5E9LA

Crystal structure of baz2b bromodomain in complex with fragment f103
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title High-Throughput Fragment Docking into the BAZ2B Bromodomain: Efficient in Silico Screening for X-Ray Crystallography.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 41
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-10-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5e9lA00
4YYIA 2DKWA 5EWVA 4MR4A 4NR5A 4YADA 4LYIA 4ZC9A 5A5PA 5I7YA 2G4AA 4NR4A 5IGLA 5CZGA 5FFWA 5CS8A 5HENA 4OGJA 3SVFA 4N4IA 4C66A 4QR4A 5CQ4A 4TZ2A 4HXPA 3O35A 4LYSA 5EICA 5L8TA 4KV1A 3D7CA 3HMFA 4O77A 4QSPA 5J0DA 5CRZA 4WIVA 3P5OA 4O75A 5EWWA 4Q0NA 5I80A 5ENFA 5FB0A 2H60A 4QSWA 4ALHA 5EV9A 5I1QA 5L99A 4A9KA 5ENGA 4QR5A 4HXKA 2RNWA 4PY6A 3SVGA 4QUUA 3UVYA 4ZQLA 4O70A 5F5ZA 5EISA 4LZRA 4QC1A 5FG6A 5DYXA 2RS9B 4CUUA 4A9EA 5KO4A 2KTBB 4LZ2A 2D82A 5DX4A 5F63A 5H1UA 5AD3A 5II1A 5HRXA 5D3TA 5A83A 4NR9A 5DKDA 5CQTA 2OSSA 4NR7A 5LKUA 4CURA 5F36A 4PCEA 4NYXA 5D25A 4MEPA 5LKXA 5FE5A 5HRWA 2I7KA 4A9IA 5ACYA 4J3IA 4O78A 4NUDA 5FBXA 1WUMA 4YK0A 5E9KA 2D9EA 5L8UA 4TT4A 5EA1A 5CTLA 2MJVB 4TT2A 5FB1A 3SVHA 5HQ5A 4WHUA 5FE9A 4IOOA 3S92A 2WP2A 2RNXA 5F61A 2RO1A 5E7DA 4QEWA 3O36A 5L98A 4CFKA 4YYJA 5D3LA 4NXJA 5L97A 4TQNA 4YYMA 5JI8A 4IR3A 4HXNA 5D7XA 4UIWA 4XUAA 5HQ6A 5HEMA 3LXJA 5F25A 3AADA 5KTXA 3K2JA 5D0CA 3U5NA 5ENJA 3MQMA 5DKHA 4YBSA 5AMFA 4WHWA 4CFLA 5E9LA 3Q2FA 5EWDA 5FH7A 3G0LA 4XY9A 3LQHA 5E9IA 5BT3A 4XUBA 1JM4B 4O7FA 5I86A 3QZVA 4QSSA 3MXFA 4QSUA 5CPEA 5COIA 4HBXA 4PCIA 5FH6A 5FE0A 4QZSA 4PKLA 4IR4A 4IORA 4O72A 2DVVA 3U5MA 4YYGA 5F1HA 4QSTA 5BT4A 4Z6IA 5C4QA 5CQAA 4A9NA 5LJ2A 3U5JA 3MB3A 2N9GA 4BW3A 2YQDA 4XY8A 5HRVA 5EPRA 5F60A 3DAIA 4J0RA 4UIYA 2OO1A 4A9LA 5ETDA 5IBNA 4YBMA 5HFRA 1JSPB 5EGUA 5HM0A 3UVXA 4NYWA 3UW9A 5CQ6A 4CLBA 5FG5A 4CL9A 4MENA 4UYFB 2R0VA 4X2IA 5CUBA 5I83A 5IGNA 3IU6A 5E0RA 5LJ0A 5D3HA 4LZSA 2DATA 3NXBA 4MR5A 4O74A 3ONIA 4HXOA 2R0SA 