1Z0HA

N-terminal helix reorients in recombinant c-fragment of clostridium botulinum type b
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
438
structure length
438
Chain Sequence
NKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title N-terminal helix reorients in recombinant C-fragment of Clostridium botulinum type B.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type B
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
total genus 101
structure length 438
sequence length 438
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2005-03-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1z0hA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1z0hA02
4XE9A 4FPOB 2M49A 1R1ZA 2VY0A 2ZGLA 3WUCA 3S8JA 3BRGC 2UU8A 4GXLA 4FPLA 2FFVA 1WLDA 1LULA 5D61A 4ZKTB 5JLVA 3HBWA 4GAIA 1II4A 4YZ2A 1W6PB 4I4XA 2YZ4A 4DEPA 2IWTB 4GKYA 1MVEA 4OZXA 1FV2A 3TB0A 5CAZA 1V6XA 1IT0A 3IPVA 2ZGRA 2JECA 2NP0A 2DVFA 1H9WA 3V0BB 3ZC9A 2EXIA 3OGGA 1W3FA 4H9WA 2ESUA 3BAVA 1ENSA 3K1XA 3V65A 3IM0A 3PVOA 3RTJB 1V00A 3C9ZA 1BLAA 2CL2A 1BLDA 4M3CB 5T54A 2ZGSA 3VKFC 1UZYA 1W6OA 4A7YA 1HQLA 4XMIA 1JT5A 1EV2A 1W3AA 2BFHA 1DBNA 3FFZA 1K5VA 4WVWA 5JMCA 2UURA 4TLPA 3L2YA 2WSVA 1V6IA 2GALA 3CAHA 1AX0A 1LOCA 2WSUA 2A70A 1AX1A 1TIEA 4XJZA 4G6JA 2W39A 1ULEA 7I1BA 3SLIA 1LOBA 4QKRA 2F2FA 1V6JA 3PUBA 1QQKA 1SR4C 4XTMA 5DZGA 2Y9XE 1IKPA 3USUB 4EFQA 3UJOA 1YO8A 1G82A 4Y1XA 1LEDA 1AVWB 2V73A 5DZFA 1YI7A 2KLLA 1Z2VA 4K20A 2Z48A 1YIFA 1F9KA 3H6RA 1CN1A 4KBBA 3D5OA 4GOVA 3OYWB 3I8TA 5EYYA 1N1TA 3PJQA 1L2HA 2C5DA 1R8NA 4LBNA 3VT1A 2OUJA 4OWJA 3SISA 3H0OA 2D3RA 5JOYA 4LO3A 4ZBVB 2Q9XA 5I1BA 3HSMA 4FOYA 4Y20A 4USPA 3WDTA 4PBOA 4M01A 4R9AA 3AP5A 3AXDA 4YM2A 3EF2A 4L8QA 4XJ8A 4I4SA 3ZX7A 3B9UA 1S0BA 4OEFA 1JUIA 2PHFA 1S0CA 3FBYA 4IY9A 4TYSA 3IAGC 3N36A 2ENRA 1AX2A 4PF5A 2F8XC 1ULCA 1J0SA 4A7ZA 4CZSA 1N1VA 1FQ9A 2NYYA 1SLCA 2ZAAA 1V6VA 2F2FC 3H6SE 3VEQA 2WT2A 4I30A 1AVBA 4P14A 3CA5A 2JE9A 1AJOA 4XMAA 3FJFA 2WLQA 2WT1A 2HWMA 5IK5A 3CRGA 3WA1A 1QKQA 3BB2A 