKGA 4FGFA 3NV2A 2NMOA 5BVPI 1Q04A 2W39A 3VEQA 3S8KA 1AXKA 2JJ6A 5D62A 4Y20A 1KQRA 2R1BA 5KXBA 2WKKA 3BA5A 1AVXB 1W6NA 4I96A 5BXPA 1NXD1 1QQLA 3RTIB 3H6RA 3VWCA 2DTYA 2EXJA 2D24A 5E89A 1FMZA 4XE9A 2DV9A 2VU9A 7I1BA 3FJ9A 1CN1A 1QF3A 4ATFA 1BXHA 5DXDA 4GXLA 2GALA 1V6NA 3BAOA 1V6LA 4P9XA 1ONAA 2A6WA 5LK5A 4GA9A 4ZBVB 4I4UA 3LCPA 2DRYA 1HQWA 4LO1C 1PZZA 1ISWA 3INAA 3HALA 1LOBA 3WCSA 4XJ9A 4LO0A 5CAZA 5HCBA 1WW7A 1SLLA 5GZGA 1MS3A 4Q8LA 2P3JA 1GKBA 3ASIA 3I8TA 3K1XA 4ENDA 3SISA 3P6JA 1BLDA 2ARXA 4Q1PA 1JUIA 4I4QA 3ZPYA 3PVEA 3A4UA 1IOAA 2HW9A 1ULCA 1JT5A 1ENSA 1Q8OA 2F2FC 4H04A 2DUPA 1LOCA 3N3HA 3KMVA 4QC4A 5GZDA 2R49A 3NV1A 1AF9A 2ENRA 3OYWA 1EVTA 4YM1A 1GICA 4I4XA 3U4XA 2ZQOA 1RINA 2VUAA 5CBLA 1YI7A 1TWMA 4CJMA 4K20A 3BA7A 1S0DA 5E8AA 3BAHA 3AYDA 1Q8QA 1DQ5A 4I2SA 4GAIA 4FP3A 3POSA 2UWAA 4JP0A 3OPZA 3JUTA 3BOPA 4HA2A 1DFCA 2P3KA 2UWBA 1LU2A 3JU9A 4XJUA 2DVFA 3ATGA 1LOFA 1QOTA 4WVWA 5GLZA 1HIBA 1MR5A 1Z0HA 3ILRA 1LEDA 4Y26A 2JDZA 1MC9A 1DYPA 1G9CA 2G4IA 1AVBA 3CQAA 2WQZC 3SH5A 2LIEA 1MZ5A 5HPZA 2ZHKA 4YFWA 4FOVA 2JD4A 4J2SA 3VT2A 1Q1UA 4L4IA 1FQ9A 5CNAA 3AP5A 4CTEA 4Q8KA 3QR5A 4YW3A 4Y22B 1AVAC 4GAFA 4DCKC 3B69A 2VLCA 1R8OA 1CIWA 4J2KA 1UX6A 1Q8VA 1JY0A 1OKQA 4XTMA 2E4MA 2E51A 1ISZA 2ZZJA 1LCLA 4DEPA 3UJ0A 1BYHA 4XKIA 2GMPA 3AX4A 3ZSMA 3IN9A 4QBVA 2R0HA 1GBGA 1WLCA 4XJAA 4G9NA 4YFZA 2A5ZA 3WA1A 3R05A 4CRQA 1FAYA 4LO2A 2HZ9A 3O0WA 1LGCA 4I4OA 2A7AA 4LBKA 3T1LA 1VCLA 3VUOA 4FOYA 3MEPA 4RA0A 3OJ2A 2DUOA 2Y9XE 3IM7A 3P53A 2WSUA 3H0OA 1CQ9A 3WDVA 2JE7A 1MZ6A 2DVDA 1CESA 4WBCA 2C9AA 4ZLBB 4JKQA 3MW2A 3AZVA 2I2SA 2GMEA 2VSEA 1JTCA 1GZCA 3SH3A 1S0BA 1C1LA 4BQ1A 4Q2FA 