2NP0 | Genus

Total Genus 418

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	418
sequence length	1290
structure length	1289
Chain Sequence	PVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVPLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKDMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVKPGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIEYNTQSNYIENDFPINELILDTDLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVNDFVIEANKSNTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRNEKWSDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYRYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINGCSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVNKYLKTIMPFDLSIYTNDTILIEMFNKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Structural basis of cell surface receptor recognition by botulinum neurotoxin B. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Botulinum neurotoxin type B
molecule tags	Hydrolase
source organism	Mus musculus
total genus	418
structure length	1289
sequence length	1290
ec nomenclature	ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date	2006-10-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01742	Peptidase_M27	Clostridial neurotoxin zinc protease
A	PF07951	Toxin_R_bind_C	Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A	PF07952	Toxin_trans	Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A	PF07953	Toxin_R_bind_N	Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1120.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain	Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain	2np0A02
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	2np0A03
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	2np0A04
3.90.1240.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Zincin-like	Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like	2np0A01

1CJPA 4P9XA 2GO2A 2P37A 4Y20A 5EYYA 2D6OX 4EFPA 2WNEA 1N1TA 2IMAA 2JDZA 1Z7HA 1PWAA 1F9KA 2EIGA 3AJZA 3PHZA 1O4ZA 3DUIA 1LGCA 3AKHA 4XHXA 4GALA 5H9RA 4LBLA 5DUXA 3BAHA 4ZJXA 1SLCA 1OQLB 4Q26A 3V79C 1XG6A 1IILA 1LTEA 5BQMB 3VSZA 2NP0A 2R16A 4J2SA 3BRDA 1N3QA 3ZYRA 3O4OA 1LOAA 2R0FA 3AZYA 3M3CA 5KXCA 3TB0A 1YIFA 1FWVA 1IOAA 3O3QA 1CQ9A 4AGGA 1ILR1 4ZLBB 3RG0A 3T8SA 2I2SA 2ZGPA 4HANA 2WQZC 5IK4A 2CWMA 1G7YA 