2NP0 | Genus

Total Genus 418

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	418
sequence length	1290
structure length	1289
Chain Sequence	PVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVPLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKDMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVKPGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIEYNTQSNYIENDFPINELILDTDLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVNDFVIEANKSNTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRNEKWSDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYRYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINGCSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVNKYLKTIMPFDLSIYTNDTILIEMFNKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Hydrolase
source organism	Mus musculus
publication title	Structural basis of cell surface receptor recognition by botulinum neurotoxin B. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Botulinum neurotoxin type B
total genus	418
structure length	1289
sequence length	1290
ec nomenclature	ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date	2006-10-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01742	Peptidase_M27	Clostridial neurotoxin zinc protease
A	PF07951	Toxin_R_bind_C	Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A	PF07952	Toxin_trans	Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A	PF07953	Toxin_R_bind_N	Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1120.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain	Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain	2np0A02
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	2np0A03
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	2np0A04
3.90.1240.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Zincin-like	Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like	2np0A01

2QN4A 4G9NA 1UX6A 1QQLA 4R9AA 3IM5A 2ZGLA 1UKGA 1A3KA 5EWSA 4G6JA 1QQKA 4XBLA 1V6UA 1DBNA 3VKFC 3OGGA 5T5LA 5IK7A 1G8WA 4TZDA 1B09A 1LGBA 1IS5A 2ZGSA 1BFBA 7I1BA 5KXDA 4OEFA 4GWMA 3O12A 4FOWA 3CU1B 4I4SA 5E89A 3W9TA 3WDXA 1TIEA 3V0BB 1Q8SA 3T8SA 1DIWA 4FQZA 5HCBA 2VXTI 1JY0A 1ISWA 5BXRA 3ZSKA 3S8JA 5B2HA 1ILR1 1DZDA 1MVEA 1JUIA 4IONA 3ZXDA 3V0AB 2ZKNA 5H9PA 2W2DB 4A7ZA 3AH4A 3CA6A 2DU1A 1CPNA 1L2HA 3OGFA 