4CURA

Crystal structure of human baz2b in complex with fragment-3 n09555
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords BROMODOMAIN ADJACENT TO ZINC FINGER DOMAIN PROTEIN 2B
publication title Crystal Structure of Human Baz2B in Complex with Fragment-3 N09553
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 40
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4curA00
5CQ8A 5L96A 1EQFA 4UIYA 5DFCA 3U5OA 2DWWA 2D82A 3MQMA 5DBMA 3QZTA 5DYCA 4TQNA 3S91A 5EP7A 4UIWA 4NR5A 4NRBA 4ZC9A 4UIUA 5F62A 5LJ2A 4N4GA 4N4FA 5KO4A 4QC3A 3P1CA 5DFBA 4QSVA 4UYFB 5IGKA 5ETBA 3UV4A 2RS9B 4TZ2A 4BHWA 4PCEA 5EWWA 4UYFA 3D7CA 4HXLA 4Z6HA 4IORA 4MR3A 5I29A 2R0YA 5FE9A 2DVQA 5D0CA 4YATA 4QC1A 2MJVB 3JVKA 4Q0NA 4XY9A 3UV5A 2YEKA 2YEMA 4TS8A 5FE5A 3O35A 4XUBA 5IGLA 5CQTA 4NRAA 5FE1A 4PCIA 3U5MA 4NYXA 3SVHA 1ZS5A 5JI8A 1E6IA 4YBTA 5ENBA 4UYDA 3JVJA 5DW1A 5E0RA 4A9OA 5A82A 5LJ0A 4HXKA 2RNXA 4J0RA 3UVXA 4IR3A 4HBXA 5FFYA 2GRCA 5E9KA 4UIZA 4Z1QA 4QEVA 4XUAA 5C87A 2I7KA 5KTUA 5CP5A 5IIDA 4TU4A 5LVQA 4BW1A 5C7NA 1F68A 4ALHA 5D3RA 5L8TA 4QSXA 4BJXA 3SVFA 3AQAA 4NR8A 4Z6IA 4LC2A 5DW2A 5EPSA 4AKNA 5CUBA 5AD2A 4O7BA 5BT5A 5LJ1A 4LDFA 5DX4A 5E9VA 5CRZA 5EA1A 5F3AA 4MR6A 5HEMA 3LJWA 4YYNA 5FE6A 4CLBA 4PS5A 5D3NA 5CFWA 4NXJA 4OGIA 5ENFA 3P1FA 4MEPA 4A9IA 5H85A 2L85A 4LZ2A 5ENHA 4J1PA 4QSQA 5IBNA 4QSSA 5DYUA 4O77A 3JVMA 5FH7A 5CUEA 4CUTA 4IR4A 5FG5A 5I7YA 4BW4A 4LZSA 5I80A 4F3IA 1WUMA 4A9HA 3U5PA 2FSAA 5CGPA 4NR6A 4QNSA 5HCLA 5EWDA 3RCWA 4LYSA 2E3KA 2F6NA 4A9EA 3UW9A 4N4HA 5H1VA 4A9MA 4NR9A 5E7DA 5FDZA 4YY6A 4YBMA 5EPBA 4GPJA 3NXBA 4MEQA 4QEWA 4YABA 5CZGA 4QSTA 5ACYA 4LR6A 4TTEA 5CRMA 4IR5A 5AD3A 5CY9A 4NR4A 3GG3A 3ONIA 5CU8A 5II2A 4QR4A 4UYHA 5F60A 3O34A 4A9FA 5CQ7A 5HENA 4XYAA 5EICA 5HQ7A 5IGNA 5HJCA 2OUOA 