2VXRA

Crystal structure of the botulinum neurotoxin serotype g binding domain
Total Genus 117
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
117
sequence length
431
structure length
428
Chain Sequence
NAILSLSYRGGRLIDSSGYGATMNVGSDVIFNDIGNGQFKLNNSENSNITAHQSKFVVYDSMFDNFSINFWVRTPKYNNNDIQTYLQNEYTIISCIKNDSGWKVSIKGNRIIWTLIDVNAKSKSIFFEYSIKDNISDYINKWFSITITNDRLGNANIYINGSLKKSEKILNLDRINSSNDIDFKLINCTDTTKFVWIKDFNIFGRELNATEVSSLYWIQSSTNTLKDFWGNPLRYDTQYYLFNQGMQNIYIKYFSKASMGETAPRTNFNNAAINYQNLYLGLRFIIKKASNSRNINNDNIVREGDYIYLNIDNISDESYRVYVLVNSKEIQTQLFLAPINDDPTFYDVLQIKKYYEKTTYNCQILCEKDTKTFGLFGIGKFVKDYWDTYDNYFCISQWYLRRISENINKLRLGCNWQFIPVDEGWTEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of the Botulinum Neurotoxin Type G Binding Domain: Insight Into Cell Surface Binding.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BOTULINUM NEUROTOXIN TYPE G
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
total genus 117
structure length 428
sequence length 431
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2008-07-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2vxrA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 2vxrA02
3CA3A 4I4PA 1TFMB 4WV8A 4XJWA 1LJ7A 2FO1A 4LO0A 1RINA 1EPWA 1LGCA 1DYKA 3RRDA 2OW4A 2DV9A 4UW4A 4LO8B 1RG8A 1HDKA 1QNWA 5DUVA 3OBRA 1APNA 3QR5A 1LEMA 2JECA 3AH1A 4TYSA 3WG3A 3ILAA 1QMJA 5SV8A 2BEAA 3CA4A 4AVSA 2J3PA 4ISQA 1DZQA 3M3EA 5D62A 1GZWB 1TIEA 5T50A 1AVAC 2K43A 3SNMA 1N3PA 1VAMA 2I2SA 3I4IA 3N7KA 2A6WA 5FZZA 3UD8A 5BXRA 4I4RA 5L73A 2XOAA 2GN7A 4XZPA 4U36A 3VKMA 4XILA 3JU9A 4IZXA 3AJ5A 4BLIA 1ITBA 2UWBA 3GALA 3O5SA 4FP2A 5EYYA 3QLQA 2VH9A 3AP4A 5EXOA 1ULGA 3ZXKA 3IPVA 5GM0A 2ZHNA 3RQ0A 5F5QA 2FGFA 2AUYA 4FOQA 1WD4A 3ZSLA 4M3CE 5FZUA 1ENRA 1T9FA 