4F83A

Crystal structure of the receptor binding domain of botulinum neurotoxin mosaic serotype c/d with a tetraethylene glycol molecule bound on the hcn sub-domain and a sulfate ion at the putative active site
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
416
structure length
413
Chain Sequence
SINDSKILSLQNKKNALVDTSGYNAEVRLEGDVQVNTIYTNDFKLSSSGDKIIVNLNNNILYYENSSVSFWIKISKDLTNSHNEYTIINSIKQNSGWKLCIRNGNIEWILQDINRKYKSLIFDYSESLSHTGYTNKWFFVTITNNIMGYMKLYINGELKQSERIEDLDEVKLDKTIVFGIDENIDENQMLWIRDFNIFSKELSNEDINIVYEGQILRNVIKDYWGNPLKFDTEYYMINYNYIDRYIAPKNNILVLVQYSDISKLYTKNPITIKSAANKNPYSRILNGDDIMFHMLYDSREYMIIRDTDTIYATQGGQCSKNCVYALKLQSNLGNYGIGIFSIKNIVSQNKYCSQIFSSFMKNTMLLADIYKPWRFSFENAYTPVAVTNYETKLLSTSSFWKFISRDPGWVEHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural insights into the functional role of the Hcn sub-domain of the receptor-binding domain of the botulinum neurotoxin mosaic serotype C/D.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Type C neurotoxin
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 109
structure length 413
sequence length 416
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4f83A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4f83A02
1S0GA 1N3PA 2A3XA 4NO4A 4FPGA 4OWKA 3AP5A 2PHWA 4FPEA 5KXEA 2Z49A 3AYCA 4FOQA 3RQ0A 2F8XC 4JQ0A 1SR4C 1XHBA 4KEKA 5T54A 1SBEA 2VU9A 4P0KA 1Q1UA 1TFMB 2EXJA 1LOBA 4EB2B 3SH3A 1JLYA 1AX1A 1GZ9A 3SLIA 4QBVA 1V6JA 3CNAA 1S0JA 3FJKA 2VH9A 4XJUA 3I2AA 4ZA3B 4AWDA 3OYWA 3H6SE 2ZGQA 2JD4A 4HJJA 3TB0A 3WZ1A 4Q9PA 4YM2A 4ZFYB 3UD9A 1DZQA 1JN2P 3ZVXA 5GM0A 3ZXFA 3WO4A 4ATEA 4Q2FA 1CN1A 3AYAA 4TLPA 2VW0A 1FAYA 3FLPA 3VT1A 4LBQD 3LCPA 3ZSLA 4LBMA 2GMMA 2Y9WC 4YLZA 1JT5A 1IOAA 3ZX7A 4EFRA 2NZ9A 1KDMA 1WW4A 1R8OA 2R0FA 