5D61A

Moa-z-vad-fmk complex, direct orientation
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
292
structure length
292
Chain Sequence
SLRRGIYHIENAGVPSAIDLKDGSSSDGTPIVGWQFTPDTINWHQLWLAEPIPNVADTFTLCNLFSGTYMDLYNGSSEAGTAVNGWQGTAFTTNPHQLWTIKKSSDGTSYKIQNYGSKTFVDLVNGDSSDGAKIAGWTGTWDEGNPHQKWYFNRMSVSSAEAQAAIARNPHIHGTYRGYILDGEYLVLPNATFTQIWKDSGLPGSKWREQIYDCDDFAIAMKAAVGKWGADSWKANGFAIFCGVMLGVNKAGDAAHAYNFTLTKDHADIVFFEPQNGGYLNDIGYDSYMAFY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title An Unusual Member of the Papain Superfamily: Mapping the Catalytic Cleft of the Marasmius oreades agglutinin (MOA) with a Caspase Inhibitor.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Agglutinin
molecule tags Hydrolase
source organism Marasmius oreades
total genus 92
structure length 292
sequence length 292
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF14200 RicinB_lectin_2 Ricin-type beta-trefoil lectin domain-like
A PF18021 Agglutinin_C Agglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 5d61A01
3.30.460.70 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Beta Polymerase; domain 2 Beta Polymerase; domain 2 5d61A02
4QKRA 3AH1A 1FV3A 3BA5A 4YOLA 5DZUA 4J2KA 2D7RA 3FUOA 3P53A 4LO2A 5FNWA 4I96A 3BA4A 1DQGA 2NP0A 3C9ZA 3RTJB 1PUUB 3AH4A 5BP5C 4I4YA 3FJAA 4J23B 2F2FA 4I4QA 3A21A 4Q9PA 1TTUA 1V6XA 2K8RA 1YF8B 4FGFA 4LO3A 2J3PA 4HJJA 3N0KA 4P0JA 5BXPA 4CJMA 1WBCA 1R8OA 3FJEA 1ISYA 2AFGA 1IOBA 1BFBA 4A7ZA 3FJCA 1L2HA 1BARA 1JY0A 1EPWA 3BRDA 1IT0A 3LTQA 1XG6A 3FJIA 4G6JA 2ESUA 6I1BA 4Z9WB 1V6UA 3CRHA 1AVWB 4GAFA 4A7YA 1SZ6B 3I2XA 2D22A 4QKSA 2HZ9A 2VXTI 3CA1A 4LO1C 3H6SE 3PG0A 5EG6C 3BTAA 1PC8B 3A07A 3VWCA 3ILAA 3FJ9A 4JQ0A 3AH2A 3F1RA 2E4MC 4XFTA 1M2TB 