1V6UA

Crystal structure of xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86 complexed with 2(2)-alpha-l-arabinofuranosyl-xylobiose
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
436
structure length
436
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGSSTPPPSGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords endo-1,4-beta-D-xylanase
publication title Crystal structures of decorated xylooligosaccharides bound to a family 10 xylanase from Streptomyces olivaceoviridis E-86
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces olivaceoviridis
total genus 168
structure length 436
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2003-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1v6uA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1v6uA02
1RZOB 1H49A 4Z2LA 3TC2A 4BCEA 2VMFA 2WZEA 1NWSA 1TZ7A 3BCDA 4WSKA 1JDDA 4U2YA 1M2TB 3M07A 1QOXA 5HPCA 2BHZA 2VX6A 1T9FA 1VIWA 3DHUA 4JQ0A 2DH2A 3FFZA 3GNRA 4OUEA 1UA7A 1JD9A 3E1F1 1UHVA 2WVVA 4V2XA 3OLGA 1IZJA 4JFSA 3CPUA 4UOJA 3UG5A 1AVXB 3AJ5A 1FP9A 3PN8A 2A3HA 3ZJKA 1E72M 1MD6A 1US2A 1CXHA 1B2YA 1FA2A 2VRJA 1VEOA 3OBRA 2WKLA 3VIPA 9ILBA 3O5WB 3ZT7A 3ZQ9A 1ZS2A 4MJ4A 1HJQA 5ABGA 3BAOA 1OT1A 3APGA 3K4AA 1BVZA 1XD0A 1JTCA 4XZWA 1HF6A 3UCQA 4EEEB 1FN0A 3AS2A 3F5LA 5IHRA 3KMVA 1W32A 3VMPA 1PZ3A 5EB8A 2CETA 3ZOAA 2HZ9A 5CPQA 1B0IA 4V28A 3QR3A 3ILAA 2AFGA 4XFSA 2ESUA 3O44A 3LPOA 4UZUA 4I4PA 3EMQA 1NOUA 3WQWA 5FIPA 1XCXA 3W0KA 3JUTA 3BLKA 1TR1A 1HP4A 3WD4A 3M7SA 1QNRA 5EHAA 2QMKA 3K8MA 4IQPA 3VUPA 4C7FA 1WDRA 1LG2A 3WH9A 3AROA 4CCEA 2D0GA 4JKMA 4M24A 3WH5A 2GSJA 4PSPA 1NWUA 5E0FA 4D1JA 1G94A 4XKIA 4DWSD 3M46A 1NARA 1W91A 3B8SA 3K1XA 1VFFA 4PBGA 1VB9A 2WVVB 4ATLA 3WN6A 3WY1A 1UWQA 4TVDA 3BB2A 4ZXLA 1D2KA 4HTYA 1QI0A 3AXIA 1J0ZA 4KRTA 3BLPX 1MYRA 2TAAA 4TUFA 5D61A 4GZEA 1RD6A 4P7NA 1C3FA 4DM2A 1U2YA 1C7TA 3GXDA 2J8GA 3SUVA 1Y7VA 5IXEA 2W61A 3OB8A 3ZJ7A 3CZGA 3VO0A 5LA1A 2DQXA 1JLXA 3BMWA 3T08A 3BTAA 4AD4A 1PX3A 2VX4A 1NP2A 2XVPA 1G0CA 3KZSA 3L2MA 1TVNA 4ZFWB 1BSIA 