5D3SA

First bromodomain of brd4 bound to inhibitor xd44
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
125
structure length
125
Chain Sequence
MNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title 4-Acyl Pyrrole Derivatives Yield Novel Vectors for Designing Inhibitors of the Acetyl-Lysine Recognition Site of BRD4(1).
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 43
structure length 125
sequence length 125
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5d3sA01
4PCIA 5K29A 4HXMA 4CUQA 3JVMA 4UIVA 2F6NA 5E9YA 2R0VA 5CS8A 5F3AA 4ALHA 5DYAA 4UYGA 4QZSA 4RVRA 2RFJA 2DVQA 4HXSA 5FE8A 3Q2FA 4XUBA 4Z1SA 2LSPB 4QUUA 5FBXA 2R0SA 5A5NA 4TZ8A 5D3JA 4ZQLA 2YYNA 3QZVA 3UV2A 4Z6HA 4TQNA 4YYIA 5FFWA 4O71A 5HFRA 2I7KA 5HRXA 5HFQA 4X2IA 4HBYA 5DBMA 1EQFA 3IU6A 4YYNA 5DX4A 4QYDA 5KHMA 3U5LA 4O7AA 5D24A 4Q0NA 4YY6A 5I7XA 1JM4B 4MR4A 4PS5A 4QSXA 2D82A 4NR8A 3FKMX 3U5JA 3AADA 4IOQA 2YEMA 3P5OA 5DW2A 5E7DA 4A9OA 4NUDA 5DFCA 3LJWA 5A5SA 4ZW1A 5EWDA 5D25A 5BT4A 2OO1A 4LYWA 2L84A 2DKWA 3I3JA 3O37A 4YYKA 4NR4A 4A9MA 4BHWA 3QZSA 3U5NA 2KTBB 5J0DA 5II2A 5F5ZA 5DYCA 3AQAA 3JVJA 4QSRA 5KO4A 4O7EA 4A9LA 4MEPA 5DLXA 5F1LA 5C85A 4A9HA 5E3GA 3DAIA 2R10A 5DFDA 5E0RA 4A9KA 5HLSA 5FE3A 5I86A 3JVLA 4LDFA 5C89A 5LKTA 4KCXA 5A85A 2RNYA 3MULA 5EA1A 5IGNA 5KU3A 3O35A 5I80A 4PTBA 5CPEA 5F2PA 2RNXA 4O76A 5CUBA 3QZTA 3HMHA 5EWWA 5ACYA 5E3DA 4C67A 5G4SA 5ENBA 5AMFA 5E9MA 4HXLA 4PKLA 5CQTA 2D9EA 4MR6A 5EI4A 5EV9A 5KTXA 4HBVA 4A9JA 4KV4A 2YW5A 4HXNA 5D3NA 5DW1A 4O70A 5C8GA 3P1CA 4OGJA 3ZYUA 4QSVA 5TCMA 4LZSA 3LXJA 4O7CA 4QNSA 5EU1A 5H85A 2I8NA 4N4IA 4BJXA 4HXKA 5CQ5A 4QUTA 5E73A 1X0JA 5LJ1A 5G4RA 3UVXA 4O74A 5FH8A 4CURA 5FH6A 4TYLA 2DVVA 5I40A 4TT4A 4QC3A 4QEUA 4NR7A 1JSPB 4O75A 3SVFA 3UV5A 5HM0A 4YH4A 3LQIA 5FE2A 