1EQFA

Crystal structure of the double bromodomain module from human tafii250
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
267
structure length
267
Chain Sequence
GTTVHCDYLNRPHKSIHRRRTDPMVTLSSILESIINDMRDLPNTYPFHTPVNAKVVKDYYKIITRPMDLQTLRENVRKRLYPSREEFREHLELIVKNSATYNGPKHSLTQISQSMLDLCDEKLKEKEDKLARLEKAINPLLDDDDQVAFSFILDNIVTQKMMAVPDSWPFHHPVNKKFVPDYYKVIVNPMDLETIRKNISKHKYQSRESFLDDVNLILANSVKYNGPESQYTKTAQEIVNVCYQTLTEYDEHLTQLEKDICTAKEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure and function of a human TAFII250 double bromodomain module.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RNA POLYMERASE II TRANSCRIPTION INITIATION FACTOR
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
total genus 97
structure length 267
sequence length 267
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2000-04-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 1eqfA01
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 1eqfA02
5C4QA 3JVLA 4ZC9A 4N4HA 4UYHA 5LKZA 4QEWA 3UVYA 3S92A 4BHWA 5LVRA 4OUFA 3D7CA 4YABA 5CQ7A 4A9FA 2YQDA 5CQ4A 4HXSA 2LSPB 3U5OA 4LYSA 5CUAA 5IG6A 5DBMA 2NXBA 5ENIA 5FDZA 3MB4A 4NR5A 5E9MA 4IORA 3P5OA 5D0CA 4QBMA 4WIVA 5BT3A 4NR6A 5FG4A 4YY4A 5HQ5A 5HQ7A 5J0DA 2WP2A 3P1FA 5CRMA 5ACYA 4CFLA 5I1QA 5ENFA 5H85A 3Q2FA 2R0SA 5L96A 4O7FA 4QYLA 2DVQA 5A85A 4NYVA 4TS8A 5L99A 4NS5A 3UVWA 4XY8A 4QSPA 5DY7A 4TT2A 5EU1A 4QSTA 4N3WA 5DYCA 4ALGA 4NYXA 5CQ3A 4CUUA 5D26A 4YAXA 3LQIA 2F6JA 3AADA 4HBYA 5CGPA 3IU5A 5FE6A 3QZSA 3JVKA 5KHMA 5KTWA 4LC2A 3TLPA 3P1DA 5TB6A 4E96A 2DATA 4CUQA 4O74A 4TU6A 5EICA 5FE4A 5AD3A 4HXMA 3UV5A 4YADA 4ALHA 4XYAA 5CUEA 5CY9A 5CS8A 4A9IA 2RFJA 3S91A 4UITA 4O7BA 4XY9A 5CUGA 5F61A 5EP7A 3LXJA 5DYAA 4HBXA 5JWMA 1F68A 3SVHA 5FE7A 3O33A 3I3JA 4MEOA 5C89A 4LDFA 4KV1A 5ENEA 5CRZA 4UYFA 4MR4A 5LJ0A 5FE5A 4DONA 4X2IA 3JVJA 4QY4A 5LKUA 5F63A 5EVAA 4XUBA 4LYWA 5D25A 