3R4UA

Cell entry of botulinum neurotoxin type c is dependent upon interaction with two ganglioside molecules
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
428
structure length
422
Chain Sequence
SMANINDSKILSLQNRKNTLVDTSGYNAEVSEEGDVQLNPIFPFDFKLGSSGEDRGKVIVTQNENIVYNSMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNEDSEQSINFSYDISNNAPGYNKWFFVTVTNNMMGNMKIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFEINKIPDTSDNINMWIRDFYIFAKELDGKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYNKEYYMVNIDYLNRYMYANSRQIVFNTRRNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGGDILYFDMTINNKAYNLFMKNETMYADNHSTEDIYAIGLREQTKDINDNIIFQIQPMNNTYYYASQIFKSNFNGENISGICSIGTYRFRLGGDWYRHNYLVPTVKQGNYASLLESTSTHWGFVPVSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The biological activity of botulinum neurotoxin type C is dependent upon novel types of ganglioside binding sites.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type C1
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
total genus 99
structure length 422
sequence length 428
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3r4uA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3r4uA02
5GJ6A 2EXIA 2JJ6A 3OBRA 1LHOA 3D5OA 3IM7A 3OY8B 4I1EA 4YLZA 5BOWA 3FJEA 3VKNA 4Z9WB 3ZYPA 3UL2A 1HLCA 2ZMKA 1FYUA 1FV2A 2YXSA 3KQRA 2ZHNA 4YGCA 4DPNA 4BLJA 2VXTI 2FGFA 2LTNA 1JT3A 3FJAA 4GWNA 1M2TB 2WSVA 3NV1A 1SBFA 1NUNA 1XZZA 1S0BA 1AFCA 4YZ3A 1VCLA 3KMVA 4Y20A 3O12A 2CWSA 5DUXA 2G4IA 5E24E 3NBDA 4AVVA 1GZWB 3ENRA 3OJMA 5DG2A 3ATGA 4YOLA 1W6MA 3WDUA 3WO2A 3NJ5A 1MS5A 2H0BA 5F8SA 2ZQNA 1SLLA 2K43A 3O4CA 1LTEA 1DZDA 4KEJA 1YO8A 2P34A 4LO0A 3B9UA 1HWNB 2KKIA 1KJRA 3POYA 1N1TA 3SISA 3K1XA 4X37A 2ES3A 3UJ0A 3O0XA 4YW4A 2NTDA 4KEIA 