5C85A 1E6IA 4A9JA 4O7CA 4Z1QA 4RVRA 3LQIA 4HXRA 4O71A 5DLXA 5CFWA 5ETBA 5FE3A 5LKTA 4HXLA 5F2PA 3TLPA 2YEMA 5C89A 4J1PA 5E3DA 5FE2A 1N72A 4UIXA 4YAXA 2L85A 5DW1A 4KV4A 5DBMA 4N3WA 3S91A 5L96A 5E9YA 5E74A 3Q2EA 5HQ7A 3JVKA 5A5SA 5F1LA 4IOQA 5D3PA 4N4HA 5KTUA 2DVQA 4QC3A 4QSRA 4MR6A 3GG3A 5EQ1A 5EI4A 4NUEA 5EK9A 5DFDA 5EU1A 5FFVA 4QY4A 5KHMA 4A9OA 5E9VA 5AMEA 5I29A 4QEUA 3U5OA 5D3SA 4CUQA 4F3IA 2E3KA 5AD2A 4QBMA 4LDFA 5EPBA 5C7NA 5K29A 5DKCA 4NUCA 5FH8A 3JVMA 4NQNA 5FE4A 5FFYA 5A5RA 2RFJA 5A85A 4YC9A 4NR6A 3QZSA 1EQFA 4OGIA 5DYUA 4O7EA 5E3GA 2RI7A 4UITA 4E96A 4HXSA 4TTEA 5CUCA 5FE6A 5FE8A 5DW2A 4A9FA 3P1CA 5CQ7A 3UV4A 5A81A 3O37A 5FDZA 4IR5A 4YABA 4UIVA 2YYNA 4O76A 4UYGA 5LVQA 2L5EA 3P1FA 5E73A 5IG6A 4HXMA 4A9MA 4ALGA 3RCWA 4NYVA 5HELA 3HMEA 2F6NA 3UVWA 5FE1A 2YW5A 3JVJA 3P1DA 5G4SA 4NRBA 2DVSA 4YY6A 5ENHA 4BW1A 4YYDA 5DFBA 3MB4A 4BHWA 4BW2A 5C87A 5C8GA 5CUDA 2DWWA 4YATA 4QR3A 4YY4A 4KCXA 4Z93A 3IU5A 3ZYUA 3AQAA 4MR3A 4O7AA 5CQ8A 4TT6A 4CUPA 3QZTA 5CP5A 5IIDA 5LUUA 4NS5A 4TS8A 4OUFA 5EPSA 3JVLA 5F62A 2E7NA 4NQMA 5EVAA 5CUGA 4N4FA 2YELA 5LJ1A 2WP1A 3U5PA 5CRMA 4LC2A 1F68A 3HMHA 4QSVA 5H1TA 2LSPB 3G0JA 4XYAA 5EWCA 5BT5A 3P1EA 3O34A 4MEQA 5A5OA 4HBVA 2E7OA 5DYCA 4CUTA 1WUGA 3O33A 5A5NA 2R10A 2YEKA 5HCLA 4DONA 5CGPA 2L84A 5DYAA 3I3JA 3UVDA 2R0YA 5CU8A 3LQJA 4Z6HA 2GRCA 2YDWA 4O7BA 4UIZA 5I7XA 4Z1SA 5CUAA 3U5LA 5FG4A 1X0JA 5H1VA 4YYHA 4QSXA 4YBTA 5D3JA 4NRCA 4N4GA 2RNYA 4NR8A 4ZW1A 2FSAA 2DVRA 3FKMX 4QUTA 4AKNA 4QB3A 4UYDA 5H85A 2OUOA 5ENCA 4MEOA 5I40A 5DLZA 5CUEA 4QYDA 4LR6A 4A9HA 5IGMA 5IGKA 4UYEA 5II2A 5D3NA 2I8NA 5ENIA 5D24A 1ZS5A 5A7CA 4QSQA 5LKZA 5JWMA 4YYNA 3MUKA 4YYKA 4BW4A 5A5QA 5DFCA 5ENEA 3UV5A 4CUSA 4TU4A 3LJWA 5EP7A 4UYHA 4BJXA 4GPJA 5KU3A 4HBYA 5EWHA 4UIUA 4UYFA 5CY9A 3DWYA 4LRGA 5F3AA 4QYLA 5I88A 3U5KA 4IR6A 4TYLA 5E9MA 4PS5A 4Y03A 5HFQA 5TCMA 4HBWA 5CQ5A 5HJCA 4YH4A 4TZ8A 3MULA 4YH3A 5D3RA 5FE7A 5G4RA 5A82A 4LYWA 5CQ3A 5I89A 3UV2A 5D26A 2F6JA 