5LUUA 5E3DA 5CQ3A 4HXMA 4ZW1A 5CQAA 5COIA 1WUGA 5H1UA 5HQ5A 3IU5A 4HXRA 5HELA 4NYWA 4QR3A 1N72A 4XY8A 5L97A 2R10A 5DLZA 5FE3A 5LKTA 4YYHA 5D3SA 5KTWA 5A5RA 3HMHA 5CQ6A 4HXNA 4UYEA 2RNWA 4YK0A 4UITA 5DLXA 5FH8A 5CUGA 2OSSA 5CTLA 5II1A 4Q0OA 5E3GA 5FE7A 4CUPA 4O71A 5EWHA 3LQJA 5ENGA 4A9LA 4J3IA 5FE4A 5LKUA 4CURA 1X0JA 4CUQA 5E9MA 5ENIA 4PTBA 4YYKA 5AMFA 4YYGA 4O78A 5FB1A 4O76A 5EISA 5I89A 4NQMA 4YAXA 5CUAA 3LQIA 3U5LA 5ENJA 5EM3A 4TYLA 4YBSA 5A81A 4HBWA 3FKMX 5D25A 4O72A 4YH3A 5EV9A 3G0LA 4QZSA 3DAIA 5DKCA 3O37A 4PKLA 2DVVA 5A5NA 2DATA 2G4AA 4CL9A 2WP2A 4HXPA 5D24A 5K29A 2NXBA 4O75A 4MENA 5LVRA 3TLPA 4UIXA 3SVGA 5L99A 4QBMA 5HRWA 5A83A 3UV2A 5E9LA 2D9EA 5E73A 3HMFA 4YADA 5KTXA 3LXJA 2RI7A 5EPRA 5TB6A 5G4RA 4E96A 5DYXA 5DY7A 4CUSA 4YYJA 5E74A 5DKDA 5ETDA 5D3PA 4TZ8A 5I40A 1JM4B 4NYVA 3S92A 5DKHA 5A7CA 5F61A 5I1QA 5D3HA 5D3JA 4A9JA 5JWMA 4ALGA 3MB4A 5EU1A 4LRGA 3HMEA 5F36A 4YH4A 4CFLA 2KTBB 4YC9A 2YYNA 4NS5A 5L98A 5HFQA 2RFJA 2RNYA 5F5ZA 3O36A 4KV1A 5G4SA 4NUEA 4NUCA 5A85A 3P5OA 4HXOA 5CUDA 5LKXA 5F1HA 1JSPB 4QR5A 3MB3A 3O33A 5FG4A 4OUFA 4PY6A 4Z1SA 3G0JA 2DVSA 4QYLA 4UYGA 4HBVA 4Z93A 3Q2EA 4O70A 5C85A 4FLPA 4LZRA 4C66A 3LQHA 4CFKA 5HQ6A 4X2IA 5AMEA 5FFVA 2OO1A 5HLSA 5DYAA 2H60A 5L8UA 5HRXA 2YQDA 4TT6A 4Y03A 3DWYA 5KHMA 2LSPB 5KU3A 5CQ5A 4C67A 4QYDA 5ENEA 4N4IA 4YY4A 5A5SA 5HM0A 2RO1A 3I3JA 5A5PA 5EVAA 4NR7A 5FB0A 5F25A 5BT4A 4J0SA 4MEOA 3K2JA 5EK9A 5EWCA 5H1TA 4QEUA 3UVYA 4NRCA 3P1EA 2L84A 5FG6A 4UIVA 3UVWA 4HBYA 3MXFA 5FE0A 4O74A 2DKWA 5E9IA 3AADA 4DONA 5E9YA 5FFWA 5F2PA 5C89A 3P1DA 4IOQA 5D7XA 2YW5A 5ENCA 4YYMA 5FE2A 5BT3A 4LYWA 2N9GA 5I88A 5F1LA 5TCMA 2F6JA 3UVDA 3ZYUA 4QUTA 5CS8A 2R0SA 3U5JA 4WIVA 4A9KA 4BW2A 5EQ1A 4WHUA 4KCXA 5IGMA 5CUCA 5I86A 4QSWA 3IU6A 2E7NA 4CUUA 3U5NA 5EGUA 4MR4A 