5E9LA

Crystal structure of baz2b bromodomain in complex with fragment f103
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
116
structure length
116
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title High-Throughput Fragment Docking into the BAZ2B Bromodomain: Efficient in Silico Screening for X-Ray Crystallography.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 116
sequence length 116
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-10-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5e9lA00
3HMHA 5CRZA 2FSAA 4QEWA 4A9JA 4QSXA 3O37A 5DLXA 4IORA 2OUOA 5FG5A 5HQ6A 5CY9A 5D25A 2L5EA 5ETDA 4TZ8A 2OSSA 5F61A 4A9LA 3HMEA 2E7NA 2R0SA 5LVRA 4YABA 4LYIA 4O78A 4YBTA 4IR4A 5FH8A 3QZVA 2YYNA 4YY4A 4O7FA 2RI7A 3UVYA 5FE0A 4A9NA 5D3HA 4KV1A 5IIDA 4HXLA 4TS8A 2D9EA 4O70A 4O72A 5I7XA 4LYWA 2OO1A 4NR7A 5FFWA 4ALHA 4NQMA 4YC9A 4IR3A 5IGMA 5FE9A 4J0SA 5I7YA 4XYAA 5I29A 5F5ZA 5A82A 5HFRA 4A9OA 5DW1A 5H1VA 4CURA 5EA1A 5IGLA 4YYNA 4C67A 1E6IA 2DVRA 4MEQA 2DVSA 3P5OA 4Y03A 5CQ3A 5EWVA 5COIA 4WHWA 4QUUA 4YYGA 2RFJA 3IU5A 3Q2FA 4QB3A 4BW4A 3JVKA 4NRBA 5KTWA 5CGPA 5FE7A 4UYFB 3AQAA 2LSPB 5I1QA 4UYDA 5FE6A 4PTBA 3P1DA 4QC3A 4QR5A 5CUCA 3LXJA 5EI4A 3O34A 5D26A 2F6JA 5TCMA 5CQ4A 5CUBA 5CUAA 4MEPA 5L8UA 2E3KA 5TB6A 4YAXA 4UIXA 5G4SA 1ZS5A 5D3LA 5FG6A 5KO4A 5CRMA 5I40A 4QSRA 4DONA 4CFKA 5EICA 3MB4A 3D7CA 2R10A 3DWYA 5E9YA 5FB0A 5BT5A 4TT2A 5FH7A 4YATA 4PCEA 5CQ8A 3U5LA 2H60A 5L8TA 5LKUA 5I89A 3P1FA 4MR5A 3U5JA 4A9EA 2RNXA 5C4QA 5D3RA 4LZSA 4A9FA 5F1HA 3P1CA 5CUGA 5D3SA 5EK9A 5CQAA 4LZ2A 5F60A 4MEOA 5E3GA 3UVWA 5H1UA 4IOOA 5FE1A 4NUDA 5KTUA 2RO1A 4LZRA 4LRGA 4HBXA 4BW3A 5A5SA 2WP1A 5DY7A 5BT4A 5H85A 4O77A 3LJWA 4O7EA 3LQJA 5IBNA 4TZ2A 1X0JA 3TLPA 5C7NA 5DFDA 4X2IA 4LC2A 4Z6IA 5HENA 5EVAA 4TTEA 4HXRA 3LQIA 5C8GA 1N72A 2YDWA 5CQ5A 5ENEA 3SVHA 2I8NA 4N3WA 5A81A 5FBXA 5DYXA 4O76A 4MR6A 3UVDA 3JVMA 4QBMA 4QSVA 4YH4A 5FFVA 5E74A 5D3JA 3GG3A 4HBWA 4XUAA 3NXBA 4Z1SA 4N4IA 5ENJA 3MXFA 4BW1A 