4ISQA

Binding domain of botulinum neurotoxin dc in complex with human synaptotagmin i
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
422
structure length
414
Chain Sequence
SINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNDNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYWFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
publication title Crystal Structures of Botulinum Neurotoxin DC in Complex with Its Protein Receptors Synaptotagmin I and II.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Neurotoxin
total genus 96
structure length 414
sequence length 422
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-01-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4isqA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4isqA02
2Y9XE 4YZ1A 3AKGA 3KM5A 5HCFA 2OUHA 3AXEA 2AREA 2GMMA 4Z8SB 1DHKB 2TEPA 5JOWA 4QD2C 2RHPA 5KXCA 2ESUA 2AGSA 5GALA 1LHNA 3WINA 4ITCA 1IS4A 1DQ6A 1AFCA 2QN4A 4KEIA 3AK0A 4XDQA 3WCRA 1W0PA 2UU8A 1IHKA 2A3WA 2E4MC 1YYNA 5L73A 4XMIA 1LEDA 4AGVA 3ZYPA 4Y24A 4I6IA 3BOPA 2DUPA 3SH3A 1V6KA 4X39A 4FPYA 4I7IA 2D1ZA 4GOVA 2J3PA 5F9TA 5FRAA 1WW7A 1DFQA 4Y20B 1FNYA 4I4OA 1QDCA 1B09A 4I4VA 4Y1XA 4AN7B 4P9XA 4TLPA 3QYDA 3WINC 5F8WA 3ASIA 4XBLA 2A6ZA 4UW3A 2ET2A 3H6SE 4I4RA 2PHTA 4M3CE 1CJPA 2DVAA 1LU1A 4FQ4A 1FV2A 1H9PA 1SLBA 1UAIA 1YI7A 4D0TA 2WBCA 2I2SA 4ZLBB 3O49A 1AF9A 5CAZA 3TB0A 3L2YA 3ZXJA 1LEMA 4P9YA 2D22A 1HQWA 3FJJA 1FYUA 4IY9A 3ZVXA 1ENSA 3RS6A 2DUOA 3GALA 3VV1A 1ISZA 1MS9A 1HWNB 3O5WB 3OJMA 2VSAA 4DEPA 1UMZA 4F34A 1HWPB 3FLRA 3FUOA 3V64A 2Y9WC 4GP3A 1SBFA 3VSZA 1AVBA 3OYWA 1LU2A 3N7MA 1W6OA 2LALA 1FNZA 3AYEA 3V0AB 2XOAA 4LO0A 2M49A 3F1RA 1N47A 2ZGPA 4ZFWB 5E88A 2ZHNA 2YY1A 4FGFA 2YUGA 2D24A 4PF5A 1OFSA 4YG6A 2GN3A 5JMCA 2DRYA 1QF3A 4I4SA 4YW3A 2HZ9A 5DZUA 3CA3A 3WG2A 2P23A 1JN2P 2D6NA 4GWMA 5BXSA 2VXTI 4NO4A 2WLQA 5AVAA 4QBVA 2DTWA 4YW1A 2JECA 1JTCA 4BOWA 4GAIA 1MS5A 1GICA 4QALA 2ZR1B 1W3AA 4P0LA 2JE9A 4I4PA 2PHUA 2HW9A 2A6WA 5BP5A 1F31A 2KH2A 3H6QA 1V6UA 2VH9A 4Y22B 3FBYA 4Q2FA 