1WD4A

Crystal structure of arabinofuranosidase complexed with arabinose
Total Genus 157
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
157
sequence length
482
structure length
482
Chain Sequence
MGPCDIYEAGDTPCVAAHSTTRALYSSFSGALYQLQRGSDDTTTTISPLTAGGIADASAQDTFCANTTCLITIIYDQSGNGNHLTQAPPGGFDGPDTDGYDNLASAIGAPVTLNGQKAYGVFMSPGTGYRNNEATGTATGDEAEGMYAVLDGTHYNDACCFDYGNAETSSTDTGAGHMEAIYLGNSTTWGYGAGDGPWIMVDMENNLFSGADEGYNSGDPSISYRFVTAAVKGGADKWAIRGANAASGSLSTYYSGARPDYSGYNPMSKEGAIILGIGGDNSNGAQGTFYEGVMTSGYPSDDTENSVQENIVAAKYVVGSLVSGPSFTSGEVVSLRVTTPGYTTRYIAHTDTTVNTQVVDDDSSTTLKEEASWTVVTGLANSQCFSFESVDTPGSYIRHYNFELLLNANDGTKQFHEDATFCPQAALNGEGTSLRSWSYPTRYFRHYENVLYAASNGGVQTFDSKTSFNNDVSFEIETAFAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Aspergillus kawachii
publication title Crystal structure of a family 54 alpha-L-arabinofuranosidase reveals a novel carbohydrate-binding module that can bind arabinose
pubmed doi rcsb
molecule keywords alpha-L-arabinofuranosidase B
total genus 157
structure length 482
sequence length 482
ec nomenclature ec 3.2.1.55: Non-reducing end alpha-L-arabinofuranosidase.
pdb deposition date 2004-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05270 AbfB Alpha-L-arabinofuranosidase B (ABFB) domain
A PF09206 ArabFuran-catal Alpha-L-arabinofuranosidase B, catalytic
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1wd4A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1wd4A02
4Y20B 3AXDA 3RMXA 2GNBA 1AVXB 1EV2A 1GZCA 2ZGNA 3FJAA 4PBOA 1WLCA 1QOOA 4Y26A 4Z9WB 1QF3A 3UJQA 1BARA 1YF8B 1F31A 5KXBA 1G9BA 3VUOA 2UURA 5BP5C 1IILA 1W6MB 4LBMA 4Y22A 1HKDA 3AP5A 4LO0A 4PC4A 1QQLA 3MW2A 1MZ6A 1DQ5A 2EXKA 5DSSB 2A75A 2ARBA 1CIWA 2NN8A 5DUUA 2V5YA 4FVVA 3ZXLA 4JKQA 4XJWA 4XOGA 2GDFA 2FDBM 4FOQA 2ZQOA 2D1ZA 4KEKA 