1G9AA

Crystal structure of clostridium botulinum neurotoxin b complexed with an inhibitor (experiment 3)
Total Genus 395
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
395
sequence length
1290
structure length
1287
Chain Sequence
PVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVPLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKDMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIEYNTQSNYIENDFPINELILDTDLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVNDFVIEANKSNTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRNEKWSDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYRYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINGCSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVNKYLKTIMPFDLSIYTNDTILIEMFNKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords BOTULINUM NEUROTOXIN TYPE B
publication title A Novel Mechanism for Clostridium botulinum Neurotoxin Inhibition
pubmed doi rcsb
total genus 395
structure length 1287
sequence length 1290
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2000-11-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07952 Toxin_trans Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 1g9aA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1g9aA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1g9aA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 1g9aA01
4LO2C 5DZGA 1IHKA 1G9AA 1ULCA 4R9DA 3WZ1A 2Y9XE 5F8YA 3NV1A 3AKFA 2P3IA 4LBMA 3IPVB 4BPZA 4HJJA 5SV8A 3I8TA 4KEKA 2NN8A 3NJ5A 3FJBA 3C9ZA 2VH9A 1W6MA 5GALA 4YZ2A 3O4BA 1WD3A 1N47A 2LIQA 4GWMA 1R8OA 4MYEA 1MC9A 1QQKA 2AR6A 3B9CA 3WG3A 4OW4A 4I2SA 3N35A 1R1ZA 3LSDA 3HN1A 1AVBA 2E4MC 2NMOA 1DQ5A 1WLDA 2DU0A 5GLVA 3ZXKA 4Q1PA 2D3SA 1ZM1A 1IS3A 2GNMA 2Q9XA 4ZFYB 2NYYA 1HWNB 3IM7A 2P3JA 2D23A 3UK9A 4AVSA 3WMUA 2NTDA 3AFKA 1S0LA 4XKIA 5GAQA 5F9TA 5EXOA 1DZCA 4JQ0A 5F8SA 2DUOA 1VALA 4Y20B 4R9CA 5GLZA 3O12A 5JOWA 4AYUA 2A97A 4LO1A 3AP7A 3A07A 1SCRA 3Q7YA 4LO7C 4QC4A 3SH3A 4ZKTB 4EL4A 1TIEA 4LO3A 5KXEA 2GN3A 4JRAA 1UMZA 4XXAA 1TEIA 4IZXA 1TWEA 4H9WA 3DEBA 4AVVA 2YV8A 4Q8KA 1XYFA 1W3GA 4XJAA 3SLIA 3QIYA 4Y1YA 3ZC8A 2P3KA 4Y22B 3FGMA 2YZ4A 1LU1A 