5I89A

Crystal structure of the bromodomain of human crebbp bound to the benzodiazepinone g02857790
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
KIFKPEELRQALMPTLEALYRQDPESLPFRQPVDPQLLGIPDYFDIVKNPMDLSTIKRKLDTGQYQEPWQYVDDVWLMFNNAWLYNRKTSRVYKFCSKLAEVFEQEIDPVMQSLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Protein binding/inhibitor
molecule keywords CREB-binding protein
publication title Fragment-Based Discovery of a Selective and Cell-Active Benzodiazepinone CBP/EP300 Bromodomain Inhibitor (CPI-637).
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2016-02-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5i89A00
4O7AA 4QSSA 5FFWA 5EA1A 5ENEA 4Q0NA 4J0SA 5ENFA 5EP7A 5FE5A 1WUGA 5A5OA 5A85A 3UV2A 5K29A 5HCLA 4NRBA 4MR3A 4Z6IA 4NUCA 5CQ4A 4CUTA 3ZYUA 5D3NA 4Y03A 4N4IA 4PCIA 5E9LA 3MQMA 5KO4A 5C8GA 2OO1A 4Q0OA 4TU6A 5HFQA 3MUKA 4LZSA 4C66A 4CUPA 5FB1A 3DAIA 4UIWA 2E3KA 5KHMA 3QZSA 4UYGA 3LQHA 4XY8A 5KTWA 4TQNA 1E6IA 5CP5A 5EQ1A 5FDZA 5FE6A 4MENA 3G0JA 5C7NA 4LZ2A 5ACYA 5LKZA 5LJ2A 2YW5A 5ENHA 5CUEA 4CFLA 5IG6A 4YBSA 4QSTA 4IR5A 5EV9A 5F62A 5FE4A 4UYFA 4A9NA 4NQMA 4O7FA 5AD2A 4KV4A 3P1FA 4E96A 4BW2A 5DLZA 4YK0A 5CQ3A 5HELA 2E7OA 4YBMA 4NUDA 5I80A 4LYIA 5COIA 3G0LA 5C87A 3Q2FA 5LJ0A 5FH7A 4NRAA 5HQ7A 5L98A 4YBTA 4NXJA 5E0RA 3LQIA 2DKWA 4YY6A 1N72A 4GPJA 5H1TA 4NYXA 4X2IA 3LQJA 5E73A 5FE2A 5A5QA 3ONIA 4YABA 5DKDA 5D25A 2F6NA 4BJXA 5FE7A 4YYIA 3UV4A 4QSWA 5JI8A 4FLPA 4ZC9A 4PKLA 4ALHA 5HQ6A 2RFJA 4HBXA 5D3PA 4QYDA 5CFWA 5HLSA 5F5ZA 3O37A 5DYAA 4A9LA 4YYHA 5II2A 5EI4A 5TB6A 3RCWA 5F1HA 2DVRA 5J0DA 4IOOA 5HEMA 2DVQA 4QSPA 5EWVA 5BT5A 1X0JA 4HBVA 3Q2EA 5KTXA 5CGPA 4HBWA 4C67A 4TS8A 2R10A 5DFCA 2OSSA 5HRXA 5EU1A 2DWWA 2L85A 5L8TA 5C85A 5A81A 5LKXA 5D3RA 5DBMA 3O36A 4XUAA 5I40A 4J0RA 4O78A 5E9MA 4HXOA 4LYWA 5A7CA 4RVRA 3O33A 4NQNA 4O7EA 2YQDA 2GRCA 4QSXA 4IR4A 4NYWA 4A9IA 5D3TA 5TCMA 2YELA 4YAXA 4YYMA 3AQAA 4QEUA 2RNWA 3U5PA 5HENA 4O72A 2RNXA 5ETBA 4IORA 3UVWA 3LXJA 4UYDA 5CUBA 5CZGA 2I7KA 2YDWA 5ENJA 