4QNSA 4QEVA 5DY7A 4NRAA 4C67A 4Q0OA 5KTWA 4J0SA 4TU6A 2NXBA 4FLPA 5EM3A 4PTBA 5TB6A 5ENBA 5LVRA 5HLSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YYIA 2DKWA 5EWVA 4MR4A 4NR5A 4YADA 4LYIA 4ZC9A 5A5PA 5I7YA 2EJNA 2G4AA 4NR4A 5IGLA 5CZGA 5FFWA 5CS8A 5HENA 4OGJA 3SVFA 4N4IA 4C66A 4QR4A 5CQ4A 4TZ2A 4HXPA 3O35A 4LYSA 5EICA 5L8TA 4KV1A 3D7CA 3HMFA 4O77A 4QSPA 5J0DA 5CRZA 4WIVA 3P5OA 4O75A 5EWWA 4Q0NA 5I80A 5ENFA 5FB0A 2H60A 4QSWA 4ALHA 5EV9A 5I1QA 5L99A 4A9KA 5ENGA 4QR5A 4HXKA 2RNWA 4PY6A 3SVGA 4QUUA 3UVYA 4ZQLA 4O70A 5F5ZA 5EISA 4LZRA 4QC1A 5FG6A 5DYXA 2RS9B 4CUUA 4A9EA 5KO4A 2KTBB 4LZ2A 2D82A 5DX4A 5F63A 5H1UA 5AD3A 5II1A 5HRXA 5D3TA 5A83A 4NR9A 5DKDA 5CQTA 2OSSA 4NR7A 5LKUA 4CURA 5F36A 4PCEA 4NYXA 5D25A 4MEPA 5LKXA 5FE5A 5HRWA 2I7KA 4A9IA 5ACYA 4J3IA 4O78A 4NUDA 5FBXA 1WUMA 4YK0A 5E9KA 2D9EA 5L8UA 4TT4A 5EA1A 5CTLA 2MJVB 4TT2A 5FB1A 3SVHA 5HQ5A 4WHUA 5FE9A 4IOOA 3S92A 2WP2A 2RNXA 5F61A 2RO1A 5E7DA 4QEWA 3O36A 5L98A 4CFKA 3VKHA 4YYJA 5D3LA 4NXJA 5L97A 4TQNA 4YYMA 5JI8A 4IR3A 4HXNA 5D7XA 4UIWA 4XUAA 5HQ6A 5HEMA 3LXJA 5F25A 3AADA 5KTXA 3K2JA 5D0CA 3U5NA 5ENJA 3MQMA 5DKHA 4YBSA 5AMFA 4WHWA 4CFLA 5E9LA 3Q2FA 5EWDA 5FH7A 3G0LA 4XY9A 3LQHA 5E9IA 5BT3A 4XUBA 1JM4B 4O7FA 5I86A 3QZVA 4QSSA 3MXFA 4QSUA 5CPEA 5COIA 4HBXA 4PCIA 5FH6A 5FE0A 4QZSA 4PKLA 4IR4A 4IORA 4O72A 2DVVA 3U5MA 4YYGA 5F1HA 4QSTA 5BT4A 4Z6IA 5C4QA 5CQAA 4A9NA 5LJ2A 3U5JA 3MB3A 2N9GA 4BW3A 2YQDA 4XY8A 5HRVA 5EPRA 4AKIA 5F60A 3DAIA 4J0RA 4UIYA 2OO1A 4A9LA 5ETDA 5IBNA 4YBMA 5HFRA 1JSPB 5EGUA 5HM0A 3UVXA 4NYWA 3UW9A 5CQ6A 4CLBA 5FG5A 4CL9A 4MENA 4UYFB 2R0VA 4X2IA 5CUBA 5I83A 5IGNA 3IU6A 5E0RA 5LJ0A 5D3HA 4LZSA 2DATA 3NXBA 4MR5A 4O74A 3ONIA 4HXOA 2R0SA 5C85A 1E6IA 4A9JA 4O7CA 4Z1QA 4RVRA 3ERRA 3LQIA 4HXRA 4O71A 5DLXA 5CFWA 5ETBA 5FE3A 5LKTA 4HXLA 5F2PA 3TLPA 2YEMA 5C89A 4J1PA 5E3DA 5FE2A 1N72A 4UIXA 4YAXA 2L85A 5DW1A 4KV4A 5DBMA 4N3WA 3S91A 5L96A 5E9YA 5E74A 3Q2EA 5HQ7A 3JVKA 5A5SA 5F1LA 4IOQA 5D3PA 4N4HA 