4CURA

Crystal structure of human baz2b in complex with fragment-3 n09555
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords BROMODOMAIN ADJACENT TO ZINC FINGER DOMAIN PROTEIN 2B
publication title Crystal Structure of Human Baz2B in Complex with Fragment-3 N09553
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 40
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4curA00
3HMFA 5FE1A 3ZYUA 4TU4A 1JSPB 2GRCA 4UIZA 3UVXA 4TT2A 4CFKA 3NXBA 5FE5A 4LYSA 4YYJA 5G4RA 5II2A 2F6NA 4QYDA 5BT5A 4TS8A 5IGNA 4PKLA 5DW2A 2YEKA 2OSSA 4UYFB 4YATA 4NQNA 3P1DA 3ONIA 3O34A 4N3WA 5L97A 4XUBA 5DY7A 5E0RA 4A9EA 5EWHA 4Z1SA 4HBVA 5FG6A 5KU3A 2D82A 2R0SA 5DFCA 3LJWA 4NYWA 3JVLA 4BHWA 4QB3A 5ENEA 5I80A 5D3JA 1N72A 5DFBA 3MB4A 5E9MA 5D3TA 4A9LA 4YABA 5K29A 5II1A 5A85A 1EQFA 4O7FA 4AKNA 5EPBA 5CUGA 3P1FA 4C66A 4NR9A 2RNXA 4YBTA 5FG4A 4LRGA 4YYMA 5LKUA 5L96A 2MJVB 4TT6A 3SVHA 3JVKA 4QSRA 3U5JA 5KO4A 5CUCA 4N4GA 4O7AA 2I7KA 5LVRA 4A9NA 1E6IA 5CUEA 5CY9A 5L99A 2YDWA 5HRVA 5A7CA 5D3HA 5TB6A 5FE0A 5DYCA 5HRXA 3O35A 5FG5A 4HXLA 4XUAA 5HELA 3U5OA 4HXMA 5FB0A 4QEVA 3JVMA 4N4HA 5FH7A 3Q2EA 5EP7A 5CPEA 3LQHA 2E7OA 4QSSA 5D3NA 5AMEA 3P5OA 4PY6A 5DYXA 4YYHA 5IGMA 4J0RA 4ALGA 5EK9A 4Z6IA 4IORA 5F63A 5IG6A 4CUSA 5L8UA 4J3IA 4Y03A 5C8GA 4HXNA 5CQTA 3I3JA 5FE3A 5EGUA 4E96A 4QNSA 4NR6A 4LZ2A 4NRCA 5HRWA 4YK0A 5LUUA 4J0SA 5F3AA 3LXJA 4OGJA 5HQ5A 4Z93A 3AADA 4CL9A 5FFWA 4NXJA 5FH8A 4YADA 5E7DA 4CUPA 5JI8A 3QZTA 4CUQA 4O72A 4PCEA 3DWYA 3Q2FA 5CS8A 2RI7A 4BJXA 4NRAA 3JVJA 4NR7A 5CRZA 5CU8A 5I89A 3UV2A 5D0CA 5ACYA 4PTBA 4QR4A 2R10A 4QSVA 5A5OA 3AQAA 4XY9A 2L85A 5LJ0A 5FE8A 5DKDA 4ZQLA 5ENIA 5IGLA 3O36A 4IR4A 4YBSA 5H1VA 4CURA 4TYLA 4BW2A 4QC3A 5E9YA 2DWWA 4A9HA 2N9GA 5EA1A 5FE4A 4O70A 5C4QA 3DAIA 5DYUA 4A9MA 4CUTA 5F5ZA 3QZVA 2DVQA 4YH3A 4A9JA 5F2PA 4XY8A 4Z6HA 5J0DA 5FE7A 4A9FA 4YYDA 4UIXA 4X2IA 4YY4A 2R0VA 4A9OA 2DATA 5CQ8A 5FBXA 4Q0OA 5D3SA 2YEMA 3GG3A 4O78A 4HBXA 2I8NA 2YYNA 