4ZKTB

Crystal structure of the progenitor m complex of clostridium botulinum type e neurotoxin
Total Genus 271
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
271
sequence length
1159
structure length
1114
Chain Sequence
KINGNLNIDSPVDNKNVAIVRSRDVFFKAFQVAPNIWIVPERYYGESLKINEDQKFDGGIYDSNFLSTNNEKDDFLQATIKLLQRINNNVVGAKLLSLISTAIPFPYENNTEDYRQTNYLSSKNNLVIFGPGSNIIKNNVIYYKKEYAESGMGTMLEIWFQPFLTHKYDEFYVDPALELIKCLIKSLYYLYGIKPNDNLNIPYRLRNEFNSLEYSELDMIDFLISGGIDYKLLNTNPYWFIDKYFIDTSKNFEKYKNDYEIKIKNNNYIANSIKLYLEQKFKINVKDIWELNLSYFSKEFQIMMPERYNNALNHYYRKEYYVIDYFKNYNINGFKNGQIKTKLPLSKYNKEIINKPELIVNLINNTVLMKSNIYGDGLKGTNFYSNYIIPYNHSINYSYLDNVNIEEIEKIPPINDEDIYPYRKNADTFIPVYNITKEINTTTPLPVNYLQAQMIDSNDINLSSDFLKVISSLVYSFLNNTMDYLEFIKYDKPIDTDKKYYKWLKAIFRNYSLDITETQEISNDTKIIPWIGRALNILNTNNSFVEEFKNLGPISLINKKENITIPKIKIPSSMLNFKDLSENLFNIYCKNNFYLKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMASKSVLAQEKLIKKLIQKQLRYLMENSNISSTNLILINLTTTNTLRDISNQSQIAINNIDKFFNNAAMCVFENNIYPKFTSFMEQCIKNINKSTKEFILKCTNINETEKSHLIMQNSFSNLDFDFLDIQNMKNLFNSYTELLIKEQTSPYELSLYAFQEQDNNVIGDTSGKNTLVEYPKDIGLVYGINNNAIHLTGANQNIKFTNDYFENGLTNNFSIYFWLRNLKQNTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFENDGLVFNIIDSNGNEKNIYLSNISNNSWHYIVISINRLKDQLLIFIDNILVANEDIKEILNIYSSDIISLLSDNNNVYIEGLSVLNKTINSNEILTDYFSDLNNSYIRNFDEEILQYNRTYELFNYVFPEIAINKIEQNIYLSILNFKPLKFKLLNQYVQKWDEVIFSVLEKYLDISTTNNRIQLVDNKNNAQIFIINNDIFISNCLTLTYNNVNVYLSIKNQDYNWVICDLNHDIPKKSYLWIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Molecular Assembly of Clostridium botulinum progenitor M complex of type E.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bontoxilysin A
molecule tags Hydrolase/toxin
total genus 271
structure length 1114
sequence length 1159