4ATEA 4YM2A 2GN3A 5GZFA 1LHWA 1VALA 1BFBA 3BRFA 2A70A 2DRZA 4J2XA 4OEFA 5EYXA 1HIBA 4LBQA 5T5LA 1DGLA 5CAZA 5IUQA 1NLSA 1F9KA 2ZGUA 3WINC 4LO3C 1MD6A 2D6PA 1H30A 3DGTA 4YOLA 3H6RB 1N3OA 1RIRA 1QDCA 1S0BA 1PZ7A 4Q91A 3SH5A 1GBGA 3BA4A 1HDKA 4Y20A 4CZSA 1W3FA 5BXPA 4YZ4A 2SLIA 3OJMA 3VT0A 1H9WA 3N0KA 1JT3A 4GAIA 3O5WB 2D3RA 5JMCA 5SV8A 1I3HA 4JCKA 3IM5A 2NVHA 3WMVA 3RSJA 3O49A 4FOWA 2VW1A 3CNAA 2NTDA 2GNMA 1J0SA 5T5PA 3RRDA 3WG3A 4RA0A 3WDWA 3ZXJA 3V64A 5E8AA 1Q56A 3A0KA 1Z4SA 1GICA 2G4IA 3UJOA 2R1BA 1Z78A 3T8SA 3R4SA 3VSFA 1LTEA 2D7IA 3FJFA 1W6NB 2UWAA 3VKOA 5BXRA 4Y24A 2ESUA 1DIWA 3POWA 1XG6A 4XFUA 2A3YA 4XTPA 5GZDA 2D20A 3AFKA 1V6MA 1SLIA 2AGSA 4FP2A 2DU0A 1BYHA 1ZM1A 4ZLBB 2NP0A 2X2TA 2VSAA 4FQZA 3FJIA 3JU9A 1FATA 1EPWA 3AH2A 3H6RA 3QYDA 4IZXA 2WSVA 3N3HA 2GMPA 3O4CA 2VU9A 3B9UA 3PVNA 1A3KA 3A22A 2BEAA 1UPSA 5GLTA 3OPZA 1JT4A 2D6NA 1V6IA 2F2FA 4PF5A 4SLIA 3POSA 4GKYA 1FYUA 5FNXA 3FFZA 1WLDA 4OWKA 4OW4A 4I8MA 2MIBA 1Y7BA 1OKQA 4J2KA 2ZGQA 3ZXFA 4LO2C 1LOFA 3FLTA 4KC3A 2YROA 1CE7B 1LECA 4JC1A 3MW4A 1MC9A 3K1XA 1FMMS 4IY8A 2P3IA 1QMJA 3GNEA 3WO2A 4Q9PA 4Q1RA 5F90A 1DFCA 2CNAA 4I3NA 2GMEA 3FLPA 4FPJA 3I29B 5BQUA 4AWDA 2SBAA 3N7JA 5D63A 3WHUA 1AFCA 2A6XA 1A8DA 3OJ2A 3AJYA 2WT0A 1HKNA 3R4UA 4ISRA 3OYWB 4ZOTA 1W6QB 2A6VA 3AKFA 2DS0A 2X2SA 4HL0A 5DUVA 4ZFYB 1KDKA 1Q04A 1YRZA 3SNVA 1BFGA 2D6MA 3AYDA 2DWRA 3CA1A 4EKXB 1JLYA 4H04A 4DEPA 4HA2A 5BVPI 1UZZA 4XYXA 1DFQA 3M2MA 1YTOA 3VT1A 3BRDA 5KXCA 1Q8SA 4I30A 1ULGA 1TEIA 1CR7A 3KQRA 1C57A 2Z48A 4P14A 2ZGPA 3FJ8A 2FO1A 2YV8A 4UW4A 3VKLA 3AP9A 2JE9A 5GAQA 3VSZA 4AN7B 3QR5A 3ASIA 1KITA 4XHXA 1DQGA 5HCFA 5T5OA 1GANA 1VAMA 3HSMA 2NZ9A 2AQZA 1ILR1 3WOGA 1GZWA 3JRRA 1LODA 4H55A 2OUHA 4XHBA 3SLIA 2P23A 4OUJA 2ZHLA 1G7YA 2D44A 1KRIA 2ZACA 1KJLA 4IHZA 4Q27A 1U0AA 1IS6A 3NV2A 1IRAX 5JOYA 