1FAYA 3I2AA 4QO3A 2D6NA 3M1HA 2VSAA 2A6ZA 5GLUA 1SR4C 2WLQA 3ZXFA 2RQ9A 5H9SA 1HWOB 3S8KA 2DURA 3AZVA 4Y20A 4GXLA 1H30A 3UD7A 3O4AA 2DVGA 1Q8PA 1W6OA 3WHUA 3D5OA 4Q2FA 3V0AA 5E24E 1LOFA 4LBOA 4LBJA 3RTJB 4FOWA 5CNAA 2V5YA 4CJMA 4XBNA 3N36A 1DZCA 3W58A 3MW3A 3RS6A 1FWVA 2KI6B 2PHRA 1G8WA 1V6KA 4YZ5A 1Q8VA 1V6OA 1G86A 2CWMA 3HR9A 3T8SA 4LBMA 4IY8A 2VLCA 1QQKA 1OFSA 1W6NA 4LO2A 3NBEA 2I1BA 3I2XA 4L4IA 2ZA9A 2ZGMA 2A70A 2EXIA 3F1RA 1FGAA 4KEKA 1ILR1 4Q1PA 3WLUA 3AYEA 3N3HA 3B9CA 4YG0A 2ZGPA 2A7AA 2ERFA 4FQZA 4IZEA 2BEBA 4I37A 3FLPA 4IONA 2LIEA 1KITA 4FPFA 1BFBA 3ILNA 4HANA 2ZGSA 2B7YA 2YMZA 2D6PA 3VT0A 2UWAA 4ISRA 2PHXA 1JT7A 1PWAA 1VALA 4P9WA 4AYUA 2A6VA 3BB2A 1DQ4A 4C1WA 1MS8A 4AGVA 1UKGA 3WHTA 3FGMA 3HN1A 3MALA 4I1EA 1YTOA 2A6XA 2D7IA 4LO3C 2Z48A 1LOGA 5GJ6A 4YW3A 2JE7A 5KXDA 2YY1A 3POYA 3BA7A 3WO3A 5BOWA 4M00A 2Y9WC 1QKQA 1ONAA 4YGCA 1WUVA 1GBGA 2WT1A 2AAIB 1WW5A 4I96A 1Q8SA 1LHUA 5HCBA 2X2TA 1HQLA 3LCPA 3FJKA 5GZFA 1FATA 1G9FA 4Y20B 2ESUA 4L4HA 2DTYA 3BAVA 2CTVA 2A71A 3TAYA 1DQ2A 5F9TA 1IT0A 3V0AB 4C1XA 4FQ4A 4XJ9A 4QALA 2NM1A 3L2YA 2ZZJA 3WDWA 1DIWA 1YRZA 1MD6A 1MVQA 2ZGNA 4YW4A 3C2UA 1N1YA 1EV2A 2YZ4A 3FBYA 4YM2A 3IM7A 3ILFA 3A0NA 3WOGA 2XG3A 1ISWA 2L5XA 5DUXA 1D0HA 3M3OA 4F34A 2Z42A 2RHPA 3SH3A 2OVUA 4AGGA 1W6NB 1SCRA 4J23B 3HSMA 2EAKA 3D6EA 3TC2A 4FP3A 1BASA 3AH4A 4I6IA 3VWCA 2A3YA 2PELA 5EHAA 1BARA 4OEEA 2ZGLA 1N3QA 5H9PA 1YIFA 2C5DA 3FJAA 3WUCA 4M3CB 2ZKNA 1MVEA 1IRPA 1LHVA 1DGLA 1LOCA 3ASIA 4K20A 2R0FA 3PMEA 3N0KA 2E4MA 1GV9A 3AJZA 1CIWA 3FJBA 2MC2A 2ZGOA 1DYPA 2MLLB 2P34A 3Q7XA 4LBLA 1KDMA 4GOYA 1ZM1A 4Y1XA 2JDZA 5GLZA 1WBAA 3AZXA 1C1FA 2HYKA 2P3JA 3WV6A 3O3QA 1ISYA 1BLAA 3APBA 4XTPA 4PF5A 5JVVA 2RG9B 4XOGA 1BFCA 3WG2A 1X50A 1J1TA 5EYXA 1UPSA 3FJJA 5DZFA 4P14A 