2LTNA 2RHPA 3I8TA 3C8AA 3ILFA 3RTIB 4IQPA 1MZ5A 5DG1A 4Y1UA 3UJOA 2FPQA 1PUUB 3O0VA 1W6PB 1ISVA 3AJ6A 2D7IA 1HQLA 2FMDA 2H0BA 2DUPA 3UJ4A 1MS1A 3W58A 3NBCA 3BONA 1WCSA 4AGVA 4AN7B 4YM2A 4K21A 5DVHA 1FGAA 3WG4A 1S0BA 3A4UA 1CN1A 5E24E 1GKBA 3P6IA 1TWEA 4OZXA 1ULDA 4P0KA 4YFWA 4USOA 2ZHNA 4GP3A 2XOAA 3DGTA 1KITA 5SV8A 1LHWA 1RIRA 2EXKA 2HW9A 1AVAC 4A7KA 3WOGA 1M16A 4Z8SB 2WT2A 1AFCA 5BQNA 1FMZA 3H6SE 4A7ZA 4OWJA 1EVTA 1W6MB 1DFQA 2GNMA 3R05A 1JXNA 2W2DA 2XHLB 3MW2A 3ZXEA 4ZBVB 2VH9A 1AJKA 1WLCA 1ABRB 1BQPA 4FP3A 1FN0A 2FHRA 4I7IA 4U2AA 1KRIA 2ZGSA 4LO2C 1ENSA 5DG2A 1HQWA 3AYCA 1KQRA 3LSEA 2Z42A 4FOQA 3OJMA 4P14A 1FQ9A 1LOFC 1V6JA 3JU9A 2HZ9A 2G7NA 3EF2A 4ATEA 1C4RA 1JYIA 4M3CF 2A6VA 2DRYA 4HEVA 1BFFA 3MW3A 1OKQA 2WJSA 3CNAA 2ZGOA 4LBQD 1DYKA 3M1HA 2E7QA 2WBCA 4TYSA 3ZVXA 1TOOA 2D23A 4XBQA 1W0PA 4AYUA 4EL4A 5F8WA 2HWMA 5CB7A 1RY7A 2ZA9A 4ZOTA 2VW1A 4QD2C 4XIOA 2P39A 1RINA 5EC5A 5G00A 3WLUA 3OPZA 4NOTA 3ZXFA 1KJLA 1BLAA 2ZHLA 4YG6A 2A5ZA 2EF6A 4I30A 3BOKA 3ZXGA 3OYWB 4Z8BA 1DZQA 2VLCA 3FJDA 1WBAA 2CYFA 2ZMKA 2OUJA 2ZGRA 3HR9A 1F82A 1DQ6A 1WW5A 3WA1A 3FJJA 4YOLA 3D6EA 4WBCA 3QLQA 4FPLA 4I0YA 2R9KB 5DSSB 4I4SA 4LBQB 4LO1C 2D44A 5T50A 3H0OA 4H04A 1W6NA 1W6OB 4OWKA 2DTYA 4BLIA 1Z2VA 5KXEA 1IHKA 5DXDA 2UUSA 4J23B 1JW6A 2TEPA 3L2YA 1GGPB 1JOJA 4YW5A 4ISQA 4C1XA 2VU9A 1JUIA 3B00A 2K43A 3N0KA 4GXLA 2F8XC 1DQ1A 5JVVA 1VCLA 1QF3A 3MEPA 2P3JA 1FV2A 5GZCA 5D61A 3OBTA 1Q8QA 4TZDA 1S0FA 1Q8SA 2PHXA 2ZAAA 4EEEB 1AXZA 1GANA 2Q3NB 1AVBA 4XBLA 3CA5A 4XFUA 3NF3A 3C88A 3QW7A 1BJQA 3WO4A 3W59A 1SBFA 1MS9A 3O4BA 2VW0A 4K1YA 2ZBJA 3AZVA 1G9BA 1BXHA 4HJJA 3ILNA 2YMZA 1ISZA 4L8QA 2A8AA 1AX2A 4YG0A 3ZXKA 1UL9A 2BEAA 4XKIA 1QNWA 3VT0A 3W9TA 4YM3A 1WBCA 2VUAA 1DJSB 3BIWE 4XIKA 4EFRA 2R1BA 5T55A 1TTUA 3AP9A 4OWLA 2PHUA 5KXBA 4PC4A 2ZZJA 1JHNA 1SLLA 4XZPA 1CVNA 5DUVA 1URXA 3WINC 2D7FA 4KBBA 1JTCA 2ES3A 3FJIA 3OY8B 2SBAA 3AH2A 1GBGA 3CU1B 1PZZA 3OJ2A 3UDAA 1LU2A 5JMCA 4BLJA 3ZXJA 4I1BA 1NLSA 4FPEA 3AJYA 3BRFA 5I1BA 1S0IA 5GZDA 1Z0HA 3BB2A 1UMZA 21BIA 1G9AA 1OFSA 2KKIA 4XILA 4X38A 1E1HA 3LLPA 1LULA 2E4MC 1VLNA 5B2HA 1H30A 1WD3A 4QBVA 1FNZA 1F31A 2YZ4A 5H9QA 1V6WA 2XB6C 2ZGMA 5BXRA 3BAGA 1DQ2A 3AH4A 1DFCA 3WNXA 2ET2A 1N3OA 1T9FA 4I2SA 1N4KA 3F62B 3N36A 1FYUA 4I6IA 3NBNA 1LU1A 2ARXA 4U36A 1WUVA 1AXMA 1GNZA 1JQZA 4G6MA 1XTGA 3N7LA 3WG2A 1EV2A 5F8YA 4I3NA 5BQUA 1HCEA 2YY1A 