2DKWA 3P1EA 4NUCA 5HFRA 4UYHA 5CUBA 2RNWA 5A83A 4YYNA 5CTLA 5CQ6A 4LYWA 4BW3A 5ENFA 4QSUA 5HQ7A 5EVAA 3G0JA 3MUKA 4MEQA 4QYLA 5CRMA 5DLXA 4KCXA 4O77A 5ENGA 5EWVA 4NRBA 5A5SA 4O76A 4HXKA 5F61A 4YH4A 5FE9A 5I88A 5EWWA 5G4SA 4LDFA 3UVYA 2WP2A 5D25A 4UIYA 3IU5A 4UYGA 4UYDA 3HMHA 3HMEA 5HENA 5E9LA 4BW1A 5C7NA 5E3GA 5E9IA 2KTBB 5CFWA 3MQMA 5D7XA 5AMFA 2OO1A 4Q0NA 5LJ2A 4QY4A 5E9VA 3LQIA 3SVGA 4TTEA 5D3RA 3MB3A 4QSXA 5CZGA 4LZSA 3TLPA 5EV9A 2LSPB 4QR5A 5DLZA 4WIVA 4A9KA 5I1QA 4UYEA 2RNYA 4Z1QA 5ENCA 3UV4A 5HCLA 4MR3A 2DVSA 4CFLA 4QUTA 5EISA 5HFQA 4QSWA 4NQMA 2F6JA 5E3DA 4O74A 4HXOA 5EWDA 5CUDA 4UITA 5EQ1A 4N4FA 3UVDA 4HBWA 5EICA 4TZ2A 3UV5A 4F3IA 4YY6A 3O33A 4O7BA 5TCMA 4O7CA 5F25A 4TQNA 4QEUA 4KV1A 4YYIA 3UW9A 4KV4A 5LVQA 2YQDA 4QBMA 5ENBA 4QSQA 3U5MA 5HJCA 4NUEA 4HXRA 5D24A 4ZW1A 5EM3A 5F1HA 5F36A 5FH6A 2DVRA 4UIUA 5L98A 5C87A 4NR5A 2FSAA 5I86A 4CLBA 4PS5A 4QZSA 3P1CA 5DKCA 5IIDA 2RFJA 3S91A 4IR3A 4YBMA 3S92A 5C89A 5A81A 3D7CA 4IOQA 4MEOA 5A82A 4UIWA 5BT4A 5D3PA 5A5NA 4N4IA 4O71A 4NYXA 4DONA 4QSPA 5HLSA 4YC9A 4NR4A 5E9KA 2RS9B 3U5KA 5ETDA 3O37A 5I40A 1F68A 5EPSA 5ETBA 4WHUA 5KTXA 4YAXA 4QEWA 5AD3A 4LYIA 4ALHA 4O75A 5E73A 5KTWA 5FE6A 4NS5A 3MXFA 4QC1A 5A5QA 5CP5A 4HXPA 5LKZA 5FE2A 5F60A 3U5PA 5I29A 4IR6A 5FB1A 5L8TA 3SVFA 4OGIA 5EI4A 4O7EA 5F62A 2DVVA 1X0JA 5ENJA 4HXSA 5HM0A 4LC2A 5DYAA 4A9IA 2YELA 4TT4A 5DKHA 3IU6A 3UVWA 4C67A 5DW1A 5F1LA 4OUFA 5CQ4A 5FFVA 2E3KA 4NYVA 3QZSA 4PCIA 5DBMA 4QSTA 4GPJA 4NUDA 4UYFA 2NXBA 5IBNA 5CQ7A 4J1PA 5LKTA 5H1UA 5H85A 3MULA 5KHMA 4MR4A 5CQ5A 2R0YA 4LR6A 4MR5A 2L84A 1ZS5A 2WP1A 5EWCA 2E7NA 4UIVA 3U5LA 4YYKA 5AD2A 3U5NA 4FLPA 2H60A 2YW5A 2G4AA 3K2JA 5LKXA 5I7YA 4TU6A 2D9EA 5A5RA 4ZC9A 5H1TA 4MR6A 5EU1A 5CQAA 4IR5A 5DX4A 3LQJA 5LJ1A 4BW4A 4QR3A 5BT3A 3FKMX 2L5EA 2OUOA 5DFDA 5D26A 1WUMA 5C85A 1JM4B 4NR8A 4RVRA 4WHWA 5HEMA 3G0LA 4XYAA 4YYGA 5I83A 4QUUA 5JWMA 5E74A 3RCWA 4CUUA 5COIA 4LZRA 5ENHA 4MEPA 5FFYA 5FDZA 4TZ8A 5EPRA 