1ISVA

Crystal structure of xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86 complexed with xylose
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
436
structure length
436
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGSSTPPPSGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces olivaceoviridis
publication title Crystal structures of the sugar complexes of Streptomyces olivaceoviridis E-86 xylanase: sugar binding structure of the family 13 carbohydrate binding module.
pubmed doi rcsb
molecule keywords endo-1,4-beta-D-xylanase
total genus 163
structure length 436
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2001-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1isvA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1isvA02
3WF1A 4JP0A 1OSEA 1ISYA 3DYPA 5BWFA 3AYSA 5D9MA 5FZZA 1UD8A 1KXQA 2XM2A 1PX3A 4XX6A 2KH2A 4GZEA 3WQVA 3WINA 5ABHA 1E5JA 3OBTA 1FFRA 1JZ8A 1UA7A 3K4AA 4TVCA 3FJJA 3MUAA 2WSPA 1CLXA 3AS1A 4LGXA 3RILA 2F2HA 3T08A 3VD5A 5I3DA 2DSWA 3DHUA 3H6SE 4A7KA 1XYFA 4BQ4A 4ML4A 3VDAA 1G01A 4RE2A 3F5LA 1Q6EA 3GM8A 2VJXA 3NBNA 3BAQA 4GO8A 5I5RA 1BLIA 3BSHA 4CCDA 3CZ8A 2VX7A 3WFZA 5HOSA 5F7UA 2G3NA 1V3JA 5A1AA 2BS9A 3CA1A 4KEKA 2GJRA 3ARRA 1B90A 4OBRA 4IQPA 5FCZA 1JZ5A 3VIHA 1UKTA 1JTCA 2W91A 1A8DA 4JHZA 3UEQA 1ONKB 5A2CA 4FVVA 4G6MA 2JIEA 3EMQA 3OA5A 4EFPA 1R7AA 4PTMA 1B0IA 4MTVA 4TXEA 2WSKA 1IRAX 3Q7XA 1E1EA 5A6AA 3I2AA 2GO2A 5IDIA 5JUVA 1V6XA 5A69A 3NJ3A 1ILR1 2FH6A 1Q04A 4W5ZA 3SCOA 4HPHA 3CQAA 3W38A 4D6IA 4WKFA 5BCAA 1XH1A 4D6GA 4PMOA 1W3LA 5DT7A 3DECA 4TLPA 4ACZA 3IJ9A 3AZVA 3H6RB 4ZBVB 4QALA 2VRKA 3CGTA 4J3WA 5DMYA 3CHDA 4W8LA 3GH4A 3T2QA 5M3WA 4BQ5A 3MANA 1JF5A 1K5UA 4URIA 2O92A 2X0YA 2EPLX 2ZR1B 4H7VA 1D3CA 4LO7B 2YIHA 1CGWA 1EOKA 3RCNA 1W2VA 1AVUA 2BEAA 4GOVA 4JRAA 1H09A 4OEEA 2D7RA 3O49A 1IILA 1UKPA 4W85A 3HU7A 1AQ0A 2IXUA 1UYQA 2XIBA 2HW9A 4MAVA 3CA0A 2VZOA 4I4PA 5IXEA 3N7MA 1W3GA 2E4TA 3AIWA 5I1BA 2AXMA 1V6VA 1W3KA 2XWEA 4U2YA 3NBCA 5A6BD 4MDPA 1B2YA 1UG6A 1JDDA 4I7IA 4JFWA 