2R0VA 3SVFA 4YYDA 4O74A 4QB3A 2RS9B 3NXBA 4BW4A 4TT6A 5L8UA 5IIDA 4Z1QA 3SVGA 4O71A 5L96A 5EGUA 5CQ7A 5FE1A 4LR6A 5EPBA 4LZRA 2R0YA 4Z6HA 2LSPB 4CUUA 4CURA 4A9MA 4LYSA 4A9FA 5H1UA 5G4SA 5H85A 5LKUA 4KCXA 4YY4A 5A83A 4HXLA 3IU5A 4PS5A 4YC9A 5HJCA 4CL9A 5FE8A 5LVRA 4NYVA 5DKHA 4MEQA 5E9VA 2NXBA 5FH8A 4QEWA 5FBXA 2L84A 5ENBA 4QSVA 4PY6A 4HXPA 2RNYA 4MEOA 4QSRA 5CQ8A 5F2PA 5D26A 3U5NA 3I3JA 4TU4A 4YYJA 5I7YA 5F3AA 5HM0A 4YATA 3QZTA 4ZQLA 5F60A 5A5SA 5ETDA 4QBMA 5FG6A 5D3SA 3O35A 4O76A 2E7NA 4OGJA 4XUBA 4NR4A 4TYLA 3JVJA 4HXSA 5CQAA 3GG3A 5FFYA 3LJWA 4Z93A 2R0SA 4NR6A 4A9HA 4ALGA 3JVLA 4A9EA 5E3GA 2DVVA 4UIYA 5HFRA 5D7XA 5E7DA 5I29A 4YH4A 4WIVA 5BT4A 5F36A 5EVAA 5H1VA 2DATA 2G4AA 1ZS5A 4UIVA 5DYCA 5L97A 5D3LA 5L99A 4UYFB 5EWDA 2YEKA 3D7CA 4HXMA 3P5OA 4TT4A 5G4RA 2H60A 4O75A 3MULA 5IGMA 3HMHA 5LUUA 5DW1A 5I86A 2I8NA 3MB3A 4LRGA 4A9KA 3AADA 5EWCA 2L5EA 5FG5A 4MR6A 5I7XA 5KTUA 4QC3A 2OUOA 3QZVA 3TLPA 4N3WA 5F25A 5C4QA 2WP1A 5EM3A 4O70A 5D3HA 5I88A 5CQ5A 3MB4A 5DYUA 4QR3A 4YH3A 5IGKA 2KTBB 5CRMA 5DFBA 4UYEA 5A5PA 5LJ1A 5E3DA 5AD3A 5JWMA 1F68A 4LDFA 5E9IA 4O7CA 4QC1A 4QSUA 4QYLA 4CLBA 5CUCA 4O77A 5E74A 3S91A 3P1DA 4A9JA 4YYNA 4UYHA 3DWYA 5IGNA 4MR4A 5D24A 4QUTA 4NR9A 5CUGA 5LVQA 3MXFA 5C89A 3IU6A 5I1QA 3S92A 4WHWA 5DX4A 1JM4B 4HXNA 5HRVA 3HMEA 4QUUA 5A82A 3FKMX 4UIUA 3U5KA 4CFKA 5FH6A 5II1A 4Z1SA 5BT3A 5DYXA 4QR5A 5CQTA 4NUEA 4YYKA 5DKCA 5ENIA 4CUQA 5D0CA 3O34A 5AMEA 5HRWA 3UVXA 4NR7A 3JVMA 3SVHA 3U5JA 4AKNA 4BW1A 4MEPA 2YYNA 5EPRA 5IGLA 5FE0A 4XY9A 5F61A 5A5NA 3U5LA 4IOQA 4QZSA 5EICA 3UVYA 4N4HA 5I89A 2MJVB 5IBNA 5A5RA 5DW2A 5CUAA 5ENCA 2RI7A 4PCEA 5FE9A 4TZ2A 2F6JA 5DFDA 3P1EA 5DLXA 5FFVA 3HMFA 2RO1A 4NRCA 4A9OA 4NS5A 4TT2A 5KU3A 2DVSA 3P1CA 2D9EA 4J3IA 4NR8A 5ENGA 5F1LA 5E9KA 4HXRA 5FB0A 4O7BA 5FG4A 3UV5A 5CY9A 5EISA 5EK9A 5CRZA 4UIZA 3U5OA 3U5MA 4QEVA 4F3IA 4CUSA 5CQ6A 1WUMA 4QSQA 2FSAA 5CPEA 4ZW1A 3JVKA 3UW9A 4LC2A 4IR3A 5CU8A 4J1PA 5AMFA 5F63A 4QR4A 5E9YA 5CUDA 2D82A 4OUFA 1EQFA 5CTLA 4N4FA 5DY7A 4HBYA 5EWHA 5CS8A 