3N7KA

Crystal structure of botulinum neurotoxin serotype c1 binding domain
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
424
structure length
422
Chain Sequence
NINDSKILSLQNRKNTLVDTSGYNAEVSEEGDVQLNPIFPFDFKLGSSGEDRGKVIVTQNENIVYNSMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNEDSEQSINFSYDISNNAPGYNKWFFVTVTNNMMGNMKIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFEINKIPDTITSDSDNINMWIRDFYIFAKELDGKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYNKEYYMVNIDYLNRYMYANSRQIVFNTRRNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGGDILYFDMTINNKAYNLFMKNETMYADNHSTEDIYAIGLREQTKDINDNIIFQIQPMNNTYYYASQIFKSNFNGENISGICSIGTYRFRLGGDWYRHNYLVPTVKQGNYASLLESTSTHWGFVPVS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Identification of a Unique Ganglioside Binding Loop within Botulinum Neurotoxins C and D-SA .
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type C1
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 91
structure length 422
sequence length 424
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2010-05-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3n7kA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3n7kA02
3O0WA 4ZXKA 5IK5A 4Q2FA 2ZHLA 3WG4A 5EYYA 1AX0A 1LEDA 3AP5A 2VXRA 2WRYA 3CA3A 3CA6A 3V65A 1Z0HA 4M3CE 1FYUA 2DS0A 2H0BA 5HCFA 1GGPB 1TTUA 4Y24A 3V0AA 1APNA 1H9WA 3O3QA 1A3KA 1EPWA 2KH2A 2RSTA 4J2XA 4AN6A 6I1BA 1SACA 1MD6A 4EKXB 3VKOA 1WW7A 4G6JA 3A23A 4AVVA 3VT1A 2WNEA 1Q8SA 1PZZA 5JOWA 4FPYA 5LK5A 1HCDA 1LHWA 4NOTA 2AYHA 1RITA 1ISWA 1G9FA 2A3YA 4NO4A 2VW0A 4QKRA 4GWNA 4M3CB 3V0BB 3B3QE 5BP5A 3O5SA 1CVNA 2ARBA 1DQ4A 1MS8A 1W6OB 4YZ5A 4YG3A 4UW6A 1OFSA 1T4QA 3U4XA 4DENA 2FDBM 3WO2A 1AJKA 3BX1C 1DQ2A 4LO3A 4KEJA 4YG6A 1BZWA 1JT4A 2FMDA 