5L99A 5FH6A 5II2A 5FB1A 5DBMA 4QSTA 5FE5A 4NQNA 3K2JA 5ENHA 4NXJA 4AKNA 4OUFA 4MR3A 4YADA 2F6NA 4YYJA 5E73A 5A85A 4XY9A 5I88A 5EQ1A 5LJ2A 4CFLA 5D3TA 5L98A 4E96A 5JI8A 4UYEA 4NUEA 5D3PA 4A9HA 4QYDA 5KU3A 5AD2A 4QSWA 5CQ7A 5HJCA 5A5NA 4LDFA 4N4GA 4NRAA 5FE8A 4UIUA 5FE3A 5HQ7A 5CFWA 3S92A 4UITA 5E9LA 2R0VA 5C85A 3O35A 4PY6A 4UYGA 5BT3A 5DYCA 2YQDA 5D0CA 4NYVA 4O74A 4J3IA 4QC1A 5AD3A 2E7OA 3SVGA 5HRXA 4QEUA 5CUDA 5IGKA 5ENGA 2N9GA 5EP7A 2YEKA 5J0DA 2D82A 4YY6A 5A5OA 5AMFA 4MR4A 4J1PA 3UW9A 4QSPA 4A9IA 4NR6A 5ETBA 2KTBB 4YYIA 5HRWA 3U5MA 4QEVA 5HLSA 3G0JA 4YYHA 5EWWA 4UIWA 4NYXA 4O7CA 4HBVA 5CU8A 4YYMA 4N4HA 5I86A 4HXNA 5FFYA 4UYHA 5EPRA 2YEMA 4ZC9A 3Q2EA 5A83A 4TQNA 5E9KA 3QZTA 5E9IA 4F3IA 4CUSA 2NXBA 5KHMA 5A7CA 1WUMA 3U5NA 3FKMX 4UYFA 2I7KA 4QSUA 4MENA 5DYAA 5EWHA 5FG4A 4OGIA 5JWMA 3O36A 5DX4A 5II1A 2DWWA 2DATA 5C89A 5L96A 5I83A 5EWDA 3P1EA 5DLZA 2G4AA 4IR6A 1WUGA 5F25A 3RCWA 1JM4B 5HFQA 4YBSA 5E7DA 3ONIA 5D7XA 4FLPA 5A5PA 4YBMA 2DVQA 3JVLA 4QY4A 5CPEA 5HM0A 5ENBA 4CUPA 5A5QA 4CUTA 4O7BA 4UIVA 1F68A 5G4RA 5FDZA 4NR9A 4TU6A 4NR8A 5CQ6A 5DKDA 4YH3A 2R0YA 5I80A 5EM3A 5ENFA 4NR4A 2DKWA 5D3NA 5C87A 4LYSA 5F36A 5LKXA 2L84A 5LKZA 4HXPA 4NUCA 3U5OA 4HXOA 4HXKA 3UV2A 5DW2A 4Z6HA 4QSSA 5LJ0A 5L97A 2MJVB 4CUUA 5DKHA 5E0RA 4KCXA 4QR3A 3SVFA 5DFCA 3ZYUA 4IR5A 5EU1A 5CZGA 4HXSA 2WP2A 3O33A 5F62A 4IOQA 3UV4A 3MQMA 4BHWA 5HQ5A 4XY8A 5F3AA 3MUKA 2DVVA 3LQHA 3IU6A 4BJXA 2GRCA 4QUTA 5KTXA 5EPBA 4J0RA 4TYLA 3I3JA 4ZQLA 4ZW1A 3DAIA 2YW5A 1EQFA 4QR4A 4PKLA 4UIYA 5CS8A 4YYKA 3HMFA 4LR6A 4NS5A 5LJ1A 5EWCA 5H1TA 3MULA 5HCLA 4O7AA 4Q0OA 3QZSA 4O75A 5CTLA 5IG6A 2RNYA 5AMEA 5ACYA 3AADA 4ALGA 5DYUA 5HRVA 4N4FA 5HELA 4CLBA 5DKCA 4WHUA 2RNWA 5A5RA 4PS5A 3S91A 5F63A 5CUEA 5FE4A 4QYLA 2L85A 5IGNA 4QZSA 4TT6A 5E3DA 5K29A 4GPJA 5EPSA 4YK0A 3JVJA 3U5KA 4CUQA 4O71A 4NYWA 4BW2A 4RVRA 4UIZA 4QNSA 4WIVA 4CL9A 5CP5A 3UVXA 5E9VA 4Z93A 5EISA 5LVQA 5ENCA 5LKTA 4XUBA 4A9MA 5D24A 5DFBA 2RS9B 5FE2A 5EGUA 4TT4A 5F1LA 4PCIA 4YYDA 