1W3GA 2AAIB 3OBRA 4OEEA 2P23A 4HA2A 4EKXB 3ZC8A 3OBTA 4ZFUB 1ABRB 4OEFA 4EFQA 2Y9GA 3W9TA 3TC2A 2RSTA 3OGFA 3RMXA 3FUQA 3BAVA 1UPSA 3OGGA 4ENDA 1S0LA 2Y9WC 1DQOA 4J2XA 4EFRA 3V0AA 2X2SA 4IQPA 1T9FA 2P39A 1FWVA 1BFFA 1EYLA 3S8JA 5BQUA 3H6RA 1PUMB 3OJVA 3NJ5A 1S0FA 4R6UB 2YUGA 2MLLB 2F8XC 3V0BB 3NBNA 3OJ2A 1ISXA 3AKIA 2RQ9A 4GAIA 4QD2B 4ZOTA 3VUOA 4DENA 1T4QA 2E4MA 3FJJA 1Z0HA 2VSAA 4I8MA 4ZFYB 3HOMA 1R8NA 4OUJA 4QALA 4USPA 3QR5A 5BXSA 2BEBA 2MIBA 4IONA 4JKQA 3O4DA 3F62B 5D62A 4X3AA 3BADA 2BEAA 4OWKA 1RMLA 3ZXGA 1CE7B 1BFCA 2ZR1B 3VT2A 3CRGA 3FGMA 1JTCA 3AKHA 3I2AA 4LO7C 4ZA3B 1HKNA 1Q04A 2R9KB 3BAQA 2GO2A 3WMVA 1I1EA 2LIQA 1DFQA 3VSFA 1AVUA 4IZXA 4LO7B 3BX1C 4GOVA 3NBCA 3K1XA 3D7WB 1YBIA 2K4AB 3AZVA 1IRPA 4II0A 1Z4SA 4ZGRB 5JLVA 4TLPA 4KC3A 1IILA 3Q7YA 5FZUA 2ET2A 4I1EA 1S0DA 1N4KA 1Z2VA 4X39A 3WA1A 4F83A 1SR4C 3HN1A 1D0HA 2KI6B 1ITBA 4IZEA 2UUSA 5BXRA 4I4XA 4QBCA 2Q3NB 3MALA 1JLXA 1ISZA 3BAHA 1TIEA 4IY8A 3UD7A 2RG9B 3UJ0A 4G1RA 3AKGA 2AQZA 2ZQOA 4JAWA 3CA3A 1IRAX 3JUTA 3FJDA 4D0TA 4XKIA 1HWOB 3O49A 4I4SA 4I0YA 1YTOA 1BASA 2KH2A 5GAQA 2D24A 5BVPI 2AXMA 3SNVA 4AN7B 1FV2A 4KBBA 4QC4A 2ERMA 3LLPA 2L5XA 3OJMA 2NVHA 1FGAA 1V6VA 2D1ZA 4J2SA 5E24E 1TOOA 4D8HA 3AJ5A 2QN4A 1Q03A 2LIEA 4L4HA 5BP5A 4ZFWB 3WO4A 1SR4A 1BFGA 2D44A 1AXMA 3CAHA 4X37A 2Q9XA 1BLAA 3BB2A 3FJKA 4H04A 1JLYA 3O4OA 4XFSA 4DEPA 3Q7XA 2Y9FA 3CU1B 3N7JA 3B9UA 5HPZA 3V79C 1S0CA 5DUYA 3PMEA 1FQ9A 2D43A 2NYYA 3AKFA 4H9WA 2HWAA 5BOWA 5F8YA 4I3NA 4QD2C 4EEEB 1QQLA 3RMYA 3O4AA 1IJTA 1XZZA 2FFUA 4Q9GA 2NM1A 1V6WA 1AF9A 3IAGC 3S8KA 4LO1A 4ZKTB 2Y9XE 4LO8B 1TWEA 3UD8A 1G9BA 1EV2A 1HIBA 5F8WA 1BA7A 3T8SA 4IHZA 3FJBA 3IM5A 3HBWA 1G82A 3N7MA 4J2YA 3WMUA 1TP0A 3KMVA 4AN6A 4G6MA 4KEIA 4KEKA 4I4OA 2M49A 2IWTB 