3ATGA 5BYNA 4F34A 3RTIB 3WLUA 1NLSA 1FV3A 3MEPA 3OY8A 4I3NA 3AZVA 3ZX7A 3SH4A 1Z4SA 5AVAA 3RQ0A 4D0ZA 2PHRA 3WCSA 4XDQA 5KXEA 4ZGRB 4WVWA 4UW3A 4LBQB 4D69A 3VUOA 2M49A 4PQ9A 3W9TA 2EXHA 2FO1A 3BTAA 1C4RA 2GNMA 3PG0A 5JLVA 2OW4A 3USUA 1ENRA 3DGTA 2QYIB 5EWSA 2GNTA 1LOGA 5BP5C 5FREA 2PHXA 3AX4A 3ZXGA 2PELA 1SBFA 3PHZA 3D6EA 2WLQA 4FP2A 4USPA 2E4MA 3Q7WA 5GALA 2D23A 3UD7A 3AP6A 3W58A 4WBCA 3AH2A 3VKMA 4H9WA 2VW1A 3WDTA 3WOGA 5CAZA 1V6NA 3PVOA 1V6VA 1MS0A 1G9CA 3FJCA 4TZDA 1QQKA 5DZUA 2P39A 3ZXFA 3E8LC 3JU9A 3B9UA 2I2SA 3KM5A 4Z9WB 1S1AA 5GZEA 2YROA 4J2KA 2ZHKA 4BQ1A 3S8JA 2ET2A 1WBLA 1CONA 5DUVA 3WZ1A 1DQ1A 4J23B 5FZZA 3Q7XA 3A0KA 2Y9GA 4PC4A 4OWJA 1W6PA 4M3CA 4OEEA 1IOAA 4OW4A 1QMJA 2OUJA 1A78A 3WUCA 1UX6A 1W6OA 2E4MC 1G9BA 1KJLA 1TP0A 4II0A 4QALA 4GOVA 3TC2A 1Q04A 2JKBA 1RG8A 5DUWA 1IKQA 4GKXA 3R4UA 1LECA 3AKGA 5FNXA 1MC9A 2D7RA 2BQPA 2Q5TA 1XQNA 2E51A 4XXPA 1LTEA 4WZFA 2GN3A 1VAMA 3ZXEA 3FJDA 1LEMA 4LBNA 5F8YA 1BKZA 1QNWA 2W08A 3M3EA 2CTVA 3CA0A 2X2TA 3ZXDA 3N7LA 3CNAA 1N3OA 4Y26A 3NBNA 2D24A 3WMUA 3WO4A 1DQ0A 1S0BA 3HR9A 2WQZC 3M1HA 4M01A 2DREA 5DG2A 2DUQA 3BRDA 5DZFA 2DU0A 2P3IA 3ZSJA 3BAOA 3AJ6A 4JC1A 3IKWA 5D61A 2ENRA 1UMZA 2HWAA 5JOYA 1KRIA 1UAIA 1WW4A 2GNBA 4Y20B 4GKYA 4BLJA 2LALA 2FGFA 4HA2A 3AP7A 3OBTA 5GLVA 1DYPA 1GYKA 1BJQA 4XJUA 5T5PA 5IK8A 4FPHA 1V6JA 3BAHA 1DZCA 1W3FA 4AVSA 4L4HA 3R4SA 4AWDA 3SNVA 3PMEA 3H6SE 2GN7A 3WA1A 3BA4A 3BA5A 4LBLA 5CBLA 2JE7A 2D20A 1Q56A 2CYFA 1VCLA 3VEQA 2VY0A 5T5OA 4PBPA 1CIWA 1KITA 1O4YA 1HQLA 2NM1A 4FOQA 4XBLA 2Q9XA 4EEEB 1MACA 1XHBA 2VH9A 4R6UB 2ZBJA 3AXEA 1FQ9A 1S0DA 4TLPA 2UU8A 1JY0A 4QBVA 3V0AB 2DRYA 5T50A 1YXWA 1FX5A 3O4OA 4HR6C 3FLTA 1GZCA 2GMPA 3N7MA 1OQLB 3MPPG 3POYA 3ZPYA 1AVWB 3W59A 2ZGKA 2I1BA 2HYKA 1GV9A 2HW9A 5JVVA 2ZKNA 