4RVRA

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with gsk2801
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
117
structure length
117
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKVS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Discovery and Characterization of GSK2801, a Selective Chemical Probe for the Bromodomains BAZ2A and BAZ2B.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 39
structure length 117
sequence length 117
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-11-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4rvrA00
4YYNA 4YH3A 5FB0A 5A5PA 5DKCA 3O35A 5A5RA 5IGKA 4Z93A 5DFDA 5C4QA 5CUAA 5KU3A 3Q2EA 5EWVA 5DKHA 5G4SA 4TS8A 5DY7A 5CRMA 5FBXA 1E6IA 4DONA 5JWMA 4QZSA 4TYLA 5D3SA 5CQAA 5E9KA 5EU1A 4N3WA 5F36A 2WP2A 3LJWA 4O75A 4XY9A 4YYGA 4QSUA 4QSTA 5E9VA 4YBSA 5C89A 5E9IA 4NR4A 4J1PA 4NUCA 4NR6A 5CRZA 4YYIA 5FE6A 5L8TA 5LKUA 4NRCA 3HMEA 4LR6A 5FE9A 5HM0A 3UVDA 4BHWA 2RNWA 3MULA 4NR9A 5D3NA 4BW1A 3JVKA 3ONIA 3G0LA 5ENGA 3QZTA 4MEPA 5EGUA 2G4AA 5ENHA 2R0VA 5IBNA 4QNSA 2MJVB 4F3IA 4YYJA 2F6NA 4O78A 4IR6A 4A9LA 4CL9A 4ZW1A 4CUTA 5EISA 4C67A 5DX4A 4MR5A 5HQ5A 4KV4A 4YAXA 5H1TA 4FLPA 3IU6A 4PKLA 5FE3A 3UV4A 5EPRA 5IG6A 4QBMA 3JVJA 4LYWA 4BW2A 5F1HA 4O70A 4O7AA 3RCWA 2E7NA 3DWYA 4QSQA 4TQNA 4TT4A 5I83A 2RFJA 5FE0A 2YDWA 4NYVA 5ENEA 5EI4A 4YYHA 4NUDA 4LZRA 4UIXA 5LVRA 3AADA 4MEQA 5D3TA 5F5ZA 5HQ6A 5C85A 5IGLA 5I1QA 5J0DA 4NR7A 4Z1SA 3MQMA 5CQ3A 4LRGA 5KO4A 5LJ0A 5D3JA 5IGMA 4O71A 4A9FA 2R10A 5K29A 4UIUA 4O77A 4IR4A 5H1VA 4MR3A 3O33A 4HXOA 4PS5A 4UYEA 4BW3A 1F68A 5LJ1A 3P1CA 4O7CA 5E73A 5A7CA 5A5OA 5DLZA 3O34A 4QUTA 5CUEA 2I7KA 2OSSA 5CPEA 5COIA 2KTBB 2R0YA 3MB3A 5E9MA 5EWWA 2DWWA 4TT2A 5HRVA 3MXFA 3MUKA 5CZGA 3O36A 4QC3A 5FH6A 5D7XA 2H60A 3U5PA 4CLBA 4MR4A 4TZ2A 3P5OA 5JI8A 5E0RA 4YADA 2WP1A 5ENBA 5CS8A 4CUSA 4UYGA 4UIZA 2OUOA 4QSXA 3UVXA 3LQJA 5C7NA 5DW2A 5FE2A 3LXJA 4QEWA 1EQFA 1JSPB 4ALHA 4OGJA 5EK9A 4IOOA 5CUBA 4YC9A 5AD3A 5EQ1A 5EICA 5CQ5A 