3R4UA

Cell entry of botulinum neurotoxin type c is dependent upon interaction with two ganglioside molecules
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
428
structure length
422
Chain Sequence
SMANINDSKILSLQNRKNTLVDTSGYNAEVSEEGDVQLNPIFPFDFKLGSSGEDRGKVIVTQNENIVYNSMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNEDSEQSINFSYDISNNAPGYNKWFFVTVTNNMMGNMKIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFEINKIPDTSDNINMWIRDFYIFAKELDGKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYNKEYYMVNIDYLNRYMYANSRQIVFNTRRNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGGDILYFDMTINNKAYNLFMKNETMYADNHSTEDIYAIGLREQTKDINDNIIFQIQPMNNTYYYASQIFKSNFNGENISGICSIGTYRFRLGGDWYRHNYLVPTVKQGNYASLLESTSTHWGFVPVSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title The biological activity of botulinum neurotoxin type C is dependent upon novel types of ganglioside binding sites.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type C1
molecule tags Hydrolase
source organism Clostridium botulinum
total genus 99
structure length 422
sequence length 428
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3r4uA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3r4uA02
1DYPA 4TLPA 3BRDA 1CJPA 2DVAA 4H04A 4ATFA 2ERFA 3H6QA 4X38A 4R9CA 1HWNB 2DU1A 3ZXJA 1TWMA 1Q04A 2W68A 5EHAA 1CPNA 1KDKA 2UWBA 4Q8LA 2WKKA 2GDFA 5EYXA 2YROA 1SBFA 4XKIA 4FPJA 3IM5A 1GZ9A 5FZYA 3ZXLA 1BFGA 4J2YA 3SISA 1MACA 3APBA 3A07A 3FJ9A 2EF6A 2UWAA 2A5ZA 3SH5A 4FPCA 4M3CF 1AJKA 2ZACA 3USUA 4FPHA 4UW3A 4XXPA 4Q1RA 3AKHA 4ZFUB 3FLPA 3O4OA 1DQOA 4OEFA 3GALA 2ZABA 3HALA 3NWKA 3D6EA 1IS6A 4JRAA 2CYFA 1H9WA 3RMYA 1N47A 3HBWA 4OEEA 4LBMA 4K21A 4JCKA 2EXKA 3AYEA 5HCFA 4FPGA 1ZM1A 3JRRA 5H9QA 1S0FA 4C1XA 3CA6A 3Q7WA 2WT1A 