1AF9 | Genus

Total Genus 110

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	110
sequence length	441
structure length	441
Chain Sequence	EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Clostridial neurotoxin
molecule keywords	TETANUS NEUROTOXIN
publication title	Structure of the receptor binding fragment HC of tetanus neurotoxin. pubmed doi rcsb
source organism	Clostridium tetani
total genus	110
structure length	441
sequence length	441
ec nomenclature	ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date	1997-03-24

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07951	Toxin_R_bind_C	Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A	PF07953	Toxin_R_bind_N	Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	1af9A01
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	1af9A02

2CL2A 2W68A 4YFZA 3O0VA 2GMEA 2GNDA 2GNTA 1C1FA 6I1BA 3M2MA 5JOYA 1DZCA 2YUGA 1Q56A 3N0KA 3N36A 1LULA 2A6XA 2AXMA 2P3JA 2A3YA 3DUIA 1A3KA 3FBYA 3FLPA 2JE7A 3ZX7A 3V65A 1WLDA 2ZMNA 1PUUB 2VU9A 4IYBA 1YBIA 1S0GA 1ILR1 1W6QB 4PC4A 3QYDA 4Q9PA 4GKXA 4L8QA 4F34A 1ULGA 2J3PA 1DQ2A 2Z42A 4F83A 1S0IA 5BQUC 3M3OA 4BLIA 1N1SA 3S8JA 3CRIA 1BFCA 4I37A 2WBCA 4USPA 3WG2A 4D69A 1FNYA 1FAYA 2D6MA 1VIWB 5GZGA 3A23A 4FOQA 3MW3A 1DHKB 2Q3NB 5IK8A 3IMNA 1SACA 2AH2A 1DFCA 2Y9WC 3NV1A 3M1HA 3BA5A 1LEMA 1GZCA 4WZFA 2FFUA 5DG1A 2AUYA 1YRZA 4GP3A 3PJQA 2ZGOA 1GBGA 1MS3A 1G9DA 1CR7A 2P39A 1V6MA 3AP4A 1SZ6B 5FREA 4OEFA 3AK0A 1BA7A 1TEIA 2UWCA 4M3CE 1MD6A 4FPCA 3O12A 1Q8OA 4KBBA 3NJ5A 2LIQA 1QOTA 3BTAA 1ABRB 1GZ9A 4BLJA 2DURA 2KLLA 2W52A 1L2HA 3HMYA 3AXEA 1ITBA 1FWUA 4FPKA 1LECA 2VXTI 2ZBJA 5IUQA 4X38A 1KNMA 4BOWA 5IT6A 2E53A 4PCRA 2R16A 4R9AA 4XJWA 1HWMB 2GMMA 1DFQA 4YG6A 2ZZJA 1S0JA 1XG6A 3FJFA 3FJHA 1UN1A 5BVPI 2YV8A 3GALA 2M49A 1LOEA 3R4UA 2OVUA 4UW5A 5CB7A 4BQ1A 4Y1VA 1W6OA 1M2TB 2EALA 3AX4A 3AZXA 1DJSB 3OGGA 4YG0A 1AX2A 1KJRA 5DUXA 3RTIB 4P14A 4EEEB 4P0LA 3D6EA 4HA2A 4Y22B 4K21A 3PVEA 5BYNA 1W3AA 4I8MA 5HCFA 3QCWA 1Y7BA 2ZHNA 1ISWA 2WRYA 3FJCA 4YM3A 3O3QA 2ZGTA 4Q1RA 