4F83A

Crystal structure of the receptor binding domain of botulinum neurotoxin mosaic serotype c/d with a tetraethylene glycol molecule bound on the hcn sub-domain and a sulfate ion at the putative active site
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
416
structure length
413
Chain Sequence
SINDSKILSLQNKKNALVDTSGYNAEVRLEGDVQVNTIYTNDFKLSSSGDKIIVNLNNNILYYENSSVSFWIKISKDLTNSHNEYTIINSIKQNSGWKLCIRNGNIEWILQDINRKYKSLIFDYSESLSHTGYTNKWFFVTITNNIMGYMKLYINGELKQSERIEDLDEVKLDKTIVFGIDENIDENQMLWIRDFNIFSKELSNEDINIVYEGQILRNVIKDYWGNPLKFDTEYYMINYNYIDRYIAPKNNILVLVQYSDISKLYTKNPITIKSAANKNPYSRILNGDDIMFHMLYDSREYMIIRDTDTIYATQGGQCSKNCVYALKLQSNLGNYGIGIFSIKNIVSQNKYCSQIFSSFMKNTMLLADIYKPWRFSFENAYTPVAVTNYETKLLSTSSFWKFISRDPGWVEHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural insights into the functional role of the Hcn sub-domain of the receptor-binding domain of the botulinum neurotoxin mosaic serotype C/D.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Type C neurotoxin
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 109
structure length 413
sequence length 416
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4f83A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4f83A02
1YXWA 2WSVA 1D0HA 4WBCA 2KKIA 4F34A 3H0OA 2A3WA 1W6NA 2GN7A 4XZPA 4XXAA 2W39A 4Q8KA 4KEKA 3MW4A 1ENRA 4FPYA 2EXHA 3PHZA 3AH1A 4OEFA 1GSLA 1WW5A 3B01A 1MS0A 3MEPA 1VAVA 2GNMA 2LIQA 1YIFA 3OBTA 4QC4A 4USOA 3ZSLA 5HCAA 1QNYA 3AJ5A 1MC9A 3WDXA 1VLNA 3AYEA 4G1RA 1J1TA 3WO3A 4HR6C 3QCWA 4YM0A 4LO2C 1G82A 3C2UA 3PJQA 1F5FA 2YMZA 3VV1A 1WD3A 1DQ0A 2C5DA 1N1VA 1V6VA 4AVSA 4ZKTB 3APBA 2FDBM 4YW3A 2PHRA 1EPWA 2BFHA 1TTUA 1DLLA 4I0YA 1V6KA 2DVFA 4P0KA 2R0HA 2P3IA 1MS8A 3O4BA 5DXDA 4BLJA 4ZA3B 4FOYA 2XOAA 5F90A 1SCSA 