3BTA | Genus

Total Genus 336

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	336
sequence length	1295
structure length	1277
Chain Sequence	PFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNVGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHELIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNRKTYLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERPL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Crystal structure of botulinum neurotoxin type A and implications for toxicity. pubmed doi rcsb
molecule keywords	PROTEIN (BOTULINUM NEUROTOXIN TYPE A)
molecule tags	Toxin
total genus	336
structure length	1277
sequence length	1295
ec nomenclature	ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date	1998-08-12

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1120.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain	Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain	3btaA02
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	3btaA03
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	3btaA04
3.90.1240.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Zincin-like	Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like	3btaA01

3A21A 2A6YA 3BRGC 2GNMA 2KI6B 4C1WA 2GMMA 3FLRA 4X39A 4Y26A 2P37A 5FZYA 6I1BA 3Q7YA 3O0WA 4ZFUB 2ZMKA 2BQPA 2VY0A 1ISZA 2UU8A 3KQRA 3O4CA 1JT5A 4FPJA 3L2YA 9ILBA 2A3WA 3BIWE 4LO0A 1AJOA 4HR6C 1N1TA 3O44A 1XTGA 3WCSA 1JN2P 3HOMA 4Q2FA 1VCLA 4Q8LA 4JPZA 3WA1A 1DYKA 2DREA 2WT2A 4QBVA 5T52A 2JECA 4FOYA 4KBBA 4JKQA 4W65A 1LGCA 2YROA 1G9BA 1Z0HA 1S0EA 1BZWA 4I6IA 3USUB 3B00A 1GLHA 4ZBVB 4XTMA 1V6JA 4I3NA 1S0FA 4JP0A 1C57A 1MR5A 3BAUA 4H9WA 1PUUB 3FJJA 2GN7A 1Z2VA 1SLAA 1LOFC 4FGFA 3ATGA 1LECA 5GM0A 2ZZJA 5JLVA 2AR6A 1LULA 5DZUA 3ZXFA 1W3FA 1KITA 1BLDA 4FPEA 5H9RA 4XFUA 3WDTA 1G9AA 2ZMNA 2YZ4A 3ILFA 3IM7A 3ZURA 1CESA 4FQZA 1ULCA 1ZM1A 2ZHNA 1IT0A 1AVWB 3F62B 2KI4A 2WKKA 3BTAA 1W3AA 3CRIA 2DVAA 3D3XA 3FJCA 1DIWA 1ENRA 4BLIA 2F8XC 3NV2A 1FYUA 1KQRA 4FPHA 2PHFA 4ATFA 2D1ZA 3A07A 1R1ZA 3CQAA 3ZUSA 1CE7B 1TTUA 5T50A 2ZHKA 1WUVA 3ZXJA 1IS5A 1SLBA 4I4XA 2E7TA 1T3AA 1LU2A 2XB6C 3VT0A 4GALA 