4QR4A 4LRGA 5I86A 5LJ1A 3IU6A 5KTXA 4HXNA 4QUTA 2H60A 4NRAA 3O37A 2R0YA 5D3LA 3MB3A 3U5KA 3QZTA 5HELA 4PTBA 3O36A 3U5PA 3FKMX 5COIA 5EM3A 2E7OA 4QSQA 5HFQA 5IGNA 3MQMA 5E0RA 4MEQA 5A81A 4HXKA 4YY6A 2RS9B 3P1EA 4YC9A 5ENBA 4YYIA 2N9GA 5F3AA 2YEKA 4A9NA 2E7NA 5I83A 1WUMA 5FE3A 3LQJA 5CUCA 2R10A 5L8UA 5II1A 3RCWA 4YH4A 4HBVA 4TQNA 2RO1A 4YYMA 3HMEA 4BW2A 5EA1A 4Z1QA 5C85A 3U5JA 5I88A 4NR8A 2GRCA 5D3HA 4NQNA 5DLXA 5DFDA 4QB3A 4J0RA 3MUKA 2L84A 2I7KA 5C8GA 5FB1A 3U5LA 3U5MA 4F3IA 5H1TA 4NYWA 4UYEA 4YK0A 4ZQLA 5EI4A 5I80A 4MR6A 3SVFA 5HM0A 2DVRA 5EWWA 5E73A 4A9MA 4O77A 5KU3A 5IBNA 3O35A 4Z93A 4QR5A 4YBTA 5AMEA 5LJ2A 4YYNA 1ZS5A 4FLPA 3LQHA 5DKDA 2I8NA 4Z1SA 4IOOA 4LZRA 4IOQA 5KO4A 3ZYUA 4WHWA 5F5ZA 4A9JA 3U5NA 4UIYA 4CLBA 5FE2A 4CURA 5LUUA 4YH3A 4MR5A 3LJWA 3HMFA 5FG5A 5HCLA 5ENGA 2YELA 2E3KA 5K29A 5G4RA 4O7AA 2DWWA 4TT4A 4UIUA 5F60A 4NQMA 4Q0NA 5H1UA 5EK9A 4QSVA 3GG3A 5EGUA 5E9KA 5H1VA 4QYDA 4QSXA 5I40A 2OO1A 4AKNA 4QSUA 4NR7A 2OSSA 4QEUA 4CL9A 4YBMA 5EPBA 5A5OA 5I7XA 4NRCA 5E9IA 4YATA 4O7CA 3MULA 5LVQA 4PCEA 4O71A 3G0JA 4YBSA 4CUSA 2F6NA 4HXOA 2RNYA 2RNXA 4OGIA 4MR3A 2RNWA 1N72A 5DW2A 4QC1A 5D3NA 5E9YA 5EV9A 5CFWA 4UIVA 4BW1A 4Q0OA 5FE8A 5A5RA 5IGMA 5FFYA 5HENA 5F62A 4BJXA 4NR4A 5D3SA 5CTLA 2OUOA 5CPEA 4QSWA 5A5PA 2YYNA 4YYGA 4TT6A 3MXFA 4Z6IA 3Q2EA 4O72A 5DYXA 5I7YA 2G4AA 3UV2A 4OGJA 4UYGA 5CZGA 5F1LA 1EQFA 5EWHA 4IR5A 5EWCA 2DVSA 5L98A 5IGKA 5FB0A 5DKHA 2YW5A 5F1HA 4GPJA 4C67A 4O76A 4TZ8A 4HXRA 4A9HA 3HMHA 4N4FA 5CUDA 4PY6A 4NUEA 5CQ6A 3UW9A 4J1PA 5E9VA 5FBXA 5AD2A 2R0VA 5KTUA 4PKLA 3DWYA 5HJCA 4A9KA 5EPRA 5HRXA 2WP1A 5HLSA 3P1CA 5EWVA 4NUCA 5F25A 5CU8A 5HRVA 3O34A 5EWDA 1JM4B 4LZSA 4O70A 5HFRA 2L85A 4PCIA 5E9LA 4N4IA 4IR3A 4TTEA 2FSAA 4NR9A 5D3JA 3K2JA 5D3TA 4LZ2A 5E3DA 3AQAA 5CQ8A 4N4GA 5DYUA 5HEMA 5D3RA 5FFVA 5FH6A 1JSPB 5D3PA 5A7CA 3NXBA 4J3IA 5FE9A 2DVVA 4YYKA 5DFBA 5DW1A 4O78A 5CQAA 5FFWA 5BT4A 