2EALA 3IIRA 5FNXA 3N7JA 1GICA 3SNMA 5H9RA 2ZHNA 1FMMS 3WCRA 5F8SA 5IK4A 2ZGTA 2P37A 1AX0A 3R4SA 3LSDA 5BQUC 4LO0A 3FJFA 3IM7A 1H9WA 1MR5A 5H9SA 1GNHA 1I3HA 2ZGPA 1AVAC 3WA1A 4YW2A 3WDTA 1Z4SA 4LO2C 1CE7B 1G9CA 5GZCA 4I4UA 3F62B 1JXNA 1SBFA 3AZWA 2R9KB 2Y9XE 1ABRB 3AYDA 1EYLA 4JPZA 1W6QB 3SITA 3BADA 1IS5A 1LOFC 3N35A 2DUOA 4JRAA 1XYFA 1F5FA 4IZEA 3JUUA 4X38A 4XJ8A 1WW6A 3B00A 4G6JA 4XE9A 3RTJB 2CWMA 2A6ZA 3N7MA 2ZQOA 4QBCA 1BFBA 1HIBA 3ZC8A 4D0ZA 5KXBA 2VLCA 4I4VA 2W39A 2CY6A 3RS6A 4HANA 3U4XA 5JOYA 3HBWA 3M3QA 2GZBA 3BAHA 5E8AA 1DFQA 31BIA 3WO3A 1FYUA 3OY8A 1DZCA 4AN7B 1MVEA 1AXZA 2KKIA 4XTMA 2P34A 1APNA 2AQZA 4QKSA 4DRRA 1LHVA 1WW5A 1WBLA 1ULDA 3VEQA 4R9CA 3O4OA 4GP3A 2NP0A 2A7AA 1W6MA 3R05A 4BOWA 4A7ZA 5AVAA 4TYSA 4F83A 3WINC 2DTYA 2AXMA 5E89A 2BQPA 1V6WA 3CRIA 4LO3C 4UW4A 5L73A 1TTUA 4YW4A 1BFFA 1G9FA 4I6IA 4GOVA 3VSFA 4G9MA 4RL7A 3IM6A 2A6VA 2OVUA 2AFGA 1GSLA 1O4ZA 2W08A 1WD4A 4P9XA 3USUB 1BXHA 2KM2A 1LGCA 4LBKA 3RMYA 1P63A 3QYDA 1ZA4A 9ILBA 1WUVA 4DRVA 3NV2A 2VW2A 2VSAA 4JC1A 3V79C 1V6UA 4Y1VA 5GLVA 4BPZA 4YZ4A 3W58A 1LESA 5JOXA 3ASIA 1FV2A 3N3HA 4LBNA 1CPNA 5CNAA 3VSZA 4USPA 3KM5A 3VT2A 4D0TA 3BAOA 5E88A 2PHTA 4ISRA 3ZYRA 3NBNA 1FWVA 4XKIA 2W68A 4J2YA 1DQ5A 1YF8B 4Q26A 4IY8A 1AF9A 1HLCA 2GMPA 5DSSB 1BZWA 2D20A 5EC5A 1SBDA 4WBCA 1W6OA 3ENRA 3HMYA 1W0PA 4W65A 1ZM1A 1R1ZA 3WMUA 4LBQB 4UW3A 4GAIA 4ZOTA 2K4AB 1CONA 1QNYA 3FJAA 5GZDA 5BXPA 1FN0A 2ZR1B 3KMVA 5GZFA 1NZKA 1I1BA 3HN1A 3AP7A 3BAGA 2CL2A 1BYHA 2BEAA 1FWUA 4LO0C 2GDFA 4LO7B 4XJZA 4Y20A 1KJLA 4XFTA 4Z8SB 3UJ0A 4R9BA 1YRZA 4GKYA 1MZ6A 1S0CA 2A70A 1QOTA 3WUDA 1KITA 4XBLA 4XYXA 2V73A 3WDWA 2HZ9A 2ES3A 1W3AA 1Q56A 2BFHA 3CA5A 2LALA 4MYEA 1LHWA 3VT0A 4OWLA 4FPCA 4I4RA 3CA4A 3WMVA 1SLTA 2ZMKA 1VIWB 4XDQA 3ZSMA 3GNEA 1K5UA 2UURA 3H6RB 