2GNDA 3C88A 1JOJA 2ES3A 4XBQA 1GYKA 4QO3A 1QDOA 1FGAA 3FJCA 1ENQA 1LOFA 1LHWA 4YGCA 2YY1A 4EB2B 2ERMA 3M3OA 1FYUA 4LBNA 4XJUA 4EKXB 1SCSA 3DDAA 1CIWA 1J1TA 3ZSLA 2BEBA 4XJ9A 3OJ2A 1FATA 4KS6A 4YM3A 4J1LA 2ZGSA 1HWPB 3VKOA 3A4UA 3JUTA 1MVEA 1MS8A 1LU2A 1BLDA 1GLHA 4M3CB 2W08A 3Q7XA 2RQ9A 4DCKC 3A21A 1IRAX 2V73A 1V6XA 1A3KA 2GN7A 1MZ6A 1S0IA 4ZFWB 4FQZA 1DFCA 1HIBA 3CA1A 3FUOA 1YVGA 1MS4A 1W6PB 2JE7A 3PHZA 1W3AA 2KI6B 1CPNA 2GALA 1FN0A 4ZXKA 4YM0A 2BEAA 4XIKA 2C9AA 3C8AA 1OQLB 1YBIA 3BODA 4H04A 4Y1UA 1GZWB 1UKGA 1LESA 2X2SA 1L2HA 4IYBA 1JHNA 1KDKA 5HCFA 4GOYA 4F34A 2W52A 3BADA 2ZGNA 5BXRA 4G9MA 4R9AA 4I96A 5FNWA 1BYHA 1W0PA 3I2XA 1S0FA 1Z7HA 2AENA 4QBCA 1W6OA 4FOYA 4ZA3B 4EFQA 5BVPI 3FJEA 4UW6A 5H9PA 3I29B 2GDFA 4AWDA 2ZQOA 4J2YA 1BFBA 2R1BA 3FLPA 3V0AA 2ISGA 1GGPB 2ZGKA 4YG3A 4XHBA 1CVSA 1WBLA 1AF9A 2JKBA 5T5PA 3H6SE 3OJBA 1H9PA 5BQMA 1XG6A 3N7MA 1V6IA 1MZ5A 3DUIA 1F5FA 2P2KA 5IK8A 1VAMA 3WDUA 3T2TA 3WG2A 2OUHA 2Y9WC 2G7KA 2Z48A 1Z0HA 1LGCA 3BAHA 3BA4A 4D0TA 3FJDA 1MR5A 1SLIA 2WNEA 3BWIA 4YGEA 3O5SA 1SR4A 3BOPA 4FPGA 3SITA 4PF5A 4RL7A 5GZDA 4I4PA 3MPPG 3OYWA 2PHXA 3RMXA 4UW3A 4P9XA 5JMCA 2GNTA 1CQ9A 3BRGC 1HDKA 1S0CA 1OKQA 1GBGA 3V64A 4G9NA 1SFYA 1CVNA 2YMZA 3ILFA 4HANA 1DQ6A 2D22A 2CWSA 1VLNA 1RINA 1JN2P 4I7IA 1EV2A 4K21A 4TZDA 3FJAA 3I2AA 1CN1A 1ISVA 4ZFUB 2ZA9A 4ENDA 4LO1C 1PUUB 3IPVA 1XHBA 3FIEA 4FGFA 3BTAA 1EPWA 1IILA 1I1BA 3GALA 4DS0A 4I4YA 1WD4A 2E7QA 4Y24A 2KH2A 4LO0A 5BP5C 4DPNA 3AYEA 1ITBA 4YGDA 1MD6A 3V79C 1KDMA 5T5LA 2DS0A 4J2SA 1YTOA 2DU1A 2W68A 4ASMB 4F83A 2FHRA 1AX0A 2G7NA 5JVVA 1BFGA 1W6QB 2GZBA 1IOBA 4XMAA 4SLIA 3WHTA 4OWLA 3C89A 3IAGC 4M00A 1PZ9A 3CNAA 3M1HA 3WO2A 5D62A 3BOKA 4XMIA 4KBBA 4L4HA 1LOFC 5E88A 1HWMB 3WUCA 1JY0A 5BYNA 1FAYA 2ZAAA 1MACA 3INAA 3VWCA 5T52A 4P0JA 1RG8A 1QU0A 2G7PA 4YZ5A 2ZHLA 3K1XA 3AH1A 3AJZA 4XBLA 4Y20A 1S1AA 3IKWA 2LALA 1N1YA 2FMDA 2WQZC 5BQUA 4Q9GA 4XFSA 1H30A 1LTEA 2VSAA 2OUJA 3POYA 1HCEA 3O0VA 1V6NA 2F2FA 2ZGLA 4FP2A 4ITCA 4AN7B 2CL2A 4FPYA 3WHUA 3ATGA 5E8AA 1F9KA 1JUIA 4UW4A 1LECA 3ZXDA 2OW4A 5D61A 1DQ4A 4GOVA 1M16A 4I4UA 3AH4A 3M3CA 4A7YA 5EC5A 1YI7A 4YM1A 4JKXB 2ZMKA 1Q8PA 4Y22A 3FJHA 4I4VA 2JJ6A 2AAIB 3N36A 4Q27A 3ZSMA 3KMVA 