4XIKA 1WW7A 3AXEA 2HW9A 3IIRA 1BYHA 1AXKA 1Q56A 3AFKA 1SBFA 1DJSB 4SLIA 3Q7YA 4EEEB 2TEPA 5FZYA 4DFSA 4FPHA 1PUMB 2NVHA 2FHRA 5DXDA 1O4YA 1SLBA 3B01A 2WBCA 2IWTB 2WSVA 4AN7B 4ITCA 3ZXGA 4BLJA 2NYYA 1V6UA 1IS6A 4P6AA 1RITA 5F90A 1KDKA 5IT6A 4KBBA 1MC9A 2DTWA 4FPYA 4FPCA 1W0OA 1GZWA 2D7FA 2AYHA 2YXSA 4GWNA 4AWDA 3VV1A 1KRIA 4I4YA 4M3CF 1WD3A 1W3GA 3Q7WA 4QKSA 1BLDA 1F31A 4G1RA 5F8WA 3BRDA 4M01A 1GZCA 3FUQA 4WBCA 7I1BA 5BP5A 4PBOA 2D43A 5JMCA 3M2MA 3HOMA 4HA2A 5GALA 2DREA 4ATEA 1Z2VA 3V64A 4YZ3A 3SH4A 3C9ZA 5KXCA 1JY0A 1MS0A 4X39A 4YW2A 1DQ6A 1UZZA 3FJCA 1ENSA 1S0BA 3ZC9A 2ZBJA 3H6SE 3WCRA 1HWMB 3BX1C 1SZ6B 31BIA 4Z8SB 2ZHKA 3DUIA 1G9CA 3H6QA 3Q9OA 2V73A 2E4MC 5KXEA 1N1TA 2GMMA 2ZQOA 3ATGA 1GSLA 1V6MA 5BVPI 1T4QA 3O12A 5FRAA 3WDTA 2D1ZA 4XFUA 4ZBVB 4H55A 4X3AA 5G00A 1NLSA 2F8XC 3AJYA 3V0BB 2R1DA 4FPJA 3BRGC 3S8JA 3FJ9A 1TP0A 4HL0A 1IS3A 2CNAA 3ZXEA 3VT1A 5JOWA 4R9CA 1LOEA 3M3CA 5T54A 4AVTA 4Y22A 1CVSA 2WKKA 3SITA 4TZDA 1AVUA 2KI4A 4I7IA 1D2SA 4JKQA 3WVJA 3K1XA 2YROA 3JUUA 1G7YA 2A6YA 2SBAA 4QKRA 1JUIA 1QOTA 4OW4A 1AF9A 3O4DA 1S0GA 2FDBM 2WT0A 4P0LA 4BMEA 3V79C 1HWNB 1S0JA 4USPA 2ZGTA 2Y9FA 1WLDA 1DLLA 3QCWA 1EVTA 2K4AB 2JKBA 2E6VA 2PHUA 4GOVA 1LOBA 1V6IA 2FMDA 1SACA 2YUGA 3ZXJA 3FLRA 3OBTA 4DRRA 3AP6A 1YF8B 1TEIA 2YV8A 1MR5A 1FMZA 3ILRA 4YM1A 3VSZA 5FNWA 1JHNA 3KM5A 4A7YA 3A4UA 1JT4A 2M49A 3P6IA 2LTNA 3RG0A 1QGLA 4I4XA 4YGBA 2GALA 3RMXA 4I2SA 2P2KA 1JN2P 4YLZA 3OJ2A 1MZ6A 1FWUA 4I0YA 1QQLA 3FJ8A 4JP0A 4I4OA 4Y1UA 4P0KA 4Q8KA 3AX4A 3W9TA 1JYCA 4Y1VA 1BFFA 3BTAA 1G82A 4XXPA 1LECA 2ZABA 3BA5A 1V6WA 2ZHLA 2DVAA 1LGBA 4XJUA 4GA9A 4P0JA 2DVBA 2K8RA 1V6JA 5B2HA 2NN8A 2ET2A 1ULDA 5T5PA 1ONKB 1IJTA 1IILA 2PHFA 1RMLA 4JQ0A 3QYDA 1TOOA 5BXTA 3USUB 3R4UA 5DUWA 1B09A 3PVOA 1Z4SA 4FOVA 1NUNA 