4CURA

Crystal structure of human baz2b in complex with fragment-3 n09555
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transcription
molecule keywords BROMODOMAIN ADJACENT TO ZINC FINGER DOMAIN PROTEIN 2B
publication title Crystal Structure of Human Baz2B in Complex with Fragment-3 N09553
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 40
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4curA00
4NUCA 2L85A 3MXFA 5FE3A 4ZW1A 4O75A 4MENA 4O78A 5CUDA 4TZ2A 5DBMA 4O7AA 5CUEA 5E9IA 5FBXA 5LKTA 4PY6A 4O7FA 5EGUA 4QSPA 5FE6A 5HEMA 5D3NA 4QSVA 5IGNA 4TQNA 2DVQA 5ENCA 5KTUA 5CQ8A 5EQ1A 5E9KA 5DKDA 4A9MA 4IOQA 5C85A 4WHWA 5ETDA 4UITA 4YYDA 2RFJA 4UYFA 4Z6HA 4MR3A 3SVFA 4A9OA 4Z1SA 5DFDA 5IGKA 5FFWA 5FE0A 5A5SA 4TS8A 4XY8A 4QSSA 5ENJA 3O34A 3UW9A 2DVSA 2R10A 5CQTA 5D7XA 4J0RA 5A7CA 5FE2A 5CFWA 5J0DA 2D82A 4QC3A 4NYXA 5HM0A 1N72A 4YYKA 5CQ3A 4IORA 4BJXA 5FE8A 4PCIA 5BT5A 4KV1A 5A5PA 5A5RA 4J3IA 5F36A 4HXKA 3O36A 3MB3A 4WIVA 5DFCA 3U5NA 4UIVA 3D7CA 5F60A 3K2JA 5C87A 3U5PA 3G0LA 5I89A 4J1PA 5DYUA 4N4FA 5HELA 4MR5A 4YBSA 4QC1A 5H1UA 5EPBA 5C7NA 5DYAA 2RNXA 4CUQA 4UYGA 4KV4A 4UIWA 4ALHA 3HMFA 5EWCA 5EWDA 2RNWA 5DW1A 4QSQA 2RO1A 5I88A 4QSXA 1EQFA 5D3SA 4O77A 5D3HA 5HENA 5II2A 5HQ6A 5DKCA 2I8NA 3P1FA 5LVQA 5EPRA 4J0SA 5DYXA 3O35A 4YYMA 5C89A 2KTBB 5FB0A 5EA1A 3LQJA 4A9FA 5KO4A 5LKZA 3DAIA 5A5NA 4LRGA 5E0RA 4IR5A 4QR3A 3UVXA 4OGJA 4PKLA 4QSUA 5CRZA 5EM3A 5L99A 4NYWA 5CUCA 5KHMA 3NXBA 5ENBA 5A82A 4E96A 4HXSA 4QEVA 3U5LA 4Q0OA 4O76A 4HBWA 5D0CA 5IBNA 4TT6A 3DWYA 4QBMA 1E6IA 5AMFA 4NR5A 5CTLA 4C66A 3JVMA 4MEPA 5I1QA 4IR3A 4TT2A 4TYLA 5HJCA 5F5ZA 4ZQLA 2I7KA 4C67A 5A5OA 1WUGA 5IIDA 2R0VA 2OO1A 5D25A 5FFVA 4BHWA 5ENFA 5AD3A 4XY9A 5EICA 4F3IA 4YK0A 5LUUA 4O7EA 5HCLA 5HFQA 2FSAA 4UIYA 5E3GA 5E7DA 3SVGA 5CU8A 2DKWA 5CS8A 5E9LA 5HQ5A 5DX4A 4QUUA 5FG6A 5FH7A 2N9GA 2YDWA 5CQ7A 2F6NA 5BT3A 5C4QA 3U5JA 5DFBA 4WHUA 4N4GA 5KTXA 4HBXA 5KU3A 5FE1A 4CUSA 5CQ5A 5H85A 5DW2A 