5KTUA 5CQ3A 5CGPA 5D3LA 2RO1A 5HQ6A 5I7XA 5A5PA 4HBYA 5IGKA 4MENA 4IOOA 1WUGA 5CUAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HMFA 5FE1A 3ZYUA 4TU4A 1JSPB 2GRCA 4UIZA 3UVXA 4TT2A 4CFKA 3NXBA 5FE5A 4LYSA 4YYJA 5G4RA 5II2A 2F6NA 4QYDA 5BT5A 4TS8A 5IGNA 4PKLA 5DW2A 2YEKA 2OSSA 4UYFB 4YATA 4NQNA 3P1DA 3ONIA 3O34A 4N3WA 5L97A 4XUBA 5DY7A 5E0RA 4A9EA 5EWHA 4Z1SA 4HBVA 5FG6A 5KU3A 2D82A 2R0SA 5DFCA 3LJWA 4NYWA 3JVLA 4BHWA 4QB3A 5ENEA 5I80A 5D3JA 1N72A 5DFBA 3MB4A 5E9MA 5D3TA 4A9LA 4YABA 5K29A 5II1A 5A85A 1EQFA 4O7FA 4AKNA 5EPBA 5CUGA 3P1FA 3VKGA 4C66A 4AI6A 4NR9A 2RNXA 4YBTA 5FG4A 4LRGA 4YYMA 5LKUA 5L96A 2MJVB 4TT6A 3SVHA 3JVKA 4QSRA 3U5JA 5KO4A 5CUCA 4N4GA 4O7AA 2I7KA 5LVRA 4A9NA 1E6IA 5CUEA 5CY9A 5L99A 2YDWA 5HRVA 5A7CA 5D3HA 5TB6A 5FE0A 5DYCA 5HRXA 3O35A 5FG5A 4HXLA 4XUAA 5HELA 3U5OA 4HXMA 5FB0A 4QEVA 3JVMA 4N4HA 5FH7A 3Q2EA 5EP7A 5CPEA 3LQHA 2E7OA 4QSSA 5D3NA 5AMEA 3P5OA 4PY6A 5DYXA 4YYHA 5IGMA 4J0RA 4ALGA 5EK9A 4Z6IA 4IORA 5F63A 5IG6A 4CUSA 5L8UA 4J3IA 4Y03A 5C8GA 4HXNA 5CQTA 3I3JA 5FE3A 5EGUA 4E96A 4QNSA 4NR6A 4LZ2A 4NRCA 5HRWA 4YK0A 5LUUA 4J0SA 5F3AA 3LXJA 4OGJA 5HQ5A 4Z93A 3AADA 4CL9A 5FFWA 4NXJA 5FH8A 4YADA 5E7DA 4CUPA 5JI8A 3QZTA 4CUQA 4O72A 4PCEA 3DWYA 3Q2FA 5CS8A 2RI7A 4BJXA 4NRAA 3JVJA 4NR7A 5CRZA 5CU8A 5I89A 3UV2A 5D0CA 5ACYA 4PTBA 4QR4A 2R10A 4QSVA 5A5OA 3AQAA 4XY9A 2L85A 5LJ0A 5FE8A 5DKDA 4ZQLA 5ENIA 5IGLA 3O36A 4IR4A 4YBSA 5H1VA 4CURA 4TYLA 4BW2A 4QC3A 5E9YA 2DWWA 4A9HA 2N9GA 5EA1A 5FE4A 4O70A 5C4QA 3DAIA 5DYUA 4A9MA 4CUTA 5F5ZA 3QZVA 2DVQA 4YH3A 4A9JA 5F2PA 4XY8A 4Z6HA 5J0DA 5FE7A 4A9FA 4YYDA 4UIXA 4X2IA 4YY4A 2R0VA 4A9OA 2DATA 5CQ8A 5FBXA 4Q0OA 5D3SA 2YEMA 3GG3A 4O78A 3ERRA 4HBXA 2I8NA 2YYNA 2DKWA 3P1EA 4NUCA 5HFRA 4UYHA 5CUBA 2RNWA 5A83A 4YYNA 5CTLA 5CQ6A 4LYWA 4BW3A 5ENFA 4QSUA 5HQ7A 5EVAA 3G0JA 3MUKA 4AKGA 4MEQA 4QYLA 5CRMA 5DLXA 4KCXA 4O77A 5ENGA 5EWVA 4NRBA 5A5SA 4O76A 4HXKA 5F61A 4YH4A 5FE9A 5I88A 5EWWA 5G4SA 4LDFA 3UVYA 