1YBIA 1KDKA 1KNMA 3CAHA 2WBCA 1HWNB 2DYCA 2B7YA 3ZXJA 3I2AA 5I1BA 2HZ9A 3LCPA 4YZ4A 4U2AA 3POKA 4AN7B 3FBYA 4EB2B 4GALA 2A70A 4I1EA 4ZA3B 4K1ZA 1ZM1A 3QLQA 3AYEA 4BLIA 4I4QA 1AJOA 3IM7A 1S0EA 4H55A 3LLPA 4XXAA 3BA7A 3M2MA 5GZFA 4Y22A 1JXNA 1PWAA 3AH1A 4R9CA 1AF9A 4XTPA 1JHNA 2ZAAA 3GALA 1ITBA 5SV8A 2ZGNA 1V6OA 3VWCA 3OY8B 1R8NA 4ENDA 3EF2A 1V6KA 3SH3A 2DUOA 2NP0A 4GOYA 1LHOA 2YV8A 1BA7A 3POSA 1ILR1 3O44A 4FOVA 3TAYA 1IS5A 2DTWA 3T2TA 4FOYA 4Y1YA 3NWKA 3GNEA 1F9KA 5E88A 2CY6A 2UWCA 3ZSLA 5GLTA 2EXKA 2E6VA 2XB6C 4ZOTA 1QDOA 3USUB 1XG6A 3NJ5A 2DWRA 4H04A 1OQ1A 4Q9GA 4L8QA 2ZGSA 3RRDA 1FV2A 5F5QA 4LO2A 1SR4A 1SLBA 2ZMLA 1IILA 3UD9A 1KQRA 3O4AA 2JJ6A 4FVVA 4FGFA 1HKNA 3CQAA 1JLYA 1B09A 3FFZA 1S0FA 2GDFA 4LO7C 1AFCA 1W0PA 5FNWA 3JUTA 4X37A 1JTCA 4BOWA 3F62B 4I4OA 2D1ZA 2EXIA 2A7AA 1AXMA 1TFMB 2WJSA 3MALA 4YM2A 2D6LX 1I1BA 3V64A 3M3QA 1AXZA 1J0SA 4TYSA 2Y9XE 5BXTA 4DEPA 1NUNA 4I4XA 2R49A 5GZGA 3WMVA 3AP4A 4I2SA 1ABRB 3IN9A 1LOFA 1AZDA 1GBGA 4I4SA 1DZQA 1IJTA 3UJ4A 2UUSA 1V6IA 4XBQA 2UWAA 2VSEA 3S8KA 1JUIA 2MIBA 2P23A 4WV8A 4DS0A 1JYIA 3ILAA 2JE9A 4I4UA 2CWSA 5GJ6A 5E24E 4EFQA 1TOOA 1I3HA 3T8SA 1JOJA 2PHUA 1W6NA 2KI6B 4PBOA 1YO8A 1W6PB 1LOCA 2JD4A 2ZHNA 3OJVA 1SLAA 1U0AA 1SR4C 2Y9WC 4LO2C 4IZXA 2R0FA 2JECA 2D3SA 3JUUA 1FN0A 2SBAA 1D2SA 4G9NA 5JOZA 4L4IA 1CESA 1SCRA 3ZSMA 3F1RA 3FJBA 4QBCA 1WLDA 3NV1A 3P6IA 1W3AA 4P0KA 2D22A 2IWTB 1IS3A 2KKIA 3CRGA 5H9SA 2ZGPA 3D5OA 4GP0A 4DCKC 4JQ0A 3H6RA 1MR5A 4YM0A 2A75A 5BQUA 4P0LA 3A4UA 5T52A 1ISXA 1QOOA 1LOFC 1WD3A 2Y9FA 4P0JA 1MS4A 1JT7A 3CA5A 4WVVA 1MS3A 4LBMA 4QC4A 4I1BA 4XFUA 1VALA 3FLRA 1X50A 5T54A 1MS5A 1S0JA 5HPZA 1S0CA 2X2SA 3BAGA 1Q1UA 4GA9A 4YW5A 3L2YA 2GNDA 2P3JA 3ILRA 3C9ZA 2TEPA 4XMAA 3OJ2A 2LTNA 1TEIA 3FJEA 1JT3A 2P3KA 2ZACA 2F2FA 