1BLDA 2SBAA 3HN1A 4PBPA 1T9FA 1DFQA 1ITBA 1X50A 2EAKA 2MLLB 3I2AA 5DUUA 2R1BA 3AP6A 4D0TA 2NZ9A 3WZ1A 3F1RA 3LCPA 2ET2A 3OJ2A 3N7MA 1BFGA 3B3QE 4FPGA 4YFZA 4AVTA 4ISRA 5E24E 1APNA 4I37A 4X3AA 1G9AA 3AJYA 3I29B 1II4A 4LBQB 5FREA 3V0BA 4I96A 4YZ1A 1FAYA 3ZC9A 4Y22B 1GKBA 1DQ6A 4DS0A 2D20A 1FV3A 5T5PA 1AXMA 4USPA 4Z8SB 3ZXKA 2LTNA 4YM1A 1FQ9A 1WBLA 3F62B 3UJQA 1GNZA 1JXNA 5BXSA 2D3SA 3WHTA 4YM2A 5D62A 2HWMA 4Y1YA 2H0BA 1S0IA 2E7TA 1V6NA 4FGFA 3ZX7A 2JJ6A 2HWAA 5DG2A 4I8MA 2CY6A 1XZZA 1WW6A 3SLIA 3R4SA 1TWEA 1JLXA 3MALA 1UAIA 1LGCA 2DVGA 3USUB 2PHWA 3O49A 1YTOA 4FOWA 1BFFA 2WT1A 4Z9WB 4ISQA 2Y9FA 3WMUA 2VUAA 3D6EA 2DWRA 4LBLA 4QD2B 3O5SA 4XHXA 3CQAA 4GKXA 4ZBVB 3UDAA 3ZXFA 2WT0A 3S8JA 4EEEB 1W3AA 4AYUA 1CIWA 1SFYA 3QLQA 4W65A 2ZGQA 3UJOA 1BA7A 1AX2A 2VY0A 3AZXA 3VT1A 4I2SA 1ULDA 2UURA 2ZGPA 1G9DA 4P0LA 5EC5A 3WDVA 9ILBA 4HL0A 2DTYA 3OY8A 5KXDA 1V00A 5CB7A 1ONAA 1UX6A 4L4HA 4XJWA 3SNVA 1CR7A 1W6OA 4Y1XA 3VUOA 1SR4C 4X38A 5SV8A 2ZHKA 1CVSA 1LOFC 2YROA 5T5JA 4LO1C 1VALA 1JT7A 3O4OA 3CA3A 3Q7XA 3AKGA 3NBEA 4P9YA 4BOWA 4LBQA 4YW5A 2AGSA 3O5WB 4Y1UA 3PUBA 3IM0A 5DZEA 3A22A 2D6LX 4A7ZA 3N7LA 3A23A 1ENQA 4XIKA 2ZGLA 1IHKA 4YM3A 4XMIA 1T4QA 3SITA 3SH5A 4LBOA 2ERMA 1YBIA 2WNEA 3IM6A 1ISVA 4XJ8A 1IS5A 3T8SA 5CBLA 3NBDA 3BRGC 4R9BA 5BOWA 3ZYRA 1GNHA 1GBGA 4WVVA 1IILA 1LENA 1CESA 2D3RA 5DG1A 2P39A 3WCRA 3HMYA 4G9MA 2K4AB 1NZKA 2ZGKA 3WDYA 2GDFA 4AGRA 1TP0A 4R9CA 3POSA 1HDKA 4LBMA 3ZSMA 2WKKA 2WRYA 4M3CA 2ZHLA 4XJUA 4OW4A 5BXTA 1ZA4A 4H9WA 1PC8B 3A0NA 2W68A 5T5OA 2ZGRA 4OZXA 1JOJA 2GMEA 2A6XA 3NV2A 3VWCA 1S0LA 3FJFA 1QQKA 5JVVA 3RG0A 5FZYA 3M3CA 2CNAA 4Y1VA 4PC4A 1GZWB 2CL2A 2CWMA 5GALA 1O4ZA 4LBJA 2A3XA 1AXKA 3BAUA 1W0PA 1FWVA 3P6IA 3FJBA 3AYCA 2J3PA 4XILA 4M3CF 3W9TA 2EIGA 1HWPB 3R4UA 1SCRA 1LESA 5DUWA 