4RVRA

Crystal structure of the bromodomain of human baz2b in complex with gsk2801
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
117
structure length
117
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFKVS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain adjacent to zinc finger domain protein 2B
publication title Discovery and Characterization of GSK2801, a Selective Chemical Probe for the Bromodomains BAZ2A and BAZ2B.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 39
structure length 117
sequence length 117
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-11-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4rvrA00
3JVLA 5A81A 2MJVB 4A9IA 5FE0A 4CUPA 5I80A 4IR3A 3TLPA 4MEQA 2L84A 5FE3A 3U5LA 3JVMA 4LC2A 2KTBB 5FE4A 5DYXA 4CUSA 5FH7A 2R0YA 4UIUA 5A5NA 5F2PA 4Z6HA 5A5PA 5H1TA 5E9LA 4TT2A 5KTXA 3UVWA 4HBYA 4YYHA 3LQHA 4CLBA 5FE6A 5A82A 4QUTA 4Z1SA 4XY9A 2I7KA 5DYCA 5HRXA 5CGPA 5ETBA 3MULA 5ETDA 2OSSA 5HRWA 4LZ2A 4A9FA 5HFQA 5F5ZA 4CFLA 4KCXA 4YY6A 2OO1A 5D3RA 4HXNA 4HXPA 3U5OA 4UYHA 5CU8A 3G0JA 4E96A 3S91A 5HRVA 4NS5A 4A9NA 3FKMX 4NQNA 4HXSA 5FG4A 5DW2A 5EPSA 5C4QA 5HCLA 5II2A 5D7XA 4O72A 5CQ5A 4QSUA 2YELA 5HQ7A 4TZ8A 4PTBA 4J0RA 4QSTA 2WP1A 3O36A 5F25A 3U5MA 3O37A 5FE9A 5L99A 5DFBA 4A9EA 2H60A 5D3LA 5DLXA 4N4IA 4C67A 4Z1QA 5A85A 5CQ4A 4NR4A 4CURA 4NR8A 4A9OA 5J0DA 4YYDA 2LSPB 4NYWA 3LQIA 5CQ3A 2YW5A 4J3IA 5FE2A 4NQMA 4IOOA 4UYEA 4YYGA 5LJ2A 4YYNA 4IR6A 4N4GA 5LJ0A 5E74A 4N4FA 5EWCA 5G4RA 5D3PA 5EQ1A 5FH8A 3K2JA 5D3NA 5L98A 4A9MA 3Q2EA 4QY4A 3ONIA 3LJWA 5FE7A 3JVJA 5E9YA 5IGLA 4UIYA 5LVRA 5EISA 4QZSA 5DBMA 3U5NA 5E7DA 4QEVA 5E9KA 4O7FA 5EWWA 4Z6IA 4IOQA 4N3WA 5A5RA 2E7NA 3MQMA 4CUUA 4FLPA 2NXBA 4QEUA 5IGMA 4QSQA 5FE8A 5KTUA 5EWVA 4MR5A 5FB0A 5EGUA 5F62A 4TU6A 4NYVA 4QR4A 4Y03A 4LZRA 4LYWA 5HEMA 