3P53A 2ZGQA 3AP5A 5D61A 4YZ4A 2A5ZA 4D69A 4Y22B 1IOBA 4HR6C 1LCLA 4XHBA 1Q04A 4H04A 4J2YA 4LO0C 3LLPA 3CA5A 3BADA 1ABRB 2BFHA 4QD2B 3RMYA 4YOLA 1HQWA 4Y1ZA 5BXPA 4M3CA 2ZGKA 1FQ9A 5FNXA 3CRHA 2GO2A 5EC5A 2ES3A 1S0LA 1IRAX 1AZDA 1W6PA 5BXSA 3AXDA 2GNMA 1S0FA 1LHOA 5DG2A 4OZXA 1CR7A 1QOOA 4XYXA 1VCLA 3O44A 2DUQA 3IKWA 3NV3A 4YGDA 4J2SA 1V6VA 1AXZA 2AH2A 4L8QA 3AYCA 3CRGA 3PVEA 2DRZA 4BPZA 1FN0A 4XBLA 3VKNA 1AJKA 1SBDA 2GMPA 4R9DA 3BAGA 4GKYA 2ZACA 1SFYA 1I1BA 4GP3A 1OQ1A 2P39A 4KC3A 1JLXA 3GNEA 4Y1YA 2R9KB 1WW4A 3OGGA 2ZMKA 4G9MA 2F2FA 3KMVA 1PZ7A 4LO7B 3WDVA 3FJDA 5IK4A 2ZGUA 3IAGC 3RSJA 1JLYA 2VXRA 3MW2A 2ENRA 1BJQA 1N47A 4FPOB 3LSDA 3R4SA 2WNEA 9ILBA 4XJ8A 4YGEA 1DQ0A 1LODA 3B00A 2CYFA 5JOXA 2GDFA 4EKXB 1BFGA 2P37A 1S0CA 2D7RA 1U0AA 3BOPA 1W3AA 4IYBA 1LOFC 2NMNA 3M3QA 2JE9A 3D7WB 4Y26A 3KQRA 2ZAAA 3PG0A 1GICA 1WCSA 1ISXA 5GLWA 4Q91A 3VKFC 3ZSJA 4JCKA 1CQ9A 3ZX7A 2HZ9A 3AYDA 3WMVA 5BQUA 4Z8BA 4LO2C 3WDUA 2D3PA 2LALA 2FFUA 3WDYA 1CE7B 4BQ1A 3A21A 3H0OA 1ISVA 3WG4A 1Q1UA 3OJVA 3IM0A 3UJOA 1RY7A 5E8AA 3UJ4A 4Y24A 3ZXDA 4XXAA 1ZA4A 5I1BA 1WW6A 3P6JA 1QU0A 1FNYA 1WLCA 1S0IA 5IUQA 4EB2B 5DSSB 1HCEA 2G4IA 1W6PB 2MIBA 5GZDA 4KEIA 5FREA 1DFCA 3VKOA 4PCRA 1LHNA 4OEFA 1IS5A 1F5FA 5T52A 2D6OX 5H9QA 5KXBA 2DYCA 1AJOA 2UWCA 3V0BA 2ZMNA 3AKGA 1N1VA 2FFVA 4Q9PA 3AZZA 1JOJA 1QOSA 5GLVA 4ZA3B 2F2FC 5EWSA 4X38A 1QDOA 2JJ6A 3BAQA 2P3KA 3AKIA 1ENQA 2DU0A 3HALA 1JXNA 1N4KA 1C1LA 4YM0A 5IK8A 2Y9GA 2ZQNA 2EALA 4GWMA 2GNTA 2NTDA 4R9BA 2UU8A 4EFPA 2HWAA 1R8OA 1CPNA 4CZSA 3CU1B 1HWPB 2QYIB 1H9PA 1SLAA 5HCAA 3V65A 3N7JA 4XJZA 3WUDA 5DZUA 3FLTA 1AX2A 2ZMLA 5JOYA 1BKZA 4WZFA 3B9UA 1LEDA 1Z78A 4OEGA 1C57A 2AQZA 2D44A 5E89A 2Q9XA 3OYWA 5DZEA 2AGSA 4A7KA 5T55A 2R16A 1JBCA 3O0VA 4USOA 1LENA 5BQUC 1KJRA 3CQAA 