4XZPA 2ZBJA 3LTQA 1DQ5A 1GZCA 4GAFA 2E53A 3B00A 4XIKA 1G9CA 3M3OA 4AN6A 3A23A 4BPZA 3ZYRA 2GZBA 3ZSLA 3WMVA 3O3QA 4BLJA 2KM2A 2W08A 2C5DA 3I2AA 1Z78A 2P37A 1K5VA 5BP5C 1IOBA 1Q8SA 1G9BA 4EFRA 3IM7A 9ILBA 3UJQA 1W6PB 3AH4A 3T2TA 1RMLA 4M01A 3AFKA 2A71A 4AVTA 3BAUA 4L4HA 3SNMA 4ZBVB 3OJBA 2BEAA 1JLXA 3WDWA 4HJJA 1XG6A 3TAYA 5DG1A 1FMMS 3MEPA 5IK5A 5GAQA 3QCWA 4Q8LA 3WZ1A 2PELA 1QOOA 5GZCA 4P0JA 1S0BA 2CL2A 2WSUA 3V0BB 2C9AA 3UL2A 2P34A 4R9BA 1S1AA 2AYHA 2ZHLA 1J0SA 1DBNA 3MALA 1ULCA 2EXJA 3WNXA 1Q03A 5T50A 1LOEA 3LLPA 1MACA 1W6OB 1S0JA 2WNEA 3WLUA 3ILRA 3WDTA 1JW6A 1PZZA 3POYA 2WQZC 2WKKA 4HANA 5IUQA 2JDZA 1LJ7A 2IHOA 4A7ZA 2Q5TA 1S0DA 3FLPA 4AVVA 1WD4A 2D6MA 4LO2A 1UZZA 3T8SA 1M16A 4DRRA 3AXDA 4LBQB 2V5YA 1DQGA 4XMAA 3M3QA 3IIRA 1V6LA 3IKWA 1GSLA 3D6EA 1FMZA 4XBNA 3A07A 2PHRA 2ZGSA 1GBGA 4JPZA 3FJCA 3CRGA 2ENRA 4D69A 2W52A 1IS5A 1NXD1 2W39A 4QKRA 1GGPB 2VW2A 1UPSA 3RMYA 3CQAA 1OQ1A 2ZGKA 4I96A 3AP9A 4Y1VA 4LO2C 4YG3A 2PHFA 4H55A 1DZDA 1IILA 2EALA 1V00A 1V6WA 3IM5A 5JLVA 4PC4A 1JQZA 3FJEA 2OUJA 2EIGA 1G9AA 4I1BA 1AXMA 3RMXA 4ENDA 3JUUA 2P3IA 4CZSA 1WLCA 1BFCA 1MVQA 4FP2A 2JE7A 4SLIA 1BYHA 3FJBA 5GJ6A 4FPEA 3LSEA 3N0KA 2EF6A 1MD6A 3H6RA 4J2XA 4YM3A 4FPGA 1W6MB 5CNAA 4I0YA 3VKLA 4QBCA 1YIFA 4TZDA 2GN7A 3IPVA 4ASMB 4LO7C 5FNWA 5T55A 3BA7A 2K8RA 1VALA 2ZZJA 1LOBA 4FPKA 1Q8VA 5HCAA 4K1ZA 4EFQA 3O0WA 2P3JA 3PHZA 3N36A 3HALA 4J2YA 2LIQA 2E7TA 4XJZA 2P3KA 4U2AA 4XHBA 3OY8B 5BVPI 4USPA 1JT5A 3RQ0A 2A7AA 2R1DA 1N3PA 1RITA 1UKGA 3WG1A 2KI6B 4BMBA 4DCKC 3AZXA 2VLCA 3O4AA 3WUCA 1R1ZA 3NBCA 3HMYA 2E51A 4YW4A 1KJRA 4YM0A 5GLUA 1LHUA 1L2HA 4XHXA 4PBOA 4C1WA 2NMOA 2DTYA 1LGBA 1LOGA 1Q04A 5DUXA 4LBLA 1LODA 1Q8PA 1C57A 5BYNA 1RINA 2R16A 1BZWA 1QNYA 3APBA 5T52A 4YW2A 1C1FA 5IK4A 1AXZA 4GOYA 3I8TA 5KXEA 3O44A 2GNBA 1CVNA 2FGFA 5D61A 5DG2A 1IKQA 1ULEA 1IRPA 1G9FA 3CRIA 4DQAA 3P6JA 5HPZA 3AZVA 4WVVA 4M3CF 2ZGQA 1CVSA 1QXMA 1HQLA 3INAA 2MIBA 4XXAA 3O0VA 4JAWA 2E4MA 4YFZA 3A0KA 1YF8B 4J2KA 3BADA 5T5PA 2VXRA 1WW4A 3FJHA 2ZHMA 3QLQA 1FGAA 4II0A 1CESA 3W59A 1QOTA 