4YY6A

Crystal structure of brd9 bromodomain bound to a butyryllysine peptide
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
102
structure length
102
Chain Sequence
STPIQQLLEHFLRQLQRKDPHGFFAFPVTDAIAPGYSMIIKHPMDFGTMKDKIVANEYKSVTEFKADFKLMCDNAMTYNRPDTVYYKLAKKILHAGFKMMSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Protein binding
molecule keywords Bromodomain-containing protein 9
publication title A Subset of Human Bromodomains Recognizes Butyryllysine and Crotonyllysine Histone Peptide Modifications.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 36
structure length 102
sequence length 102
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-03-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4yy6A00
2R0YA 2RFJA 4NUDA 5F60A 3LJWA 5C85A 5FE7A 2WP1A 4LR6A 3U5NA 4XUBA 4ALHA 5FB0A 5CGPA 2R0VA 4KV1A 5HELA 4NUCA 4BHWA 5ENCA 2RI7A 5D3TA 2L84A 1X0JA 4IR3A 4QSWA 4QZSA 5FB1A 5FH7A 3Q2EA 5F36A 5DKDA 5HJCA 4CUTA 5ENEA 5E7DA 3TLPA 5FFWA 5CQ6A 5LJ2A 5CUEA 4XUAA 5H1TA 5E3GA 5F5ZA 4FLPA 4YAXA 5CQ8A 5A5SA 5HQ5A 4UYEA 3P1EA 4NXJA 5FE8A 5G4SA 4YC9A 4CLBA 2D82A 4N4HA 5EPSA 5FG5A 3MB4A 5LVRA 4XY8A 4LZ2A 5TB6A 4A9NA 5EK9A 4HBWA 4QB3A 2L85A 4CFKA 4HXOA 5E9VA 5HRWA 5L8UA 4ZC9A 4DONA 5CQ4A 5EWDA 4TU4A 5D3SA 4N4FA 4MR3A 3O37A 4O76A 5LKUA 2F6JA 5HQ6A 3LQHA 5IGKA 4UYGA 4QC1A 3DWYA 5CZGA 5CUGA 5FE4A 3UVXA 1N72A 3P1DA 3LXJA 2DVRA 5EWWA 4YYDA 5ENGA 4NRCA 4HXKA 4O7BA 5F61A 4O7FA 4O7EA 1WUGA 5II1A 1ZS5A 4KCXA 2OSSA 3LQJA 4UITA 5CQTA 5DLXA 5LKTA 5A81A 5FE1A 4J3IA 5CPEA 5C4QA 3AQAA 5CUAA 3K2JA 5FH8A 4AKNA 4TS8A 4UYDA 5E73A 4QR5A 2I7KA 4XY9A 2DATA 5CQ7A 3MUKA 4CUPA 5I89A 4HXRA 5FFVA 5DYAA 2YW5A 3U5OA 2GRCA 4LYSA 4LZRA 5C89A 5A5PA 3FKMX 5LKZA 4NR7A 4YH3A 5D7XA 3ONIA 4QYDA 5IBNA 2OUOA 3IU6A 5J0DA 4YBTA 5L8TA 4MR6A 4CURA 5EA1A 4QY4A 2RNYA 3UV4A 4WHUA 5EGUA 4YYJA 3QZVA 5AD3A 2KTBB 3UV2A 5FE0A 2N9GA 4QSTA 3U5PA 4O75A 4TQNA 5D3HA 5HENA 5DYUA 4YY6A 5HRXA 3NXBA 4RVRA 5HLSA 5JWMA 4NR9A 3U5JA 4OUFA 4PKLA 4X2IA 4O71A 5FG6A 5I7YA 3P1CA 4N4IA 5CS8A 3JVLA 5DFCA 