1KQRA 1W6OA 1MD6A 1I3HA 3Q9OA 4M01A 1D0HA 5DUWA 2DREA 3WDVA 2LIEA 1ONKB 4IQPA 1ISVA 1W6MA 1WW4A 4GKYA 3FLRA 3APBA 2Y9FA 1ZKXA 3N36A 1UL9A 2WSUA 1MS1A 1YXWA 1DQGA 1LU2A 3AZWA 1S0CA 3A22A 2WT1A 4EFPA 1N1VA 5DZEA 4FP2A 4A7KA 1FAYA 3AP7A 1HCDA 1QOTA 2HYKA 4YW5A 3BA5A 2JD4A 1AVWB 4OUJA 2Z48A 1YYNA 3DGTA 1FN0A 1LOCA 2D7FA 1WBFA 3HR9A 3BOPA 5BQMB 3P6IA 3LSDA 3N3HA 4FPJA 4LBQA 5IUQA 1LEDA 5DVHA 2G7QA 1CQ9A 1XHBA 3LSEA 4M3CF 2PHXA 1GZ9A 3AXDA 2K43A 4G1RA 3WHTA 2OUJA 4R9BA 1T3AA 4XDQA 3N7MA 1EYLA 4OEEA 4JKXB 5GLUA 4LBKA 1AVAC 4ZFYB 4JPZA 4FPYA 2D6MA 4USPA 1GGPB 1YF8B 3VT1A 4DRRA 4YGDA 2DS0A 3CAHA 5GLZA 4LBMA 1BFCA 3R4SA 2EXHA 1S0IA 1W6NA 1PZ7A 1JQZA 5CB7A 2ZGUA 3AJ5A 3O4DA 1CESA 4C1XA 4GWNA 1MR5A 3FJKA 3UL2A 2QN0A 3FJJA 3POWA 4PCRA 3POYA 5H9SA 4YW2A 2ENRA 5F8YA 2A8AA 1UMZA 3A07A 4KUFA 2KLLA 4QO3A 1XTFA 1FNYA 4LO0A 4YG6A 3BOOA 2DU0A 1FYUA 3W58A 3WDUA 3SLIA 3ZPYA 1Q04A 2WSVA 1W6QA 1LHNA 2X2SA 1GV9A 1DZCA 4ZBVB 5FNWA 1G9DA 2CWMA 1LOFA 5KXCA 2CL2A 1HDKA 4AWDA 2EALA 3BAOA 3H6RA 2VW2A 4IY9A 3ZSJA 4DEPA 1JYIA 4ZFWB 1IRPA 3UDAA 3SH5A 1EVTA 4YM1A 3C89A 4XJAA 4ZJXA 1HWOB 2YROA 2P23A 3HSMA 5H9RA 3Q7WA 3N7LA 2MIBA 2OW4A 3ILFA 1T9FA 3FJ8A 1DQ1A 2A7AA 2ZQNA 2ZQOA 5T5OA 4LO0C 3PMEA 1DYKA 3BAQA 2E7QA 1ISZA 2VU9A 1QNWA 1JLYA 3WO4A 1N1YA 2UUSA 1H30A 1W3FA 2E7TA 5D62A 2IWTB 3QIYA 3CRHA 5I1BA 3OY8A 3WDYA 3WHUA 1UAIA 1ULDA 3BA4A 4F83A 2R9KB 4QKRA 3SH3A 1CN1A 2XHLA 2AYHA 5FRAA 1LOFC 4LO1A 4QD2C 4ELCA 3IN9A 4OEGA 2NMNA 1JT3A 1DQ0A 4XIOA 3C8AA 3CQAA 4H55A 4FQ4A 5JOYA 3IM7A 3ZXJA 1V6VA 3VKOA 4ZGRB 3UJ0A 1TP0A 1NZKA 3U4XA 1ZM1A 1NUNA 5JLVA 3M3OA 2A6ZA 4GA9A 3CNAA 2EXJA 3IAGC 5F8SA 2WKKA 4JKQA 3FJAA 1IILA 5FZUA 2MC2A 4EJ5A 4LO7C 5F9TA 2Q5TA 2GNDA 2GN7A 3QIZA 2ESUA 2VH9A 1Q8OA 1ULCA 5DUUA 4CRQA 4LO1C 4FP3A 4GKXA 3JUTA 3B9CA 3BA7A 4P0KA 1GSLA 1N3OA 2D3SA 3FIIA 4P0LA 3ZYPA 1TEIA 4YGEA 1FX5A 2DUPA 3GALA 3CA4A 1QU0A 3TAYA 1A8DA 1Q1UA 1JTCA 3NV4A 1N4KA 1QMJA 2WRYA 2G7NA 5G00A 2P2KA 5FREA 1H9WA 1BLDA 1WCSA 4BMBA 4LO8B 1Z7HA 1C1LA 2ZAAA 4I4OA 4EKXB 4NO4A 1R8NA 1C1FA 1LODA 5GZDA 1LU1A 3AJ6A 2GDFA 3AFKA 6I1BA 4XZPA 1BZWA 3B01A 4PQ9A 3AYCA 4QBCA 3RSJA 2RSTA 5E24E 1W3AA 3OJBA 4FGFA 3SISA 2FFVA 1K5UA 3HBWA 2ZGPA 1HLCA 1LCLA 4CZSA 3WCSA 2ZMNA 2DUOA 5SV8A 3NBEA 1ONAA 1GZWB 5GZEA 3RMXA 1LOAA 2R1DA 4LBLA 4P9YA 1C4RA 3AX4A 3R05A 2NP0A 3V0BA 4BQ1A 1E1HA 1DQOA 2LTNA 2HW9A 4Y1VA 2NMOA 