1WLCA 4FVVA 1G8WA 1FATA 4NOTA 2ZGUA 2TEPA 4JRAA 1ABRB 1IRPA 1G7YA 5BXRA 4G6JA 4IZEA 1DFCA 4I4PA 2WSUA 1N3QA 3B69A 3M3EA 5T54A 1SLIA 4JQ0A 1MS9A 3UJ0A 4YW2A 3CU1B 2P34A 1SLBA 2YUGA 1WUVA 3AYDA 2DVDA 5GLUA 1MS3A 1JTCA 1EV2A 5BP5A 4XJ9A 3BAVA 4I4VA 1QU0A 4JKQA 3WG2A 1B09A 4OUJA 3V79C 1IKPA 1XHBA 1Z4SA 2XG3A 4Y26A 1S0JA 4BMEA 1W6MA 5BVPI 3HALA 1JYCA 1MS5A 3UL2A 1FMMS 1H30A 1G86A 2GZBA 3FJAA 4GP3A 4YGCA 1JHNA 2Y9GA 4YW1A 2DU0A 2D24A 4Y20A 3ASIA 1Q8SA 1CE7B 2PHTA 4D0ZA 4M3CE 4M01A 1S0BA 4J2SA 3NBNA 3WUDA 2D6PA 3O3QA 3AH4A 1ENSA 3BB2A 5DZFA 3AYAA 3FJJA 2OUJA 2ESUA 5IK5A 1V6XA 1FX5A 1LOFA 1NUNA 2DTWA 2R9KB 1OQ1A 2EXJA 4PQ9A 1GLHA 3JUUA 4A7YA 3BRDA 3VEQA 2ZACA 1HWMB 1IS3A 1FMZA 1F9KA 4TLPA 3QR5A 2DS0A 1C4RA 1QKQA 4BMBA 4I7IA 1IKQA 4IYBA 4NO4A 5H9PA 1DYPA 2IHOA 2DVAA 1HKDA 1IS6A 2KI4A 1LGBA 2WLQA 4I4UA 4II0A 5GLTA 4HJJA 3R05A 3B9CA 3MW3A 1WLWA 1V6JA 4GWMA 4DPNA 3FLPA 2Z49A 5IK4A 2HYKA 1CVNA 2JECA 4M00A 2ZMKA 4I4YA 1CJPA 1Q03A 4P9XA 3IM5A 3WG4A 1BLAA 1LOCA 3HOMA 4IY9A 3MPPG 1DQ5A 3WCSA 4GA9A 5GLVA 1N1TA 1LOGA 2Y9WC 3AX4A 1SBDA 1N3PA 1AVBA 3AP5A 2UUSA 2UU8A 1OKQA 1LGNA 2ERFA 1ULGA 1WBAA 5G00A 1JUIA 2KH2A 4WV8A 4K20A 4R9DA 3D7WB 1CPNA 2DRZA 2KI6B 1XYFA 4LO0A 2WT2A 5F9TA 5GZGA 3T1LA 1Z0HA 1AJKA 2GN3A 3N0KA 1R8OA 4GAIA 1RINA 2D44A 3VKNA 4RL7A 5IUQA 3OJMA 4I4SA 1WBFA 3PMEA 1E0OA 2VLCA 4ZLBB 2WJSA 2D22A 4XBQA 4YG6A 4YZ5A 3JU9A 3WG1A 2VSEA 3TB0A 4PBOA 1YYNA 3CNAA 1MZ6A 1MS1A 3DUIA 3D5OA 1S0CA 3WV6A 1QMJA 2CYFA 5GAQA 1HQWA 1IOAA 1CQ9A 1V6WA 2QYIB 5IK8A 3DGTA 5GJ6A 2KM2A 5T5LA 4EFRA 5DUYA 4JCKA 1DBNA 1IS4A 1QF3A 1HKNA 4XIOA 4L8QA 1DJSB 4QD2C 1FGAA 1TEIA 3WOGA 4CTEA 3LSEA 4P14A 3M3OA 3OJBA 4OWKA 2Q3NB 1DQGA 3A0KA 4XJZA 1AX1A 3BADA 1AXYA 2FMDA 3WINC 3UD9A 3O0XA 3O44A 2QN4A 1RG8A 3ZXLA 3N35A 3CRHA 3AJZA 