2NZ9A

Crystal structure of botulinum neurotoxin type a complexed with monoclonal antibody ar2
Total Genus 379
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
379
sequence length
1294
structure length
1267
Chain Sequence
PFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNVGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHELIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNRKTYLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEANISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Molecular evolution of antibody cross-reactivity for two subtypes of type A botulinum neurotoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Botulinum neurotoxin type A
molecule tags Toxin/immune system
source organism Homo sapiens
total genus 379
structure length 1267
sequence length 1294
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2006-11-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 2nz9A02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2nz9A03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2nz9A04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 2nz9A01
1ISWA 4TZDA 3LTQA 1EVTA 4Q1PA 1GGPB 3WLUA 1HKNA 1Q1UA 2QYIB 1BLDA 3FFZA 1TOOA 2NVHA 4Y1VA 3W58A 3UJ0A 1DQ5A 2W08A 1LCLA 2DU0A 2DU1A 2JE9A 2D20A 4W65A 5T5OA 3RMYA 3INAA 2D3RA 1W0PA 3WNXA 3BAVA 4JPZA 1LOFA 5IK7A 1G9BA 5IK4A 4DEPA 3VEQA 3WDTA 1PZ8A 4DENA 3VT0A 3PHZA 3POSA 2FGFA 1UN1A 3FJDA 1QOSA 3OBTA 4IONA 2B7YA 3AZVA 2DREA 3FJAA 3M1HA 3QJ0A 1MVEA 2XHLB 4XJWA 3ATGA 5IK8A 2FFVA 3CA0A 3DS9A 1YXWA 1F5FA 3BAGA 5FZYA 3BTAA 2FMDA 4EKXB 1DFQA 4AN7B 2GNDA 1QDOA 1GANA 4K20A 3FIIA 1Q8OA 5JDBA 4LO1C 2NTDA 3WA1A 1WBFA 1PUUB 2D7RA 2NZ9A 4Y1XA 4ATEA 3AZZA 3MALA 1V6KA 4XBQA 3N0KA 1ONAA 4FQ4A 4I2SA 3RS6A 2ZGSA 2AYHA 4I4VA 2QN0A 4OEEA 5BQMA 2LALA 3TC2A 1G86A 1G9CA 4Q8LA 3QW8A 1H9PA 2PHTA 4I3NA 1LULA 2SBAA 3H6SE 1LOBA 3ZYRA 1O4ZA 4M00A 3MW4A 1I3HA 4YW2A 1XG6A 1AJOA 1CJPA 5GZEA 4C1WA 2YXSA 3T8SA 2CY6A 4G9MA 2UUSA 3F62B 3A21A 4YGCA 3A22A 3WDXA 4KUFA 5DUWA 1VCLA 4YG6A 1APNA 4WV8A 1EPWA 1FNZA 3S8JA 3ZX7A 4XMIA 1Z7HA 4QD2C 1LHUA 4Z9WB 5EC5A 1CPNA 