5KTUA 2DVQA 4QC3A 4QSRA 4MR6A 3GG3A 1PUOA 5EI4A 5EQ1A 4NUEA 5EK9A 5DFDA 5EU1A 5FFVA 4QY4A 5KHMA 4A9OA 5E9VA 5AMEA 5I29A 4QEUA 3U5OA 5D3SA 4CUQA 4F3IA 2E3KA 5AD2A 4QBMA 4LDFA 5EPBA 5C7NA 5K29A 5DKCA 4NUCA 5FH8A 3JVMA 4NQNA 5FE4A 5FFYA 5A5RA 2RFJA 5A85A 4YC9A 4NR6A 3QZSA 1EQFA 4OGIA 5DYUA 4O7EA 5E3GA 2RI7A 4UITA 4E96A 4HXSA 4TTEA 5CUCA 5FE6A 5FE8A 5DW2A 4A9FA 3P1CA 5CQ7A 3UV4A 5A81A 3O37A 5FDZA 4IR5A 4YABA 4UIVA 2YYNA 4O76A 4UYGA 5LVQA 2L5EA 3P1FA 5E73A 5IG6A 4HXMA 4A9MA 4ALGA 3RCWA 4NYVA 5HELA 3D1BA 3HMEA 2F6NA 3UVWA 5FE1A 2YW5A 3JVJA 3P1DA 5G4SA 4NRBA 2DVSA 4AKGA 4YY6A 5ENHA 4BW1A 4YYDA 5DFBA 3MB4A 4BHWA 4BW2A 5C87A 5C8GA 5CUDA 2DWWA 4YATA 4QR3A 4YY4A 4KCXA 4Z93A 3IU5A 3ZYUA 3AQAA 4MR3A 4O7AA 5CQ8A 4TT6A 4CUPA 3QZTA 5CP5A 5IIDA 5LUUA 4NS5A 4TS8A 4OUFA 1ZKRA 5EPSA 3JVLA 5F62A 2E7NA 4NQMA 5EVAA 5CUGA 4N4FA 2YELA 5LJ1A 2WP1A 3U5PA 5CRMA 4LC2A 1F68A 3HMHA 4QSVA 4AKHA 5H1TA 2LSPB 3G0JA 4XYAA 5EWCA 5BT5A 3P1EA 3O34A 4MEQA 5A5OA 4HBVA 2E7OA 5DYCA 4CUTA 1WUGA 3O33A 5A5NA 2R10A 2YEKA 5HCLA 4DONA 5CGPA 2L84A 5DYAA 3I3JA 3UVDA 2R0YA 5CU8A 3LQJA 4Z6HA 2GRCA 3D1DA 2YDWA 4O7BA 4UIZA 5I7XA 4Z1SA 5CUAA 3U5LA 5FG4A 1X0JA 5H1VA 4YYHA 4QSXA 4YBTA 5D3JA 4NRCA 4N4GA 2RNYA 4NR8A 4ZW1A 2FSAA 2DVRA 3FKMX 4QUTA 4AKNA 4QB3A 4UYDA 5H85A 2OUOA 5ENCA 4MEOA 5I40A 5DLZA 5CUEA 3VKGA 4QYDA 4LR6A 4A9HA 5IGMA 5IGKA 4UYEA 5II2A 5D3NA 2I8NA 5ENIA 5D24A 1ZS5A 5A7CA 4AI6A 4QSQA 5LKZA 5JWMA 4YYNA 3MUKA 4YYKA 4BW4A 5A5QA 5DFCA 5ENEA 3UV5A 4CUSA 4TU4A 3LJWA 5EP7A 4UYHA 4BJXA 4GPJA 5KU3A 4HBYA 5EWHA 4UIUA 4UYFA 5CY9A 3DWYA 4LRGA 5F3AA 4QYLA 5I88A 3U5KA 4IR6A 4TYLA 5E9MA 4PS5A 4Y03A 5HFQA 5TCMA 4HBWA 5CQ5A 5HJCA 4YH4A 4TZ8A 3MULA 4YH3A 5D3RA 5FE7A 5G4RA 5A82A 4LYWA 5CQ3A 5I89A 3UV2A 5D26A 2F6JA 4QNSA 4QEVA 5DY7A 4NRAA 4C67A 4Q0OA 5KTWA 4J0SA 4TU6A 2NXBA 4FLPA 5EM3A 4PTBA 5TB6A 5ENBA 5LVRA 5HLSA
chains in the Genus database with same CATH topology
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