4ZKT | Genus

Total Genus 271

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	271
sequence length	1159
structure length	1114
Chain Sequence	KINGNLNIDSPVDNKNVAIVRSRDVFFKAFQVAPNIWIVPERYYGESLKINEDQKFDGGIYDSNFLSTNNEKDDFLQATIKLLQRINNNVVGAKLLSLISTAIPFPYENNTEDYRQTNYLSSKNNLVIFGPGSNIIKNNVIYYKKEYAESGMGTMLEIWFQPFLTHKYDEFYVDPALELIKCLIKSLYYLYGIKPNDNLNIPYRLRNEFNSLEYSELDMIDFLISGGIDYKLLNTNPYWFIDKYFIDTSKNFEKYKNDYEIKIKNNNYIANSIKLYLEQKFKINVKDIWELNLSYFSKEFQIMMPERYNNALNHYYRKEYYVIDYFKNYNINGFKNGQIKTKLPLSKYNKEIINKPELIVNLINNTVLMKSNIYGDGLKGTNFYSNYIIPYNHSINYSYLDNVNIEEIEKIPPINDEDIYPYRKNADTFIPVYNITKEINTTTPLPVNYLQAQMIDSNDINLSSDFLKVISSLVYSFLNNTMDYLEFIKYDKPIDTDKKYYKWLKAIFRNYSLDITETQEISNDTKIIPWIGRALNILNTNNSFVEEFKNLGPISLINKKENITIPKIKIPSSMLNFKDLSENLFNIYCKNNFYLKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMASKSVLAQEKLIKKLIQKQLRYLMENSNISSTNLILINLTTTNTLRDISNQSQIAINNIDKFFNNAAMCVFENNIYPKFTSFMEQCIKNINKSTKEFILKCTNINETEKSHLIMQNSFSNLDFDFLDIQNMKNLFNSYTELLIKEQTSPYELSLYAFQEQDNNVIGDTSGKNTLVEYPKDIGLVYGINNNAIHLTGANQNIKFTNDYFENGLTNNFSIYFWLRNLKQNTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFENDGLVFNIIDSNGNEKNIYLSNISNNSWHYIVISINRLKDQLLIFIDNILVANEDIKEILNIYSSDIISLLSDNNNVYIEGLSVLNKTINSNEILTDYFSDLNNSYIRNFDEEILQYNRTYELFNYVFPEIAINKIEQNIYLSILNFKPLKFKLLNQYVQKWDEVIFSVLEKYLDISTTNNRIQLVDNKNNAQIFIINNDIFISNCLTLTYNNVNVYLSIKNQDYNWVICDLNHDIPKKSYLWIL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Hydrolase/toxin
publication title	Molecular Assembly of Clostridium botulinum progenitor M complex of type E. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Bontoxilysin A
total genus	271
structure length	1114
sequence length	1159
chains with identical sequence	D, F
ec nomenclature
pdb deposition date	2015-04-30

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
B	PF01742	Peptidase_M27	Clostridial neurotoxin zinc protease
