5D3LA

First bromodomain of brd4 bound to inhibitor xd35
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title 4-Acyl Pyrrole Derivatives Yield Novel Vectors for Designing Inhibitors of the Acetyl-Lysine Recognition Site of BRD4(1).
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5d3lA01
4QSVA 4X2IA 5D3JA 5C7NA 3HMHA 5EV9A 5F63A 4YK0A 5HRWA 3P5OA 3O33A 2E7NA 4YAXA 4QSTA 5AD3A 5AD2A 4NR4A 5CUCA 5HQ6A 4QYLA 3G0LA 5II2A 4LR6A 4HBVA 4J1PA 4UIUA 4YYNA 4NQMA 5HELA 4PY6A 5A81A 1F68A 5HM0A 5EK9A 2D9EA 5DYUA 2DVRA 5I1QA 5H85A 5D26A 4BW1A 2DATA 5CZGA 4QY4A 1JSPB 5AMFA 5ETBA 5CFWA 4PS5A 4C67A 5DFBA 4CUQA 5ENFA 4ZQLA 5II1A 4YYIA 4O7BA 4YY6A 1N72A 5HRXA 5A85A 4LRGA 4N3WA 4HBXA 5I7YA 5A5QA 4A9EA 5DFDA 5COIA 4IR3A 3HMEA 4QC3A 4MR5A 4UIYA 5A5SA 5EM3A 5CTLA 2F6NA 3P1CA 2G4AA 4QZSA 5C85A 4WHWA 3O35A 4NR6A 5TCMA 5L8TA 5EQ1A 4TZ8A 2YEMA 5CS8A 5E73A 4GPJA 4A9HA 5FE2A 5J0DA 1JM4B 4MENA 3U5LA 4A9IA 1WUGA 4NYXA 3ONIA 5H1TA 4BW2A 2YYNA 3JVMA 2RNXA 5A5PA 3MXFA 5DYCA 5A83A 4IOOA 3QZTA 5KTUA 2RS9B 5F5ZA 5FH6A 4QBMA 5I83A 5D7XA 3JVLA 4LZ2A 3JVJA 4IR5A 5E3GA 4UIVA 4LYWA 4O71A 5D3NA 4UITA 4F3IA 5FE4A 3U5MA 4Z93A 5A5RA 5DW1A 5EWDA 4NXJA 4E96A 4MEQA 5E9LA 4NQNA 4O7FA 5ENHA 3UV2A 2RNWA 5HFQA 4YBMA 4TZ2A 4O70A 4CUUA 5EA1A 3QZSA 5CY9A 4CFKA 3O34A 5I89A 2OSSA 4UIXA 4MEOA 5CQTA 4QSWA 4UYEA 4YBTA 4QSXA 4YYHA 5C8GA 5FE0A 5F36A 5BT3A 4YYMA 3LQJA 4YH3A 4N4FA 4J0SA 5E0RA 4Z6HA 3SVHA 5IG6A 5EWHA 4NR7A 3UVWA 5I7XA 4QSQA 4HXOA 3SVFA 5CQ3A 4XY9A 4MR4A 5FE6A 4HBYA 4YY4A 4YADA 5CQ6A 5DLXA 5HCLA 4TQNA 4LDFA 4QSPA 5HRVA 4QEUA 5EPSA 4NR9A 5HENA 5KO4A 2E3KA 4HXNA 4O7CA 4O77A 4O72A 2D82A 5ENBA 4O7AA 2YQDA 5E9VA 3UVXA 5K29A 5EVAA 4OGJA 5CUAA 5EPBA 5FFVA 5FE5A 5F60A 4IOQA 5JI8A 5LVQA 5CUGA 5DW2A 5KTWA 5LJ2A 5DKCA 4O76A 5EPRA 5FH8A 4HXKA 4PCIA 2GRCA 5FG4A 2WP2A 4UYFB 5BT5A 4CURA 4KCXA 4HXSA 4TYLA 4KV1A 4ALHA 4TT2A 5EI4A 5DKHA 3SVGA 4N4IA 5A5NA 5ACYA 5DFCA 5AMEA 1ZS5A 2LSPB 