3V0BB

3.9 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 377
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
377
sequence length
1194
structure length
1150
Chain Sequence
MNINDNLSINSPVDNKNVVVVRARKTDTVFKAFKVAPNIWVAPERYYGESLSIDEEYKVDGGIYDSNFLSQDSEKDKFLQAIITLLKRINSTNAGEKLLSLISTAIPFPYGYIGYRETNYLSSEDNKSFYASNIVIFGPGANIVENNTVFYKKEDAENGMGTMTEIWFQPFLTYKYDEFYIDPAIELIKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVIPYRLRSELENIEYSQLNIVDLLVSGGIDPKFINTDPYWFTDNYFSNAKKVFEDHRNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFRININDIWELNLNYFSKEFSIMMPDRFNNALKHFYRKQYYKIDYPENYSINGFVNGQINAQLSLSDRNQDIINKPEEIINLLNGNNVSLMRSNIYGDGLKSTVDDFYSNYKIPYNRADSSLDNVNIGVIDNIPEIIDVNPYKENCDKFSPVQKITSTREINTNIPWPINYLQAQNTNNEKFSLSSDFVEVVSSKDKSLVYSFLSNVMFYLDSIKDNSPIDTDKKYYLWLREIFRNYSFDITATQEINTNCGINKVVTWFGKALNILNTSDSFVEEFQNLGAISLINKKENLSMPIIESYEIPNDMLGLPLNDLNEKLFNIYSKNTAYFKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMAKRSVLAQETLIKRIIQKKLSYLIGNSNISSDNLALMNLTTTNTLRDISNESQIAMNNVDSFLNNAAICVFESNIYPKFISFMEQCINNINIKTKEFIQKCTNINEDEKLQLINQNVFNSLDFEFLNIQNMKSLFSSETALLIKEETWPYELVLYAFKEPGNNVIGDASGKNTSIEYSKDIGLVYGINSDALYLNGSNQSISFSNDFFENGLTNSFSIYFWLRNLGKDTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFQDTGLVFNMIDSNGNEKNIYLSDVSNNSWHYITISVDRLKEQLLIFIDDNLVANESIKEILNIYSSNIISLLSENNPSYIEGLTILNKPTTSQEVLSNYFEVLNNSYIRDSNEERLEYNKTYQLYNYVFSDKPICEVKQNNNIYLTINNTNNLNLQASKFKLLSINPNKQYVQKLDEVIISVLDNMEKYIDISEDNRLQLIDNKNNAKKMIISNDIFISNCLTLSYNGKYICLSMKDENHNWMICNNDMSKYLYLWSFKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BoNT/A
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 377
structure length 1150
sequence length 1194
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0bB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0bB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0bB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0bB01