2DVVA 1N72A 5D3LA 2R0SA 5A82A 4XUBA 3JVMA 3U5KA 4QSPA 5FE4A 2NXBA 5ENCA 5G4RA 4WHUA 4Z6HA 4CUUA 3GG3A 5ACYA 4UITA 5L97A 4YYDA 3K2JA 5D3PA 4HXSA 2RNYA 5ENIA 4PCEA 5EWHA 4TU6A 5ETBA 2D82A 2YQDA 4J3IA 4LC2A 5F60A 4Y03A 5HEMA 4NS5A 5F3AA 5II2A 4NR8A 3QZVA 4QEVA 2GRCA 5E3DA 5DYCA 4QSRA 5LVQA 5I7YA 2L5EA 4PTBA 4LZ2A 2YEMA 5E3GA 4NQMA 3UV2A 4YY4A 4E96A 4CFKA 3U5NA 3G0JA 3P1FA 5EWDA 5FG6A 4TTEA 4UIYA 3ZYUA 2L85A 3P1DA 5F62A 3Q2FA 5DLXA 5F25A 5AMFA 4QB3A 5EP7A 5FFWA 5A81A 4QUUA 4A9HA 5FB1A 4UYFA 4IORA 3SVFA 4TT6A 4X2IA 5II1A 5L99A 5FH8A 5D3RA 5CGPA 4QYLA 4HBWA 5BT5A 4N4GA 2L84A 4C66A 4GPJA 5AMEA 5F2PA 3UVYA 4UIWA 5E74A 5BT3A 5FE1A 5ETDA 5I7XA 5D0CA 3LQHA 5HELA 2DVSA 4Q0OA 4YYKA 3U5LA 4CFLA 4UIVA 5I89A 2LSPB 3TLPA 4XUAA 5CQ6A 4LZSA 5C8GA 5DFBA 2YYNA 4HXRA 4CURA 4A9EA 5FFVA 4MR6A 5DYAA 5DYXA 1WUMA 5CUCA 3LQIA 4HXKA 5EPSA 3FKMX 5EWCA 5CQ7A 4A9NA 3U5JA 4QY4A 4OUFA 5FE7A 3HMHA 5DBMA 2DATA 4A9IA 5HRXA 4QEUA 5AD2A 5CP5A 4CUPA 5EV9A 5C87A 4HXNA 4HBVA 5IGNA 4RVRA 5D3HA 4BW4A 5E9YA 5A85A 5I40A 5I86A 5HFQA 2YW5A 5LUUA 5A83A 2FSAA 4NR5A 5CQ8A 3MB4A 4NUEA 4NYXA 4UYDA 5F63A 2I8NA 5ENFA 2RS9B 5CQ4A 3D7CA 5TB6A 2E7OA 5FG4A 5I29A 4HBXA 4XYAA 3JVLA 4Z1QA 4OGIA 4HXLA 4LYSA 4NRAA 5L8UA 4KCXA 4QR4A 2YEKA 1JM4B 4MEOA 3DAIA 3QZSA 2D9EA 5CTLA 2RNXA 5EVAA 5A5QA 3AQAA 4QYDA 5L96A 3SVGA 5IIDA 5LKXA 5H85A 3NXBA 5EA1A 4HXPA 1X0JA 5CY9A 5F1LA 5FG5A 5KHMA 4J0SA 5FFYA 4QR5A 3IU5A 5CUGA 4J0RA 4N4FA 5EPBA 5HJCA 4QR3A 4YY6A 2N9GA 4O74A 2OO1A 4IOQA 4O76A 4IR3A 4YBMA 5KTWA 4QSSA 2RI7A 5LJ2A 3UV5A 5D26A 3UVWA 4YATA 4QSVA 4ZC9A 4A9OA 5D24A 4YABA 4WIVA 4XY8A 5FH7A 5LKZA 5E9LA 5L98A 4NQNA 4NYWA 5EM3A 3S91A 5FDZA 4WHWA 4PCIA 5HLSA 4YBTA 3P1EA 5E7DA 5FE5A 3I3JA 5HQ7A 5CU8A 4Z6IA 5HRWA 4YYMA 4LDFA 5CUDA 2F6JA 3HMFA 5D25A 5I88A 4QSWA 4UYFB 2DKWA 5H1UA 5KTXA 3U5OA 4N4HA 4UYHA 4TU4A 4HXMA 5HFRA 4A9KA 5KTUA 5DYUA 4PY6A 4IR5A 4O7FA 2YELA 5LKTA 5HENA 5CFWA 4LYIA 4AKNA 4N4IA 4NRBA 1ZS5A 2E3KA 4YH4A 4YK0A 4O7EA 5TCMA 5DW1A 4MENA 5HCLA 4A9MA 3O37A 5DKDA 