4XIOA 1ISYA 3V65A 4OEGA 3D4KA 4OUJA 4R9CA 3VKFC 1GNZA 1LHVA 3U4XA 4AGGA 1ABRB 3AYCA 2D3PA 4QC4A 3IPVB 1DZQA 3N7JA 2VU9A 2ZMNA 2GNTA 1IS6A 4XTPA 4OWJA 1BLDA 3POWA 1QMJA 1V6IA 1MS3A 4YGCA 3SH5A 3AH1A 3IM6A 2X2TA 1Y7BA 3M3EA 5FNXA 1SBDA 3IN9A 4AVSA 5GLVA 2FFVA 4H9WA 5DXDA 1TWEA 3O4DA 4Q1PA 1HWMB 3NV3A 4BQ1A 5D63A 1W6NA 1JHNA 3PVOA 1CONA 2NMNA 3PVEA 1T9FA 1QU0A 4CTEA 3UD7A 3VSFA 2JD4A 7I1BA 3MW2A 2GMEA 2NN8A 4GWNA 3OPZA 1DYPA 3HOMA 1BFBA 1JUIA 4LBOA 3FJIA 1LHOA 2YZ4A 4DFSA 2KKIA 3I4IA 2DU0A 5BXTA 4YFWA 3AJ6A 2ZQOA 4XXPA 1LOAA 1FV3A 1MS1A 1MS8A 3OBRA 1J1TA 3ATGA 3JRRA 1JT4A 5KXDA 4H04A 1LTEA 1PUMB 1G86A 3WOGA 1AVUA 1KDMA 4XTMA 2VUAA 3DUIA 4FVVA 3ILNA 2ERFA 4QD2B 4QKSA 1TFMB 5T54A 5F5QA 2G4IA 1BKZA 4M3CA 3F62B 1NLSA 1ONKB 1IRAX 1DQ1A 5SV8A 3WCSA 1NUNA 1DYKA 5CA6A 1AX2A 1GZWA 2I1BA 2WJSA 4OZXA 3CRHA 1PUUB 3D5OA 1F9KA 2HWMA 1JYIA 4I37A 3UK9A 4USOA 1AXYA 2GNMA 1FATA 1QGLA 2XB6C 2MC2A 1W6QA 2QYIB 2ARBA 4FPCA 1ILR1 2RSTA 2YMZA 1MZ5A 4ISRA 1CPMA 3A21A 4WZFA 4OWLA 3Q9OA 2ZMLA 2AENA 4QO3A 5DZFA 4GKYA 1MC9A 3FJ9A 1HWOB 1YO8A 3AH2A 1BQPA 3MW3A 2DWRA 1W3FA 4JP0A 5BQUA 4K21A 3B9CA 1CQ9A 4LBMA 4XJUA 4XJWA 4BMEA 1SLIA 1TOOA 3EF2A 4LO3A 3USUA 1V6OA 1SCRA 4ZXKA 1SLCA 3B3QE 2FFUA 4OEFA 1AX1A 1MZ6A 1I1BA 4P6AA 1BXHA 3MW4A 4FOVA 2CWSA 5H9QA 3WV6A 1S0CA 1MVEA 2DVBA 5DVHA 1RG8A 1DQ0A 3AYDA 3CAHA 3FJFA 1X50A 1AJOA 3AP4A 3WDVA 5BQUC 4A7YA 1AXKA 2OW4A 3BAQA 3H0OA 4LO3C 3AZYA 1GLHA 4I2SA 1AVAC 5IT6A 1T4QA 3N7KA 1H30A 2DYCA 5GZEA 1WBCA 3VWCA 1UZYA 4CRQA 1ISWA 1DQ4A 4Z8BA 4YG0A 1PZ8A 2A6VA 3BODA 3O4BA 3O4CA 4BM8A 1XQNA 4XBQA 4ZFYB 2ZACA 5GLTA 1BASA 1G8WA 5FREA 4UW5A 1HKNA 1S0FA 4ZKTB 1FWUA 3ILFA 3B01A 1ULDA 3POKA 5DUVA 2Y9GA 4IYBA 3T1LA 1BARA 1V6VA 3LCPA 3OYWB 1URXA 3IAGC 2NM1A 3NBNA 4FOQA 4XFUA 4Y26A 1LOFA 3JUTA 3ZC9A 4EB2B 3POSA 4YM2A 1II4A 4XJAA 3UD9A 2DV9A 1XYFA 1JLYA 1DJSB 3KMVA 5H9RA 2ZGMA 4Q9GA 1JBCA 4IONA 5CBLA 2A6YA 4RA0A 1LOCA 2UURA 3UDAA 1VIWB 4LBJA 3VEQA 1ZA4A 3WHTA 5BOWA 2DU1A 5EYYA 4Q1RA 3RTIB 1PZ9A 3NV1A 3NJ5A 1A78A 1JT7A 1VLNA 3O0XA 1LOFC 1DLLA 3SISA 