3V0AB 3BA4A 3UD7A 3O44A 3HN1A 1MS4A 4CJMA 2WT2A 4M01A 2F8XC 5D62A 3O4DA 4GOYA 4XOGA 3R05A 1IS4A 3MPPG 5IK8A 2D6KA 2D3PA 3WCSA 4U36A 4BQ1A 4M3CE 4Z8BA 1GYKA 2VW0A 3NBCA 1JT3A 1O4ZA 3BX1C 3RMXA 3RSJA 4KBBA 1DJSB 2IWTB 2GNTA 4ZGRB 1RINA 3V64A 3UD8A 1W6OA 1AX0A 1UL9A 1CVNA 1DZCA 1JQZA 4IHZA 4PQ9A 3C9ZA 5GAQA 3OBRA 2DVFA 1NUNA 2MLLB 1Z78A 2RG9B 3WA1A 1A3KA 5EXOA 3AH4A 4Q27A 1W6PA 5DG1A 3IAGC 1JT7A 4D0ZA 2EAKA 2LTNA 3FJDA 4Q8KA 3FUOA 4EB2B 3WV6A 4LO2C 3ZXEA 3V0BA 3VEQA 5GZDA 4OUJA 4XHBA 1UN1A 3ZX7A 3A0NA 3VKNA 2CWSA 4I96A 2GNDA 1KRIA 1QQKA 4LBLA 1W0OA 2P37A 2LALA 3VKOA 2E4MA 2RSTA 3AKIA 4OWJA 3WMVA 3OJ2A 4CZSA 4YG3A 1IKQA 1WBFA 4FQ4A 2YZ4A 5GZGA 2VSEA 1QGLA 1L2HA 5KXCA 1JHNA 5T55A 4I4VA 1TIEA 3AYDA 2Y9FA 4EFRA 4Y1UA 2A6YA 1GNHA 3MW3A 1ENRA 3ZXDA 5JVVA 4YG0A 2ARBA 4G1RA 3V65A 3FJHA 3Q7YA 3AJ6A 3PMEA 4Q26A 2P2KA 1BQPA 3SH3A 3HMYA 1YO8A 3WO4A 1UPSA 3CA4A 3WMUA 3Q7XA 2AAIB 5CB7A 4EFPA 1JT5A 2WNEA 5DG2A 2DV9A 1EV2A 1VCLA 3KMVA 1PZ7A 5BOWA 1RMLA 1ENSA 1DLLA 2CL2A 4I3NA 3BODA 2VUAA 2C5DA 2VLCA 3H6SE 1II4A 3LSEA 2D7FA 3ZSKA 1DGLA 4YGCA 2AR6A 2LIQA 2UURA 4FPEA 1AXMA 3WINC 5F9TA 2DU0A 3IM6A 1HKDA 2ZGUA 3QLQA 1JXNA 4XJWA 4LBQA 41BIA 1ULEA 4LBJA 1QXMA 1WBCA 4FPKA 3NV4A 5BQUA 1LHVA 31BIA 1FGAA 5BP5C 1LOGA 5T52A 2OUHA 3I2XA 1VAMA 5T5OA 3TC2A 3V79C 3AZVA 3A0KA 2FDBM 1V6IA 2C9AA 3WUCA 4QBCA 3VT2A 4XJZA 2YY1A 1HCEA 4GP0A 1KNMA 2NTDA 4GWNA 4PBOA 5FNXA 2EXHA 3OY8B 1SLCA 1XZZA 2Y9XE 3PVOA 5DUWA 1NZKA 1MVQA 3GNEA 1SZ6B 3M3EA 1DQ2A 3K1XA 3AP4A 4P0LA 1BLAA 1NLSA 1LOBA 1ULFA 1PZ9A 4J2SA 4BPZA 2DVGA 3WHUA 2D24A 2KH2A 2ZMKA 1FQ9A 1H9PA 4USOA 3C2UA 3T1MA 1HQLA 1V6VA 4NO4A 5BXTA 4GXLA 4ZKTB 2H0BA 1A78A 5CA6A 3ZXKA 3AFKA 1GZWB 2SBAA 3KQRA 4Q2FA 2UU8A 4YW4A 1LOCA 2F2FC 4FOVA 2ZGRA 4XMIA 1M16A 1HWOB 5H9RA 4KEJA 2ZHNA 