3RMXA

Crystal structure of hcr/d f1240a mutant
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
415
structure length
404
Chain Sequence
NSINDSKILSLQNKKNALVDTSGYNAEVRVGDNVQLNTIYTNDFKLSSSGDKIIVNLNNNYENSSVSFWIKISKDLTNSHNEYTIINSIEQNSGWKLCIRNGNIEWILQDVNRKYKSLIFDYSESLSHTGYTNKWFFVTITNNIMGYMKLYINGELKQSQKIEDLDEVKLDKTIVFGIDENIDENQMLWIRDFNIFSKELSNEDINIVYEGQILRNVIKDYWGNPLKFDTEYYIINDNYIDRYIAPESNVLVLVQYPDRSKLYTGNPITIKSVSDKNPYSRILNGDNIILHMLYNSRKYMIIRDTDTIYACSQNCVYALKLQSNLGNYGIGIFSIKNIVSKNKYCSQIFSSFRENTMLLADIYKPWRASFKNAYTPVAVTNYETKLLSTSSFWKFISRDPGWVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Novel Ganglioside-mediated Entry of Botulinum Neurotoxin Serotype D into Neurons.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type D
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 89
structure length 404
sequence length 415
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-04-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3rmxA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3rmxA02
3SISA 1YO8A 2JKBA 3POWA 1BFCA 2A3WA 4OUJA 2E7QA 4G6JA 3N7JA 3USUA 3ENRA 1JBCA 4DENA 2Y9FA 4GKXA 4PC4A 3WG1A 1R1ZA 4AVSA 2A3YA 1ULGA 3N3HA 3M3OA 3CA1A 1JXNA 1EVTA 3L2YA 2GNMA 2FMDA 4DFSA 2VW0A 2D6OX 3CA4A 4SLIA 9ILBA 5FRAA 1V6UA 2ESUA 1D2SA 4YFWA 1GNHA 4II0A 1N3OA 3ZSLA 3ILAA 3TC2A 2E6VA 1T9FA 4R9DA 4I4VA 5BXPA 3I29B 4GKYA 4NO4A 1XZZA 1Z0HA 4XHXA 1LOAA 2NMNA 1ENQA 2D7RA 4XFSA 1DYKA 5SV8A 2A75A 3AYEA 4Y20B 4XJUA 1V00A 3SITA 2KH2A 4Y1UA 1AX0A 1YF8B 1VAVA 1DYPA 1GSLA 2W68A 1V6VA 4Q91A 4H9WA 3BAVA 2UWAA 2DURA 3V0BA 1VLNA 1RZOB 1DQOA 2NZ9A 31BIA 4Q8LA 3ZVXA 4I4PA 1QF3A 4I0YA 2GMMA 3O3QA 1RG8A 3FFZA 3W9TA 2AR6A 2E4MA 2A6VA 1WD4A 5H9QA 2A5ZA 1S0GA 4BQ1A 1QMJA 4YZ3A 