4CL9A 3HMEA 3MULA 3QZTA 4QZSA 5K29A 2H60A 4ALGA 4O70A 4YAXA 5KTWA 4CFLA 5BT4A 5DYCA 3U5OA 5D24A 3P1CA 3IU6A 4YH3A 3S92A 4HXOA 5L97A 2WP2A 5II1A 5D3RA 5TB6A 5DLXA 3P5OA 5LKUA 4YYNA 5FE7A 5CRMA 5F62A 3S91A 4UYFB 5I80A 5C8GA 5G4RA 5L98A 2G4AA 5LVRA 4OUFA 4TU4A 4NS5A 5L8UA 5E74A 5EP7A 5A85A 4BW3A 5I40A 3G0JA 5COIA 4LDFA 5CQAA 5FB1A 4QSWA 2L5EA 4QYLA 3P1EA 2E3KA 3QZSA 5HQ7A 5ENIA 3RCWA 3ZYUA 4QUTA 4QB3A 2DWWA 5I7XA 5HRWA 3U5KA 2YEKA 4KCXA 4AKNA 5FFYA 4UIXA 4NQNA 5IGMA 4UYEA 5EI4A 4A9JA 5LJ1A 4NQMA 4XYAA 4HXLA 5E9MA 3LQHA 5HRXA 4NR7A 4MR6A 5A5QA 5CQ6A 4YH4A 5D3LA 5FG5A 4LYIA 4YABA 4YYJA 4TTEA 4CUUA 3O33A 1X0JA 4UIUA 4BW4A 4LYSA 5F25A 5CP5A 5ENEA 5EU1A 3IU5A 4NR9A 4MR4A 5I86A 5FDZA 4LR6A 2NXBA 4TU6A 3AQAA 3UVDA 3HMHA 4IR4A 5HLSA 5LJ0A 4BW2A 4FLPA 5HRVA 4O72A 2YW5A 4MEOA 5EPSA 3SVHA 2R0YA 4RVRA 4N4IA 4A9IA 3UVWA 4NRBA 5ACYA 4TZ8A 2WP1A 4YYGA 3GG3A 4UIZA 4YY6A 5EK9A 1JSPB 4HXRA 4NRAA 4YBTA 5FE4A 3FKMX 4LC2A 4N3WA 5LKXA 1ZS5A 4O7CA 4A9KA 3I3JA 5EV9A 5EVAA 5EISA 2MJVB 4CUPA 4HXPA 4QR4A 4CFKA 2OUOA 5D3TA 5F1LA 3AADA 2OSSA 4O71A 4A9EA 5HFRA 5H1VA 5CUGA 2DVRA 4O7BA 4YYIA 2E7NA 5CPEA 4NXJA 4YYHA 4Z6IA 4QR5A 4OGIA 4LZ2A 4TT4A 5F2PA 3O37A 2RI7A 3MUKA 5JI8A 5E9YA 4MEQA 1WUMA 4Z93A 5CUBA 5ETBA 3UV2A 5DKHA 3TLPA 2LSPB 4A9HA 3P1DA 5AMEA 2F6JA 4XUBA 4Y03A 2YQDA 3UV4A 4O74A 5A81A 4BW1A 4LZRA 4QEWA 4A9LA 4HBYA 5ENHA 4PTBA 1F68A 5H1TA 5F1HA 1JM4B 4CURA 4YC9A 5I29A 4CUTA 5AD2A 2RNYA 5D3PA 5I7YA 5LJ2A 5CGPA 4PS5A 5EWWA 5E9VA 4PCEA 2E7OA 5L8TA 4LZSA 4HXNA 2DATA 2L84A 2RS9B 5DY7A 4YATA 4Z1QA 5CZGA 3JVKA 5IGLA 5JWMA 5CY9A 3Q2FA 2YYNA 3Q2EA 5FH6A 5CUAA 4IR6A 3UVYA 4LYWA 4NR4A 5E3DA 3QZVA 4ZC9A 5TCMA 4QY4A 5I83A 3U5MA 4NRCA 4NR8A 3LJWA 2D9EA 4NUDA 5DLZA 4CLBA 5F61A 5FE9A 3JVLA 4QNSA 5ENGA 5F3AA 3LQIA 5EWVA 2GRCA 5IG6A 4DONA 4QYDA 4NYVA 4GPJA 4YBMA 3MQMA 3ONIA 4XUAA 4A9NA 5D3JA 4YADA 5G4SA 4NUEA 5FE5A 4QEUA 5FG4A 4HBVA 5FH8A 4HXMA 2R0SA 4Q0NA 4QSTA 5CQ4A 3UV5A 4X2IA 4IOOA 5A83A 4NR6A 