4YGCA 2FO1A 1IS5A 3O5SA 3RG0A 1JOJA 4DPNA 3N35A 2D6LX 3ZXFA 3MALA 4WV8A 4PBOA 1C4RA 1S0LA 3Q7YA 2MIBA 4DENA 2VY0A 1DGLA 1IRAX 3CAHA 4AVTA 1BZWA 3V0AB 2YROA 1RZOB 2R16A 1G9AA 3WHUA 3HN1A 3LSEA 3M3QA 5GLUA 3LLPA 4OWJA 4IHZA 1RMLA 3AZWA 3N7JA 1IHKA 1M2TB 1BQPA 3O4CA 1TWEA 4ZFUB 1N47A 2XG3A 4GP3A 5AVAA 2B7YA 4Y1UA 3AKHA 3PUBA 4USOA 3M3EA 1AX1A 1W0OA 1T9FA 1JBCA 3HOMA 2Q5TA 1A78A 5FZZA 3UL2A 1XQNA 4J2YA 1ISXA 2ZGPA 2D7IA 2WJSA 4DQAA 1ISVA 4C1XA 2R1DA 3IM6A 3MW4A 4JPZA 3N7LA 1S0CA 1Z4SA 4EEEB 1WBAA 2PHUA 2D6NA 4ASMB 2AYHA 1VAVA 2BFHA 3AJZA 1W3FA 3RS6A 3RMYA 5DZEA 8I1BA 5DUUA 2RQ9A 3MW3A 1L2HA 1LENA 4I4YA 3O4OA 1FV3A 1JT3A 4A7ZA 5GZCA 1W6OB 2VW1A 4A7YA 1JN2P 1J0SA 4I1BA 1YRZA 5F8WA 3P6IA 3POKA 1KJLA 4P0JA 1WW5A 5JDBA 5BXTA 2YMZA 3USUB 1H9PA 2P2KA 1KNMA 4LBOA 2JKBA 4XYXA 4NO4A 1LOFC 4UW4A 2VSAA 3OBRA 3AJ5A 4LBNA 1WD4A 3AKIA 4UW5A 3Q7XA 1JT7A 4GOYA 4CZSA 4IQPA 5EYXA 2ZA9A 3QYDA 3OJBA 2ZAAA 2ZGTA 2CNAA 5GLVA 4I7IA 1SBFA 2Y9GA 3VV1A 1N3QA 5JOXA 1W3AA 3HMYA 3NBEA 2Z49A 4II0A 1SLCA 1AXYA 1H9WA 3IM5A 3OY8A 1ABRB 3WOGA 1C1FA 1ENRA 3VKMA 2WSVA 1GZ9A 1V6MA 1URXA 3LTQA 4YW4A 2ZGKA 4Z9WB 2HYKA 2VW2A 4Q27A 2EIGA 2BEBA 2ET2A 4I37A 1TIEA 3O44A 1S1AA 3NV4A 3TC2A 1YO8A 2C5DA 3ZYPA 4R9CA 1FNZA 3O3QA 2CTVA 6I1BA 4YZ4A 4UW3A 2FMDA 3A23A 5EHAA 3AFKA 2KI4A 2KI6B 1CONA 1UZZA 3R4UA 5BXSA 5F8SA 4P6AA 1BFBA 2PHRA 4OWKA 3FJ8A 1G8WA 2NZ9A 1J1TA 1SLTA 4Z8SB 4MYEA 1W6PB 3VKLA 2A6ZA 1TEIA 4OEEA 4GKYA 1XG6A 4R6UB 1QOOA 3NBNA 1RITA 2WLQA 3ZC8A 4BPZA 1DLLA 3WO4A 3VKNA 4FQZA 2DU1A 3T1MA 1PZ9A 1JT4A 3AH4A 1DFQA 3PVNA 4XTPA 3FBYA 3VKFC 2DVAA 3W59A 2ZR1B 2AH2A 3D6EA 1ILR1 3VSFA 3WG2A 3FGMA 3QCWA 2E53A 