3FLPA 2UUSA 1KNMA 1LJ7A 4YZ1A 4YOLA 5T5JA 2FFUA 3WV6A 2ZGKA 5F8WA 5L73A 1JYCA 2WRYA 5BYNA 2NVHA 4ZFUB 1WLWA 2A5ZA 4XDQA 5T52A 1BQPA 4BLJA 1QGLA 4KEKA 4LO3C 3D7WB 4I1EA 1SBFA 1H30A 1Q04A 3B00A 3BRFA 4HANA 1ZM1A 1CPNA 3N7KA 4JQ0A 3I4IA 4AN7B 1J1TA 3OBRA 1JYIA 4Q9GA 2GN3A 4WZFA 1IRAX 1TFMB 1JN2P 1DZDA 1YTOA 2VW2A 3AZXA 1V6LA 4XJWA 5EC5A 2MC2A 1AXZA 1DJSB 5IK8A 1EPWA 1G7YA 1LHOA 3NBNA 5EG6C 2I1BA 4R9DA 5GLVA 3O0WA 1BASA 3N7MA 1WBLA 5EXOA 1CJPA 3CRHA 4I7IA 1WLCA 4YGCA 4BMEA 4Y22B 5BP5A 4II0A 3SNVA 2VW0A 4P6AA 3SH3A 3INAA 3Q7XA 2VW1A 4FPCA 2ZGPA 3OY8B 4LO2A 1AXYA 4QBCA 3AYAA 1IILA 2R9KB 4EEEB 1YXWA 1JY0A 2DRYA 5FRAA 4HJJA 3VT0A 4YM1A 4ASMB 3NJ5A 1FATA 4SLIA 1VIWB 4GALA 1GNHA 2A6XA 1LOFA 1LOGA 4Y1ZA 3UK9A 4FVVA 4ISQA 2D3PA 2YXSA 1HQWA 2UWAA 2EXHA 4M00A 4BQ1A 2ZHMA 3ZXKA 1LODA 4GWNA 3POKA 1Z0HA 4DENA 1FGAA 4YG0A 2P3JA 5DXDA 1MZ5A 1Q8QA 1JT3A 3FJDA 4IQPA 1MS4A 4H04A 4I4QA 4I4VA 3QR5A 3V0BA 3AX4A 1LGBA 3N7JA 3SNMA 4PCRA 1JLYA 4G6MA 3VKMA 2YY1A 4M3CA 3QYDA 2P34A 3PMEA 1FYUA 1ILR1 2ZGNA 3O4AA 2LALA 4LBKA 2YROA 2ES3A 4XIKA 5GAQA 4Q26A 3IM6A 3DUIA 3N7LA 2R0HA 1W6QB 4XBLA 3CA1A 4F34A 2VSAA 1CONA 5BP5C 2D24A 1C4RA 1Q8VA 4Z8SB 5T50A 3RTIB 2CTVA 3UD9A 1Z4SA 5IT6A 4QBVA 2E7QA 5H9RA 2CNAA 5GZGA 3IM5A 2DS0A 4XBQA 1OQLB 3IM7A 31BIA 1TWEA 3O4OA 1YRZA 2HW9A 1V6WA 1CVNA 3POYA 5CB7A 3ILFA 5E88A 3WDYA 1ISXA 3VSZA 1MZ6A 1M2TB 1LU1A 1G9BA 1JQZA 1RMLA 1LOFC 2LIEA 3AZYA 2P3KA 1UMZA 1XG6A 3A0KA 1I3HA 4Y1YA 3OYWA 3MEPA 2R0FA 4QALA 2DUQA 2WBCA 4CJMA 5IK7A 4I0YA 5GM0A 2Y9FA 4AVSA 5FZZA 4K21A 3OJBA 4R9CA 1GSLA 3B9CA 2Q5TA 2JE7A 1VALA 4LO0A 2RHPA 2P39A 2EAKA 3RS6A 2JKBA 3WMUA 3KM5A 3AZVA 4GAFA 2AGSA 3ZSMA 2ARBA 2GNMA 3WDVA 1SLBA 3O49A 5CNAA 2KM2A 3LSDA 5DUYA 3ZXDA 2A6VA 5D62A 4YW2A 2Z42A 3I29B 4OWLA 3ZXLA 3A23A 2KI4A 3AP9A 3W59A 1BFFA 2WKKA 1F31A 1DFCA 1TWMA 4ZGRB 1FWUA 4DCKC 5GLTA 1BXHA 3ZVXA 3ILRA 1LOEA 3LSEA 1U0AA 1VCLA 1IS4A 2AQZA 2W52A 4LBLA 2P2KA 3MW3A 2ZGQA 2KI6B 3AJZA 3ZYRA 2PELA 5BVPI 2ZKNA 5KXEA 1MS1A 2PHTA 4J2KA 1N3PA 3WMVA 1MS3A 4YFWA 4IHZA 