5FE0A 3UVDA 4UYFB 4QUUA 4BW4A 4TYLA 5ENJA 5ENHA 5I89A 3JVMA 5FE1A 4PS5A 4UIWA 1WUGA 4WHUA 5AMFA 4NUDA 5ETDA 5CUBA 4RVRA 3G0LA 4UYDA 5FH7A 4QSSA 4YYDA 5HQ6A 5A5SA 5G4SA 4TU4A 5A82A 5BT5A 2DKWA 5E74A 4HXPA 5A5NA 5FH8A 4TZ2A 4CFKA 5DX4A 5L8TA 4LR6A 4A9OA 5CQTA 4Z6HA 4HXLA 4LYIA 4UIZA 2YEMA 4C66A 2D9EA 4QEVA 5II2A 5ETBA 4MENA 4A9LA 2YDWA 5CP5A 5IIDA 4BW3A 4KV4A 4QR3A 5I29A 4CUTA 5HRWA 5A5QA 3DAIA 4ZW1A 3ONIA 5IGLA 3QZVA 4J0SA 5CQ5A 4QNSA 5E7DA 5E3GA 3UV4A 5TCMA 2MJVB 4XUAA 5L97A 2L5EA 4UIXA 4A9EA 5C87A 1E6IA 4O75A 5D24A 4QSRA 5D7XA 4IR4A 2D82A 5F2PA 2KTBB 5DKCA 4YYJA 4MEPA 5FG6A 5A83A 2RI7A 3SVGA 4O7EA 4KCXA 4Y03A 5LKTA 5ENCA 4IR6A 5DFCA 5F36A 5EISA 5C7NA 1X0JA 4NRBA 4QZSA 3UVXA 4QC3A 5EPSA 4NXJA 5LKXA 5DLZA 5JI8A 4HBWA 4CUPA 5EQ1A 4YYHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5C4QA 3JVLA 4ZC9A 4N4HA 4UYHA 5LKZA 4QEWA 3UVYA 3S92A 4BHWA 5LVRA 4OUFA 3D7CA 4YABA 5CQ7A 4A9FA 2YQDA 5CQ4A 4HXSA 2LSPB 3U5OA 4LYSA 5CUAA 5IG6A 5DBMA 2NXBA 5ENIA 5FDZA 3MB4A 4NR5A 5E9MA 4IORA 3P5OA 5D0CA 4QBMA 4WIVA 5BT3A 4NR6A 5FG4A 4YY4A 5HQ5A 5HQ7A 5J0DA 2WP2A 3P1FA 5CRMA 5ACYA 4CFLA 5I1QA 3D1BA 5ENFA 5H85A 3Q2FA 2R0SA 5L96A 4O7FA 4QYLA 2DVQA 5A85A 4NYVA 4TS8A 5L99A 4NS5A 3UVWA 4XY8A 4QSPA 5DY7A 4TT2A 5EU1A 4QSTA 4N3WA 5DYCA 4ALGA 4NYXA 5CQ3A 4CUUA 5D26A 4YAXA 3LQIA 2F6JA 3AADA 4HBYA 5CGPA 3IU5A 5FE6A 3QZSA 3JVKA 5KHMA 5KTWA 4LC2A 3TLPA 3P1DA 5TB6A 4E96A 2DATA 4CUQA 4O74A 4TU6A 5EICA 5FE4A 5AD3A 4HXMA 3UV5A 4YADA 4ALHA 4XYAA 5CUEA 5CY9A 5CS8A 4A9IA 2RFJA 3S91A 4UITA 4O7BA 4XY9A 5CUGA 5F61A 5EP7A 3LXJA 5DYAA 4HBXA 5JWMA 1F68A 3SVHA 5FE7A 3O33A 3I3JA 4MEOA 5C89A 4LDFA 4KV1A 5ENEA 5CRZA 4UYFA 4MR4A 5LJ0A 5FE5A 4DONA 4X2IA 3JVJA 4QY4A 5LKUA 5F63A 3VKHA 5EVAA 4XUBA 4LYWA 5D25A 4QR4A 4LRGA 5I86A 5LJ1A 3IU6A 5KTXA 4HXNA 4QUTA 2H60A 4NRAA 3O37A 4AI6A 2R0YA 5D3LA 3MB3A 3U5KA 3QZTA 5HELA 4PTBA 3O36A 3U5PA 3FKMX 5COIA 5EM3A 