3IU5A 5DY7A 5EU1A 4N4GA 5DKHA 4Z93A 3UV5A 2DVQA 5D25A 2OO1A 5IGLA 5EVAA 2LSPB 3QZSA 4LZSA 4YH4A 4N3WA 4UIVA 4YADA 5EWCA 4UIUA 5F2PA 4O7AA 5A85A 4TU6A 5LUUA 2E7OA 4HBXA 2L5EA 5ENHA 5EWVA 4IORA 3P5OA 4J0SA 5AD2A 4O70A 4HBYA 4MEPA 4F3IA 5FE9A 4CUUA 5A5OA 5A83A 4QR3A 4QUUA 5FBXA 4UIYA 4IR5A 4NR4A 4A9FA 2YYNA 5EISA 4HXPA 4PTBA 5FE5A 5FH6A 4MEOA 5E0RA 2NXBA 4A9JA 4YABA 3JVJA 3UVDA 5BT4A 5HQ7A 2YEKA 3MB3A 1JSPB 5CU8A 1EQFA 5EQ1A 4PCIA 5E3DA 5FE3A 4Q0OA 4NR5A 4YY4A 5EPBA 4ZW1A 3P1FA 4UIWA 4NUEA 2DVSA 2YEMA 4HXMA 4MEQA 5ENBA 2E7NA 4WHWA 2FSAA 5HFQA 2RNXA 3U5MA 4WIVA 4OGIA 3U5KA 5CUDA 5F1LA 2R0SA 4QUTA 5DW1A 4Y03A 5A5QA 2RNWA 4PY6A 3MXFA 5FDZA 4YYMA 4XYAA 5F62A 5D3RA 4Z1QA 3ZYUA 2MJVB 4LYIA 5D3NA 4A9HA 4CFLA 4E96A 5CRMA 3LQIA 4YBSA 5FE2A 4LC2A 5DKCA 1E6IA 2YQDA 5C8GA 4HBVA 4QEUA 3HMEA 5H1VA 4QSQA 3JVMA 5HM0A 5KTXA 3Q2FA 4UIXA 5HFRA 4QSXA 5IGNA 3QZTA 5KTWA 4TYLA 4HXLA 3SVGA 5L99A 5E9KA 5L97A 5H85A 4YK0A 5DLZA 4HXNA 4QNSA 5ETBA 5A7CA 5LJ0A 5EWHA 4CL9A 5CTLA 4IOOA 5CFWA 5II2A 3O35A 4YYGA 5DFDA 4BW4A 4A9OA 4PS5A 5D24A 3RCWA 5G4RA 2WP2A 3HMHA 5EI4A 4C66A 5ENFA 5F1HA 4O72A 4QSPA 3UVYA 5BT5A 5HRVA 5E74A 4J1PA 4LYWA 5C7NA 3U5LA 4BJXA 4QYLA 5I80A 3O33A 4UIZA 4Z6HA 2DKWA 4O7CA 4QEWA 5H1UA 5FFYA 4LRGA 5DX4A 2RS9B 5AMFA 5I29A 4Q0NA 4TT2A 5D3PA 5IG6A 4A9IA 3AADA 5EICA 3D7CA 4YATA 5LKXA 4NRBA 5ENJA 5EV9A 4NR6A 4NS5A 4A9LA 5IGMA 5JI8A 3I3JA 4TZ2A 5F63A 5L98A 4YYHA 2I8NA 2YDWA 4YYKA 5C87A 5LVQA 4O74A 4NR8A 5E9MA 4YBMA 5CY9A 4UYFB 4IR4A 4A9KA 4GPJA 5HCLA 5E9LA 5DFBA 5CUCA 5I7XA 4NYXA 3G0JA 5F3AA 5I86A 5D3LA 5COIA 4QC3A 5L96A 4HXSA 4A9EA 4UYFA 3GG3A 5D3JA 4BW1A 4NRAA 4UYHA 4TTEA 4Z1SA 5AMEA 5ACYA 5KTUA 5D26A 5E9IA 5I88A 3HMFA 5KU3A 4MENA 2R10A 5F25A 5HEMA 3DAIA 4PCEA 5CQ3A 4BW2A 5A5NA 3O34A 4YYIA 4MR4A 4NYWA 4CUSA 5I83A 5TCMA 2G4AA 5ETDA 4QSRA 4ALGA 3S91A 5ENIA 5CQ5A 5LJ1A 3JVKA 3S92A 2D9EA 4TT6A 5FE6A 4IR6A 4QR4A 3SVFA 5K29A 4J0RA 1WUMA 4IOQA 1F68A 2DVVA 2H60A 4QEVA 4TT4A 3MULA 5EP7A 3G0LA 4NYVA 1JM4B 5I40A 2DWWA 4O77A 5EPRA 4NQMA 5FG4A 4YYNA 5BT3A 2YELA 