2JE9A 4PBPA 4CJMA 2OUHA 1DBNA 3QR5A 1YO8A 1TIEA 4FPHA 1FATA 4LO3C 3UJ0A 1BFBA 2MLLB 2A6WA 1LTEA 1LOBA 4D0ZA 1YYNA 1II4A 1IOBA 1H9PA 4FVVA 4YZ2A 1QNWA 3BAHA 2DUQA 4K20A 1VLNA 5T5JA 5T54A 4JQ0A 2VUAA 4YGCA 1IOAA 1RMLA 2KI4A 3ASIA 3AKHA 3LCPA 2GO2A 3I8TA 3O44A 3CRHA 1HIBA 5F90A 4J2XA 2NM1A 4HR6C 4XJAA 1LHWA 1ULFA 1JLXA 4OUJA 4QKSA 3AJYA 4XHXA 3P6IA 1LOAA 3HN1A 3NBEA 2A70A 3WZ1A 5FNXA 3UK9A 2YROA 2FO1A 2K8RA 3ZYPA 2JD4A 5D63A 4NO4A 1Z2VA 5FZZA 1GANA 1PZZA 4M01A 4K1ZA 5JMCA 2HYKA 2V73A 2LALA 2E7QA 1AJOA 4KEIA 1JN2P 1ULDA 4CTEA 2DWRA 3N7KA 1TP0A 1W6PA 1NZKA 3IM0A 4LBMA 3C9ZA 1PWAA 4P6AA 3WDVA 1V6OA 3KM5A 5E8AA 1HCEA 3I4IA 1HCDA 3RMYA 1BLAA 2SBAA 4Y26A 5HCAA 4LO3A 3WOGA 2WT2A 1MVEA 2D6NA 2GNMA 2UUSA 1HLCA 1BARA 1Q1UA 4D8HA 2D23A 4LBJA 4MYEA 3JU9A 3ZXDA 4YG3A 3NBDA 4Q1PA 3BAGA 4XMAA 3FLRA 5HCBA 2PELA 2ZGUA 5BXRA 2VSEA 3D7WB 1O4ZA 2A71A 1FQ9A 5CAZA 3INAA 3SNMA 5BP5C 3FJ9A 1DQ0A 3S8KA 3LSEA 4QBVA 2R49A 1UPSA 3LSDA 2NP0A 4OWLA 3Q9OA 5GZEA 1TTUA 4AGGA 1OFSA 1W6MA 1PC8B 2RHPA 5GLZA 2D3SA 4M3CB 1AJKA 1N3PA 4LO0A 4C1WA 4LBQA 2FDBM 4DEPA 5FZUA 1N47A 1IS6A 4X37A 1WBLA 4EFPA 2D6LX 2AR6A 1A78A 4JC1A 3RMXA 2CNAA 2DTYA 4XBNA 2Y9GA 4EFQA 2D20A 4LO7B 3ENRA 4WVWA 1CPNA 3VV1A 5D62A 4ZOTA 4YZ3A 2X2SA 3AP7A 4ZBVB 2NZ9A 1ZA4A 3ZC8A 1DYKA 3A0NA 2RG9B 3SNVA 4FOYA 1WCSA 4Y1YA 2NYYA 2GNBA 2D6OX 2ZGSA 3CNAA 1CONA 3ZSJA 3WCRA 3OJVA 1KDKA 3PVNA 3CRGA 3I2XA 1QDCA 1K5VA 4ZFYB 3F62B 5EC5A 3USUB 3PMEA 3VKMA 1I1EA 4EB2B 4XJ8A 1JT4A 4XJ9A 5BXSA 4TLPA 9ILBA 1HKNA 4IY8A 2DVAA 1F5FA 2D3RA 2DVDA 5T52A 5BP5A 1C57A 2K43A 3H6QA 1ONAA 2AFGA 5F8YA 3VKNA 1SLIA 4YW2A 1VAMA 3WDWA 4I4OA 3U4XA 3WMVA 1Z78A 2Y9FA 5GZCA 1CN1A 3SITA 1CVNA 4XTMA 5H9SA 4YZ5A 5F8WA 2KKIA 2E51A 2I1BA 5JOWA 1MZ5A 3V64A 1GGPB 4GP0A 3CA4A 3BADA 3AZVA 5EYXA 2NTDA 3NBCA 1LOCA 3BRDA 2D6KA 5T5OA 5DZGA 1W3FA 3V0BA 2E4MC 4QD2C 1KJLA 4WBCA 1AF9A 2CYFA 1MR5A 3O4OA 3ZVXA 5IK5A 3O49A 3FFZA 3OJBA 2WJSA 4WV8A 5DZFA 4FP2A 3WCSA 2AREA 2EF6A 4Y20A 3UD8A 3Q7XA 3H0OA 3Q7YA 3RRDA 2WKKA 4DFSA 1UAIA 3L2YA 1UL9A 3A07A 4KC3A 2HWAA 3EF2A 1SBEA 