2E7OA 4QSQA 5HFQA 5IGNA 3MQMA 5E0RA 4MEQA 5A81A 4HXKA 4YY6A 2RS9B 3ERRA 3P1EA 4YC9A 5ENBA 4YYIA 2N9GA 5F3AA 4AKIA 2YEKA 4A9NA 2E7NA 5I83A 1WUMA 5FE3A 3LQJA 5CUCA 2R10A 5L8UA 5II1A 3RCWA 4YH4A 4HBVA 4TQNA 2RO1A 4YYMA 3HMEA 4BW2A 5EA1A 4Z1QA 5C85A 3U5JA 5I88A 4NR8A 2GRCA 5D3HA 4NQNA 5DLXA 5DFDA 4QB3A 4J0RA 3MUKA 2L84A 2I7KA 5C8GA 5FB1A 3U5LA 3U5MA 4F3IA 5H1TA 4NYWA 4UYEA 4YK0A 4ZQLA 5EI4A 5I80A 4MR6A 3SVFA 5HM0A 2DVRA 5EWWA 5E73A 4A9MA 4O77A 5KU3A 5IBNA 3O35A 4Z93A 4QR5A 4YBTA 5AMEA 5LJ2A 4YYNA 1ZS5A 4FLPA 3LQHA 5DKDA 2I8NA 4Z1SA 4IOOA 4LZRA 4IOQA 5KO4A 3ZYUA 4WHWA 5F5ZA 4A9JA 3U5NA 4UIYA 4CLBA 5FE2A 4CURA 5LUUA 4YH3A 4MR5A 3LJWA 3HMFA 5FG5A 5HCLA 5ENGA 2YELA 2E3KA 5K29A 5G4RA 4O7AA 2DWWA 4TT4A 4UIUA 5F60A 4NQMA 4Q0NA 5H1UA 5EK9A 4QSVA 3GG3A 5EGUA 5E9KA 5H1VA 4QYDA 4QSXA 5I40A 2OO1A 4AKNA 4QSUA 4NR7A 2OSSA 4QEUA 4CL9A 4YBMA 5EPBA 2EJNA 5A5OA 5I7XA 4NRCA 5E9IA 4YATA 4O7CA 3MULA 5LVQA 4PCEA 4O71A 3G0JA 4YBSA 4CUSA 2F6NA 4HXOA 2RNYA 2RNXA 4OGIA 4MR3A 2RNWA 1N72A 5DW2A 4QC1A 5D3NA 5E9YA 5EV9A 5CFWA 4UIVA 4BW1A 3VKGA 4Q0OA 5FE8A 5A5RA 5IGMA 5FFYA 5HENA 5F62A 4BJXA 4NR4A 5D3SA 5CTLA 2OUOA 5CPEA 4QSWA 5A5PA 2YYNA 4YYGA 4TT6A 3MXFA 4Z6IA 3Q2EA 4O72A 5DYXA 5I7YA 2G4AA 3UV2A 4OGJA 4UYGA 5CZGA 5F1LA 1EQFA 5EWHA 4IR5A 5EWCA 2DVSA 5L98A 5IGKA 5FB0A 5DKHA 2YW5A 5F1HA 4GPJA 4C67A 4O76A 4TZ8A 4HXRA 4A9HA 3HMHA 4N4FA 5CUDA 4PY6A 4NUEA 5CQ6A 3UW9A 4J1PA 4AKGA 5E9VA 5FBXA 5AD2A 2R0VA 5KTUA 4PKLA 3DWYA 5HJCA 4A9KA 5EPRA 5HRXA 2WP1A 5HLSA 3P1CA 1PUOA 5EWVA 4NUCA 5F25A 5CU8A 5HRVA 3O34A 5EWDA 1JM4B 4LZSA 4O70A 5HFRA 2L85A 4PCIA 5E9LA 4N4IA 3D1DA 4IR3A 4TTEA 2FSAA 4NR9A 5D3JA 3K2JA 5D3TA 4LZ2A 5E3DA 3AQAA 5CQ8A 4N4GA 5DYUA 5HEMA 5D3RA 5FFVA 5FH6A 1JSPB 5D3PA 5A7CA 3NXBA 4J3IA 5FE9A 2DVVA 4YYKA 5DFBA 5DW1A 4O78A 5CQAA 5FFWA 5BT4A 5FE0A 3UVDA 4UYFB 4QUUA 4BW4A 4TYLA 5ENJA 5ENHA 5I89A 3JVMA 5FE1A 4PS5A 4UIWA 1WUGA 4WHUA 5AMFA 