B	PF07953	Toxin_R_bind_N	Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B	PF08470	NTNH_C	Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1120.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain	Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain	4zktB02
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	4zktB03
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	4zktB04
3.90.1240.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Zincin-like	Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like	4zktB01

1GNHA 4BLIA 3RRDA 4AWDA 1HCEA 3KQRA 4R9DA 4J2SA 1AVBA 4PCRA 3AJ6A 2GNMA 4JCKA 5D63A 1Y7BA 2MLLB 3BRFA 4Y24A 3NBCA 2BEBA 1Z2VA 3BA5A 4ZBVB 3WO2A 1WBFA 2UUSA 3OGGA 3GALA 4TLPA 1KQRA 4OEGA 1FGAA 3PVNA 1AX1A 1MZ5A 1R8NA 1FX5A 5BQNA 5GLTA 3RG0A 4A7YA 1W0PA 2ERFA 1QDOA 3WOGA 3RTIB 8I1BA 1FWUA 2QYIB 2ZAAA 2A70A 4FPOB 3QIZA 4LBQD 1ISXA 3WUDA 2CWMA 5KXEA 4LO1C 4YGCA 5KXCA 3VKOA 3BWIA 3B9CA 3D5OA 3TC2A 1IS3A 1ILR1 2UWBA 3BAUA 4YW3A 3WDUA 1ZL5A 3HSMA 2YZ4A 4FP3A 4UW5A 5IK5A 2XOAA 3DUIA 3D6EA 1V6IA 5BXRA 2DS0A 3QW7A 3CRIA 3AZWA 4P14A 1ENSA 5D61A 3T1MA 4YG6A 2DVFA 1EYLA 4BMBA 2A6YA 2JD4A 4L4HA 2RQ9A 4J2YA 4C1XA 2KI4A 4L4IA 4Y20B 1CJPA 1ULEA 1GBGA 1FV3A 1HQLA 3V79C 2FO1A 4ISQA 1WW5A 4M3CF 4DEPA 3USUB 3WG1A 3CA5A 5HPZA 1ULDA 1EV2A 4DENA 3CAHA 5GAQA 3OJ2A 4XFSA 1TIEA 4FPFA 2GMEA 4K20A 2ZQOA 3CRHA 3QCWA 1XQNA 5F8WA 4Y1YA 4AGGA 2YUGA 5IK4A 3HMYA 4YZ2A 2J3PA 4SLIA 5GALA 1N3PA 3UJOA 4JRAA 2DREA 3VKLA 4H55A 4TZDA 3VKNA 1WBCA 2VH9A 5EXOA 3NV2A 4ZA3B 3WMVA 5HCBA 2Y9GA 3AKGA 3FJAA 3ENRA 2PHUA 1FQ9A 2QN4A 4IY9A 2GN7A 4LO0C 1V6UA 2JJ6A 4FOQA 4LBOA 4XFUA 1XHBA 4KEIA 1FAYA 4LO3A 1BFCA 4P0KA 1AX2A 4K1ZA 1ZKWA 2P39A 1WD4A 1JW6A 1HCDA 2WSVA 4WZFA 3N0KA 1W6NB 3INAA 1DJSB 2PHFA 5DUWA 3JRRA 2A6ZA 4K1YA 5T54A 2YROA 1Z4SA 3O4AA 1LJ7A 4XMIA 1Q04A 1NLSA 3ZPYA 3PMEA 2ZGNA 2F2FA 1ZB7A 1OFSA 1DQ5A 4X3AA 4EB2B 4YFZA 1MS3A 4DRVA 3U4XA 2HW9A 3QR5A 4JKXB 5GZFA 1JLYA 5FZYA 1G8WA 2VXRA 2CY6A 3V0BB 1LGCA 4LBMA 3CA6A 4I4QA 3O5WB 1BQPA 4PQ9A 2PHTA 2DUQA 3UJ4A 1S0BA 1DQ6A 2YXSA 