1WD4A

Crystal structure of arabinofuranosidase complexed with arabinose
Total Genus 157
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
157
sequence length
482
structure length
482
Chain Sequence
MGPCDIYEAGDTPCVAAHSTTRALYSSFSGALYQLQRGSDDTTTTISPLTAGGIADASAQDTFCANTTCLITIIYDQSGNGNHLTQAPPGGFDGPDTDGYDNLASAIGAPVTLNGQKAYGVFMSPGTGYRNNEATGTATGDEAEGMYAVLDGTHYNDACCFDYGNAETSSTDTGAGHMEAIYLGNSTTWGYGAGDGPWIMVDMENNLFSGADEGYNSGDPSISYRFVTAAVKGGADKWAIRGANAASGSLSTYYSGARPDYSGYNPMSKEGAIILGIGGDNSNGAQGTFYEGVMTSGYPSDDTENSVQENIVAAKYVVGSLVSGPSFTSGEVVSLRVTTPGYTTRYIAHTDTTVNTQVVDDDSSTTLKEEASWTVVTGLANSQCFSFESVDTPGSYIRHYNFELLLNANDGTKQFHEDATFCPQAALNGEGTSLRSWSYPTRYFRHYENVLYAASNGGVQTFDSKTSFNNDVSFEIETAFAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of a family 54 alpha-L-arabinofuranosidase reveals a novel carbohydrate-binding module that can bind arabinose
pubmed doi rcsb
molecule keywords alpha-L-arabinofuranosidase B
molecule tags Hydrolase
source organism Aspergillus kawachii
total genus 157
structure length 482
sequence length 482
ec nomenclature ec 3.2.1.55: Non-reducing end alpha-L-arabinofuranosidase.
pdb deposition date 2004-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05270 AbfB Alpha-L-arabinofuranosidase B (ABFB) domain
A PF09206 ArabFuran-catal Alpha-L-arabinofuranosidase B, catalytic
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1wd4A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1wd4A02
3O5SA 3N7MA 4Q27A 3AKFA 4I4YA 5F8SA 1SFYA 1BFFA 4D0ZA 1LU1A 2DVGA 3FJ8A 1BLAA 5T52A 4XBQA 2DRYA 1V6XA 4LO2A 1YRZA 4G9NA 4XJUA 3NBNA 1DFQA 1AVWB 3FJFA 3AKIA 3CRHA 1QDCA 2SBAA 4II0A 3AH2A 3Q7XA 1QF3A 2AFGA 1IOAA 2RSTA 3AP6A 3EF2A 4GP3A 1IILA 2LALA 5HPZA 3ZPYA 1O4ZA 4WVWA 1QXMA 1YI7A 4FVVA 5D61A 2DVDA 1SCSA 1N4KA 1GGPB 1AVAC 