3UVWA 5FE7A 4NR6A 5A7CA 5ENIA 5I7YA 5CZGA 5HJCA 4YYMA 5IIDA 2L5EA 5FB0A 4YYDA 4N3WA 3G0JA 4Z1QA 5AD2A 5E74A 5JWMA 4O78A 5CQ6A 3TLPA 1WUGA 1WUMA 5IG6A 5HCLA 5H1VA 4NQMA 2RNWA 4QSUA 5DKCA 5CGPA 4J0SA 3U5PA 4HXPA 5FFYA 5EQ1A 3GG3A 5EVAA 2RI7A 4QSWA 4IR3A 1ZS5A 4IR4A 5CUEA 1E6IA 4YBTA 4YBMA 5EK9A 5ENFA 5CP5A 4CL9A 4HBWA 5EPRA 5CQAA 5COIA 3O36A 3RCWA 4UIYA 5FE6A 5H1UA 1F68A 5I83A 2OSSA 5EP7A 5IBNA 2G4AA 5D3RA 4QBMA 2FSAA 2RS9B 4TU6A 3NXBA 4CFLA 5FG4A 3UVDA 4CUUA 4WHWA 5I29A 4BW3A 5DKDA 4IORA 4LZRA 3P1DA 4OUFA 4A9EA 4N4HA 5FE4A 2E3KA 5DKHA 5HRWA 4XYAA 4LYIA 4LZ2A 5DYXA 4NRBA 4YBSA 5C4QA 3O34A 5LKZA 5C7NA 5CY9A 4QB3A 4WHUA 5IGLA 2NXBA 5D0CA 4XY8A 4YYJA 5CU8A 5D3SA 3SVHA 5D3PA 4HXOA 3JVKA 4N4GA 5LVRA 3MQMA 2L85A 4HXRA 3S92A 5FH7A 5EGUA 2MJVB 3K2JA 4UIUA 4N4FA 5FE1A 4MR3A 2YELA 3HMEA 3MUKA 5ENCA 2GRCA 4CUSA 4YABA 4HBXA 3D7CA 4DONA 5LKXA 2YEKA 4UYFB 3UVYA 3Q2EA 5CQ8A 3MXFA 5F62A 4ZC9A 3U5MA 5A83A 3LQHA 3MB4A 5LJ0A 5E9LA 5LKUA 5EICA 4CUPA 4IR5A 5A81A 5HQ7A 5CUDA 4UIXA 5H1TA 4BW2A 5ENHA 5D3TA 5A5RA 5LUUA 4QSSA 5KTWA 5F60A 4TTEA 4QSPA 5I1QA 4QSTA 5CUGA 4QR5A 4KV1A 5L96A 3SVGA 5CTLA 1N72A 5FG6A 5CFWA 4TU4A 5D3HA 4OGIA 4UIZA 5FE5A 3G0LA 5CRMA 2WP1A 5HRVA 4MEQA 4NYXA 4XUAA 5E9KA 5DLZA 5TB6A 4E96A 3U5OA 5EISA 4C66A 5AD3A 4TZ2A 4YATA 4LR6A 4A9NA 5HQ5A 3HMFA 5D3LA 5I89A 4MR5A 4QYLA 4QEWA 5L8UA 4LC2A 4O72A 5JI8A 5L99A 5CQ4A 4PCEA 5FE9A 5E9VA 4TT2A 5ENGA 4NYVA 5FFVA 4UYDA 2N9GA 4CUTA 4NQNA 3P1FA 5FG5A 4GPJA 2E7NA 5EWHA 4F3IA 4Z93A 5L98A 3UV4A 5DYUA 5A82A 5F63A 5II1A 4UITA 2YQDA 5E9IA 2H60A 5DFBA 5D7XA 4TT6A 2E7OA 4CLBA 5F25A 5IGMA 2DVSA 4NR9A 4YK0A 3O33A 5F61A 4YY4A 2RO1A 4NRCA 5ETBA 4A9IA 3ONIA 4NR5A 2F6JA 4Q0OA 5D26A 4O7FA 5HELA 5C87A 4QR3A 4QR4A 4MEOA 5CQ3A 3P1EA 4XY9A 4NXJA 5EPSA 4NYWA 5LVQA 3IU5A 5IGKA 2DVRA 