1XH1A 3NBDA 1UUQA 3OBTA 4I4OA 2WMJA 4QFUA 1V3LA 3IIRA 2FH8A 7A3HA 1OGBA 5C8BB 3FJIA 1CZ1A 5CXPA 1IZKA 2KI4A 3WQ4A 4G1RA 1M03A 3WDIA 3HBWA 1OGSA 3ARRA 2VZOA 1HCDA 1RP8A 1KWGA 5I1BA 2WC7A 4W8LA 4C7GA 1CNVA 4F66A 4EB2B 2J3PA 3VIFA 4TTGA 1H1NA 1LWJA 2PWGA 4ZGRB 1JNEA 1R8LA 4H41A 1JZ6A 3W81A 5JBDA 1ODUA 1UZ4A 3AIVA 3RM8A 4Z2IA 1IV8A 1VENA 2VO5A 4E8DA 4IONA 5I0DA 3RILA 5A6AA 5BYWA 3VPLA 3CHFA 5F8YA 3ZJ8A 1R8OA 3G6MA 5A6JA 4AN7B 4TVCA 4I8MA 2FHFA 3QHMA 3GH7A 3CQAA 3NBEA 1B3ZA 1IT0A 2CYGA 1JZ8A 3O3QA 4I4RA 2C8NA 3WUGA 3BXWA 3SCOA 4IPNB 2L5XA 5D63A 3IK2A 2EPKX 2V3DA 4RE4A 4CN4A 1Z32X 4DEPA 5A8OA 2PB1A 3W26A 1GOOA 2PBGA 3VU2A 3EDEA 2GDVA 3FHQA 1W1TA 3VIOA 1WD3A 1JYNA 2UUSA 4J3WA 4PTMA 2WHLA 4WJXA 3OIHA 3CA0A 4HOXA 1G9DA 3AIUA 3NYDA 2FDBM 4B9ZA 1E6PA 5BROA 3D5HA 4M56A 2D44A 2OSXA 2MIBA 2DT3A 1II4A 3O6AA 4OIFA 3RMXA 2DIEA 2DRYA 2BY2A 2X2SA 1JXKA 3ARTA 4CD8A 3VDBA 4PSRA 1M16A 4FLSA 1EH9A 2D3LA 1VJSA 2V3FA 4PMUA 1V3IA 1EQCA 5GPRA 2WC4A 1BYAA 4ML4A 2CEQA 4LO2C 4D1IA 5A2AA 2J75A 5AYIA 3WA1A 4OKDA 3VM7A 3WMSA 2Y9XE 3VMNA 2BS9A 2V5CA 4ATWA 1BA7A 2ZX5A 4AC1X 4NRSA 2D24A 1X1NA 4KGJA 3I3DA 2ZX6A 2XIBA 4D6HA 2EEXA 4EANA 4W84A 3W82A 3AOFA 3PTMA 2GZBA 1VFOA 3K8LA 2Q8XA 1QBAA 1XC6A 2IHOA 1K9EA 3VGBA 4Z2HA 3PZIA 3FJ8A 4ZE5A 1M7XA 1CGXA 3AH1A 1GORA 5GNXA 1K9DA 3NSNA 3OZPA 3EMCA 3SCWA 2VZTA 1E6RA 4J2XA 1DEDA 2YLAA 5TD4A 1LG1A 1NWRA 1U30A 2X2YA 4MDPA 4JFTA 1GHSA 7CGTA 2EPLX 2OSWA 4W8BA 2CXGA 3WMBA 5I24A 2NZ9A 3CUFA 1BASA 4LO0C 1BFNA 3GM8A 1JYWA 4AYSA 2VX5A 5A95A 1QNOA 3CUHA 1AQHA 2YL5A 2CPUA 2UY4A 3LPGA 1O6IA 4TLPA 5A6SA 4OEGA 5CPTA 4IUGA 3Q7YA 4EFRA 1E6SM 4A7KA 1C90A 1UKQA 4MTVA 3MSGA 3TTYA 3VINA 5D9OA 2WKGA 4Q91A 4Q9PA 1GPFA 4ZOTA 3W29A 1V0KA 3DYPA 5A3HA 1FFQA 4JL2A 1BLDA 1UWIA 4EFQA 1W3HA 3ZT6A 2WZHA 1E56A 3VT0A 3A4XA 1DHKA 3VOCA 2WCAA 3CHEA 3T2PA 1UQZA 1XYZA 2IXUA 3N18A 4RE2A 3B9UA 1KGUA 4OZOA 3IM6A 5KZ6A 3WQ5A 3VSFA 2I1BA 3FY1A 4PMZA 2F2FC 1JAEA 5M17A 2E8ZA 5AYBA 4LO7C 5E6ZA 2YIHA 4XX6A 4Z2KA 3QOKA 5A8MA 2A3CA 3S8JA 4ZE4A 3H6QA 2CBVA 3WSUA 1AVUA 4ZKTB 5DVHA 