1JT4A 1ISWA 1K5VA 4EB2B 1KNMA 1FN0A 2ZQNA 3IM7A 3R4SA 3I29B 5FNXA 1J0SA 4G9MA 4X38A 1DJSB 3A22A 3IM6A 4Z8SB 2KI4A 3BAUA 3WINC 3FFZA 4P0LA 4FVVA 4I4RA 3HSMA 3V0BA 2FO1A 2GZBA 3H6QA 1FWUA 21BIA 1MC9A 2DREA 1OQLB 2WBCA 2VSEA 3BA7A 4Q91A 1AVXB 2VU9A 5F8SA 31BIA 3O3QA 2FDBM 1AVAC 1CVSA 1QQKA 4IYBA 1TWMA 2DRZA 7I1BA 5FZZA 4P6AA 4USOA 3CA4A 4JP0A 4ZLBB 4OW4A 3RSJA 1ISVA 1S0BA 4I2SA 1HWPB 2VUAA 1PWAA 3PUBA 3VT1A 2I1BA 3AJ6A 4ISRA 3O4CA 4I1BA 4L4IA 4F34A 1JT7A 5D63A 5I1BA 1RG8A 2X2TA 3A23A 1F31A 3NBDA 1GGPB 1NZKA 5G00A 4ZBVB 5JMCA 3IIRA 1BLDA 1FMZA 3O44A 3WINA 3ZC9A 5DVHA 1JT5A 4LO0C 4I4PA 2D7IA 1HWNB 1E0OA 2QYIB 3O4BA 1PZZA 3BAOA 4P0KA 3N7KA 8I1BA 1S0EA 3HMYA 1ONKB 1WD4A 1VCLA 1G9AA 4D0ZA 3JRRA 4GOYA 2DRYA 3CA0A 2K43A 3FJFA 3Q7WA 2IHOA 3E8LC 2HW9A 1K5UA 5BQUC 4OEGA 3V0AB 3WO3A 1DZDA 1DFCA 2BFHA 3UJ4A 4EFPA 5F90A 4PC4A 5D61A 3H6RB 3UD9A 3BRGC 4IY9A 2D20A 3WO2A 3ZX7A 1WD3A 3P6JA 4JRAA 1NUNA 2KKIA 4I37A 4QBVA 2WRYA 2XOAA 2MC2A 3FJ8A 1A8DA 3NBEA 3UDAA 3ZXDA 1G9CA 2FGFA 41BIA 3VSZA 4LO0A 5EHAA 2Z49A 1HCEA 5DSSB 1RY7A 1IHKA 2DS0A 5BXTA 1XHBA 3CRIA 2VLCA 3POKA 3FJHA 1DLLA 1ILR1 3BAGA 4I7IA 3VEQA 2NZ9A 3HALA 1W3FA 4A7KA 1S0GA 1QXMA 9ILBA 1EVTA 1II4A 3CA6A 3BRFA 3P6IA 4LO2C 4GP3A 3QYDA 1HWMB 4I4VA 1W3AA 1YYNA 3EF2A 4QO3A 4HR6C 3RTIB 4G9NA 2F2FC 1DZCA 2FFVA 5EC5A 2NTDA 2Z48A 1JQZA 1YXWA 3N7LA 3R4UA 2HWMA 1JT3A 4I4UA 4I6IA 4OWJA 4DCKC 4LO3C 3AZWA 2D23A 1WBAA 2KLLA 4ISQA 4GP0A 5FZYA 1FMMS 4OWLA 3MPPG 1G9DA 4WBCA 1AFCA 1MD6A 4JKXB 1P63A 2VXRA 4XFUA 1Q1UA 4JPZA 1DIWA 5B2HA 3VT0A 1I1BA 1M16A 1XYFA 3PHZA 3O5WB 1HCDA 1TFMB 4KEJA 3CA5A 3CQAA 1RZOB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3AH1A 1FV3A 3H37A 9ICQA 3FUOA 3P53A 5FNWA 1DQGA 4WC1A 2NP0A 3C9ZA 1ZQNA 3AH4A 4RWQA 