3A0KA 2NVHA 2GDFA 2WLQA 1Q03A 2UWAA 3ZSMA 1VALA 3QLQA 2AGSA 1S0CA 1CE7B 3B01A 3AKFA 2FFVA 3POWA 1V00A 3JRRA 1Q04A 1FV2A 2ZGNA 3BB2A 4XE9A 4XYXA 1ISXA 3H6RA 4LBNA 4GOYA 5CA6A 3F1RA 2P34A 3TB0A 1CQ9A 2QYIB 3IAGC 1XYFA 4D0TA 1KQRA 2YZ4A 2MIBA 5T5LA 4YFWA 3AZZA 1RITA 1DQGA 1R1ZA 4AGRA 3OY8B 1LESA 3AH1A 3IPVB 4FOWA 2A6ZA 3R4SA 3O4BA 2ZMLA 1G82A 4ISRA 4XZPA 4I4UA 1GKBA 1LU1A 2DU1A 4W65A 4I96A 2E4MA 5DXDA 4DPNA 1CJPA 4I0YA 4PBOA 3DGTA 1FWVA 1N1TA 2WSUA 2BFHA 1QF3A 1Q8SA 2F2FC 3O5SA 1C1LA 1WLCA 4PF5A 3WUCA 4GAIA 4Y24A 4BMEA 4QALA 2ZKNA 2VXRA 2ZHLA 3O4DA 5EG6C 1Q8VA 3FUOA 1HQLA 3AYDA 2ARBA 2PHTA 5KXCA 4P0JA 3NV2A 4J23B 4LBKA 2D24A 1TOOA 1D2SA 3N35A 1DQ1A 4FPFA 1WBFA 1AXZA 1V6VA 1ENRA 4LO8B 1JOJA 3T8SA 5BQUA 4EKXB 1U0AA 4ZLBB 4KEJA 4Z8SB 3SH4A 1DGLA 3FJKA 1AVUA 3WVJA 1QOSA 4I4VA 2E7TA 4DQAA 3RTJB 2F8XC 2C5DA 2MC2A 1MS4A 1LGCA 3SH3A 4AVSA 1W6NA 2VY0A 3FUQA 2I2SA 1TWMA 3V0AA 5DG2A 1PUMB 1AX0A 3IM5A 4SLIA 1DLLA 2EIGA 2HWMA 1S1AA 1UZZA 2OUJA 3POYA 1XZZA 5GZFA 1V6UA 3NV4A 4CZSA 3BAOA 4Y1XA 5H9PA 3WDTA 4A7KA 4FOVA 3WG3A 2QN4A 2D6PA 2F2FA 1X50A 3IM6A 2ERFA 4RA0A 3ZC9A 3A4UA 5GLTA 3Q7WA 2R1DA 1VAVA 3IM7A 1LEDA 4FPJA 1JHNA 2A3XA 4ITCA 2P37A 4YZ1A 4R9DA 4U2AA 4BMBA 1T9FA 4YM2A 3W59A 1SR4C 4BPZA 3JUUA 3BOPA 2B7YA 1KITA 2PHFA 4G6JA 4QO3A 1BYHA 4I4SA 4OW4A 3ILFA 4GOVA 3B00A 3WUDA 3VT1A 3H6SE 2PHWA 2D7FA 4I7IA 2XOAA 1CPMA 2D7IA 2YMZA 4G9NA 3N7JA 4BM8A 5EWSA 1G9AA 4G1RA 2A3WA 3D5OA 3WDXA 4Q2FA 3P6JA 1MS0A 1YI7A 1LGBA 2E6VA 1VCLA 4ZKTB 2D1ZA 5GZDA 2A5ZA 4I3NA 2LTNA 4USOA 3HALA 4GKYA 2VH9A 1DZDA 1UMZA 1V6NA 2XG3A 2ZGKA 2CWSA 1GZWA 3CA5A 1G9CA 3E8LC 2EXKA 3FJJA 1UZYA 4YM1A 1NLSA 4K1YA 4Y1ZA 4FPEA 1H30A 1MVQA 2ESUA 4ENDA 1G8WA 1W0OA 5T55A 1IS4A 1S0EA 4XKIA 4XJUA 4Y1UA 1P63A 1EVTA 3BX1C 3OYWA 1GSLA 4I4PA 2GZBA 4J2KA 2DVBA 1FYUA 3T1LA 3ZYRA 3KMVA 5FZYA 4JKXB 4I4YA 1W6OB 3VKLA 5G00A 4AWDA 2VLCA 1DQ6A 4GA9A 1KDMA 1E0OA 2D7RA 3POSA 2ENRA 1LENA 3AJ5A 1IT0A 4GWMA 4ISQA 1OQ1A 3AXDA 1N3QA 2FHRA 4Z9WB 1DQOA 5F8SA 3CA6A 5BXPA 5DUWA 1FNZA 1GV9A 3PUBA 5DZEA 1QKQA 3VUOA 3W9TA 1W6QA 2IHOA 