5GLZA 3O5WB 1JYCA 1BJQA 2AGSA 1FGAA 1KNMA 5BXRA 3DGTA 2CTVA 2D3RA 3JU9A 2VXTI 5DUUA 4IZXA 3WDTA 3BA5A 2ENRA 1WBFA 4M3CE 5DXDA 2DUQA 3GNEA 1ZM1A 1FWUA 5KXBA 3AP7A 4FQZA 4AWDA 3UK9A 4OEGA 1W6PB 4I37A 3CA0A 4AGRA 4LBJA 4LO2A 4Z8BA 2Z48A 2ZGRA 1OKQA 2ZGKA 3N36A 3OJ2A 4C1WA 4LBLA 1SR4C 3AH4A 1CESA 5IK5A 1HWMB 4XIKA 5DUVA 2KI6B 1LHOA 5DSSB 2YMZA 1Q8PA 5EC5A 3O49A 2DTWA 3MW2A 1ULFA 1V6IA 2NMOA 3IM0A 1JN2P 1V6LA 4WV8A 3RS6A 5DZGA 5DVHA 3AZVA 5EHAA 5GZEA 4DPNA 3RQ0A 2EXKA 2D3SA 4LBKA 5HCAA 4YM2A 1QDCA 1A8DA 1JT4A 2WLQA 1OFSA 3B00A 4AGVA 3RG0A 4RA0A 3O4AA 2P3IA 3WHUA 3OBTA 3U4XA 4G9MA 3WG3A 3KM5A 1PUUB 3IAGC 3K1XA 1XQNA 4CRQA 4ZKTB 3VKOA 3M1HA 3QLQA 3VKMA 4YZ1A 1LECA 3JUTA 2AENA 1N3PA 3H6SE 3B01A 2YZ4A 2W52A 3UJ4A 1HKDA 3ZC9A 1IJTA 4YGDA 1J1TA 4EKXB 3CQAA 2ZHLA 1CIWA 3VT0A 1S0LA 3QYDA 4DRVA 5F8WA 2YXSA 4R9CA 5JMCA 1BFBA 1Q04A 1GZWB 2UURA 1WCSA 1VCLA 1W6QA 4LO0A 3PMEA 1QOSA 1L2HA 4DQAA 1ITBA 1IKQA 4I4UA 5IT6A 3CNAA 3CA6A 4I6IA 1JT7A 1SLTA 3FJBA 3BIWE 1DFQA 5BXTA 4Q27A 4WVVA 2LIEA 4XDQA 2ZMNA 3A0NA 4K20A 1CN1A 3VV1A 3IPVA 4JKXB 4QBVA 4I4SA 5F8SA 1CR7A 4Y1ZA 2D6KA 1P63A 1X50A 5JOZA 5GAQA 4QC4A 2ZGTA 3AXDA 3AJZA 3BX1C 4I30A 1W3GA 3AKFA 1W6MB 4XE9A 1QNYA 1W0OA 3N0KA 3UJOA 2R0FA 2JD4A 3DUIA 1JHNA 2ZAAA 2ZKNA 4XZPA 4KEJA 1TWEA 2PHFA 1DIWA 2D7IA 2UU8A 1G7YA 1S0DA 1W6OA 3APBA 3O4DA 5GZFA 4Y26A 1WBAA 4LO3A 4FPGA 3VSZA 5BOWA 3TB0A 2DS0A 2D44A 4I4RA 4XHBA 4MYEA 2LALA 3I2AA 1AVBA 5HCBA 1APNA 3UJQA 2KM2A 1NUNA 1E0OA 4EFRA 1AJOA 4YM1A 4A7ZA 4P0JA 2G4IA 3AH2A 4Q2FA 4XBQA 3WMUA 2LIQA 1ILR1 2ZMKA 4PBOA 4L8QA 1A3KA 2XG3A 2ZABA 1MS0A 2D6PA 4R9AA 4CZSA 1BLAA 2DUPA 1FV3A 3RSJA 4TLPA 1Z4SA 3WVJA 1BLDA 1V6JA 2DTYA 3O4OA 3WZ1A 3W59A 5T50A 3ZSJA 4UW4A 1HIBA 4GXLA 1W3FA 4I1BA 2W39A 4YW3A 