3R4UA

Cell entry of botulinum neurotoxin type c is dependent upon interaction with two ganglioside molecules
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
428
structure length
422
Chain Sequence
SMANINDSKILSLQNRKNTLVDTSGYNAEVSEEGDVQLNPIFPFDFKLGSSGEDRGKVIVTQNENIVYNSMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNEDSEQSINFSYDISNNAPGYNKWFFVTVTNNMMGNMKIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFEINKIPDTSDNINMWIRDFYIFAKELDGKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYNKEYYMVNIDYLNRYMYANSRQIVFNTRRNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGGDILYFDMTINNKAYNLFMKNETMYADNHSTEDIYAIGLREQTKDINDNIIFQIQPMNNTYYYASQIFKSNFNGENISGICSIGTYRFRLGGDWYRHNYLVPTVKQGNYASLLESTSTHWGFVPVSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
molecule keywords Botulinum neurotoxin type C1
publication title The biological activity of botulinum neurotoxin type C is dependent upon novel types of ganglioside binding sites.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 99
structure length 422
sequence length 428
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3r4uA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3r4uA02
2M49A 5IK4A 5SV8A 4I4XA 2D43A 3OJVA 2K43A 3RMXA 4DFSA 4BMEA 2F8XC 1DQ1A 1BXHA 1O4ZA 1LOGA 3WO4A 4GOVA 4G1RA 5BQUC 1QQKA 4TZDA 3V64A 1N1TA 2ZGPA 4JRAA 4CJMA 1V00A 1ISWA 2A3YA 5EHAA 1EVTA 5IT6A 1EPWA 1W6QA 4EFPA 1S1AA 2D7IA 1KDKA 3WG4A 3ZC9A 1APNA 5HCBA 2VW2A 2BEBA 2P3JA 1UL9A 4LO2A 4XFTA 3LCPA 4USPA 4I30A 2RSTA 2P2KA 3KMVA 5BXRA 4C1WA 1I3HA 1QU0A 1WBLA 1MS3A 1DGLA 2ZQOA 1A8DA 2F2FA 1V6MA 1MS9A 3E8LC 1N3QA 2AR6A 2KM2A 1QDOA 1S0DA 3I4IA 1HQLA 1V6OA 2WJSA 4K20A 4ZFWB 5EYYA 4WV8A 2H0BA 2GZBA 2ZGMA 1CIWA 3OPZA 1DJSB 4WBCA 4ENDA 4Y1ZA 3WINC 