4YZ5A 1KJLA 2GALA 1QKQA 1CE7B 4YM2A 1G7YA 1GLHA 1MVEA 4WV8A 3POSA 4GA9A 2Q3NB 4FPOB 2J3PA 4I4OA 3ILNA 3H6RA 1LEMA 4XE9A 3RTJB 1SLIA 3LSDA 4I4UA 4LBOA 5D61A 2PHFA 1N3PA 5DZFA 3SLIA 1C1LA 1FWUA 4Y1VA 4AGRA 5F8YA 1QF3A 4PF5A 4ZLBB 2V73A 3WDVA 1JN2P 1SLLA 2HWMA 3POKA 3PVNA 4XHXA 4II0A 4BLJA 2HWAA 3JUTA 3DGTA 1G9FA 3E8LC 2P3KA 1ABRB 3OYWB 3ZC9A 2PHRA 1SR4C 4HANA 3SH4A 2ZBJA 2FO1A 4XFSA 3T1LA 2PHXA 2DVDA 1AX1A 1BA7A 2WBCA 4GP3A 2GN3A 1CN1A 1BKZA 1VAVA 1FMMS 4Y22A 2MC2A 2PELA 3A21A 2AGSA 4K20A 1SBDA 3TAYA 1N1YA 1XHBA 5FZZA 4BMEA 4I6IA 4AN6A 1S0LA 3NV1A 2YUGA 2WSUA 3SITA 2EIGA 4QKSA 4R9AA 3ATGA 2DURA 2GO2A 1HCDA 1G8WA 3H0OA 4XYXA 1LCLA 2P23A 2D6OX 1I1EA 1BZWA 4IZXA 1T4QA 4YLZA 2ZQNA 5F90A 1WLWA 4P14A 4JAWA 1N1SA 3B00A 2D6PA 1IRPA 4XJ8A 1DBNA 4C1WA 3CA0A 3FBYA 2UWCA 1FN0A 1R1ZA 3O3QA 3B69A 2D6LX 5KXDA 3OJVA 2ZGLA 1B09A 3AYCA 4HJJA 1D2SA 4NOTA 2A3XA 3VKMA 5DUXA 2P34A 4M00A 4LO3A 1ISZA 4J2KA 4R9BA 4WVWA 4JKXB 4FGFA 4MYEA 3AZWA 3M3CA 4XTPA 2PHTA 4YZ4A 2ERMA 3MW2A 2HW9A 1DFCA 2A3WA 1BJQA 2E51A 2E7TA 3FUQA 3IMNA 3O4CA 4I4XA 1K5VA 2SLIA 1IT0A 4U2AA 2XG3A 3D7WB 5IK4A 1F5FA 3PVEA 2CWMA 2BQPA 1AVAC 3W9TA 1GANA 3FJFA 3JU9A 7I1BA 4YG6A 1R8NA 1X50A 4JQ0A 2E4MC 2TEPA 2D22A 3ZC8A 1LESA 4YFWA 1W6MA 3CRIA 2GMEA 3HOMA 1S0EA 4LBQD 2FGFA 1T9FA 2A6VA 1LU1A 5BVPI 3AJYA 4PCRA 1XYFA 2G4IA 1IJTA 2ZGTA 1IKPA 1LODA 2I1BA 2GNBA 1CIWA 4DQAA 1U0AA 3O0WA 2DUQA 3ZXGA 3AX4A 3F1RA 3N36A 1OQLB 3IPVB 3BAOA 4QO3A 4ZBVB 1JLXA 4QKRA 4P9WA 1SACA 3ZVXA 4YOLA 1G9BA 3ZPYA 2ZAAA 3WDUA 1CR7A 2I2SA 2D7RA 3FJCA 3B9CA 2DVBA 2FFUA 3S8JA 3AKGA 1SLTA 2JKBA 5CNAA 1MZ5A 1WBLA 4X37A 4DPNA 3BADA 3SNVA 2ENRA 4LBNA 1EYLA 4AWDA 4XXAA 2ZGMA 3IM0A 1V6UA 4YZ3A 1DQGA 1Q8PA 3WDXA 5EC5A 1MZ6A 1W6QB 2FFVA 2OW4A 4D0TA 3WO2A 1WUVA 2M49A 1RY7A 5BQUC 2YXSA 