2D22A 5E88A 1A8DA 4YG3A 1GKBA 4CTEA 1ISZA 3VUOA 2D24A 4ENDA 2VY0A 4JC1A 5F8YA 1CPMA 5D63A 2WSUA 1LU1A 2KM2A 4Q8LA 3AYAA 4LBNA 4XJAA 4GP0A 2UURA 1R8NA 3CA1A 4YFZA 4FOYA 5F8SA 2JD4A 2EXHA 3POKA 5T5OA 2GN3A 1CN1A 4YZ2A 3JRRA 4K21A 2GMEA 2KKIA 4DCKC 3UJQA 4YW1A 8I1BA 4BMBA 4FPGA 3BODA 2Q5TA 2EIGA 3SH5A 3NBCA 2WT2A 3H6RA 2NMOA 1AX1A 1JTCA 1SLIA 2R1BA 4PBPA 4RL7A 1SR4A 3USUA 1GNHA 5H9RA 3NV4A 1V00A 1SBEA 3AKFA 5DUYA 3FUOA 4EFRA 4XMAA 1VAVA 4XE9A 1GYKA 1S0DA 1PZ8A 2OUHA 4G6MA 4XKIA 3CA6A 3UL2A 3IMNA 5BYNA 1KQRA 4I4VA 1PUUB 1W6MA 3ZYRA 3WG1A 3AJ6A 2SLIA 3N7LA 1GLHA 3BAOA 3WINA 3VKLA 3ENRA 5JOZA 1YXWA 2PHWA 1R1ZA 2DWRA 1II4A 1PZ9A 1DQGA 5CAZA 5AVAA 4J2KA 1AVWB 3ZSKA 5HCFA 4G6JA 4QC4A 4I1BA 3UK9A 2A75A 2AENA 2EXKA 1S1AA 21BIA 1JT5A 4YG6A 4LO1A 1LULA 41BIA 5DZGA 1V6XA 3NV2A 1DQ5A 3IM5A 4ZGRB 1XZZA 4Q27A 1V6NA 3OYWB 2A3XA 3NJ5A 5BP5C 3AZWA 5HPZA 1IOAA 1M16A 4IY9A 1URXA 1S0EA 3HBWA 3POSA 4XFSA 1JYIA 1YYNA 2GNBA 3B3QE 2PHTA 2DUPA 4UW6A 1K5VA 4QBCA 4OWJA 3O0WA 4K1YA 3A23A 3SNVA 3MEPA 4GKXA 1G9AA 4Q9GA 2Z49A 1Q03A 2ZHMA 1BQPA 4Q26A 2D20A 5GZCA 1CONA 4LO3A 4LBQD 4XMIA 3WNXA 1FX5A 1N1SA 1K5UA 2Q3NB 1N3OA 1CVNA 2E53A 1IHKA 4I4SA 2AXMA 3WMUA 3U4XA 3H6RB 1P63A 1KJLA 5IK5A 2DUOA 4QBVA 1MS1A 1GANA 2GNDA 2ZR1B 1FYUA 1LOAA 1AFCA 4XFTA 4LBQA 3F62B 1LU2A 4G9NA 1PZZA 4LBKA 4YM3A 3BRFA 1ULFA 2ARXA 4I3NA 1E0OA 2A3WA 3ZC8A 1GNZA 3WINC 2EF6A 1W6MB 4QD2C 1Q8QA 1BZWA 3OGFA 4RA0A 2KLLA 5GAQA 3BAHA 4I8MA 4ZFYB 2DVFA 3BA4A 3N35A 1TWEA 1ULEA 6I1BA 3ZPYA 1G9BA 1UX6A 1LTEA 1M2TB 1J0SA 3ZSMA 4ZOTA 1HCDA 4LO1C 4JRAA 1DBNA 3NBNA 1QXMA 3RTIB 1YO8A 1XG6A 1CJPA 4D0ZA 1UAIA 1G9DA 4XHXA 1RZOB 5DVHA 3HMYA 3I8TA 4W65A 2DVDA 4II0A 1DQOA 4ZLBB 2WQZC 4GAFA 1HIBA 4ZFWB 2E7QA 1CESA 3EF2A 3BAUA 2H0BA 3O4CA 3TB0A 2D6LX 3CA0A 3D4KA 