4JCKA 4HR6C 5H9PA 1GKBA 5GALA 1Z78A 3D7WB 3ILNA 4YZ1A 2DTWA 3IKWA 4Z9WB 1C1LA 1AVBA 1HCEA 1BQPA 4I4XA 1LTEA 1IHKA 2WLQA 1D0HA 4K1ZA 4DENA 4Y26A 1FATA 2PHXA 3VKOA 3BODA 4I96A 4UW5A 5EYXA 4KEIA 3RSJA 4XMAA 1Q8PA 1PZ8A 5F8YA 1GYKA 1NUNA 5FRAA 1ONKB 1S0EA 4GKXA 1YTOA 2PHRA 2ZZJA 3VKLA 1UX6A 1MS9A 2AUYA 4I4YA 4GOYA 3I2XA 4Q9GA 4FPFA 3UJOA 5HCBA 2NVHA 1S0LA 1V6KA 4RA0A 2D22A 4YM1A 1QQKA 2EXHA 1AFCA 1WLWA 2D6OX 1SFYA 2ZGUA 1W6NA 5BXRA 1IT0A 4KEJA 3RRDA 4IZXA 3B3QE 3B69A 3P6IA 5F8WA 3V64A 3CA6A 3IPVB 1TWMA 3WG4A 2WSUA 2LIQA 3HALA 3BA7A 2D43A 2GALA 4J2XA 3OYWB 4WV8A 5DUWA 2GNDA 2FFVA 3N36A 3AH2A 5GJ6A 4C1XA 1JT3A 2UUSA 1DQ1A 2P3KA 2GO2A 3O0WA 3PMEA 2DVFA 3R4UA 3BTAA 1RINA 2ZACA 2BEBA 1N1VA 1LGNA 5DUXA 4YFZA 4X39A 2JKBA 2FO1A 1M16A 2D24A 2ZGRA 4P14A 1QMJA 2D6PA 5KXDA 3V0AB 3IM0A 3BB2A 4FP2A 1OQLB 4XZPA 5D62A 2Y9GA 2OUJA 2FFUA 3AKGA 41BIA 1WBAA 4XXAA 1C57A 5SV8A 2DU0A 2ZGKA 4BQ1A 4D69A 1KDKA 5GLWA 2FGFA 1LEDA 3NJ5A 5KXCA 4I4OA 4PC4A 3A0KA 4YW5A 3IMNA 3NBCA 1AXYA 1AXKA 3AJZA 3PVNA 2CYFA 4AVTA 4SLIA 1QOOA 4L4IA 1LULA 1ISVA 1W3FA 2HW9A 2XG3A 3ZXGA 2CWSA 3APBA 3MW4A 4AGGA 4H9WA 3MW2A 4BM8A 2SLIA 4U2AA 4XIOA 4CJMA 1NXD1 3WCSA 4P0LA 1HWNB 4AVSA 4L8QA 5CAZA 1FMZA 1GBGA 2XB6C 5EXOA 3QR5A 1CVNA 2UWBA 4ZBVB 4XFSA 2R1BA 4ZGRB 1BASA 3ZSJA 1V00A 2SBAA 1SLIA 2R0HA 3FFZA 1AX2A 2K8RA 5DG2A 4DQAA 4EKXB 1HWPB 5FNWA 4P9YA 1M2TB 5HCAA 2ZGOA 3WV6A 3FGMA 4AYUA 1JLXA 4M3CB 1IJTA 2DRYA 1PZ7A 2JECA 3WVJA 3MW3A 3VKFC 4J2KA 1ILR1 4GALA 2UWAA 4XJ9A 1AVWB 3M3CA 5T5JA 2Z42A 3AJ5A 3TAYA 2RHPA 3RMXA 1QDOA 3HOMA 5GZGA 1S0FA 1LHNA 1IS6A 2DURA 2F2FC 3POSA 1QGLA 3HSMA 5JDBA 4X37A 3T8SA 1TWEA 5T5OA 3FJDA 4AGVA 1GZWB 4Y1YA 3BX1C 3QCWA 2ZMLA 5GLUA 1GV9A 1CJPA 8I1BA 5GLZA 4P9WA 5IUQA 1ULGA 2DV9A 3AH1A 3O44A 2D7RA 2AREA 4YGCA 1QDCA 