4JP0A

Crystal structure of cry35ab1
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
380
structure length
378
Chain Sequence
LDTNKVYEISNHANGLYAATYLSLDDSGVSLMNKNDDDIDDYNLKWFLFPIDDDQYIITSYAANNCKVWNVNNDKINVSTYSSTNSIQKWQIKANGSSYVIQSDNGKVLTAGTGQALGLIRLTDESSNNPNQQWNLTSVQTIQLPQKPIIDTKLKDYPKYSGNIDNGTSPQLMGWTLVPCIMVNDPNIDKNTQIKTTPYYILKKYQYWQRAVGSNVALRPHEKKSYTYEWGTEIDQKTTIINTLGFQINIDSGMKFDIPEVGGGTDEIKTQLNEELKIEYSHETKIMEKYQEQSEIDNPTDQSMNSIGFLTITSLELYRYNGSEIRIMQIQTSDNDTYNVTSYPNHQQALLLLTNHSYEEVEEITNIPKSTLIKLKKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural and biophysical characterization of Cry34Ab1 and Cry35Ab1
rcsb
molecule keywords 43.8 kDa insecticidal crystal protein
molecule tags Toxin
source organism Bacillus thuringiensis
total genus 100
structure length 378
sequence length 380
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05431 Toxin_10 Insecticidal Crystal Toxin, P42
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.60 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Homeodomain-like 4jp0A03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4jp0A01
2GLOA 4USOA 4D5CA 5E3NA 4Q9GA 3VT0A 3B6CA 1MSEC 3BTLA 1U9NA 2GZBA 3PMEA 3TP0A 1U8BA 3HBLA 3AJ6A 2OPTA 3GTOJ 2K9QA 2Y31A 2E2IJ 4JRAA 3FGMA 3LNQA 4I1BA 3O44A 3VT1A 1FTTA 1VF9A 3BAUA 1YF8B 4A3MJ 1M16A 3BADA 1UMQA 4C3JJ 3HDDA 1TWGJ 1YRNA 3S8JA 1JUMA 4GFBA 2Y9ZA 2D43A 1LFBA 1F43A 2D24A 5BQUA 4DENA 1DU0A 3JR9A 4EB2B 4MFDA 3HEFA 3NJ5A 2K4AB 2JA7J 1BLAA 2ECBA 5D62A 3FJFA 1NK3P 4JYKA 3H6SE 2YUGA 1JKPC 5GPAA 1IHKA 3BA4A 2LVSA 1N4KA 3S14J 1RPWA 1IRAX 2H8RA 3E8LC 1FIAA 5EG0B 3OSFA 1W3FA 1JT7A 31BIA 2XB0X 3WA1A 2M34A 4TLPA 4IONA 4AN6A 3BAOA 7I1BA 2RG9B 1Q1VA 1DZDA 1CQTA 3IH4A 5M5XJ 5K7FA 4A69C 5BVPI 3HOWJ 3WINC 2G0EA 3TW7A 3FJIA 1DQGA 1U9OA 4D0ZA 3HOMA 3TP3A 3K2AA 2LD5A 3SDGA 2FGFA 2VLCA 3O5WB 2KKIA 2NOGA 2F2FA 2AO9A 1RKWA 3WHCA 3WHBA 4B3AA 4HNVA 4G9MA 2DA2A 4F83A 3FUQA 4I8MA 2XOAA 2MC2A 4DW6A 5IP7J 1XS9A 1QRYA 3OGGA 2HWAA 4HR6C 1GGPB 1II4A 3BX1C 4B1RA 2TCTA 3BRDA 4QALA 2YU9J 2D20A 3CDLA 3H6RB 