2R1BA 2DUOA 4AN6A 2ZGTA 1TIEA 3CNAA 1ULFA 3WMVA 3RG0A 2WT2A 4GKYA 3A23A 1U0AA 2WLQA 3CRGA 4Y1YA 4I4VA 1C1FA 2DU1A 2E51A 1V6IA 5DVHA 4FPCA 4CTEA 2Y9GA 3PG0A 3W59A 4XIKA 3OGGA 5DUUA 1G9DA 1GZWA 3IPVA 1FYUA 4G9MA 4I3NA 2WT0A 3NV4A 1CR7A 5HPZA 1URXA 4QALA 2EXJA 2KI6B 1FQ9A 3MALA 3RMYA 1LEMA 4D0TA 1SBEA 4QKSA 1N4KA 6I1BA 1WBAA 2RHPA 1DHKB 1SLAA 2DVAA 1SLCA 4AVTA 3OBRA 1IS4A 1F5FA 3ZXGA 3POWA 3OBTA 2CYFA 3V0AB 2AGSA 5CAZA 4ZXKA 4IZXA 41BIA 2I2SA 3C2UA 3MPPG 3V0BB 4D0ZA 5JVVA 3A22A 4QD2C 2IWTB 4GOYA 1G82A 2PHTA 1WD4A 2DTWA 1LGBA 1S0FA 1GKBA 4X38A 2HYKA 3FJHA 1DQ5A 3WG3A 1DQ6A 4P0JA 4DCKC 2GN7A 2WRYA 1IT0A 1QXMA 4J2KA 2NVHA 2QYIB 1SFYA 1BFCA 1AFCA 2D7FA 1Z2VA 5DUXA 4YM3A 4JKQA 1T4QA 1C57A 1CPMA 2ZACA 3SH3A 2JE9A 4XJ9A 1LOFA 2NZ9A 1DZQA 1M2TB 3T8SA 1Q8PA 3FJDA 5GZFA 3CA4A 3LLPA 2XOAA 3WVJA 4K1YA 2Z42A 1V6JA 3NBEA 1IRAX 2PHRA 1N1VA 1IRPA 5KXCA 2TEPA 3FFZA 2CY6A 3AXDA 3WDUA 4OWJA 1ONAA 3ZYRA 2ZGQA 1K5VA 4DRVA 3NJ5A 2WKKA 3UD8A 3FUQA 1BASA 2JE7A 4GA9A 1XQNA 5DUYA 1AVWB 4XHXA 5D63A 1BJQA 1LECA 3TB0A 4YGBA 2ZBJA 3PVNA 1W6MB 9ILBA 2E53A 1PC8B 1JBCA 1VCLA 1LENA 1UKGA 1OQ1A 4OEEA 4P9WA 4Y1XA 4EKXB 1LOAA 2NTDA 2Q5TA 4AGVA 2ZKNA 1S0JA 2VSEA 1WLCA 4CRQA 1IHKA 1RIRA 2A3WA 3CQAA 1QNWA 2AFGA 2VW1A 3UJQA 1QOOA 2EXHA 4QD2B 2WSVA 3DUIA 4ZLBB 31BIA 4KBBA 3CA3A 3SH4A 1IS5A 5BQUA 3ILNA 3W58A 1S0LA 4XOGA 4SLIA 1HCEA 3PUBA 5B2HA 4OW4A 3RSJA 2BFHA 4BQ1A 2DVFA 4A7YA 1OFSA 2W68A 3FJBA 2OVUA 3KQRA 1JY0A 4QO3A 2DUPA 3VV1A 2HW9A 3B9CA 4Q8LA 4LO0C 4FGFA 3FJJA 1LU1A 2VXTI 2P39A 4K1ZA 4M00A 2MIBA 4FPFA 3H6QA 5EWSA 4Z8BA 1FV3A 2D3RA 4XE9A 1DFQA 1N1SA 1MZ6A 3V0AA 4K21A 3VKOA 3CA6A 3HMYA 4I4UA 1JQZA 2ERFA 3AFKA 3V0BA 4HA2A 3BADA 1II4A 1BKZA 1LOEA 2WBCA 3O0VA 3ZXEA 3O4CA 2RQ9A 2D7RA 4P0KA 2ZGSA 3MW3A 2UWBA 1AX1A 3DGTA 