2WP2A 5D25A 4UIYA 3IU5A 4UYGA 4UYDA 3HMHA 3HMEA 5HENA 5E9LA 4BW1A 5C7NA 5E3GA 5E9IA 2KTBB 5CFWA 3MQMA 5D7XA 4AKIA 5AMFA 2OO1A 4Q0NA 5LJ2A 4QY4A 5E9VA 1PUOA 3LQIA 3SVGA 4TTEA 5D3RA 3MB3A 4QSXA 5CZGA 4LZSA 3TLPA 5EV9A 2LSPB 4QR5A 5DLZA 4WIVA 4A9KA 5I1QA 4UYEA 2RNYA 4Z1QA 5ENCA 3UV4A 5HCLA 4MR3A 2DVSA 4CFLA 4QUTA 5EISA 5HFQA 4QSWA 4NQMA 2F6JA 5E3DA 4O74A 4HXOA 5EWDA 5CUDA 4UITA 5EQ1A 4N4FA 3UVDA 4HBWA 5EICA 4TZ2A 3UV5A 4F3IA 4YY6A 1ZKRA 3O33A 4O7BA 5TCMA 4O7CA 5F25A 4TQNA 4QEUA 4KV1A 4YYIA 3UW9A 4KV4A 5LVQA 2YQDA 4QBMA 5ENBA 4QSQA 3U5MA 5HJCA 4NUEA 4HXRA 5D24A 4ZW1A 5EM3A 5F1HA 5F36A 5FH6A 2DVRA 4UIUA 5L98A 5C87A 4NR5A 2FSAA 5I86A 4CLBA 4PS5A 4QZSA 3P1CA 5DKCA 5IIDA 2RFJA 3S91A 4IR3A 4YBMA 3S92A 5C89A 5A81A 3D7CA 4IOQA 4MEOA 5A82A 4UIWA 5BT4A 5D3PA 5A5NA 4N4IA 4O71A 3VKHA 4NYXA 4DONA 4QSPA 5HLSA 4YC9A 4NR4A 5E9KA 2RS9B 3U5KA 5ETDA 3O37A 5I40A 1F68A 5EPSA 5ETBA 4WHUA 5KTXA 4YAXA 4QEWA 5AD3A 4LYIA 4ALHA 4O75A 5E73A 5KTWA 5FE6A 4NS5A 3MXFA 4QC1A 5A5QA 5CP5A 4HXPA 5LKZA 5FE2A 5F60A 3U5PA 5I29A 4IR6A 5FB1A 5L8TA 3SVFA 4OGIA 5EI4A 2EJNA 4O7EA 5F62A 2DVVA 1X0JA 5ENJA 4HXSA 3D1BA 5HM0A 4LC2A 5DYAA 4A9IA 2YELA 4TT4A 5DKHA 3IU6A 3UVWA 4C67A 5DW1A 5F1LA 4OUFA 5CQ4A 5FFVA 2E3KA 4NYVA 3QZSA 4PCIA 5DBMA 4QSTA 4GPJA 4NUDA 4UYFA 2NXBA 5IBNA 5CQ7A 4J1PA 5LKTA 5H1UA 5H85A 3MULA 5KHMA 4MR4A 5CQ5A 2R0YA 4LR6A 4MR5A 2L84A 4AKHA 1ZS5A 2WP1A 5EWCA 2E7NA 4UIVA 3U5LA 4YYKA 5AD2A 3U5NA 4FLPA 2H60A 2YW5A 2G4AA 3K2JA 5LKXA 5I7YA 4TU6A 2D9EA 5A5RA 4ZC9A 5H1TA 4MR6A 5EU1A 5CQAA 4IR5A 5DX4A 3LQJA 5LJ1A 4BW4A 4QR3A 5BT3A 3FKMX 2L5EA 2OUOA 5DFDA 5D26A 1WUMA 5C85A 1JM4B 4NR8A 4RVRA 4WHWA 5HEMA 3G0LA 3D1DA 4XYAA 4YYGA 5I83A 4QUUA 5JWMA 5E74A 3RCWA 4CUUA 5COIA 4LZRA 5ENHA 4MEPA 5FFYA 5FDZA 4TZ8A 5EPRA 5KTUA 5CQ3A 5CGPA 5D3LA 2RO1A 5HQ6A 5I7XA 5A5PA 4HBYA 5IGKA 4MENA 4IOOA 1WUGA 5CUAA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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