4J23B 2F2FA 4I4QA 3A21A 1V6XA 3C66A 2J3PA 5BXPA 4P0JA 2AFGA 1BFBA 1L2HA 3BRDA 1IT0A 1BPZA 2ESUA 4Z9WB 4NM1A 1AVWB 4KLIA 1F5AA 2HZ9A 3PG0A 5DB9A 3VWCA 3A07A 7ICQA 4FH5A 3RJFA 3WFSC 4OEEA 2P23A 7ICTA 1ABRB 4OEFA 2Y9GA 4NY8A 3RMXA 3FUQA 1Q79A 3BAVA 7ICUA 3OGGA 4ENDA 1S0LA 2RFFA 4EFRA 2X2SA 5IIKA 5F2VO 1EYLA 3H6RA 4WQKA 3OJVA 4NKUA 2ZH4A 4NLZA 1T4QA 2E4MA 4HX0A 4F5RA 4TUPA 1BPDA 1R8NA 4OUJA 2BEBA 4LEZA 4JKQA 2NRKA 3F62B 5HRLA 1ZQEA 2BEAA 3ZXGA 5DBAA 2ZR1B 3VT2A 2BE3A 3I2AA 4ZA3B 4QZEA 2LIQA 4KLQA 2W9MA 3VSFA 3BX1C 5D49A 3K1XA 5DDMA 9ICJA 4II0A 9ICOA 2M2TA 4KC3A 3PMLA 1ZQAA 4E8FA 3NYBA 4GXKA 1VJ7A 3HN1A 4MF2A 2KI6B 4KLMA 3MBYA 4KLSA 8ICRA 4FHXA 3C2MA 3MALA 1JLXA 3UJ0A 4G1RA 4JAWA 4XKIA 1HWOB 4UAYA 1ZQXA 4RQ8A 4I0YA 3TFRA 3SNVA 5HRHA 4RQ1A 4M04A 3ER8C 3OUYB 4KBBA 2BPCA 4UBCA 2L5XA 8ICIA 2NVHA 1FGAA 4J2SA 4WC0A 3JPPA 4D8HA 5CB1A 4YCXA 4L4HA 5BP5A 5HRKA 4X4SA 5HRBA 5J2EA 4X37A 2Q9XA 3C2LA 1JLYA 3O4OA 3UXOA 4EBKA 2Y9FA 4RPYA 3CU1B 3N7JA 4I2IA 4UAZA 1S0CA 5BOWA 4EEEB 3O4AA 2VANA 3HWTA 2NM1A 1AF9A 4LO1A 4ZKTB 4NXWA 1UEUA 5B3PA 5F8WA 1XSNA 4K9AA 4X4NA 1JN3A 2DVIA 3N7MA 1TP0A 3KMVA 9ICTA 4KEIA 4MFCA 4MZHA 4TURA 3IM7A 4G9MA 3IM6A 1GPJA 4NLNA 4RQ3A 2GZBA 9ICCA 1FWUA 9ICWA 21BIA 1MC9A 1OQLB 2WBCA 2VU9A 31BIA 1CVSA 2ISOA 1QQKA 1TWMA 2DRZA 1NO5A 3OVAA 4P6AA 4EEBA 4JP0A 1ISVA 2VUAA 5J2HA 2P66A 4NXVA 4EGWA 4WC5A 4F34A 1HUOA 5D63A 2PFOA 3NBDA 1ZQTA 2EWRA 2ZH3A 1NZKA 4FH3A 5J0RA 3O44A 4LZGA 1HWNB 4EBJA 2BCRA 1ZQDA 3O4BA 8I1BA 1S0EA 9ICAA 4R66A 1VCLA 1TFWA 1G9AA 3JRRA 3CA0A 3FJFA 4R65A 2IHOA 4IQUA 2HW9A 1K5UA 3MGHA 4OEGA 2PXIA 1DZDA 3UJ4A 2I9GA 4MZFB 1MIVA 3P6JA 4JRAA 1NUNA 2KKIA 2MC2A 4M9GA 3UDAA 3ZXDA 4QZBA 4LO0A 3OUYA 2Z49A 2B56A 5J29A 5CFSA 4KLGA 3CRIA 2VLCA 3POKA 1ILR1 1UETA 