1W6PB 1JUIA 1SLBA 3V79C 4LBQD 4D8HA 3OYWA 1LEDA 2R9KB 3O4AA 4AGGA 2K8RA 3PJQA 3CAHA 4H9WA 4K20A 2E4MC 1FX5A 3ZPYA 1LU2A 4I6IA 3VEQA 2ERFA 1G9FA 1LJ7A 4LBJA 2E53A 1Q8PA 3CQAA 4BMBA 4I1EA 4EFPA 3O3QA 3LTQA 2EF6A 2WT1A 2JECA 4XJ9A 4QBCA 2NM1A 4LBNA 4OEEA 2ZHKA 2CL2A 3FBYA 3WDXA 3H6QA 3ZYPA 4L8QA 3O4DA 4JRAA 3POYA 2I2SA 1MZ5A 1MS4A 1D2SA 4EB2B 1DJSB 1FNYA 1YYNA 2WQZC 4WZFA 4JAWA 2Q5TA 2ZGKA 1URXA 3VV1A 1ULCA 1UAIA 2C5DA 3NWKA 1MACA 4IQPA 3HR9A 1QQKA 4XILA 2E7TA 3O0WA 2AUYA 4L4HA 3HBWA 3BIWE 3AKIA 1HQWA 1TP0A 3AZYA 5FREA 3Q9OA 1LULA 1N1VA 2H0BA 1BKZA 4FPOB 5EXOA 1JYCA 1GLHA 3Q7YA 1JN2P 4CRQA 1ABRB 1AXKA 1QXMA 5F9TA 3P6IA 2DYCA 1UX6A 3TB0A 1V6UA 2R0FA 3WNXA 1SR4A 2DUQA 2Q3NB 1QNWA 3WDYA 4AVVA 2OUJA 2OVUA 2A5ZA 2ZGTA 4Y22B 1DZQA 2LALA 1II4A 1V6NA 2Q9XA 2YZ4A 1IKQA 1RINA 4J2YA 4Q26A 3RMYA 4DRVA 2CWSA 3ZVXA 1N3PA 5EHAA 1RZOB 2DVDA 4FPCA 2AENA 3PVOA 1QNYA 1KNMA 4WV8A 2VW0A 1JLXA 7I1BA 3B69A 4BMEA 5E89A 2XOAA 1F5FA 2M49A 4LBQB 2P3JA 1WBFA 1DQ0A 3UJ4A 4WVVA 4AGVA 3WUCA 5GLVA 3UD7A 1UKGA 2VW2A 4OWJA 1TTUA 2A71A 3A0NA 4I7IA 2DU1A 1M2TB 3H6SE 1WD4A 3ZXDA 4UW5A 3O4BA 3CRGA 3FUOA 5LK5A 1S0DA 5JDBA 2FGFA 1CVSA 3MALA 1LU1A 3BAUA 2ZGMA 1AZDA 5FNWA 4LO7C 2D6OX 3O12A 2WT2A 1RG8A 3FUQA 5IK8A 3ZSLA 2VXRA 2ZHNA 2P37A 1VAVA 4XXAA 3O0XA 2Z49A 5T5JA 1TIEA 9ILBA 2HWMA 4XTMA 1I1EA 5DXDA 5B2HA 3USUA 4CTEA 2LIEA 3TAYA 2GMMA 3V0BA 3FJEA 5E88A 2A7AA 1LHVA 1GGPB 1IKPA 4XMAA 3AP4A 2PELA 1EYLA 2WBCA 3CRHA 4EFRA 1NZKA 4C1WA 4XJUA 3V65A 5F8YA 1BXHA 4I4RA 3IAGC 5DUXA 3BB2A 1LOEA 4GAFA 2GZBA 3WA1A 3WDTA 2WNEA 3RS6A 2PHUA 1TOOA 1IHKA 1WW7A 1W6OA 1MS8A 1PUUB 2QN4A 1LESA 1RITA 4XE9A 3RTIB 1G9CA 3N35A 1SCSA 1QGLA 3M3OA 4M3CB 4AVTA 3CA5A 2IHOA 5JOWA 5CBLA 4G6MA 4XZPA 1OQLB 5I1BA 4JKXB 2UWBA 3ZSMA 2EAKA 2NYYA 4YZ5A 1YI7A 3AJ6A 3VKFC 1Q8QA 4BOWA 1GZ9A 1LGBA 1SLAA 