4DONA 5I83A 4PTBA 4UITA 2YEMA 3K2JA 5D3JA 4N4GA 1JSPB 5HQ5A 4OGIA 4NR5A 4QNSA 4UIXA 3UVDA 4YADA 4YYGA 4MR5A 2WP2A 2N9GA 4QY4A 5EWWA 5FE3A 4BW3A 5LKTA 4HXKA 4XYAA 4BHWA 4WHUA 4TTEA 4TZ8A 4KV1A 4IR6A 5EPSA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4O7AA 4QSSA 5FFWA 5EA1A 5ENEA 4Q0NA 4J0SA 5ENFA 5EP7A 5FE5A 1WUGA 5A5OA 5A85A 3UV2A 5K29A 5HCLA 4NRBA 4MR3A 4Z6IA 4NUCA 5CQ4A 4CUTA 3ZYUA 5D3NA 4Y03A 4N4IA 4PCIA 5E9LA 3MQMA 5KO4A 5C8GA 2OO1A 4Q0OA 4TU6A 5HFQA 3MUKA 4LZSA 4C66A 4CUPA 5FB1A 3DAIA 4UIWA 2E3KA 5KHMA 3QZSA 4UYGA 3LQHA 4XY8A 5KTWA 4TQNA 1E6IA 5CP5A 5EQ1A 5FDZA 5FE6A 4MENA 3G0JA 5C7NA 4LZ2A 5ACYA 5LKZA 5LJ2A 2YW5A 5ENHA 5CUEA 2EJNA 4CFLA 5IG6A 4YBSA 4QSTA 4IR5A 5EV9A 5F62A 5FE4A 4UYFA 4A9NA 4NQMA 4O7FA 5AD2A 4KV4A 3P1FA 4E96A 4BW2A 5DLZA 4YK0A 5CQ3A 5HELA 2E7OA 4YBMA 4NUDA 5I80A 4LYIA 5COIA 3G0LA 5C87A 3Q2FA 5LJ0A 5FH7A 4NRAA 5HQ7A 5L98A 4YBTA 4NXJA 5E0RA 3LQIA 2DKWA 4YY6A 1N72A 4GPJA 5H1TA 4NYXA 4X2IA 3LQJA 5E73A 5FE2A 5A5QA 3ONIA 3VKGA 4YABA 5DKDA 5D25A 2F6NA 4BJXA 5FE7A 4YYIA 3UV4A 4QSWA 5JI8A 4FLPA 4ZC9A 4PKLA 4ALHA 5HQ6A 2RFJA 4HBXA 5D3PA 4QYDA 5CFWA 5HLSA 5F5ZA 3O37A 5DYAA 4A9LA 4YYHA 5II2A 5EI4A 5TB6A 3RCWA 5F1HA 2DVRA 5J0DA 4IOOA 3ERRA 5HEMA 2DVQA 4QSPA 5EWVA 5BT5A 1X0JA 4HBVA 3Q2EA 5KTXA 5CGPA 4HBWA 4C67A 4TS8A 2R10A 5DFCA 4AKGA 2OSSA 5HRXA 5EU1A 2DWWA 2L85A 5L8TA 5C85A 5A81A 5LKXA 5D3RA 5DBMA 3O36A 4XUAA 5I40A 4J0RA 4O78A 5E9MA 4HXOA 4LYWA 5A7CA 4RVRA 3O33A 4NQNA 4O7EA 2YQDA 3D1DA 2GRCA 4QSXA 3VKHA 4IR4A 4NYWA 4A9IA 5D3TA 5TCMA 2YELA 4YAXA 4YYMA 3AQAA 4QEUA 2RNWA 3U5PA 5HENA 4O72A 2RNXA 5ETBA 4IORA 3UVWA 3LXJA 4UYDA 5CUBA 5CZGA 2I7KA 2YDWA 5ENJA 2R0VA 3SVFA 4YYDA 4O74A 4QB3A 2RS9B 3NXBA 4BW4A 4TT6A 5L8UA 5IIDA 4Z1QA 3SVGA 4O71A 5L96A 5EGUA 3D1BA 5CQ7A 5FE1A 4LR6A 5EPBA 4LZRA 4AKHA 2R0YA 4Z6HA 2LSPB 4CUUA 4CURA 4A9MA 4LYSA 4A9FA 5H1UA 5G4SA 5H85A 5LKUA 4KCXA 4YY4A 5A83A 4HXLA 3IU5A 4PS5A 4YC9A 4AI6A 5HJCA 4CL9A 5FE8A 5LVRA 4NYVA 5DKHA 4MEQA 5E9VA 2NXBA 5FH8A 4QEWA 5FBXA 2L84A 5ENBA 4QSVA 