1PZZA 1LHVA 2A71A 4M01A 4YFWA 2DVDA 4GP0A 3MW2A 1QKQA 4GA9A 2VY0A 1JT5A 1SLAA 1G9DA 2ESUA 4I8MA 3UD9A 1YIFA 3Q7WA 1LJ7A 1CESA 1ULFA 3BOOA 1GSLA 4LBOA 4P14A 5E89A 3AZWA 1QOSA 1SZ6B 4JC1A 2EALA 1JBCA 4J23B 1SACA 3QJ0A 4C1XA 1BXHA 2NZ9A 4ZGRB 4QD2C 2ARBA 1PC8B 3FJ8A 1V6MA 5D63A 4M3CA 1V00A 4FOQA 1QNWA 1G9BA 3HR9A 3ZURA 1QF3A 1LOAA 2KLLA 4D0ZA 2D6PA 2B7YA 1T3AA 1YXWA 3NBEA 5DUXA 4HA2A 2E53A 4YW3A 4X39A 1W6PA 2HZ9A 1ZL6A 2HW9A 1ONAA 4LO7B 4P9WA 2ILPA 2ERFA 3OGGA 4YZ4A 1LEMA 1LGNA 2UWCA 2ZHNA 1FWVA 1WW5A 2UWAA 3K3QB 1GZWA 4EJ5A 1AVWB 4GWNA 5GZCA 4BLIA 4JAWA 1LOEA 4XOGA 1N1SA 3WOGA 3ZUQA 1SR4C 3O0WA 3V0BB 2A6VA 1IKQA 2ZKNA 3HMYA 2JDZA 1G7YA 3UJOA 1RMLA 3WINA 1BASA 4LBJA 2EXKA 1MS1A 1YO8A 3FLRA 3A23A 3VUOA 2ZGMA 3FJJA 1NLSA 2UUSA 3O44A 1G9CA 4ISQA 3W9TA 1ENSA 1Q8SA 2EAKA 1V6WA 2FPQA 1RZOB 1ULEA 4R6UB 1QDCA 2I2SA 2AREA 3S8JA 4JPZA 1DHKB 3OPZA 3RTIB 3CU1B 4FPKA 3NV2A 3MALA 3AP4A 1HLCA 4X3AA 3VV1A 2ZABA 3RQ0A 3ZVXA 3QW7A 1LEDA 2A75A 5CBLA 1LHNA 2GO2A 3AJ5A 2P39A 1G9FA 2L5XA 3H0OA 4WZFA 1WBAA 4Q9PA 4KEIA 4I1BA 2P37A 4L8QA 1JLYA 1DQ2A 1N1VA 2ZR1B 4QKSA 2XHLB 3N7JA 3GNEA 4EFPA 1RIRA 4KC3A 9ILBA 1T4QA 4YFZA 3BRFA 1P63A 2IWTB 1FX5A 3RMYA 1JXNA 1UL9A 4I3NA 4AGVA 1K5VA 4H55A 3VEQA 4OZXA 1K5UA 2M49A 1KJLA 2CNAA 3ZYRA 1BA7A 3UJ4A 2A6XA 1WLCA 3C8BA 4AGRA 5IT6A 21BIA 5BQUC 4LBLA 4PBOA 3CRIA 1G8WA 1WUVA 2GMMA 1ONKB 3ILNA 2F2FC 1MS9A 1AXYA 4FOWA 2ZQNA 3IM6A 4M3CF 3OY8B 1JYCA 3WLUA 4AN6A 4CZSA 3USUB 2VW0A 2NVHA 4X37A 3TB0A 3ZSJA 4U36A 1BLAA 5DVHA 1GNHA 4PQ9A 3H6QA 4BMEA 2XOAA 1IS6A 4RA0A 3WDTA 3VSFA 1W6QA 3NV3A 1C1LA 2D7IA 1KNMA 3WG4A 2GMPA 4FPJA 1AXZA 4FPCA 5JDBA 1F31A 2F8XC 3HSMA 4P9YA 1AVAC 3WO3A 5L73A 2AUYA 3F1RA 1UZZA 4YGBA 7I1BA 1UAIA 4L4IA 2D20A 3OGFA 5BXSA 2ZMNA 3HBWA 3AP6A 1URXA 4CTEA 4I37A 2WRYA 2IMBA 3WDWA 3JUUA 4LO8B 1CPMA 4I6IA 2DVBA 2KI4A 4XJ8A 1IT0A 1FMMS 2ZGRA 2C5DA 4LO2A 1T3CA 5H9RA 3I4IA 5F90A 3AYDA 3N7LA 3N3HA 3AK0A 4WBCA 1S0DA 4II0A 2DTWA 2YROA 5GLTA 4YG6A 3WDYA 2R49A 1A78A 1I1EA 1AVUA 3WUDA 2R9KB 5DSSB 1Q8VA 2ARXA 2EXJA 3RRDA 1RY7A 1QGLA 1DGLA 4XBNA 3QW6A 4XTMA 2HYKA 4XYXA 5HCAA 1ISXA 4JP0A 1GKBA 1DYKA 1O4ZA 2DVGA 5KXCA 41BIA 4XDQA 1XZZA 4G1RA 3P6IA 3FFZA 3R4UA 4YW2A 3QLQA 2E4MA 