3OYWA 2EIGA 3FJ9A 2E7TA 3P53A 5CA6A 5BXPA 2V5YA 1RINA 4XJAA 3HALA 3UD8A 4CTEA 4R9BA 2D3PA 3IIRA 4X38A 5F8WA 1N1YA 4M3CF 4IY8A 5BQUC 2A3XA 1TWMA 4P14A 1BFBA 2Z48A 1BASA 4Q26A 3APBA 2VXTI 2NN8A 3QYDA 1AVUA 3HMYA 4GAFA 4RL7A 2Q3NB 2GZBA 2ZGRA 7I1BA 3B69A 1ULEA 5T5JA 1YF8B 4J2YA 3VKLA 3AYAA 3BAUA 2A6VA 1QOSA 4YFZA 3Q9OA 5GAQA 1WBFA 3N7JA 2ZGMA 4YM1A 4YGCA 3A22A 1S0IA 1C57A 1C1LA 3BAQA 1BXHA 1MZ6A 4A7ZA 3PJQA 1CPNA 2GALA 2D7IA 3CRIA 3OPZA 5E8AA 1J1TA 1ISYA 2F2FC 1IHKA 1FNZA 4XILA 1HWMB 2Z49A 3NBEA 5DZEA 2R1DA 3UJQA 4DRRA 3UJOA 1MS9A 1A8DA 1Q8OA 2Z42A 1I1EA 1H30A 1WUVA 3INAA 3KMVA 4FPGA 4P9WA 2BEAA 4U36A 4YZ3A 5EC5A 3CU1B 1M16A 1FWVA 1BARA 2DVAA 1HQWA 5IT6A 4A7KA 5B2HA 5FZUA 4DFSA 4FP3A 3A0NA 4Y22B 4LO7B 5EYXA 1UL9A 4I96A 3HOMA 4USOA 1V00A 2A6ZA 1G82A 4P9XA 4LO1A 1AVXB 3AKHA 2UURA 2VW2A 1M2TB 3FGMA 3AJYA 5DUXA 1LGCA 1G8WA 1PUMB 4LBOA 1FGAA 1PZ7A 1K5VA 3VSZA 2AH2A 4YW2A 1T9FA 1YTOA 2WT0A 1DIWA 5HCAA 3VT0A 5IUQA 2C5DA 1DBNA 1WW6A 4ATFA 3AFKA 1DYKA 4XZPA 1LENA 3ASIA 3NBDA 3FUQA 5T55A 2NZ9A 1P63A 5T5LA 1Q03A 3WINC 1NZKA 5F8SA 4YGEA 1WLCA 4X3AA 2DTYA 2KM2A 1EV2A 3RG0A 1CN1A 3POWA 3AJZA 3AH4A 1GSLA 2YZ4A 2CL2A 5GM0A 1G86A 2K4AB 2ZR1B 1AXKA 4ZLBB 2A71A 1AXYA 3WDWA 4KC3A 4LO1C 4JKQA 3NBCA 1N3PA 1N1TA 2ZMNA 5FZYA 4AYUA 3AXDA 2WSUA 3T1MA 2W52A 3MW2A 2GO2A 4FPCA 3I4IA 1W6QA 3WV6A 1ISZA 3I8TA 5DUUA 2DVDA 4BMBA 1DHKB 2A5ZA 1JBCA 1HIBA 5EHAA 2ZZJA 3FJ8A 2W68A 1JN2P 1DZDA 3WHTA 2KI4A 4FPEA 1QXMA 4LBQD 2R0HA 2FFVA 4EFRA 1QF3A 3N35A 3ENRA 4XTMA 4XKIA 5L73A 3O0VA 1W6NB 4IQPA 5H9QA 5CNAA 3ZXKA 1IS6A 4ZKTB 4I30A 4D0TA 4R9AA 21BIA 1ENSA 4JCKA 2ZGOA 1LJ7A 1SLCA 1ISVA 2A6YA 5CB7A 4P9YA 3OGFA 2ZGLA 4Q91A 2AUYA 5F9TA 1H9PA 4XOGA 5F90A 5IK4A 1DFQA 1UPSA 1LHUA 4K20A 1YIFA 1IRAX 2CWMA 5GLZA 4ISQA 2MLLB 1CJPA 4HANA 