3AKIA 3V65A 4YGBA 2UWBA 2AGSA 2D3PA 1LOGA 5T5JA 4K1YA 3V0AA 1U0AA 2AAIB 5BXSA 1QXMA 1K5VA 2W2DA 2UU8A 5F8WA 2PHUA 3ILRA 2AREA 2DYCA 3AP5A 5EYYA 4DFSA 1G9AA 3AZVA 5T5PA 2KKIA 1WW7A 3D3XA 2EXKA 1DHKB 3I2XA 1V6KA 2ZGRA 3WG4A 5JDBA 1LECA 4XKIA 3PVEA 3BB2A 2AQZA 5GAQA 1SACA 3QR5A 2ZGQA 4J2YA 2H0BA 5T55A 3A23A 1G9CA 1MACA 1Q56A 3O4OA 3I2AA 5BQMA 4WVVA 4PC4A 1FWVA 2Q3NB 3WNXA 3INAA 2IMAA 2VLCA 4P9WA 3HOMA 1AVBA 1SLAA 4RA0A 4YM0A 3FJBA 1JLXA 1MS0A 3OBRA 4ISRA 2IMBA 3RTIB 1DJSB 2ZA9A 2ZZJA 2K8RA 1OFSA 1VALA 1DLLA 1KJLA 1ENQA 3ZC8A 5DUVA 1TOOA 4ZKTB 3O4CA 1R1ZA 2P3KA 4NOTA 2VSEA 1AVUA 4QC4A 3BAUA 3QW5A 1LGCA 1S0GA 3UJQA 3FLTA 2D23A 3MW2A 4LO3A 5HCAA 1NLSA 3TC2A 2GMPA 3ZXGA 1AFCA 4XFSA 3A0NA 1PUUB 4YG3A 3ZC9A 2KM2A 2ZHMA 1RITA 4I4YA 4M00A 1W3GA 5KXEA 4I4VA 4R9CA 1FQ9A 1AXZA 2D7IA 1HWPB 1DYPA 1V6IA 1BFGA 4Y20A 4LO2A 1GICA 3B00A 3V64A 3AZZA 1LOBA 21BIA 4H04A 3IPVB 4AGGA 2JKBA 2F2FC 2JJ6A 2YMZA 3MW4A 3O5WB 1LESA 3FBYA 3POKA 2R16A 2FFUA 4IZEA 3QW8A 4UW6A 3USUB 1JT5A 1S0FA 3IM0A 2GN3A 2HWAA 4Y26A 1FV2A 5GJ6A 3MPPG 3N0KA 3Q7XA 3K3QB 1V6XA 1FWUA 1SCRA 5D61A 2AUYA 2GALA 1X50A 4LO3C 3AKHA 2BQPA 4XJ9A 4I8MA 2W08A 3VV1A 4I0YA 3O0XA 2R0FA 2WQZC 2SBAA 1HQLA 2A75A 4JQ0A 1SLLA 5CA6A 1P63A 5JMCA 1HCEA 3D6EA 2WJSA 4J2KA 3PVNA 1ITBA 4FPFA 4Q9GA 3AYDA 4LO2C 3QW6A 1LGNA 2FMDA 1QOSA 4G6MA 4FPLA 1W6PB 2ZGTA 1F31A 3ATGA 5IK8A 3KMVA 4XJWA 4HL0A 3AH1A 1ISXA 5FZZA 3E8LC 3DDAA 1SLBA 2EXIA 1MZ6A 3DEBA 1CJPA 4WVWA 4Y22B 1IKQA 1S0DA 2IHOA 1A78A 4Y24A 4XHBA 4Z9WB 2D6NA 2GNTA 1WW6A 3BRDA 1T4QA 2YUGA 4HJJA 1V6LA 2DUQA 3ZVXA 1FV3A 4SLIA 4GP3A 3AH2A 1Q03A 3AZYA 4X39A 2MLLB 3SH4A 3B3QE 1TWMA 1LJ7A 4YM2A 2EIGA 4F34A 4DRVA 3VKNA 2EF6A 1IHKA 3B9UA 1V6MA 4X3AA 4I7IA 4XMIA 2K4AB 1RIRA 1XTGA 1TTUA 4YM3A 3AZXA 3C88A 1WD4A 4XE9A 1W0PA 4AGVA 1WLDA 3QLQA 4XIKA 3NJ5A 4YFWA 4YLZA 4X38A 4KC3A 4OWKA 1BLAA 1JN2P 3BRGC 2OVUA 3WO2A 2DVDA 2PHFA 2HZ9A 2LIQA 1N47A 3AP9A 1AF9A 2ZGNA 1LULA 1BKZA 1IJTA 3BODA 4Y20B 5L73A 2PHRA 1SLTA 1MZ5A 4QALA 2WNEA 5JOZA 3RG0A 2DTYA 4ATFA 4BOWA 4AVVA 3O4BA 3WINA 1ZKWA 1S0BA 3ZXEA 2AXMA 1II4A 4I4UA 4BPZA 4DENA 2D3RA 2D44A 1S0LA 2WT0A 3ZUSA 3RTJB 4GOVA 5BQUA 4USOA 4JAWA 3BAGA 2ERFA 4D8HA 4ZFUB 5DXDA 3UD7A 2GZBA 3NBCA 1DZQA 1H9PA 3F1RA 1F82A 4J23B 4KEKA 2Y9XE 4I30A 1RY7A 4I96A 3MEPA 1G9FA 4Y1YA 1IS6A 2Y9WC 2A97A 1KNMA 3N35A 5FNXA 4D0ZA 3KM5A 1GZWA 4FVVA 4TYSA 2G4IA 1ENSA 