3C2BA 1IRPA 1XYFA 2O9LA 4FCYA 1WH5A 3P53A 1B8IA 2FX0A 4M3DA 2K40A 4FE4A 1ETXA 2N8GA 3VUOA 1FQ9A 2LY9A 1IUFA 4IHYA 5D63A 3NBEA 2ID3A 3CRHA 1TWMA 5FKLA 4LO8B 5M3MJ 2DA3A 3AH4A 3ZC9A 5F8YA 2ZQNA 3BA5A 5D61A 5B2HA 4V2FA 5FKMA 2XPUA 2IHOA 3JRRA 4D5FA 1TFMB 1LE8A 4IY8A 4DZJA 4LO3C 5IYCJ 3RTJB 3H3VK 4EEEB 1QQKA 3O4DA 2HDDA 3IH3A 1G9AA 1RY7A 4XRSA 3RZOJ 4M3EA 4I4UA 1JTYA 2ZR1B 1K83J 5DVHA 3Q0WA 2NVYJ 4DCKC 2X9DA 1TIEA 1APLC 4ZKTB 1GT0C 4A3CJ 1QVTA 4DYQA 4P0LA 1FJLA 4OWJA 2FDBM 4OWKA 1X2MA 1IV6A 4BY1J 1W0TA 3S2DJ 1EYLA 4XFUA 1HF0A 4OEEA 3O49A 2KI4A 3M3YJ 1BL0A 3W9TA 1HCDA 1GDTA 2OF7A 3HOUJ 4AUXA 4OEFA 3Q7WA 2VKEA 2MW8A 3R4SA 2K9NA 5E3LA 3SFIA 1PC8B 3S16J 2CRGA 1BASA 2L7ZA 1MBGA 4XIDA 3V0BA 1R9TJ 5HPZA 3NARA 5F1JA 3WINA 3FJ9A 4JX6A 1XHBA 3S1QJ 2D44A 4J23B 1DIWA 1HOMA 2E2JJ 1IOBA 1HWMB 1ETQA 3ZQCA 2GM4A 1EF4A 2FFUA 2M8GX 2VUMJ 1I1EA 1TP0A 2RQ9A 4JPZA 3PM1A 5F0HA 2EZKA 3AKFA 5JLWA 2CQXA 5FNXA 2DMPA 2DMNA 3CU1B 2VXTI 4LO7B 3I29B 4AN7B 3D1NI 4G12A 3ZQLA 2X2SA 2QN4A 2I1BA 2DA6A 5EF6A 1FN0A 4CJMA 1JKRC 1ZR4A 4DYCA 1OCTC 1ZR2A 1TOOA 5E24E 1YRNB 1CVSA 1FGAA 3W6VA 1LFUP 3IM7A 2ECCA 4A7YA 2XGEA 3HOYJ 1JJ6C 5F90A 1K5UA 1G2HA 4GP3A 2M49A 4LOCA 5F0FA 4JX5A 4XRSG 3HBWA 4Z9WB 4C3IJ 4JX4A 1D0HA 2LK2A 5IOYA 3UKGA 5IYBJ 4G6JA 2YS9A 2MG4A 5EC5A 3R4UA 4RBOA 5JLVA 2DMQA 4LO3A 5FZZA 2JA8J 2Y9FA 2DA1A 1F31A 3WMUA 1V6VA 3Q0VA 3POKA 5BXSA 2NVTJ 4ZA3B 1MBEA 1XG6A 3JRBA 3S1RJ 4M3FA 5EYRA 3BAVA 1AHDP 4QKSA 2WV1A 21BIA 3PHZA 3OSGA 1TC3C 3JUTA 3WMVA 3ZQHA 4G6MA 1POGA 2ZQOA 1QVUA 4XRMA 1B72A 2R5ZA 3LLPA 1FIPA 4A3JJ 2DTZA 1G9CA 2Q9XA 4KC3A 3CQZJ 2E19A 1P7JA 3HOVJ 3K7AJ 3MN2A 4I4RA 1ZTRA 3BTAA 4I0YA 3MKLA 1ABRB 3BAQA 1ONKB 4P6AA 2Y9XE 2WB1N 1NUNA 1MSFC 1JUSA 1DFQA 3GBGA 3UJ4A 5EG6C 2L7FP 2KT0A 1W3AA 1RESA 1FV3A 1ZKGA 5EGOA 3A22A 3BTIA 4QBCA 4OEGA 3N7JA 2CJJA 2DN0A 3BRGC 2EZIA 1B8IB 5F08A 4A3GJ 2WBCA 1WPKA 4ZOTA 5FZUA 5IYDJ 1H8AC 2XPWA 3FK6A 2Y30A 1HDDC 3K1XA 3O3QA 3P6JA 4H04A 3FKIJ 3RQIA 1W0UA 3A23A 2R5YA 2HI3A 2L5XA 1KNMA 2XB5A 1Q1UA 3N7KA 1MNMC 1AFCA 3ZXDA 3QR5A 4I6ZA 2ZB9A 5DZUA 5FJ8J 1I3QJ 