4LYIA 4BW4A 3ZYUA 2YEMA 5HQ6A 5BT4A 5C85A 5FBXA 5CZGA 5KO4A 3DWYA 4KV4A 4PY6A 5EICA 5I89A 2YQDA 5D3SA 4BW2A 2I8NA 2RNYA 4OGJA 5DKCA 4TZ2A 4YBTA 4IR4A 4NUEA 2F6NA 3HMHA 5CUEA 5AD2A 4HXMA 2R0SA 5DY7A 3U5KA 4QC3A 3IU5A 4YYMA 5LKZA 1JSPB 4O7CA 4QBMA 5ENCA 4LZSA 4QEWA 5CRZA 4UIVA 5G4SA 4NRCA 3QZSA 5EI4A 5A7CA 2RI7A 4O70A 5KHMA 5ENEA 4YADA 5A5SA 3U5PA 1WUMA 4C66A 4QSVA 4O77A 4YBSA 5BT5A 5COIA 4QR5A 5D3HA 5I40A 5LUUA 2D82A 4LR6A 5F63A 5EVAA 5LJ1A 4TU4A 4YYJA 4HXOA 5AMEA 2DVQA 5EM3A 4PCEA 5A5QA 4PKLA 4Q0NA 4LRGA 4F3IA 5F60A 3UV4A 5HJCA 5D0CA 4NR7A 4TT6A 4XYAA 5F1LA 5FDZA 4QNSA 4ZC9A 4NUDA 5E3GA 3AADA 4BW3A 2L85A 5L96A 4HBXA 5DYUA 5II1A 1E6IA 5ENIA 3HMEA 4IR5A 5FE1A 5AMFA 5C8GA 2G4AA 5IIDA 4CFKA 5I88A 4OUFA 2OUOA 5F61A 4QUUA 4O78A 4UYFB 5D24A 5L8TA 3JVKA 5CFWA 4MR4A 2RNXA 5H1UA 5D3TA 5FFYA 5DKHA 5FB1A 4A9JA 5ENBA 5K29A 4LYSA 4UITA 3P5OA 3UV5A 4CUQA 4UYGA 3SVHA 3RCWA 4J1PA 5CUBA 4Q0OA 5CTLA 5HENA 4TYLA 3UVYA 4MR6A 3S92A 4BJXA 2DVSA 2WP2A 4QSWA 4YH3A 4QSRA 5CP5A 4WHWA 5HM0A 5L97A 2YEKA 2DVRA 2DKWA 4QSPA 5IBNA 3UV2A 4KV1A 3P1FA 5CRMA 5CPEA 4O76A 5DFDA 2L5EA 3MUKA 5EV9A 3G0LA 4XY8A 5FG5A 4ZW1A 4NRAA 4A9KA 4A9LA 3AQAA 5DYAA 1N72A 4WHUA 4LDFA 4NR6A 5CUGA 5E73A 4BHWA 5FE5A 5FG6A 5IG6A 4UYDA 5AD3A 4NXJA 4MR3A 2RFJA 3P1DA 3O33A 1ZS5A 3UW9A 3SVFA 3MXFA 5DLZA 5D26A 5C87A 5CS8A 5E3DA 3LQJA 4J0SA 3DAIA 5I7XA 3MB3A 3IU6A 5H1VA 5L8UA 5EWDA 4QR3A 5D25A 3O34A 4ZQLA 5I1QA 4PS5A 2R10A 5C89A 4ALGA 4YAXA 5E9VA 5ENFA 2E7OA 4O7EA 3U5JA 4NYXA 1X0JA 5TB6A 5I83A 4WIVA 5CUAA 5DW1A 3Q2FA 4TS8A 4BW1A 4YYIA 5LKUA 5FFVA 4QSSA 3UVXA 4UIXA 5LKXA 4O75A 3MB4A 5CQAA 2DWWA 4YATA 5FH6A 4TQNA 5D3JA 1EQFA 4TTEA 5DX4A 4HBVA 4O71A 5FFWA 1F68A 4GPJA 4AKNA 4QYLA 4QSXA 3QZVA 4Z93A 5CQTA 4A9HA 2GRCA 5LVQA 4YBMA 3I3JA 5KU3A 5A5OA 4PCIA 4IORA 2DATA 5EA1A 4MEPA 4UIWA 3NXBA 2YYNA 2RO1A 