4Z1QA 5LUUA 4A9KA 3G0LA 3U5PA 4NR5A 3UV5A 4HBYA 3MB3A 5F2PA 5ENIA 4C66A 2YELA 4OGJA 5HEMA 4Q0NA 4QSQA 1JSPB 5CQTA 4TU4A 4HXMA 4NRCA 4KV4A 5E9MA 5EV9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HMHA 5CRZA 2FSAA 4QEWA 4A9JA 4QSXA 3O37A 5DLXA 4IORA 2OUOA 5FG5A 5HQ6A 5CY9A 5D25A 2L5EA 5ETDA 4TZ8A 2OSSA 5F61A 4A9LA 3HMEA 2E7NA 2R0SA 5LVRA 4YABA 4LYIA 4O78A 4YBTA 4IR4A 5FH8A 3QZVA 2YYNA 4YY4A 4O7FA 2RI7A 3UVYA 5FE0A 4A9NA 5D3HA 4KV1A 5IIDA 4HXLA 4TS8A 2D9EA 4O70A 4O72A 5I7XA 4LYWA 2OO1A 4NR7A 5FFWA 4ALHA 4NQMA 4YC9A 4IR3A 5IGMA 5FE9A 4J0SA 5I7YA 4XYAA 5I29A 5F5ZA 5A82A 5HFRA 4A9OA 5DW1A 5H1VA 4CURA 5EA1A 5IGLA 4YYNA 4C67A 1E6IA 2DVRA 1ZKRA 4MEQA 2DVSA 3P5OA 4Y03A 5CQ3A 5EWVA 5COIA 4WHWA 4QUUA 4YYGA 2RFJA 3IU5A 3Q2FA 4QB3A 4BW4A 3JVKA 4NRBA 5KTWA 5CGPA 5FE7A 4UYFB 3AQAA 2LSPB 5I1QA 4UYDA 5FE6A 4PTBA 3P1DA 4QC3A 4QR5A 5CUCA 3LXJA 5EI4A 3O34A 5D26A 2F6JA 5TCMA 5CQ4A 5CUBA 5CUAA 4MEPA 5L8UA 2E3KA 5TB6A 4YAXA 4UIXA 5G4SA 1ZS5A 5D3LA 5FG6A 5KO4A 5CRMA 5I40A 4QSRA 4DONA 4CFKA 5EICA 3MB4A 3D7CA 2R10A 3DWYA 5E9YA 5FB0A 5BT5A 4TT2A 5FH7A 4YATA 4PCEA 5CQ8A 4AI6A 3U5LA 2H60A 5L8TA 5LKUA 5I89A 3P1FA 4MR5A 3U5JA 4A9EA 2RNXA 5C4QA 3D1DA 5D3RA 4LZSA 4A9FA 5F1HA 3P1CA 5CUGA 5D3SA 5EK9A 5CQAA 4LZ2A 5F60A 4MEOA 5E3GA 3UVWA 5H1UA 4IOOA 5FE1A 4NUDA 5KTUA 2RO1A 4LZRA 4LRGA 4HBXA 4BW3A 5A5SA 2WP1A 5DY7A 5BT4A 5H85A 4O77A 3LJWA 4O7EA 3LQJA 5IBNA 4TZ2A 1X0JA 3ERRA 3TLPA 5C7NA 5DFDA 4X2IA 4LC2A 4Z6IA 5HENA 5EVAA 4TTEA 4HXRA 1PUOA 4AKGA 3LQIA 5C8GA 1N72A 2YDWA 5CQ5A 5ENEA 3SVHA 2I8NA 4N3WA 5A81A 5FBXA 5DYXA 4O76A 4MR6A 3UVDA 3JVMA 4QBMA 4QSVA 4YH4A 5FFVA 5E74A 5D3JA 3GG3A 4HBWA 4XUAA 3NXBA 4Z1SA 4N4IA 5ENJA 3MXFA 4BW1A 5L99A 5FH6A 5II2A 5FB1A 4QSTA 5DBMA 5FE5A 4NQNA 3K2JA 5ENHA 4NXJA 4AKNA 4OUFA 4MR3A 4YADA 2F6NA 4YYJA 5E73A 5A85A 4XY9A 5I88A 5EQ1A 5LJ2A 4CFLA 5D3TA 5L98A 4E96A 5JI8A 4UYEA 4NUEA 5D3PA 4A9HA 4QYDA 5KU3A 5AD2A 4QSWA 5CQ7A 5HJCA 5A5NA 4LDFA 4N4GA 4NRAA 5FE8A 4UIUA 5FE3A 5HQ7A 5CFWA 3S92A 4UITA 