5T50A 5B2HA 5CBLA 1EYLA 1AFCA 3WO2A 4ZXKA 2PHXA 4IONA 4XXAA 3CAHA 2DRZA 1I3HA 3CA0A 2ZGMA 5KXEA 4LO2C 4TZDA 4DRVA 4DCKC 4LBOA 5D61A 2WSVA 3BA7A 3UJ4A 1LCLA 3BIWE 2D3PA 2KI6B 1QQKA 2BEAA 3AP9A 3AP6A 2ZA9A 1LGNA 2DU0A 3UJOA 1HWPB 5E88A 2HW9A 4H9WA 4I4RA 1JTCA 3KQRA 2VW1A 1RINA 1FX5A 3HOMA 3OBTA 3RS6A 5IK4A 2R9KB 1AX1A 5GALA 5L73A 1T4QA 1V6KA 4C1XA 4AVTA 2P3KA 1XQNA 1F9KA 5BXTA 1GNHA 3O0XA 4OZXA 1YF8B 2Y9XE 3A21A 2JECA 5GAQA 1JBCA 3ZXKA 3AYEA 4H55A 5JOZA 3OJMA 4PQ9A 1ZM1A 1IJTA 4QKRA 3N3HA 4XJZA 5JDBA 1ENQA 1RG8A 1GYKA 1ISZA 3MEPA 1WUVA 1WD3A 4ATFA 3UDAA 3AYAA 5JOXA 4LO1C 2VW0A 3C2UA 2D43A 1IS5A 1WW6A 1MS9A 4U36A 3AKGA 2ZMKA 1IRPA 1D0HA 2C9AA 4ASMB 1QDOA 1BFFA 4HL0A 1S0DA 3HBWA 4A7YA 4XMIA 1W6PB 2ZGLA 4P9XA 2JDZA 1HDKA 1Q8QA 3WA1A 1QGLA 3NWKA 5JLVA 4LO2A 2EXHA 3ATGA 2WT1A 1AXMA 1LHUA 3HSMA 1BKZA 4Y22A 3AKIA 2AENA 1WW7A 4FP3A 1IRAX 5CNAA 4XFUA 4P9YA 4YM0A 1JT3A 3M3QA 2DVGA 41BIA 3AH4A 3BAUA 1I1BA 4L4HA 4X39A 1N1VA 21BIA 2UWBA 1DYPA 1A8DA 1SBFA 3APBA 3FJBA 1YTOA 3WHUA 4RL7A 2WNEA 2DUPA 1G9FA 2WT0A 5GLWA 4JP0A 1XHBA 1Z4SA 2IWTB 4H04A 2VSAA 2XB6C 3FGMA 4JRAA 3ZXGA 1OQLB 2ZGQA 1JLYA 4Z8BA 3BRGC 5GJ6A 3PVOA 4YZ4A 3D4KA 1FMZA 5H9QA 2Z48A 1W6MB 5EXOA 2JJ6A 1ULCA 5HPZA 2DVFA 3AFKA 4LBQB 1H9WA 5SV8A 1FMMS 2NMNA 1NUNA 2AAIB 5KXDA 3FJDA 2AQZA 4LO1A 2UU8A 4JKQA 3WINC 2VW2A 4Q26A 1RY7A 4AGVA 3ILRA 4AN7B 1WD4A 2JKBA 2G4IA 1YXWA 1SLTA 2L5XA 3WG4A 4Q9GA 1AVWB 3WDYA 3P53A 5E24E 3OJ2A 3VSZA 4LO7C 3FJAA 1JXNA 1SLBA 1W0PA 5H9RA 2A6YA 4HANA 2UURA 2AYHA 4XFTA 2P2KA 4P0KA 3A22A 3BODA 5F9TA 2EAKA 4G9MA 3FJIA 3TAYA 1G9BA 1FV3A 1CVSA 5E89A 4I4QA 3UD9A 4FPOB 1Z0HA 4XTPA 3UL2A 4UW6A 2EXJA 2CWMA 4I1BA 2KM2A 3GNEA 1WBCA 3O0WA 2DREA 4YGBA 1BASA 3LLPA 3N7MA 2P23A 2ZQNA 1SCSA 2GN7A 3VT2A 4OWKA 4R6UB 5FNWA 2GALA 3MW2A 2NN8A 1FN0A 3AJZA 1J1TA 4NOTA 1HWOB 3ZXJA 5AVAA 2WQZC 2ET2A 4XFSA 4YW1A 1LHOA 4LBLA 4KEKA 1C4RA 5DUUA 1DZQA 3POKA 1AVAC 3AJ6A 3AP5A 4I1EA 1AXYA 5EHAA 4LBQD 3B69A 1V6JA 3WINA 4EFRA 1V6WA 2ZHKA 4QC4A 2LIEA 1N3OA 3VEQA 4GXLA 1S0FA 1GICA 2RQ9A 2A6VA 2ZAAA 1QOOA 2DUOA 3ZXLA 