1CESA 2KM2A 3M1HA 2NMNA 3IPVB 3WLUA 3N7MA 4XBLA 4F34A 1KJRA 1FV3A 2PHXA 5EC5A 3WINA 5HPZA 1JBCA 4LO3A 3FJDA 4QD2B 3AZXA 2K43A 3WV6A 1OFSA 4XFTA 3OJVA 3S8KA 2EALA 1JQZA 4USPA 1K5UA 1PC8B 1FN0A 3NV3A 5DZEA 4A7KA 2D7RA 3C2UA 4I2SA 3AYAA 3AZWA 4LO8B 1AF9A 2PHRA 5GZGA 4MYEA 1S0IA 4KBBA 2UUSA 1SBEA 4FP3A 3WG4A 2D3SA 1TWMA 4Y1XA 3CA4A 5F5QA 1C4RA 2Z42A 1ENRA 4F83A 1GSLA 3FLRA 1LOCA 1KDMA 3UD8A 4M3CA 1BJQA 3D7WB 2CWMA 1CQ9A 4XJZA 3O44A 4GP0A 4IY9A 2MLLB 5DUWA 2DTYA 2A6YA 6I1BA 4FPKA 2AFGA 4LO1C 2DVAA 3IPVA 3NV4A 3AYCA 1DYKA 1G86A 3IM0A 5BQUC 4DENA 2LIQA 4GOVA 4YGDA 2PHFA 1WBAA 2ZGSA 3WG1A 3FJKA 4YG6A 4G1RA 4R9BA 1IJTA 2EIGA 1SLCA 4P0JA 1ITBA 2PHWA 3OJBA 3OBRA 1GZWB 3CU1B 1N3QA 1DZCA 4I0YA 4Y1UA 2ZBJA 4K21A 2GNTA 2NMOA 3NBDA 2L5XA 3H0OA 1S0JA 2VXTI 3VWCA 3Q7XA 3N7LA 2VLCA 2R1DA 1SACA 1PWAA 1MS5A 3W59A 2Y9XE 1HCDA 2DUPA 4K1YA 3I4IA 4IONA 2ZR1B 4M00A 2WJSA 1PZ8A 4OZXA 3PMEA 1IOAA 2EXJA 5GM0A 1RY7A 3LLPA 1ISVA 4XBQA 2WSUA 2OW4A 3L2YA 3HN1A 3IN9A 5KXDA 1JW6A 4DRRA 1AJKA 1MR5A 1JXNA 2UU8A 1Q8VA 4I4QA 1UN1A 2ZMLA 5E24E 4G9NA 5JLVA 3Q7WA 3FJHA 1S0FA 1JOJA 4YZ3A 4GWMA 4L4IA 4TZDA 4YLZA 1DYPA 4AYUA 3ZYRA 3FJBA 5F8SA 2CY6A 2ET2A 3VKNA 1TFMB 2ZGRA 3ILNA 2HW9A 1BA7A 2RSTA 4QC4A 1D0HA 1IS3A 4ZBVB 3NBCA 2LTNA 4DCKC 1DZDA 4DQAA 4I4XA 1WUVA 4J2SA 1SLTA 2ZGLA 5EYYA 4ZXKA 3HALA 4QKSA 1JT5A 3UK9A 1DQ6A 4FOYA 4TLPA 4UW3A 2D43A 2D22A 3D6EA 2GN7A 1FNZA 1JTCA 5GZEA 4D0ZA 2P2KA 4GOYA 1ISZA 2JD4A 21BIA 4IZEA 1UMZA 3IKWA 4YGCA 4BLIA 4YG3A 1BLAA 3ZXGA 5BOWA 1ULDA 3O4OA 2YMZA 1XYFA 2AH2A 2BQPA 4Q9GA 3I2AA 3BRGC 2GALA 1XZZA 4A7YA 2B7YA 5FZYA 2JDZA 2ZABA 1G9DA 4ENDA 1EVTA 4R9CA 4GKXA 4YW3A 3BA7A 1AVUA 3B9CA 4BLJA 3O5SA 4YW1A 2E6VA 1DHKB 2HZ9A 5H9PA 2Y9FA 1NUNA 2J3PA 4GXLA 4JQ0A 1YIFA 1AXZA 3N36A 5CB7A 1WBLA 2Y9GA 1WW6A 3DUIA 3R05A 2MC2A 1LHUA 4EEEB 4GALA 1FAYA 