3AXEA 2Q3NB 4GA9A 1IRAX 1IS6A 2XB6C 4LO8B 4OEGA 2YXSA 1JT4A 1LCLA 5GLUA 3I2AA 5GLWA 2AAIB 2R1BA 2D3PA 1XQNA 2ZGNA 2D3RA 1WW4A 8I1BA 2LTNA 1MZ6A 5T55A 3V65A 5T5LA 4QKRA 3SNVA 1MS3A 3O4OA 4M01A 5FZZA 4YM3A 4P14A 1FAYA 4FPOB 1JOJA 4Q91A 2ZR1B 3ATGA 3CA3A 4R9BA 4P0KA 1TWEA 4Z8SB 2SLIA 4KC3A 2GNBA 1N1VA 3AJ5A 2DU0A 1G9CA 2UU8A 3N35A 3NBEA 4XBNA 2JDZA 1LGNA 4JP0A 3PVEA 3VKLA 3OY8B 4QALA 1SACA 3HMYA 3PVNA 4I2SA 2FO1A 4J2SA 3ILFA 1C4RA 4EFQA 3AJYA 3CA4A 3ILNA 3UJQA 1BARA 1LOBA 2Z48A 3O0VA 3QCWA 1AZDA 3A22A 3O44A 3WDWA 1FMZA 4Q8LA 1R8OA 3VKFC 2BFHA 3IKWA 4BLIA 1LODA 4LO7B 1MACA 4YZ1A 4YGDA 1ULCA 1UN1A 1W3FA 3BAQA 5DG1A 41BIA 4GKXA 7I1BA 1W3AA 1CR7A 4X3AA 4M3CA 2PHWA 3VV1A 5CBLA 3V64A 2D7RA 5CB7A 1JY0A 1UZYA 5DUXA 4ZGRB 2PELA 3UJOA 1ZA4A 1HKNA 4ATEA 4XJWA 5D63A 1G82A 2KLLA 1IKQA 4EFPA 1HWMB 1LJ7A 1QQKA 1CE7B 4XTMA 4AWDA 1QGLA 4GALA 1CESA 3I4IA 3I2XA 4ATFA 3ENRA 5F8WA 2R1DA 1AX0A 2GMEA 1JHNA 2E6VA 2DRZA 1FATA 4WBCA 1SLTA 4XFTA 4ZA3B 4FGFA 5KXDA 4DEPA 1HQWA 3NJ5A 4FOQA 4JKQA 4YW2A 4WZFA 4QC4A 2EALA 3K1XA 5T5JA 2DTWA 4D69A 4FPGA 5JOWA 3WHUA 1ULEA 4GKYA 1J1TA 4HJJA 1MC9A 1ENQA 4FPYA 4LO0A 4K21A 2R0HA 3FLPA 4XKIA 3DUIA 2D20A 5D62A 1AVBA 2P3JA 1MS5A 1MR5A 4UW3A 3KMVA 1LEDA 1QQLA 2WSUA 1ULDA 4I6IA 3KM5A 3ZSMA 1G9AA 3FFZA 4IZXA 5G00A 2D3SA 3O49A 3AXDA 1ABRB 1W0OA 4EFRA 2CYFA 3RTJB 1HWPB 2ERMA 2C5DA 1FQ9A 3APBA 3GALA 3UD7A 4PQ9A 1GSLA 5BXSA 1W6MA 1PZZA 1UL9A 3WG3A 3OY8A 4Y22B 1R8NA 2F2FC 1I1BA 1DZDA 1W6NA 4AN7B 3AZYA 1FNYA 1WD4A 1DQ5A 2EXIA 4USOA 3GNEA 3A0NA 1DQOA 2A3XA 2BQPA 3LLPA 1WD3A 1NUNA 2AGSA 3WDUA 2CWSA 4OW4A 1V6IA 2VW2A 1KDMA 3F1RA 2R0FA 1V6UA 5F5QA 3POSA 3BIWE 4A7YA 4PC4A 1S0CA 2ZGTA 1G9BA 4QD2C 4XDQA 2NTDA 4LO1C 4AVSA 4OEFA 4Q26A 1VLNA 2AREA 5GZDA 4LBJA 2B7YA 2YROA 4XYXA 3T1LA 1LOFC 3V0AB 2WBCA 3CAHA 4WVVA 1KJLA 4LBKA 3WUCA 3O3QA 