4Y26A 3NBNA 1JYCA 2ZKNA 1LHWA 3O4DA 3OPZA 3CA1A 1SCSA 1GZCA 1ULCA 2AR6A 4AYUA 3ILNA 1UX6A 2NN8A 4XJWA 2JKBA 2E7TA 1FV3A 2WT2A 1ZA4A 1FQ9A 3ILAA 2K4AB 2ZAAA 4M01A 1IJTA 3ZXGA 2Q5TA 3AJYA 2NYYA 1R8OA 4GP0A 3BRGC 1ULFA 3CA3A 4Y22A 4L8QA 5T54A 1MACA 4XXPA 1QKQA 5FNWA 4IZXA 4XFSA 1MZ5A 3QR5A 2WSUA 1SLCA 3HBWA 5KXDA 3WG2A 5EHAA 1SR4C 3FJCA 4P9WA 3AKIA 1XHBA 4K20A 3POKA 3L2YA 5KXCA 1W6OA 3LSDA 2ERMA 4CJMA 4DENA 4Q1PA 4J2YA 4J23B 3ZSLA 3T1MA 1G9DA 3U4XA 1DQOA 4Q8KA 4XMAA 1CPMA 2RHPA 2D1ZA 2NMNA 3V65A 1MR5A 3C9ZA 2ZACA 3RTIB 3IIRA 1WBAA 5FREA 5KXBA 4PC4A 1LOGA 3AFKA 2ESUA 1WD3A 3P6JA 2EAKA 3P6IA 4I8MA 3USUB 3WUDA 2DRYA 1GNHA 5L73A 2Y9WC 4XXAA 1RIRA 5DVHA 1H9WA 1F5FA 5GM0A 2EXHA 4YM2A 1Q56A 4J2KA 3P53A 4F34A 4LBKA 2RG9B 3O44A 3D7WB 4FPKA 1SZ6B 2FO1A 4CRQA 1XQNA 5EG6C 1AXKA 4PF5A 1BASA 2KH2A 1DQ4A 4XJAA 3ZXEA 4FPOB 4ISRA 2UWCA 2KI4A 2CYFA 2A3XA 4Q91A 2KI6B 1DZCA 5G00A 2VSAA 3DUIA 3VWCA 1VAMA 4BOWA 41BIA 2P39A 5GLZA 4JAWA 1GZ9A 1IOAA 1MS9A 2EIGA 1ISVA 2WBCA 4HJJA 3F1RA 1S0IA 4I30A 3AKGA 1LODA 2MC2A 1JT4A 5D62A 3WG3A 1LGCA 1LOBA 1FATA 3T8SA 4AGRA 5DUUA 4YGBA 2ZA9A 1CE7B 1ENRA 1Q8PA 4JQ0A 2WKKA 2ARXA 1CR7A 3WDWA 1IRAX 1GICA 1F31A 1WW4A 3UJOA 3V79C 2D6NA 2UWBA 3OJBA 4PBOA 2GMPA 1LHUA 4XJ9A 2ZQOA 3ILFA 2E51A 2KM2A 4K1YA 5IUQA 1DLLA 3AP9A 1ITBA 3FUQA 4I6IA 3WOGA 4I0YA 21BIA 2HWMA 4IQPA 3IM6A 4U2AA 5DUVA 1RY7A 2D20A 5GLUA 3ZXFA 5JLVA 2VW2A 4AGGA 3V0AB 1TEIA 5T5OA 3R4UA 4YW3A 4XIKA 5FZUA 4H04A 4UW4A 3AJ5A 2W68A 1D2SA 4LO7B 3ZXDA 4XHXA 3WA1A 3LLPA 1CVSA 4C1XA 1G9AA 4LO2C 1ULEA 4FOWA 5F9TA 2B7YA 5HCFA 2JE9A 3PVNA 3B3QE 4DRRA 4OEEA 4EFQA 1LHVA 1JQZA 1WBFA 3WMUA 3N7KA 1MS1A 1PUMB 1ISZA 4QBCA 2GALA 4P6AA 1YTOA 4M3CA 1RZOB 3IKWA 2BFHA 3APBA 2ZGPA 3RTJB 4USOA 1ULGA 1KQRA 1DQ6A 1YI7A 2ET2A 4LBQB 3O5SA 2VH9A 