2R16A 2BQPA 3IPVB 1JN2P 2Z42A 5JOYA 4CJMA 1GANA 3HN1A 2E4MC 4AN7B 1ZL6A 5FRAA 2MIBA 2JECA 3TAYA 3FJCA 3AP6A 3PUBA 5IK7A 5HCAA 4RL7A 1ONAA 1S0CA 5T5JA 2W52A 1QDCA 5GZEA 3Q9OA 4H04A 4ZFYB 3JUUA 4YM3A 3VKMA 1N4KA 4XKIA 3PJQA 3EF2A 2CYFA 3S8KA 2R49A 1W6MB 2ARXA 2ZGUA 4OWJA 4OEEA 2ENRA 1LOGA 3RMXA 1YBIA 3CA1A 4UW4A 5DZFA 3AH4A 2V5YA 2ERMA 2HYKA 4P6AA 1Q1UA 2ARBA 1CR7A 1Z0HA 3A0NA 3W9TA 3AZXA 2JDZA 4JPZA 4USPA 1XG6A 2FHRA 1SLLA 3WO3A 2GO2A 3BAGA 2BFHA 1BFBA 5GLZA 3IN9A 4XJAA 2CTVA 3ZYRA 1W3AA 5EWSA 5GZDA 4AVVA 1TWEA 1WD3A 3I8TA 3UD9A 4HEVA 1Z78A 5BXPA 4YGBA 1PZ7A 4CTEA 1V6KA 4FQ4A 3FJHA 2ZKNA 2NTDA 1RY7A 4XJUA 3AJYA 4XIKA 1LHUA 2ZABA 4LO3C 2B7YA 3SISA 1AX0A 21BIA 2G4IA 3VT2A 1O4ZA 2GMMA 3B9UA 3QW5A 2D43A 5G00A 1S0DA 5T5LA 3PVOA 3AP9A 2OW4A 1CQ9A 4Y20A 1QU0A 3T2TA 3IIRA 5H9PA 3UD8A 4YZ3A 3OJMA 4M3CB 4EFRA 1G9DA 4JP0A 4DFSA 1XYFA 2WRYA 1DBNA 1UPSA 2LALA 2Y9FA 4LBKA 2WQZC 1JLXA 3P53A 3USUA 3MW2A 2R1DA 2ISGA 4KEKA 3OBRA 1CPMA 1R8OA 2W39A 4Q2FA 3CQAA 3MPPG 3NJ5A 3O4DA 1QQKA 3E8LC 3FJDA 1HWPB 4I4OA 2D1ZA 3FJ9A 3I2XA 4I30A 1IS4A 2A6WA 2DVGA 4G6MA 3WA1A 3C2UA 1KDKA 2ZR1B 3SH4A 9ILBA 1RINA 1SLAA 3AYAA 3CRGA 1W3FA 4U2AA 4M00A 4JC1A 3RSJA 4LBQB 3JUTA 3CNAA 4UW3A 1O4YA 5IUQA 4HA2A 5H9SA 1HDKA 3IM0A 2FDBM 2A6VA 3FIEA 3N7LA 1QKQA 1AFCA 1G86A 2WKKA 2ES3A 3AKHA 3AKIA 3ZSMA 2F8XC 4YG3A 1SBFA 1LOFA 2R1BA 1HQWA 3NBNA 4I3NA 1IS5A 2X2SA 4ZFUB 1ISVA 3B69A 3UL2A 5H9QA 1G82A 1AZDA 1AXZA 1F5FA 1PUMB 1S0LA 3BONA 3OBTA 2P34A 3BA4A 4H9WA 1G7YA 3C8AA 4TYSA 5BOWA 2ISEA 1OKQA 1AVXB 3O4BA 1W6NA 4GP0A 1DFCA 4FPYA 1H9WA 1V6XA 4YM1A 1WW4A 1V6JA 3WINA 1MVEA 4YGDA 2C9AA 3D3XA 3QW6A 2ETFA 1YVGA 2D6KA 1JBCA 1JT3A 1P63A 5JMCA 1GNZA 1QMJA 4IZXA 4Z8BA 4GAIA 4I4XA 1MS0A 2SBAA 3RTJB 4UW6A 3AP4A 2IHOA 1WW6A 3V0BA 4AVTA 4FPJA 2RHPA 2UWAA 4XZPA 4WVWA 5BYNA 2FFUA 3UD7A 2VU9A 2GDFA 4F34A 3AYCA 1R1ZA 3W59A 3R4UA 2AENA 5SV8A 5JOZA 1BXHA 3KMVA 3V64A 2ZA9A 2DWRA 3I4IA 1JTCA 1OQLB 1T4QA 1G9CA 3CA3A 2R0HA 1MS5A 5FNXA 4FGFA 4Q9GA 