2FHRA 5BXPA 2SBAA 2YV8A 1HLCA 1ULDA 2D24A 4K21A 1V6MA 2ENRA 4Y22A 2WSVA 1SBDA 3H6SE 1Q8PA 5BQUA 1C4RA 1SLAA 3P6IA 3AK0A 1IRPA 1JLXA 4QC4A 3N3HA 3VEQA 2Y9GA 4C1XA 4XFSA 3R4SA 4P6AA 1Z2VA 1SBFA 2G7NA 1FMMS 5JVVA 3V65A 1Q04A 4X38A 3FJ8A 3SISA 1IJTA 1MS4A 1WW5A 2W08A 5GM0A 5DUYA 2WNEA 3CQAA 1KRIA 4OWKA 4WVWA 4FPKA 2R0FA 3HR9A 5T5LA 1OKQA 1IRAX 4CRQA 5IK5A 4YM0A 3Q7YA 4KS6A 1Q1UA 2KI6B 1IKPA 3O4BA 2YY1A 5HCFA 5IK7A 3ILNA 2A70A 4LBJA 4JP0A 5CA6A 4XILA 4JAWA 3UJOA 1E0OA 3O4AA 2DRYA 1LHUA 3POSA 3T2TA 3ZSMA 2VW1A 1DYPA 4XTMA 3O5WB 4Q9GA 2X2TA 1DIWA 2E53A 3WDVA 3C8AA 3ENRA 1PZ9A 4G9NA 1YTOA 2J3PA 3AP6A 2G4IA 3SNMA 2D3SA 2A6WA 4U2AA 1MD6A 3AKFA 1N3QA 4WZFA 2DTWA 1YIFA 2DUQA 2P3JA 2K8RA 3AJ5A 2NMOA 1IHKA 4IY8A 1DQGA 1YYNA 1RIRA 2CWSA 3AYEA 5GZFA 4YW4A 41BIA 1NUNA 1W6MB 2PHUA 4QKRA 3JUTA 1P63A 5KXEA 3NWKA 1V6XA 2NZ9A 2A3WA 4J2YA 3HOMA 3MPPG 1DQ0A 3B9UA 4YM2A 3I29B 1YBIA 2HWMA 4GA9A 4C1WA 1HWMB 1FMZA 4G6JA 1IKQA 2GNBA 1BFCA 4DRVA 3V0BA 4FP2A 4AWDA 3ILAA 1W6PA 3FBYA 1N1YA 2R0HA 4OWLA 1K5UA 5DUVA 3FJHA 3B9CA 1R8OA 3DUIA 5JMCA 1DLLA 1JY0A 1VLNA 2NVHA 3HBWA 3RRDA 4M01A 5DZFA 3AH2A 3TB0A 4Y1XA 2IMCA 2FFVA 1AXZA 1HWPB 3F1RA 3WMVA 4Z8SB 1SCSA 3BAGA 1LHOA 4I3NA 2D3PA 1UZYA 2D6PA 4UW4A 3WG2A 5I1BA 3F62B 4R9DA 3ZUSA 2D23A 3D7WB 4M3CB 1YRZA 3ZYRA 3VSFA 4Y24A 4FPYA 3ZX7A 1GZWA 1QOOA 7I1BA 3ZSJA 5IK4A 1LU1A 3O44A 1QDCA 2DRZA 4YGDA 1HCDA 4XHBA 4I4SA 2Q3NB 1J1TA 2A6VA 2UUSA 1AVUA 3HN1A 2ETFA 1GV9A 1AX0A 2UURA 1JTCA 1CJPA 2JKBA 2ARXA 2XOAA 2AAIB 2SLIA 2V73A 2WLQA 1HKNA 2DUOA 4GP0A 3O0WA 2VLCA 2NN8A 3QLQA 3CA3A 2DURA 4DENA 1MR5A 4ASMB 1BLAA 4FPOB 4HEVA 5T5JA 4EB2B 1H9WA 3VWCA 1DQ2A 4XOGA 4EKXB 5GLZA 1QDOA 3DDAA 1JN2P 3QCWA 3BAHA 4G1RA 4LBQA 3FUOA 3FJKA 4YW1A 4HANA 1APNA 3RSJA 1XTFA 5F8SA 3BA7A 4R9AA 2FDBM 4D0ZA 5H9QA 1QQKA 