1LJ7A 2ZGSA 2P2KA 1KQRA 4SLIA 3RRDA 5DZUA 4XYXA 1AXZA 2ZGTA 5JOWA 2K43A 4U2AA 3RTIB 3FJEA 2NMOA 5DUXA 1GV9A 2VW0A 1PUMB 2DUQA 2OW4A 3AKIA 2ZHMA 5H9SA 4EFPA 4DQAA 1QOTA 1QOSA 4FP2A 4R9AA 2D6MA 4OWLA 3ENRA 4XOGA 1G9CA 3VKOA 1K5UA 1JBCA 1HLCA 1DQ2A 4PCRA 4AGGA 3LSDA 2AUYA 4EB2B 2AQZA 3FGMA 5BP5C 3EF2A 1MZ5A 3CRIA 1WBCA 1DQ4A 1TWMA 3M2MA 3AZVA 2A3YA 3S8KA 1HCDA 1ILR1 4ZOTA 3FFZA 3KMVA 1R1ZA 1LHOA 1LU2A 3OYWB 4HA2A 4I6IA 1RMLA 4RA0A 5JOZA 4ZFUB 5JDBA 3PVNA 3IKWA 1AVUA 1AF9A 4JKXB 1S0GA 4GP0A 3IM7A 3K1XA 2DYCA 3MW2A 1JY0A 1A78A 3O4AA 2EXKA 1W6PB 3POKA 5CNAA 1BZWA 3AZYA 1H9PA 2D23A 1IT0A 3WG3A 1P63A 5EWSA 2Y9XE 2UWAA 1WW7A 1DQOA 1PWAA 4FP3A 4GWNA 3WVJA 4Q1RA 2D6NA 3IMNA 3CRGA 4XDQA 2LALA 1MS4A 2AREA 3FJ8A 3ILAA 4BQ1A 3WLUA 4ENDA 4UW3A 1JT5A 3HR9A 4ATFA 3O12A 5FZZA 4Y22A 1M16A 1KJLA 4UW5A 2GNDA 3AP7A 4DEPA 4I4RA 2VH9A 1ONKB 1G9FA 1IJTA 2A71A 3A21A 3W59A 4GXLA 5CAZA 4ZGRB 4H04A 4CJMA 3FUQA 3AFKA 5L73A 4Q26A 2A7AA 2NM1A 1AVAC 4AWDA 4D69A 1BJQA 2Q9XA 1AJOA 2W08A 4KBBA 4Y1ZA 5EYYA 1GZCA 3ZSKA 4QKSA 5KXEA 1SZ6B 3WNXA 3USUA 2ZR1B 2K8RA 1Q56A 1Z2VA 2EALA 1O4YA 4I4OA 3AP4A 1W3FA 4XE9A 3O4CA 1W6QB 4BPZA 2YXSA 1DGLA 2D7RA 3CA0A 1NLSA 1DYKA 1SLLA 1XQNA 3VKFC 1WCSA 1HWNB 3AP9A 4ITCA 5DVHA 1YF8B 5GZEA 1BARA 3UD8A 4LO0C 4C1XA 4LO7B 3OYWA 5D61A 1V6IA 1TFMB 2F8XC 1WW4A 3WINA 1W0OA 3NJ5A 4J23B 5AVAA 3H6SE 4XTMA 4FQ4A 4XJAA 2A70A 2A6ZA 3OGGA 4QKRA 3OPZA 1OQLB 1W6PA 4YFWA 4ATEA 2D3PA 1J0SA 3IN9A 1EVTA 2FGFA 3T2TA 1JLYA 8I1BA 1CONA 4OEEA 1V6LA 1FN0A 2XB6C 2MC2A 3B9UA 3SISA 1QNWA 3NV1A 2I1BA 5DSSB 3H6RB 3ATGA 1LECA 3SNMA 4FPEA 3VKLA 1PZ9A 2A6VA 1FNYA 4JC1A 4FOVA 2L5XA 2UWCA 1LHVA 2R1DA 1VCLA 2NP0A 2A6YA 3BAQA 31BIA 2V73A 4G6MA 1GZ9A 2ZMLA 4Q27A 3WHUA 3CA6A 1DHKB 4DRVA 1LHNA 3A07A 3BA7A 2VXRA 5BYNA 2A6WA 4ZFYB 