4QKRA 1J1TA 3PMEA 5DZFA 3N35A 3AKFA 5E8AA 4R9AA 2LIEA 3POYA 3QIZA 1F9KA 3PVEA 4YW3A 4LO2C 2VW0A 1JUIA 1KDMA 5GLUA 3Q7WA 1E1HA 2A3YA 3LCPA 4YM0A 1XHBA 4OWKA 2AXMA 3VKOA 3FJKA 1JBCA 1HDKA 2V73A 3C8AA 3IM0A 5DZEA 1LTEA 4F83A 1TTUA 3AJYA 1JTCA 4Q2FA 1Q8PA 1AFCA 1GICA 2D6LX 5GALA 1YRZA 2GALA 2MC2A 3Q7YA 5JMCA 4GALA 3BA5A 1A78A 4ELCA 4KS6A 1J0SA 3KM5A 1LECA 3OBRA 1AVWB 4OW4A 3WUCA 4FPOB 2CYFA 3RTJB 3N7LA 1W6PB 2IMCA 2ZHKA 3ASIA 2ZAAA 3POKA 2KM2A 4JRAA 3CU1B 4L4IA 3C9ZA 2GMPA 3VKNA 4I4OA 1SLIA 1EYLA 2EF6A 4EJ5A 3ZXEA 5SV8A 4ZGRB 2ZGKA 4CTEA 5LK5A 4GKYA 1Z78A 3I2AA 1GNHA 2AH2A 2NMNA 2DS0A 3BAQA 1IILA 3HALA 4AVSA 3A0NA 1D0HA 4Y1UA 2WT2A 2PHFA 2WRYA 3BB2A 4XJAA 2ZBJA 1HLCA 3OJVA 2A70A 1RIRA 5AVAA 1FWVA 5T50A 3RMXA 4YW4A 1AZDA 1MVQA 4M3CB 4ZOTA 1FYUA 1LU1A 2PHXA 4L8QA 4FPKA 2W2DB 5F9TA 1WUVA 4D8HA 3B00A 2AR6A 5F8SA 4X37A 4KEIA 2GNBA 1FQ9A 3I29B 5CNAA 1LOGA 1IJTA 1WLWA 1DGLA 3FGMA 1LOAA 3AZXA 1G82A 3DGTA 1LGNA 3AKGA 1MS4A 1YYNA 3V0BA 4EFRA 2A3XA 1IHKA 1JHNA 3UL2A 1AXMA 2KLLA 4RL7A 2A75A 4Y1ZA 3CQAA 4DCKC 1F82A 2W39A 3SLIA 3W59A 3QLQA 2R9KB 3NBCA 5F8YA 5BXPA 5BOWA 3DEBA 1LHOA 4HL0A 1E0OA 3WHTA 1UL9A 2R0FA 2ZQNA 4RA0A 1HQLA 3FJJA 1M16A 2RG9B 3NBDA 3O49A 3C88A 1JN2P 3VT2A 1PWAA 4FVVA 3EF2A 4XTPA 2ERMA 2Z42A 2Y9FA 3H6RA 4AYUA 1S0FA 3IAGC 4I30A 1FN0A 4G9NA 3AZWA 2DVFA 3D6EA 4UW5A 1CQ9A 1AXKA 2D6PA 5D61A 1V6JA 1DQ1A 1RMLA 3AYDA 2X2SA 7I1BA 2EAKA 1WW6A 1W6OA 1MS3A 21BIA 5FZUA 2C5DA 4QBCA 5GZCA 1CIWA 1SLTA 4IZEA 2OVUA 3HR9A 5GLZA 4FPFA 1AX2A 1BFBA 1PZ7A 1V6OA 2D43A 2VXRA 1I1BA 5BQMB 4Y1YA 1JXNA 2AUYA 3FUOA 3LSEA 3WDYA 4BMBA 4XKIA 1MS1A 2AENA 3WUDA 1W3FA 1LENA 1WBCA 3D5OA 4OWJA 4XTMA 1ENQA 5IK5A 4UW4A 2E53A 3ZXDA 5JOZA 5DUYA 1WBAA 2ENRA 1ISXA 4I0YA 4AN6A 2ISEA 2IHOA 1DYKA 5JVVA 1ZL5A 2GZBA 2NN8A 3KQRA 1JOJA 3O0VA 5T54A 3QYDA 4II0A 3OGGA 4TLPA 4C1XA 3IM5A 1YBIA 1JQZA 3O0WA 1WBLA 1AVAC 4FOQA 2A6WA 4YGEA 2A97A 5EWSA 3WCRA 5L73A 3BOOA 2DUOA 3WHUA 1V6NA 3I4IA 2ISGA 2YROA 2R1DA 2DVDA 2P3JA 4DRRA 4LO8B 2AREA 2ZHLA 2ZGMA 5H9SA 2VLCA 4WVVA 3BAUA 3AXEA 5GJ6A 3SISA 1XYFA 3DSEA 3ZXJA 3A23A 2CWSA 4XFTA 1NLSA 1GZWA 4QO3A 4GXLA 1IOAA 3RG0A 1RINA 