5I80A 5BT4A 4QC1A 3U5MA 2DVRA 4KV1A 4A9JA 4HBYA 4CUQA 5F61A 1WUGA 3S92A 5A5SA 4ALGA 5CQTA 4Q0NA 4ZQLA 4BJXA 2DVQA 3SVHA 4O72A 5A5NA 5FE8A 4TZ8A 5ENJA 4NXJA 2RO1A 3UW9A 5DFCA 4O7BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YYNA 4YH3A 5FB0A 5A5PA 5DKCA 3O35A 4AKGA 5A5RA 5IGKA 4Z93A 5DFDA 5C4QA 5CUAA 5KU3A 3Q2EA 5EWVA 5DKHA 5G4SA 4TS8A 5DY7A 5CRMA 5FBXA 1E6IA 4DONA 5JWMA 4QZSA 4TYLA 5D3SA 5CQAA 5E9KA 5EU1A 4N3WA 5F36A 2WP2A 3LJWA 4O75A 4XY9A 4YYGA 4QSUA 4QSTA 5E9VA 4YBSA 5C89A 5E9IA 4NR4A 4J1PA 4NUCA 4NR6A 5CRZA 4YYIA 5FE6A 3VKHA 5L8TA 5LKUA 4NRCA 3HMEA 4LR6A 5FE9A 5HM0A 4AKHA 3UVDA 4BHWA 2RNWA 3MULA 4NR9A 5D3NA 4BW1A 3JVKA 3ONIA 3G0LA 5ENGA 3QZTA 4MEPA 5EGUA 2G4AA 5ENHA 2R0VA 5IBNA 3D1DA 4QNSA 2MJVB 4F3IA 4YYJA 2F6NA 4O78A 4IR6A 4A9LA 4CL9A 4ZW1A 4CUTA 5EISA 4C67A 5DX4A 4MR5A 5HQ5A 4KV4A 4YAXA 5H1TA 4FLPA 3IU6A 4PKLA 5FE3A 3UV4A 5EPRA 5IG6A 4QBMA 3JVJA 4LYWA 4BW2A 5F1HA 4O70A 4O7AA 3RCWA 2E7NA 3DWYA 4QSQA 4TQNA 4TT4A 5I83A 2RFJA 5FE0A 2YDWA 4NYVA 5ENEA 5EI4A 4YYHA 4NUDA 4LZRA 4UIXA 5LVRA 3AADA 4MEQA 5D3TA 5F5ZA 5HQ6A 5C85A 5IGLA 5I1QA 5J0DA 4NR7A 4Z1SA 3MQMA 5CQ3A 4LRGA 4AI6A 5KO4A 5LJ0A 5D3JA 5IGMA 4O71A 4A9FA 2R10A 5K29A 4UIUA 4O77A 4IR4A 5H1VA 4MR3A 3O33A 4HXOA 4PS5A 4UYEA 4BW3A 1F68A 5LJ1A 3P1CA 4O7CA 5E73A 5A7CA 1PUOA 5A5OA 5DLZA 3O34A 4QUTA 5CUEA 2I7KA 2OSSA 5CPEA 5COIA 2KTBB 2R0YA 3MB3A 5E9MA 5EWWA 2DWWA 3VKGA 4TT2A 5HRVA 3MXFA 3MUKA 5CZGA 3O36A 4QC3A 5FH6A 5D7XA 2H60A 3U5PA 4CLBA 4MR4A 4TZ2A 3P5OA 5JI8A 5E0RA 4YADA 2WP1A 5ENBA 5CS8A 4CUSA 4UYGA 4UIZA 2OUOA 4QSXA 3UVXA 3LQJA 5C7NA 5DW2A 5FE2A 3LXJA 4QEWA 1EQFA 1JSPB 4ALHA 4OGJA 5EK9A 4IOOA 5CUBA 4YC9A 5AD3A 5EQ1A 5EICA 5CQ5A 2DVVA 1N72A 5D3LA 2R0SA 5A82A 4XUBA 3JVMA 3U5KA 4QSPA 5FE4A 2NXBA 5ENCA 5G4RA 4WHUA 4Z6HA 4CUUA 3GG3A 5ACYA 4UITA 5L97A 4YYDA 3K2JA 5D3PA 4HXSA 2RNYA 5ENIA 4PCEA 5EWHA 4TU6A 5ETBA 2D82A 2YQDA 4J3IA 4LC2A 5F60A 4Y03A 5HEMA 4NS5A 5F3AA 5II2A 4NR8A 3QZVA 4QEVA 2GRCA 5E3DA 5DYCA 4QSRA 5LVQA 5I7YA 2L5EA 4PTBA 4LZ2A 