5DG2A 5T5LA 5DG1A 1GGPB 4QO3A 2D1ZA 1W6QB 3FLTA 2Q9XA 4I6IA 3DUIA 5EWSA 1PUUB 2W52A 1V6IA 1B09A 1KITA 1LOEA 3JRRA 3FUQA 1IILA 1E0OA 1DQ4A 4AVSA 1IJTA 4BLJA 1OQ1A 1P63A 3BAVA 1LHVA 3WO2A 2QYIB 4I4RA 1FATA 1LHWA 1GZWA 1N3OA 1JXNA 3MPPG 1HWMB 1XZZA 1S0IA 1CE7B 1QMJA 2Z42A 1JQZA 1LECA 3BTAA 4KEJA 2WT0A 2GN3A 4YGDA 3BAUA 3IM0A 4LO7B 3I4IA 1I3HA 2OW4A 4EB2B 5BXRA 1GV9A 3CU1B 1FYUA 4X38A 4UW6A 2VH9A 3ILNA 2D44A 1FGAA 1KRIA 4JQ0A 2IHOA 1FV2A 3V64A 1DQ2A 4GOVA 4Y1XA 4USPA 1BARA 4XFSA 4DFSA 4JKXB 2QN4A 3V79C 1PC8B 3NWKA 5DZUA 1BKZA 2WRYA 5F9TA 21BIA 3LSDA 1AX2A 1ULEA 3O4AA 2VW0A 4M3CB 3Q7WA 3VT0A 1PWAA 3D7WB 4PQ9A 4X3AA 4XBNA 1N4KA 2DRZA 1G9BA 1KJRA 2ZACA 3V0BB 4M01A 2YY1A 4XJ8A 3WZ1A 2D7RA 2TEPA 2OUJA 2E7QA 1W6MB 3F62B 3POYA 4YW5A 4EFRA 5DZGA 1HKNA 4XBQA 2LALA 1LHUA 5HCAA 1N1VA 4OEFA 1S0GA 1A3KA 5GZEA 1T4QA 2P37A 3ZSKA 1LGNA 1ULDA 1DHKB 1ISYA 2KM2A 1HWNB 4ZXKA 2UWCA 4YZ3A 2DU0A 1M16A 3QLQA 1BJQA 3UJOA 1LGBA 5IT6A 1R1ZA 3BAGA 2D3RA 1V6XA 5IK8A 3FJJA 4RL7A 3H6QA 2CL2A 1MD6A 3FJBA 4IZXA 1V6WA 1QXMA 1XYFA 1MACA 1UPSA 2ERFA 2Y9FA 4IZEA 3WUDA 1RIRA 4PBPA 4GALA 4XJZA 4D8HA 1BA7A 1HCEA 4YGBA 3M1HA 1JHNA 3POWA 1BFFA 1VAMA 1V6VA 3O4DA 1FWUA 4ATEA 1Y7BA 5IUQA 4YZ2A 3AP6A 2A6XA 4I8MA 2PELA 3AYCA 4XILA 4AGVA 3PG0A 5D61A 2A75A 4XXPA 3WMVA 5DUWA 3D5OA 5KXDA 5GZFA 2Z48A 5FZYA 1LU1A 2ZGNA 1SCRA 1DQ1A 1N1SA 5T5PA 4AGRA 1CPMA 1N1TA 1IS6A 4AWDA 4ITCA 4JAWA 3ZYRA 2NYYA 2EF6A 1GYKA 3B00A 1K5VA 1GLHA 2EAKA 2W68A 4IYBA 2ZGLA 5DUXA 5EXOA 4Y20B 4I1EA 1YF8B 4QBCA 5FNXA 1GSLA 1ULGA 2M49A 4FPGA 3BAQA 5L73A 2VXTI 1DQGA 4XFUA 4AVVA 3H6RB 2WBCA 1KDMA 2Y9WC 5F90A 3V65A 3AP9A 3OBTA 1MS8A 2GDFA 3DGTA 