2VY0A 1F5FA 3WG4A 3VKOA 4P14A 1QQKA 2YROA 3ZPYA 2SBAA 2RQ9A 4KEKA 2A70A 3FJAA 2W68A 5I1BA 4ZA3B 1E0OA 1KRIA 1S0LA 4KBBA 1BFFA 1MS4A 4FOWA 1SCSA 4WBCA 5F8YA 3WDXA 2ZGTA 2WT1A 1RY7A 1Z0HA 1ULGA 6I1BA 1BLAA 3AP5A 4FPOB 1Q1UA 5EG6C 1CIWA 1WLDA 1EVTA 1C4RA 1FWVA 2D6OX 2L5XA 4W65A 4A7KA 4C1XA 3WO4A 2DVDA 2B7YA 1UN1A 4P0KA 3PJQA 4G1RA 3LSDA 4XKIA 4IHZA 3A4UA 4P9WA 4YW5A 3O12A 1IKPA 2ES3A 3GNEA 3FJ8A 2CY6A 4JCKA 4G9MA 5BXRA 2BFHA 1TTUA 2Z42A 4CJMA 2A3XA 4Q9PA 2D43A 2UWCA 4R9DA 2OVUA 3Q7YA 3BB2A 4D0ZA 4FOYA 4HL0A 1GNHA 1BA7A 1EYLA 1APNA 3ENRA 4Q8KA 4Y20A 3OJ2A 2NZ9A 2AQZA 2DVGA 1TWMA 2HWAA 5JVVA 3AKHA 2D3SA 1V6JA 1WCSA 4TYSA 3AJYA 4D8HA 2NVHA 4EFPA 5EYXA 1FAYA 4DS0A 2CTVA 1IJTA 3AYAA 1YBIA 3BAOA 3MPPG 3B9UA 4YLZA 3N7LA 3SLIA 4YGBA 1SZ6B 5FZUA 1WBFA 3ZX7A 1WD3A 3ZSKA 4UW4A 1AJKA 1DGLA 1W3GA 1YTOA 1VAVA 4WVWA 4JC1A 4Q91A 4LO8B 3N35A 2K43A 3FLTA 4LO1C 3WG3A 1WUVA 3WDYA 4YOLA 2A5ZA 3SH4A 3HBWA 1N1VA 2E6VA 2LTNA 4RL7A 5EHAA 4JKQA 4LO7B 3BA5A 4M00A 4KEJA 2DRZA 1DIWA 1HLCA 3FJKA 4HR6C 5LK5A 2E7QA 5D62A 5BXPA 3WDUA 4BLIA 3WHUA 3W9TA 4YZ3A 3OGGA 2AAIB 5H9SA 2WT2A 3H6RB 2LIEA 1Q8QA 2ZQNA 3ZXEA 2PHXA 3O4OA 2UWBA 3V0AA 1G82A 2VW1A 3BA4A 1QNWA 4OEEA 4PCRA 3SITA 1LESA 3PMEA 4JKXB 1WLWA 1KQRA 1ISVA 1QKQA 3UJ0A 2ZABA 4IY8A 2GO2A 4J2SA 3WO2A 5T5LA 5JOZA 1JY0A 5JDBA 3AX4A 1LECA 4ATEA 3BRDA 4U36A 3A22A 4XOGA 3PG0A 2Q3NB 2HYKA 1V6XA 5B2HA 2R1BA 5DSSB 4ATFA 2WSVA 4G6JA 2XG3A 1ULFA 2ERMA 2D23A 1XZZA 5KXBA 1BJQA 1I3HA 3ILAA 4LBQD 1Q8OA 4Y22A 2JKBA 1LHWA 3WA1A 3FJDA 3OJVA 4J23B 4Y1YA 2UWAA 3CA0A 2WT0A 3AZZA 3BIWE 5EC5A 1S0GA 3IM0A 3HN1A 1GKBA 1N1TA 1N4KA 2AFGA 3PUBA 1DQ2A 3CU1B 1RIRA 1LENA 1HIBA 3VUOA 3AJZA 2BQPA 3S8JA 2DVFA 3VKMA 4ZOTA 4Y1ZA 1DZCA 1ISXA 1N1YA 4FPJA 3AKFA 2Z49A 1SLTA 3NV2A 4MYEA 4XJ8A 4AWDA 1S0EA 3P53A 4YZ4A 1W6PA 3KQRA 4IZEA 2WRYA 1Q56A 3FGMA 1PWAA 2AR6A 3QR5A 5DZEA 3RSJA 2Q9XA 1SFYA 5GLZA 1WBLA 1Z4SA 3RG0A 5HCBA 2ZHKA 3V0BA 1FQ9A 1N3OA 5GZGA 3WUDA 2FMDA 2Y9FA 1KNMA 3Q7XA 1YRZA 1Z2VA 4I4UA 3S8KA 4YM1A 1SR4A 4I4YA 4YGEA 4YZ5A 3R05A 3BTAA 4FPHA 1FN0A 