chains with identical sequence D, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 4zktB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4zktB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4zktB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 4zktB01
3NBNA 1S0CA 4P0KA 4RL7A 1U0AA 2F8XC 3BADA 2JD4A 4YZ5A 1K5UA 3UD7A 2PHXA 2AXMA 2XOAA 3VKMA 3QW6A 1NUNA 2A6VA 2FHRA 5AVAA 2ZGTA 1XYFA 1DYPA 4HANA 4Y24A 4CRQA 5LK5A 4ZLBB 3CA3A 4KEIA 4EFPA 4I2SA 2G7KA 2NMOA 5BVPI 2GO2A 2ZGRA 4I0YA 1BFCA 3QYDA 2D24A 3CAHA 4G9MA 2NTDA 4K20A 1GKBA 3AYAA 1AZDA 3IN9A 3N7JA 3QW7A 5DUWA 5GM0A 1AXYA 3TB0A 5T5JA 4Y1XA 4HJJA 5D61A 3ZSJA 4D0TA 2WSUA 1FV2A 1UN1A 4DEPA 4Y22A 4I4QA 1XTGA 1N1SA 4A7KA 1T4QA 2YUGA 4CJMA 1JXNA 4KEKA 2D44A 2ERFA 2P3KA 4XJWA 5B2HA 1QXMA 4XJ9A 1J0SA 4JC1A 5D63A 3ILFA 1MACA 1BKZA 2GALA 5E88A 4ZJXA 2AREA 3DDBA 3C8BA 4FGFA 1D0HA 1NXD1 4XFSA 3JU9A 2E7QA 3VEQA 3AP7A 3T1MA 1SLTA 4XXPA 5F8SA 2WLQA 4LBMA 3PVOA 5HCBA 5DZEA 3B00A 1Q56A 4YW1A 3VT0A 3BONA 1SLAA 4Z9WB 3WCSA 2A7AA 4OW4A 3N7KA 2DV9A 3N3HA 3O5WB 2UWCA 1W3FA 2WT2A 1RITA 4J23B 2A6YA 3W58A 1MZ6A 4BMBA 2ET2A 3POSA 1G86A 3FJAA 4XMAA 1I1EA 2MLLB 3UJQA 3A07A 2PHFA 4GAFA 1I3HA 3LTQA 3V0BA 1AVUA 3JRRA 4LO2A 4YLZA 1V6WA 2XHLB 5DZFA 4P9YA 3ZPYA 4KUFA 1LOBA 2HWAA 5CBLA 1PZ8A 3CRHA 4IYBA 4X39A 4P9WA 4AGRA 4BLIA 2P3IA 1M2TB 3FUQA 2IMAA 3VT1A 2DTYA 1PUUB 4Y1YA 3VWCA 1AVBA 5F8YA 3AYDA 4P6AA 2ZABA 1DQ2A 1LHOA 3MPPG 1ENQA 1HCEA 2WJSA 2ZHKA 1ITBA 2QYIB 4XOGA 1YIFA 3RSJA 2ZGLA 1F5FA 3CA6A 4FPHA 4IZXA 2D43A 1Q8VA 2CNAA 4YG0A 4DRVA 1H9WA 2ZQOA 1WLDA 3GNEA 1QMJA 2ZHMA 1UZYA 1F31A 4XFUA 2GMMA 4I37A 1SLIA 2RHPA 5T52A 41BIA 1ONAA 5SV8A 1UX6A 2JE7A 2CTVA 3M3CA 4NOTA 2ZQNA 1WCSA 3V0AB 1DFQA 4ZXKA 5BOWA 5KXEA 4Q1RA 1Q04A 2W52A 4ZBVB 1ULDA 4JP0A 1XZZA 3AP6A 5GLTA 3CRGA 4ZA3B 4Q1PA 2BQPA 3FBYA 2Q3NB 4I6IA 5GZDA 1LECA 4L8QA 2H0BA 3NV1A 2A3YA 1ZN3A 1H9PA 4XYXA 2GMPA 1FMZA 1S0IA 3I29B 1Q8QA 1C4RA 3OGGA 3O12A 3AYCA 4FPJA 1QQKA 1XQNA 4YZ3A 1GGPB 1WW7A 3VT2A 2D23A 2DUPA 