1AXKA 3WINA 3MW4A 1WD3A 1BFFA 3SLIA 4XKIA 4P9XA 5T5OA 1V6VA 4FPLA 2P37A 1FN0A 4JP0A 5FREA 3WUDA 3SITA 4I6IA 4LBJA 4XBQA 1V6KA 2JD4A 3BAHA 1W3GA 2ARBA 2X2TA 2W52A 4HR6C 1UPSA 3VWCA 3BIWE 4FPEA 4YG3A 1SBFA 4JQ0A 1YRZA 1ENSA 4FPKA 2YMZA 1O4YA 2UWAA 3EF2A 4DRRA 1TOOA 5T5PA 3AH2A 3HSMA 3AZZA 3M3CA 4FOWA 1ULDA 3ZPYA 3WDVA 3NWKA 3VKFC 3A0KA 2WQZC 2D6LX 3AKIA 1N3PA 3AJZA 1V6UA 1FNZA 2YROA 2DTYA 4J2SA 1G86A 2ZGOA 2D6PA 2EXKA 4CZSA 1ONKB 2G4IA 1LOFC 1DZDA 4PF5A 4II0A 4GP0A 4FP3A 4Y1VA 1QKQA 2GNTA 2YY1A 4M3CB 5DZUA 1MC9A 3UL2A 2YUGA 4HJJA 5KXBA 3IKWA 1BFBA 1Q8SA 4DENA 3LSEA 2Z48A 4Z9WB 1UAIA 1QNYA 4JAWA 1VAVA 3M3OA 3K1XA 2VH9A 4YZ5A 21BIA 4LO7C 1XYFA 2ZHLA 5BP5A 1GSLA 3UD7A 2UURA 2ZMNA 1J1TA 3MEPA 2P3KA 2PHFA 4EEEB 3FJCA 5GAQA 5GLUA 4G6MA 3O44A 3B01A 4J2XA 2AH2A 2L5XA 5D61A 3ILFA 1JUIA 3Q9OA 4Y24A 3AYAA 3NBNA 1Z4SA 3O12A 3HR9A 5EXOA 1MVQA 2EIGA 3B9UA 3B00A 2WNEA 4Y22A 1VLNA 3WV6A 1WBCA 2JKBA 3OJBA 1M16A 3TC2A 1FMZA 1PZ8A 4YOLA 3BA7A 2ZMLA 4FQZA 5JOWA 1NXD1 2A71A 3MW2A 5DXDA 1ULGA 4DPNA 2SLIA 1IS6A 1MS0A 2E7QA 2A6VA 1S0IA 2YV8A 5JOXA 5DSSB 3WNXA 5GZGA 1W6OA 4XBNA 2FDBM 4YM1A 3ZXJA 2VY0A 4FPHA 5FNXA 5JOYA 3BRGC 2AENA 2ZHKA 3P6JA 3UJ0A 4BMBA 3HOMA 1PZ7A 1LHVA 1HDKA 3M1HA 3VSFA 1I1BA 1CVNA 4FQ4A 2D6NA 2PHUA 1AVAC 2KI4A 1RG8A 1DFCA 4LO7B 5CA6A 2LIEA 5IK5A 1UX6A 1MD6A 4LBOA 1B09A 4BOWA 2DYCA 5IK8A 1AXMA 1AX2A 3IAGC 5GALA 1BZWA 1Q04A 1JXNA 4AN7B 4EFQA 5BXTA 4LO0A 4WVVA 4XDQA 5BYNA 1HWOB 4YW3A 4LO3C 4Q9PA 2R9KB 4TYSA 4AWDA 4KC3A 2P3IA 2ZR1B 3WO3A 2W08A 1ULEA 4M3CA 4X3AA 1GGPB 1D0HA 3CRIA 5JLVA 4DS0A 3FJFA 1MZ5A 4ZGRB 4F83A 3ZVXA 2Y9WC 3WDXA 2JJ6A 3BAOA 2GMMA 1WW6A 2K8RA 4HL0A 3WZ1A 1R8OA 3ATGA 1AX0A 1JT7A 2AYHA 1BLAA 2VW0A 1Y7BA 1TEIA 3AZXA 3WA1A 3P6IA 1F31A 3FGMA 2AUYA 2LIQA 2I1BA 4I8MA 1UZYA 3AXEA 