3ZX7A 1LU2A 1S0FA 2D44A 3WUCA 1SCRA 4Y1UA 1QOSA 2GN3A 1ENQA 3I8TA 1KRIA 1V6OA 3TB0A 3T1LA 1AZDA 2ZGNA 1H9PA 1IILA 3O0VA 2WT1A 4NOTA 1CONA 1DQ5A 2D3SA 3MW3A 3LCPA 2ZBJA 2E4MC 1PUUB 2GDFA 4P0JA 1APNA 4FP2A 1WLDA 1GYKA 2ZGQA 4FOQA 1J1TA 2DVDA 2A3YA 2D22A 3CRIA 1W6PA 3FJFA 3IPVA 5CNAA 1EV2A 4ZFYB 1IKPA 2JE7A 3AP6A 1HWOB 1MVQA 3POSA 5BQUA 1DHKB 3SITA 1HIBA 3I29B 4Y22B 1MZ6A 3V0BA 2V73A 1OKQA 3MEPA 4Y1YA 4KEKA 2PHUA 1CVNA 1H30A 4LBOA 4FPCA 3NV2A 1QXMA 3SH4A 1DFQA 4YZ5A 1V6MA 3F62B 5T52A 3INAA 1LULA 1AXYA 1HQLA 1QQKA 2SLIA 3BB2A 2X2SA 3PHZA 5GZGA 3A07A 3FJJA 4IZEA 1V6VA 2CNAA 3N0KA 4HA2A 4Y1ZA 2WT0A 4P0KA 1FGAA 2Z42A 3JUTA 1JTCA 5GZEA 4AN6A 3B01A 4D0TA 3HOMA 5JOYA 1BQPA 3NWKA 5JDBA 4R9CA 3WINA 4J2SA 1LEMA 3AP7A 5KXEA 1E0OA 3BA4A 3BAUA 4YM0A 2PHRA 2MIBA 1W0PA 2A71A 3HALA 3FJHA 5F8YA 1V6WA 4AWDA 4TLPA 1AF9A 3V64A 4YG6A 2VY0A 3WDYA 4IYBA 4FPJA 1PWAA 1LJ7A 2R1DA 3WZ1A 1FN0A 4AVSA 4FPYA 1NZKA 2D3PA 1G7YA 4LO7C 3CA5A 4OWLA 1RINA 1JUIA 2YUGA 3OBTA 1ONKB 3ZXJA 1W6QB 3RRDA 2M49A 4ZKTB 4X3AA 5H9SA 4SLIA 3CQAA 3LTQA 3H6RA 1JHNA 2VW0A 2NP0A 2ZHMA 3H6QA 4ZGRB 3Q7YA 2ZGLA 5GZFA 1DJSB 4XIOA 2ZMNA 1V6LA 4Z8SB 1ZM1A 4XYXA 3MW4A 2ZZJA 2UWAA 4I7IA 3FBYA 4OWJA 3D6EA 5LK5A 1AJKA 2DUQA 5GZCA 3NBEA 4G9MA 3RS6A 2ZABA 5JOWA 1GGPB 3GALA 5I1BA 3WDVA 3OYWA 3O3QA 5H9PA 1QNYA 5FZZA 1WBLA 1S0JA 4W65A 5IK8A 3M3CA 4DRVA 1WLWA 1IT0A 2ZGKA 1TWEA 5BYNA 1FMZA 1Q8VA 1HWPB 1UZZA 3BAHA 3FJBA 1LOAA 1V6KA 1W6NB 1GNZA 2P23A 3PJQA 4YM1A 4UW3A 4G6MA 1YIFA 4OEGA 2NM1A 4L4IA 5JOZA 2CY6A 3VT2A 3WDTA 4I4QA 2DS0A 1JLXA 3MW2A 4LBLA 2ZGSA 3I2XA 1HQWA 4C1WA 1TFMB 1G86A 3QYDA 1CJPA 4ZA3B 5BXRA 3WLUA 1I1EA 1RG8A 3N35A 4ATFA 3FFZA 1TWMA 3WVJA 1HCDA 2AREA 2GZBA 4D8HA 1AVAC 5AVAA 1UAIA 2NVHA 1BFCA 3FJKA 2LIQA 5H9QA 4JKQA 2D43A 1QOTA 2P37A 