3M2MA 2A71A 4LBOA 5FNXA 1WBLA 2VW2A 2DVDA 1NZKA 2DWRA 3SLIA 1SLLA 4XFTA 3OY8A 4I96A 2D20A 3T2TA 3NV3A 3WV6A 1S1AA 1MZ5A 3FJDA 5T5JA 1WD3A 1LGNA 1BFFA 1N1TA 4FPOB 1JUIA 2GNBA 5FREA 4XJ8A 3JRRA 3ZYRA 1I3HA 3C2UA 4XJZA 5F8YA 4OEFA 5DG1A 1S0IA 4TZDA 3BRDA 2DVAA 1PZ9A 3FJIA 2AREA 2JDZA 2ET2A 1LGBA 2AUYA 4I4XA 4ZLBB 1IOAA 2MIBA 5D63A 4HANA 3USUB 3MALA 5BVPI 1FV2A 1S0CA 2YUGA 1OQLB 1LULA 2GDFA 1AX2A 8I1BA 2DYCA 2EXJA 3BODA 5T5OA 1DZQA 3WUDA 1W6NA 2I1BA 1KDKA 3RTJB 3N7MA 4GAIA 4GOVA 3M3EA 2VSEA 1IS3A 2D22A 1LOFC 1BXHA 3P6JA 2VUAA 2BEAA 3WINA 1LHVA 1CPNA 3IIRA 4YGEA 1KJLA 2EXIA 4FPJA 1SFYA 2LTNA 1AVWB 4KC3A 4WBCA 2ZZJA 5AVAA 4U2AA 2AAIB 1H9PA 4EEEB 2RQ9A 1VAMA 3NBEA 4AGGA 3V0BB 1C1LA 4WZFA 3CAHA 4CJMA 1IS5A 3A22A 4Z9WB 5F9TA 1IOBA 2F2FC 2Q3NB 1G9BA 1LGCA 4XKIA 3H6RA 1F5FA 2SBAA 3RMYA 3BADA 2WT2A 1SLBA 3D4KA 2DVBA 4D8HA 2R9KB 4X38A 3WOGA 1VIWB 4W65A 2BEBA 1HCEA 4FVVA 3T1LA 2AQZA 1FNZA 4GP3A 5H9PA 1QQKA 2GMEA 4FOVA 1HLCA 4XJ9A 1O4ZA 5JVVA 1DQ6A 1BARA 4LBNA 1WW7A 1FMZA 4WVWA 1IRPA 4A7YA 1SLIA 2A7AA 1WW6A 4XOGA 2D24A 2NM1A 5KXDA 2DREA 5G00A 3HOMA 1N47A 1V6NA 3A07A 5EXOA 3OGGA 1AVUA 1DQ1A 1BASA 1W3AA 4QKRA 1LODA 4LBQD 1MS4A 2JE9A 3NWKA 5H9SA 4I4YA 2Q9XA 1HCDA 4LBQA 3IM6A 4OWKA 5EYYA 4I4OA 3IM7A 5EYXA 1ULEA 2QN4A 3AKGA 6I1BA 3N7KA 3INAA 3ZYPA 1DBNA 3VKNA 4I2SA 1DFCA 4J23B 3AZYA 2ZGLA 4LO1A 1KJRA 4AVVA 3B9UA 2BQPA 1QDOA 1RMLA 2D6LX 1KRIA 3WO4A 5BQUC 2GNTA 3IKWA 3AP6A 3B9CA 1AXZA 4Q9PA 2X2SA 5BP5C 1QNWA 2KLLA 4Y1VA 1KQRA 2YY1A 4ITCA 2EXHA 3BA7A 1UX6A 2UWBA 3FLRA 1GGPB 2GN3A 1S0FA 1A78A 4FOWA 4GA9A 4ATFA 2AH2A 4M3CF 3FBYA 5DZEA 3WO2A 3R4SA 3WLUA 3NBCA 2P34A 2ZQNA 5L73A 5FZYA 3Q7XA 1W0PA 3O4CA 1MS3A 3BAUA 2ZBJA 1V6KA 4USPA 1PZ8A 5D62A 1BQPA 3TAYA 2HYKA 1PC8B 3AKHA 1WLCA 