4PY6A 4HXPA 2RNYA 4MEOA 4QSRA 5CQ8A 5F2PA 5D26A 3U5NA 3I3JA 4TU4A 4YYJA 5I7YA 5F3AA 5HM0A 4YATA 3QZTA 4ZQLA 5F60A 5A5SA 5ETDA 4QBMA 5FG6A 5D3SA 3O35A 4O76A 2E7NA 4OGJA 4XUBA 1ZKRA 4NR4A 4TYLA 3JVJA 4HXSA 5CQAA 3GG3A 5FFYA 3LJWA 4Z93A 2R0SA 4NR6A 4A9HA 4ALGA 3JVLA 4A9EA 5E3GA 2DVVA 4UIYA 5HFRA 5D7XA 5E7DA 5I29A 4YH4A 4WIVA 5BT4A 5F36A 5EVAA 5H1VA 2DATA 2G4AA 1ZS5A 4UIVA 5DYCA 5L97A 5D3LA 5L99A 4UYFB 5EWDA 2YEKA 3D7CA 4HXMA 3P5OA 4TT4A 5G4RA 2H60A 4O75A 3MULA 5IGMA 3HMHA 5LUUA 5DW1A 5I86A 2I8NA 3MB3A 4LRGA 4A9KA 3AADA 5EWCA 2L5EA 5FG5A 4MR6A 5I7XA 5KTUA 4QC3A 2OUOA 3QZVA 3TLPA 4N3WA 5F25A 5C4QA 2WP1A 5EM3A 4O70A 5D3HA 5I88A 5CQ5A 3MB4A 5DYUA 4QR3A 4YH3A 5IGKA 2KTBB 5CRMA 5DFBA 4UYEA 5A5PA 5LJ1A 5E3DA 5AD3A 5JWMA 1F68A 4LDFA 5E9IA 4O7CA 4QC1A 4QSUA 4QYLA 4CLBA 5CUCA 4O77A 5E74A 3S91A 3P1DA 4A9JA 4YYNA 4UYHA 3DWYA 5IGNA 4MR4A 5D24A 4QUTA 4NR9A 5CUGA 5LVQA 3MXFA 5C89A 3IU6A 5I1QA 3S92A 1PUOA 4WHWA 5DX4A 1JM4B 4HXNA 5HRVA 3HMEA 4QUUA 5A82A 3FKMX 4UIUA 3U5KA 4CFKA 5FH6A 5II1A 4Z1SA 5BT3A 5DYXA 4QR5A 5CQTA 4NUEA 4YYKA 5DKCA 5ENIA 4CUQA 5D0CA 3O34A 5AMEA 5HRWA 3UVXA 4NR7A 3JVMA 3SVHA 3U5JA 4AKNA 4BW1A 4MEPA 2YYNA 5EPRA 5IGLA 5FE0A 4XY9A 5F61A 5A5NA 3U5LA 4IOQA 4QZSA 5EICA 3UVYA 4N4HA 5I89A 2MJVB 5IBNA 5A5RA 5DW2A 5CUAA 5ENCA 2RI7A 4PCEA 5FE9A 4TZ2A 2F6JA 5DFDA 3P1EA 5DLXA 5FFVA 3HMFA 2RO1A 4NRCA 4A9OA 4NS5A 4TT2A 5KU3A 2DVSA 3P1CA 2D9EA 4J3IA 4NR8A 5ENGA 5F1LA 4AKIA 5E9KA 4HXRA 5FB0A 4O7BA 5FG4A 3UV5A 5CY9A 5EISA 5EK9A 5CRZA 4UIZA 3U5OA 3U5MA 4QEVA 4F3IA 4CUSA 5CQ6A 1WUMA 4QSQA 2FSAA 5CPEA 4ZW1A 3JVKA 3UW9A 4LC2A 4IR3A 5CU8A 4J1PA 5AMFA 5F63A 4QR4A 5E9YA 5CUDA 2D82A 4OUFA 1EQFA 5CTLA 4N4FA 5DY7A 4HBYA 5EWHA 5CS8A 4DONA 5I83A 4PTBA 4UITA 2YEMA 3K2JA 5D3JA 4N4GA 1JSPB 5HQ5A 4OGIA 4NR5A 4QNSA 4UIXA 3UVDA 4YADA 4YYGA 4MR5A 2WP2A 2N9GA 4QY4A 5EWWA 5FE3A 4BW3A 5LKTA 4HXKA 4XYAA 4BHWA 4WHUA 4TTEA 4TZ8A 4KV1A 4IR6A 5EPSA
chains in the Genus database with same CATH topology
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