5HQ7A 2RFJA 4QR5A 2R10A 3G0JA 5CRZA 3DWYA 5LVRA 4QYDA 3UW9A 2KTBB 4LYIA 5A7CA 5D0CA 4CL9A 4CUSA 5C89A 2DVVA 3JVKA 5H1UA 4ALGA 2FSAA 2DVSA 5FDZA 3LQHA 4LZSA 5E3DA 2WP1A 5KTXA 4TT4A 2RNYA 4UYFA 5E74A 2OO1A 4DONA 5FE9A 5LJ0A 5IIDA 2R0VA 1E6IA 2I8NA 4TT6A 5CRMA 4HXPA 5FE7A 4XY8A 5FB1A 3DAIA 3HMFA 2N9GA 4LYSA 3UVYA 4NRCA 3LXJA 4NRBA 4YYGA 5A5OA 5TB6A 3MULA 3P1FA 5E9KA 4XYAA 5HEMA 5ENIA 5F25A 5I88A 3O36A 5EICA 4A9MA 5FFWA 4A9JA 5D3LA 4QEWA 4A9OA 4FLPA 4CLBA 4BHWA 3MB4A 5CQ7A 3S91A 5H1VA 2YW5A 3MQMA 4HXRA 4XUBA 5L98A 5CQAA 4QSRA 2RI7A 4N4GA 4TU4A 5ENEA 3UV4A 5LKUA 4ZW1A 4O7EA 3U5OA 3FKMX 4NS5A 5FE1A 5HQ5A 5EWVA 4BW4A 4A9KA 4Q0OA 4QB3A 5EISA 5CPEA 5ENCA 5A82A 4QR4A 5LKZA 5D3RA 4N4HA 4Z1SA 3AADA 2DVQA 5CU8A 4LZRA 4MR6A 2YDWA 4TS8A 4NUEA 5L96A 4TTEA 5LUUA 5F2PA 3O37A 4QR3A 2H60A 4Q0NA 4QNSA 4CFLA 4YC9A 3ZYUA 5E9MA 4QSUA 4YH4A 5L8UA 4YBSA 5IGNA 5HJCA 5I40A 2YEKA 4IORA 5HFRA 4J3IA 4HBWA 4YYJA 2I7KA 5G4SA 4WIVA 4UYHA 4IR6A 5DYXA 5IGMA 3AQAA 2F6JA 5FE8A 3U5KA 3U5PA 4PTBA 5CUBA 4O74A 5LKXA 3Q2FA 4MEPA 5F62A 4QSSA 4UYGA 5E7DA 5DX4A 5D3TA 3MUKA 5FG5A 5CQ8A 3NXBA 3QZVA 4WHUA 3U5NA 4UIWA 4Z1QA 4NR8A 3LQIA 5F3AA 5D24A 4RVRA 4OGIA 2L85A 4LC2A 5FBXA 5L97A 5CP5A 5FE3A 5KU3A 2OUOA 2NXBA 4J0RA 5FB0A 5CQ5A 2DWWA 3P1EA 3I3JA 5D3HA 5LKTA 2L5EA 3U5JA 5F1LA 3MB3A 4NUDA 5KHMA 3P1DA 5I86A 4O78A 5CQ4A 4A9NA 2DKWA 4CUPA 2R0YA 3LJWA 5EWWA 4A9FA 3RCWA 4CUTA 5CGPA 2RO1A 3GG3A 3K2JA 4QC1A 4UIZA 5DLZA 5ENGA 4ZC9A 3D7CA 1X0JA 1WUMA 2R0SA 5ENJA 4AKNA 5L99A 5JWMA 4NYWA 5I29A 5IGLA 5EWCA 5F61A 4NYVA 3S92A 4TU6A 5I80A 3Q2EA 5E9YA 4Y03A 4QUTA 4PCEA 4YATA 5EGUA 4O75A 5DY7A 4BW3A 4PKLA 5HLSA 4KV4A 4OUFA 5DKDA 5E9IA 4YYDA 4YABA 5CUDA 5LJ1A 5FFYA 4BJXA 4IR4A 4HXLA 5F1HA 4QUUA 2MJVB 3IU6A 2L84A 3UV5A 4Z6IA 5C4QA 4NR5A 4XUAA 4C66A 5D25A 3IU5A 4MR3A 4UYDA 3TLPA 2E7OA 5C87A 5DYAA 4NUCA 5IGKA 2YELA 5FG6A 5G4RA 5D3PA 1EQFA 5BT4A 5ETDA 5IBNA 4HXMA 5FH7A 5DBMA 4QEVA 5CUEA 4YYKA 