1AVBA 4M3CB 1G9DA 1W0PA 2A6XA 2NP0A 3FLRA 3WO3A 4J2XA 2W08A 2ZGNA 4QD2C 3EF2A 1FYUA 2A7AA 4FQZA 1G82A 5DUYA 5CAZA 4GALA 3UDAA 4WVVA 3AZXA 4YW2A 1AZDA 3UJ0A 3M1HA 1JBCA 3CU1B 2D3RA 5GZFA 1AVUA 4ZFYB 4GOVA 5DZEA 3T2TA 4WZFA 2Y9WC 4XJ9A 2VH9A 4L4IA 2JD4A 5DUVA 1LTEA 2OVUA 3ZSMA 1Q8OA 3OGFA 3ZSLA 1LJ7A 1W6NA 4LO1A 5I1BA 4XBQA 1Q1UA 4XFUA 4Q9PA 4EEEB 3NBDA 1IRAX 4LO7C 1VIWB 1BYHA 2D44A 4QC4A 1MS9A 5BXRA 2W52A 1ISVA 1ZA4A 3BA7A 4LO0A 5T50A 3FJIA 3N3HA 2W39A 1IS3A 1G9CA 3UL2A 3RG0A 1LGNA 1V6KA 1UZZA 2CNAA 1MS5A 2BEBA 3P6JA 3AH2A 4W65A 1UX6A 5DUUA 1CVSA 3BB2A 2ET2A 2A6WA 1WCSA 3CAHA 2KM2A 3POYA 3ENRA 1G86A 2E6VA 2NM1A 1I3HA 4Z8SB 1S0CA 4F34A 4P0JA 1C57A 3FJBA 4YZ2A 5KXEA 5JOYA 4Y1XA 4GAIA 4ISQA 2LIEA 1GZCA 1YXWA 1D0HA 3AJZA 1DYKA 4GWMA 1WW5A 3AK0A 2WLQA 2A70A 2ARXA 5DSSB 3NJ5A 3D4KA 1AXYA 2DYCA 3O12A 1M2TB 2KKIA 3USUB 4IY9A 1WW4A 1TTUA 3CQAA 1RITA 3HR9A 2KI6B 2VW1A 1QU0A 4AGGA 2XB6C 3RS6A 2VW2A 4A7KA 4K1YA 3VUOA 5JOWA 4ASMB 4OWLA 3MEPA 4YW1A 5FZUA 3U4XA 2DRYA 1RG8A 4CRQA 3FFZA 3FJEA 4RA0A 2AYHA 3M3OA 1JYCA 4D8HA 3WLUA 3AXDA 1BXHA 1PUUB 4YW5A 4LBKA 4L4HA 4Y20B 3BRFA 5JOXA 2RQ9A 1SLAA 1QOSA 1JLYA 1HQWA 5HPZA 1IS5A 1Y7BA 1WLDA 4I30A 3V0AA 3I8TA 5HCBA 1R8OA 2Z42A 3UK9A 2V5YA 1F31A 2VXTI 1FV2A 1HIBA 4HR6C 2A6ZA 2R1DA 2EALA 5T5LA 1E0OA 5FRAA 2Y9GA 4I37A 3QYDA 1WD4A 4YW3A 3RQ0A 1PC8B 4Q1PA 3O5SA 1P63A 1DHKB 2KLLA 1TEIA 1Q03A 1N1TA 1GBGA 3LCPA 2JE7A 1FATA 1GNZA 1DQ4A 5E24E 2IHOA 2KI4A 1ISYA 1LULA 5GLTA 1N3OA 4X39A 3A4UA 1RZOB 1JYIA 1J0SA 3R4UA 1QMJA 3V0BB 1V6XA 3WDWA 1MD6A 4XBNA 2ZHLA 3VT0A 1QNWA 4AVTA 3SNMA 3Q9OA 2WJSA 1PZ8A 3BAGA 1YF8B 2ZMNA 4P6AA 2DTWA 1AVWB 3NBEA 4UW4A 1S0BA 4DS0A 1S0GA 1YRZA 4HL0A 1ILR1 4ENDA 1C1FA 1DFQA 1VALA 4WBCA 5E89A 2BFHA 1WW7A 1GGPB 2L5XA 1MS1A 2VSAA 4R6UB 3NBNA 3B01A 