1IOAA 2QN4A 3WHTA 4HANA 5GLVA 3N35A 5FNWA 4YM2A 1AVUA 4PC4A 4DEPA 1CN1A 2NM1A 2GALA 2FO1A 3PMEA 2XB6C 2Q3NB 1RINA 1DZCA 2ET2A 1NLSA 4IYBA 4WZFA 4LBQB 5F5QA 5BP5C 1N3OA 4USOA 2GNMA 4IY8A 2IHOA 3OYWB 1FATA 3AKHA 2LALA 1A3KA 3BA4A 5GJ6A 8I1BA 3IM5A 2OUHA 3BB2A 3IM0A 5GLWA 2DU0A 3RTJB 3B3QE 4I1BA 4YZ3A 5BVPI 1JN2P 1Q8OA 4QBCA 2LTNA 1R1ZA 2HWAA 1AVXB 1S0GA 5DG1A 2DREA 3VT0A 3OY8B 4Q27A 2Y9XE 4QKRA 3AH1A 4Y20B 3F1RA 3BA5A 1RITA 2WT1A 4I4SA 4PCRA 1ENRA 1DQ4A 2EAKA 1G9FA 3FJAA 3PVOA 1AF9A 4I4YA 1KDMA 2CWSA 1FX5A 2A5ZA 1Z78A 3H6RA 1MACA 3M2MA 4C1XA 4Q8KA 4JKXB 4OUJA 2DS0A 4G6JA 4X37A 4I4QA 1IKQA 3ZC8A 3AKGA 3PJQA 2OW4A 2CL2A 4XZPA 2ERMA 1Z0HA 3O5WB 3BAUA 3INAA 3M3EA 1SACA 1RMLA 1GV9A 3N7MA 2FMDA 1JT5A 1DQOA 2ZA9A 1R8NA 1V6XA 4Q1PA 1HCDA 1LGNA 3I2XA 1TFMB 3P53A 1LULA 1H9WA 4YFZA 1BA7A 4H04A 3FJ9A 5FRAA 5F8WA 3IMNA 1AVBA 5H9PA 1LHNA 1KITA 2A6YA 1LHOA 4L4IA 2DVBA 4X39A 1PUMB 1WBFA 4YGCA 3AJ6A 5FZUA 1LU2A 3BRDA 2NMNA 1N1YA 3RQ0A 1QOTA 3QCWA 2UUSA 2ENRA 1SZ6B 1ISVA 3IM6A 1GBGA 5KXEA 1DQ0A 2SBAA 4I1EA 4A7KA 3UK9A 4PBOA 3O4DA 4XHBA 3BODA 3WMUA 3AH4A 4Y22B 4TLPA 5T54A 4AGRA 2HZ9A 3N36A 4YLZA 1SCSA 2ZMKA 4H55A 2ES3A 4ISRA 2A6WA 3OJ2A 1LHUA 4R9DA 4ATFA 4AGGA 1P63A 4QC4A 5F9TA 2FGFA 1VIWB 1WCSA 2ZHMA 2EXIA 4GALA 1SR4C 3FJKA 1SLIA 2HWMA 2R0FA 4LBQA 1W6OB 1Q03A 1BYHA 3O4OA 3OYWA 4AYUA 1QMJA 1AXZA 2FFUA 2P34A 3WCSA 3GALA 4OWLA 4DQAA 1V6WA 2R49A 1RY7A 1NZKA 4LO3A 1SBDA 2VXRA 1MS5A 3POSA 2MLLB 4D69A 5H9RA 4XJ8A 1YIFA 1JLXA 3CA5A 5F8YA 2P23A 2ARXA 2PHXA 2GNDA 1DYKA 5DZFA 2YXSA 1JW6A 3OY8A 4LBNA 4Y20A 5E24E 3O5SA 1YTOA 3USUB 4GWNA 4ISQA 4PQ9A 3SH5A 1S0CA 4UW3A 4LO1C 3GNEA 1HKDA 5L73A 1UZZA 4FOYA 1IOBA 1LGCA 1S0BA 5EYXA 1LHWA 1W0OA 2AXMA 5IK7A 3H6SE 4FVVA 3FBYA 1X50A 1UN1A 3NV2A 1FAYA 1V6NA 1RZOB 4YZ4A 