5IK4A 3APBA 1YO8A 2W39A 1RMLA 1AXMA 4YGBA 1T4QA 3LSDA 4FQ4A 3W9TA 4ZFWB 4TYSA 3AP7A 3GALA 3A4UA 4ITCA 3B00A 1S1AA 2ZA9A 3AK0A 4FPGA 2RG9B 3AJZA 4GWNA 4Z8SB 3CRIA 3BADA 3MPPG 4ISQA 4QALA 4P9WA 4D69A 3V0AA 2EXIA 4G6JA 3D4KA 1S0EA 2DV9A 3USUB 2I1BA 2E7QA 3V0BB 1VLNA 3BAHA 3WDVA 1K5VA 1IS5A 1Q8OA 4KEJA 4EFQA 4I4OA 3NBNA 3AKGA 3WG2A 1V6LA 1LOGA 1ONKB 5BXSA 3JUTA 4FPYA 3ZC9A 4PQ9A 2KI6B 2D6LX 1OQ1A 5JOXA 5FZZA 5DZFA 1W6OB 3A07A 5CNAA 2WKKA 3ZXEA 3M3QA 3IM6A 1SBDA 1W0OA 3PG0A 1FMZA 3INAA 3W58A 3BAQA 1W0PA 1R1ZA 3QCWA 4LO0C 3P53A 4II0A 1H9PA 2FFUA 1ISWA 3MW3A 1MS1A 4I1BA 1W3GA 4M01A 4P0LA 2A6ZA 3IMNA 3A21A 4I4UA 5DUYA 3PHZA 4XIOA 2R0HA 2W68A 3N7KA 5BXTA 2ZKNA 3AJ5A 4M3CE 2DUOA 5GLUA 4XFSA 1MS3A 1E0OA 3HMYA 3A23A 4UW6A 2Y9WC 1JY0A 1BFFA 1KQRA 4R9DA 1BASA 2PHTA 3SH3A 1HQLA 3POKA 4XBNA 4RL7A 2VSEA 3SH4A 3S8JA 3KM5A 4FOVA 3BAVA 3UJ0A 3NV1A 5DVHA 3PVEA 2ZGOA 1MVQA 5BP5A 3ZSKA 2R16A 4WVWA 1ENQA 1WD3A 1G82A 4W65A 4IYBA 4ZKTB 2V73A 3IIRA 2DVGA 2D3PA 1IRPA 3ATGA 5KXEA 1CN1A 1CONA 1BQPA 3CA0A 3B01A 1MS0A 1HWOB 5JOZA 2DTWA 1DQ1A 2GNDA 2YY1A 2FHRA 1V6JA 1LHNA 3UL2A 1SZ6B 1V6OA 1M16A 3FJJA 1N1TA 3ILAA 3D5OA 1LGNA 2HYKA 4BM8A 3AXEA 4FPLA 1CPNA 3OGGA 3B3QE 5GZCA 2F8XC 4Z8BA 1BZWA 2JKBA 4Q8LA 4LBKA 4YFZA 1GNZA 2DVFA 1GKBA 1AX2A 3E8LC 2XB6C 1PZ9A 3I2XA 1Q1UA 1APNA 5IK7A 2D24A 1J1TA 2HWAA 1W6MA 5GALA 4BQ1A 3AP6A 1QOTA 4ATFA 3WO4A 4ZFUB 3WZ1A 1SBFA 1SCRA 4JPZA 3CA3A 1AXYA 2VY0A 3AH4A 1FWUA 1ZA4A 4XIKA 2A6WA 3WHTA 3F1RA 3SITA 4YW4A 2XG3A 2A3XA 1FGAA 3RTJB 4ZGRB 2R49A 4WBCA 1WBCA 2F2FC 4GA9A 2ENRA 2AREA 2ZAAA 3WDUA 4AN6A 1QDOA 4Y1ZA 1GV9A 1AJOA 1CJPA 2P34A 1JHNA 3AYEA 4QD2C 4Q1PA 1R8OA 2ZMKA 5D62A 5IT6A 3BA5A 2RHPA 4XDQA 4X39A 4Y1VA 4OEGA 3C9ZA 2D6KA 1LOFC 1V6WA 4K1ZA 1ENSA 3QLQA 5T52A 1V6VA 3WUDA 5CA6A 1QKQA 4YM1A 1FQ9A 1ISYA 2A3WA 2DURA 2AAIB 