3MB4A 5EWHA 4UYDA 2YELA 2YEMA 3JVJA 5L96A 2DVVA 4UYHA 5F63A 4YY4A 5D26A 4N4HA 3LXJA 5E73A 4QSRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NUCA 2L85A 3MXFA 5FE3A 4ZW1A 4O75A 4MENA 4O78A 5CUDA 4TZ2A 5DBMA 4O7AA 5CUEA 5E9IA 5FBXA 5LKTA 4PY6A 4O7FA 5EGUA 4QSPA 5FE6A 5HEMA 5D3NA 4QSVA 5IGNA 4TQNA 2DVQA 5ENCA 5KTUA 5CQ8A 5EQ1A 5E9KA 5DKDA 4A9MA 4IOQA 5C85A 4WHWA 5ETDA 4UITA 4YYDA 2RFJA 4UYFA 4Z6HA 4MR3A 2EJNA 3SVFA 4A9OA 4Z1SA 5DFDA 5IGKA 5FFWA 5FE0A 5A5SA 4TS8A 4XY8A 4QSSA 5ENJA 3O34A 3UW9A 2DVSA 2R10A 5CQTA 5D7XA 4J0RA 5A7CA 5FE2A 5CFWA 5J0DA 2D82A 4QC3A 4NYXA 5HM0A 1N72A 4YYKA 5CQ3A 4IORA 4BJXA 5FE8A 4PCIA 5BT5A 4KV1A 5A5PA 5A5RA 4J3IA 5F36A 4HXKA 3O36A 3MB3A 4WIVA 5DFCA 3U5NA 4UIVA 3D7CA 5F60A 3K2JA 5C87A 3U5PA 3G0LA 5I89A 4J1PA 5DYUA 4N4FA 5HELA 4MR5A 4YBSA 4QC1A 5H1UA 5EPBA 5C7NA 5DYAA 2RNXA 4CUQA 4UYGA 4KV4A 4UIWA 4ALHA 3HMFA 5EWCA 5EWDA 2RNWA 5DW1A 4QSQA 2RO1A 5I88A 4QSXA 1EQFA 5D3SA 4O77A 5D3HA 5HENA 5II2A 5HQ6A 5DKCA 2I8NA 3P1FA 5LVQA 5EPRA 4J0SA 5DYXA 3O35A 4YYMA 5C89A 2KTBB 5FB0A 5EA1A 3LQJA 4A9FA 5KO4A 5LKZA 3DAIA 5A5NA 4LRGA 5E0RA 4AKHA 4IR5A 4QR3A 3UVXA 4OGJA 4PKLA 4QSUA 5CRZA 5EM3A 5L99A 4NYWA 5CUCA 5KHMA 3NXBA 5ENBA 5A82A 4E96A 4HXSA 4QEVA 3U5LA 4Q0OA 4O76A 4HBWA 5D0CA 5IBNA 4TT6A 3DWYA 4QBMA 1E6IA 5AMFA 4NR5A 5CTLA 4C66A 3JVMA 4MEPA 5I1QA 4IR3A 4TT2A 4TYLA 5HJCA 1PUOA 5F5ZA 4ZQLA 2I7KA 4C67A 5A5OA 1WUGA 5IIDA 2R0VA 2OO1A 5D25A 5FFVA 4BHWA 5ENFA 5AD3A 4XY9A 5EICA 4F3IA 4YK0A 4AI6A 5LUUA 4O7EA 5HCLA 5HFQA 2FSAA 4UIYA 5E3GA 5E7DA 3SVGA 5CU8A 2DKWA 5CS8A 5E9LA 5HQ5A 5DX4A 4QUUA 5FG6A 5FH7A 2N9GA 2YDWA 5CQ7A 2F6NA 5BT3A 5C4QA 3U5JA 5DFBA 4WHUA 4N4GA 5KTXA 4HBXA 5KU3A 5FE1A 4CUSA 5CQ5A 5H85A 5DW2A 4CL9A 3HMEA 3MULA 3QZTA 4QZSA 5K29A 2H60A 4ALGA 4O70A 4YAXA 5KTWA 4CFLA 5BT4A 5DYCA 3U5OA 5D24A 3P1CA 3IU6A 4YH3A 3S92A 4HXOA 5L97A 2WP2A 5II1A 5D3RA 5TB6A 5DLXA 3P5OA 5LKUA 4YYNA 5FE7A 5CRMA 5F62A 3S91A 4UYFB 5I80A 5C8GA 5G4RA 5L98A 2G4AA 5LVRA 