4O7FA 2YDWA 2I8NA 2WP1A 5DFDA 2YELA 4IOOA 3MUKA 4OGJA 5IG6A 5CQ4A 5HFRA 4O7CA 4LYIA 5F63A 5FH6A 5C4QA 5EI4A 4QB3A 5D3LA 4ZQLA 4O7AA 5FBXA 4QSRA 4QY4A 4N3WA 5D26A 4MR5A 4YYDA 3QZSA 4QUUA 2L5EA 4IR6A 4YYIA 4A9NA 4HXSA 5HRVA 3Q2FA 2E7OA 5EWVA 4WHWA 4NQNA 5CPEA 4QSUA 4QSPA 4KV4A 5J0DA 2DVRA 4TT2A 5A5QA 5FE8A 3U5KA 3QZVA 4O7EA 3JVLA 5D3TA 2R0VA 4NUDA 5C8GA 3MULA 5I7XA 5I83A 5A5OA 4TU6A 4BW3A 4RVRA 4TT4A 5LKZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CQ8A 5L96A 1EQFA 4UIYA 5DFCA 3U5OA 2DWWA 2D82A 3MQMA 5DBMA 3QZTA 5DYCA 4TQNA 3S91A 5EP7A 4UIWA 4NR5A 4NRBA 4ZC9A 4UIUA 5F62A 5LJ2A 4N4GA 4N4FA 5KO4A 4QC3A 3P1CA 5DFBA 4QSVA 4UYFB 5IGKA 5ETBA 3UV4A 2RS9B 4TZ2A 4BHWA 4PCEA 5EWWA 4UYFA 3D7CA 4HXLA 4Z6HA 4IORA 4MR3A 5I29A 2R0YA 5FE9A 2DVQA 5D0CA 4YATA 4QC1A 2MJVB 3JVKA 4Q0NA 4XY9A 3UV5A 2YEKA 2YEMA 4TS8A 5FE5A 3O35A 4XUBA 5IGLA 5CQTA 4NRAA 5FE1A 4PCIA 3U5MA 4NYXA 3SVHA 1ZS5A 5JI8A 1E6IA 4YBTA 5ENBA 4UYDA 3JVJA 5DW1A 5E0RA 4A9OA 5A82A 5LJ0A 4HXKA 2RNXA 4J0RA 3UVXA 4IR3A 4HBXA 5FFYA 2GRCA 5E9KA 4UIZA 4Z1QA 4QEVA 4XUAA 5C87A 2I7KA 5KTUA 5CP5A 5IIDA 4TU4A 5LVQA 4BW1A 5C7NA 1F68A 4ALHA 5D3RA 5L8TA 4QSXA 4BJXA 3SVFA 3AQAA 4NR8A 4Z6IA 4LC2A 5DW2A 5EPSA 4AKNA 5CUBA 5AD2A 4O7BA 5BT5A 5LJ1A 4LDFA 5DX4A 5E9VA 5CRZA 5EA1A 5F3AA 4MR6A 5HEMA 3LJWA 4YYNA 5FE6A 3ERRA 4CLBA 4PS5A 5D3NA 5CFWA 4NXJA 3VKHA 4OGIA 5ENFA 3P1FA 4MEPA 4A9IA 5H85A 2L85A 4LZ2A 5ENHA 4J1PA 4QSQA 5IBNA 4QSSA 5DYUA 4O77A 3JVMA 5FH7A 5CUEA 4CUTA 4IR4A 5FG5A 5I7YA 4BW4A 4LZSA 5I80A 4F3IA 1WUMA 4A9HA 3U5PA 2FSAA 5CGPA 4NR6A 4QNSA 5HCLA 5EWDA 3RCWA 4LYSA 2E3KA 2F6NA 4A9EA 3UW9A 4N4HA 5H1VA 4A9MA 4NR9A 5E7DA 5FDZA 4YY6A 4YBMA 5EPBA 4GPJA 3NXBA 4MEQA 4QEWA 4YABA 5CZGA 4QSTA 5ACYA 4LR6A 4TTEA 5CRMA 4IR5A 5AD3A 5CY9A 4NR4A 3GG3A 3ONIA 5CU8A 5II2A 