2W08A 4FOYA 4CRQA 1H9PA 1UPSA 3AJ6A 5E8AA 5JOZA 4QBCA 2A6YA 4YZ5A 2VY0A 1LOEA 5GZFA 4DFSA 4LBQB 2Z49A 2MLLB 2PHUA 4Y26A 4DQAA 31BIA 3CU1B 1WW6A 4QKSA 1YBIA 1GYKA 2Y9WC 1URXA 1PZ8A 2FMDA 4LO3C 4HANA 1W6QA 1NLSA 3P53A 4WV8A 3UK9A 1ENRA 1PUMB 1FWVA 5BQUC 1CVSA 1RZOB 2ET2A 1NZKA 1O4YA 2WJSA 4L8QA 3B01A 3FUOA 1Q1UA 3NV4A 5KXBA 1QNYA 1EVTA 1Z0HA 2P39A 3AYDA 1LHWA 3A4UA 3OJBA 1IS3A 3PHZA 4FPKA 3IMNA 4KEJA 1Z78A 4J23B 4I4PA 3AP4A 1WLDA 4JPZA 6I1BA 5DZFA 1Y7BA 3D7WB 4AVVA 3VKNA 3MW4A 2ZACA 1C1LA 3CA6A 5JOXA 3FJHA 1N1SA 4D0TA 3H0OA 1MS0A 5E88A 1LHNA 3TC2A 3AP9A 1AVUA 2EAKA 2GNDA 3SH4A 4DENA 4YW3A 4I96A 1LESA 2VXRA 4FQ4A 1RMLA 3A0KA 1VIWB 4IYBA 4XJ8A 2ZHMA 4YGCA 1QNWA 4P9WA 4Y20A 4Y22A 3N7KA 3Q7YA 5BP5A 3S8JA 4ZFUB 3WOGA 4Y24A 3RMXA 3B9CA 4TYSA 1W6OA 2P2KA 3WG2A 4AYUA 2Y9XE 1WW5A 2WT2A 4I4OA 3A23A 2ZHNA 4IONA 3LSEA 1S1AA 1I3HA 3MW3A 1WLCA 4K1YA 4XIOA 2G4IA 3BAOA 1FV3A 1V6JA 4UW4A 1APNA 3QR5A 1N1YA 3ASIA 2D6OX 2A6XA 1ONAA 1JTCA 2D6MA 4M3CB 1DQ1A 1FV2A 2L5XA 3AH1A 2GMPA 4U2AA 2ZHKA 2CY6A 1DYPA 1YTOA 1OFSA 1IKPA 1QOOA 3SITA 1HQLA 3C2UA 1GZWA 3FUQA 2JD4A 3V0AA 1ISZA 1OQ1A 3WHTA 4I8MA 4Q2FA 5H9PA 3AX4A 1SLAA 3QYDA 4ZFWB 3OBRA 2F8XC 1V6KA 2E53A 1G9DA 5DUWA 5BXPA 5H9QA 1X50A 4LBQA 4P0JA 1A3KA 4X39A 2QYIB 2PHXA 3ZXJA 3RG0A 3AYEA 3AKHA 1UZZA 1ISYA 1QKQA 4PBPA 3VKMA 3O4CA 2A3WA 1ENSA 5JDBA 2KI6B 1G9FA 4ENDA 2A6ZA 1H9WA 1FN0A 2FFUA 1G8WA 2AUYA 1XYFA 1LTEA 3H6SE 3Q9OA 4ZKTB 3FJEA 1XG6A 1GANA 1PC8B 2A71A 5FZUA 4JAWA 2UWAA 4ASMB 1VAMA 4FPJA 3VSFA 3IIRA 5HCFA 3UL2A 3W9TA 4Y1ZA 3OBTA 1N3QA 2GDFA 1KDKA 4I30A 1KJRA 4F83A 2WNEA 4HA2A 1JW6A 1Q8SA 2NVHA 1MS8A 2UUSA 3FBYA 4IHZA 1UAIA 3UJ0A 1BYHA 2AH2A 3WV6A 2JECA 1BFGA 1MS1A 4J2KA 1SBDA 3B9UA 1W6MB 4LBOA 4KBBA 1DZCA 1MZ5A 3FLTA 2K8RA 3NBCA 5CA6A 5SV8A 4IY9A 4YZ4A 1W6NB 3FJCA 1T4QA 2DTYA 3FJJA 3ILRA 