5IT6A 3UDAA 1GICA 4G6JA 4G1RA 3ZXEA 4ENDA 2Q9XA 1N1YA 1IOBA 4ASMB 3IAGC 1O4YA 1VAVA 1BFBA 1AFCA 4I96A 2XHLA 2P2KA 4BOWA 2OUJA 2FHRA 2KH2A 1JW6A 4XBQA 3UD7A 2AFGA 1H9PA 3RQ0A 3FJBA 2B7YA 4FPKA 2UUSA 4A7KA 4LBMA 3R05A 5CNAA 1HKNA 4P6AA 5BXTA 3ZYPA 2P34A 3WZ1A 4EB2B 1RIRA 3FUQA 1GGPB 5IUQA 1MS0A 2AQZA 5T5LA 3WVJA 1G8WA 3RTIB 3WUDA 3B01A 5DXDA 1JHNA 4P0LA 2FMDA 3ZXDA 3CRGA 2SBAA 4YGDA 1K5UA 3AZWA 1YO8A 2GMPA 1YF8B 3BRFA 5T5PA 4J2SA 2WSUA 5DUYA 1Q8OA 1PC8B 1JLXA 5LK5A 1EYLA 2WQZC 2A70A 2EXKA 1HCEA 3WINA 5GLUA 1FNYA 4DPNA 3AK0A 5GZFA 1DLLA 2ZGTA 4ZXKA 3O4DA 5BP5C 3FJIA 1WBFA 1IKQA 2WT0A 1S0CA 3M3OA 2NTDA 2EXHA 1ISWA 4XKIA 1WBCA 3DEBA 2MLLB 4OZXA 2DVDA 4P9YA 2HYKA 3DSEA 3LSEA 4OUJA 4EKXB 4GWNA 4QKSA 1LENA 1N1VA 4FPCA 1FAYA 1MZ5A 5GZGA 4QO3A 1CVSA 1FGAA 3AKGA 3C2UA 2KLLA 1IILA 3T8SA 3D6EA 4BLJA 2K4AB 1J1TA 3QIXA 4WVWA 4DCKC 3FJEA 4XJ9A 3V0BA 1BYHA 1SBFA 2ZGQA 2CYFA 5BQUA 1JTCA 3BAVA 1ULEA 1UL9A 1IOAA 1JT4A 4IY9A 3D5OA 5E88A 1G9CA 4XDQA 3AKIA 4U2AA 3AKHA 2ZGKA 5JDBA 3V0AA 4K1ZA 4GOVA 2GALA 2Y9XE 1LGBA 3O0XA 4Y20A 5BXSA 1BXHA 3RMYA 3ZPYA 2HWMA 2W08A 5BQNA 3JUUA 3INAA 1HWOB 3ZXLA 1DQ2A 2ZGLA 1BA7A 3P53A 5DG1A 3CA0A 3NV3A 1A78A 1W6PB 4YFZA 1PZ8A 1W6OB 4AN6A 4LO3C 3ASIA 2D6PA 4HANA 4AGRA 1OFSA 2ZGPA 3QIYA 3UD9A 4XJZA 4YZ2A 4IY8A 4I4OA 2VXRA 3RMXA 1I3HA 5JOXA 4XXPA 3AH4A 2DU0A 3FFZA 2JDZA 3AP9A 2D3PA 1DHKB 1HWPB 4J2XA 2TEPA 2IHOA 3UJOA 2G4IA 2RSTA 4KS6A 5BXRA 1MS9A 4Z9WB 4LBQA 3H6QA 1HQWA 1ULDA 3QJ0A 3WDVA 1SR4A 2E6VA 2VU9A 2E4MA 2W2DB 3N36A 3VUOA 4Q9GA 5HCBA 1SLLA 1T9FA 3I8TA 2WLQA 3FGMA 4LBQD 4YG6A 4KTXA 4YM1A 4Q9PA 4AYUA 4R9AA 1FATA 3P6JA 1DQGA 3WG4A 3C89A 1QDCA 1IS6A 2R0FA 4UW5A 1EV2A 4FOWA 3AKFA 4XFSA 2VUAA 3QW7A 1YIFA 1QNYA 2V5YA 4PF5A 3BAGA 1AX2A 5L73A 3MW3A 4USPA 3AJ5A 3BOOA 2DUOA 4P9XA 2YUGA 3O5SA 3AH2A 4JQ0A 1W6NA 3M3QA 3PJQA 1Q8QA 4I7IA 1S0JA 3E8LC 3K1XA 1QQLA 1MZ6A 3VT1A 1DFCA 4Y1XA 2D6LX 4QC4A 8I1BA 3OJBA 2FO1A 3JRRA 1V6WA 1NLSA 1SLCA 1V6XA 3FLTA 3N0KA 1SLIA 1C4RA 5EC5A 5JOZA 4HJJA 4USOA 1GV9A 4J1LA 1DZQA 1GYKA 1Q04A 3FLPA 3JU9A 2GDFA 4ELCA 1F9KA 1WLDA 3BA5A 2Z49A 1KDKA 4M01A 1GZWA 1BQPA 1U0AA 3TC2A 1URXA 4I4SA 1FMMS 1BFCA 1SBDA 2BFHA 2GNTA 1EVTA 