5DW2A 4MR5A 3SVHA 2RO1A 4NQNA 4C67A 5DYCA 4A9MA 5A5RA 3UVWA 5A82A 4LDFA 4CUQA 4TZ8A 5DBMA 4KV4A 5CP5A 3UW9A 4OGJA 5D0CA 4BW3A 5IIDA 5EM3A 2E3KA 4Z6IA 5I1QA 4QSUA 2F6NA 4QSVA 4QSSA 5CQAA 3MQMA 5CRZA 5DYXA 4QBMA 5KO4A 4ZQLA 3O36A 5KHMA 5CUBA 4O78A 5E9YA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2R0YA 2RFJA 4NUDA 5F60A 4AI6A 3LJWA 5C85A 5FE7A 2WP1A 4LR6A 3U5NA 4XUBA 4ALHA 5FB0A 5CGPA 2R0VA 4KV1A 5HELA 4NUCA 4BHWA 5ENCA 2RI7A 5D3TA 2L84A 1X0JA 4IR3A 4QSWA 4QZSA 5FB1A 5FH7A 3Q2EA 5F36A 5DKDA 5HJCA 4CUTA 5ENEA 5E7DA 3TLPA 5FFWA 5CQ6A 5LJ2A 5CUEA 4XUAA 5H1TA 5E3GA 5F5ZA 4FLPA 4YAXA 5CQ8A 5A5SA 5HQ5A 4UYEA 3P1EA 4NXJA 5FE8A 1PUOA 5G4SA 4YC9A 4CLBA 2D82A 4N4HA 5EPSA 5FG5A 3MB4A 5LVRA 4XY8A 4LZ2A 5TB6A 4A9NA 5EK9A 4HBWA 4QB3A 2L85A 4CFKA 4HXOA 5E9VA 5HRWA 5L8UA 4ZC9A 4DONA 5CQ4A 5EWDA 4TU4A 5D3SA 4N4FA 4MR3A 3O37A 4O76A 5LKUA 2F6JA 5HQ6A 3LQHA 5IGKA 4UYGA 4QC1A 3DWYA 5CZGA 5CUGA 5FE4A 3UVXA 1N72A 3P1DA 3LXJA 2DVRA 5EWWA 4YYDA 5ENGA 4NRCA 4HXKA 4O7BA 5F61A 4O7FA 4O7EA 1WUGA 5II1A 1ZS5A 4KCXA 2OSSA 3LQJA 4UITA 5CQTA 5DLXA 5LKTA 5A81A 5FE1A 4J3IA 5CPEA 5C4QA 3AQAA 5CUAA 3K2JA 5FH8A 4AKNA 4TS8A 4UYDA 5E73A 4QR5A 2I7KA 4XY9A 2DATA 5CQ7A 3MUKA 4CUPA 5I89A 4HXRA 5FFVA 5DYAA 2YW5A 3U5OA 4AKIA 2GRCA 4LYSA 4LZRA 5C89A 5A5PA 3FKMX 5LKZA 4NR7A 4YH3A 5D7XA 3ONIA 4QYDA 5IBNA 2OUOA 3IU6A 5J0DA 4YBTA 5L8TA 4MR6A 4CURA 5EA1A 4QY4A 2RNYA 3UV4A 4WHUA 5EGUA 4YYJA 3QZVA 5AD3A 2KTBB 3UV2A 5FE0A 2N9GA 4QSTA 3U5PA 4O75A 4TQNA 5D3HA 5HENA 5DYUA 4YY6A 5HRXA 3NXBA 4RVRA 5HLSA 5JWMA 4NR9A 3U5JA 4OUFA 4PKLA 4X2IA 4O71A 5FG6A 5I7YA 3P1CA 4N4IA 5CS8A 3JVLA 5DFCA 3IU5A 5DY7A 5EU1A 4N4GA 5DKHA 4Z93A 3UV5A 2DVQA 5D25A 2OO1A 5IGLA 5EVAA 2LSPB 3QZSA 4LZSA 4YH4A 4N3WA 4UIVA 4YADA 5EWCA 4UIUA 5F2PA 4O7AA 5A85A 4TU6A 5LUUA 2E7OA 4HBXA 2L5EA 5ENHA 5EWVA 4IORA 3P5OA 4J0SA 5AD2A 4O70A 4HBYA 4MEPA 4F3IA 5FE9A 4CUUA 5A5OA 5A83A 4QR3A 4QUUA 5FBXA 4UIYA 4IR5A 4NR4A 4A9FA 2YYNA 3VKGA 5EISA 4HXPA 4PTBA 5FE5A 5FH6A 4MEOA 5E0RA 2NXBA 4A9JA 4YABA 3JVJA 3UVDA 5BT4A 5HQ7A 2YEKA 3MB3A 