1Q04A 3V0BB 1DYKA 4A7YA 1LOEA 3OJBA 4I3NA 4D8HA 1V6NA 1NLSA 3RTIB 1W0OA 2CNAA 3PHZA 2D3RA 3MALA 3ZYPA 3O4AA 1FX5A 2D6MA 4EEEB 2WJSA 3PVOA 3UDAA 1IILA 3AKIA 4M01A 1BJQA 3PG0A 1XG6A 5T50A 2AH2A 5DUYA 1JT7A 4I0YA 1G9DA 5GZEA 3BOPA 4CTEA 3POYA 3ILAA 3O4BA 1W6QA 1L2HA 4IQPA 4I4QA 1W6OB 3DGTA 1JBCA 3OBTA 3ZXJA 2W52A 3ZPYA 2L5XA 2WNEA 4EFQA 3N7LA 1JYIA 1ISXA 1DGLA 2DVBA 2JDZA 4YGEA 4TZDA 1K5VA 2YUGA 3VWCA 4H04A 1KQRA 2GMEA 4Y22B 5E24E 2M49A 5BP5A 1BLDA 1G86A 1AJOA 2D44A 4FVVA 2UU8A 1PZZA 3T1MA 1S0BA 2QN4A 1IOBA 1JHNA 2JJ6A 2PELA 3WDVA 5BXTA 2ZGNA 2NMOA 2HYKA 4XIKA 5DVHA 4XHBA 4BLIA 3NV3A 3B9UA 1MS8A 4I37A 4YGBA 5DUUA 1N4KA 1JQZA 1ENQA 4Y24A 4LBLA 1BKZA 3O0VA 2FMDA 4JP0A 4OWJA 3POKA 3OJVA 1TIEA 4WVWA 3FJHA 4AGRA 2ZQNA 2GNBA 3BRFA 1ISZA 1SR4A 1DQ4A 4XILA 1N3OA 1FGAA 1HCDA 1V6MA 1AVXB 5F9TA 3AP9A 1Q8OA 1SCRA 1W6PB 4DEPA 1A3KA 3ZSKA 4ATFA 2E4MA 4QC4A 2P3JA 3UJQA 1EPWA 4GAFA 3USUA 2NYYA 3N0KA 4Z8BA 1DLLA 3A0NA 1AXMA 3T1LA 1V6IA 5IT6A 3FJCA 2KI4A 1F9KA 1ITBA 3LSEA 2WBCA 3CU1B 1G8WA 3FUOA 4OEGA 5DZEA 3JRRA 1H30A 3L2YA 1DIWA 2R1DA 4LBOA 1Z2VA 2PHUA 1BLAA 4I2SA 3I4IA 1A8DA 3Q7WA 1DYPA 4ISQA 2NMNA 3UJ4A 1YXWA 1LU2A 1LECA 4Q27A 3I8TA 1D2SA 2ZHMA 2ZABA 2E6VA 4QALA 5GLTA 5EG6C 1JW6A 3FUQA 2D6LX 2VY0A 4XHXA 3BAUA 2JE9A 1N1TA 3M3EA 3FLRA 4I1EA 3D6EA 2ARXA 1MACA 1SCSA 1DQGA 2ZKNA 3BIWE 3JU9A 3VKNA 3WDYA 4FQZA 4Y1UA 1JY0A 3M1HA 3ILFA 5D63A 1BFCA 3FJ8A 2EXKA 4H55A 3MPPG 2E7QA 4M3CF 4LBQA 4HA2A 2ZGLA 4WZFA 3WNXA 4Y1ZA 3ZXLA 3ZC9A 1MS5A 1ULCA 1MS4A 2TEPA 5BYNA 3SH4A 4P6AA 1BA7A 3JUTA 4XXPA 4FOWA 1F31A 2P39A 2KI6B 1MD6A 5IK5A 1RIRA 2DVDA 2EAKA 1A78A 4ZKTB 4GXLA 3AFKA 2OUHA 5HCFA 2A6YA 4OEFA 1HWMB 5IK8A 4GWMA 1T4QA 1DZDA 4ENDA 1SLLA 1DHKB 1VALA 3I29B 3POWA 1IRPA 4M3CE 1PUUB 2AAIB 1V6LA 5F90A 1JUIA 4YM0A 4GA9A 