4Q8KA 4JAWA 4AYUA 4FQZA 4ZFWB 1LOGA 3IKWA 3V0BB 4M3CA 1N1YA 1AVXB 3O4AA 4IHZA 1AZDA 2V5YA 1GLHA 4Q91A 2R1BA 1ULEA 2SLIA 1APNA 5JVVA 2ZHMA 4IZEA 3BAVA 2DS0A 5DUYA 1PZ8A 1MC9A 4R9CA 2Q9XA 1MS1A 4Y20B 1QMJA 2DTWA 3VKFC 2A7AA 2FGFA 3I29B 3NV3A 2HZ9A 4L4IA 1QU0A 3MW4A 1GNZA 4FQ4A 2A75A 3ZSLA 4AN6A 4ZA3B 4UW3A 5KXBA 1LODA 1IILA 1R8NA 3R05A 1V6LA 3WO3A 3CU1B 3ZXEA 4GAFA 4OWJA 2ES3A 3CQAA 1JT7A 1ENSA 3USUA 3RQ0A 4I4XA 1IKQA 5I1BA 4YLZA 4X3AA 1O4YA 4DS0A 2CTVA 3AZWA 1OKQA 3UJQA 3H6RB 1RZOB 2YXSA 3K1XA 4WVVA 1JT5A 2R0HA 5DUVA 2DYCA 3FLTA 3MALA 1WW5A 1SFYA 1SLCA 4XOGA 3SLIA 3WNXA 1QQLA 4P9WA 3ZSKA 4GALA 4AVVA 4HJJA 3B9CA 4LO0C 3W58A 4XILA 1M16A 2BQPA 1JUIA 3RSJA 1BFGA 3WLUA 4QD2B 3WHTA 4OEEA 1ISVA 1UX6A 2W39A 1B09A 2ZABA 4FPGA 2ZQOA 1F31A 5LK5A 1URXA 1KRIA 1EPWA 1S0LA 3LTQA 1DIWA 2RSTA 3JUTA 3NBNA 3VWCA 3OBRA 3OGFA 3TC2A 1CIWA 5DZUA 3WV6A 1Q8PA 4XIKA 4DENA 4FPYA 2BEBA 1EV2A 2W08A 1SR4A 4II0A 3VT0A 4A7ZA 3B9UA 3ILNA 2ZR1B 1JY0A 5GM0A 5GLVA 2ERMA 4XHBA 1BLDA 5T5PA 1RIRA 3UD7A 5DSSB 1LOFC 1UKGA 1FGAA 5FRAA 1MACA 2KH2A 1LU2A 1QNYA 2OW4A 4R9BA 3BA4A 2DV9A 1BQPA 2DRYA 2GMPA 3ZPYA 4I2SA 1W6NB 4UW4A 2ZACA 3HR9A 3V0AB 2CY6A 2NMOA 1BXHA 3WMUA 1PZ7A 1HQWA 1PZ9A 4CRQA 1QXMA 1CESA 5F5QA 3SISA 2H0BA 1AVBA 3V79C 3BAQA 3BRFA 1AXKA 1TFMB 2R0FA 4YW4A 3AH2A 1IKPA 2K4AB 1BJQA 4DRRA 2Z49A 2X2TA 3RG0A 1SBDA 1IHKA 3OY8A 4ATEA 3IPVA 2ARXA 7I1BA 1G7YA 1LHVA 4XXPA 1IS3A 3B3QE 4ZFUB 2P3IA 1HKDA 4OEGA 2PHRA 1ISYA 1TWEA 1N4KA 1NXD1 2ZGPA 3IIRA 3O4CA 4IY9A 3FJEA 4J2SA 3ZXFA 5IK7A 4Q8LA 3CA1A 5EYYA 1MZ6A 2ZGRA 1DQ5A 1BZWA 1JW6A 2D22A 4QBCA 3FJ8A 3N7LA 3CA3A 2FMDA 2GN3A 4JPZA 1WW4A 1LOFA 4IQPA 3T2TA 2EXIA 1DQ4A 1JQZA 2TEPA 4GWNA 4YGDA 3WO4A 4XIOA 1HWNB 1YIFA 4IZXA 4M3CF 4FPLA 4XDQA 1JYCA 1LJ7A 1MS8A 3IN9A 3WG1A 1SLLA 3SH5A 3O5WB 4G6MA 1J0SA 4J2YA 4M00A 3OPZA 1SLAA 8I1BA 4I30A 1LHNA 5DVHA 3WDUA 4XBQA 2PHUA 3VSFA 4YOLA 3VKOA 4TYSA 1V6XA 1GZWB 2YY1A 3AZYA 5GLUA 1W3GA 1K5UA 1JYIA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1AF9A

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