5BXSA 4NO4A 3N7JA 2VSAA 2K8RA 3IIRA 1AXZA 3WV6A 1DLLA 1VAVA 3CNAA 3AJ6A 1LOEA 1SZ6B 2M49A 2R16A 4K1YA 4FPYA 1G7YA 1ISVA 3SH3A 1LOCA 3UJOA 1V6XA 1FWUA 3BOPA 2K43A 3M3EA 1AJKA 1VAMA 3CRIA 2FHRA 5HCFA 2UWBA 4XDQA 2PHRA 3WG4A 1AVBA 4TYSA 1RG8A 3NV1A 2HZ9A 1LJ7A 1MS9A 3A4UA 2RSTA 1II4A 1P63A 1VIWB 4XOGA 2CWMA 3AYEA 3UD9A 3WMUA 2DUPA 4EEEB 2F8XC 3SITA 1JLXA 2P3KA 3QW7A 4OEGA 3R05A 2ZZJA 2ZA9A 4J2XA 1PC8B 4UW3A 1HCDA 3OY8A 1JYIA 3BAOA 3ZYPA 4I1EA 1FATA 1V00A 1URXA 4EB2B 3PG0A 1QXMA 4XZPA 4Y22A 2ZACA 2IMAA 3O5WB 2E6VA 1A8DA 3SNVA 1QOTA 4XYXA 1G8WA 1C4RA 2BEBA 1KNMA 1LEDA 1MZ5A 5G00A 4LO0C 1DJSB 3HOMA 3AP7A 3MW3A 1XQNA 3BA7A 41BIA 1MS8A 4FOVA 2XOAA 2D6OX 1ULCA 4YG3A 2ESUA 1LGCA 3AJ5A 5CBLA 3WDVA 2OUJA 1FNYA 5DVHA 5EXOA 1UKGA 2P23A 3FJ8A 5HCBA 1ABRB 1AVUA 3V0BB 2JECA 2KI6B 3ZUQA 5GLWA 5GAQA 4OUJA 9ILBA 2WSVA 1UPSA 4J2KA 2JJ6A 2AQZA 3O4BA 2ZGQA 4PF5A 5T52A 2G4IA 2D6MA 3RTIB 3AKIA 1HWNB 3PUBA 1WLDA 4XMAA 3WO3A 3MW2A 3BX1C 4USPA 4YW1A 1GV9A 1IRPA 3NV4A 4M3CE 4YGBA 3M3CA 4ZLBB 4PC4A 3AH1A 1KJLA 5HCAA 1GLHA 2WBCA 1QGLA 2MLLB 3ENRA 2PELA 3QR5A 2Z49A 1HQWA 1EV2A 4LO7C 1PUMB 2ZKNA 2G7NA 4YW5A 1W6OB 4M3CF 4HA2A 3V0AA 3OYWB 2HYKA 1L2HA 3BRDA 3FUQA 4Z8BA 1DBNA 2A6YA 3W9TA 1MZ6A 1QDCA 5KXCA 4IY8A 4FQZA 4PCRA 2KH2A 1UAIA 2CL2A 4I4XA 2GMMA 2E7QA 4OZXA 2EXJA 1C57A 2ZABA 1N3PA 3M2MA 4R9BA 1Z0HA 3V79C 2JD4A 3UJ4A 4FPHA 1QF3A 4IY9A 1N3QA 2D3SA 3D3XA 1YTOA 3JUTA 4HJJA 1CPMA 4XJ9A 4Y24A 2A5ZA 5DUXA 4K21A 3C8BA 2DRZA 1OKQA 4GOVA 4YZ3A 2E51A 2WQZC 2Y9GA 1SR4A 4OEFA 3Q7XA 5FNWA 4IHZA 3UK9A 1LESA 1W6QA 3TB0A 4YFZA 3F1RA 3ILAA 3ZSKA 4MYEA 3CRHA 4XIKA 4G6JA 3ZXKA 4P14A 3MPPG 3BADA 3K3QB 4KC3A 2WLQA 4A7KA 2A7AA 1ZN3A 1V6IA 1T3CA 4QD2B 1JT4A 1MS0A 4QC4A 1BJQA 3D7WB 2D22A 1R8OA 4Q9GA 4D0TA 1W6MB 2JDZA 2DURA 3A0KA 4I6IA 3ZC9A 4H9WA 1ONKB 1GZWB 3IMNA 1KQRA 4FPCA 3WINC 1ULDA 4GAFA 2RQ9A 4GAIA 3QW6A 3ZSLA 1LHVA 1MS5A 1Q8VA 5E89A 4GKXA 1KDKA 4Y20B 3APBA 1V6VA 3B9CA 4J2SA 2VW2A 1SBFA 2OUHA 2A71A 5KXEA 5FNXA 3HN1A 4GA9A 4ZFWB 4HR6C 4FPJA 1YI7A 1ITBA 5GZDA 4F34A 1QKQA 1DQ0A 1Q04A 3K1XA 2GNMA 4P6AA 1V6LA 2HWAA 3P53A 2EXIA 2DRYA 3VSZA 4XJUA 2ZMNA 1LU2A 3FJHA 