1VALA 4I4PA 1LOFC 4P9YA 3O4OA 2Y9FA 5B2HA 1FAYA 1S1AA 4M3CB 4P0LA 1U0AA 3JU9A 2VW1A 1Q8OA 4XILA 3AXDA 2D6PA 4EFRA 1BA7A 4R9DA 2DU1A 3M3QA 1BFFA 2UU8A 4I4YA 1SR4A 5DUYA 3UK9A 5T55A 3A4UA 2DVFA 4X38A 5JVVA 1EVTA 2D23A 4XOGA 2WQZC 1JT5A 2ZGMA 1DBNA 1UL9A 4EFPA 2FMDA 1MS4A 1GSLA 1WD4A 4WVVA 1L2HA 4QO3A 4A7KA 2D6MA 4LBNA 4I4XA 5DSSB 1B09A 4Q8LA 4G6JA 2OUJA 4YW5A 1T9FA 2DRZA 3S8KA 1A78A 3BADA 1MC9A 3AJ6A 1S0GA 4XBLA 2FFUA 2AAIB 3R4SA 4H55A 1V6NA 4FP3A 2LIEA 5BP5C 5CA6A 4BPZA 3UJ4A 1A3KA 4QBVA 4Q2FA 2ZR1B 5EYYA 2F8XC 5DXDA 1WW5A 4Q26A 4LO1C 1G82A 3V0BB 1V6IA 2A5ZA 3OGGA 2ENRA 3Q7XA 1ULDA 2Y9XE 1BYHA 1LGBA 1N4KA 8I1BA 2HWAA 3S8JA 4XJ8A 2VU9A 2BQPA 1I3HA 2HZ9A 3VT1A 3UJQA 1I1BA 3WCRA 1IHKA 1SFYA 3A23A 2IHOA 3FJDA 1AVXB 1QF3A 4XKIA 1HDKA 4YG0A 3D4KA 1ISYA 1GZWA 4Q27A 5T5LA 5CBLA 1MS3A 4XJZA 2A6ZA 4ASMB 3A21A 4Y1XA 1N1SA 4D0ZA 1JT7A 1A8DA 1Z4SA 3POWA 4GP3A 2Z48A 1BKZA 1XYFA 3AH4A 3CRGA 3BA7A 4QD2B 2XOAA 3AZZA 4LO3C 4HANA 3CA6A 4KC3A 5BXPA 4PBPA 5DZFA 3AZYA 5F8WA 3AH2A 1QGLA 5DZEA 3FLTA 1MD6A 2C9AA 3JUUA 4ITCA 31BIA 1C1LA 3PG0A 1Z2VA 3WO4A 3CA4A 1JN2P 4GAIA 2HYKA 2ZHLA 4YG3A 2A3WA 2UURA 2YROA 2W08A 2GMEA 1V6JA 3CU1B 4YW2A 3PMEA 3Q7WA 2VLCA 1O4YA 2PHFA 3ZSMA 4IY9A 5IK4A 2D24A 4M00A 4Y20B 7I1BA 2A7AA 3H6RB 4DQAA 3VUOA 2BEAA 1QU0A 3UD8A 1BZWA 5FRAA 4G1RA 1AVWB 5EXOA 4JC1A 2DURA 4BMBA 4LO2A 5GLVA 1OQ1A 4WBCA 1W6MB 3WG4A 1XG6A 4G9NA 4QALA 2A6VA 5D61A 1ISXA 2PHTA 1S0EA 3RMXA 1ONAA 1UZYA 4GALA 1PZZA 1BLAA 4LBMA 4I37A 4PQ9A 1OQLB 3WHTA 4GXLA 3BOPA 2XG3A 1D0HA 4YM3A 1AXMA 4I4OA 3JRRA 2A6WA 4TZDA 1X50A 2J3PA 4XTPA 1O4ZA 2DUPA 2TEPA 5JOXA 3WNXA 2OUHA 2ARBA 4K1ZA 2GO2A 4LBQD 3W9TA 4M3CE 3VKMA 5BXTA 1EPWA 3AXEA 1YRZA 1NXD1 1GANA 2A6XA 1LOCA 1Q8QA 2GNMA 3CRHA 2D6KA 2D6LX 1Q1UA 1UMZA 3ASIA 1II4A 4BQ1A 1DYKA 