3N7KA

Crystal structure of botulinum neurotoxin serotype c1 binding domain
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
424
structure length
422
Chain Sequence
NINDSKILSLQNRKNTLVDTSGYNAEVSEEGDVQLNPIFPFDFKLGSSGEDRGKVIVTQNENIVYNSMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNEDSEQSINFSYDISNNAPGYNKWFFVTVTNNMMGNMKIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFEINKIPDTITSDSDNINMWIRDFYIFAKELDGKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYNKEYYMVNIDYLNRYMYANSRQIVFNTRRNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGGDILYFDMTINNKAYNLFMKNETMYADNHSTEDIYAIGLREQTKDINDNIIFQIQPMNNTYYYASQIFKSNFNGENISGICSIGTYRFRLGGDWYRHNYLVPTVKQGNYASLLESTSTHWGFVPVS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Identification of a Unique Ganglioside Binding Loop within Botulinum Neurotoxins C and D-SA .
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type C1
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 91
structure length 422
sequence length 424
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2010-05-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3n7kA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3n7kA02
2YY1A 4AGRA 5HPZA 1XG6A 2XG3A 1N47A 4I2SA 3P53A 2LIQA 3VKNA 1FN0A 1YIFA 1IOBA 1QF3A 1FMZA 4OEEA 3AKFA 1LHVA 5IK8A 4NOTA 1AVWB 4I7IA 2CY6A 2VW2A 3FFZA 4F34A 1RINA 3V79C 3T2TA 2D6OX 1Z78A 3CRIA 4FOQA 5BXRA 2AXMA 1IHKA 4ZGRB 1JN2P 1VAVA 3O3QA 1R8OA 4XOGA 1I3HA 1FAYA 4GAIA 3QR5A 1Q8SA 4YG6A 5EWSA 2GNDA 4GOYA 2JJ6A 2G4IA 4G9MA 3O4CA 4CZSA 3BRFA 4YW4A 5D63A 2A5ZA 2R1BA 3CQAA 5GZFA 4XXPA 4JPZA 1PUMB 4YOLA 2YXSA 3NBNA 3WDVA 41BIA 1QDOA 3A22A 5FRAA 1S0IA 1HCEA 3ZPYA 4NO4A 4WV8A 2EF6A 3AZZA 4PBOA 1XZZA 4EEEB 5DSSB 1SLCA 3BX1C 3AJ6A 1GKBA 1DHKB 