1TIEA 2ZQNA 3A22A 4TZDA 4XYXA 2LALA 3POYA 2PHUA 1PUMB 3R4SA 2OVUA 4K1YA 2AGSA 5GAQA 4FP3A 3HMYA 4Y1UA 1RG8A 4ZOTA 4HA2A 1VAMA 2AXMA 2Y9GA 1DYPA 3VKLA 4YGCA 1V6IA 5KXEA 4XMAA 4Y22A 4IONA 3NBEA 2VSEA 2D6NA 1V6OA 4FVVA 1FV3A 4Q8KA 4I4QA 2A3XA 5GLZA 1YXWA 2AH2A 1YYNA 1DQOA 3FJKA 1HKDA 1KNMA 2AREA 3M1HA 3LLPA 1MC9A 5GZEA 2FGFA 2WBCA 3FJ8A 2BEAA 3MEPA 1ISYA 1WW7A 5F5QA 2VW2A 2A6XA 2FDBM 5JOWA 1PZZA 3CA6A 1Y7BA 3AFKA 3CRHA 4I1EA 1ULFA 2VW1A 2PHWA 3WNXA 3OYWA 3OY8A 3QW8A 5CB7A 2DTWA 1DQ0A 3WO2A 1APNA 1DZDA 5H9PA 2R1BA 3PG0A 3S8KA 2P3KA 1A3KA 4FPLA 1LOGA 2A6VA 2DRYA 3B9UA 4KEJA 3M3EA 3N7KA 4Z8BA 2EAKA 3CA1A 2CWSA 4LBLA 4DRRA 1XTFA 3AP6A 4C1XA 3DDBA 5HCFA 4YFWA 2Y9FA 5BQMA 4KEIA 1EPWA 1GBGA 3JUTA 2ZGSA 1KRIA 1ZN3A 1UZZA 3AP5A 4OWJA 5T5JA 2ISGA 2HZ9A 4L4IA 3AZYA 1IJTA 2VXTI 3SH4A 2V73A 4YW1A 2WSVA 3WO4A 5BQUC 5F8YA 2EF6A 2H0BA 3N7MA 3NWKA 4K21A 4X37A 3ZSJA 3DDAA 4XTPA 3OBRA 4WVVA 3IPVA 1RZOB 4D0TA 3SLIA 2YXSA 3T1LA 5EXOA 1QOOA 3SNMA 3OPZA 4CTEA 1CONA 4M00A 4Y1VA 1CN1A 2C9AA 4J2YA 1QF3A 2DUPA 2DRZA 2P39A 1VALA 3ZC8A 4FPGA 3K3QB 2D6KA 3AXDA 1C1LA 4GWMA 4DENA 3QR5A 2WT1A 3OGFA 4KC3A 2ES3A 5D63A 4H55A 3NBCA 5FNXA 31BIA 1IS3A 1IRPA 1ZB7A 1SCSA 3ZC9A 2JKBA 3GALA 1GNHA 4I30A 4G9NA 4BMEA 4GA9A 1S0LA 1DBNA 2RHPA 2R16A 5DZEA 1B09A 1CJPA 2UWAA 3BA4A 1XHBA 4XFTA 1ONAA 4OEGA 2CWMA 4YW4A 1N1SA 2D44A 4FQ4A 1E1HA 2JE9A 2D23A 1AVUA 4IZXA 3KM5A 4IZEA 4R6UB 4R9DA 1WW6A 5FRAA 3AH1A 1JXNA 1SR4C 3USUA 2E4MC 1Z78A 2ZGMA 4Y1ZA 3WG3A 4WBCA 1CPNA 4GP0A 1OQLB 1LESA 1Q8VA 1CPMA 1MS5A 2JD4A 4U36A 4OWKA 4LO2C 3SH3A 4I4VA 4LBQB 3EF2A 4ZLBB 4GP3A 2Q5TA 1FV2A 2WRYA 3UL2A 3N3HA 3H0OA 3A0KA 1BFGA 4I37A 1Q56A 2EIGA 1HLCA 4AN7B 3BADA 4AWDA 4UW4A 3U4XA 2AAIB 3FUOA 2GNDA 3WO3A 3A23A 3POKA 1LOFA 1JLYA 2A97A 2I1BA 4IYBA 1QXMA 2ERMA 3V65A 1UX6A 1QOSA 5FZZA 1HWMB 4YW5A 3BAHA 1HQLA 1FMZA 4XBLA 2ZQOA 3WV6A 2LIEA 2RQ9A 1FN0A 4I4RA 3QIZA 1AF9A 3H6RA 4J23B 1LOAA 3MPPG 3FIIA 2LTNA 4XJ8A 3ILNA 2D7IA 1LU1A 3WHTA 5HPZA 5GZDA 1JYCA 2OW4A 4GXLA 2W52A 2AYHA 41BIA 4WV8A 1QKQA 3M2MA 1LOCA 1W6QA 1LCLA 1SCRA 5E8AA 1QU0A 1W3GA 2QN4A 5DSSB 1VLNA 3PMEA 2P3IA 4YLZA 3C88A 4GOYA 1ENSA 3IM0A 1GNZA 5F8WA 3RSJA 1AVBA 1QQKA 