4W86A 3Q7XA 1GQIA 1AMYA 2VSAA 2PWDA 3CRGA 4D71A 3WF1A 2W67A 5ABHA 2D2OA 2NP0A 2XFFA 4FLQA 3OJMA 4EAMA 3D3AA 3E8LC 4UFJA 4KEIA 3CA5A 3VD9A 3VDAA 2Z48A 1JF6A 1PIGA 5GNYA 3GYCA 1V6XA 2FGFA 1E0WA 3W25A 2W63A 1EXPA 3AIEA 4L4OA 3F5JA 3FJDA 2W4XA 1SYTA 4KGLA 4I4XA 1M04A 3VD4A 1DLLA 5HDRA 1XZZA 3WD3A 4PMQA 5F7UA 2D1ZA 1V3MA 3RMEA 2CBJA 3FJEA 4CN6A 3R4SA 4MNLA 4M8UA 2GJXA 2YOCA 3F4VA 5E6YA 4ATDA 4QCEA 2XYLA 3BCFA 3JRRA 4U2ZA 4W89A 6A3HA 3AKGA 3N15A 2WBKA 3GH5A 2E9LA 4W5UA 3CZ8A 5I78A 4J3XA 3I3BA 1B31A 1C7SA 1DJSB 2VL4A 3WFZA 1KBKA 1V0LA 4P8VA 1DIWA 4LYPA 4BQ2A 5FL0A 1V0MA 2CKSA 1D0HA 5EBAA 3WELA 5CLWA 7I1BA 3CMGA 4PMRA 3AZWA 1DWJM 4UFIA 4AEEA 3OGSA 3WH8A 3WNPA 3OJ2A 1UQYA 3WUEA 2FGLA 1H41A 3UERA 1OBAA 4PCTA 2PWEA 2X0YA 3WQVA 4PTWA 4RL3A 4X9YA 4CU7A 2VCCA 1N4KA 2XFYA 1XV8A 1RY7A 4Z8SB 2DRZA 4QLLA 2E3ZA 3P53A 1B1YA 4OEFA 1PJ9A 1R8NA 1TMQA 3UEQA 1IHKA 1BLIA 3VUOA 4XV0A 4DUVA 1BGAA 1S0CA 2O9TA 4G9MA 4CU6A 1TUXA 3UETA 4TXEA 2CBUA 1H09A 3CZJA 4DWSC 1FP8A 4Q9GA 2VT0A 3SUWA 2VZVA 3B9DA 4B3KA 2VZSA 3VWCA 4MB3A 1YQ2A 2VVNA 4FLRA 3KE0A 2FGZA 3HMCA 3H6RA 3BAVA 1E6ZA 3ZC9A 2WRYA 3O4BA 1UKOA 4GQQA 1BG4A 1MQQA 1ODZA 4GO8A 3PMEA 3AZSA 1TA3A 4TX6A 3MUY1 3VEQA 1PIFA 3N7LA 1W3KA 3RM9A 1JYVA 2Z1KA 3ARUA 1JT5A 1LL7A 1NWTA 1DQGA 1UR4A 3AYRA 2XJ7A 3AJ7A 4WKFA 1FFRA 2FFVA 2RGLA 2WHJA 4PMNA 5I5RA 2EPNA 3NJ3A 5E70A 3IJ9A 3I29B 2WWDA 4GQRA 1SMAA 3P6JA 4GAFA 3BAHA 1CPUA 3VX0A 1FMZA 1ITCA 4UQEA 1KXHA 1GVYA 1D3CA 2G41A 3AXXA 2FO1A 5E0CA 1CLVA 1Q6CA 5IDIA 2V5DA 1HWOB 4H04A 3AZVA 1WZAA 5BQUC 4JCLA 4NI3A 1ITBA 3N17A 2BEBA 1CTNA 4JFVA 1JXJA 2XOAA 5FZUA 2V3GA 1PUMB 3QYDA 4J28A 1ZB5A 5D8WA 4W8AA 4HOZA 1MC9A 3BSHA 5HPZA 2C7FA 3BAKA 3AHYA 3PZVA 5D62A 3S2CA 3D7WB 3WEOA 2GDUA 3VD3A 2DSKA 1HJXA 3GBEA 1OGGA 3RTIB 1ISZA 1MXGA 4H8HA 2CBIA 4ENDA 3GNOA 4K68A 4BZYA 1CVSA 1KWKA 3W6LA 3FNDA 3O4OA 2W92A 5EG6C 5DZUA 1ZBVA 1ZBCA 4I1BA 3A22A 3AKHA 2PI6A 1G82A 3VX1A 2W91A 2NTDA 3WDPP 3TA9A 1TWMA 1RH9A 3RPMA 4QP0A 2J47A 4AY1A 4URIA 5CG0A 1D7FA 1JGIA 2WVTA 1JZ5A 4WLCA 3H6RB 1ZU8A 2G8ZA 1VJZA 3PUBA 