4Y1XA 3FJAA 1DIWA 4EFRA 2ZA9A 1MC9A 1HDKA 4LO0A 3FLRA 31BIA 3ZYPA 2BEAA 4ATEA 4OZXA 4DQAA 1N1YA 1SBFA 3U4XA 1MZ5A 3I4IA 1TEIA 3UJQA 9ILBA 4M3CA 3NJ5A 1NXD1 2KLLA 5KXCA 1A78A 3NV1A 2HYKA 3O0WA 4FPYA 4A7KA 5B2HA 2D23A 1QQLA 5DG1A 3FJ8A 4JKXB 4J2XA 1K5UA 3POYA 3MW2A 2F2FA 1HWOB 2DVGA 4L8QA 3D5OA 3BRDA 1LEMA 5L73A 1JTCA 2FFUA 4IZXA 4I37A 4LO7B 3FJFA 1LOEA 2D7FA 3T1MA 1YXWA 1SBDA 3PHZA 1ULCA 1JY0A 4WZFA 3WG1A 4P0KA 2ZKNA 1XQNA 4QO3A 1IS6A 2AAIB 4GAFA 1IS4A 3IAGC 1DGLA 4TZDA 4QBVA 1SLTA 3NWKA 3D7WB 4I6IA 4XE9A 4GKXA 5GLUA 5KXDA 3AYDA 5DZUA 1JYIA 4DFSA 3OBTA 2DWRA 5GM0A 4FGFA 4PF5A 1JBCA 4J2KA 2ZMKA 2NMNA 2D6KA 1AVUA 1AJOA 4OWKA 3AYCA 3AJ5A 2GNTA 2NP0A 3V0BB 1V6JA 1Q04A 3WVJA 2DVAA 4FPLA 3S8JA 1Q8VA 2CNAA 3AK0A 2DU1A 3QLQA 1PZ9A 4FOVA 4YGDA 4YG0A 5GZEA 3ZC8A 4LBOA 3O5SA 2P34A 3FLTA 4JP0A 4AYUA 4P14A 4LBQB 3N7KA 3WG3A 1VLNA 4Z9WB 2PHUA 4LO3C 2P3IA 5DUWA 4XTMA 1TIEA 5FNWA 3BAGA 1GV9A 3HN1A 1UX6A 4IONA 2GNBA 2WNEA 1DFQA 3FUQA 1SACA 5D61A 2WT1A 2ZHLA 1LHNA 3PVOA 4P0JA 1WUVA 4Z8SB 2D6LX 3JU9A 1ZA4A 1CQ9A 4GA9A 2E53A 3CRHA 1LOGA 2GALA 5FZUA 1AXYA 2WQZC 1SR4A 3AH4A 1GZ9A 1G9FA 1MS8A 5JLVA 1EYLA 3PUBA 3A0KA 4Z8BA 4SLIA 3WNXA 5EHAA 1IS3A 1DFCA 1WW5A 1UKGA 1GLHA 4XYXA 1ISZA 1F9KA 1HIBA 1ZM1A 1HWNB 1Q8PA 2JDZA 1LENA 4YW2A 2ZBJA 3N7LA 1AXZA 3BA5A 4XBQA 1LJ7A 4QKRA 3AXEA 1MS4A 1JQZA 3UK9A 4H9WA 4I0YA 2ERFA 3B01A 3HMYA 3WUDA 3V0BA 2DRYA 2P2KA 1ULDA 4FOWA 3ZXLA 2R0HA 2XB6C 2ZGQA 3BTAA 4AWDA 1CPMA 4Y1ZA 5F9TA 1ULEA 2GZBA 2ZACA 4UW4A 5CNAA 4CJMA 1SLAA 2A75A 4PC4A 4LO7C 3WOGA 2D3SA 4FPKA 3ENRA 2NMOA 1SR4C 1XHBA 4OW4A 2KI4A 4M3CF 2R49A 1AVBA 2BEBA 4XJZA 3A07A 3ILAA 3ZVXA 1S0FA 4RL7A 1HWPB 1QOSA 2IWTB 2DURA 3L2YA 3BRGC 4U2AA 2FGFA 1HKNA 3NV2A 1TTUA 3N7MA 4FOYA 4Q1RA 3RMXA 3APBA 4D8HA 2A7AA 2KKIA 1G9AA 