5FLMJ 4I1EA 1LE8B 4GOVA 4JAWA 3OIOA 4BY7J 3HN1A 3B6AA 4XFSA 3RTIB 1TWHJ 3JRFA 1PUFA 1HCEA 4FISA 3FISA 1TWAJ 4IY9A 2FO1A 2XRLA 5J1RA 3CA5A 1VI0A 3H6QA 1X58A 4ABZA 1FWVA 2MLLB 1K61A 4XFTA 2AFGA 1HDPA 1T9FA 3VEQA 3OGFA 1YTOA 4XKIA 3VSFA 2D5VA 1UHSA 5K7ZA 3BTCA 4EEFG 1JT6A 4Y52J 3AZWA 2NVQJ 2XPVA 3O4CA 4J19A 4CYCA 1WD3A 3V0BB 4MLOA 3AKHA 2CUEA 3BR2A 3JRGA 3TW6A 3QPLA 3Q7XA 4X1EA 3F62B 1X2NA 3G1OA 2MGQA 1IGNA 1FEXA 1S0DA 3BTJA 3BQZA 5F04A 4I96A 2NVXJ 4AYBN 1BW5A 2X2TA 5K7HA 3ZQIA 2DREA 3A21A 1JJ8C 3N0KA 2H1KA 2JMWA 2HYJA 3FJAA 4ZFYB 1IDZA 1K5VA 1NTCA 4RDUA 3BR3A 1ZQ3P 2DMUA 3TEDA 2Z49A 4QKRA 3L1PA 4L4HA 2HXIA 5M5WJ 2Y9GA 3B9UA 2O7OA 2NP0A 4AC0A 3OOUA 1SANA 1Z2VA 3Q3SA 3M4OJ 1E3OC 4BBRJ 1V6XA 1JGGA 5IOZA 2KLLA 4G9NA 2EQRA 3BG9A 4ISQA 1IC8A 3BAGA 1RMLA 2VI6A 4Z8SB 4UUTA 6I1BA 1HWPB 1JQZA 5GP9A 3DEWA 3AH1A 2FD5A 4D7NA 4OUJA 4DEPA 1Z4SA 3A01A 1EVTA 5EEAA 4F34A 1Y1WJ 1AVUA 3OJ2A 1JKOC 2ELKA 2K9SA 4IYBA 1HLVA 3H0GJ 3FJCA 2UUSA 3RKQA 3BT9A 4MFEA 1A6IA 5J3LA 3IV5A 1ZK8A 1JLXA 1MC9A 4IHXA 2QF7A 3GTJJ 4I2SA 4PC4A 1WD4A 3GTGJ 2D7RA 1RKTA 1BA5A 4IEJA 1EPWA 1QXMA 1T56A 3CRIA 5JLXA 4LO0A 3JRIA 1DLLA 2DA4A 1G82A 1B72B 1XC5A 2R5ZB 4H9WA 1JUPA 3EF2A 3LSGA 5FNWA 4IQPA 5FKNA 3BB2A 2JJ7A 2JK3A 2KDZA 4QO3A 3S17J 1YBIA 4QD2C 4J2SA 1GUUA 1DJSB 5FZYA 3OBTA 4X38A 1ZGWA 1WI3A 5EGOB 2JWTA 2PMZN 5BNGA 4NDLA 4UUSA 4QIWN 2NM1A 3PG0A 2IEKA 1V6WA 4QC4A 2ID6A 3FJJA 2KI6B 2D1ZA 3V0AA 4Q9PA 3BR5A 1MD6A 2JN6A 3OJVA 2B63J 5FKOA 4USPA 3QPSA 1V6UA 4BXXJ 2LR8A 2R5YB 1J0SA 1EV2A 2LTPA 1T4QA 4M3GA 3NBDA 1ISZA 1I6HJ 2Y9YA 3OBRA 5IPAA 2M2EA 2NYYA 2HW9A 2EBIA 3C9ZA 4QSHA 2P23A 2MIBA 1ETYA 5JMCA 4XK4A 2BEBA 2IBDA 1E0OA 1VFCA 2NS7A 5G00A 1PUFB 5DTDA 4C3HJ 3JREA 1HWNB 1Z77A 1U78A 1NZKA 1IJWC 5C4XJ 3NAUA 3LSRA 3WO3A 3UDAA 3BR1A 3HMYA 3PUBA 3PO3J 4FE7A 3QYDA 4MO7A 4I6IA 3NBNA 3ZC8A 1YYNA 3CQAA 2ME0A 5F0CA 3I4NJ 3BA7A 4W97A 5EDNA 1JY0A 1ILR1 4JQ0A 1Q04A 1OQLB 1S0FA 2EZLA 1ETVA 2P39A 3S1MJ 5DSSB 1G9BA 2RSTA 4L5EA 4CYCB 4GP0A 4D8HA 5IP9J 1YXWA 2LFBA 1HIBA 2E4MC 1RETA 3HGYA 1H89C 3IIRA 4ZFWB 3P6IA 2LP0A 3BG5A 