1N4KA 3ZR6A 5A2BA 2J74A 5CSUA 3UG3A 3AS3A 1H5VA 4OIFA 1WDQA 4L4IA 2CBIA 1MXDA 2V38A 5AY7A 4HTYA 4AZBA 3WUBA 4I0YA 1XHGA 1E0OA 2OYLA 2XTKA 3W0KA 1PIGA 4QCEA 2FHFA 1FWUA 4I4RA 1A47A 2A3AA 1EHAA 3W4RA 1W3AA 1VENA 2ZWZA 4H8VA 3WD4A 5ABFB 3AMLA 3WNMA 1DTUA 2W62A 1XZZA 2XYLA 1K5VA 4HU0A 2V5CA 3WQ5A 1G9CA 3R4SA 1NM9A 2YBUA 2AAIB 2OWWA 2WVSA 1E3XA 1FMZA 5A6MA 4XV0A 5GNXA 1EDQA 3K46A 2DS0A 4CGTA 3VIFA 4UFLA 4DEPA 1MQQA 4LO1A 4GOYA 1BYCA 2EPKX 4MADA 1GPFA 3AXXA 2ZUMA 3FW6A 5BVPI 4D6HA 4GI9A 2PWGA 2WVTA 2CKRA 2YLAA 1K9TA 6A3HA 4J3TA 1BYAA 4PMZA 4AZ5A 1UZ1A 4LO3C 2X09A 4FGFA 2AOSA 4MAZA 3WY1A 3ZIZA 4KC3A 1G9BA 1UWTA 2HVMA 1GOQA 4PMXA 3ZSSA 2PBOA 4D6FA 2OYKA 4ZENA 4LYPA 5CXPA 4JFVA 1DWHM 1FH9A 1F4HA 4U33A 3FAWA 2DSZA 4ZA3B 1CZ1A 1GVYA 4Z2GA 5HXMA 3BAUA 1XSIA 2DSUA 4MNLA 5D9NA 1RD6A 3ZXGA 1JT3A 1HJVA 4H41A 3VGFA 1EA9C 1PJ9A 4QKSA 2JEQA 4ZXOA 2RQ9A 2Y2WA 4DENA 3W6LA 2AFGA 1TIEA 1HN1A 1FGAA 4C7DA 3MMDA 1EDTA 3OLIA 3VM7A 2GZBA 3EYPA 2XFYA 4B3LA 3PZTA 1R85A 1W9DM 4GPNA 3SCTA 3KE0A 3MV11 2VXRA 4LQ1A 3RTIB 2YL6A 4WSKA 1HKJA 4NRRA 2CEQA 4HOZA 3IJ7A 1H41A 2J8GA 3S6TA 3WDHA 2DDXA 3T09A 3CZJA 3WA1A 2YOCA 3CRGA 3WF2A 2F8QA 2D43A 3VGHA 1ODUA 4PSPA 2CERA 4PRWA 1HXJA 1MVYA 4ZXLA 1BFFA 1BARA 3NJ5A 3BX1C 1OGSA 3NUKA 1Q6DA 1TA3A 3FHQA 1WP6A 1S0BA 2MC2A 1WB0A 3V0BA 5LA0A 2J47A 3TTOA 3TP4A 4B9YA 4QD2B 2K8RA 3CA6A 1HP4A 1KCLA 3SEPA 5AYIA 4LO2C 5F90A 2Z49A 3K8MA 4W8BA 7TAAA 3PTMA 3WBEA 2F2FC 4HOWA 4X0VA 1PPIA 4W8AA 1AMYA 1E6NA 3BB2A 2OSWA 1FP9A 1RP9A 3UCQA 3AFBA 2DRZA 5JMCA 5I2UA 2WHJA 2PBGA 5F8YA 3POKA 3OGSA 4H2CA 4OZOA 3WD3A 1M03A 3AIVA 5D9OA 2D3LA 5GAQA 1BFNA 2BXZA 2ZXAA 1M04A 3FJFA 1D2KA 1R8LA 7A3HA 1MQRA 3HJEA 4HMCA 3FJ8A 2VZUA 4AZHA 3L4WA 3SCPA 3SCVA 2FFVA 2Y9FA 1UKQA 2AMGA 2XWDA 3GXMA 2CBVA 4UQAA 5E24E 3HMCA 3ZXDA 1RH9A 1C8QA 3N15A 1SMAA 1JLXA 4J2YA 3WENA 2V3EA 4JFUA 1KWKA 1GQLA 3WH8A 1OT2A 2ZUVA 3ECQA 4DUWA 3RTJB 1MXGA 3WQ8A 1JNEA 3P6IA 1NH6A 4UOJA 1DFCA 3AJ6A 2ZX7A 2VZTA 5JBEA 1L2HA 1YTOA 4DWSB 3IAGC 4NF7A 1EO7A 3RMEA 1AVAC 2DPEA 5I24A 1BLAA 2YUGA 1MFUA 