3P53A 2XG3A 3UK9A 1F82A 1YI7A 5JDBA 4I30A 2C5DA 3AP5A 3AZZA 4I1EA 5FNXA 1BXHA 2DVFA 3SISA 2Y9XE 4M3CF 4GWNA 1LEDA 4H55A 3IM7A 4UW4A 4GAIA 5T54A 4XJUA 1G9BA 1LOFC 2I2SA 3Q9OA 4OWKA 1WW5A 3WLUA 1BFFA 3SITA 2EIGA 2NVHA 1N4KA 1IT0A 2DU0A 5BYNA 3P6IA 2VW1A 2Z49A 1N47A 1ISZA 3AZXA 1AFCA 1FATA 4I8MA 2ISGA 1LGCA 3O0WA 3PVEA 4XBLA 4PF5A 4C1WA 2YMZA 4Q9PA 3C8AA 1P63A 4M00A 1QOTA 2VW2A 3H0OA 3A0NA 4TLPA 2IWTB 4LO1A 2KLLA 4YM3A 4I4XA 3D4KA 1AX0A 1MS1A 3F62B 2A75A 4Q27A 1KJLA 5D62A 1ZKXA 3TAYA 3A4UA 5T5PA 5EWSA 4YW3A 3I8TA 3PG0A 5H9PA 2LALA 1NZKA 4IY8A 5DUYA 1BA7A 3AXEA 1L2HA 3V79C 3AZVA 4K21A 2PHUA 2W39A 1G82A 3RTIB 4UW6A 3UD8A 4ZGRB 5T5LA 4OEFA 1S0DA 3CA5A 3ILNA 1S0GA 1SLLA 1WD4A 2P2KA 1KITA 1MZ5A 3ZXFA 4XMIA 4XE9A 4FPEA 2AH2A 2DRZA 1Q8SA 2A5ZA 1CE7B 4G6JA 2AYHA 2FMDA 1ULFA 2E6VA 1SLCA 3IM5A 3RMYA 3FGMA 2NZ9A 1LODA 2FFUA 1R8NA 3KM5A 5H9RA 5G00A 5BP5A 2A97A 3O3QA 3WOGA 2YZ4A 5E24E 2ZKNA 2DYCA 1FNYA 1UAIA 3GALA 2D20A 3O4CA 4QC4A 4P14A 1QOOA 2VSEA 1ZKWA 2D6LX 1A8DA 5EC5A 5GLUA 1V6XA 4YGEA 2Q9XA 4EFRA 1W3GA 3WINC 3D5OA 4YM2A 2E51A 5EXOA 3T8SA 3MEPA 3V0AA 1WLWA 1BQPA 3IKWA 1HLCA 5JOWA 1ABRB 4I7IA 4TYSA 3AJYA 3Q7WA 1S0EA 3AJZA 3ZXGA 3SH3A 3WDXA 1CQ9A 4I3NA 2FGFA 1JBCA 3VKNA 3C2UA 2PHTA 3PUBA 1RIRA 3WVJA 5CB7A 2ZACA 4NO4A 1Q03A 3ZC9A 4YG3A 2D6PA 3WHTA 3V0BB 3DUIA 3M2MA 2GN7A 3NWKA 4FOWA 3ZXJA 3FLPA 4GOYA 5IK8A 1PZZA 2ZBJA 5DSSB 2WT1A 1CONA 4FPYA 4YM1A 2ZR1B 4P0JA 3I2XA 1VCLA 3FJ9A 4R6UB 1A3KA 1H30A 3Q7YA 1AX2A 1HDKA 3VKLA 3FJBA 3LSEA 3ZUSA 1SFYA 1FV3A 4WZFA 4WV8A 3IM6A 4JAWA 1HCDA 4AVTA 5F8WA 2G4IA 1TFMB 1V6VA 5DVHA 1A78A 4QD2C 1ENSA 1II4A 2ISHA 2Y9WC 4HL0A 3AX4A 3FLRA 3WDWA 4ZOTA 2EXIA 1QNWA 4I4SA 1M16A 2AQZA 3AK0A 4DRRA 1BASA 2DU1A 2BEAA 2ARXA 4QALA 1SCRA 3BAUA 3KQRA 5JMCA 4R9BA 4K1YA 5GAQA 1LOCA 2QN4A 5JVVA 1IS4A 3BTAA 2HWMA 3MW2A 1QDOA 2ZMLA 2VSAA 4ISQA 1HWOB 3QIYA 1GNHA 2P34A 2D3RA 4PBPA 