1A8DA 5DUWA 4GXLA 1D0HA 5DUYA 2RG9B 3PVNA 1PZ7A 1HDKA 4LBQA 2GNDA 1EPWA 3JU9A 1KDKA 4OW4A 4EEEB 2D6LX 3D7WB 2GALA 3CNAA 3VT1A 5F90A 1SR4C 5GZFA 1AVWB 4G6MA 4LO0C 1W6NB 1W0OA 2DUQA 1DQOA 4I30A 31BIA 1BFGA 3CA1A 1C1LA 3NBDA 3T1MA 2ARXA 3V79C 3I2XA 2FHRA 2F8XC 2GMPA 3BAGA 1ENQA 1QDOA 3ZXDA 1S0IA 4XFSA 1HKDA 1VCLA 2YV8A 3AKIA 1UL9A 2R0HA 1ENRA 5IK8A 1G7YA 3CA5A 1GZ9A 4JRAA 3C2UA 4ISQA 3BRFA 1U0AA 1LCLA 4IZXA 4KC3A 1AX0A 2ZGLA 1WBAA 4EKXB 1W6MA 1I1EA 1LGCA 4DPNA 4ZGRB 1CR7A 5GLWA 3ZXFA 5T5OA 4R6UB 4L4IA 1EV2A 1AZDA 4LBNA 4M3CB 1QOSA 3UJOA 3VT0A 1SBEA 2D6PA 2ZAAA 1M2TB 3AP6A 4X38A 4UW6A 2ZGUA 3W58A 1A3KA 2FO1A 2D3RA 4Q27A 2AUYA 4I1EA 4AGRA 1GZWB 1MS0A 4X3AA 4FPFA 1V6MA 3OY8A 4WV8A 1CE7B 2CNAA 1W6QB 3BAVA 5CB7A 4L8QA 1GANA 4F83A 1XHBA 1CN1A 2AXMA 4GALA 2ZMKA 2KLLA 4NOTA 2ZGNA 3HR9A 5IK7A 1NZKA 1WW6A 2Z48A 2F2FA 3SNVA 3UJ4A 2PHWA 1SLLA 4JQ0A 5E24E 2SLIA 2D6KA 4Z9WB 2FDBM 2DREA 1TEIA 3AZWA 2P39A 1N3QA 3USUB 4I8MA 2MLLB 4IQPA 4I4QA 4GKXA 1K5UA 4FPLA 1VAMA 2ZGOA 2D7IA 3ZXGA 3N3HA 2F2FC 4DENA 1PC8B 2UUSA 1KJLA 1MR5A 3DGTA 3RRDA 4YGDA 1D2SA 2CWMA 4I4XA 1JT3A 5GZDA 3C9ZA 1GYKA 2ZGRA 4XE9A 3OBTA 3ZSJA 1AVXB 1P63A 1QQLA 3NWKA 3R4SA 3WO3A 3AJ5A 2P2KA 1R8OA 3P6IA 2H0BA 2NP0A 2JJ6A 1H9WA 4DRVA 2R9KB 2D44A 3K1XA 1OKQA 5H9PA 4PBPA 2R0FA 5DUUA 3Q7WA 4LBKA 1HCDA 1OQLB 3BAHA 3B69A 3AP7A 4K1YA 3R4UA 21BIA 2CYFA 1ONAA 1SACA 3A0NA 3OGFA 4Y1UA 2EXKA 3M2MA 5JOXA 5G00A 1N1SA 1JYCA 4I3NA 1G9DA 4FP3A 2NYYA 4GA9A 3WMUA 4XFTA 5E89A 3WVJA 1LGNA 3E8LC 1ZM1A 4PQ9A 3VKNA 1JOJA 2EXHA 2IWTB 1IS3A 2DS0A 2GDFA 4Q26A 3ZXLA 1YXWA 1GV9A 3VT2A 2EAKA 2V73A 1KITA 2R49A 4XYXA 2D20A 4FQZA 5F8SA 4LO1A 5EWSA 1LULA 2D7RA 4HA2A 3NV4A 2EXIA 5GM0A 2A6XA 2VSEA 1DFCA 3CA6A 4OWKA 3ZSMA 1HCEA 5E8AA 3NBEA 1IT0A 5DZGA 2ZA9A 1WW5A 2KI4A 3O5SA 2DURA 4GP0A 3HSMA 4R9AA 4K20A 4AYUA 3I29B 1IOAA 3FUQA 1R8NA 3M1HA 4X37A 3BX1C 4G9NA 2AH2A 4XJ9A 2D7FA 1TP0A 3TC2A 2K4AB 3M3CA 1ITBA 2ZKNA 4YZ2A 5JOYA 1SLAA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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