1A78A 4LO7C 3ZXLA 2CWSA 1I3HA 4UW3A 4XDQA 1OQLB 2VUAA 5DG1A 4CRQA 1WBFA 1DFQA 1DHKB 3A0KA 2RSTA 2R49A 3IPVB 1IKQA 4IQPA 3AH2A 2W08A 5CB7A 4I30A 3PHZA 4JKXB 3IM6A 1W6QA 2VW2A 1QDCA 4Z9WB 2VW0A 1BXHA 1BA7A 3OY8A 2VW1A 4DEPA 2D6KA 3FJHA 5GZEA 2X2SA 4IHZA 1Q8OA 4ZXKA 4K1ZA 1AVBA 3PVNA 5T5JA 4JPZA 3VT2A 4YFWA 3FJFA 3AKHA 3FJIA 1YI7A 4LBQB 4HJJA 1MS3A 1W6OB 3T1MA 1DQ1A 4R9AA 1C4RA 3CRIA 4Q1RA 3VEQA 3SLIA 2W52A 3T2TA 1SLTA 1ULCA 1PC8B 3WCSA 4P9XA 4D0TA 1W3FA 1RIRA 3O0XA 1QNYA 4GALA 3NBDA 3PJQA 1LHWA 1IKPA 3MW4A 4X37A 1O4ZA 3DGTA 3WDXA 1YBIA 3NWKA 4P9YA 2CL2A 3R05A 5GLTA 4DENA 1HKDA 1AXMA 2QN4A 4NOTA 1SLCA 1LESA 3ZYPA 5CA6A 2ERMA 4BM8A 3WO2A 2R0HA 2ZGRA 4DPNA 1GZ9A 1MZ5A 3A22A 5JLVA 5IK7A 4DS0A 3OJBA 4OWLA 4FPEA 2HWMA 3AK0A 4PQ9A 2DS0A 1LGNA 2W39A 1TWMA 2D23A 2C9AA 4ZKTB 2IHOA 3WO4A 1UMZA 2VXTI 4XTMA 1OKQA 1JT3A 3UJ0A 4EFQA 1W0PA 3WA1A 5EG6C 2W68A 5GZGA 1H9WA 5DUUA 5T5LA 2D3SA 1FNZA 2E7TA 4FPLA 3CAHA 3ZVXA 3AP7A 3O49A 3UDAA 2NZ9A 1SCSA 4XIOA 3INAA 3B69A 4ZFUB 2P3IA 3N7MA 4AGRA 1VLNA 4BOWA 1FMMS 4U2AA 1SLLA 4GAIA 4TLPA 1W6QB 4WVVA 3UD9A 2NP0A 1I1EA 3OY8B 4I4UA 4AVVA 4MYEA 4NO4A 2KH2A 4A7ZA 3OJMA 3OPZA 1NZKA 5LK5A 2VU9A 1HLCA 2AR6A 2UUSA 4OWKA 3AP9A 1MS9A 2XB6C 1F9KA 1WBCA 1UN1A 3O5WB 1QF3A 3FFZA 1UL9A 2Y9XE 1MS5A 1XYFA 3BIWE 1HKNA 4JAWA 1XQNA 3E8LC 2WJSA 2CY6A 2E51A 4WVWA 4XBQA 3JUTA 4F83A 1XHBA 2P23A 1AXYA 4AN6A 1MS4A 1EYLA 3O4OA 1A3KA 3A07A 2BQPA 2WRYA 4J2XA 1WBLA 4FVVA 4YZ1A 3PUBA 3MPPG 1JQZA 4I4QA 1V6LA 2ARBA 2DU1A 2EXJA 4DRVA 5CBLA 4ASMB 4KEJA 4PC4A 3I29B 2DRYA 3CNAA 1TTUA 4H9WA 2AREA 1Z0HA 3LSEA 2AFGA 2LIQA 4FGFA 3FJEA 3SISA 1DZDA 5JDBA 4FPKA 4YW5A 2VSEA 1JW6A 4ATFA 3NV1A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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