4OWJA 2EF6A 2DVAA 4ISQA 5GAQA 4I3NA 1DJSB 1GLHA 2EXHA 5DUYA 4LO2C 1ULGA 1LGCA 4YLZA 2ZGQA 2AQZA 1SBEA 1JYIA 1EV2A 3FJKA 1CPMA 3BAHA 3VT1A 2D23A 3UD8A 3BRFA 4RL7A 5HCBA 3CRGA 4YM0A 2ZQNA 1FX5A 4GAIA 1AFCA 1TEIA 1A78A 5FNWA 1HCEA 3HBWA 2ZABA 4LBQD 3RS6A 3LCPA 1JXNA 1Q03A 2F2FA 4XJAA 3O5WB 2I2SA 1V6WA 2X2TA 1OKQA 4QO3A 4Q8KA 2BEBA 4PF5A 1JT5A 4I4QA 3ZX7A 5CNAA 3D4KA 1DIWA 4FOWA 4FPFA 3T1MA 4ZBVB 1JT7A 4JQ0A 2W52A 1S0JA 2D22A 1RY7A 1S0BA 1QOSA 2K4AB 2Z42A 2YUGA 1LOCA 2ZGRA 1DYKA 4USPA 3W59A 4W65A 3NV3A 1V00A 5HCAA 3PJQA 2NYYA 3N0KA 1TFMB 1W6QB 5BYNA 1JBCA 3H6QA 1YYNA 4MYEA 5BXRA 5T5OA 1VCLA 1AX2A 1GNHA 2PHTA 2ERFA 1LOFA 2A7AA 2VH9A 3SNMA 3ZC8A 1V6VA 1GICA 1CVNA 4P9XA 5F8YA 5AVAA 4JC1A 2HYKA 1D0HA 3PMEA 4XJ9A 2A75A 4QBVA 4XHXA 5GZGA 1UMZA 3O0WA 1YXWA 1DLLA 1BJQA 1K5VA 4XIKA 5DVHA 1U0AA 3ZXLA 3T2TA 4I4SA 2DUPA 1SLIA 2FGFA 1DQ4A 5L73A 2ZA9A 2HWAA 3N7LA 2GALA 2ZHLA 4YGEA 3O4BA 1NXD1 5T5PA 3MEPA 3WDVA 4X37A 5DG2A 4NO4A 3HALA 1FNZA 4Y20B 4H55A 4CTEA 2QN4A 4ZXKA 3LTQA 5F9TA 3R4SA 3NWKA 4FQZA 3WINA 2Y9FA 1F5FA 3BX1C 2DREA 1W6OB 5GLTA 3OPZA 5H9RA 3OJMA 3BAGA 3M3QA 1F31A 4XOGA 2UURA 4C1XA 4XTPA 2ZGMA 4GP0A 1CN1A 3SLIA 1A8DA 1JT3A 4JRAA 4EKXB 2WKKA 2WT0A 2ZGKA 3L2YA 1AF9A 2CTVA 2ZMLA 2DYCA 1N1TA 3WO2A 2PHRA 5BOWA 4DPNA 1CJPA 5JOYA 1RG8A 3AZVA 1QOTA 3AFKA 4NOTA 3M3CA 3RRDA 4XBLA 1GNZA 4XFUA 2UWCA 1DQ2A 2E7QA 1IOBA 1GZWB 4LBMA 1HKDA 2FHRA 1ITBA 3FJBA 2DUOA 2W68A 3WO4A 5LK5A 1FYUA 2VUAA 3WUDA 4YOLA 2Q9XA 3MALA 2NMOA 3RMYA 3AP5A 3AJZA 3AYCA 3U4XA 2Q5TA 1YO8A 2DURA 2E4MA 3RQ0A 1LHUA 3BAUA 3OYWA 1S0IA 4HR6C 1RITA 1W6PB 5GALA 1BKZA 4M3CF 4SLIA 3C9ZA 4GAFA 3AKGA 3P6JA 1CPNA 3WA1A 4R9AA 5GM0A 1EPWA 5E24E 3AP7A 3F62B 4AGGA 3AZWA 2EIGA 2ZQOA 1HDKA 2DWRA 2AR6A 3AH4A 4I4VA 1W0PA 3BRDA 5FZYA 4EB2B 4XMAA 4OWKA 2GNMA 2DVFA 4Q9PA 1ISWA 5H9SA 2H0BA 4JCKA 