2YEMA 5E3GA 4NQMA 3UV2A 4YY4A 4E96A 4CFKA 3U5NA 3G0JA 3P1FA 5EWDA 5FG6A 4TTEA 4UIYA 3ZYUA 2L85A 3P1DA 5F62A 3Q2FA 5DLXA 5F25A 5AMFA 4QB3A 5EP7A 5FFWA 5A81A 4QUUA 4A9HA 5FB1A 4UYFA 4IORA 3SVFA 4TT6A 4X2IA 5II1A 5L99A 5FH8A 5D3RA 5CGPA 4QYLA 4HBWA 5BT5A 4N4GA 2L84A 4C66A 4GPJA 5AMEA 5F2PA 3UVYA 4UIWA 5E74A 5BT3A 5FE1A 5ETDA 5I7XA 5D0CA 3LQHA 5HELA 2DVSA 4Q0OA 4YYKA 3U5LA 4CFLA 4UIVA 4AKIA 5I89A 2LSPB 3TLPA 4XUAA 5CQ6A 4LZSA 5C8GA 5DFBA 2YYNA 4HXRA 4CURA 4A9EA 5FFVA 4MR6A 5DYAA 5DYXA 1WUMA 5CUCA 3LQIA 4HXKA 5EPSA 3FKMX 5EWCA 5CQ7A 4A9NA 3U5JA 4QY4A 4OUFA 5FE7A 3HMHA 5DBMA 2DATA 4A9IA 5HRXA 4QEUA 5AD2A 5CP5A 4CUPA 5EV9A 5C87A 4HXNA 4HBVA 5IGNA 4RVRA 5D3HA 4BW4A 5E9YA 3D1BA 5A85A 5I40A 5I86A 5HFQA 2YW5A 5LUUA 5A83A 2FSAA 4NR5A 5CQ8A 3MB4A 4NUEA 4NYXA 4UYDA 5F63A 2I8NA 5ENFA 2RS9B 5CQ4A 3D7CA 5TB6A 2E7OA 5FG4A 5I29A 4HBXA 4XYAA 3JVLA 4Z1QA 4OGIA 4HXLA 4LYSA 4NRAA 5L8UA 1ZKRA 2EJNA 4KCXA 4QR4A 2YEKA 1JM4B 4MEOA 3DAIA 3QZSA 2D9EA 5CTLA 2RNXA 5EVAA 5A5QA 3AQAA 4QYDA 5L96A 3SVGA 5IIDA 5LKXA 5H85A 3NXBA 5EA1A 4HXPA 1X0JA 5CY9A 5F1LA 5FG5A 5KHMA 4J0SA 5FFYA 4QR5A 3IU5A 5CUGA 4J0RA 4N4FA 5EPBA 5HJCA 4QR3A 3ERRA 4YY6A 2N9GA 4O74A 2OO1A 4IOQA 4O76A 4IR3A 4YBMA 5KTWA 4QSSA 2RI7A 5LJ2A 3UV5A 5D26A 3UVWA 4YATA 4QSVA 4ZC9A 4A9OA 5D24A 4YABA 4WIVA 4XY8A 5FH7A 5LKZA 5E9LA 5L98A 4NQNA 4NYWA 5EM3A 3S91A 5FDZA 4WHWA 4PCIA 5HLSA 4YBTA 3P1EA 5E7DA 5FE5A 3I3JA 5HQ7A 5CU8A 4Z6IA 5HRWA 4YYMA 4LDFA 5CUDA 2F6JA 3HMFA 5D25A 5I88A 4QSWA 4UYFB 2DKWA 5H1UA 5KTXA 3U5OA 4N4HA 4UYHA 4TU4A 4HXMA 5HFRA 4A9KA 5KTUA 5DYUA 4PY6A 4IR5A 4O7FA 2YELA 5LKTA 5HENA 5CFWA 4LYIA 4AKNA 4N4IA 4NRBA 1ZS5A 2E3KA 4YH4A 4YK0A 4O7EA 5TCMA 5DW1A 4MENA 5HCLA 4A9MA 3O37A 5DKDA 5I80A 5BT4A 4QC1A 3U5MA 2DVRA 4KV1A 4A9JA 4HBYA 4CUQA 5F61A 1WUGA 3S92A 5A5SA 4ALGA 5CQTA 4Q0NA 4ZQLA 4BJXA 2DVQA 3SVHA 4O72A 5A5NA 5FE8A 4TZ8A 5ENJA 4NXJA 2RO1A 3UW9A 5DFCA 4O7BA
chains in the Genus database with same CATH topology
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