3AKIA 2R0QC 3SNVA 1TTUA 3GTMJ 1Q03A 8I1BA 1OJLA 4D0TA 5BXPA 1S0BA 3N7MA 4ZLBB 3AKGA 1JT0A 4M6VA 4V2GA 3GTLJ 4X39A 2R93J 3IAGC 1L2HA 2DA5A 1BLDA 4YOLA 3MVPA 2O8KA 1AVWB 1WH7A 5C4JJ 2LIEA 2HZ9A 4ZFUB 2BFHA 5J1YA 1IG7A 5M5YJ 1TWCJ 4MIMA 3HKZN 4A3FJ 4OWLA 1VNDA 1UPSA 1ENHA 3V79C 1BFCA 2VXRA 5I1BA 2DJNA 1PZZA 3VT2A 1T33A 4QBVA 1FMMS 4L4IA 1TWFJ 2K43A 3HB9A 3A01B 2VUAA 3FUOA 4EKXB 3S8KA 2RAEA 1JT3A 2J3PA 1I50J 1ETWA 4HA2A 1W3GA 4I37A 1DFCA 3O8GA 1R8NA 5GAQA 4FVVA 5C3EJ 2Y0SN 2HOAA 3LSJA 2IWTB 3IH2A 2NTDA 1WBAA 4EFRA 2CUFA 3D7WB 5F8SA 2VSEA 1S7EA 2KH2A 3HOZJ 1CE7B 1JTCA 4A7ZA 1AF9A 2HWMA 2TRTA 2ESUA 4LO0C 1WGXA 3WO4A 4JP0A 2XSDC 4LO1C 1AVXB 3IM5A 9ILBA 1AKHA 1FWUA 4A3EJ 4IHWA 1R8OA 1VCLA 2FQ4A 2XGDA 3UJ0A 4A3KJ 4A3LJ 1QQLA 5EZHA 1IDYA 2M0CA 2EH3A 3GTPJ 1JTXA 2E4MA 2E2HJ 1A8DA 1HWOB 5DS9A 2NZ9A 1TWEA 3CA0A 2L9RA 9ANTA 4Q91A 2DRZA 4I4VA 3CA4A 1RR7A 2M9HA 2D23A 4J2XA 4ZBVB 4UUSB 4A3DJ 1RG8A 2VU9A 4G1RA 4ZGRB 3G1MA 2R7ZJ 2D7IA 2ERMA 5BXRA 3A03A 3AZVA 1BW6A 3V0AB 3SJMA 4DZPA 4QTRA 1FV2A 5F8WA 1ISYA 3QQAA 1GV2A 5E3OA 5M3FJ 4X3AA 4IHVA 1ISXA 4I4PA 2R92J 1ORKA 1ITBA 5DUYA 1BFFA 3O4OA 4HJJA 3ZXGA 3BG3A 4I7IA 4KBBA 4I4YA 4X6AJ 3F1RA 3RMXA 3ZQGA 4J2KA 1UG2A 3TC2A 1ETKA 3FJKA 1P7IA 4OW4A 2L7MP 3Q0UA 4DYRA 1OCPA 3LSPA 3N7LA 2HXOA 3HOXJ 3O4BA 2L0KA 2YUSA 2Q3NB 3O8HA 2WAQN 1M2TB 1WBCA 5BOWA 2LIQA 1FMZA 2CQQA 1GVDA 1S0CA 1Z0HA 1NK2P 3UD7A 1BFBA 3ILAA 3S15J 2LLKA 4BKXA 1H88C 4LO2C 1JT4A 2QYIB 3F0CA 1IILA 2DRYA 2FJ1A 1IT0A 1S0GA 4WBCA 1SR4C 4ENDA 1S0LA 3O4AA 4KEIA 1BJZA 3UD8A 4I4SA 3BAHA 2K8RA 4C2MJ 3I2AA 3JRCA 4LO1A 1HCRA 2DS0A 2GBYA 3LOCA 2NVHA 3CA1A 2HQ5A 2Z48A 2P81A 1JKQC 5HODA 4A7KA 3Q7YA 2IAIA 1BARA 1O4XA 1DZCA 5GPCA 1SZ6B 1JLYA 4GAFA 1GV5A 2VSAA 4I4XA 4QD2B 5EG0A 4KEKA 3VSZA 4II0A 4J2YA 4I4QA 3BR6A 2XGCA 5BP5C 5FLVA 3GTKJ 4I76A 4I3NA 2AHQA 3I4MJ 4XICA 4I4OA 5FKKA 3FIWA 1SFOJ 5E3MA 3A02A 1ISWA 3HGGA 3CCYA 4FGFA 1Z0XA 3AJ5A 3NBCA 2BEAA 3JRHA 3JRAA 3HALA 4KEJA 1PUMB 2E1OA 5C44J 3MPPG 2GO2A 3FJHA 4GOYA 2HOTA 4A3IJ 2VKVA 1MH3A 3VPRA 1FTZA 4LO7C 3CA6A 3UD9A 1P63A 2W48A 3S1NJ 1BFGA 