1DZQA 4GWMA 1CQ9A 2QN4A 1LESA 1AJOA 3MALA 4USPA 4I1BA 1VLNA 3SNVA 4BLIA 4R6UB 3NV4A 3CAHA 2E4MA 2GMMA 2Z49A 3O49A 1IS3A 1QNWA 5HCAA 4J2XA 2VUAA 1BJQA 1W3AA 5CB7A 2EALA 1S0CA 2GNTA 4GKXA 4Q1RA 1JLYA 4ZFUB 4GA9A 2ZGRA 1SLTA 1HKNA 3N7LA 1RITA 5GLTA 4PCRA 4EEEB 4ZFWB 1SLIA 1G9CA 3RG0A 1LECA 3FLRA 1WBCA 4DS0A 2Q3NB 4ISQA 3VKLA 1W6OB 2CTVA 3QLQA 2HW9A 2CWMA 3PUBA 4I96A 3BIWE 2PHWA 1BFBA 5T5JA 1GLHA 3ZPYA 3MPPG 4UW6A 4LBJA 3LSEA 2DU0A 1PZ7A 5FNXA 4KBBA 4Z8BA 2A6YA 2WNEA 6I1BA 3UD7A 2F2FC 3IN9A 4XFUA 1DQ0A 5GALA 3HN1A 2P3JA 2AQZA 1FMMS 1TP0A 5IK7A 5EWSA 4FVVA 1IS4A 4BM8A 3DGTA 4XHBA 1AVUA 1N1YA 1ENSA 4FPGA 3BAQA 1S0LA 2LALA 4CZSA 1YXWA 2IWTB 3VSFA 3FJ8A 1YF8B 2E7QA 3M3EA 1KDMA 3AP5A 1GKBA 1G8WA 4FPLA 1YYNA 3V0AA 3R05A 1C57A 1AX0A 1DQGA 2ZGTA 3OJVA 2Q9XA 1R1ZA 1C1FA 4YFZA 1PC8B 3A0NA 2EXJA 4XBNA 2P3KA 1Z78A 3VV1A 4U36A 1K5UA 2AFGA 3ILRA 1K5VA 4AGVA 1BLDA 2VXRA 3WDXA 2NZ9A 4OW4A 4ZOTA 4I4RA 3HR9A 2JECA 3ZVXA 3FUOA 4QC4A 1CESA 1HWMB 2JDZA 3ZXKA 5HPZA 1MVEA 4LO0C 5F90A 1N3PA 2Y9GA 4OZXA 3FJ9A 4YFWA 1MS8A 4II0A 3NV3A 5IK5A 4I2SA 4JRAA 4LBQA 1IKQA 1R8NA 4NO4A 9ILBA 4TYSA 3Q9OA 3HMYA 1T4QA 1IS6A 2DVBA 3BODA 1WLCA 1SACA 3VSZA 3AZWA 1Q8SA 1DYPA 1JY0A 2OVUA 4XZPA 2DREA 2MLLB 3FJIA 2YV8A 1SBEA 4GKYA 4YZ2A 3IM5A 1ABRB 1EYLA 3FLPA 2DVGA 3B69A 3T2TA 1URXA 2R49A 4Y24A 5DUWA 1GV9A 4IY8A 4HL0A 1QQLA 3B00A 5D63A 4DCKC 4XE9A 2OW4A 2I2SA 2KLLA 4I3NA 1AXZA 3N3HA 1DIWA 2R9KB 1C4RA 3H6SE 3PVEA 4A7YA 1QMJA 1FWUA 2W39A 2GNBA 3WCSA 1J0SA 1G9BA 4WVWA 3C2UA 4A7ZA 3ZSKA 1QOOA 2R0FA 2A75A 3BAVA 2AENA 2D3RA 3A22A 1AX2A 1DFCA 1UN1A 4EKXB 1CN1A 1LOFA 4YZ4A 2E6VA 4I4SA 1QDCA 4OUJA 2WRYA 2I1BA 1Z0HA 1LENA 1LCLA 5H9RA 3BX1C 3B9CA 1LGNA 5IT6A 3M1HA 2L5XA 4ZXKA 3VEQA 2RSTA 4LO8B 4FPEA 1LEDA 2P2KA 5GAQA 3AYCA 4ENDA 5DZGA 