4XJAA 3D5OA 3ZXKA 2VW1A 2IHOA 4KBBA 4R6UB 2A3YA 3BRGC 2ENRA 21BIA 2G4IA 5G00A 3H6RA 1UZYA 3WUCA 1TP0A 4XFUA 5BP5C 1CESA 5DZGA 1S0IA 3DUIA 3FJBA 1QF3A 2DYCA 2VSEA 4LO3A 2A6XA 3VUOA 1V6VA 1CQ9A 4XOGA 5T52A 2WT0A 2DUQA 2ZGMA 2LIEA 3BA4A 1II4A 4CZSA 2AGSA 3P6JA 2A71A 2YV8A 1YI7A 1UL9A 5DZFA 4ASMB 3WHTA 4FP3A 4IONA 3AXEA 4QD2C 2WKKA 3IN9A 1JOJA 1SZ6B 2K43A 5EWSA 2DWRA 7I1BA 3NV1A 4FQ4A 3S8KA 4YGDA 3ZXEA 3WOGA 3H6QA 2DREA 1PZ9A 2GNMA 4LO8B 4XBNA 2A5ZA 3AP6A 4YZ2A 4G1RA 5H9QA 1WBFA 1GLHA 5FZUA 4FPKA 5FZYA 5LK5A 4NOTA 2C5DA 3GALA 2NTDA 3B01A 3BAQA 3D4KA 3N7KA 4PQ9A 1SACA 1FV3A 1G9AA 4Y1XA 4EFPA 3IPVA 2E4MC 1N1YA 1IKQA 2YZ4A 2HWMA 3OJMA 3LLPA 3AH4A 1MZ5A 2WT1A 3W9TA 1SLCA 1LOGA 4FOYA 1LCLA 2KLLA 3WG3A 1QKQA 4QO3A 3CRHA 1RZOB 2WSVA 2HWAA 3CRGA 2ZGSA 4I4PA 4QKRA 2D7FA 1TEIA 1IS4A 3UD7A 2X2TA 4R9DA 4K20A 3OY8B 4BMBA 3M2MA 1YIFA 4BLJA 2I2SA 4IHZA 4YOLA 3V0AA 3T2TA 1BFGA 4G9NA 4YW1A 3OBRA 3Q7YA 2E51A 2RQ9A 1LENA 3FJEA 1VAMA 1YO8A 3O0XA 1G82A 2AENA 2GN3A 3TC2A 2YMZA 1KNMA 1LODA 1URXA 1GANA 5DG1A 2FDBM 2A75A 3NBDA 1W6MB 2WRYA 1BARA 3IAGC 2Y9FA 1RY7A 4FPLA 3CA0A 2LTNA 3ZXDA 1MS3A 1X50A 2J3PA 1JYCA 5I1BA 3O5SA 1Q8VA 4PBOA 5DZUA 1MS0A 3NV4A 4FPOB 1KRIA 2ZAAA 3WLUA 3O5WB 2D3PA 1HQWA 4YZ5A 3UL2A 3BA5A 3A21A 4I4SA 2A3WA 1AJKA 2EF6A 2FHRA 3AP4A 5FREA 1Q03A 5CA6A 1HQLA 4A7KA 4OW4A 2H0BA 4P0JA 1U0AA 1S1AA 4JAWA 1OFSA 3VKMA 5BVPI 3CA1A 2RG9B 1HKDA 2I1BA 5JLVA 3KQRA 3O3QA 1Y7BA 1ISWA 4LO7C 3WDXA 1LHUA 3SH5A 1ISYA 1DQ2A 1YYNA 1S0DA 1LGBA 3INAA 2KH2A 4PBPA 4KC3A 2OW4A 1VLNA 1WLCA 2E53A 1ENSA 3S8JA 2E7TA 3B9CA 5GAQA 3NWKA 4QD2B 5F5QA 3FLTA 4AN6A 4DS0A 3A22A 3IM5A 4JKQA 4LO1A 4I7IA 3NBEA 2P23A 2D7IA 4M3CA 2ESUA 4ZFUB 1HWOB 2MIBA 3A4UA 4OUJA 1FQ9A 4K1YA 3WHUA 1LU1A 3WG2A 4HL0A 1EVTA 4YFWA 1DJSB 4BMEA 4XBQA 4CRQA 