3UVDA 5D3SA 4A9LA 4NRAA 5EP7A 5EU1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4QSVA 4X2IA 5D3JA 5C7NA 3HMHA 5EV9A 5F63A 4YK0A 5HRWA 3P5OA 3O33A 2E7NA 4YAXA 4QSTA 5AD3A 5AD2A 4NR4A 5CUCA 5HQ6A 4QYLA 3G0LA 5II2A 4LR6A 4HBVA 4J1PA 4UIUA 4YYNA 4NQMA 5HELA 4PY6A 5A81A 1F68A 5HM0A 5EK9A 2D9EA 5DYUA 2DVRA 5I1QA 5H85A 5D26A 4BW1A 2DATA 5CZGA 4QY4A 1JSPB 5AMFA 5ETBA 3D1BA 5CFWA 4PS5A 4C67A 5DFBA 4CUQA 5ENFA 4ZQLA 5II1A 4YYIA 4O7BA 4YY6A 1N72A 5HRXA 5A85A 4LRGA 1PUOA 4N3WA 4HBXA 5I7YA 5A5QA 4A9EA 5DFDA 5COIA 4IR3A 3HMEA 4QC3A 4MR5A 4UIYA 5A5SA 5EM3A 5CTLA 2F6NA 3P1CA 2G4AA 3VKHA 4QZSA 5C85A 4WHWA 3O35A 4NR6A 5TCMA 5L8TA 5EQ1A 4TZ8A 2YEMA 5CS8A 5E73A 4GPJA 4A9HA 5FE2A 5J0DA 1JM4B 4MENA 3U5LA 4A9IA 1WUGA 4NYXA 3ONIA 5H1TA 4BW2A 2YYNA 3JVMA 2RNXA 5A5PA 3MXFA 5DYCA 5A83A 4IOOA 3D1DA 3QZTA 5KTUA 2RS9B 5F5ZA 5FH6A 4QBMA 5I83A 5D7XA 3JVLA 4LZ2A 3JVJA 4IR5A 5E3GA 4UIVA 4LYWA 4O71A 5D3NA 4UITA 4F3IA 5FE4A 3U5MA 4Z93A 5A5RA 5DW1A 5EWDA 4NXJA 4E96A 4MEQA 5E9LA 4NQNA 4O7FA 5ENHA 3UV2A 2RNWA 5HFQA 4YBMA 4TZ2A 4O70A 4CUUA 5EA1A 3QZSA 5CY9A 4CFKA 3O34A 5I89A 2OSSA 4UIXA 4MEOA 5CQTA 4QSWA 4UYEA 4YBTA 4QSXA 4YYHA 5C8GA 5FE0A 5F36A 5BT3A 2EJNA 4YYMA 3LQJA 4YH3A 4N4FA 4J0SA 5E0RA 4Z6HA 3SVHA 5IG6A 5EWHA 4NR7A 3UVWA 5I7XA 4QSQA 4HXOA 3SVFA 5CQ3A 4XY9A 4AKHA 4MR4A 5FE6A 4HBYA 4YY4A 4YADA 5CQ6A 5DLXA 5HCLA 4TQNA 4LDFA 4QSPA 5HRVA 4QEUA 5EPSA 4NR9A 5HENA 5KO4A 2E3KA 4HXNA 4O7CA 4O77A 4O72A 2D82A 5ENBA 4O7AA 2YQDA 5E9VA 3UVXA 5K29A 5EVAA 4OGJA 5CUAA 5EPBA 5FFVA 5FE5A 5F60A 4IOQA 5JI8A 5LVQA 5CUGA 5DW2A 5KTWA 5LJ2A 5DKCA 4O76A 5EPRA 5FH8A 4HXKA 4PCIA 4AI6A 2GRCA 5FG4A 2WP2A 4UYFB 5BT5A 4CURA 4KCXA 4HXSA 4TYLA 4KV1A 4ALHA 4TT2A 5EI4A 5DKHA 3SVGA 4N4IA 5A5NA 5ACYA 5DFCA 5AMEA 1ZS5A 2LSPB 5HQ7A 2RFJA 4QR5A 2R10A 3G0JA 5CRZA 3DWYA 5LVRA 4QYDA 3UW9A 2KTBB 4LYIA 5A7CA 5D0CA 4CL9A 4CUSA 5C89A 2DVVA 3JVKA 5H1UA 4ALGA 2FSAA 2DVSA 5FDZA 3LQHA 4LZSA 5E3DA 2WP1A 