3BOKA 1XHBA 5FNWA 5KXDA 4Y1ZA 2AENA 3NV2A 4DQAA 3S8JA 1SCSA 2OUHA 4Q8KA 1LHNA 1BFBA 5IK5A 1AVWB 2LTNA 5DG1A 2R0FA 4KEJA 1ISYA 2IHOA 4XILA 1R1ZA 3BWIA 1D2SA 4R9AA 2DUOA 2DWRA 2L5XA 4AN7B 4FPLA 1Q8PA 3OPZA 3FJEA 4HA2A 2D6MA 2D7RA 4X3AA 3FIIA 2ZHNA 2X2TA 4M3CB 1W6NB 1TIEA 2A6ZA 1SR4A 5GZFA 3WMUA 2R0HA 2IMCA 3DGTA 1XTFA 4KC3A 1FYUA 3OBRA 4EEEB 1S0FA 4QBVA 4HR6C 3ILRA 2E7TA 4FPGA 1E0OA 4GWMA 1ISVA 3ZYPA 3FJ8A 1HQLA 4Y1VA 3AP4A 3FJHA 1N3QA 4FPCA 3FJDA 1MS3A 1C57A 2Y9FA 2FDBM 4UW5A 1KJRA 4YG6A 1AXKA 3OY8A 3WG1A 5I1BA 1URXA 5BQUA 4XHBA 1LOEA 4JKQA 3LLPA 4BQ1A 4Y26A 1VAMA 3PHZA 1LOAA 3HSMA 1IRPA 4F34A 1W6OA 3N0KA 1TP0A 1S0BA 1BARA 2ETFA 2E4MA 1LGNA 4XKIA 1S1AA 1ZL5A 1DQOA 4ENDA 4QKSA 3NV3A 2C9AA 1SBEA 2Z48A 4ASMB 3ZVXA 4TZDA 3AYEA 5T5OA 1HKNA 3BA5A 1V6IA 1IKQA 2KI6B 4I4YA 2G7PA 3AKIA 2D3PA 2OW4A 4LO2C 2DREA 3BA4A 2NP0A 1CR7A 1QF3A 2WKKA 2VUAA 2R49A 1Z0HA 3WUCA 2B7YA 4C1XA 1ZB7A 4ISRA 2JKBA 2GN3A 3M3QA 1ULEA 4YGCA 2DRYA 4AWDA 1G7YA 2NM1A 3FIEA 3WDTA 4YGBA 1ULCA 3ENRA 4JQ0A 3UJ0A 1WBLA 3POYA 21BIA 1AF9A 1W6QB 4XJ8A 4LBQA 5DUXA 1GV9A 3O5SA 4AVSA 1HQWA 5L73A 1DQ0A 5JOXA 1MD6A 2K43A 3N36A 2D6NA 2UURA 4X37A 2NMNA 3B69A 1EVTA 2GZBA 1WBCA 1UPSA 1YRZA 5F9TA 2D7FA 2ZMKA 4FPKA 2R1DA 4KTXA 2LIQA 1DGLA 3FLTA 3QCWA 1DQGA 2AFGA 4J2YA 2VY0A 5CA6A 3P6JA 1RMLA 3TC2A 1IOAA 4GXLA 4LBOA 1TWMA 1ILR1 3DS9A 3WCRA 4P9XA 1LHWA 3QJ0A 1VAVA 2FFVA 4FVVA 4QBCA 2DVGA 2EF6A 2HW9A 1VALA 3UDAA 2DS0A 1Q1UA 2AUYA 4LO3A 1AXZA 4WBCA 3M3EA 4YW2A 4QKRA 3OJMA 3A21A 3AH2A 1FN0A 4YZ4A 4IQPA 2ZZJA 4OZXA 1MVQA 4M3CA 3O4DA 2LIEA 3ZXLA 1W6NA 4AN6A 2X2SA 3SNVA 4HEVA 4BM8A 4XJZA 1JHNA 2P23A 3H6RA 3D7WB 2ZMNA 2A6XA 2I1BA 1O4ZA 1JT7A 3CU1B 1CPMA 1ULGA 1K5VA 2ZGPA 3KMVA 1MR5A 3RRDA 4XIOA 1LHUA 3OJ2A 1ENRA 2KI4A 1V00A 3N7LA 4ZFYB 3BA7A 3O49A 3NF3A 1JLYA 2V5YA 1GLHA 3ZUQA 1MS0A 4U2AA 2ZGNA 1SBDA 2Q5TA 1QKQA 5GJ6A 5FZZA 3FJKA 1I1BA 1AX1A 