4QKRA 3WMUA 3T1MA 1FV2A 1LHOA 4I96A 2KLLA 4FGFA 3JUUA 3P6JA 3F62B 2C9AA 5JVVA 4DFSA 1BLDA 3LCPA 5HCAA 2VUAA 4P9YA 4HJJA 1DQ4A 1GNHA 2TEPA 1W6NA 1SFYA 1LCLA 5D61A 1HWMB 2VH9A 2D23A 4DS0A 4LO1A 2FMDA 4YGEA 1QU0A 2ES3A 3OY8B 1V6XA 1LEMA 3IM7A 1L2HA 3OBTA 1HWPB 4I4SA 1MVEA 1MS9A 1FWVA 2AYHA 1N4KA 1HCEA 5DZUA 4YFWA 1PUMB 1LOBA 1Q03A 1V6KA 4GP3A 4LO2A 1BFCA 1DQOA 4XJ8A 2JJ6A 1WLWA 3BOPA 3ZX7A 1YXWA 1UL9A 41BIA 1Z0HA 4YW5A 1IT0A 4P9XA 5AVAA 4J23B 1O4ZA 4XJAA 3AH1A 5HCBA 4FPFA 4D0TA 3ILRA 3VKMA 4U2AA 1G9AA 2BEBA 5BYNA 2W52A 3BODA 2ZHMA 1AVWB 3RQ0A 1Z2VA 4NO4A 4XKIA 5GJ6A 1ONAA 1W3AA 1O4YA 3M3EA 2P3KA 5DZGA 1S0CA 2P39A 1B09A 2YUGA 4QBVA 3ZSJA 3SISA 3WO3A 1VIWB 3WVJA 3SNMA 3T1LA 1R8NA 5H9SA 1CVNA 1QOSA 3OY8A 4NOTA 4YZ2A 3RG0A 4OWLA 2IWTB 1P63A 4CJMA 2ZQNA 5EWSA 2DRYA 4I37A 1WW5A 2GO2A 4M3CF 3V0AB 1C1FA 1VCLA 3CA6A 4YM0A 1JYIA 2UWCA 4YZ1A 4BPZA 5F8WA 2WRYA 5L73A 4XXPA 1W6QA 4PBPA 4LBLA 4LBOA 4YM3A 4R6UB 2RQ9A 1ISXA 4X38A 4HR6C 3BAOA 4KEIA 3ZXKA 4QO3A 31BIA 3I8TA 5T55A 1JT7A 4R9AA 4Y1YA 2DREA 3NBEA 5H9RA 2ZZJA 4P0KA 2D7FA 1S0GA 4X3AA 2E4MA 3LSEA 3ENRA 1X50A 5G00A 4XMIA 1XQNA 4Q8KA 4AVSA 3VT2A 1SR4C 1ULEA 2FFVA 1PZZA 5GLZA 1DLLA 1AVBA 2W08A 4U36A 3TC2A 1AX1A 3AKHA 3T2TA 1IS4A 5FZUA 2WLQA 3KMVA 1A78A 1WCSA 1S0LA 2CYFA 4I4YA 3O0VA 5H9QA 3U4XA 3BTAA 4FPEA 2KKIA 3BX1C 3ILFA 1ULFA 2AR6A 3ZC8A 1AX0A 1W6PA 3NJ5A 1UZYA 1IOBA 5DG2A 2JE7A 1DQ2A 3FGMA 2QYIB 3AZVA 1V00A 3M3CA 2E51A 4FPHA 5T54A 1DBNA 5GLWA 1AVAC 1N1SA 3HOMA 4I4VA 1CPMA 1N1YA 1N47A 4Q2FA 4X37A 1T9FA 2ZMNA 5T50A 1LGCA 3WCRA 2K4AB 2AXMA 1HWNB 1C1LA 1GYKA 5FRAA 1LENA 4ZA3B 1HLCA 3OGFA 4YW2A 4AGRA 2EXHA 8I1BA 4LO7B 4HANA 1I1BA 4P6AA 1TWEA 3FJ9A 2ERMA 4DPNA 2ARXA 1YBIA 1WW4A 4A7ZA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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