4NUDA 5ETDA 5CUBA 4RVRA 3G0LA 4UYDA 5FH7A 4QSSA 4YYDA 5HQ6A 5A5SA 4AKHA 5G4SA 4TU4A 5A82A 5BT5A 2DKWA 5E74A 4HXPA 5A5NA 5FH8A 4TZ2A 4CFKA 5DX4A 5L8TA 4LR6A 4A9OA 5CQTA 4Z6HA 4HXLA 4LYIA 4UIZA 2YEMA 4C66A 2D9EA 4QEVA 5II2A 5ETBA 4MENA 4A9LA 2YDWA 5CP5A 5IIDA 4BW3A 4KV4A 1ZKRA 4QR3A 5I29A 4CUTA 5HRWA 5A5QA 3DAIA 4ZW1A 3ONIA 5IGLA 3QZVA 4J0SA 5CQ5A 4QNSA 5E7DA 5E3GA 3UV4A 5TCMA 2MJVB 4XUAA 5L97A 2L5EA 4UIXA 4A9EA 5C87A 1E6IA 4O75A 5D24A 4QSRA 5D7XA 4IR4A 2D82A 5F2PA 2KTBB 5DKCA 4YYJA 4MEPA 5FG6A 5A83A 2RI7A 3SVGA 4O7EA 4KCXA 4Y03A 5LKTA 5ENCA 4IR6A 5DFCA 5F36A 5EISA 5C7NA 1X0JA 4NRBA 4QZSA 3UVXA 4QC3A 5EPSA 4NXJA 5LKXA 5DLZA 5JI8A 4HBWA 4CUPA 5EQ1A 4YYHA
chains in the Genus database with same CATH topology
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 5C4Q A;  3JVL A;  4ZC9 A;  4N4H A;  4UYH A;  5LKZ A;  4QEW A;  3UVY A;  3S92 A;  4BHW A;  5LVR A;  4OUF A;  3D7C A;  4YAB A;  5CQ7 A;  4A9F A;  2YQD A;  5CQ4 A;  4HXS A;  2LSP B;  3U5O A;  4LYS A;  5CUA A;  5IG6 A;  5DBM A;  2NXB A;  5ENI A;  5FDZ A;  3MB4 A;  4NR5 A;  5E9M A;  4IOR A;  3P5O A;  5D0C A;  4QBM A;  4WIV A;  5BT3 A;  4NR6 A;  5FG4 A;  4YY4 A;  5HQ5 A;  5HQ7 A;  5J0D A;  2WP2 A;  3P1F A;  5CRM A;  5ACY A;  4CFL A;  5I1Q A;  5ENF A;  5H85 A;  3Q2F A;  2R0S A;  5L96 A;  4O7F A;  4QYL A;  2DVQ A;  5A85 A;  4NYV A;  4TS8 A;  5L99 A;  4NS5 A;  3UVW A;  4XY8 A;  4QSP A;  5DY7 A;  4TT2 A;  5EU1 A;  4QST A;  4N3W A;  5DYC A;  4ALG A;  4NYX A;  5CQ3 A;  4CUU A;  5D26 A;  4YAX A;  3LQI A;  2F6J A;  3AAD A;  4HBY A;  5CGP A;  3IU5 A;  5FE6 A;  3QZS A;  3JVK A;  5KHM A;  5KTW A;  4LC2 A;  3TLP A;  3P1D A;  5TB6 A;  4E96 A;  2DAT A;  4CUQ A;  4O74 A;  4TU6 A;  5EIC A;  5FE4 A;  5AD3 A;  4HXM A;  3UV5 A;  4YAD A;  4ALH A;  4XYA A;  5CUE A;  5CY9 A;  5CS8 A;  4A9I A;  2RFJ A;  3S91 A;  4UIT A; 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