1YBIA 4DS0A 1Q8SA 1B09A 1OQ1A 4ENDA 3UD8A 1S0LA 3VV1A 1HWPB 1RG8A 3LCPA 3T1LA 1TTUA 1NUNA 2RG9B 2D6OX 21BIA 1C1LA 3LLPA 1V6OA 3WCRA 4G1RA 2JD4A 2DURA 4OW4A 3C2UA 2DREA 4OEGA 1AXMA 3VSFA 3F62B 2NM1A 1GZWB 3CA0A 3WINA 3AFKA 4XOGA 3UJ4A 1ULFA 4XYXA 4OEEA 3CA3A 1SLAA 3CA6A 4EFRA 3FJBA 4Q1RA 2ZMLA 4DPNA 2W08A 3VKOA 1AXKA 3ATGA 1GKBA 4HA2A 4Y22A 5E89A 2W68A 4YW1A 3CU1B 1A78A 3FJKA 4Q1PA 3NBEA 4I4PA 41BIA 2ZR1B 3R4UA 3VWCA 5F9TA 3FJHA 1HDKA 2J3PA 1V6KA 3GALA 3OY8A 4AVTA 1G9CA 4LO7B 4ZOTA 2FO1A 2KH2A 4PBPA 1NXD1 3ZYPA 3D6EA 4P0LA 4QO3A 1WBAA 4XZPA 1DQ2A 1W6MB 4LBMA 3WVJA 3MW4A 5IK4A 4WV8A 3T8SA 3BTAA 5BXSA 4C1XA 2X2TA 4LBJA 3M1HA 3RRDA 3VKNA 3APBA 4XBNA 1BARA 2EF6A 4YGBA 8I1BA 1MD6A 1BZWA 2D6LX 3FLRA 1HWNB 2R49A 1CQ9A 3MALA 4OWKA 1ISVA 2ZHLA 4JRAA 4XKIA 1GV9A 2LTNA 1Q8OA 3R4SA 3WINC 1LOAA 3PHZA 3NBCA 5FNXA 1UN1A 2DTYA 2HZ9A 1LENA 2RQ9A 2ZGUA 5FZYA 3WG3A 1PC8B 2TEPA 1ABRB 1MACA 4JAWA 4Y1UA 1A3KA 2VU9A 1N1SA 1UPSA 4F83A 1JT4A 1GZ9A 4RA0A 5GJ6A 5E24E 3ZXGA 5GZEA 4QD2C 1W6QA 5FREA 1GYKA 2FHRA 3QLQA 2D43A 2SBAA 2GZBA 3ZSKA 2XOAA 4R9BA 3FLTA 1IHKA 5CBLA 2ZQNA 4AN6A 4Z9WB 4JC1A 4HR6C 4YM3A 1DIWA 4I8MA 4XXAA 1AVXB 2VLCA 5HPZA 3AP4A 4K1YA 1GNZA 4DFSA 1S0IA 5F8YA 4J2XA 1UL9A 4GKXA 4QC4A 4UW3A 1CIWA 2D6MA 4UW6A 5D63A 1ULDA 1I1BA 1JOJA 1APNA 4I4UA 1N47A 3N35A 1DQ0A 1UZZA 1V6NA 2K4AB 4FPGA 5T5LA 1QXMA 1G86A 1QDOA 5F90A 2A6YA 4LBQB 5JVVA 1ISWA 5GLUA 1GBGA 3AXEA 3VT2A 3O3QA 3OPZA 4U36A 1WBCA 5DG1A 3W58A 3AH1A 1S0DA 4JKXB 3AKGA 4JPZA 5F8SA 3WUDA 2DVDA 1NZKA 1AVUA 2FGFA 2PHRA 3CQAA 3NV4A 3WG4A 5G00A 4FPKA 2P37A 1Q8PA 3P6IA 3WG1A 1IS5A 1KDKA 2DVGA 5JDBA 4DRRA 5BXRA 2CYFA 4YG6A 3B3QE 2AR6A 1CVSA 3BA7A 4XFTA 4AVVA 3SH4A 4J2YA 4I96A 4C1WA 3BX1C 1DQOA 1WD3A 5EHAA 2E7TA 2HWAA 2Y9GA 5DZUA 1C57A 1G8WA 1VAMA 1PZ8A 2H0BA 5SV8A 1W6NB 2X2SA 4X38A 2DV9A 2HYKA 1JW6A 4BM8A 3AKIA 3POWA 1FMZA 1W6PA 1QU0A 4X37A 3Q9OA 3V0AB 3N3HA 2BEAA 4ATFA 1QMJA 5GZFA 4XTPA 3GNEA 3TAYA 1T4QA 4X3AA 3POSA 2GMMA 1TOOA 1G9AA 2AAIB 3WHUA 3JU9A 3I2AA 2RSTA 2NMOA 3AYEA 3O4BA 1DLLA 