3TC2A 1TTUA 3FGMA 4RL7A 1ILR1 3CNAA 3O4BA 3O5WB 2FFVA 2SBAA 1WCSA 4JKXB 1HCEA 4HR6C 4YGEA 2AXMA 1W6PB 5T50A 4DEPA 3N36A 3IPVB 4K21A 3OY8A 4R9AA 1ISWA 5E89A 2C5DA 5HCBA 5CAZA 2XB6C 5F5QA 4XDQA 4X39A 5BP5A 3AZVA 4AN7B 1MS0A 1FNYA 4FGFA 4EB2B 5BXSA 1FNZA 5BVPI 3WG1A 1JOJA 1PZ8A 1VAVA 4JP0A 1UKGA 1UPSA 3A0KA 1V00A 1DQ2A 1S0DA 2DTWA 4LO1A 1NLSA 4FQZA 2D7IA 1JYIA 1N1VA 2ZGUA 1W6QA 1OFSA 1LU1A 4YZ1A 4BMEA 1IOBA 4YW1A 3I4IA 3BTAA 2DVAA 1CIWA 3O0WA 4GOYA 2PHXA 5SV8A 3AJZA 1DGLA 1W0OA 3GNEA 4UW5A 3RQ0A 4CTEA 2A70A 4H9WA 2ZGOA 3M2MA 3BA5A 1TOOA 1JXNA 4D69A 4JCKA 1P63A 3WMVA 2CL2A 2DUOA 1Q03A 1YBIA 3M3OA 1PZ9A 1SLBA 1BXHA 2ZHKA 4LO3A 4QKRA 2DYCA 1W3GA 1N3QA 3ZSJA 4MYEA 4M3CF 1WW6A 4ATEA 2DWRA 2P3IA 5E8AA 1Y7BA 4YGDA 3AYEA 1N47A 4RA0A 2W52A 1JW6A 1W6NA 4R9BA 3VKOA 2GNDA 1TIEA 4P9XA 2AGSA 2R1BA 3AH1A 1WW7A 3BRDA 5GLWA 3RSJA 4WV8A 5E88A 5T5PA 2UUSA 2DV9A 5JMCA 4L4HA 1FX5A 3BRFA 2AH2A 3SH5A 3WO3A 3UD9A 1N3OA 3AYAA 3ZYRA 2WJSA 1F9KA 2ZMLA 3IMNA 5EYXA 1BARA 2K8RA 4FPFA 3E8LC 3AP4A 3AYDA 4XMIA 3N7MA 2RQ9A 3NBCA 3BAOA 3IM0A 4FQ4A 1QDOA 4DFSA 1BFGA 1LOEA 3AX4A 3N7JA 4FOYA 3AKHA 3OYWB 4GOVA 3W59A 3BAGA 2GN7A 3W58A 2JD4A 1W3FA 1KITA 3HSMA 2X2TA 2BEBA 2V5YA 2QYIB 1IS5A 4Y1VA 3KM5A 4ZLBB 1JBCA 3SNMA 1LHNA 5DG1A 2DTYA 2D7FA 3UDAA 4IHZA 4XBQA 2D7RA 4I4VA 4QKSA 2ERFA 3CA0A 4FPHA 3USUA 3AKFA 2EXKA 3PVOA 2PELA 3SH3A 1Q04A 1VIWB 2R0HA 2EF6A 2FDBM 5BQUC 1SBDA 2D6OX 1CPNA 1AX1A 4F83A 3VKFC 5DZUA 1M16A 2E53A 1G9FA 2YZ4A 1WUVA 1FWVA 1IRPA 2YMZA 5GZDA 3IAGC 3AZXA 3ZC9A 1KNMA 3RMYA 4I4UA 1GBGA 4ZBVB 3QCWA 1HKDA 3ZC8A 5EC5A 3ZXLA 4GAFA 1DQ1A 4XFTA 4Q9PA 1SLAA 1V6XA 3AK0A 4IONA 4Q9GA 2R16A 2AYHA 2AUYA 3OJ2A 2FHRA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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