4YGBA 3NV2A 1W6QB 3IM5A 1JTCA 4ISRA 3ZXKA 4KEKA 4J2XA 1LU2A 4IY9A 3SNMA 1H30A 3FJFA 3FJKA 41BIA 2A6ZA 1XG6A 3AXEA 3AH1A 3V0AA 3IPVB 1AVXB 4IZEA 4Y20A 3D6EA 2ZQOA 5DZUA 4K1ZA 1PZ7A 1F31A 3ATGA 3RTIB 1MVQA 1AVAC 3POYA 2RHPA 2ZMLA 1S0JA 2ZA9A 4QKSA 1QOTA 4XILA 5CNAA 4AN6A 1QU0A 4UW3A 3AJYA 5D61A 2CWSA 3Q7YA 4IYBA 3UL2A 1EV2A 1UKGA 1MACA 1FN0A 1LOGA 1W6OB 3AP4A 3O0WA 2HWAA 3FJAA 2QYIB 1QXMA 4JAWA 4PBPA 3O5SA 1HQLA 2EF6A 1MVEA 4HL0A 1TEIA 4YW1A 3BB2A 2GN7A 2W08A 2Z49A 1LESA 3OJBA 4P14A 1ENSA 4X39A 1SLCA 1K5VA 2D6MA 4Q8KA 3WCRA 3WNXA 1PWAA 2R49A 2ZHMA 1T4QA 1UL9A 3ILNA 1WBCA 3SH4A 4Q26A 4JC1A 1HKNA 2P39A 5F5QA 1QKQA 2DRYA 2ERMA 3FJ9A 1JY0A 3LLPA 4BLJA 3MW4A 4U36A 1SBFA 5GZGA 3UD7A 1ULDA 2UUSA 2EIGA 4BMBA 3OYWA 2D43A 3ZSMA 4M3CA 4DS0A 3AYAA 1LJ7A 1SR4A 1BFGA 3ZXDA 2E53A 5CA6A 3PJQA 1KDMA 3HR9A 2P23A 2HW9A 1ULCA 1MS9A 3WDXA 4UW6A 1B09A 3R05A 1GYKA 3OPZA 3VT1A 3OY8B 2FGFA 1GBGA 1N3QA 1I1EA 1IS6A 3AZXA 4USOA 2C9AA 4AVTA 3Q9OA 3W58A 2ARXA 1FYUA 5I1BA 1G9DA 1HDKA 1QQLA 4ZFYB 2XB6C 5T5LA 4Y1YA 1CVSA 1DZDA 1LU1A 5JOYA 4XMIA 2ZGNA 2BFHA 3S8JA 4YM0A 3OGFA 1AXYA 4C1XA 3M3CA 2P2KA 4P9YA 1GICA 2ARBA 4HJJA 2VU9A 1GZWA 1G9AA 4IONA 2R1BA 3PHZA 5FZUA 2E51A 3MPPG 1UAIA 4QBCA 2JECA 3AP5A 4ZXKA 1UN1A 1ONAA 1IILA 3I2XA 1W6NB 2I2SA 3AK0A 2CL2A 1IRAX 3ZXLA 3FJ8A 4ZBVB 2A70A 3NBNA 4LO8B 3AZZA 1M2TB 3N35A 1HWNB 1JT3A 2EALA 2ZR1B 1AXMA 1OQ1A 4XBNA 1G9FA 4FP2A 1GKBA 1JLYA 2ZGSA 7I1BA 4KEIA 2CWMA 2GO2A 4X37A 3GALA 3ZXJA 1DQ5A 3WG4A 2D1ZA 1YI7A 3WA1A 1Q1UA 2NN8A 3H6RB 4XBLA 5EG6C 3VT2A 2AFGA 3CRGA 3AZWA 1V6XA 2K4AB 1YXWA 3I8TA 3AKIA 4NOTA 4ZA3B 1BKZA 3ZXGA 1FNYA 3BTAA 2OUJA 2WBCA 4GWMA 1J0SA 3EF2A 4XMAA 3POSA 3KMVA 1ISWA 2WJSA 1V6WA 4OEEA 1CVNA 2MC2A 5FNWA 3UDAA 2DU1A 1RIRA 2Z42A 1MS1A 