3BRFA 1DQGA 1YI7A 3VT1A 2EALA 4YZ1A 3UDAA 3WUCA 3R4UA 1LESA 2D22A 5BXPA 3FLTA 1MS1A 2CNAA 3RS6A 3BX1C 3RRDA 2D6KA 1WW5A 3OGFA 2D44A 3Q7YA 1ENQA 3O0WA 2A3XA 2DRYA 3NBDA 1HWMB 4P6AA 1CONA 2XG3A 4IONA 1Q8QA 1WUVA 1JYIA 3HBWA 1IS3A 3SNMA 1C4RA 4Q1RA 3I8TA 3ZSJA 2D6OX 1HIBA 2E7TA 4YG0A 5DUVA 5GZCA 4QBVA 4XJWA 5H9QA 2DWRA 4OEGA 1HWNB 1DQ2A 4BPZA 4P0LA 4WVWA 2PELA 4M3CF 1OQLB 1FGAA 3ASIA 4FOQA 3BAQA 1Q1UA 2OUJA 4GXLA 1GNHA 5E8AA 3V65A 4JCKA 1IILA 3POYA 1W6NB 1YO8A 2ZGNA 5KXDA 2C9AA 1XHBA 3WG2A 4Y26A 4XYXA 5T52A 1YBIA 2R16A 2D6MA 1AXYA 3JUUA 5EC5A 3O49A 2Q9XA 3N7JA 4BM8A 3WDYA 3U4XA 1AJKA 4GAIA 4PBPA 3KM5A 5T5LA 3FLPA 4Q91A 1DLLA 1ITBA 1SLBA 4JPZA 1WW4A 1IJTA 1QF3A 2ZGKA 2GDFA 4OZXA 1KNMA 4XFSA 2FFVA 1GNZA 1FMMS 2UWCA 4I37A 4R9CA 5HCAA 4XMAA 3ZXLA 1LODA 4P14A 3O4BA 3M3QA 1I1EA 5BXSA 2AQZA 4UW5A 4ZKTB 5DUWA 2VSAA 1PZ9A 4LBMA 3N7LA 3D4KA 3NBCA 3AP6A 4Q9GA 1DIWA 5F8SA 2FHRA 1W6PA 2V5YA 4XIOA 3H6RB 5GZDA 3USUA 4IY9A 2BQPA 3WDTA 4ATEA 1FWVA 1G9CA 3IN9A 1MS4A 3AK0A 3SISA 4I4PA 2D3PA 4LBQD 3UJ4A 4GAFA 3POKA 5LK5A 3D6EA 3I29B 4J2YA 5CNAA 4GKXA 1ZM1A 1LOCA 1YYNA 4KEJA 4FOVA 4U2AA 4Q2FA 5FZZA 1JHNA 3C9ZA 2PHWA 1HKNA 3NV1A 2KKIA 3AJYA 3LSDA 4P9YA 1TWEA 2J3PA 3BAGA 3O4AA 3Q7XA 1S0EA 4G9NA 1V6LA 4YFWA 4I7IA 3AP5A 3ILRA 5EG6C 3AP7A 2VLCA 3A21A 3PHZA 3QR5A 2E4MC 1Q8VA 4ASMB 1YXWA 3Q7WA 1LEDA 3FUOA 1SR4A 5DG2A 5GLTA 4M3CE 3ZSKA 4XJAA 3AYCA 1JOJA 1IKPA 4ZBVB 4Z8SB 1CQ9A 2D3SA 3N3HA 1CESA 4UW6A 3VKLA 4YW1A 3ILAA 4I4OA 5I1BA 3WOGA 4D8HA 3A4UA 5D62A 3S8JA 1AJOA 3R05A 4W65A 3AZWA 1H9PA 4XILA 3VKNA 1W3AA 1ISXA 2NP0A 3N0KA 1GANA 1SCRA 4EB2B 1W0PA 5IUQA 1SLLA 2DV9A 1LTEA 4GWMA 5T55A 1BARA 5JDBA 1ISZA 3FLRA 4OEFA 3WCRA 2ESUA 4XMIA 2ZGRA 1OKQA 4YZ2A 3ZYPA 4KEIA 5E89A 1FNYA 2BEAA 1WLDA 4LO1A 1W6NA 3CA0A 1G9AA 