4XBNA 3BAQA 3WOGA 2GN3A 3IAGC 2R1DA 3ILFA 3KMVA 5DG2A 1G9AA 4Y1YA 3M3EA 1BJQA 5GZGA 1ILR1 2FPQA 2A6ZA 3NBDA 4DEPA 5T50A 3NV2A 5B2HA 4DPNA 2ARBA 3BA5A 3U4XA 4XJWA 5E89A 1ULCA 2Y9FA 2I2SA 2VU9A 1DQOA 1A8DA 1JBCA 4P0LA 1XTGA 1M16A 1W0PA 2LTNA 3WO4A 3MALA 2ISHA 4EFPA 2DVBA 5BXRA 3ZC8A 2IHOA 1WD3A 3AP4A 4YZ3A 1KITA 2D6MA 3ZYPA 1AVAC 4HJJA 3OYWA 3N35A 5EG6C 2IMAA 1DQ1A 4ZLBB 3E8LC 3EF2A 2ZGTA 1TOOA 3V64A 2ES3A 1LHVA 4XHXA 1BARA 4X39A 1PUMB 1SLLA 5DG1A 3WINA 5GLUA 1SBEA 4I4YA 2XG3A 3HMYA 31BIA 1AVBA 3USUA 3M3QA 1WLDA 5BXSA 5BXTA 3QW8A 4GWNA 3OPZA 3W59A 4TYSA 2EALA 1RMLA 3UJ4A 2AENA 1W3AA 4YW5A 3HALA 4Z8BA 3W58A 2EXHA 1N1SA 2R9KB 3AYAA 3DS9A 5T55A 5JDBA 1VCLA 1JXNA 2IMBA 1MVQA 1PZ8A 3VUOA 3A21A 1G9DA 4GOYA 3TAYA 1SFYA 1G7YA 3OY8A 4KBBA 4P9YA 2ZMKA 3JRRA 3FJ9A 2A6YA 4AN7B 4GXLA 3CU1B 5DUWA 4DQAA 1UKGA 1WUVA 2LALA 1N1TA 3BRDA 2XHLA 4LO0C 4FVVA 1QU0A 2HW9A 4FOYA 1CONA 2NP0A 1N3PA 1JLYA 1LTEA 1WW6A 1V6NA 1DQ5A 2ZGQA 2K43A 1UX6A 5GALA 2Z49A 3PVNA 4F34A 1SLTA 4L8QA 2YUGA 2VXRA 5LK5A 2ZGOA 5H9RA 1LOFA 4U36A 2CL2A 2A5ZA 2KI4A 2F2FC 2JD4A 2NM1A 3LTQA 3M2MA 3D5OA 3ZSKA 4LBNA 4XMAA 3B69A 1BA7A 1IOAA 5BQMB 3H6RB 4AYUA 2ZHMA 3SH5A 4YG3A 2AFGA 2CTVA 2ZKNA 5T52A 2GMPA 3A22A 1MS5A 4J2SA 3I2AA 9ILBA 2Z48A 4XYXA 4YM1A 1OQLB 4R9CA 1FQ9A 2ZA9A 3NV4A 5JOZA 3SH3A 3UD8A 1LOCA 1MS3A 3FIEA 5CNAA 1TWMA 1KDKA 3MW4A 2W2DB 4LO3A 5IT6A 3N36A 4SLIA 1ZKXA 1CPNA 4XDQA 1LOGA 4L4HA 1G86A 4Q9PA 5GLWA 3FJBA 1MS9A 1QNYA 2ZACA 3Q9OA 1ZL6A 1BYHA 2DTYA 3AXEA 3AKGA 4Y1UA 4A7KA 5BQUC 3FFZA 1LOAA 4ZFYB 5SV8A 1N3OA 3NBEA 4XXPA 2E7QA 1OFSA 2UWAA 1V6VA 2EXJA 1KJRA 3ASIA 4QO3A 1PC8B 1GICA 2ERFA 3QJ0A 4OEEA 2P3IA 4MYEA 1HCEA 1FX5A 2D1ZA 1CVNA 1Z4SA 3FGMA 3GNEA 2GNMA 3BOKA 2D6KA 4CZSA 1TTUA 5G00A 3MEPA 4AVVA 5T5OA 3SLIA 4I2SA 4XBLA 3SITA 2ZMNA 1ITBA 3CA6A 3VSZA 5BP5A 3JUUA 1C1LA 2BFHA 4QKSA 3AX4A 3A0KA 2ZAAA 