4GP0A 2ZHLA 2GN7A 1ULFA 4YG0A 1KJRA 2D6KA 1YBIA 3Q9OA 2GNTA 1QOSA 3A07A 3OPZA 1GGPB 2V5YA 3EF2A 1GZWA 4U36A 5JOWA 1DQ6A 5B2HA 3C9ZA 2JE7A 1TOOA 2MLLB 1UPSA 1PC8B 4Y20B 3ATGA 3H0OA 4PCRA 1FNYA 1LHOA 2ZBJA 1ENRA 2XOAA 2WT2A 1EV2A 2ARBA 3V0BA 2B7YA 1UKGA 5HPZA 4Q1PA 3VV1A 4YG3A 2AYHA 4PF5A 3F1RA 3FBYA 1OKQA 3OGFA 3CA3A 1ONAA 4FPJA 1XZZA 1HKNA 5EYYA 2Z48A 2YXSA 3O12A 3AKFA 5EHAA 3BAVA 1LEMA 2ET2A 1H9PA 5T5LA 4YZ3A 4ITCA 2DS0A 3LTQA 4Q91A 2UWCA 2DRZA 4FGFA 1FNZA 1C4RA 2YY1A 3A23A 2ZHKA 1IS3A 2Q5TA 1VCLA 1Z0HA 4R9AA 1JTCA 4ZXKA 3OJ2A 4ZLBB 1JT4A 3AYEA 2ERMA 4YW3A 2P3IA 1QU0A 1HDKA 4FPYA 1LJ7A 4XJWA 4II0A 4OEEA 1GZCA 1QNWA 1UMZA 3W59A 1RG8A 2A6WA 2R49A 1IRAX 5D61A 2Q9XA 3UD8A 4Y22A 2DVAA 3C2UA 6I1BA 3AKHA 3SNVA 1DQ0A 2QYIB 2Q3NB 2ZA9A 3AZZA 1O4YA 3K1XA 2CTVA 1RITA 3AK0A 4JKXB 5BXSA 5JMCA 2RSTA 4UW6A 2VXTI 3WO2A 4USOA 4IY9A 1W6NB 3AZVA 1ULEA 1E0OA 1OQ1A 3SISA 4FOVA 3AZYA 3P53A 4F34A 3FJJA 5BQUA 1QQLA 1IKPA 4M00A 5IK7A 4L4HA 4IYBA 2EXIA 4I1BA 5T55A 2PHFA 1AVUA 2AR6A 4LO2A 5T5PA 3O49A 1T9FA 4I8MA 1VAVA 1AZDA 3AXDA 3FJ9A 3PVEA 1DFCA 3UK9A 4Q8KA 1CVSA 3ILRA 1CPMA 2D1ZA 2D23A 1LOAA 4AVVA 3MEPA 2NN8A 1J0SA 1W6PA 4FPHA 1LOFA 4J2SA 4OZXA 2YROA 1MS1A 3Q7XA 4YG6A 1UAIA 2D3SA 4GWNA 1WCSA 5JVVA 1PUMB 4DFSA 4G6MA 2R16A 1RMLA 2ERFA 2VXRA 3PUBA 3WG1A 5CB7A 2X2SA 1Q8SA 1C1FA 1N47A 2F2FA 1V6OA 1WBCA 4J23B 1V6XA 3AJ6A 1SLBA 2DU1A 2EIGA 3QLQA 4LBJA 1I1EA 4DPNA 3AZXA 3RG0A 2WQZC 1J1TA 1CIWA 3PJQA 3FJIA 4LO1C 5DUVA 1G9BA 1B09A 4K21A 2NM1A 4X3AA 3AX4A 4Q1RA 1MVQA 1GNZA 3CQAA 1DQOA 3BRDA 3OGGA 1UZZA 5FZZA 4YM3A 2VUAA 2ZMNA 4WVVA 1UN1A 4XTPA 4ZFWB 1WW7A 2D6NA 4I30A 1LOCA 2DUPA 1XQNA 3WINA 3O4DA 4DCKC 1DBNA 3HR9A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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