1ZQIA 4I2HA 3HALA 5J0OA 3V7KA 4A7KA 1ZQZA 9ILBA 4KLLA 4KLFA 4KLUA 8ICGA 3RH4A 4QO3A 5DECA 4O9MA 5HREA 1DZCA 5EC5A 3C2KA 2DRAA 4I4UA 1BPYA 4I6IA 4O5CA 4OWJA 4LO3C 5J0QA 4X4UA 3PNCA 4FO1A 1G9DA 9ICKA 4LZDA 1P63A 1ZQRA 3TFSA 5B2HA 4R64A 3VT0A 1RZOB 4QKRA 3BA5A 2M2WA 7ICMA 1BPEA 5BPCA 5BP5C 7ICVA 3FJAA 1YF8B 4QZGA 4HJJA 1WBCA 1R8OA 1WOTA 1TVAA 1BARA 4KLDA 1XG6A 4OAGA 3FJIA 4S3NA 3CRHA 3H39A 3V72A 5J2JA 5IINA 4PHDA 2D22A 9ICRA 4LO1C 1MIWA 3C5GA 1JQRA 2AAIB 4EKXB 4EFQA 8ICVA 4MFFA 4RT3A 5J2CA 3NVOA 2Y9WC 2BPFA 2BCUA 4YMNA 4PHAA 1BFFA 4M9HA 4X5VA 3S8JA 3NJ5A 1S0FA 4R6UB 3B0XA 2F8XC 4RQ7A 4WC2A 4ZOTA 4OAIZ 4QZ8A 3FJJA 3HOMA 4USPA 3QR5A 5BXSA 2MIBA 3O4DA 8ICCA 3AU6A 4X3AA 2M2UA 1CE7B 3RH6A 1BFCA 1R8BA 1R89A 1Q04A 1ZQMA 5DBBA 4FO6A 5CFTA 3AQLA 2GO2A 1DFQA 4LO7B 4GOVA 3NBCA 3OVSA 3AZVA 1IRPA 4ZGRB 4WBZA 5HHHA 3Q7YA 4I2DA 3K7DA 2BPGA 3JPQA 2HN1A 4X39A 3WA1A 4F83A 1SR4C 1D0HA 4IZEA 7ICGA 5BXRA 5J2DA 4I4XA 4WC4A 5IILA 1ISZA 4FHYA 1TIEA 3RJHA 3H38A 2ZQOA 3JUTA 4UB3A 5J2IA 3O49A 4I4SA 1BASA 2KH2A 2D24A 1FV2A 1UEVA 3JPSA 3HW8A 4QC4A 2ERMA 4F5PA 1V6VA 2D1ZA 7ICEA 1TOOA 9ICGA 3AJ5A 1BFGA 8ICPA 1AXMA 3CAHA 4PPXA 3BB2A 4K8VA 4XFSA 4QZCA 4KB6A 3UPQA 2IUBA 4RQ6A 3UQ2A 3V79C 3PMEA 1FQ9A 2D43A 2NYYA 4M0AA 2HWAA 4I3NA 4Z6FA 4QD2C 3RMYA 3AU2A 1XZZA 4Q9GA 1OU5A 4QZHA 4LO8B 1G9BA 4PGQA 4NXTA 3MDCA 5BOLA 3IM5A 3HBWA 1G82A 2M2VA 4O5EA 4AN6A 4AT9B 8ICEA 2HN2A 4F5NA 1JT4A 4O68A 1FA0A 4EP7A 4LEVA 2ZQNA 2IHMA 3R4SA 1J0SA 1YLQA 1DJSB 4PHEA 4WC7A 3BAUA 3FFZA 4I4RA 3OV7A 3BA7A 4UD4A 1AVXB 2O5AA 3O3QA 2FDBM 1ZJMA 3WFPA 8ICWA 5BOMA 2ZH1A 3CA4A 3RSJA 1S0BA 1HWPB 5CA7A 3PUBA 3VT1A 7ICJA 2ZH8A 4ISRA 3O4CA 1ZQJA 1RG8A 4NKTA 1F31A 2ZH6A 3L9DA 5G00A 5JMCA 3WINA 7ICRA 5DVHA 2ZH2A 1JT5A 2DR9A 3C5FA 4P0KA 