1QNYA 4XJAA 1F5FA 3FJDA 3KM5A 1CVSA 3FJIA 5E24E 4DRVA 2HWAA 3RMYA 4UW6A 3POWA 4BMEA 3PG0A 1VAMA 1LHOA 2VH9A 1BA7A 4EFPA 4AN7B 1BFGA 3BAVA 4XBLA 4XHXA 2Z42A 4YZ4A 3O4DA 2EXIA 5GLTA 3AH2A 5E89A 2LTNA 1KJLA 2SBAA 1Q56A 3ZXEA 1CR7A 3AJZA 4XHBA 4ZKTB 4I30A 3M3CA 4ZLBB 3I2XA 1TWEA 4H04A 2FDBM 4LBNA 3A23A 3UL2A 3ILFA 3M3QA 1KNMA 2RHPA 4BLJA 2K4AB 3Q7YA 3A0NA 1W6MB 3WDTA 2CYFA 2XOAA 1FX5A 3POKA 5GZCA 3F62B 3Q7WA 4Q1PA 2X2TA 4BMBA 5IK5A 3SH5A 5KXBA 1IILA 2AYHA 3Q9OA 4G1RA 1RY7A 3UJ0A 3MEPA 2AR6A 2BQPA 3FJJA 3WMUA 1IRPA 1MS5A 1P63A 5EYYA 2GMPA 1QQKA 1DJSB 2ZMNA 2VXTI 4D69A 1Z2VA 5IT6A 3W9TA 3AKGA 4AVVA 3DGTA 1ISWA 1GICA 4ZBVB 1LCLA 5E88A 3AP6A 4QC4A 1AX1A 1R1ZA 4ITCA 2C5DA 4ISRA 4Q8LA 4ZFUB 2CL2A 1MS9A 2WJSA 4YLZA 1CONA 2P23A 2UURA 1LU2A 3BAUA 1LOFC 1D2SA 5FREA 4EB2B 2E7QA 4XFTA 2GNMA 3SNVA 1FV3A 4WVVA 3VKMA 2A6ZA 2VLCA 3C9ZA 4I1EA 1ISVA 3VT1A 1S0BA 3WDYA 1RITA 2YUGA 2ZHNA 5DZFA 2A6VA 5JDBA 2Q3NB 2C9AA 3RRDA 4ZFWB 2AREA 3OGGA 2H0BA 2RQ9A 1W6QB 3C2UA 4EFQA 4Y1UA 1W6NA 3WO2A 1WW7A 4XJUA 4Q9PA 5GALA 3RS6A 2Y9GA 3VEQA 2WT2A 3R4UA 4KEIA 4FPGA 4UW5A 2RG9B 4Q27A 5DUUA 5BOWA 2R1DA 1W6MA 3ZYRA 2ZGTA 4FPCA 1BQPA 4I4UA 1HQLA 4LBKA 3TB0A 1T9FA 3WINC 5CA6A 1JT4A 1DQ2A 3N35A 4DPNA 3I8TA 3BB2A 4I4SA 3M1HA 4KBBA 1S0GA 1PC8B 2ZGNA 6I1BA 4FVVA 2R0FA 1G9CA 2GMEA 3AH1A 3BADA 3W58A 1I1EA 1H30A 2D7RA 2Q5TA 3WG4A 4YZ5A 2ZHKA 5H9SA 4QD2C 2ZGPA 1V6OA 1N3QA 1YYNA 1ONKB 3BOPA 4A7YA 1AFCA 4UW3A 4FPEA 4XJWA 4Q9GA 4DCKC 1PZZA 3AYAA 1SZ6B 4Y24A 5DUVA 4J2YA 5BXTA 1GSLA 1Q1UA 3SLIA 2D1ZA 3I2AA 4WBCA 3VSZA 4WVWA 1AX0A 1M16A 4X3AA 1UN1A 2M49A 3V64A 1A8DA 3T8SA 2BFHA 3F1RA 2DREA 4L4HA 5DUXA 1ILR1 4YZ3A 1WBAA 5F8YA 4K1ZA 1JT3A 1W6QA 3LTQA 4GOVA 1WLDA 4YFZA 1DQ4A 1VALA 1BASA 4Y20B 3AJYA 2WBCA 1MR5A 4IQPA 3JUUA 1W3GA 1LODA 