3ILAA 3PVEA 3FUOA 3M3EA 2WJSA 1ZA4A 4FPFA 1GZCA 5FZUA 2D6PA 2R1BA 1GZWA 5JOXA 1JXNA 4OUJA 3FJIA 1AVAC 3WO3A 1FMMS 4DQAA 3P53A 2CWSA 3IMNA 1Y7BA 2A6ZA 2SLIA 1URXA 4USOA 2WNEA 1RINA 3BAUA 1XQNA 4XFSA 4FQ4A 5BQUA 1R8OA 1LTEA 9ILBA 2DRZA 1V6MA 4Y24A 1LHVA 1DYPA 3O4CA 4LO2C 1F5FA 1WW7A 1HIBA 2OUHA 1DQ6A 3USUA 1N3QA 4G9MA 2R1DA 4H55A 3T1MA 4ZXKA 3FUQA 2K8RA 4D0ZA 1SBDA 3HR9A 1QNWA 4AWDA 1DZQA 3AKHA 3ZXEA 2A71A 3CRIA 2ZGOA 5GLWA 1UAIA 2CWMA 3OJ2A 3AH4A 3AJ6A 4MYEA 4XXPA 5JOWA 1N4KA 1TP0A 1BYHA 3N0KA 3AYCA 3UJQA 1LHUA 4QKSA 5CA6A 1W6MA 2YMZA 4XHXA 3JRRA 4IY8A 3MW2A 2B7YA 1ENQA 4FP3A 4FQZA 2A75A 3BAHA 1LESA 2JJ6A 1S0EA 1QOOA 3WDWA 1JTCA 1HKNA 5B2HA 5H9SA 3BAQA 2WT0A 4P9YA 1PZ7A 4XJ9A 3BAGA 1KITA 4GWMA 4TZDA 3T2TA 2GNBA 3Q7WA 3UJ0A 2VSEA 6I1BA 3ILNA 4YW5A 2DWRA 4GP3A 1KJLA 4BOWA 5BQUC 1WD4A 1YYNA 2PHWA 4AGVA 4W65A 2AFGA 4I4YA 1W0PA 1K5UA 3ZXFA 2NZ9A 2P3IA 3BRDA 1WW6A 3I2XA 1Q1UA 1Z78A 1AJKA 3BOPA 1HCDA 2VXRA 3WDXA 4CRQA 4YGDA 4LO1A 1SR4A 2D7FA 2XG3A 2ZABA 1I1EA 4BLIA 1HWOB 4LO7C 2EIGA 3AH2A 4J23B 2NN8A 3RMXA 2DU1A 1MR5A 1PZ9A 3NV1A 2MLLB 5JOZA 3HOMA 3H6QA 1BFGA 2AH2A 4FOVA 3MPPG 1N3OA 4LO0C 1FWVA 3AJYA 1A8DA 4D8HA 1DGLA 4YZ5A 3QCWA 2GMPA 1G9DA 4LBQA 4RL7A 4X39A 1AZDA 2A7AA 2DVAA 1BJQA 1T9FA 1WW5A 3O0VA 4BPZA 1DQ1A 4Y26A 2GN7A 3WG2A 5KXDA 5DUVA 1DQ4A 5GZDA 2AYHA 1JT7A 2OW4A 5GZCA 1MC9A 3D4KA 4YZ3A 3VUOA 5T5OA 4NO4A 1ISZA 1XYFA 1EVTA 2GO2A 1XZZA 3JUTA 5BXTA 3M2MA 3JUUA 1AF9A 4M3CF 4DRVA 3BA4A 2P23A 4L4IA 4XHBA 2XB6C 3WNXA 2AUYA 4ZFYB 3SH5A 1CESA 1ENRA 2JDZA 1LU2A 4KC3A 4LO1C 5H9QA 2D1ZA 2E51A 3SITA 3M3OA 2A3YA 4I4OA 1BA7A 1HWMB 1LGNA 4P0KA 4YG3A 1G9FA 3FGMA 2ZACA 5DUXA 3RG0A 1IOBA 1OFSA 2DU0A 4I4RA 5BOWA 4LO8B 1W6NA 3WLUA 2AXMA 2PHUA 1KJRA 1SLTA 4YFZA 1IOAA 3OBTA 4ZLBB 3P6JA 3VKLA 4G9NA 3V0AA 2YUGA 4L4HA 4U2AA 1DQ5A 1PZZA 1SCSA 4GOYA 1S0JA 5DUWA 2C9AA 2ZHNA 3O12A 1GANA 3V64A 4A7KA 4FPHA 1QQLA 3FJCA 1GLHA 1DZCA 4GA9A 3O4DA 2GMEA 1SLIA 2Y9WC 3PVNA 2D22A 4I37A 4FPJA 2GNDA 2LIQA 4FGFA 5DG2A 2ZMNA 1LECA 4YLZA 3WZ1A 1WCSA 1PWAA 5DZEA 