2UUSA 3FGMA 2ZGQA 3M3QA 3WHTA 1PUMB 3QR5A 3S8KA 3WG2A 3I29B 3JUUA 4CTEA 2B7YA 2ES3A 1ISWA 4F83A 1SLBA 2R16A 2D6MA 4YM1A 4XZPA 4P0KA 3IM7A 2A75A 3F62B 3AXEA 1EPWA 3WVJA 1QDCA 3AKFA 2AUYA 4KC3A 1V6LA 3VSFA 1K5UA 6I1BA 2NMNA 4Q91A 8I1BA 5HCAA 1IOAA 4LBQB 1CQ9A 1Z2VA 1HLCA 5LK5A 2ZGPA 4TYSA 3I2AA 4G6MA 2DUOA 3AP9A 3CA3A 2AH2A 1CESA 1YTOA 3O4BA 2ZQOA 3VKLA 2NMOA 2JDZA 1APNA 2DS0A 2R49A 2D6NA 5E8AA 3WDYA 2AFGA 4EKXB 4XIOA 4IQPA 5AVAA 4XTMA 1W3FA 3VSZA 3N7JA 1DIWA 5F8SA 1QOOA 2ZZJA 1ISXA 3MALA 2QN4A 3CRHA 1SR4A 1MR5A 1DQ6A 2PHUA 1UAIA 1I1BA 3LTQA 4YGBA 4DRRA 2GMMA 1LOFA 3BAQA 4KEIA 3OY8A 3TB0A 4YZ1A 4YFZA 5GZCA 1TWEA 2NVHA 4I4RA 2NN8A 2JE9A 4P9XA 4AVVA 3CNAA 4LO7B 5GZEA 3ILRA 4QALA 5GLVA 1HDKA 2K4AB 3ZSJA 3OGGA 1PWAA 1Q8QA 2NZ9A 5T54A 3BIWE 3FJJA 3W59A 1FNYA 5IT6A 5IUQA 4G6JA 5GJ6A 21BIA 4AYUA 1JTCA 4FVVA 4XILA 5F8WA 1IOBA 3AP5A 1DZQA 3OBTA 4LO1C 2D43A 1SBEA 1GZWA 4Z9WB 1DZDA 4Y20A 4OEGA 3IKWA 3O5WB 4I7IA 1HKNA 3O4AA 3KM5A 4LO0C 4XIKA 3ILAA 1FMZA 1PZZA 2ZKNA 4FOQA 2HZ9A 3LLPA 2QYIB 1H30A 4ZFWB 2Q5TA 3H6RB 1GSLA 3ZXFA 3OJBA 4YM3A 1LHNA 5DVHA 4Y1YA 4ZXKA 1YBIA 1URXA 2DWRA 1QDOA 3BTAA 5F5QA 1KDMA 1MS8A 2AXMA 1S0JA 1YYNA 3HSMA 2ESUA 1BFFA 1SCSA 2Z49A 4YM0A 1ULGA 3O0VA 3WZ1A 4DCKC 2ZHMA 4G9MA 3CRGA 4OWKA 4I4QA 1LGBA 4J23B 1WD3A 4BOWA 4QBVA 3N7MA 4XBLA 3NV2A 3DUIA 2D1ZA 1A8DA 4GAFA 1Q56A 1UKGA 2MIBA 1HWMB 3OYWA 3PUBA 2NYYA 4I0YA 4UW6A 4Y22B 2WT0A 1W3GA 4FPYA 5JDBA 2BEAA 3O49A 3BRGC 4BLIA 5D63A 1IHKA 4JKQA 1Q8SA 2PHWA 4EFQA 5B2HA 5H9SA 1AXKA 4XDQA 4Q9GA 3BOPA 3WOGA 1ULCA 4IYBA 4IZEA 2JECA 3N0KA 1AXZA 2JJ6A 4PC4A 1V6OA 2P39A 2AREA 3AJ5A 4AVSA 4GKXA 4I4SA 3UD9A 4FP3A 1FX5A 2WSVA 2HYKA 4FOWA 3WG3A 1BARA 5JLVA 4AN7B 1FV3A 3A22A 2XOAA 3M2MA 1TOOA 3BAHA 4AGVA 4ATEA 1W3AA 3O0XA 4L8QA 1V6WA 1ULDA 2D20A 