4FLQA 4Y7EA 1V0MA 1DWFM 1EPWA 1VEPA 2BXYA 4CVUA 1XGZA 4XB3A 1HVXA 4AIOA 3CTTA 4LO0C 3FNDA 2PWDA 3BC9A 3N7KA 4HA4A 5DO8A 4I6IA 4UNIA 9ILBA 2CCRA 2XPKA 4AZGA 4N0RA 3VT0A 3ZM8A 3W53A 1EIBA 1MW2A 2BY2A 1X1NA 5GPRA 3BAKA 3AXIA 3AICA 3GDBA 2FH8A 2VRQA 3AKGA 1J11A 1JDAA 3AHXA 7CGTA 2GFTA 4ISRA 5IHRA 3FHAA 4KGJA 1US3A 2VL4A 2QF8A 5AC4A 3H6RA 2E8ZA 2WHLA 3CIVA 5LYRA 5CGTA 2VSEA 3WMVA 3BAVA 2OSXA 4ZE4A 3UD7A 4QBCA 2M49A 2VR4A 4YHEA 4UCFA 4CD6A 3MU7A 1K9EA 4PTWA 4D8HA 1HVQA 3ARVA 5D9PA 5BRQA 3W26A 3EDKA 1HCDA 4JKMA 4TUFA 1I75A 3ZJ7A 2XM1A 1BVNP 2A3CA 2CIPA 1QHZA 4M80A 4YHGA 1FH7A 2VC9A 1GUVA 3PMEA 4D0TA 5A6JA 4USOA 3O6AA 3L4UA 1MWOA 4AMCA 1FQ9A 4UOZA 4L4PA 3LPPA 5CSYA 4D6CA 1E55A 2OSYA 3MO4A 3WH5A 4DUVA 4J2XA 1UD5A 4R5EA 3PZOA 2WVVB 1GGPB 1XCWA 4IY8A 2XVPA 5A6KA 1L0PA 4L4HA 4H04A 1KGXA 1EQCA 4D6DA 4DM1A 1E4NA 2RGLA 2XVLA 3SNVA 2Y8VA 4KEJA 3ALGA 2D2OA 7I1BA 1HWNB 1BHGA 3LMYA 2D0FA 4F79A 1CXFA 2ZE0A 3CO4A 3HSMA 1V3HA 3PZMA 3SUVA 1Q1UA 1B1YA 3GTNA 4UTFA 2ESCA 5ABFA 2WCAA 3AOFA 4MNMA 5BRPA 3QGVA 4PCTA 1UUQA 2WM0A 5D8ZA 5A6SA 2DT1A 5HBFA 4OUJA 1JLYA 1BF2A 1D0HA 3Q7WA 3MS8A 4EAMA 1Z0HA 3GXIA 1DQGA 2BHZA 3AKFA 3VM5A 3GNOA 1R86A 5CPQA 4CU7A 1F31A 3OLGA 2Y4SA 4I1BA 4HZ8A 2WVUA 5BQUC 4A3YA 1V08A 1HJQA 4I3NA 5CLWA 1MD6A 2VX6A 2WWCA 3Q7YA 2OWCA 5HNNA 1TMQA 3IM5A 4HJJA 1ODZA 1W9VA 3K8LA 4HMDA 2CXGA 4AWEA 3BLKA 1V02E 1M2TB 1JG9A 3IANA 4OWJA 5FNWA 3VKKA 1BG9A 5AC5A 3OJMA 1BG4A 2J3PA 4CU8A 1UHVA 5IHSA 3A23A 1WBCA 1UH2A 1TFMB 3WINC 4ZEPA 3TA9A 1Z4SA 3ZT6A 2BHUA 3ARQA 3QR3A 1FP8A 4I4YA 2BNJA 4LX4A 4B9ZA 3GZAA 1ITCA 4PMNA 2XSBA 5I78A 4GXPA 3W82A 1QNQA 5CGMA 1BQCA 4LYRA 1Q4NX 2AAAA 1SZ6B 2J62A 2C0HA 4BS0A 3M6DA 2D22A 3KL0A 1ESWA 2D0GA 4MJ2A 3BAYA 4ZFMA 4OEFA 4E8DA 4AN6A 4S3JA 1S0FA 2FHCA 2O9RA 3NCOA 3K8KA 9CGTA 3O5WB 1QHPA 4AYSA 3CPUA 3NYDA 4P7RA 2DT0A 4J3UA 3BGAA 1ZBWA 2QV4A 3EDEA 4EB2B 1GZJA 1AQHA 2X1IA 3VDBA 2WC3A 3UETA 1DFQA 1NUNA 2KKIA 2W61A 1E4IA 2J7FA 3FAXA 3I3EA 3P53A 2BHYA 3PTQA 4EFRA 4KBBA 1VFUA 4HZ6A 4Z2KA 1QBBA 1GHSA 5M03A 3RJYA 2WHMA 1WZMA 5LA1A 