3D1DA 1JSPB 5CU8A 1EQFA 5EQ1A 4PCIA 5E3DA 5FE3A 4Q0OA 4NR5A 4YY4A 5EPBA 4ZW1A 3P1FA 4UIWA 4NUEA 2DVSA 2YEMA 4HXMA 4MEQA 5ENBA 2E7NA 4WHWA 2FSAA 5HFQA 2RNXA 3U5MA 4WIVA 4OGIA 3U5KA 5CUDA 5F1LA 2R0SA 4QUTA 5DW1A 4Y03A 5A5QA 2RNWA 2EJNA 4PY6A 3MXFA 5FDZA 4YYMA 4XYAA 5F62A 5D3RA 4Z1QA 3ZYUA 2MJVB 4LYIA 5D3NA 4A9HA 4CFLA 4E96A 5CRMA 3LQIA 4YBSA 5FE2A 4LC2A 5DKCA 1E6IA 2YQDA 5C8GA 4HBVA 4QEUA 3HMEA 5H1VA 4QSQA 3JVMA 5HM0A 5KTXA 3Q2FA 4UIXA 5HFRA 4QSXA 5IGNA 3QZTA 5KTWA 4TYLA 4HXLA 3SVGA 5L99A 5E9KA 5L97A 5H85A 4YK0A 5DLZA 4HXNA 4QNSA 5ETBA 5A7CA 3VKHA 5LJ0A 5EWHA 4CL9A 5CTLA 4IOOA 5CFWA 5II2A 3O35A 4YYGA 5DFDA 4BW4A 4A9OA 4PS5A 5D24A 3RCWA 5G4RA 2WP2A 3D1BA 3HMHA 5EI4A 4C66A 5ENFA 5F1HA 4O72A 4QSPA 3UVYA 5BT5A 5HRVA 5E74A 4J1PA 4LYWA 5C7NA 3U5LA 4BJXA 4QYLA 5I80A 3O33A 4UIZA 4Z6HA 2DKWA 4O7CA 4QEWA 5H1UA 4AKHA 5FFYA 4LRGA 5DX4A 2RS9B 5AMFA 5I29A 4Q0NA 4TT2A 5D3PA 5IG6A 4A9IA 3AADA 5EICA 3D7CA 4YATA 5LKXA 4NRBA 5ENJA 5EV9A 4NR6A 4NS5A 4A9LA 5IGMA 5JI8A 3I3JA 4TZ2A 5F63A 5L98A 4YYHA 2I8NA 2YDWA 4YYKA 5C87A 5LVQA 4O74A 4NR8A 5E9MA 4YBMA 5CY9A 4UYFB 4IR4A 4A9KA 4GPJA 5HCLA 4AKGA 5E9LA 5DFBA 5CUCA 5I7XA 4NYXA 3G0JA 5F3AA 5I86A 5D3LA 5COIA 1ZKRA 4QC3A 5L96A 4HXSA 4A9EA 4UYFA 3GG3A 5D3JA 4BW1A 4NRAA 4UYHA 4TTEA 4Z1SA 5AMEA 5ACYA 5KTUA 5D26A 5E9IA 5I88A 3HMFA 5KU3A 4MENA 2R10A 5F25A 5HEMA 3DAIA 4PCEA 5CQ3A 4BW2A 5A5NA 3O34A 4YYIA 4MR4A 4NYWA 4CUSA 5I83A 5TCMA 2G4AA 5ETDA 4QSRA 4ALGA 3S91A 5ENIA 5CQ5A 5LJ1A 3JVKA 3S92A 2D9EA 4TT6A 5FE6A 4IR6A 4QR4A 3SVFA 5K29A 4J0RA 1WUMA 4IOQA 1F68A 2DVVA 2H60A 4QEVA 4TT4A 3MULA 5EP7A 3G0LA 4NYVA 1JM4B 5I40A 2DWWA 4O77A 5EPRA 4NQMA 5FG4A 4YYNA 5BT3A 2YELA 5DW2A 4MR5A 3SVHA 2RO1A 4NQNA 4C67A 5DYCA 4A9MA 5A5RA 3ERRA 3UVWA 5A82A 4LDFA 4CUQA 4TZ8A 5DBMA 4KV4A 5CP5A 3UW9A 4OGJA 5D0CA 4BW3A 5IIDA 5EM3A 2E3KA 4Z6IA 5I1QA 4QSUA 2F6NA 4QSVA 4QSSA 5CQAA 3MQMA 5CRZA 5DYXA 4QBMA 5KO4A 4ZQLA 3O36A 5KHMA 5CUBA 4O78A 5E9YA
chains in the Genus database with same CATH topology
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