5E9LA 2R0VA 5C85A 3O35A 4PY6A 4UYGA 5BT3A 5DYCA 2YQDA 5D0CA 4NYVA 4O74A 4J3IA 4QC1A 5AD3A 2E7OA 3SVGA 5HRXA 4QEUA 5CUDA 5IGKA 5ENGA 2N9GA 5EP7A 3VKHA 2YEKA 5J0DA 2D82A 4YY6A 5A5OA 5AMFA 4MR4A 4J1PA 3UW9A 4QSPA 4A9IA 4NR6A 5ETBA 2KTBB 4YYIA 5HRWA 3U5MA 4QEVA 5HLSA 3G0JA 4YYHA 5EWWA 3D1BA 4UIWA 4NYXA 4O7CA 4HBVA 5CU8A 4YYMA 4N4HA 5I86A 4HXNA 5FFYA 4UYHA 5EPRA 2YEMA 4ZC9A 3Q2EA 5A83A 4TQNA 5E9KA 3QZTA 5E9IA 4F3IA 4CUSA 2NXBA 5KHMA 5A7CA 1WUMA 3U5NA 3FKMX 4UYFA 2I7KA 4QSUA 4MENA 5DYAA 5EWHA 5FG4A 4OGIA 5JWMA 3O36A 5DX4A 5II1A 2DWWA 2DATA 5C89A 5L96A 5I83A 5EWDA 3P1EA 5DLZA 2G4AA 4IR6A 1WUGA 5F25A 3RCWA 1JM4B 5HFQA 4YBSA 5E7DA 3ONIA 5D7XA 4FLPA 5A5PA 4YBMA 2DVQA 3JVLA 4QY4A 5CPEA 5HM0A 5ENBA 4CUPA 5A5QA 4CUTA 4O7BA 4UIVA 1F68A 5G4RA 5FDZA 4NR9A 4TU6A 4NR8A 5CQ6A 5DKDA 4YH3A 2R0YA 5I80A 5EM3A 5ENFA 4NR4A 2DKWA 5D3NA 4AKHA 5C87A 4LYSA 5F36A 5LKXA 2L84A 5LKZA 4HXPA 4NUCA 3U5OA 4HXOA 4HXKA 3UV2A 5DW2A 4Z6HA 4AKIA 4QSSA 5LJ0A 5L97A 2MJVB 4CUUA 5DKHA 5E0RA 4KCXA 4QR3A 3SVFA 5DFCA 3ZYUA 4IR5A 5EU1A 5CZGA 4HXSA 2WP2A 3O33A 5F62A 4IOQA 3VKGA 3UV4A 3MQMA 4BHWA 5HQ5A 4XY8A 5F3AA 3MUKA 2DVVA 3LQHA 3IU6A 4BJXA 2GRCA 4QUTA 5KTXA 5EPBA 4J0RA 4TYLA 3I3JA 4ZQLA 4ZW1A 3DAIA 2YW5A 1EQFA 4QR4A 4PKLA 4UIYA 5CS8A 4YYKA 3HMFA 4LR6A 4NS5A 5LJ1A 5EWCA 5H1TA 3MULA 5HCLA 4O7AA 4Q0OA 3QZSA 4O75A 5CTLA 5IG6A 2RNYA 5AMEA 5ACYA 3AADA 4ALGA 5DYUA 5HRVA 4N4FA 5HELA 4CLBA 5DKCA 4WHUA 2RNWA 5A5RA 4PS5A 3S91A 5F63A 5CUEA 5FE4A 4QYLA 2L85A 5IGNA 4QZSA 4TT6A 5E3DA 5K29A 4GPJA 5EPSA 4YK0A 3JVJA 3U5KA 4CUQA 4O71A 4NYWA 4BW2A 4RVRA 4UIZA 4QNSA 4WIVA 4CL9A 5CP5A 3UVXA 5E9VA 4Z93A 5EISA 5LVQA 5ENCA 5LKTA 4XUBA 4A9MA 2EJNA 5D24A 5DFBA 2RS9B 5FE2A 5EGUA 4TT4A 5F1LA 4PCIA 4YYDA 4Z1QA 5LUUA 4A9KA 3G0LA 3U5PA 4NR5A 3UV5A 4HBYA 3MB3A 5F2PA 5ENIA 4C66A 2YELA 4OGJA 5HEMA 4Q0NA 4QSQA 1JSPB 5CQTA 4TU4A 4HXMA 4NRCA 4KV4A 5E9MA 5EV9A
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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