7I1BA 1SBDA 1EPWA 5BP5C 2ILPA 4W65A 4A7ZA 4GKXA 2P3IA 2EAKA 4FPHA 1JXNA 4YW4A 1B09A 3B01A 1W6MA 1WLWA 4BQ1A 4I0YA 2YMZA 1HLCA 1SLCA 1T9FA 1PZ8A 1N3OA 3MW3A 3MW4A 3BRDA 1UAIA 3IM5A 2D23A 1GLHA 3N35A 5BQMB 3AZYA 4FOYA 4XFTA 2KKIA 4U36A 1LGNA 3M3OA 2E4MA 5DUXA 3VT0A 5DSSB 2VSEA 3AK0A 1BLDA 1BLAA 1MS1A 5JVVA 3N7KA 1G9FA 1LHOA 1S0IA 2A3YA 1Q8OA 3S8JA 1DLLA 3A0KA 4XYXA 3ZXDA 5JOWA 4EFQA 2ZMNA 2R0FA 2GALA 4OZXA 3N7JA 1KJLA 1GICA 4QBCA 4ELCA 3NF3A 2E53A 3ILFA 2PHXA 1LOFC 4GWNA 1QNWA 2VW0A 3AP7A 2I2SA 5FZZA 3O0XA 4DRRA 2AYHA 3W58A 2K8RA 4EKXB 1BZWA 1DQ1A 4XE9A 4XBQA 3FBYA 1DQGA 4RA0A 1XTGA 1ITBA 1KJRA 4BPZA 1VCLA 5T55A 1C57A 1PWAA 1I3HA 4YGEA 2G7PA 6I1BA 1IOAA 5IK8A 1URXA 4M3CA 1VALA 1HKNA 3WINC 5LK5A 2TEPA 2PELA 3AXEA 2WNEA 1V6LA 4XJ8A 2DRZA 2AQZA 2A97A 1IHKA 4I4VA 5BXTA 4YM2A 1Z7HA 1V6NA 3K1XA 1QOOA 2FMDA 4Q1PA 4Z9WB 5F8SA 3F1RA 5EYXA 3A07A 2YV8A 1ZM1A 2AXMA 3VV1A 2XB6C 3OJVA 2GN3A 4XJ9A 2R9KB 4LBJA 4I4YA 2EXKA 1Q8SA 1VAVA 1BKZA 4PBPA 1TFMB 1L2HA 3M3QA 1ISZA 4XHXA 2OUJA 3H6RB 2ZMKA 1IJTA 4LBQA 4D0ZA 1TTUA 3VUOA 1C1LA 2A7AA 3SH5A 1JYCA 1LTEA 2NN8A 3ILRA 4JQ0A 3DGTA 4QKSA 2IMCA 2FFVA 4YW1A 2DVAA 5CBLA 2LTNA 4R9BA 1E0OA 3IMNA 1LHNA 2ZGQA 1Q03A 4DQAA 3APBA 1DHKB 3FUOA 4XDQA 4K21A 4KBBA 3O0VA 4DPNA 1II4A 2RSTA 3LCPA 3RMYA 3IKWA 4G9MA 4KUFA 1SZ6B 4FOWA 1RIRA 4Y22B 1SLIA 1LCLA 1KRIA 1V6VA 3PHZA 2AR6A 3R4SA 1DYPA 2ZGSA 5CA6A 2P37A 2LIQA 3WDYA 1ISWA 5EC5A 4AVSA 4ZFWB 2NMOA 1LEDA 4I96A 4KTXA 1RITA 2DYCA 3KM5A 4I8MA 3JU9A 2VW1A 2WT0A 1M16A 4GALA 2EIGA 3CA0A 1LU2A 5DZEA 3T1LA 1YTOA 3A22A 4Q9PA 1D0HA 2ZGLA 4YW2A 1SFYA 1QOTA 1FYUA 4OWKA 3VT1A 1ISYA 1UN1A 1AVAC 4R6UB 3ZXFA 2VUAA 1ULCA 2CWSA 1FMZA 3UDAA 4I1EA 1DZDA 2D7IA 1UZZA 2V73A 4Y1XA 1CN1A 1JHNA 1S0EA 1M2TB 2VSAA 3B3QE 3WCRA 4LO8B 1LHWA 1MS9A 4EFPA 4PF5A 4BM8A 1ZA4A 3P6JA 3BA7A 3SLIA 1QNYA 2A71A 2KM2A 3WG4A 2XHLB 3FJJA 4AN6A 3BRGC 1UX6A 1W3GA 4G9NA 4QD2B 2AH2A 1FV2A 1BFGA 1AJKA 1RZOB 2WLQA 5F5QA 3K3QB 3FJIA 2E6VA 2G7QA 1JY0A 1PZZA 4YZ5A 5DUUA 