1II4A 3I2XA 3H6RB 2RHPA 2UWBA 1FATA 4C1WA 1SBDA 2P37A 1ONAA 4JPZA 1AX2A 3A07A 5D63A 2ARXA 2F8XC 2AAIB 1HLCA 4OWKA 3OBRA 5EG6C 1GLHA 1CPMA 4ISRA 1V6UA 4MYEA 5DUYA 4XFSA 4XHXA 1WW5A 2DUPA 3VSFA 3CA1A 3UDAA 2ZGTA 1W3GA 4I4YA 4GXLA 1BLAA 4PF5A 1HDKA 2QN4A 3O4CA 4ZFYB 1GANA 4YW3A 1MVEA 4XMIA 3N7KA 1BFCA 4EFPA 2KLLA 2L5XA 5BOWA 3H0OA 3OYWB 3OJMA 4I8MA 4Z8BA 1CR7A 1YRZA 4KEIA 3SNMA 1IKPA 4FPLA 1SLLA 1FMMS 1S0LA 1W6MB 4Q9PA 1F5FA 5JMCA 1HCEA 3AZZA 2PHWA 5GLWA 3AYDA 4JP0A 1TIEA 4DQAA 1ZA4A 2D3RA 1DJSB 3O4BA 3P6JA 3QCWA 4FOWA 2NTDA 2NMOA 3NV2A 2JDZA 3WDXA 4AGRA 4CJMA 3VV1A 3VT2A 1Q8PA 2LIQA 4QD2C 4CRQA 1QOTA 4Q8KA 2XOAA 3AZXA 4P6AA 5BXSA 3D7WB 1V6MA 3AJ5A 1CE7B 4UW4A 3AZWA 2E7QA 2EALA 4SLIA 1L2HA 2E53A 4YGBA 4C1XA 1QQLA 2VLCA 3M3OA 3IPVB 3SH5A 1CVSA 2ZQNA 1SZ6B 1GNHA 3WVJA 5GLUA 2A6WA 2ZABA 3TB0A 2RG9B 1UN1A 3FJKA 4FPKA 3LSEA 3FJIA 1V6WA 4XYXA 1WLWA 1LHVA 4IY9A 1URXA 1UZYA 2VUAA 2D6KA 4LO0A 1V6LA 4R9DA 1LHNA 3MW4A 1Z2VA 4XJ8A 4J2SA 1LGNA 2OVUA 4KBBA 2MC2A 1LGBA 2K8RA 3WUDA 5H9RA 4DPNA 1WD4A 3WHUA 4GP3A 4JRAA 3BRGC 1BLDA 1RY7A 2WSVA 1GZWB 4I37A 4YFWA 4HJJA 3ZSKA 2OUHA 1GICA 1G7YA 4YGDA 2ZGUA 3ILNA 4BMEA 4QO3A 2NMNA 3BODA 2A6XA 2D6OX 3R05A 5DZGA 1DFCA 4I6IA 2BEBA 4XJZA 1ULCA 4XHBA 4YM3A 5KXDA 2RQ9A 2V73A 4XE9A 4I4VA 4GWMA 2FHRA 2IHOA 1N1VA 5JDBA 2D6NA 3AZYA 3O4DA 1JYCA 2NYYA 1SBEA 4W65A 4Y1XA 2R1BA 1GNZA 3JRRA 2C9AA 1SLTA 4OZXA 5H9PA 1ONKB 3OGGA 4LO0C 1W6MA 2GMMA 4IHZA 4JKXB 9ILBA 2WT2A 2DVFA 3NV3A 1DGLA 1N1SA 2WT1A 5HCBA 4DRVA 1XYFA 1FWUA 4YW4A 3HBWA 1VIWB 3O5WB 2W39A 3RS6A 4K1YA 4LO3C 3RSJA 2YY1A 4F83A 4RA0A 3LSDA 5E89A 1RMLA 1QNYA 3O49A 2YXSA 1LODA 4ZBVB 1YI7A 1QGLA 2VU9A 2AREA 4K21A 1UKGA 5GZDA 2AENA 4XJWA 1W0OA 1ULFA 8I1BA 4IYBA 2D44A 4QKSA 4KEKA 1W6QB 3H6QA 1PC8B 3FJJA 1HWPB 3SITA 