5KTXA 4TT4A 2RNYA 4UYFA 5E74A 2OO1A 4DONA 1ZKRA 5FE9A 5LJ0A 5IIDA 2R0VA 1E6IA 2I8NA 4TT6A 5CRMA 4HXPA 5FE7A 4XY8A 5FB1A 3DAIA 3HMFA 2N9GA 4LYSA 3UVYA 4NRCA 3LXJA 4NRBA 4YYGA 5A5OA 5TB6A 3MULA 3P1FA 5E9KA 4XYAA 5HEMA 5ENIA 5F25A 5I88A 3O36A 5EICA 4A9MA 5FFWA 4A9JA 5D3LA 4QEWA 4A9OA 4FLPA 4CLBA 4BHWA 3MB4A 5CQ7A 3S91A 5H1VA 2YW5A 3MQMA 4HXRA 4XUBA 5L98A 5CQAA 4QSRA 2RI7A 4N4GA 4TU4A 5ENEA 3UV4A 5LKUA 4ZW1A 3ERRA 4O7EA 3U5OA 3FKMX 4NS5A 5FE1A 5HQ5A 5EWVA 4BW4A 4A9KA 4Q0OA 4QB3A 5EISA 5CPEA 5ENCA 5A82A 4QR4A 5LKZA 5D3RA 4N4HA 4Z1SA 3AADA 2DVQA 5CU8A 4LZRA 4MR6A 2YDWA 4TS8A 4NUEA 5L96A 4TTEA 5LUUA 5F2PA 3O37A 4QR3A 2H60A 4Q0NA 4QNSA 4CFLA 4YC9A 3ZYUA 5E9MA 4QSUA 4YH4A 5L8UA 4YBSA 5IGNA 5HJCA 5I40A 2YEKA 4IORA 5HFRA 4J3IA 4HBWA 4YYJA 2I7KA 5G4SA 4WIVA 4UYHA 4IR6A 5DYXA 5IGMA 3AQAA 2F6JA 5FE8A 3U5KA 3U5PA 4PTBA 5CUBA 4O74A 5LKXA 3Q2FA 4MEPA 5F62A 4QSSA 4UYGA 5E7DA 5DX4A 5D3TA 3MUKA 5FG5A 5CQ8A 3NXBA 3QZVA 4WHUA 3U5NA 4UIWA 4Z1QA 4NR8A 3LQIA 4AKGA 5F3AA 5D24A 4RVRA 4OGIA 2L85A 4LC2A 5FBXA 5L97A 5CP5A 5FE3A 5KU3A 2OUOA 2NXBA 4J0RA 5FB0A 5CQ5A 2DWWA 3P1EA 3I3JA 5D3HA 5LKTA 2L5EA 3U5JA 5F1LA 3MB3A 4NUDA 5KHMA 3P1DA 5I86A 4O78A 5CQ4A 4A9NA 2DKWA 4CUPA 2R0YA 3LJWA 5EWWA 4A9FA 3RCWA 4CUTA 5CGPA 2RO1A 3GG3A 3K2JA 4QC1A 4UIZA 5DLZA 5ENGA 4ZC9A 3D7CA 1X0JA 1WUMA 2R0SA 5ENJA 4AKNA 5L99A 5JWMA 4NYWA 5I29A 5IGLA 5EWCA 5F61A 4NYVA 3S92A 4TU6A 5I80A 3Q2EA 5E9YA 4Y03A 4QUTA 4PCEA 4YATA 5EGUA 4O75A 5DY7A 4BW3A 4PKLA 5HLSA 4KV4A 4OUFA 5DKDA 5E9IA 4YYDA 4YABA 3VKGA 5CUDA 5LJ1A 5FFYA 4BJXA 4IR4A 4HXLA 5F1HA 4QUUA 2MJVB 3IU6A 2L84A 3UV5A 4Z6IA 5C4QA 4NR5A 4XUAA 4C66A 5D25A 3IU5A 4MR3A 4UYDA 3TLPA 2E7OA 5C87A 5DYAA 4NUCA 5IGKA 2YELA 5FG6A 5G4RA 5D3PA 1EQFA 5BT4A 5ETDA 5IBNA 4HXMA 5FH7A 5DBMA 4QEVA 5CUEA 4YYKA 3UVDA 5D3SA 4A9LA 4AKIA 4NRAA 5EP7A 5EU1A
chains in the Genus database with same CATH topology
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