3O0VA 1V6WA 3OYWB 3P6JA 4LO3A 1DZDA 3UJ4A 1UMZA 5T5OA 4OEGA 4GKYA 3SH4A 3WO3A 3N0KA 3UDAA 3NBCA 1V6UA 3WG2A 1GNZA 1S0DA 2D6PA 1G86A 1V6MA 4I3NA 1O4ZA 3B00A 3O5WB 3FJBA 4X38A 3O0XA 3BA4A 2DVBA 2JECA 1XYFA 4Q26A 1BXHA 4P9YA 1DQOA 1UPSA 2NYYA 4I4QA 3WA1A 4YM1A 4I4OA 1FV2A 1PZ8A 3HBWA 1BJQA 3JUTA 5GLVA 2V73A 2AFGA 1GGPB 4DS0A 1QMJA 3IM6A 1FNYA 4LBJA 1WD3A 1BLAA 3OY8B 1G82A 1EV2A 1SLBA 2PELA 3AZXA 2ARBA 1IRAX 1W0PA 3VKLA 2KI6B 4Y26A 3M3OA 2ZGKA 4K21A 2DVFA 3IIRA 1OQ1A 1V6IA 3WDWA 3ZSLA 4TLPA 1N1TA 3RQ0A 4HJJA 4JKQA 5FNXA 5IK4A 3H6QA 3CRGA 3AXDA 1R8NA 4GP3A 2DS0A 4GP0A 2E51A 2Y9XE 2WT0A 5F8WA 1AJKA 5BYNA 2X2SA 4EKXB 1YTOA 4QKSA 4LO2C 4Y20A 3AKHA 4I4YA 3RTJB 2OW4A 2NN8A 1AF9A 1ENQA 1GNHA 3A4UA 1ONAA 2FO1A 2PHTA 3OYWA 1KITA 2IHOA 1N3OA 3TAYA 1DQ5A 2ZGLA 1S1AA 1E0OA 3OGFA 5BQUC 1JT5A 4OWLA 3HR9A 4YZ2A 2EIGA 1WW4A 1U0AA 3FGMA 4R9DA 5HCAA 4P9WA 4W65A 1QNWA 3RG0A 1W0OA 3VV1A 2P3JA 3FBYA 21BIA 2WRYA 2OUHA 2ZGRA 2UU8A 3OY8A 5GZGA 1YRZA 5T54A 3ZX7A 1M2TB 5JOWA 3BAOA 2ZABA 4JC1A 3MW4A 4DRRA 2I1BA 1F31A 1V6XA 4YW1A 3FJKA 4C1XA 4QALA 4YM3A 4I1BA 1OQLB 5DUYA 1LGCA 4OEFA 3A21A 4LBQA 2W39A 3AX4A 5DZGA 1W3FA 3IKWA 3FJEA 3USUB 2Z49A 1LGNA 1VIWB 1JXNA 3BIWE 1TWMA 1C1FA 5FZZA 1YBIA 4ASMB 3IM5A 2CTVA 4FQZA 1ITBA 1Q8QA 1CJPA 1LOCA 2FHRA 1S0CA 4L4IA 3NBEA 4KC3A 1BFBA 1L2HA 1HLCA 3WZ1A 4LBMA 3W59A 1ENRA 4I4PA 4USOA 3WO4A 1I1BA 1CN1A 3LSDA 3LSEA 3H6SE 1DQ0A 2W08A 3VSFA 5GJ6A 4A7ZA 4LBQD 2QN4A 2W68A 4I4XA 3H6RB 2ET2A 2K43A 1FGAA 4ZXKA 4XTPA 4QD2B 1IOAA 2D22A 3WDXA 1DYKA 1YF8B 4Y1VA 3ZSMA 1LOFA 1UL9A 4GWMA 2WSVA 4I4VA 3VWCA 1CIWA 4BOWA 3IPVB 4JQ0A 3V65A 3WHTA 3RSJA 3AZVA 4MYEA 4FQ4A 5AVAA 2KM2A 4H55A 3LCPA 3CU1B 4I4RA 1MZ6A 3BODA 1IJTA 5EC5A 1GZCA 4FPOB 1PZ7A 1S0LA 3NBDA 2GN3A 1G9BA 5IUQA 4CTEA 4Y22B 1HCDA 1C4RA 