1I1EA 3ZC9A 4GAFA 4FOYA 1CPMA 2CY6A 3NBEA 4UW6A 4AWDA 1SBDA 1LGBA 3C2UA 2I1BA 4Q8LA 1W6PA 3VWCA 1IKPA 1LHOA 1LODA 4FGFA 4ENDA 3WO2A 5DZFA 3PVNA 3APBA 4DPNA 5T54A 3TC2A 2UU8A 1AVXB 3N35A 1CR7A 2D22A 4BOWA 3B01A 1LOCA 4LBOA 5DUUA 5HCAA 2WKKA 2DWRA 4ZKTB 1VALA 5JLVA 1W3FA 2L5XA 3V0AA 3ILAA 1OQ1A 9ILBA 3RRDA 4ZA3B 3C89A 2W52A 5GLUA 3WDWA 1K5UA 3FJHA 1SFYA 1W6MA 1W6QB 5CAZA 2F2FA 1ULCA 4XFSA 3VV1A 2XHLA 3AYDA 1QMJA 2D24A 3QR5A 1YTOA 4PBPA 1Q8VA 2J3PA 5JOYA 1LGNA 1MVQA 4R9AA 1ZM1A 1VIWB 4Y26A 1KJRA 3BA5A 1C1FA 1HIBA 3FJFA 5BXPA 2ZKNA 3ILRA 2AR6A 2VSEA 4DFSA 2A6WA 2ISGA 2ZGUA 3SH3A 2D6NA 1AX1A 1C57A 1UPSA 2A75A 1A78A 1CESA 4JC1A 2Y9XE 3RSJA 4YFZA 1G9DA 4XOGA 3I4IA 1DGLA 2E53A 4D0TA 1RZOB 2CWSA 2DV9A 1B09A 2RSTA 1SR4A 5CNAA 3DDAA 2A7AA 2FFUA 3FLTA 4Q1RA 2A70A 4QKRA 1LHVA 4F34A 1UN1A 4IHZA 5EHAA 1XHBA 5HCFA 4CTEA 2HYKA 1W0OA 1LENA 3A07A 2ZGNA 1LEDA 5F8SA 4I4VA 3HBWA 2G7QA 2AENA 3HALA 3O0XA 4I4RA 4XJ8A 3WG1A 2FDBM 1ULFA 3FJ9A 2PHRA 2D3RA 3O4DA 1N47A 3DSEA 4YW1A 2DU0A 4ISRA 4KEKA 3B3QE 4LO2A 1BLDA 1YRZA 1R1ZA 2IMBA 3VKFC 5DZUA 2E7TA 4LO3C 3OYWA 3FJKA 3IPVB 3PJQA 3WHTA 1WBFA 5BOWA 4YZ1A 1LCLA 41BIA 4H55A 5H9SA 3SNMA 3BA4A 1SLAA 4P9WA 3BAUA 2NTDA 4KC3A 2NZ9A 4YW2A 3KM5A 2P3KA 3H6RB 1YXWA 4LBQA 3BAQA 4G9MA 2W08A 4P6AA 3ZC8A 5L73A 4LBJA 3MALA 3IM6A 3ZSKA 3LCPA 2LIEA 3VEQA 2R0HA 1AXKA 1CIWA 4XTPA 1ZL5A 1LESA 1ZL6A 2QN4A 2RG9B 3WDYA 4XYXA 1GZ9A 2D3SA 4P0JA 1CPNA 2GZBA 4NO4A 1QQKA 4M3CE 4DENA 2C5DA 3D4KA 1H9WA 4P9YA 3ZSMA 3HN1A 3ENRA 2PELA 3BWIA 3OGGA 2JJ6A 4FPCA 3QJ0A 2UURA 3T1MA 1WLDA 2D6MA 1GNHA 4RL7A 4JCKA 1FNYA 1IRPA 3BAOA 4YM1A 4OEFA 2MC2A 3OGFA 4D8HA 2G7KA 3C8BA 2OW4A 4XTMA 3HOMA 3AJ5A 1T4QA 3AP4A 2KI4A 4WZFA 3CA3A 3MPPG 2WSVA 4FPYA 1TEIA 3RQ0A 3BODA 4LO0A 3ZUSA 2CL2A 3N3HA 4XFTA 3IAGC 4GOYA 3FUOA 4ITCA 7I1BA 3Q7YA 1HLCA 2D43A 4JKQA 3A22A 1PZ9A 2E6VA 1MD6A 2Y9WC 2VXTI 1APNA 3SITA 3O44A 3OY8A 2A6ZA 4OW4A 4YZ5A 2RQ9A 1SLBA 1PZ8A 3H6QA 3AZWA 4ELCA 2GNTA 3IN9A 1G86A 1JT4A 3WMVA 1ONKB 1GZWB 3BRGC 2JE9A 3K1XA 1ENQA 1HWOB 4I96A 3M3OA 1N1YA 1JT7A 4YZ2A 3JRRA 1V6NA 3QIZA 3O0WA 4Q91A 3D7WB 1LJ7A 4I37A 2R1DA 1P63A 5GZEA 3BTAA 1MS0A 1SACA 3R4SA 2ISEA 1U0AA 1PC8B 4XDQA 3IKWA 3ZUQA 1ZN3A 3FJCA 2NM1A 1PUMB 1DHKB 3VSFA 3Q9OA 1SBEA 4J2YA 4DRVA 2DURA 4EJ5A 2CNAA 1Q8PA 4YW4A 1CONA 2D6KA 1F5FA 1A8DA 1MS3A 2OVUA 3O12A 3WCRA 2K8RA 4QD2B 2BEBA 1AXYA 1IRAX 5GM0A 