2JJ6A 4SLIA 5EG6C 2NP0A 2KM2A 1T4QA 1XYFA 3R4UA 2L5XA 1W6MA 1AVAC 1JQZA 3IM6A 3CAHA 4ITCA 5KXCA 4RA0A 1GSLA 4UW3A 1N3QA 3MW4A 1YVGA 3W59A 1DZCA 2FPQA 1GZWB 1N3PA 2UURA 3CNAA 4YZ1A 1LEDA 4AVVA 1HDKA 3WOGA 3FJ9A 3OJ2A 4Z8SB 2ZKNA 1SACA 3AZXA 1V6NA 1G7YA 1ZKXA 4LO0C 1LTEA 3SISA 4BM8A 1AVXB 3WMUA 2UWBA 4FOQA 3WG2A 2VSAA 2ZACA 2R49A 3B69A 3DUIA 3CA3A 1G9DA 2F2FA 3RS6A 1V6LA 4FPYA 1P63A 4Q26A 4LO7C 3IMNA 3T2TA 4Y22B 1I1EA 2CNAA 1BKZA 1N47A 3BX1C 4NOTA 1Q03A 1F5FA 2XG3A 4XHXA 5JMCA 4FOVA 4XZPA 5EYYA 5BOWA 1DQ4A 2GN3A 4P14A 3DGTA 1F82A 4ZA3B 2A6WA 4R9CA 4GAFA 1MACA 4XIKA 1SZ6B 1HWNB 5DUVA 1WW5A 1IHKA 1PWAA 5I1BA 1YBIA 2DS0A 3OYWB 5BP5A 1TFMB 1MS8A 3FJAA 5T55A 1GANA 5EYXA 1LHNA 1VIWB 3FIEA 1UPSA 2I2SA 4XILA 3CU1B 5DUUA 2CL2A 2GO2A 1BFFA 4XJUA 2FFUA 1UN1A 3MW2A 1WBAA 3O49A 3LSDA 1ZL6A 1L2HA 1ZA4A 2NMNA 1RINA 1YRZA 4JAWA 4I0YA 1PZ7A 4I4PA 1A8DA 3BWIA 2KKIA 2SLIA 3HALA 2NVHA 4I1BA 2ZBJA 1ISXA 2NN8A 3B3QE 4YM0A 1TWMA 2P3JA 5DUXA 4YZ3A 2VLCA 3BONA 3POWA 1WLCA 4PQ9A 3OJVA 4D69A 2W68A 1AX1A 3W58A 3ZSMA 1R8NA 5F90A 3AP7A 3O4BA 4I4YA 2PHTA 3FJHA 1QOTA 1XQNA 2E53A 4KUFA 1AXMA 1YI7A 1W6OA 1H30A 4QBCA 3UJ4A 1S0DA 1TWEA 2Q3NB 4OW4A 5B2HA 2NMOA 2MC2A 4LBOA 2YV8A 3ZSLA 4LBJA 1OQ1A 2DU1A 2E7QA 3B9CA 2EXJA 2AENA 4XHBA 4JRAA 1FWVA 2XHLB 5CA6A 2GNBA 2J3PA 4EEEB 2ZAAA 4CZSA 4LO8B 3I2XA 1LOBA 3MALA 3FJDA 4Y1YA 2P23A 2ZR1B 1DGLA 1BJQA 3RTJB 2D24A 2W2DA 3BAOA 5F8SA 2X2TA 3SNVA 1DQ6A 2D3RA 5DVHA 4MYEA 4JCKA 1S0BA 4LBKA 1HCDA 3O4AA 5IK5A 2GMEA 1JY0A 3VKNA 1D2SA 5D62A 1V6KA 1CVNA 1M16A 2G7NA 1QNWA 3WINC 2MIBA 4UW6A 4ISRA 1FNZA 1SFYA 3IKWA 2ERFA 2ENRA 3ZYRA 1AX0A 3PUBA 2ZHMA 3VSZA 4FPOB 4IQPA 1LHOA 5E24E 1H9WA 1NXD1 1F31A 3UJQA 5BYNA 4BPZA 2D6MA 5EHAA 2R9KB 3WDUA 5CAZA 1QGLA 2DVFA 5JVVA 4CRQA 5GLTA 4AVSA 2A3YA 1IRAX 3IM5A 2VH9A 3DS9A 3BOKA 3A4UA 1UKGA 4YM2A 4YGEA 1LHWA 4F34A 3F1RA 4H04A 1G9FA 2D43A 1NUNA 3LCPA 3QYDA 3BRDA 4NO4A 3QW6A 4DQAA 2DV9A 1X50A 5GLWA 1TP0A 3FJFA 5SV8A 2ZGRA 3IN9A 3ZXGA 3TB0A 3D4KA 1YTOA 3Q7XA 1Z7HA 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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3BTAA

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