4P2HA 3N7KA 9ICEA 3ISBA 4WOYA 4D0ZA 4MFAA 4GOYA 2DRYA 4X4TA 7ICIA 1PX5A 1ZQQA 4JWNA 1MQ2A 3V0AB 5D61A 4QZ9A 4IY9A 1ZQPA 5DDYA 2WRYA 2XOAA 4XQ8A 3FJ8A 1A8DA 3NBEA 1G9CA 5EOZA 3VSZA 5J0PA 1HCEA 4JWMA 8ICAA 4IQTA 2PBEA 5DSSB 5BXTA 3JCFA 3FJHA 4OAHA 4I7IA 8ICXA 9ICHA 2BCQA 3RJJA 4K99A 1QXMA 3CA6A 3BRFA 4I4VA 3MCRA 5HRGA 4HR6C 4X0BA 4WC6A 2F2FC 2FFVA 2NTDA 2Z48A 1JQZA 2HWMA 4GP0A 1FMMS 4OWLA 3OVBA 1AFCA 4XFUA 1Q1UA 4JPZA 4AT9A 1I1BA 1M16A 1HCDA 1TFMB 2K8RA 4J2KA 4LO2A 5D46A 1Q78A 4I96A 5HRDA 8ICBA 5CHGA 3JPOA 5HC9A 1NOMA 5CP2A 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8ICSA 4X38A 3A22A 4Z8SB 2KI4A 4FVVA 2ISPA 2FO1A 3H6QA 5J2BA 4RT2A 4M47A 2VSEA 5CR0A 4UB2A 4FHPA 4XUSA 4YMOA 1AVAC 2ZH9A 8ICZA 4USOA 5D4BA 3UPSA 5J0SA 4ZLBB 4OW4A 1ZQCA 9ICIA 4I2SA 1PWAA 4PH5A 3RJEA 2FMPA 4XA5A 4LEWA 3AJ6A 3JYYA 5IIOA 1VFGA 5I1BA 3A23A 1MIYA 1GGPB 7ICSA 1FMZA 4LO0C 4I4PA 2D7IA 2BCSA 4X4VA 2O1PA 3BAOA 4MZGB 1ZQKA 4MKPA 3MDAA 2K43A 3Q7WA 4WBYA 3E8LC 5DB6A 3WO3A 4M9NA 2BFHA 4PC4A 4QZFA 5B3QA 3UD9A 4R63A 4K98A 2D20A 1XSPA 4O6AA 4EEDA 1ZQUA 4QBVA 4YD1A 1ZQOA 2GA9D 2DRBA 2FGFA 7ICKA 4UD5A 1IHKA 3GDXA 1XHBA 1R8AA 4DOBA 2DR7A 2DR5A 3NKUA 8ICOA 1DLLA 4I2BA 3VEQA 2NZ9A 2PFQA 3MGIA 1W3FA 1S0GA 3V7LA 4FHWA 1II4A 3P6IA 3QYDA 1W3AA 9ICLA 1YYNA 3EF2A 4GXJA 4G9NA 1YXWA 4I28A 4DCKC 3AZWA 2D23A 4ISQA 3LQCB 5CHEA 3AQKA 4JLZA 5J2FA 2NS2A 1MD6A 4JKXB 9ICUA 4Z6DA 1XYFA 1ZQSA 3PHZA 3O5WB 4KEJA 3CA5A 3CQAA 4YOLA 5DZUA 2D7RA 4LT6A 5CJ7A 3BA4A 3RTJB 3WFQE 1PUUB 4XJEA 4I4YA 2B51A 4Q9PA 1TTUA 4FGFA 4LO3A 8ICKA 4CJMA 1ISYA 4M5DA 3FJCA 4IQVA 1JY0A 1EPWA 4PHPA 2ID1A 5J2AA 1RPLA 5JTGA 4GAFA 4A7YA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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