2G7KA 4ATEA 2IMAA 3BOOA 5CB7A 2ZGOA 1UKGA 2WT2A 4Q26A 2AFGA 4M01A 4OEFA 3RS6A 2A3WA 4X37A 2ZGTA 1AVUA 2NP0A 1WCSA 3O12A 4J23B 2ZGMA 1W6OB 1QQLA 2NYYA 4Q27A 3WVJA 3QIYA 3WV6A 2ZHNA 5BP5A 1LULA 4D0TA 2BEAA 1LGBA 3ZXJA 1MVQA 4LO2C 3FGMA 1TEIA 1BYHA 1PC8B 4XXAA 1BA7A 3BAVA 4XJZA 2D7RA 3DSEA 3V65A 3ILNA 1KNMA 4GA9A 1VIWB 3QIXA 1IKPA 3UJ0A 1A3KA 3ATGA 3WO4A 4D69A 5T52A 1FWVA 5AVAA 1DQOA 4XBLA 2WJSA 2MC2A 2P3JA 4MYEA 2JKBA 1ABRB 1NXD1 2ZHKA 3LSDA 3ZSKA 2W2DB 2AAIB 1V00A 4I4RA 3BTAA 2A75A 4Z8SB 3N7MA 1AJOA 4QC4A 3SNVA 2P3KA 1W6QB 1F82A 5HCFA 5F90A 3FJKA 4I4PA 1KDMA 4GKYA 3D4KA 4J1LA 2JE9A 3VSFA 2X2TA 2Q3NB 1S0GA 3H0OA 2Y9WC 2FGFA 1IRAX 1LECA 4PC4A 3RQ0A 2A8AA 4HL0A 4XIOA 4J2KA 3IM7A 2NVHA 3WLUA 1MS8A 4ZLBB 1CPNA 3HALA 3AZVA 3O49A 3AH2A 4Q8KA 3H6RA 1LOCA 2DTYA 4XMAA 3QLQA 4I6IA 1H9PA 5IT6A 2M49A 4EEEB 1GKBA 3WNXA 3L2YA 2AREA 3QJ0A 2E51A 1T3AA 3AXDA 4AYUA 4DCKC 4J2XA 5E89A 3AX4A 4LBNA 1GZWB 4ZKTB 3LLPA 1I1EA 2ZQNA 1W6PB 5GZCA 4Y22A 1RMLA 3I2AA 3CA4A 3NV1A 4GOYA 1AF9A 4Q91A 2D6NA 1JQZA 1DFQA 2DUOA 2AUYA 1S0FA 4I4SA 3OYWB 2GMPA 3IPVA 3BADA 1JT7A 1DZCA 3O5SA 1WLCA 5EG6C 5H9RA 4FPKA 5FZUA 3QYDA 4Q1RA 1DQ2A 1JUIA 1IKQA 3MEPA 2WBCA 4WBCA 5GJ6A 3FJFA 5JLVA 1WLDA 4QO3A 2DUPA 1BJQA 3FFZA 3UJQA 3N36A 3POWA 5EYYA 4YZ1A 4Y1VA 2DVDA 4GP3A 4FQZA 2Z49A 3NWKA 1N1TA 1SR4A 4WVVA 3FLTA 1YXWA 3SITA 4XHBA 3SH3A 2D6LX 3BAQA 3DDBA 1GGPB 4FPLA 2VW2A 1F9KA 4CZSA 3NBEA 2XHLA 4CRQA 3AYEA 1XTFA 3FIIA 1AVWB 3ZX7A 4A7KA 3PG0A 3QW8A 5E24E 3NBDA 5T50A 4F83A 4JKQA 3DS9A 2I1BA 1SCSA 5L73A 1FMMS 2CNAA 5KXBA 3IAGC 2A6XA 5DUVA 5BVPI 4KS6A 2NMNA 2P2KA 3M3CA 1TWMA 5D62A 2DU1A 2NZ9A 1MACA 1MD6A 1V6MA 2D22A 4IZEA 2Z48A 2KI6B 2FPQA 1CVSA 3FLRA 2IWTB 5KXDA 1ULFA 2HWMA 1C4RA 4JAWA 1U0AA 1CVNA 1W6OA 2W08A 4ATFA 1HWNB 2YY1A 4OWLA 2HWAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4ZKTB

Total Genus

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Chain Sequence

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