3WG3A 3IM0A 3IPVA 5DXDA 4YZ1A 4BPZA 2ERMA 2VSAA 2AQZA 2ESUA 2GMEA 2HWMA 2DVGA 4OWLA 4OEGA 5DSSB 3BOPA 1WBCA 2ZGQA 2G4IA 1AVAC 1TWEA 1C1FA 3FJAA 3AKIA 4D8HA 1AVBA 2PHTA 3UL2A 4LBJA 3B01A 3HN1A 3WDYA 3FUOA 3V0BA 3LTQA 4I7IA 4XIKA 2DVBA 1SCSA 1ULDA 3ZYPA 4BM8A 1BFFA 3IM6A 4ITCA 4G1RA 4Y1VA 3WINA 4JAWA 4I4PA 5DVHA 1QKQA 4A7YA 2NVHA 4UW5A 3UK9A 1N4KA 3RMXA 3N3HA 1MZ5A 2AGSA 5KXBA 5JOXA 3BRFA 3T1LA 2SLIA 2D6MA 1GZWA 41BIA 4G9MA 1MVQA 4X39A 4ZFUB 4OUJA 3C2UA 5G00A 3HSMA 3WG2A 1EVTA 1BYHA 3WCRA 2D6PA 4ASMB 1S0GA 3WDUA 2ZA9A 1FMZA 1XZZA 3BADA 1UZZA 1IRPA 4XFTA 4LBQA 1DQGA 1LU2A 4G6MA 1D0HA 1DLLA 1LULA 2LIEA 4QD2B 1CQ9A 2AR6A 1SFYA 1QDCA 4OEFA 4PCRA 2FFUA 3PVNA 1PZ8A 3CA4A 3B9CA 4Y1UA 1JLXA 1O4ZA 1ULGA 2PHFA 3ZXLA 3N0KA 4YG0A 3Q7YA 1QU0A 3AP9A 3AKFA 4IONA 4YZ2A 1FAYA 3WNXA 4YOLA 2A3WA 2K43A 1RIRA 3SLIA 1DQ6A 2YMZA 1JT5A 1PZ9A 2XG3A 3BB2A 4Q1RA 2DV9A 4FPOB 2ZQOA 4IZEA 2CNAA 1N47A 3WO3A 1IS4A 3O12A 1VLNA 3N36A 1KDMA 1F31A 2D43A 4Y1ZA 2D7FA 5BXRA 2ZMKA 1R8OA 1NXD1 1Y7BA 2ES3A 4LO8B 2AXMA 5FRAA 1JW6A 3AK0A 2EAKA 4LBKA 4FPJA 2R16A 4AVTA 3ZC8A 2YUGA 3ZYRA 3IM5A 5KXCA 3K1XA 1V6XA 3UJ0A 3D4KA 4Q27A 3PVEA 5GZCA 3ZC9A 4ZFWB 1AX1A 1LESA 5DG1A 3V79C 4XBNA 3SISA 1G9AA 1WCSA 4FQZA 4YLZA 2R9KB 2EF6A 1RZOB 3VKFC 1PUUB 2AFGA 2DU1A 2P34A 3DUIA 3RTJB 2WKKA 3ILFA 3IMNA 4I4RA 3BAVA 3RMYA 1N3QA 4XIOA 4CZSA 4FPFA 1Z78A 1GZ9A 1VAVA 1LOBA 4M00A 5BVPI 31BIA 3B00A 1DQOA 1HKDA 2DRZA 1DQ5A 3M3CA 1FNYA 3KQRA 1SLIA 3I29B 1OKQA 3WDVA 3FJHA 4GAIA 3WG1A 2BFHA 4Q8LA 1YYNA 4AGVA 1EYLA 1MS1A 1Q8QA 4I0YA 1R1ZA 1Q8VA 3BIWE 1G9DA 2EXJA 1HWOB 4Z8SB 4Y20A 1ENQA 2ZHMA 3PUBA 3A21A 3MW3A 1BFGA 1BQPA 4YW1A 3QR5A 4XJ9A 4AGGA 5IK7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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