1XHBA 3O0XA 2YMZA 2ZKNA 3AZXA 2ZMNA 1J0SA 4R6UB 1IT0A 3OGGA 2W39A 2ZGOA 1N3PA 3ZXEA 3HSMA 2D6PA 4BLJA 3ZSKA 1WBFA 5GZEA 1LU2A 3AYAA 2VU9A 2R16A 3BOPA 1TOOA 4ZOTA 1V6MA 3NV1A 3E8LC 1IRPA 4UW6A 1DZQA 3M2MA 1E0OA 3I29B 4LO7C 4YFWA 1KQRA 2X2SA 4G6JA 4RA0A 5E89A 5IT6A 1BFCA 4G6MA 2ESUA 4XHBA 4A7KA 5FRAA 1HWOB 4IY8A 1K5UA 1Q8VA 1HIBA 4P0LA 3IPVA 2YV8A 4I4XA 1WUVA 4H9WA 2NN8A 5KXCA 2NP0A 3V0BB 1JLXA 1TP0A 4HL0A 4GOYA 1PZ7A 3WVJA 4P6AA 5EXOA 1UX6A 1ULFA 4YG3A 3VUOA 1I1EA 2D44A 4Z8BA 3HR9A 4XJZA 4BMBA 1G7YA 1M2TB 1OQLB 1IJTA 2ARXA 1VALA 2FFVA 2XOAA 1AJOA 2JJ6A 1TWMA 1S0GA 2RHPA 3RSJA 2PHFA 1C1FA 4AGRA 5KXEA 1BA7A 3B69A 2K43A 3O12A 1V6LA 3ZYRA 1IS5A 4PCRA 4ITCA 3RTIB 1TTUA 1WBCA 3BB2A 1DQ6A 2E7TA 1JUIA 1DHKB 1SZ6B 4P9YA 2GNTA 5DZEA 3IM5A 4BOWA 3CA5A 1S0EA 4AVTA 1IS4A 3P6IA 2GN3A 2OUHA 1SLLA 4J2YA 4YG0A 2WLQA 2TEPA 1IHKA 5IK8A 1W6PA 3WCSA 5DSSB 3ILAA 4M3CE 1BLDA 1S0FA 1WCSA 4QD2B 5IK4A 2R49A 3NV2A 2ZBJA 2OVUA 4I4RA 2OW4A 2V5YA 3FGMA 1JLYA 2VXTI 3FJ9A 1ILR1 3IM7A 2ZAAA 1MS9A 4YW4A 1II4A 5IK5A 1MVEA 4J2XA 1AXKA 5JMCA 3AK0A 5T50A 3CQAA 4FP3A 1MVQA 4XXPA 2WRYA 1SCRA 5DZUA 1AXZA 1LENA 2JE9A 4XMIA 1SR4C 1WBAA 5BP5C 1G86A 3ZVXA 4K20A 3WNXA 2ZGUA 2IWTB 3BA4A 3IM0A 3LSDA 2NMNA 2WSVA 1M16A 5IUQA 1LHOA 1T9FA 4R9CA 4KEIA 2ZMKA 4C1WA 1BQPA 2HZ9A 4H04A 2HWMA 3USUA 5FREA 4OEEA 1GZ9A 5DUUA 1RIRA 3VSZA 2A6WA 1KRIA 1N47A 1N3OA 3INAA 1R1ZA 1JYCA 2NZ9A 2R9KB 1F9KA 5DXDA 2LIQA 2Y9GA 2ZGLA 3N3HA 3WCRA 3OGFA 1JQZA 1TIEA 2CWMA 3PVOA 4IQPA 3V0BA 5BXTA 5GZCA 3HN1A 5F90A 4LBLA 1GV9A 3R05A 3IM6A 2D6NA 3FJDA 5EC5A 3UDAA 1AXMA 1AXYA 2EXKA 2HW9A 3H6RA 3POKA 1HCDA 4Y1VA 1LEMA 1DGLA 3BA7A 1PWAA 4I37A 3B00A 4L4HA 1SLCA 3O4DA 1SBFA 2YZ4A 2M49A 1GBGA 1FGAA 2VSEA 2KKIA 3CRIA 3WLUA 1WLWA 3JUUA 4Y1YA 4UW5A 4I1EA 5JVVA 2A3YA 4PBOA 2JKBA 2D7FA 4X38A 3ZXDA 4BMEA 1EYLA 