1YIFA 2R1BA 1S0DA 1C4RA 1LOEA 2CTVA 2K43A 4DFSA 1XG6A 2GMPA 5JMCA 4LO2A 1CONA 5GM0A 3P6IA 4XFTA 2ZGKA 1N4KA 1WBAA 4ZOTA 4DRVA 1AVXB 4UW5A 3RRDA 1S0IA 1FAYA 1AFCA 3PG0A 2YV8A 2GN7A 3PJQA 4JC1A 3WCRA 3CA1A 1LEDA 2YMZA 3AH1A 3FLTA 3W58A 1UMZA 2WQZC 4FP2A 5SV8A 4D69A 3IIRA 1F9KA 3INAA 3WNXA 3A23A 2ZA9A 1CPMA 4X3AA 4XJUA 3VT1A 5FREA 1V00A 4YGDA 5BYNA 2DRZA 1W6MB 1IILA 1GV9A 1WW6A 4DEPA 2GNMA 3OPZA 4ZA3B 1QOTA 1BFBA 2DTYA 4ITCA 2ZGOA 2K8RA 4I4PA 2A3YA 1MC9A 2ZGSA 1EVTA 2X2TA 1GICA 3AZYA 5GLWA 1LHWA 3AYAA 1AF9A 3N7LA 3UJOA 4FPFA 1LHOA 1XQNA 3AP7A 4Y24A 2ZMLA 4OW4A 1HWPB 3ILFA 3UJQA 2D3SA 3B3QE 4HA2A 2ZR1B 1V6JA 1YI7A 3WDTA 4YGEA 2VXRA 5H9PA 4DENA 2DUPA 2WRYA 3IPVA 5EYYA 1SCRA 2A71A 3IN9A 3WINA 1W6OB 3ASIA 1V6NA 1FWVA 1ONAA 2P3JA 5GLZA 3B9UA 9ILBA 5JOZA 3AZZA 1ONKB 5BXSA 1DQ0A 4LO8B 1TFMB 4XMAA 2R0HA 1TP0A 2DREA 2D7IA 3FJAA 1W6PB 1UZYA 1KQRA 4Y26A 4I1EA 1JT4A 4K1ZA 4OZXA 3OJMA 1MS3A 4A7YA 4LO3C 5BP5A 4G9NA 1ENQA 4KEKA 1FNZA 1AJOA 2VY0A 1SFYA 1BFCA 1MS0A 2ZHKA 5FNWA 4BMBA 5T5PA 1S1AA 4I8MA 3BAUA 1W6QA 3FJKA 3T8SA 1G9AA 1NXD1 3UJ4A 1LECA 2R9KB 1O4YA 3POWA 4SLIA 5L73A 2AQZA 1DQ5A 5DZGA 4PBPA 4R9DA 1GKBA 5EWSA 4M3CA 3WUDA 5IK7A 2RHPA 5GALA 4FPLA 4JPZA 2D23A 2E53A 4Y1ZA 2FMDA 5DZUA 1QNYA 3AP6A 4I1BA 5G00A 4BM8A 1OFSA 1DQ1A 1RIRA 2CY6A 4RL7A 1LOAA 2EXJA 1LOFC 1JUIA 1QQLA 2EXIA 3ZYPA 3VKFC 1JW6A 1Z0HA 4IY8A 1LHUA 3R4SA 1W6NB 2OUJA 4GKYA 4TZDA 2VU9A 1KJRA 1JOJA 5DXDA 2P3IA 4FOYA 3BAVA 5KXBA 4XJAA 4IONA 1Q8VA 3VV1A 3D5OA 3QCWA 2Z48A 2F2FA 5IK5A 3ZYRA 3VWCA 2R0FA 1WLCA 5T5JA 4JP0A 2Q9XA 4A7ZA 4ISRA 3NV3A 5CBLA 1JY0A 1OQ1A 4P9YA 2FHRA 3N35A 5BXPA 4H55A 1LENA 5GLUA 1LU2A 1VLNA 1J1TA 4I4YA 3WG4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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