4YABA 4YY4A 4N4HA 4QB3A 4CL9A 4NR9A 4O74A 5IGKA 4YK0A 2RNWA 2YDWA 5HLSA 4O7AA 5F3AA 5CUDA 2FSAA 5HELA 5HQ5A 5JI8A 4HXKA 5KTWA 4YH4A 3GG3A 3P1CA 3O35A 5HFRA 5I7YA 3D7CA 5ENJA 5ACYA 3HMFA 5E0RA 4XUAA 4YYKA 3UVDA 4QC1A 5C7NA 5E9MA 4DONA 3QZTA 2D9EA 5EP7A 2F6JA 5DKDA 5F36A 5CUCA 5CY9A 4RVRA 5TCMA 4MEOA 5ENHA 4TT4A 5EK9A 2N9GA 5ENGA 4NR5A 3SVGA 5E9IA 5JWMA 3P1EA 4UYFA 5F1HA 4OGIA 4HBWA 5I29A 4HXLA 5I86A 4HXRA 5DFCA 1WUGA 2DVVA 2E3KA 2RS9B 4MENA 5EU1A 4O7BA 5EPBA 4QYDA 5LKTA 3LXJA 4ALHA 5H85A 5IGNA 5CQ8A 4X2IA 4NRBA 5A83A 5EPRA 1JM4B 2R0VA 4UIZA 5CQ6A 4YC9A 4CUTA 4NUCA 5CQ7A 5BT3A 5EWHA 4XUBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3JVLA 5A81A 2MJVB 4A9IA 5FE0A 4CUPA 5I80A 4IR3A 3TLPA 4MEQA 2L84A 5FE3A 3U5LA 3JVMA 4LC2A 3ERRA 2KTBB 5FE4A 5DYXA 4CUSA 5FH7A 2R0YA 4UIUA 5A5NA 5F2PA 4Z6HA 5A5PA 5H1TA 5E9LA 3D1BA 4TT2A 5KTXA 3VKGA 3UVWA 4HBYA 4YYHA 3LQHA 4CLBA 5FE6A 5A82A 4QUTA 4Z1SA 4XY9A 2I7KA 5DYCA 5HRXA 5CGPA 5ETBA 3MULA 5ETDA 2OSSA 5HRWA 4LZ2A 4A9FA 5HFQA 5F5ZA 4CFLA 4KCXA 4YY6A 2OO1A 5D3RA 4HXNA 4HXPA 3U5OA 4UYHA 5CU8A 3G0JA 4E96A 3S91A 5HRVA 4NS5A 4A9NA 3FKMX 3D1DA 4NQNA 4HXSA 5FG4A 5DW2A 5EPSA 4AI6A 5C4QA 5HCLA 5II2A 5D7XA 4O72A 5CQ5A 4QSUA 2YELA 5HQ7A 4TZ8A 4PTBA 4J0RA 4QSTA 2WP1A 3O36A 5F25A 3U5MA 3O37A 5FE9A 5L99A 5DFBA 4A9EA 2H60A 5D3LA 5DLXA 4N4IA 4C67A 4Z1QA 5A85A 5CQ4A 4NR4A 4CURA 4NR8A 4A9OA 5J0DA 4YYDA 2LSPB 4NYWA 3LQIA 5CQ3A 2YW5A 4J3IA 5FE2A 4NQMA 4IOOA 4UYEA 4YYGA 5LJ2A 4YYNA 4IR6A 4N4GA 5LJ0A 5E74A 4N4FA 5EWCA 5G4RA 5D3PA 5EQ1A 5FH8A 3K2JA 5D3NA 5L98A 4A9MA 3Q2EA 4QY4A 3ONIA 3LJWA 5FE7A 3JVJA 5E9YA 5IGLA 4UIYA 5LVRA 5EISA 4QZSA 5DBMA 3U5NA 5E7DA 4QEVA 5E9KA 4O7FA 5EWWA 4Z6IA 4IOQA 4N3WA 5A5RA 2E7NA 3MQMA 4CUUA 4FLPA 2NXBA 4QEUA 5IGMA 4AKHA 4QSQA 5FE8A 5KTUA 5EWVA 4MR5A 5FB0A 5EGUA 5F62A 4TU6A 4NYVA 4QR4A 4Y03A 