3AYAA 1HQWA 2UWAA 3DUIA 5DUYA 41BIA 5IT6A 4EEEB 3O49A 1SR4A 4J1LA 3LLPA 3SITA 3QIXA 4Y1ZA 2ISHA 5IK4A 3FJCA 2FPQA 2JE9A 2E51A 2GMEA 1JHNA 4J2SA 5BQUC 2R0HA 4Q1PA 4DS0A 1GANA 4I1EA 4GXLA 4YW4A 3WLUA 5JVVA 3Q7YA 1V6NA 1QNYA 2YXSA 4J2XA 3A21A 3PHZA 1LHVA 4XBQA 2C5DA 1V6WA 3CA0A 2Y9GA 4AGRA 1VLNA 2KI4A 4WZFA 1IOAA 1VIWB 4Q1RA 5E8AA 3KQRA 4R9DA 4DPNA 1PC8B 1SR4C 2R49A 4BM8A 4AN7B 4JP0A 4ZLBB 2JE7A 4UW5A 3ENRA 2ISGA 9ILBA 3H6QA 3BADA 5GALA 1M2TB 3UD8A 2ZHLA 1YRZA 1AXMA 3AKFA 1BFFA 5EXOA 2D7RA 4I4XA 3D5OA 3PVOA 5GZFA 1F9KA 2VW1A 3NF3A 4M3CB 3WUDA 2AR6A 1QF3A 1DQ2A 3QW7A 3M3EA 1LOEA 4XOGA 1V6JA 4KBBA 2R1BA 1SCSA 1NXD1 3AXEA 2BEBA 1GYKA 2QYIB 4RL7A 4ZOTA 3O0VA 2DRZA 1FATA 4Q26A 3JRRA 1QKQA 3VT2A 2WBCA 1JW6A 2G7PA 4XYXA 1I1EA 1OQ1A 2E6VA 3WVJA 2ARXA 3UJ4A 3IPVA 1IT0A 3VKLA 3LTQA 4QBVA 3AJYA 3O4AA 4ISQA 3B69A 3FJHA 1UPSA 1V6OA 3USUA 2VY0A 2ERMA 5JOWA 5F5QA 5DG1A 3C9ZA 3T2TA 3IIRA 1HWNB 2XG3A 1PZ9A 5CNAA 2DURA 2UWCA 3N7JA 4Q91A 1ULGA 3C8BA 4UW3A 4YGCA 1LENA 1LTEA 1AX2A 3TB0A 1XQNA 2L5XA 4XTPA 1LEMA 1S0EA 4YFZA 1IS4A 1KDKA 4C1WA 1PZ8A 1TFMB 5AVAA 3ZSMA 2VXRA 2RQ9A 3WO3A 4AVTA 1XG6A 1ZL6A 4YW3A 2VW0A 3HMYA 1W6PA 5DZFA 2RHPA 3A0KA 1GNHA 2ISEA 3HN1A 3CA5A 5BXPA 4D69A 1IS3A 1MVQA 2JDZA 2LALA 1BXHA 3UJOA 4I1BA 4XFTA 3FIEA 4HEVA 3O5SA 2DVAA 4II0A 4YW1A 2D22A 2DV9A 3WDTA 1DQ5A 3OYWB 1DFCA 3BWIA 31BIA 4EL4A 4Y22A 1UN1A 2YY1A 2PELA 4HANA 1MC9A 5H9QA 1ISYA 2ZGOA 4CJMA 3M1HA 3IM6A 1HKDA 3AJZA 1BARA 4PBOA 1JOJA 3POSA 4GALA 1FGAA 2NN8A 4XHXA 1EPWA 2C9AA 2D20A 4AN6A 3RQ0A 1ZB7A 1VAVA 3VUOA 1CONA 4XJ8A 1XZZA 2P37A 4L4HA 1FNZA 3WCRA 5CBLA 1FMZA 4YZ4A 1GNZA 3CA1A 4WBCA 1CVSA 3NV1A 2NTDA 2ZMKA 2DTWA 1WD3A 1MS5A 2PHTA 5DSSB 1XYFA 2PHWA 1QDOA 2Q9XA 1DQ6A 3CRIA 1R8OA 3BRFA 1G9BA 1RZOB 2X2TA 4ZA3B 4H9WA 4XTMA 5GZCA 5F90A 2DVFA 1ABRB 1SZ6B 1LHOA 1UZYA 4XJZA 4R6UB 1RINA 1Q8VA 1QGLA 4I4PA 3BONA 4HR6C 4IY8A 4FOVA 4I6IA 4XBNA 5DZGA 2ZHNA 5BYNA 1JXNA 1KDMA 2B7YA 4FPGA 4XMAA 3P53A 2D43A 5IK5A 3NWKA 4BMEA 2VSAA 2AENA 1S1AA 1GKBA 3D4KA 1MS8A 3WG1A 1V00A 4Y1UA 3VWCA 1F5FA 3ZYRA 4M3CE 3WA1A 3OJ2A 3ZSLA 4L8QA 3WOGA 1J0SA 2G7KA 3A4UA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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2NP0A

Total Genus

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Chain Sequence

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