1LULA 3WG4A 4EL4A 3AJ6A 2KLLA 1JOJA 4X3AA 1RINA 1GKBA 1G9CA 3QW6A 1FWUA 2E51A 1W6NA 2HZ9A 5H9SA 3FJEA 1BKZA 1Q8OA 2YZ4A 4FPHA 1AZDA 1BZWA 4GAFA 4ATEA 1HKDA 4ENDA 3A07A 3WZ1A 1I1BA 1FNZA 4LO7C 5DUXA 3PVOA 3RS6A 1WBFA 4GWMA 3QIYA 2AR6A 1LEMA 4Q1PA 4UW6A 3IN9A 2F8XC 3BA4A 4X37A 1JT4A 1Q8SA 1WBAA 1NXD1 3CA4A 1JW6A 5BOWA 3WCRA 2E7TA 1ISVA 1S0DA 1QOSA 5JOYA 1LECA 1JT5A 1V6OA 1VIWB 1LOEA 4P9WA 4YGBA 3IPVA 3O4DA 2V5YA 5EYXA 5EYYA 1HQWA 1TIEA 3AKIA 2YXSA 1D2SA 1V6LA 5BQNA 1TEIA 4Y26A 3CRGA 1IS5A 1W6QA 4USPA 3WHUA 1UZZA 4GP3A 2ZHLA 2ZMLA 1T4QA 4ZOTA 1BFGA 1MACA 2VW0A 4ISRA 2R1BA 2E4MC 1V6IA 3FLPA 1QOTA 1WW7A 3BB2A 1KQRA 1LESA 3BOOA 5GJ6A 1IOBA 2D44A 4CJMA 1FATA 3V0AB 2PHWA 1WD4A 4Q8LA 2Y9WC 2ZGSA 3N7KA 3WV6A 2P37A 1HIBA 3LSEA 2D6OX 1FN0A 3POYA 2A3YA 5FREA 3BX1C 2JE9A 1ULFA 4DFSA 4Y20B 1QF3A 2GO2A 4DCKC 2KH2A 2ZGMA 4BOWA 2VUAA 4II0A 5L73A 1RZOB 1HWOB 4YW2A 4XFUA 1AFCA 4KTXA 1SR4A 1MVEA 4ZJXA 3RTJB 3WCSA 3SNVA 4PQ9A 3M3CA 3NJ5A 1ISZA 1F9KA 1W6OA 1GNHA 1BASA 4D69A 1BXHA 4J1LA 3FJFA 3PVEA 5H9PA 4LBKA 3S8JA 1QMJA 1C57A 4XJ8A 3ILRA 1AVWB 2DVFA 1ZL5A 3AZXA 2A71A 3NV3A 2ILPA 4JPZA 1QXMA 2UWBA 4JKQA 3AJZA 1OQ1A 1SACA 4TZDA 4JKXB 3WA1A 4AN6A 2D7IA 1FAYA 1V6KA 2JE7A 1UN1A 1ZA4A 2B7YA 1BLDA 3UJQA 3VV1A 4OW4A 1ZM1A 1DZQA 2RG9B 1ENQA 4YZ2A 1AJOA 3VKNA 4LO8B 2VSAA 2DWRA 2A97A 1N1VA 5T54A 3B01A 3QYDA 4FPGA 1DQ6A 1ZKWA 1G9BA 4XIOA 2A3XA 1LODA 1BFFA 4I4RA 1LGCA 4GKYA 3QIXA 3BIWE 3ZXLA 1W3FA 1Z78A 3WG3A 2IWTB 5D61A 2AUYA 1ABRB 1N4KA 1PZZA 3C2UA 1TFMB 4LO2A 2LIEA 5E88A 4FPFA 2H0BA 3O5SA 4ZFUB 4BM8A 3N7MA 1HQLA 3Q7XA 2MC2A 4YW3A 4KEIA 1EPWA 5F8YA 4P0JA 1G9FA 3O0XA 2C5DA 2ZQNA 1WLCA 3ZXFA 4Y22B 2GNDA 1C1FA 3VKOA 2Z42A 3BAOA 1AJKA 5CAZA 1UMZA 2GMMA 1F82A 2DV9A 3AKHA 1WCSA 3ZPYA 2Y9XE 3PG0A 4JRAA 2ZHNA 2WJSA 1ZN3A 3IKWA 1H9PA 4H55A 2WQZC 4GKXA 2FGFA 3M3OA 2W39A 2WRYA 1J0SA 1YI7A 2ZGRA 5GLTA 