4QR4A 4UYHA 5F60A 3O34A 4A9FA 5CQ7A 5HENA 4XYAA 5EICA 5HQ7A 5IGNA 5HJCA 2OUOA 5LUUA 5E3DA 5CQ3A 4HXMA 4ZW1A 5CQAA 5COIA 1WUGA 5H1UA 5HQ5A 3IU5A 4HXRA 5HELA 4NYWA 4QR3A 1N72A 4XY8A 5L97A 2R10A 5DLZA 5FE3A 5LKTA 4YYHA 5D3SA 5KTWA 5A5RA 3HMHA 5CQ6A 4HXNA 4UYEA 2RNWA 4YK0A 4UITA 5DLXA 5FH8A 5CUGA 2OSSA 5CTLA 5II1A 4Q0OA 5E3GA 5FE7A 4CUPA 4O71A 5EWHA 3LQJA 5ENGA 4A9LA 4J3IA 5FE4A 5LKUA 4CURA 1X0JA 4CUQA 5E9MA 5ENIA 4PTBA 4YYKA 5AMFA 4YYGA 4O78A 5FB1A 4O76A 5EISA 5I89A 4NQMA 4YAXA 5CUAA 3LQIA 3U5LA 5ENJA 5EM3A 4TYLA 4YBSA 5A81A 4HBWA 3FKMX 5D25A 4O72A 4YH3A 5EV9A 3G0LA 4QZSA 3DAIA 5DKCA 3O37A 4PKLA 2DVVA 5A5NA 2DATA 2G4AA 4CL9A 2WP2A 4HXPA 5D24A 5K29A 2NXBA 4O75A 4AKHA 4MENA 5LVRA 3TLPA 4UIXA 3SVGA 5L99A 4QBMA 5HRWA 5A83A 3UV2A 5E9LA 2D9EA 5E73A 3HMFA 4YADA 5KTXA 3LXJA 2RI7A 5EPRA 5TB6A 5G4RA 4E96A 5DYXA 5DY7A 4CUSA 4YYJA 5E74A 5DKDA 3VKGA 5ETDA 5D3PA 4TZ8A 5I40A 1JM4B 4NYVA 3S92A 5DKHA 5A7CA 5F61A 5I1QA 5D3HA 5D3JA 4A9JA 5JWMA 4ALGA 3MB4A 5EU1A 4LRGA 3HMEA 5F36A 4YH4A 4CFLA 2KTBB 4YC9A 2YYNA 4NS5A 5L98A 5HFQA 2RFJA 2RNYA 5F5ZA 1PUOA 3O36A 4KV1A 5G4SA 4NUEA 4NUCA 5A85A 3P5OA 4HXOA 5CUDA 5LKXA 5F1HA 1JSPB 4QR5A 3MB3A 3O33A 5FG4A 4OUFA 4PY6A 4Z1SA 2EJNA 3G0JA 2DVSA 4QYLA 4UYGA 4HBVA 4Z93A 3Q2EA 4O70A 5C85A 4FLPA 4LZRA 4C66A 3LQHA 4CFKA 5HQ6A 4X2IA 5AMEA 5FFVA 2OO1A 5HLSA 5DYAA 2H60A 5L8UA 5HRXA 2YQDA 3D1DA 4TT6A 4Y03A 3DWYA 5KHMA 3D1BA 2LSPB 5KU3A 5CQ5A 4C67A 4QYDA 5ENEA 4N4IA 4YY4A 5A5SA 5HM0A 2RO1A 3I3JA 5A5PA 5EVAA 4NR7A 5FB0A 5F25A 5BT4A 4J0SA 4MEOA 3K2JA 5EK9A 5EWCA 5H1TA 4QEUA 3UVYA 4NRCA 3P1EA 4AI6A 2L84A 5FG6A 4UIVA 3UVWA 4HBYA 3MXFA 5FE0A 4O74A 2DKWA 5E9IA 3AADA 4DONA 5E9YA 5FFWA 5F2PA 5C89A 3P1DA 4IOQA 5D7XA 2YW5A 5ENCA 4YYMA 5FE2A 1ZKRA 5BT3A 4LYWA 2N9GA 5I88A 5F1LA 5TCMA 2F6JA 3UVDA 