3NV4A 2SLIA 3WO3A 2X2TA 4J2YA 1WUVA 4BM8A 2CYFA 1N4KA 2IWTB 3PVNA 2DRZA 1SBDA 2E4MC 3WDYA 2M49A 2WT1A 5E89A 3WCSA 5DUXA 2ZHNA 3F62B 1WLWA 3H6QA 3PVEA 1XHBA 4FQ4A 2R0HA 4XYXA 3P53A 3V65A 3IN9A 1C4RA 3KQRA 3D5OA 4I1EA 4FPCA 4G9NA 1AF9A 1ISXA 3BA4A 3O0XA 4AN7B 3AYCA 3S8KA 1FWVA 4TYSA 3P6IA 2J3PA 2JE7A 2WT0A 1ONKB 2ZGOA 3BRGC 2VXRA 5T52A 2JJ6A 4P6AA 1ISYA 3WDWA 2K43A 4I3NA 4Y22A 4G6MA 4JCKA 3ILFA 4OWLA 4P0KA 4M01A 1LEDA 1FAYA 1G82A 1H9WA 3O4BA 1EPWA 4PCRA 1GV9A 4LBMA 5GLTA 2KI4A 2V73A 2NTDA 4Q1PA 2CNAA 5JLVA 4IQPA 4EFPA 4YG3A 2NVHA 2DVGA 2FFUA 4HA2A 1PUMB 4ENDA 2RSTA 1V6MA 1MD6A 5CB7A 3IMNA 4Z8SB 4RL7A 4PQ9A 5E8AA 5GJ6A 3H0OA 2HZ9A 3T1MA 1JOJA 4FP3A 3FJHA 3A21A 4FPHA 4GALA 2VH9A 3ASIA 2RG9B 1S0EA 1AZDA 5KXCA 1FQ9A 1SLAA 5T54A 2DU0A 1I1BA 2R16A 1GLHA 3V0AB 4AYUA 3VKLA 1JW6A 2ZGUA 2DUOA 3C9ZA 4YGCA 1LOFA 4I8MA 1C57A 4XJWA 3Q7WA 4JPZA 3QCWA 1UPSA 3JUUA 3HMYA 4H04A 3B3QE 3WUCA 1TTUA 4GOYA 1R8NA 2IHOA 3PUBA 1QGLA 2VW1A 3NBDA 2GALA 1UZYA 1II4A 4LO0C 1LHNA 5GLVA 2CY6A 2F2FA 3R4UA 2AYHA 1BA7A 1ISVA 1DGLA 2OUHA 1LTEA 3A0KA 3VWCA 1JT5A 2TEPA 4FPFA 3BAQA 1ZA4A 5CBLA 2WSUA 4D0ZA 3V79C 4FGFA 3AX4A 2KKIA 4Y24A 2FFVA 4GAFA 1DQGA 1TP0A 1AJKA 4ATEA 2HWMA 4FPKA 1DQ0A 1YTOA 4FPLA 4YOLA 3CU1B 5DUYA 2A3XA 2EAKA 4R9BA 3A4UA 2GZBA 3HALA 2PHTA 1G86A 3WHTA 3V64A 5E24E 4DRRA 1TFMB 4LO7C 1TIEA 4IY8A 1NLSA 3WDVA 2DVFA 2XOAA 3N7LA 5F90A 5B2HA 2VLCA 5DZFA 3AYDA 4PF5A 3ZC8A 4P9XA 1WW5A 5GZCA 4YM3A 3HBWA 3OYWB 3AJ6A 4LO3C 4M3CB 1N1VA 2P37A 1RITA 1N1YA 4ISQA 3LCPA 5HPZA 4LO7B 1LOBA 3ILRA 3UD9A 2D23A 1BZWA 2YV8A 2ZGPA 1TOOA 1PZZA 2D3PA 3ZSKA 3D7WB 5DUWA 1DJSB 1GANA 1FATA 3ZXEA 2K8RA 1N1SA 4BMEA 4GP0A 3BOPA 1LHUA 1Q8QA 1G9CA 1HQWA 1KITA 5GLWA 1Z2VA 1HWOB 2B7YA 21BIA 3FUQA 3I4IA 1LEMA 4QALA 