4ZLBB 2P3IA 3OYWB 2AXMA 3JRRA 4BM8A 2DV9A 1UKGA 4YM2A 4YM1A 4YZ3A 3SH3A 4FOVA 1BZWA 3ZSLA 1W3GA 4D8HA 4LO1A 4DRVA 4GXLA 1MS4A 4I7IA 3ZYPA 4TLPA 2FDBM 4BPZA 1AX1A 1LULA 3OJVA 1ONKB 3WO3A 3VKOA 4FPCA 9ILBA 2BEAA 4EEEB 4A7ZA 3UD9A 1S0DA 3BA5A 3V79C 2VLCA 4LBNA 4DRRA 2D43A 2NM1A 4JKXB 2D6LX 3UJ4A 3CA1A 4K1ZA 5T54A 3HOMA 1QMJA 1H30A 2AENA 3D6EA 3PG0A 4Q9GA 4FPHA 4KEKA 2GO2A 2OUJA 1FWUA 3BTAA 4YW5A 5EYYA 3JU9A 1DQGA 21BIA 4LO3A 4FPEA 3ZXGA 4FPLA 2VW0A 4YG6A 5BQUA 3D5OA 3CNAA 1ISXA 3DGTA 5B2HA 5EYXA 4Y1XA 4AN6A 4ISRA 1Q56A 1LECA 2VSAA 1QU0A 2XG3A 1LOGA 4U36A 3N7JA 3ZC9A 3IAGC 3IPVB 4AGVA 5DUVA 1YIFA 4CZSA 3ZXFA 3KQRA 1CONA 3JUTA 4OUJA 2P23A 1LOAA 3POYA 3S8KA 2CNAA 2UWBA 5GJ6A 1CQ9A 1VAVA 1BXHA 2EXJA 4OWLA 2ENRA 1DFCA 4M00A 5GLZA 4BQ1A 4G9MA 1V6NA 2MC2A 2DS0A 2P37A 2CL2A 3PUBA 1HWNB 1QDOA 3MW2A 4XXAA 4GOVA 1CIWA 1JN2P 5BVPI 1YF8B 1DBNA 5EWSA 4G1RA 2JE7A 1C57A 1PUUB 1GKBA 2MIBA 5FNXA 1Z2VA 3VT0A 1AJKA 2KM2A 4XILA 5EHAA 2VW1A 1P63A 3WMUA 2RQ9A 2AYHA 5EG6C 3R4UA 1KNMA 4CJMA 3O4AA 4GWMA 5DZGA 4Y1UA 3NBDA 3N36A 4L4IA 5CAZA 4R9DA 4YZ2A 5I1BA 1WBLA 3VEQA 3OJ2A 4LO0C 3FJIA 4Q1PA 1XZZA 4IZEA 2J3PA 1KITA 4YGBA 3POWA 4FP2A 3BRGC 3WG1A 3M1HA 1Q8OA 1V6OA 3M3EA 3A07A 4I4UA 1HLCA 2D6KA 4GWNA 1DQ0A 3ZSJA 2C9AA 3B3QE 3FJAA 4DCKC 1RINA 3QLQA 1L2HA 2ES3A 2KH2A 1Z4SA 1Q04A 3TB0A 4I1BA 1ZM1A 3MPPG 3A21A 3IN9A 3VWCA 2GZBA 3WINC 2A6VA 2E51A 2DVBA 3ZXKA 1BFBA 2KI4A 1MD6A 3W58A 3WMVA 2IHOA 2GN7A 3WDYA 5IK7A 3BODA 1PZ9A 3USUB 3SISA 1Q8PA 3WZ1A 2P3KA 3TAYA 2ZGSA 1AVXB 1BASA 2WT1A 3BADA 1Q8QA 1LGBA 4F34A 2ZGPA 1FMMS 2A70A 4TZDA 5GLVA 2D1ZA 2ZZJA 3M3OA 1GZCA 1ISVA 2DU1A 3SH5A 3I8TA 4ZFYB 2V73A 4Q1RA 2D24A 4OZXA 2ARBA 3CA0A 4I0YA 1D2SA 4DS0A 5JLVA 1LHVA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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