2FO1A 3BIWE 3VKNA 4QBVA 5FZYA 4YW1A 2D3PA 3ZUSA 1O4YA 3BAQA 5GZEA 1V6VA 3BAOA 1LGBA 2SLIA 1Q03A 2R16A 2D24A 1FNYA 2ZGQA 4IHZA 1LHUA 5DZUA 1BZWA 3ZXEA 2ISEA 2DWRA 4Z8SB 4FQ4A 4LBKA 5HCBA 1ISYA 1LENA 2DUQA 4YZ1A 1F82A 2XB6C 3N7KA 3N0KA 1JTCA 3B00A 3W59A 3JU9A 2WT2A 1V6LA 5GZFA 5T50A 3AKGA 1XQNA 3WA1A 4LO3C 3FJIA 3D6EA 3CAHA 1Q1UA 3ASIA 2A6ZA 3AZYA 4UW5A 1CONA 4HEVA 3D7WB 3LCPA 3BAGA 4PC4A 1CJPA 4IY9A 1AJKA 1DLLA 4ISRA 2WBCA 3POSA 2P34A 2J3PA 4C1WA 2X2TA 5BXPA 1LOBA 2A6WA 2W2DB 1WW7A 3ZC9A 3WDVA 3V0BA 1AJOA 1DBNA 2PHFA 5EHAA 4I4QA 1FQ9A 3HALA 3CA5A 4YW5A 1DIWA 3S8KA 2DURA 2EXIA 2D6OX 3POWA 5T55A 3MW3A 4Q2FA 4I4XA 1W6NB 2SBAA 1N3PA 3WMVA 1PZ7A 2LTNA 3V65A 3WNXA 1S0JA 4P0LA 4ZOTA 1JT4A 5DUVA 2PELA 3SNVA 1YYNA 2I1BA 4KTXA 4CRQA 3QCWA 5JLVA 1HWOB 3PUBA 2ISHA 4GP3A 5DZFA 4QD2B 4GXLA 3VT0A 2Z42A 3POKA 1CE7B 3ZYPA 5GM0A 3MW4A 5IK5A 3D4KA 3WCRA 2E7TA 2A3WA 4EEEB 5DG1A 2D6LX 2HWAA 4XFUA 1JYIA 1SLBA 2BQPA 2ZBJA 5EG6C 1QMJA 4FPLA 4DQAA 2ZACA 2Z49A 5T5OA 4GAFA 3DGTA 3UJQA 5DXDA 3R05A 3CA4A 3PVNA 5G00A 1MS0A 4PCRA 1ILR1 5F5QA 1SLCA 3VKLA 3O4DA 1S0BA 3O4CA 1UZYA 2XHLA 4AVTA 3NBNA 4FPHA 31BIA 5IUQA 4WVWA 4IONA 2AQZA 4J2XA 4I4OA 2WJSA 3WG1A 5B2HA 1KJRA 4YOLA 4GKXA 4WVVA 1JQZA 3FBYA 1Y7BA 2LIEA 2TEPA 3FUQA 1Q8OA 3AYCA 1IRPA 3TAYA 3BAVA 1V6JA 4W65A 4XJZA 2FGFA 3QIZA 4DEPA 1CR7A 4R9BA 1N1TA 3AXDA 1IOAA 2AH2A 2QN0A 3WVJA 4PBPA 2AFGA 2MLLB 4G6JA 3KM5A 4OEEA 3M2MA 3OBRA 2OVUA 3AJ6A 1BFFA 1DQ0A 1BJQA 3BAUA 1V6OA 3ENRA 3BA5A 1NUNA 3LSEA 1UX6A 2DUPA 4Z8BA 1HQWA 2GNBA 2MIBA 2FDBM 1MS5A 1ULDA 3O4AA 2P23A 3DS9A 1JW6A 3M3QA 2VSEA 1KQRA 3AKHA 3APBA 3OY8A 3IMNA 1N3QA 5LK5A 4XXPA 4Q1RA 2RHPA 1JT7A 1X50A 1ZB7A 1D2SA 4ELCA 1HKDA 3USUA 1GZ9A 1SLTA 1KRIA 2PHWA 3IM5A 5EYYA 3BB2A 1TP0A 1WBFA 3PJQA 4QKRA 3O3QA 1TWMA 4YLZA 3BA7A 3O0XA 5KXBA 5E24E 2ZGPA 2ENRA 1S0EA 3P6JA 4LBQB 2D44A 2QN4A 3H6RB 4IQPA 2IMAA 3NV4A 1FV2A 3QW5A 4USOA 1WW6A 5T5JA 2ZZJA 2AGSA 1Z2VA 2BFHA 2A3XA 4OEGA 5AVAA 3RS6A 1AX1A 3AYAA 5H9QA 4ZLBB 2DTYA 2ZMLA 2KKIA 1AXMA 2EXHA 1R8NA 4GALA 1LOGA 8I1BA 2A8AA 1ZN3A 1E0OA 3NBDA 1D0HA 4K1ZA 1V6UA 5HPZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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