5FREA 1HCDA 4HL0A 3PG0A 4DS0A 3FFZA 1LECA 3ZYPA 3BOOA 3NV2A 2KM2A 3USUA 3POKA 1R8NA 5E88A 2NMNA 1JLYA 2YROA 3PUBA 2ZGKA 1JT3A 1DZCA 2IWTB 1Z78A 4K1ZA 4WVVA 5IK8A 1WLWA 1DZDA 2GNDA 3VUOA 3DEBA 5T5PA 1H9PA 3BA7A 3AH1A 3CRGA 2BQPA 3FJAA 4G1RA 3WMUA 4WV8A 1C1LA 1SLIA 3V65A 4XE9A 4HR6C 3FIIA 1IKQA 3AKGA 4J1LA 1IS4A 3GNEA 3WUCA 1Q04A 4QC4A 3FLRA 2ZGLA 3ASIA 3QCWA 4R6UB 3WCSA 2KI6B 1GICA 1W3AA 2AQZA 1DQ4A 4YZ3A 3A21A 2EXJA 3AK0A 3AP7A 2ZMLA 5GLVA 1LOGA 3K3QB 5GZGA 3WV6A 2AXMA 4OEGA 3UJQA 1ISYA 1L2HA 4XHBA 3WUDA 3UD8A 1DBNA 1SCRA 1I3HA 4Y1YA 4OUJA 1N1VA 4RA0A 1MS4A 1S1AA 4JRAA 1DYPA 3AXDA 3AXEA 1JBCA 4M00A 3VKMA 3O5WB 1WW7A 1BFCA 5BP5A 1WBLA 4GAIA 2Z49A 2MIBA 4CJMA 1QGLA 2BFHA 1IOBA 2AGSA 4LBKA 2ARBA 3T1LA 5BXSA 2EXHA 3VKNA 3B69A 1HDKA 4YGCA 4I1EA 3S8KA 3UD7A 5BQMA 4UW4A 4IY8A 4ZFYB 2JKBA 3IM0A 1Y7BA 4XXAA 4XJ9A 1XTFA 4UW5A 1UZYA 4QO3A 3ZX7A 1Q1UA 2ETFA 4JKXB 1LHNA 4CRQA 3ZXDA 3O49A 4LO8B 4YW3A 1I1BA 3QW8A 5BYNA 3FJ8A 2GMPA 3VKLA 3FJBA 2UWBA 4L4IA 1W6NB 2G7PA 3QYDA 4QBCA 2DTWA 1V6XA 5EWSA 3UL2A 1QDOA 4BMBA 1GLHA 4Y1XA 3OJBA 4JP0A 4DQAA 4FQ4A 1MS8A 1V6LA 1WW6A 1HKDA 8I1BA 4ZXKA 2VW2A 1EPWA 5T5OA 1PZ7A 2Q5TA 2D20A 1QOTA 2GN7A 1D0HA 3BOPA 4HA2A 2ZMNA 5T5LA 3BAVA 4J2XA 1QQLA 1ZA4A 4Y24A 4Z9WB 1EYLA 2SLIA 4I4QA 2DVDA 3HMYA 5JOZA 1D2SA 1BASA 31BIA 3D3XA 1LHUA 4FPOB 3B9UA 4G9NA 4USPA 4ZFWB 2OUHA 4Q27A 3P53A 4X37A 5AVAA 2W39A 4KEIA 2P34A 2WLQA 3O5SA 1ZKXA 1X50A 3AYAA 1VAMA 4I4YA 2ZR1B 5D63A 1ONAA 1JY0A 1S0GA 3QIXA 2JECA 2AREA 3POSA 1V6KA 1IT0A 3NV4A 3RTJB 5BQUC 4FOWA 3CQAA 1S0EA 3BX1C 4TLPA 2GN3A 1QDCA 1AVWB 4X39A 5JOXA 4LBNA 2ZQNA 1ULGA 2PHTA 1FX5A 3WG3A 3V0BB 2ZGQA 1TP0A 5FZZA 1YO8A 3LSDA 5FRAA 2A97A 4Q2FA 2FO1A 2Z48A 5T5JA 4Y1ZA 1S0JA 4R9CA 5D62A 1MZ6A 4BPZA 1BKZA 4JAWA 5F9TA 5EXOA 1IJTA 3N7MA 4L4HA 2QN0A 3QW6A 3OJVA 5DZGA 3AP5A 3ZPYA 1QOOA 2G4IA 3D5OA 1MS5A 3UJ0A 4H9WA 4ASMB 4XXPA 4MYEA 3NV3A 3SH4A 1GZWA 1ISXA 2AH2A 1LOFA 1J0SA 2IHOA 4LBMA 2F2FC 4GKYA 1CE7B 4YGBA 2AUYA 2A6XA 3N7JA 1BFGA 1ITBA 1QU0A 1J1TA 1GYKA 1II4A 1QKQA 5LK5A 1T3CA 2VXRA 4K20A 4I4XA 4Y22B 3I2AA 1LOEA 3RMXA 4XMIA 4YM0A 2FGFA 1SLTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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2NP0A

Total Genus

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Chain Sequence

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