2E7TA 3USUA 3VT0A 1FWVA 3CA5A 1DQ6A 3P6IA 1Q03A 1RMLA 2YMZA 3N7JA 4FPJA 1MS0A 1WBCA 3OJBA 1FQ9A 2K8RA 5I1BA 5EG6C 1GYKA 2ESUA 2CWMA 3B9CA 1N3PA 2ZR1B 3WINA 4ISQA 1W6OB 1ISXA 2VSEA 2EXKA 4I8MA 1B09A 2NM1A 1DQ1A 3R05A 4XFSA 5DG2A 3PMEA 5HCBA 2GN7A 2YV8A 3H6RA 2QYIB 5KXEA 3NV4A 3Q7XA 2ZGUA 2A71A 5BXSA 4AGGA 3WMVA 1DZCA 4KEJA 1ULFA 1UZYA 4Q2FA 2DYCA 1BZWA 3CA4A 3B3QE 1AXMA 1EVTA 1WBLA 1QKQA 1MACA 3SISA 2D6NA 3D4KA 3CAHA 2R16A 3HOMA 4YGBA 2VY0A 3IPVA 2WLQA 3O4OA 3TC2A 2A70A 2LALA 4HL0A 1TOOA 2E4MC 4PCRA 3N3HA 1IT0A 1DQGA 1ENSA 2ZQNA 5JOZA 3M2MA 5BP5C 1EPWA 2JD4A 1ABRB 1LOAA 5GAQA 1J0SA 1RIRA 4Y22A 2ZQOA 3VUOA 3D6EA 1JLXA 5BVPI 2LIEA 4R6UB 3UD9A 1V6NA 5GZDA 4XILA 5T50A 4XMAA 4TYSA 3IN9A 3IM7A 4R9BA 4LO1C 3OJVA 1ISYA 2ZGMA 1WCSA 2I2SA 5BXPA 1C1LA 2DUQA 5F8SA 3VKFC 1CESA 1II4A 4R9AA 5T52A 1O4YA 3R4SA 4YGCA 1A3KA 1WW6A 2Z48A 4X39A 2V5YA 3ZXDA 3NV3A 1W6OA 3FJHA 4XJ8A 2J3PA 4Y1YA 2D24A 2E6VA 3M3EA 4XFUA 4XIOA 4PBPA 3UD8A 5HCFA 1AVXB 3AP4A 1LGBA 1BYHA 5F90A 1N1VA 2ZGSA 1RG8A 2DV9A 2P37A 3EF2A 2VXRA 1DLLA 4P6AA 3WHUA 2D3RA 3OBRA 3GNEA 3PVNA 4J23B 5F5QA 1LULA 2Y9WC 1SLLA 4K20A 1JOJA 4FPFA 4XMIA 2ZHMA 1TFMB 3PVEA 1HKDA 2YZ4A 2UUSA 3RTIB 1FMMS 1PUUB 4XXAA 1S0JA 1VCLA 2D7IA 1GZWB 5GLWA 1NUNA 3SNMA 2D20A 2L5XA 2DRZA 2ENRA 3ZC9A 3FUOA 1LHWA 3ZXKA 4P9XA 1MS3A 4HANA 3IMNA 1UAIA 3O12A 2HW9A 1Q8OA 1WLCA 4JAWA 1BLDA 3OPZA 1PWAA 2ERMA 3O44A 1JHNA 3FJCA 1LESA 1MVEA 3BA7A 2W52A 4Q91A 4M00A 4G9NA 1LEDA 1QU0A 4LO2A 5EYXA 1FATA 3ILRA 5LK5A 1KDKA 4ATFA 2A6XA 1LECA 1IS5A 2UWCA 3HSMA 1Z0HA 4OWJA 2EXHA 1DBNA 4LO0C 1JUIA 2AGSA 3ZSJA 2D3PA 3FJ9A 2Q9XA 1KQRA 2HZ9A 5DXDA 2HWMA 2PHRA 4J2SA 2Y9FA 3AP7A 2UWBA 3I29B 3JRRA 2OUJA 5BQUA 3VT2A 2NZ9A 3WLUA 2GO2A 1TP0A 2FMDA 3CA0A 4M3CE 3N36A 3BAQA 2D43A 4M01A 1KRIA 2F2FC 