4JC1A 3CAHA 4YG6A 5E88A 3O0XA 1G7YA 1WW7A 5JMCA 1LCLA 2NN8A 4UW4A 4YW2A 3QYDA 3A07A 1Q56A 4FPYA 2ZQNA 3W9TA 4L4HA 4AVVA 2D20A 1LOBA 5BOWA 1N47A 2ZGUA 3IIRA 3CRHA 1GICA 3AYDA 4ZOTA 2W39A 4H9WA 1MS8A 4XXAA 3CU1B 1VAMA 4I0YA 3ZSMA 2D24A 3AZVA 1KJLA 4YW5A 3IM7A 1QDCA 4RL7A 4LO8B 1W3FA 2DVDA 5F90A 1CVSA 4Y1UA 4XJUA 1HQWA 4I2SA 3BAVA 2R1DA 2A6XA 1BQPA 1ULCA 3LTQA 2E6VA 3VUOA 3FJ8A 4A7ZA 3AZYA 1PWAA 3ENRA 1ZA4A 1QGLA 3BTAA 2JECA 2KH2A 3SNVA 3APBA 4BLIA 4LO2C 4J23B 2NMOA 3HN1A 1LJ7A 2X2SA 1JT4A 3AP9A 5GZEA 2F2FC 3L2YA 3HALA 1D2SA 1MR5A 2GMEA 2C5DA 3TAYA 3B69A 1WLWA 7I1BA 4OWKA 1BFGA 1QOSA 4ZA3B 4ZFUB 1KJRA 2VUAA 2WSUA 3VEQA 3CA1A 1VALA 3N7KA 3ZXDA 1JLYA 4FPJA 2NYYA 5T5JA 4U36A 2JDZA 4R6UB 4GP3A 1BLDA 4IZEA 3A0NA 1TWMA 2D23A 3D7WB 4R9BA 3WLUA 2ZAAA 4R9AA 3AKFA 3WG1A 3AYEA 1L2HA 4NO4A 2A6ZA 2ZGLA 3I2AA 3R4SA 4IHZA 4M01A 2DUQA 5GM0A 3AJ5A 5G00A 2Z49A 3O3QA 2GN3A 2EF6A 4BLJA 1E0OA 4YM0A 1CPNA 1A78A 3AX4A 5T50A 3PVEA 1PUUB 2ZHNA 3T1MA 3RTIB 4YW4A 2YZ4A 1W6QB 4IQPA 2GMPA 5HCFA 2RG9B 4FPOB 2V73A 1JT3A 1HLCA 2A70A 3BOPA 1ABRB 2GNBA 2Y9FA 1KRIA 4XFUA 4EFRA 1FWUA 3ZXFA 2KLLA 2AAIB 2ZABA 1GLHA 3S8KA 2DVGA 1GYKA 1W6PB 2DRZA 3FJEA 4L8QA 2E4MA 1DBNA 4KEKA 4MYEA 4ZFYB 4XJZA 1J0SA 3FJIA 2UU8A 3VSZA 2R0HA 4I96A 3VKMA 1GZCA 5CBLA 2CTVA 2MC2A 4XBLA 3F62B 1H30A 1DYPA 3OJMA 2A7AA 3WDWA 1CJPA 1W6MA 1UMZA 3H0OA 1FV2A 1TP0A 5DZEA 3JRRA 3V79C 1XG6A 3NV3A 2A75A 1SLTA 4Q26A 1KQRA 2ZZJA 1JYCA 1PZZA 4AVSA 1EYLA 1NUNA 4XTMA 1T9FA 3JUTA 2AREA 3ZX7A 2B7YA 3D5OA 3T2TA 4YGEA 4FP2A 2CWMA 3ZSLA 4YGDA 5DZGA 2VU9A 4XXPA 4XTPA 5GLZA 1TTUA 3ZXKA 1G8WA 1ILR1 1GZWB 3IPVB 1QQLA 2K4AB 1JTCA 5H9SA 1HWPB 1MVEA 4F34A 3QLQA 4I4RA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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