2E8YA 1LWJA 4P6AA 2X2YA 1I1BA 3U5YA 1GHRA 3D3AA 1EH9A 1PC8B 3WEOA 2WHKA 2NTDA 1BYDA 3CMJA 3PZVA 3HOMA 2CETA 4M8UA 4I4UA 3KL3A 3VMNA 1Q6GA 1W3FA 4AZCA 2NZ9A 2E0PA 4QAWA 2WMJA 5I79A 2EXOA 4EKXB 2XFRA 3KWXA 4A3HA 3QHNA 4KMQA 1FN0A 2E4MA 4J7RA 5I6SA 5BXRA 1GJWA 3WMUA 4HMEA 1IV8A 1KWGA 3P6JA 4JKLA 4WKAA 1HKNA 1NWSA 2GSJA 1H4PA 4P8VA 2DSVA 2WMIA 1KXHA 4U3AA 4F34A 3B8SA 1UR9A 3BRGC 3OJVA 1JGIA 2GJXA 4HA3A 5D61A 1UR8A 1W9XA 1JAKA 2O9TA 1AVWB 5A94A 1HKMA 2J7DA 3J7HA 5EFDA 3ARPA 3CRHA 4OOUA 1HNYA 21BIA 3S8JA 3WO2A 3O44A 3WNPA 2Q3NB 5E6ZA 3T2PA 4I1EA 1H2JA 3BAHA 2PC8A 3D7WB 3WD1A 2CKSA 4H8HA 4V27A 31BIA 3VD4A 2DREA 3BAOA 1KQZA 4HA1A 3W25A 4OBSA 5A6LA 3LPFA 4W86A 4GINA 5A3HA 4OKDA 4KEIA 5BROA 2PI6A 3WIJA 1YXWA 3G6LA 1X6LA 1XCXA 3EDJA 1OGGA 1ECEA 4DWSA 1DEDA 3WQWA 1OIFA 5LA2A 1E6XM 3T0BA 1ITXA 5FOOA 1WE5A 2YL5A 4D6JA 3VDCA 4BQ3A 1IHKA 1GCYA 1VBUA 4EFQA 3VSZA 2W67A 3SUTA 4XKIA 2ZX5A 2GK1A 4UR9A 1U2YA 1HIZA 4QC4A 1DQOA 2Y9XE 1WDRA 1DLLA 3AS0A 4USPA 4EANA 1UD3A 1V3LA 4KGLA 3LTQA 2CNCA 1ZBKA 5E6YA 2BY1A 1VJZA 4AY1A 3WUGA 2UY2A 3K1XA 2ZWYA 2XIIA 1CXLA 4ZFWB 3WDRA 1QI2A 2WMKA 4LO1C 4TTUA 5M5DA 3AZRA 4KRUA 4MPKA 3FUQA 1I1XA 4LO8B 5GQBA 3B9AA 1R87A 1UA3A 1G94A 1UQYA 4DCKC 1MYRA 3O3QA 2ZUWA 4JIEA 4CCEA 3A4XA 1NP2A 2YJQA 1FV2A 1MC9A 4MB3A 3NDZA 4GQRA 2QHAA 3DC0A 2D20A 1MW1A 2FFUA 3LPGA 2NM1A 3BA4A 3M46A 1B30A 3KL5A 4PYSA 4Z2HA 2DRYA 4QKRA 1LQ0A 1PZ3A 2G3MA 4KH2A 2O9OA 1J18A 3MALA 4IPLA 3F5KA 2X2TA 2XFFA 4IONA 1S0GA 2JF7A 2WXDM 4CD7A 1KBBA 4P7OA 2YA1A 3PZQA 2DT2A 1CGYA 3OJ2A 3SURA 1UPSA 1B3WA 2MLLB 1J0IA 1BVZA 5EBAA 3K4DA 1JFXA 3VU2A 1LWHA 1HWPB 2GDUA 3K1DA 5A8PA 1UR0A 3CHFA 3EBVA 3VO0A 1W9PA 5CG0A 2V3DA 2YL9A 2WVVA 4IYBA 3VOCA 4JKQA 2DIJA 1NOWA 3ZR5A 3ZT5A 3CMGA 3VIPA 3G6MA 2DIEA 1JT4A 3WF0A 2QLYA 1E70M 4IISA 1X6NA 1E6SM 4M24A 3WSUA 1E9LA 3RSJA 3O4BA 4MNJA 3BRFA 3U7VA 5CPTA 1JNDA 1M01A 1KNMA 4PMUA 2ZXQA 3CAHA 1UD6A 1TCMA 3NIYA 3WO4A 2VT0A 4IUGA 4CN6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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