1DQ4A 3CA5A 5BQUA 3ZX7A 4JKQA 4YG0A 3VSFA 5IK4A 1IS4A 1W6PA 4XFUA 5BP5A 2H0BA 2ZACA 3LSDA 1LOCA 3FJEA 3AP9A 4K21A 4D69A 4BPZA 1MC9A 3CRIA 2ZGMA 5JDBA 4YFZA 1CQ9A 2UWCA 3VUOA 1IHKA 2E7TA 4X3AA 4F83A 4L4IA 4YZ2A 4BLIA 4FPYA 1S0BA 5EWSA 3FJCA 4DCKC 2FO1A 1Q8OA 2Q5TA 1O4YA 2WSVA 1VALA 1SZ6B 1QOOA 3VEQA 2WKKA 1SCSA 3RRDA 5BXSA 3SH3A 1AXKA 2ES3A 4IHZA 4L4HA 1F9KA 1JQZA 1IT0A 1CJPA 2PELA 5E88A 3PVOA 5T5PA 1SBEA 3OJMA 3AFKA 3M3QA 4FOYA 5T55A 4JQ0A 3POKA 1JLXA 2C5DA 1GZ9A 1GZCA 4I7IA 3NV1A 2PHWA 2NP0A 1C1FA 4XJAA 3MW3A 1CONA 4FOQA 3NJ5A 4QD2C 1NXD1 1R8OA 1IKPA 2WNEA 4YZ4A 4P9WA 1ABRB 2P3KA 4JRAA 3E8LC 4JP0A 1Z78A 2PHUA 3O0VA 5HCFA 2D7FA 4CTEA 2Y9XE 1URXA 3FJJA 4XXAA 3BAHA 2R1DA 3WINC 4ZGRB 1LENA 2OVUA 4QD2B 4ZFUB 1BYHA 3FUOA 1CPMA 1MS5A 4Y1XA 1AX1A 1UMZA 4ZFWB 4A7KA 5CAZA 2VY0A 1ENRA 2ZHKA 1MZ6A 1HWPB 3T8SA 4G1RA 4Q1RA 1YIFA 1G8WA 4XXPA 3WG2A 5JOXA 3O44A 1Q8SA 1RINA 1DQ2A 3RMXA 3BAGA 3BRFA 1CE7B 2Y9GA 1YRZA 3UD8A 3ZPYA 1AFCA 2DV9A 1W6MA 2ERFA 4KBBA 4Q9GA 4P0LA 4OWJA 4J2KA 2ZGQA 5H9RA 4K1YA 2MLLB 1RY7A 1GNZA 5GZDA 5IK8A 3HN1A 4YLZA 1V6OA 3OJVA 1DHKB 2PHRA 1DZCA 2L5XA 5IUQA 1SACA 5KXEA 2Y9WC 4ZOTA 2P3JA 4EFQA 4XIOA 4BOWA 5JOWA 3CRHA 1LCLA 3FLTA 2GMPA 3SNVA 3QR5A 4Y22B 3UJ0A 4R6UB 3ZXFA 3LTQA 4XTMA 2OW4A 2FHRA 2PHXA 2A6YA 3PG0A 5GLUA 3SH5A 4XTPA 1JYIA 1XYFA 1Q03A 1M16A 2FDBM 1Q56A 2WQZC 4YG6A 2NYYA 4J2SA 1SCRA 4YZ5A 5BYNA 2A6XA 1MR5A 1WLDA 4HR6C 1U0AA 1ISZA 1LHWA 2F8XC 4F34A 3BAOA 4FPEA 3F1RA 4YW2A 2VSAA 1D0HA 1MS8A 4DEPA 3WDUA 1K5UA 5IK7A 3WMVA 4LBQB 2WRYA 4M00A 4I4QA 1TWMA 3MEPA 4QO3A 3O12A 4LO1C 1LOEA 4EB2B 5GM0A 2D6NA 1EYLA 4OW4A 5DG2A 2V5YA 5FZZA 1FX5A 1Y7BA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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