4JCKA 4XE9A 1W6MA 2ESUA 4I6IA 4LBMA 4Y1ZA 3C9ZA 2AGSA 3UD9A 2D43A 2R49A 3Q7WA 3WNXA 3WINC 4Q26A 3HSMA 4YG6A 3NV1A 3WLUA 4OZXA 4HL0A 2UU8A 4JC1A 3N0KA 4XKIA 1DBNA 1T9FA 3UD7A 3MW3A 1V6UA 2AYHA 4I8MA 4YFZA 1D0HA 1LGNA 3D6EA 3ZXJA 3ZXGA 4GOVA 1QNWA 4LO7B 2JECA 3WO2A 5F8WA 2K4AB 3K1XA 1CE7B 2DUPA 2G7QA 3O49A 4ZFWB 1CQ9A 2A7AA 2YMZA 3ZXKA 2HYKA 4QD2C 1QQLA 4Q27A 3P53A 2ZHKA 1JT3A 3QR5A 3I2XA 1GZ9A 4LO1A 2OUHA 1AXMA 1II4A 4FQ4A 4YGEA 4IY9A 3V79C 4PC4A 2EIGA 1YO8A 1MC9A 1S1AA 3FJAA 1DFQA 4Z9WB 3PUBA 2D3RA 4XJZA 1F5FA 2OW4A 3ZSLA 4I4PA 4M3CA 5DVHA 3APBA 2P23A 1O4YA 1K5VA 1MS0A 2VY0A 1XYFA 5E8AA 4J2XA 4XJUA 1LOFC 1N47A 1TWEA 1AXYA 4H04A 1AX2A 3QW7A 3M1HA 4YZ1A 1SCRA 5GZCA 2CY6A 3AZVA 4LBOA 1IS4A 1ONAA 3CRHA 4EFRA 2VXTI 3VKLA 3V0BB 3OGGA 2ZQOA 1UPSA 3WDYA 2BEAA 1W6PB 2WBCA 3T8SA 2GALA 1VAMA 1XG6A 4I96A 2DU0A 4F83A 1Q56A 1WBCA 3T1LA 1MZ5A 3FLRA 4M3CE 3IM6A 4WVVA 4OWJA 4AGRA 1DJSB 3WO3A 3WDUA 1DHKB 4JQ0A 3DGTA 3DEBA 1IS3A 4OUJA 3WMUA 2PELA 1AVXB 4FPEA 1I3HA 2PHRA 5HCBA 4ZKTB 4FQZA 4CTEA 4LO3C 3RMYA 5EC5A 2GN7A 4G6MA 5GLVA 2Q5TA 1HWNB 1G82A 5AVAA 4FOQA 5FZZA 1EV2A 5BVPI 2DVDA 3C88A 4LBLA 2GZBA 4BMEA 1NLSA 1GZWB 4I7IA 3RMXA 1T3CA 3GALA 4XIKA 4QBVA 3AP9A 1MZ6A 1Z0HA 3ATGA 1YVGA 3BWIA 1QGLA 2RSTA 1WW4A 3VKMA 5JOXA 2DREA 3LCPA 2EF6A 5EXOA 3NF3A 3OJVA 1WBLA 4XZPA 1YXWA 1JHNA 4KEKA 3BRGC 3K3QB 4Q1RA 1H30A 3AXDA 3S8KA 2HWAA 4Q8KA 3AH1A 1IT0A 2ZGUA 2WKKA 4Y1VA 3O4OA 5BP5C 2D7FA 4YGCA 4BPZA 3WG1A 1V00A 3LSDA 2CYFA 3BADA 3A4UA 5KXBA 4D0TA 5FNXA 4FPLA 4DS0A 1RG8A 1ONKB 4H9WA 2A8AA 1GLHA 3FJCA 1Q03A 2W52A 2ZGPA 4LBQB 5D62A 4IZEA 4WV8A 4YZ4A 1GYKA 21BIA 3BTAA 3BODA 4J2KA 4UW3A 1MS8A 3O0VA 4HR6C 3OJBA 3A23A 2R16A 1JQZA 2C9AA 2FMDA 5DXDA 2VH9A 4XJ9A 3WUCA 3IM7A 3CAHA 8I1BA 1T3AA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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