5A94A 4MNMA 4OOUA 2BHUA 1CXIA 4JP0A 3VIKA 1HN1A 2G3MA 2ZE0A 1OCQA 3WNLA 3OGVA 3OG2A 1PWAA 1S0BA 4CCDA 1TA3B 4U33A 3UD8A 4PUDA 3A07A 1A47A 1MQPA 4P7OA 1XHGA 4W85A 4WSJA 1UOKA 3RJYA 4D6IA 3VIHA 1H0IA 1W1VA 4D72A 1KXTA 1B30A 1E4LA 3CA6A 1W9XA 4QC4A 1BYCA 1DWHM 1QQKA 4JZ5A 3PZGA 1S0EA 3O4DA 1V08A 5A2BA 2JF6A 1JT7A 3WINA 3A4AA 1YF8B 2OWCA 3N0KA 5BOWA 4ZXOA 2WCGA 2PBOA 5JUVA 4D6CA 1UR9A 4D0TA 3BAYA 3K8KA 3SCUA 3MMWA 4F79A 2D43A 3FUQA 3VM5A 2QHAA 1AXMA 3ARVA 1SR4A 5EFDA 4USOA 3R4UA 4Y7EA 4AN6A 3WNNA 1R86A 3AHVA 4HA3A 2YA0A 4M29A 1M01A 2AMGA 3AS0A 3WL1A 1PX8A 4W7UA 3ZC8A 3O9NA 4TVUA 3TP4A 2G3NA 1XCWA 3AHTA 3AIRA 2ESCA 1J0IA 5DMYA 4D6JA 4X39A 1G5AA 2WMKA 3GNPA 3TONA 2O9RA 4UTFA 1WDPA 5JIPA 4HP5A 4I3NA 4CD5A 2R9KB 2WAGA 4UQCA 1EDTA 3J7HA 4CVWA 4QCFA 4Z2JA 4J7RA 3TTOA 2K8RA 1UZ1A 4P8WA 2VJXA 2JIWA 4W93A 3LPPA 1HJSA 2CHNA 3DECA 5ECUA 2WLYA 3O4AA 1Q4NX 2CIPA 3IAGC 3RSJA 4OWLA 3RDKA 3TOPA 2HWAA 1R87A 4AD3A 2WC3A 2ZUWA 4L4HA 5CZKA 3DHPA 3IAPA 4NZCA 1V6VA 3W27A 1AQMA 6I1BA 1E6QM 2O9PA 4GIAA 4GZIA 3VIJA 2UWFA 4D6FA 2NYYA 2D7IA 2VVSA 4NSBA 2ZICA 1PEZA 1W3AA 3THCA 4PMXA 3Q7WA 1HX0A 3KWXA 1BHGA 1C8YA 2OSYA 3SIMA 3POKA 1CGTA 4MPKA 4R27A 1MFVA 5A6KA 1HKIA 1GOIA 3SEPA 3W6MA 4ACZA 4PMYA 4I6IA 2PF0A 1JDAA 2KI6B 2J7CA 1TG7A 4L4PA 4YPJA 3GDBA 3MV01 3HMYA 4XFUA 2P23A 3EDJA 4R6UB 4OBRA 4HMCA 3FN9A 4MAZA 3HJEA 1K5VA 1HKMA 2MC2A 3ZR5A 3IM5A 5BXSA 1FOBA 5IFPA 2VNCA 1J01A 3N12A 2QLYA 3DYMA 3EDFA 4BS0A 3ZIZA 2Q9XA 2UY5A 4ZENA 4AZBA 2X05A 3SUUA 2OYKA 1E9LA 4ZLBB 1PUUB 2EQDA 3BSGA 1QQLA 1XSKA 3AKFA 4J2YA 5FZYA 2ZQNA 1LF1A 3W9TA 3BRDA 1CXFA 4C7DA 2XWEA 3ZX7A 4CJMA 1CGUA 1BPLB 1Q04A 3CA3A 1GOMA 5HBFA 2UY3A 31BIA 4EFPA 1QPKA 3I2XA 1X6LA 1KXQA 3WFLA 6CGTA 3ECQA 4GI8A 1MW2A 1IILA 1UR0A 4M1RA 5A6BA 1ISVA 5BP5C 3MV11 2E4MC 3WENA 2LIEA 2Y5EA 1GVIA 3CH9A 1W1YA 3FXYA 1S46A 4PMVA 1EHNA 2XM1A 1QVBA 4LGXA 4CD4A 4I4SA 1CBGA 1QNSA 2J78A 4KC3A 4WBCA 5ABEA 1EO7A 2BFHA 1H11A 3ARWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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