4YW5A 1JW6A 1UZZA 4XKIA 1MVQA 2ZGOA 2R9KB 4G6MA 1IKPA 1RZOB 3FLPA 1NLSA 3ASIA 4XIKA 1HWMB 2JE7A 5JOYA 4YZ1A 1KJRA 1G8WA 1BKZA 4DENA 1G7YA 3B9UA 3PJQA 1GZWA 1W3AA 2DTYA 2B7YA 3AP9A 2SLIA 1BARA 1JYCA 5FZYA 2MIBA 4ZFYB 1YO8A 1C57A 5CB7A 2YROA 1QOOA 4D0ZA 5JOXA 1IKQA 2A6YA 4LBLA 4RA0A 4ZA3B 4D0TA 3ZXGA 1JLYA 1URXA 3GALA 3AZWA 2OVUA 4G6JA 3HALA 3CA3A 4IYBA 1GANA 1T4QA 3ILNA 4YGEA 5T55A 3INAA 3K1XA 4IY8A 2AUYA 2VU9A 3ZXJA 1Y7BA 3O4BA 3AYEA 3E8LC 1LHUA 4JRAA 4YG3A 4OUJA 4IY9A 2MC2A 4BQ1A 4CRQA 5GLZA 4AN6A 1WD4A 3UD7A 1AX2A 3LLPA 1SBEA 3CNAA 3V0AB 5EXOA 3MALA 7I1BA 1SFYA 1Z4SA 1FNZA 4P0LA 3IM0A 2VSAA 1X50A 3KQRA 1BFCA 2CWSA 2F8XC 4BPZA 1LU1A 1JT7A 1AVAC 1ULGA 1V6LA 4KEKA 1WLWA 2DUPA 1AZDA 5IK7A 1YI7A 4XZPA 4I96A 1H9PA 4YM2A 4F83A 1SCRA 4JCKA 4R9CA 2EXJA 1D0HA 3DUIA 3KMVA 2DUOA 3OJ2A 2AH2A 3O49A 1NZKA 4GWNA 1N1SA 1QXMA 4X37A 5H9QA 4U36A 4AVSA 3H0OA 4USPA 2UWAA 1QDCA 4LO8B 5H9PA 1WBFA 2TEPA 2A3WA 1CVNA 1OKQA 1DZQA 4PQ9A 2AENA 2EALA 2P3KA 3ATGA 5H9RA 2FFVA 1KDMA 5G00A 2ZZJA 4II0A 2ZMLA 5DZEA 1V6KA 4FP2A 3AFKA 1LTEA 3S8KA 2GDFA 1AXKA 4DEPA 1S0EA 3MPPG 1V00A 2EAKA 4AVTA 3CA6A 2PHXA 4FPHA 4IHZA 5JMCA 2DTWA 1QGLA 3AKIA 1W6PB 2VW1A 4XBNA 5T5PA 1GBGA 3T1LA 5CBLA 1HQWA 2P39A 2A6WA 3O4AA 3V0AA 4BLIA 4YW3A 1K5VA 3WCSA 5CAZA 1CE7B 1G9DA 3B69A 3CA1A 4K1YA 3WUCA 4C1WA 4HA2A 1LOBA 3MW3A 3QYDA 2VUAA 4ENDA 1W6NB 2PHFA 1DYPA 1H9WA 3AP5A 4GXLA 1J1TA 4AGVA 1BFFA 3WDUA 5DVHA 2DU0A 2A3YA 3ZXFA 4QBCA 2VW0A 1QOTA 3ZSKA 5D62A 4IZEA 4XDQA 2E4MA 1CPNA 1V6VA 4YFWA 4HR6C 1SLIA 2NTDA 1N4KA 2DVDA 4Q8KA 3VKOA 3SITA 2D6MA 2ES3A 5BP5A 2MLLB 1APNA 5SV8A 1FYUA 2PHWA 2A3XA 3POSA 5T5LA 5JVVA 4ZOTA 4XJ9A 3OJMA 5E8AA 3SH3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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