1V6OA 1Q03A 1FN0A 3D4KA 2YV8A 5T54A 5FNWA 1H30A 2NVHA 1OQLB 2DURA 1WBCA 1GNZA 4XZPA 4ZA3B 1MS0A 2WT1A 2NMNA 4KEKA 2RG9B 1S0EA 4GP0A 3WDYA 4SLIA 4TLPA 2HWMA 3AKFA 3FJFA 2UURA 4D0TA 4A7KA 2P39A 5JOZA 31BIA 5DUYA 1QGLA 4ZGRB 3CNAA 1U0AA 1ZM1A 1LULA 2DREA 1DZCA 2A6VA 4IY8A 4FVVA 3CA3A 1LTEA 4OUJA 4M3CE 2RSTA 4L8QA 3VT1A 1AZDA 2ZHNA 5BOWA 4FOWA 2GZBA 4XIOA 4EFPA 2E6VA 3AJYA 2KLLA 3OYWB 3B9UA 3M2MA 3RTJB 3WDXA 3FJEA 2L5XA 5EYYA 4ISRA 1QKQA 1CPNA 2AUYA 1DJSB 1ZA4A 5F5QA 3KM5A 4DRVA 4QALA 3IPVB 5JLVA 4I4PA 2EXIA 5KXCA 3ZSJA 2CYFA 3ZSLA 1WBFA 3BB2A 5FRAA 1G9FA 1SR4C 3B9CA 2ZMNA 1YYNA 1LHNA 2I1BA 1AFCA 5GLTA 4XMAA 3ENRA 3WO3A 4HJJA 2P3IA 4ZOTA 2OUHA 1SBDA 3ZXJA 4D0ZA 4QD2B 5T55A 1MS9A 3BIWE 4QKRA 4YLZA 1HKDA 3ZXGA 3V0BA 3A21A 2RHPA 2MC2A 4PCRA 2WNEA 2Q3NB 3WDTA 2J3PA 1K5UA 4U36A 3WG1A 1YIFA 3AZXA 41BIA 1NZKA 3IAGC 4LBMA 3AH1A 1SLBA 4LBQD 5H9PA 3BX1C 1MVEA 4OEGA 2CWSA 3WUCA 3TAYA 4YW2A 1YXWA 1V6JA 4JCKA 4QKSA 4P14A 4J2XA 3IIRA 3BADA 3AZZA 1SLAA 2AXMA 4Y22A 4IY9A 4WVVA 2ZMLA 4FPYA 1FMMS 2D43A 5CA6A 3L2YA 5FREA 1SLIA 4YG0A 1MS4A 2ERMA 2NN8A 4U2AA 3BA4A 3FJHA 5JOYA 3WINA 4XBLA 1LEMA 4R9BA 1JYIA 2D7FA 3PMEA 1HLCA 2GMMA 3SLIA 3AYEA 3UDAA 3UD9A 4P9YA 2DYCA 2ZHLA 1DQOA 3A07A 1HQLA 3A0KA 3AH2A 5FZUA 2A70A 4P9WA 2D3SA 2D22A 3FUOA 4K1ZA 2ES3A 4XDQA 4Y24A 1CR7A 5I1BA 3I2AA 4LO3A 2ZGOA 5HCFA 3O4BA 1QQKA 4KC3A 4Y1ZA 2IWTB 4XOGA 4DS0A 3I29B 1EV2A 2D23A 4LBQB 2A71A 3PJQA 4XHBA 4OWLA 1DIWA 2HWAA 5GM0A 1LOGA 2D6KA 9ILBA 3SNMA 4TZDA 3ILFA 3SH4A 1VLNA 2PHTA 3A22A 3VSZA 2A3WA 1UZYA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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