4OUFA 4TU4A 4NS5A 5L8UA 5E74A 5EP7A 5A85A 4BW3A 5I40A 3G0JA 5COIA 4LDFA 5CQAA 5FB1A 4QSWA 2L5EA 4QYLA 3P1EA 2E3KA 3QZSA 5HQ7A 5ENIA 3RCWA 3ZYUA 4QUTA 4QB3A 2DWWA 5I7XA 5HRWA 3D1BA 3U5KA 2YEKA 4KCXA 4AKNA 5FFYA 4UIXA 3D1DA 4NQNA 5IGMA 4UYEA 5EI4A 4A9JA 5LJ1A 4NQMA 4XYAA 4HXLA 5E9MA 3LQHA 5HRXA 4NR7A 4MR6A 5A5QA 5CQ6A 4YH4A 5D3LA 5FG5A 4LYIA 4YABA 4YYJA 4TTEA 3VKHA 4CUUA 3O33A 1X0JA 4UIUA 4BW4A 4LYSA 5F25A 5CP5A 5ENEA 5EU1A 3IU5A 4NR9A 4MR4A 5I86A 5FDZA 4LR6A 2NXBA 4TU6A 3AQAA 3UVDA 3HMHA 4IR4A 5HLSA 5LJ0A 4BW2A 4FLPA 5HRVA 4O72A 2YW5A 4MEOA 5EPSA 3SVHA 2R0YA 4RVRA 4N4IA 4A9IA 3UVWA 4NRBA 5ACYA 4TZ8A 2WP1A 4YYGA 3GG3A 4UIZA 4YY6A 5EK9A 1JSPB 4HXRA 4NRAA 4YBTA 4AKGA 5FE4A 3FKMX 4LC2A 4N3WA 5LKXA 1ZS5A 4O7CA 4A9KA 3I3JA 5EV9A 5EVAA 5EISA 2MJVB 4CUPA 4HXPA 4QR4A 4CFKA 2OUOA 5D3TA 5F1LA 3AADA 2OSSA 4O71A 4A9EA 5HFRA 5H1VA 5CUGA 2DVRA 4O7BA 4YYIA 2E7NA 5CPEA 4NXJA 4YYHA 4Z6IA 4QR5A 4OGIA 4LZ2A 4TT4A 5F2PA 3O37A 2RI7A 3MUKA 5JI8A 5E9YA 4MEQA 1WUMA 4Z93A 5CUBA 5ETBA 3UV2A 5DKHA 3TLPA 2LSPB 4A9HA 3P1DA 5AMEA 2F6JA 4XUBA 4Y03A 2YQDA 3UV4A 4O74A 5A81A 4BW1A 4LZRA 4QEWA 4A9LA 4HBYA 5ENHA 4PTBA 1F68A 5H1TA 5F1HA 1JM4B 4CURA 4YC9A 5I29A 4CUTA 5AD2A 2RNYA 5D3PA 5I7YA 5LJ2A 5CGPA 4PS5A 5EWWA 5E9VA 4PCEA 2E7OA 5L8TA 4LZSA 4HXNA 2DATA 2L84A 2RS9B 5DY7A 4YATA 4Z1QA 5CZGA 3JVKA 5IGLA 5JWMA 5CY9A 3Q2FA 2YYNA 3Q2EA 5FH6A 5CUAA 4IR6A 3UVYA 4LYWA 1ZKRA 4NR4A 3ERRA 5E3DA 3QZVA 4ZC9A 5TCMA 4QY4A 5I83A 3U5MA 4AKIA 4NRCA 4NR8A 3LJWA 2D9EA 4NUDA 5DLZA 4CLBA 5F61A 5FE9A 3JVLA 4QNSA 5ENGA 3VKGA 5F3AA 3LQIA 5EWVA 2GRCA 5IG6A 4DONA 4QYDA 4NYVA 4GPJA 4YBMA 3MQMA 3ONIA 4XUAA 4A9NA 5D3JA 4YADA 5G4SA 4NUEA 5FE5A 4QEUA 5FG4A 4HBVA 5FH8A 4HXMA 2R0SA 4Q0NA 4QSTA 5CQ4A 3UV5A 4X2IA 4IOOA 5A83A 4NR6A 3MB4A 5EWHA 4UYDA 2YELA 2YEMA 3JVJA 5L96A 2DVVA 4UYHA 5F63A 4YY4A 5D26A 4N4HA 3LXJA 5E73A 4QSRA
chains in the Genus database with same CATH topology
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