3RQ0A 3NBDA 4XFUA 3A22A 1BFBA 1IKQA 4ZA3B 3B01A 4I6IA 3UL2A 2D7RA 1ONAA 2DYCA 1YF8B 2KKIA 4EFPA 1QOTA 4LBQD 2VXTI 2ET2A 1BKZA 5HCFA 1OKQA 2R16A 5T55A 4HL0A 1TEIA 3W9TA 2ZA9A 4Q9PA 3F1RA 2E6VA 2WQZC 2I2SA 2NTDA 1MS0A 3CNAA 2ERFA 3IPVB 1NLSA 2ZBJA 2EALA 3WOGA 2E4MA 2ZMKA 4WVVA 3WO4A 1IRPA 1X50A 3AZZA 1S0FA 1SZ6B 2MIBA 4IZEA 1MS8A 3AP6A 4P9XA 4PQ9A 4I2SA 2D3SA 1Q03A 5LK5A 3AKFA 3ZSJA 3NWKA 2ERMA 4Z8BA 5EWSA 1W6OB 1LHNA 4PC4A 3NV3A 1HCEA 5GLZA 2ARXA 4J2SA 2AENA 4Q27A 3FJEA 4JP0A 4Q2FA 3KMVA 1QDCA 4EKXB 1EYLA 3IN9A 2ZZJA 1HKDA 4IZXA 2A6WA 4I3NA 2QYIB 2GNTA 3AZWA 5E8AA 2D6KA 4R6UB 1KDMA 1QNYA 3S8KA 3V79C 3RMYA 2UWCA 3CA4A 3LTQA 1RY7A 1FNYA 4YM0A 3A4UA 5KXCA 2L5XA 3UD7A 1HLCA 1H9PA 4QD2B 5DSSB 2AREA 2ZHKA 1MVQA 1CPMA 4LBOA 2V5YA 3AK0A 4EB2B 1VAVA 4FOWA 4M3CE 3FJ9A 4D0TA 3H6RB 2FMDA 3ZSLA 2BEBA 3DGTA 4ZFWB 2DUPA 3ASIA 5DVHA 3B69A 3BIWE 4XILA 1WW4A 1W3GA 4ATEA 1KRIA 1V6UA 1XHBA 3BAOA 4WBCA 5KXBA 3A21A 5F5QA 5H9PA 4K1ZA 2A3XA 1JBCA 1SLLA 1Q56A 3TC2A 2E4MC 4YGEA 4AGRA 1SFYA 1RIRA 3HN1A 3PG0A 2IHOA 1N1YA 4Q8LA 5BXPA 4Y20B 1DQGA 4KEJA 1JLXA 3O5WB 5EYXA 2VUAA 4YW4A 4AGGA 3WHTA 4Q91A 1S1AA 3O5SA 4Q8KA 2NMNA 2YV8A 1D0HA 1GICA 4JCKA 4UW4A 1E0OA 2D7IA 4IYBA 3KQRA 3ENRA 4D69A 2BQPA 4XIOA 3ZC8A 1AFCA 5HCAA 1O4YA 1RZOB 2Q3NB 2VH9A 1PUUB 4ISRA 5HCBA 1VLNA 1SACA 2QN4A 3HALA 4XJAA 4YW3A 4FOQA 3FJ8A 3OJVA 3Q7YA 3ZXJA 1ITBA 4FP2A 2D6NA 3WCSA 1SCRA 3OJMA 4KEIA 1LEMA 1ONKB 1LHWA 3O0XA 3M3CA 1LGCA 1S0GA 3R05A 1MS9A 1UX6A 3M3QA 4YZ4A 2OVUA 5FNWA 1QF3A 2PHXA 2E53A 1WUVA 4FPEA 1UKGA 1FX5A 4I1BA 2EXKA 3WO2A 1C1FA 1FAYA 1FV3A 1JHNA 1ULGA 1W0OA 4P9WA 2ZQOA 3A07A 3WDUA 1PUMB 3UDAA 1LCLA 1KQRA 3RSJA 1SBEA 5IUQA 2DTWA 3A0NA 1CR7A 1WBFA 1IS3A 1MS5A 3O44A 1DFQA 3BA5A 3U4XA 4AYUA 4ITCA 3FJJA 1RITA 2D20A 2GDFA 4JKQA 4NOTA 3AP7A 3IKWA 2D44A 3AJ5A 4XJUA 1BFCA 2A3WA 1FNZA 5DUUA 1P63A 2DVBA 2EXJA 3AYDA 5T5PA 5GALA 2CY6A 3BADA 1D2SA 4UW5A 4Y1VA 2K43A 1FN0A 3HMYA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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