3BODA 1DIWA 4G9NA 3VUOA 4IZEA 1CVSA 2PELA 4DCKC 4I4VA 3BAGA 3OBTA 3R4UA 4PQ9A 1WUVA 1GZWA 4BPZA 1GBGA 4LO1C 3IAGC 3N7MA 1G9DA 2DVAA 1GZ9A 1ONKB 1CVNA 2PHWA 1FGAA 3WDYA 4J1LA 3WO2A 1LESA 3SH5A 3HALA 4OWLA 2UWBA 3MW4A 4ZFUB 5DZGA 1R8OA 2DUQA 1Q8OA 4G1RA 4LBQD 1QGLA 1MVEA 1KDKA 1PWAA 1WBAA 3WUDA 4AGGA 1N3OA 2A3XA 2D6KA 4Q26A 1W6QA 4XHXA 4FPFA 2E53A 3VKFC 3WDVA 1PC8B 4II0A 1EPWA 4WVVA 1V6MA 1JT3A 1FAYA 1W6PA 3OJVA 3APBA 4ZKTB 3UL2A 2FO1A 1RG8A 3WV6A 1WLCA 2GNTA 1Z2VA 1GNZA 2F2FA 3K1XA 3POWA 1HIBA 5BP5C 5BQNA 3O0VA 5DUVA 1IILA 3AZYA 4FQZA 3OY8B 2HZ9A 2ENRA 3VSFA 1BFGA 3DDAA 1MS9A 2K8RA 3K3QB 1VLNA 1W6OB 4H04A 4IONA 3A22A 1F9KA 4QO3A 1GICA 2K4AB 4FPOB 4EJ5A 3NV4A 1BLDA 3AJ5A 1LTEA 4XBNA 5FREA 3CNAA 1ZL6A 1YYNA 4LO0A 1DZDA 3O44A 5EYXA 2EALA 1T3AA 3N35A 3INAA 1S0LA 1QU0A 3ZC8A 4YZ1A 1EV2A 4YFWA 2D6OX 4KBBA 1RINA 3I4IA 1IS6A 3JUTA 1T9FA 4I4OA 1YBIA 3AKGA 4JRAA 4USPA 2ZGMA 4IHZA 2EXJA 2M49A 4LO7B 1LOGA 4A7ZA 2DVDA 3HR9A 3WNXA 4XJAA 2AGSA 3ZSMA 4DFSA 3HMYA 4LBQB 1OQ1A 1QNYA 3MW3A 2OVUA 5FZUA 3C9ZA 2WRYA 3POKA 4JKXB 4XFTA 2ERMA 1V6KA 1B09A 4YW4A 5H9SA 1PZ7A 1MS8A 4USOA 1JTCA 1J1TA 3PMEA 4OUJA 2G7NA 3OGFA 1MS5A 1WD3A 3ATGA 2YXSA 1IHKA 2WNEA 4FQ4A 2JECA 1VIWB 3SH4A 3BAHA 1FQ9A 2D22A 2GNMA 4I4RA 1HWPB 4AYUA 3DEBA 2HYKA 4UW3A 4ATEA 4L4IA 2AR6A 3BOPA 3FJFA 1Z4SA 4I96A 4GKXA 2QN0A 4X38A 1DQ5A 3S8KA 4PCRA 3PVNA 1MS4A 1GZCA 4LBKA 4WVWA 2VH9A 5T55A 1JYCA 4J2XA 5BXTA 4SLIA 3F1RA 1SLBA 5T50A 2VLCA 4EL4A 2A70A 2CYFA 3D6EA 1W0OA 3PJQA 1OKQA 4XZPA 3QW5A 1TWEA 3H6RB 3WO4A 3QIXA 3SLIA 2JJ6A 4FP2A 2ZGQA 3A23A 5IT6A 3BAVA 3A0KA 1BYHA 4M01A 3USUB 2A71A 4JPZA 2UWAA 2CWSA 1CJPA 3SNMA 3I2AA 1SR4C 1UKGA 1KRIA 5E8AA 1ZA4A 4RA0A 2Z42A 4KS6A 4XDQA 3QLQA 3NJ5A 8I1BA 1DLLA 1JOJA 5H9QA 3V65A 1KNMA 1DJSB 2W2DA 1WBFA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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