2QCOA 2I10A 1MBJA 2LKXA 3T8SA 3H6RA 4IHZA 4A3BJ 3HSMA 1A5JA 3ZX7A 3G1LA 3BQYA 1PWAA 1G9DA 5BQUC 3CA3A 1MH4A 2X6OA 1AXMA 2ME6A 5F27A 1AVAC 3KMVA 3ZOBA 3FFZA 1HKNA 4GAIA 2COBA 2D22A 2AQZA 3IM6A 1MBFA 41BIA 4LO2A 3E7LA 3RZDJ 2Y2ZA 1BA7A 1AKHB 1F36A 2X48A 1OFCX 1DU6A 1IJTA 2F8XC 5EHAA 3FK7A 4P0JA 4FTHA 4R6UB 1SR4A 3BR0A 2HOSA 4EFPA 3FJEA 5J1UA 3BRFA 4EFQA 4ISRA 4A93J 1MBHA 1AU7A 3MALA 4P0KA 4M3BA 3RSJA 2DA7A 3I2XA 2FFVA 4JKQA 1MBKA 1XG1A 1D5YA 2EZHA 3RMYA 4S0HB 1RZOB 1ITYA 2AXMA 1XZZA 3CAHA 3S2HJ 3ZQFA 1DQOA 1S0EA 2DMTA 4BBSJ 4W1UA 4IZXA 1PUUB 2CU7A 3DCFA 3A07A 2R9KB 2AAIB 1I1BA 3FJDA 4IZEA 3LTQA 1ETOA 1WCMJ 3WO2A 4B4CA 5IP6A 2Y9WC 1QPIA 1JT5A 2JA5J 5BP5A 3HM5A 3GTQJ 3PO2J 3FJBA 1ISVA 1Y1VJ 2ET2A 4D7MA 4JKXB 5BXTA 2F2FC 2MSYA 2NS8A 2JA6J 3FJ8A 3CRGA 5EZGA 3OJMA 2VPRA 3AH2A 3CMYA 3VWCA 3JRDA 2WRYA 4X37A 4Y7NJ 1IRZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3TO7 A;  1HCR A;  2DS0 A;  2GBY A;  1FOW A;  2E1M B;  3LOC A;  2NVH A;  3CA1 A;  2FOK A;  2Y75 A;  2HQ5 A;  2Z48 A;  2HS5 A;  1E3P A;  2P81 A;  2R7Q A;  3H1C A;  1JKQ C;  5HOD A;  3ZPL A;  4A7K A;  5D8K B;  3Q7Y A;  2F48 A;  5CVV A;  4A0Z A;  2QQA A;  2IAI A;  3M07 A;  1BAR A;  4II3 A;  3U9G A;  2KDO A;  2QZ8 A;  2ZME B;  2BVM A;  3ELK A;  1O4X A;  1DZC A;  5GPC A;  1FBQ A;  1SZ6 B;  2COM A;  1X1D A;  1JLY A;  4FX4 A;  4GAF A;  4L0Y B;  2LBF A;  1GV5 A;  4CA0 A;  2VSA A;  1FPQ A;  3KCC A;  2Y48 A;  1SMY F;  2P6T A;  3G2B A;  1D0Z A;  1QGP A;  2Z5U A;  4IVN A;  4BQQ A;  5E17 F;  3KFW X;  3C7J A;  3TBI A;  4I4X A;  4WF2 A;  4QD2 B;  5IT3 A;  5EG0 A;  4KEK A;  1WJF A;  3VSZ A;  2R7T A;  4P96 A;  5DEQ A;  1Z6T A;  2CYY A;  1MW7 A;  5ED4 A;  4G7Z F;  4II0 A;  4J2Y A;  2IGN A;  3RPU D;  4I4Q A;  3BR6 A;  4RAZ A;  2PQ8 A;  3ZR8 X;  4G6T B;  2XGC A;  2VJI A;  5BP5 C;  4WXH A;  3BOQ A;  5FLV A;  3GTK J;  1IO2 A;  4J01 A;  1WWX A;  2C6Y A;  3DF8 A;  4I76 A;  2ZSI B;  2L4M A;  4I3N A;  2AHQ A;  2A6E F; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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