3ZYUA 4QUTA 5CS8A 2R0SA 3U5JA 4WIVA 4A9KA 4AKIA 4BW2A 5EQ1A 4WHUA 4KCXA 5IGMA 5CUCA 5I86A 4QSWA 3IU6A 2E7NA 4CUUA 3U5NA 5EGUA 4MR4A 4O7FA 2YDWA 2I8NA 2WP1A 5DFDA 2YELA 4IOOA 3MUKA 4OGJA 5IG6A 5CQ4A 5HFRA 4O7CA 4LYIA 5F63A 5FH6A 5C4QA 5EI4A 4QB3A 5D3LA 4ZQLA 4O7AA 5FBXA 4QSRA 4QY4A 4N3WA 5D26A 4MR5A 4YYDA 3QZSA 4QUUA 2L5EA 4IR6A 4YYIA 4A9NA 4HXSA 5HRVA 3Q2FA 2E7OA 5EWVA 4WHWA 4NQNA 5CPEA 4QSUA 4QSPA 4KV4A 5J0DA 2DVRA 4TT2A 5A5QA 5FE8A 3U5KA 3QZVA 4O7EA 3JVLA 5D3TA 2R0VA 4NUDA 5C8GA 3MULA 5I7XA 5I83A 5A5OA 4TU6A 4BW3A 4RVRA 4TT4A 4AKGA 5LKZA
chains in the Genus database with same CATH topology
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 5CQ8 A;  5L96 A;  1EQF A;  4UIY A;  5DFC A;  3U5O A;  2DWW A;  2D82 A;  3MQM A;  5DBM A;  3QZT A;  5DYC A;  4TQN A;  3S91 A;  5EP7 A;  4UIW A;  4NR5 A;  4NRB A;  4ZC9 A;  4UIU A;  5F62 A;  5LJ2 A;  4N4G A;  4N4F A;  5KO4 A;  4QC3 A;  3P1C A;  5DFB A;  4QSV A;  4UYF B;  5IGK A;  5ETB A;  3UV4 A;  2RS9 B;  4TZ2 A;  4BHW A;  4PCE A;  5EWW A;  4UYF A;  3D7C A;  4HXL A;  4Z6H A;  4IOR A;  4MR3 A;  5I29 A;  2R0Y A;  5FE9 A;  2DVQ A;  5D0C A;  4YAT A;  4QC1 A;  2MJV B;  3JVK A;  4Q0N A;  4XY9 A;  3UV5 A;  2YEK A;  2YEM A;  4TS8 A;  5FE5 A;  3O35 A;  4XUB A;  5IGL A;  5CQT A;  4NRA A;  5FE1 A;  4PCI A;  3U5M A;  4NYX A;  3SVH A;  1ZS5 A;  5JI8 A;  1E6I A;  4YBT A;  5ENB A;  4UYD A;  3JVJ A;  5DW1 A;  5E0R A;  4A9O A;  5A82 A;  5LJ0 A;  4HXK A;  2RNX A;  4J0R A;  3UVX A;  4IR3 A;  4HBX A;  5FFY A;  2GRC A;  5E9K A;  4UIZ A;  4Z1Q A;  4QEV A;  4XUA A;  5C87 A;  2I7K A;  5KTU A;  5CP5 A;  5IID A;  4TU4 A;  5LVQ A;  4BW1 A;  5C7N A;  1F68 A;  4ALH A;  5D3R A;  5L8T A;  4QSX A;  4BJX A;  3SVF A;  3AQA A; 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