4LZRA 4LYWA 5HEMA 4LYIA 4BW4A 3ZYUA 2YEMA 5HQ6A 5BT4A 5C85A 5FBXA 5CZGA 5KO4A 3DWYA 4KV4A 4PY6A 5EICA 5I89A 2YQDA 5D3SA 4BW2A 2I8NA 2RNYA 4OGJA 5DKCA 4TZ2A 4YBTA 4IR4A 4NUEA 2F6NA 3HMHA 5CUEA 5AD2A 4HXMA 2R0SA 5DY7A 3U5KA 4QC3A 3IU5A 4YYMA 5LKZA 1JSPB 4O7CA 4QBMA 5ENCA 4LZSA 4QEWA 5CRZA 4UIVA 5G4SA 4NRCA 3QZSA 5EI4A 5A7CA 2RI7A 4O70A 5KHMA 5ENEA 4YADA 5A5SA 3U5PA 1WUMA 4C66A 4QSVA 4O77A 4YBSA 5BT5A 5COIA 4QR5A 5D3HA 5I40A 3VKHA 5LUUA 2D82A 4LR6A 5F63A 5EVAA 5LJ1A 4TU4A 4YYJA 4HXOA 5AMEA 2DVQA 5EM3A 4PCEA 5A5QA 4PKLA 4Q0NA 4LRGA 4F3IA 5F60A 3UV4A 5HJCA 5D0CA 4NR7A 4TT6A 4XYAA 5F1LA 5FDZA 4QNSA 4ZC9A 4NUDA 5E3GA 3AADA 4BW3A 2L85A 5L96A 4HBXA 5DYUA 5II1A 1E6IA 5ENIA 3HMEA 4IR5A 5FE1A 5AMFA 5C8GA 2G4AA 5IIDA 4CFKA 5I88A 4OUFA 1ZKRA 2OUOA 5F61A 4QUUA 4O78A 4UYFB 5D24A 5L8TA 3JVKA 5CFWA 4MR4A 2RNXA 5H1UA 5D3TA 5FFYA 5DKHA 5FB1A 4A9JA 5ENBA 5K29A 4LYSA 4UITA 3P5OA 3UV5A 4CUQA 4UYGA 3SVHA 3RCWA 4J1PA 5CUBA 4Q0OA 5CTLA 5HENA 4TYLA 3UVYA 4MR6A 3S92A 4BJXA 2DVSA 2WP2A 2EJNA 4QSWA 4YH3A 4QSRA 5CP5A 4WHWA 5HM0A 5L97A 2YEKA 2DVRA 2DKWA 4QSPA 5IBNA 3UV2A 4KV1A 3P1FA 5CRMA 4AKIA 5CPEA 4O76A 5DFDA 2L5EA 3MUKA 5EV9A 3G0LA 4XY8A 5FG5A 4ZW1A 4NRAA 4A9KA 4A9LA 3AQAA 5DYAA 1N72A 4WHUA 4LDFA 4NR6A 5CUGA 5E73A 4BHWA 5FE5A 5FG6A 5IG6A 4UYDA 5AD3A 4NXJA 4MR3A 2RFJA 3P1DA 3O33A 1ZS5A 3UW9A 3SVFA 3MXFA 5DLZA 5D26A 5C87A 5CS8A 5E3DA 3LQJA 4J0SA 3DAIA 5I7XA 3MB3A 3IU6A 5H1VA 5L8UA 5EWDA 4QR3A 5D25A 3O34A 4ZQLA 5I1QA 4PS5A 2R10A 5C89A 4ALGA 4YAXA 5E9VA 5ENFA 2E7OA 4O7EA 3U5JA 4NYXA 1X0JA 5TB6A 5I83A 4WIVA 5CUAA 5DW1A 3Q2FA 4TS8A 4BW1A 4YYIA 5LKUA 5FFVA 4QSSA 3UVXA 4UIXA 5LKXA 4O75A 3MB4A 5CQAA 2DWWA 4YATA 5FH6A 4TQNA 5D3JA 1EQFA 4TTEA 5DX4A 4HBVA 4O71A 5FFWA 1F68A 4GPJA 4AKNA 4QYLA 4QSXA 3QZVA 4Z93A 5CQTA 4A9HA 2GRCA 5LVQA 4YBMA 3I3JA 5KU3A 5A5OA 4PCIA 4IORA 