4L4HA 1G9AA 3NF3A 3SH4A 5E88A 1IS5A 4ASMB 4JQ0A 2DTWA 4YLZA 3OY8B 2VUAA 5CAZA 4PBOA 2ZGNA 2L5XA 3B69A 1CVSA 4IZXA 1HWMB 2AAIB 1IRAX 3FJIA 3GNEA 3O4OA 5H9RA 3R4SA 5DUUA 1W0OA 2UURA 4YM1A 1VLNA 1ZM1A 4JC1A 1QNWA 1ULEA 4YZ1A 1RZOB 3WMVA 5GM0A 4BPZA 4HANA 4LO0A 1PZ9A 3WDWA 1CESA 1LEMA 3N7MA 4DPNA 2DVBA 2E7TA 2GO2A 4CRQA 4J2YA 4FPLA 4DRVA 3OPZA 3UDAA 3WZ1A 3DDAA 1BLAA 2DUQA 1NXD1 1SLLA 2I1BA 4X3AA 3IKWA 4KEJA 5FZZA 3NJ5A 4I4YA 2WKKA 4ZA3B 3P6JA 2ZGLA 4LO3C 2A6VA 4XJZA 3PJQA 4BQ1A 4JKXB 4I96A 3A07A 5GLTA 3R4UA 4HEVA 3WDUA 2A3WA 3VKFC 2LIQA 1DYPA 3QW5A 3QCWA 4CJMA 3MEPA 3WO4A 4KTXA 2SLIA 2V5YA 2ZGRA 1JW6A 3IPVA 2TEPA 4CZSA 1GYKA 2VY0A 1F31A 5F5QA 1Y7BA 1U0AA 4P0KA 1UMZA 3T2TA 1BA7A 1KITA 1FX5A 1N47A 3WG1A 4J1LA 1SCRA 3RRDA 3O12A 4DFSA 1S0CA 3V0AB 2W68A 1QQLA 3WCSA 2KKIA 2ZGTA 3CRGA 1UZZA 2DVGA 1SR4C 2EIGA 4Y26A 5D62A 2J3PA 2DVAA 3OGFA 1GZ9A 2ISHA 4YM2A 4Q91A 2GMEA 2W52A 3VKLA 2ZMKA 2P37A 1DZCA 1RY7A 1Z4SA 3DUIA 1CE7B 3H6QA 4Q27A 3CA1A 1GKBA 1O4YA 4FOWA 2DYCA 4J23B 3O5SA 4Q9PA 2GN3A 3SNMA 2NYYA 2BQPA 3ZURA 2NM1A 1DHKB 1BFCA 3HBWA 1JT5A 5EG6C 4U36A 1BZWA 4XFUA 1G9DA 1WW4A 1S0JA 4XBLA 5JOXA 3AYCA 2DV9A 5DZUA 5JOYA 4I4PA 1HWPB 3RSJA 2P39A 1T4QA 1W6PA 2ILPA 1OFSA 1A3KA 1SLAA 5EYXA 3E8LC 1BARA 2R0HA 1LHWA 1QMJA 1ISZA 4ISRA 2FO1A 5BQUC 1WLCA 2K4AB 4ZFYB 2D23A 1UZYA 2YY1A 4WBCA 2EALA 4WZFA 2ZGUA 4FPEA 1SBDA 2WJSA 3ZXGA 1K5UA 4IYBA 2VW1A 1C1LA 1IS3A 1BFFA 2Q3NB 4USOA 5BP5C 2AFGA 2D24A 5D63A 5IT6A 3C2UA 2E4MC 3WINA 2HW9A 1R1ZA 2GNTA 3AH4A 4M3CA 3AJZA 3FBYA 1IT0A 3AX4A 2W2DA 2A8AA 4FP3A 4I37A 4AGRA 4LBOA 5DZGA 3CA6A 1WD4A 3AK0A 2A6ZA 3UD8A 1H9WA 4LBQA 2IMBA 1BYHA 3USUA 3AFKA 1XZZA 5KXDA 1HCEA 1B09A 3ZXLA 4AVTA 2QN4A 1LHNA 4Q1RA 1T3AA 4YG0A 3T1MA 2YV8A 3NV3A 4P9YA 4BMEA 1S0DA 4UW6A 1KJRA 4A7ZA 3UD7A 3S8KA 2UWCA 4YZ5A 5IUQA 3CA4A 3BIWE 6I1BA 4I4UA 5BXRA 1IKQA 3LSDA 4DQAA 2ZMLA 4ZJXA 5DG2A 4XHXA 1DZQA 5FRAA 4R9CA 4I7IA 3O0XA 2R1BA 2ZGPA 1M2TB 1ZKXA 1W3GA 1G9FA 2GDFA 2UU8A 4LBJA 1MC9A 3BRGC 1DFCA 1X50A 4ISQA 4AGVA 4XJ8A 3H6RB 2LTNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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