3AZWA 3VKMA 1V6UA 1N3OA 1A3KA 4J2KA 5IK7A 3WO4A 2E51A 3WDWA 2DREA 4KEJA 1BFCA 2CWSA 4YG0A 4DRRA 1W6NB 1LOAA 4PF5A 1I3HA 2CTVA 2F2FA 4EKXB 1DZDA 3GALA 3BX1C 4LBKA 1W3GA 4TZDA 4K21A 2NN8A 5LK5A 2BEAA 4L4IA 1Q04A 1PZZA 4XTPA 2YZ4A 3I2XA 1W6QA 4FQZA 1LOEA 1ISWA 4Q2FA 1TIEA 1I1BA 4GAFA 4XHBA 3ZXGA 4YG3A 5GZDA 3CA1A 2PHUA 3P6JA 1R8NA 3CA5A 4I4QA 1GYKA 4QO3A 2Q5TA 3PVEA 2ZQNA 2DVBA 5GZCA 2FHRA 1JYIA 3ZYPA 4AN7B 2OVUA 4I4XA 2AXMA 3NWKA 3ZXJA 2ZGOA 1Y7BA 4AN6A 1BKZA 3FJDA 1GZWA 3PG0A 3JRRA 1GICA 1UL9A 4LBNA 2AFGA 2NVHA 4D8HA 2P23A 1UKGA 4A7KA 3M3QA 1MVQA 3V0AB 2D1ZA 5BQUA 4IONA 5B2HA 3O0VA 1HQLA 1XG6A 3H6RA 1SLTA 3VSZA 3FLRA 5KXCA 1Q8OA 1QDCA 5IT6A 1LHWA 1KDMA 3T1MA 3SH3A 3FLTA 3ILNA 1BASA 1UN1A 2R16A 4YGDA 1ISYA 5FNXA 3V0BB 3HSMA 4C1WA 3C9ZA 2SLIA 4H55A 1MR5A 2EF6A 4I1BA 4YOLA 1KJRA 2E7QA 2DV9A 3D4KA 4Q1PA 1SLAA 4Z8BA 1AVXB 3CA4A 2P37A 3INAA 5CA6A 1ULCA 1QGLA 3RSJA 3CAHA 2VU9A 4LO8B 2GMMA 2HW9A 1KITA 2JKBA 5EG6C 1A8DA 1S0EA 2D43A 4I1EA 4G9NA 4Q9GA 1Q1UA 1GANA 1S1AA 3RTJB 5F8SA 2IWTB 4YGBA 2NTDA 1DIWA 1RIRA 1SLCA 4WVWA 1KDKA 2EXIA 1ULEA 1JQZA 1ZM1A 2GMPA 1YI7A 3E8LC 1HIBA 2I2SA 4TYSA 2M49A 4CRQA 2YY1A 1C57A 3AZZA 5I1BA 3BA5A 1JT4A 4X39A 1D2SA 2ZQOA 3BAGA 1SBEA 2DU1A 4QBVA 3VT2A 5GLZA 4LO3A 1ULFA 1AZDA 2JDZA 1QXMA 5BXPA 4U36A 3V0AA 4YZ2A 3OY8B 1QDOA 1URXA 5H9RA 5GZFA 3V65A 3NV3A 2BQPA 4GKYA 3RMXA 1BFBA 3RQ0A 1QOOA 2E4MA 2W52A 3WA1A 1LODA 1W6OB 2WBCA 4FPKA 2Z42A 5HCFA 4QBCA 3GNEA 5GM0A 2ZAAA 2BEBA 3LLPA 1CN1A 2NYYA 2AR6A 5H9QA 3V64A 4XXPA 4CZSA 1LU1A 3AKFA 3N36A 4LBQD 1DQ1A 4DFSA 3KQRA 3O0WA 4DCKC 2ES3A 4ASMB 21BIA 5E88A 4P6AA 1KNMA 1JT3A 1Q8PA 4IHZA 3AJ6A 5DUVA 1LOBA 1N1YA 4XMAA 3AXEA 3I8TA 1RY7A 2B7YA 2P3KA 4JP0A 2AYHA 2X2TA 3IIRA 1N4KA 1S0DA 2RSTA 4OEGA 3A4UA 1MACA 3W58A 1QQLA 1BYHA 3BAOA 