2DATA 5EA1A 4MEPA 4UIWA 3NXBA 2YYNA 2RO1A 4YABA 4YY4A 4N4HA 4QB3A 4CL9A 4NR9A 4O74A 5IGKA 4YK0A 2RNWA 2YDWA 5HLSA 4O7AA 5F3AA 5CUDA 2FSAA 5HELA 5HQ5A 5JI8A 4HXKA 5KTWA 4YH4A 3GG3A 3P1CA 3O35A 5HFRA 5I7YA 3D7CA 5ENJA 5ACYA 3HMFA 5E0RA 4XUAA 4YYKA 3UVDA 4QC1A 1PUOA 5C7NA 5E9MA 4DONA 3QZTA 2D9EA 5EP7A 2F6JA 5DKDA 5F36A 5CUCA 5CY9A 4RVRA 5TCMA 4MEOA 5ENHA 4AKGA 4TT4A 5EK9A 2N9GA 5ENGA 4NR5A 3SVGA 5E9IA 5JWMA 3P1EA 4UYFA 5F1HA 4OGIA 4HBWA 5I29A 4HXLA 5I86A 4HXRA 5DFCA 1WUGA 2DVVA 2E3KA 2RS9B 4MENA 5EU1A 4O7BA 5EPBA 4QYDA 5LKTA 3LXJA 4ALHA 5H85A 5IGNA 5CQ8A 4X2IA 4NRBA 5A83A 5EPRA 1JM4B 2R0VA 4UIZA 5CQ6A 4YC9A 4CUTA 4NUCA 5CQ7A 5BT3A 5EWHA 4XUBA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3JVL A;  5A81 A;  2MJV B;  4A9I A;  5FE0 A;  4CUP A;  5I80 A;  4IR3 A;  3TLP A;  4MEQ A;  2L84 A;  5FE3 A;  3U5L A;  3JVM A;  4LC2 A;  2KTB B;  5FE4 A;  5DYX A;  4CUS A;  5FH7 A;  2R0Y A;  4UIU A;  5A5N A;  5F2P A;  4Z6H A;  5A5P A;  5H1T A;  5E9L A;  4TT2 A;  5KTX A;  3UVW A;  4HBY A;  4YYH A;  3LQH A;  4CLB A;  5FE6 A;  5A82 A;  4QUT A;  4Z1S A;  4XY9 A;  2I7K A;  5DYC A;  5HRX A;  5CGP A;  5ETB A;  3MUL A;  5ETD A;  2OSS A;  5HRW A;  4LZ2 A;  4A9F A;  5HFQ A;  5F5Z A;  4CFL A;  4KCX A;  4YY6 A;  2OO1 A;  5D3R A;  4HXN A;  4HXP A;  3U5O A;  4UYH A;  5CU8 A;  3G0J A;  4E96 A;  3S91 A;  5HRV A;  4NS5 A;  4A9N A;  3FKM X;  4NQN A;  4HXS A;  5FG4 A;  5DW2 A;  5EPS A;  5C4Q A;  5HCL A;  5II2 A;  5D7X A;  4O72 A;  5CQ5 A;  4QSU A;  2YEL A;  5HQ7 A;  4TZ8 A;  4PTB A;  4J0R A;  4QST A;  2WP1 A;  3O36 A;  5F25 A;  3U5M A;  3O37 A;  5FE9 A;  5L99 A;  5DFB A;  4A9E A;  2H60 A;  5D3L A;  5DLX A;  4N4I A;  4C67 A;  4Z1Q A;  5A85 A;  5CQ4 A;  4NR4 A;  4CUR A;  4NR8 A;  4A9O A;  5J0D A;  4YYD A;  2LSP B; 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