2ARXA 3O4DA 4ZXKA 2D7FA 3N7JA 4AVVA 1Q8QA 2WQZC 4UW6A 4OWJA 2F2FC 1V6OA 4JPZA 2VW1A 5JMCA 1L2HA 4XKIA 4Q91A 4IZXA 2P3JA 1AFCA 4M3CB 3M1HA 4YZ4A 5T50A 5E8AA 1C1LA 1CPMA 2FFUA 2DUPA 3ZPYA 3PVOA 3N7KA 7I1BA 5JOYA 3IAGC 3WUCA 1KRIA 3UD7A 1UZYA 1RZOB 2E53A 2ZGMA 6I1BA 4LO7C 3TAYA 4FOQA 3I4IA 3ZXEA 2OUHA 2R0FA 3FBYA 4YW4A 1VAMA 1LTEA 2AAIB 1PZ8A 4P9WA 4XFSA 3OGFA 3WMVA 1K5VA 4K1ZA 1LCLA 3BTAA 4BLIA 1GGPB 3BODA 2LIEA 3BOPA 3KM5A 3LTQA 2ZBJA 2UWBA 1TOOA 3L2YA 2DURA 4XFTA 5BQUC 1OFSA 4XBNA 3RMYA 2ENRA 1FWUA 4FPJA 3FJKA 41BIA 1C1FA 1I1EA 3B00A 2HZ9A 3H6QA 2MIBA 1IOBA 4LO2A 3OBRA 4K1YA 3ILFA 2KLLA 5T52A 2NMNA 5FZUA 3AXDA 2JE9A 3NV4A 1HCEA 4YLZA 1FYUA 3AKHA 1W6MB 2VXTI 2D6KA 2E6VA 4Q8LA 1SACA 4FPOB 5KXBA 5F8YA 1LULA 4J2YA 1LEDA 4Y20B 4FPHA 4X37A 3ZXDA 1G9BA 2RQ9A 1YRZA 3FJIA 4IQPA 4Y24A 2VSAA 5JLVA 5T55A 2ZMNA 1BXHA 4ZFWB 2ZGNA 4XBLA 1SBFA 1V6MA 5E89A 3ZC8A 4Q9PA 1WD4A 3IPVB 2AENA 4IY8A 4I3NA 1Z78A 1H9WA 3WDTA 3BA4A 4GOVA 4KC3A 1JW6A 2C9AA 3P53A 2VW2A 2JE7A 1Q8VA 1FV2A 1UPSA 2D7IA 2A5ZA 4BM8A 1AX0A 4P0JA 3FJHA 3FJCA 4FPCA 1MD6A 3WO2A 3POYA 3U4XA 4WZFA 3BIWE 4R6UB 4LO3C 1JN2P 3HBWA 3N3HA 1LEMA 2RHPA 5EYXA 4EFQA 1NXD1 2GALA 3FJ9A 5F8WA 1UMZA 2D6OX 1AVWB 2ZA9A 1PUUB 2GNBA 4GALA 1BQPA 2DRYA 1WLDA 2ZABA 2E4MC 2DUOA 2PELA 5GLWA 1ISXA 4JAWA 5DZGA 3ZVXA 3FUOA 3QYDA 3UJ4A 4FPLA 4UW4A 3UK9A 2GO2A 1S0FA 2JD4A 1DZCA 4YGEA 5EHAA 5F5QA 1F31A 2AH2A 3SH4A 3RS6A 2GNTA 3NBCA 5FRAA 1YO8A 5D63A 4YZ3A 4J2XA 4MYEA 1RITA 3AH2A 1ISZA 3TC2A 1MVEA 4HANA 4GOYA 2YV8A 1HWOB 3Q7WA 2Z48A 5HCBA 3AK0A 3Q9OA 3BRFA 2ZZJA 1SR4A 1DZQA 2R49A 3OJVA 4DENA 4FPFA 5EXOA 1EYLA 2G4IA 4I30A 3WDUA 3POWA 4QALA 4LO1A 1PZ7A 2FO1A 3IPVA 4XFUA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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