4FLPA 4IR6A 4J3IA 4LYSA 4PY6A 4UYHA 5EPBA 4LRGA 5L97A 5CRZA 2OUOA 4J0RA 2DATA 4O7BA 5FDZA 4AKNA 4QY4A 4J1PA 4CFKA 4A9FA 4QSQA 5BT5A 3MB3A 5KTUA 3U5KA 4O77A 3LQJA 4NUEA 3UW9A 4TS8A 5AMEA 5EWCA 5A5PA 5ENJA 5BT3A 4YC9A 4IOOA 4UYEA 5FE0A 2R0YA 5FB1A 5EWVA 3S91A 4NRAA 2YDWA 4BW4A 5EM3A 4MENA 4WIVA 4YYGA 5A5OA 5F1HA 5LJ2A 4BW1A 3DWYA 5HEMA 5CUAA 5CUCA 5ETDA 4QEVA 4YYHA 4NUCA 5A5QA 5CQ7A 4NS5A 5DY7A 2WP2A 4QC1A 5F36A 4UIWA 5ENEA 4YAXA 5HENA 2DWWA 5HQ6A 4Z6IA 5L8TA 4YADA 4ALGA 4UYFA 4Y03A 4YH3A 5I88A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PCIA 5K29A 4HXMA 4CUQA 3JVMA 4UIVA 2F6NA 5E9YA 2R0VA 5CS8A 5F3AA 4ALHA 5DYAA 4UYGA 4QZSA 4RVRA 2RFJA 2DVQA 4HXSA 5FE8A 3Q2FA 4XUBA 4Z1SA 2LSPB 4QUUA 5FBXA 2R0SA 5A5NA 4TZ8A 5D3JA 4ZQLA 2YYNA 3QZVA 3UV2A 4Z6HA 4TQNA 4YYIA 5FFWA 4O71A 5HFRA 2I7KA 5HRXA 5HFQA 4X2IA 1PUOA 4HBYA 5DBMA 1EQFA 3IU6A 4YYNA 5DX4A 4QYDA 5KHMA 3U5LA 4O7AA 5D24A 4Q0NA 4YY6A 1ZKRA 5I7XA 1JM4B 4MR4A 4PS5A 4QSXA 2D82A 4NR8A 3FKMX 3U5JA 3AADA 4IOQA 2YEMA 3P5OA 5DW2A 5E7DA 4A9OA 4NUDA 5DFCA 3LJWA 5A5SA 4ZW1A 5EWDA 5D25A 5BT4A 2OO1A 4LYWA 2L84A 2DKWA 3I3JA 3O37A 4YYKA 4NR4A 4A9MA 4BHWA 3QZSA 3U5NA 2KTBB 5J0DA 5II2A 5F5ZA 5DYCA 3AQAA 3JVJA 4QSRA 5KO4A 4O7EA 4A9LA 4MEPA 5DLXA 5F1LA 5C85A 4A9HA 5E3GA 3DAIA 2R10A 5DFDA 5E0RA 4A9KA 5HLSA 5FE3A 5I86A 3JVLA 4LDFA 5C89A 5LKTA 4KCXA 5A85A 2RNYA 3MULA 5EA1A 5IGNA 5KU3A 3O35A 5I80A 4PTBA 5CPEA 5F2PA 2RNXA 4O76A 5CUBA 3QZTA 3HMHA 5EWWA 5ACYA 5E3DA 4C67A 5G4SA 5ENBA 5AMFA 5E9MA 4HXLA 4PKLA 5CQTA 2D9EA 4MR6A 5EI4A 5EV9A 5KTXA 4HBVA 4A9JA 3ERRA 2YW5A 4HXNA 4KV4A 5D3NA 5DW1A 4O70A 5C8GA 3P1CA 4OGJA 3ZYUA 3VKGA 4QSVA 5TCMA 4LZSA 3LXJA 4O7CA 4QNSA 5EU1A 5H85A 2I8NA 4N4IA 4BJXA 4HXKA 5CQ5A 4QUTA 5E73A 1X0JA 5LJ1A 5G4RA 3UVXA 4O74A 5FH8A 4CURA 5FH6A 4TYLA 2DVVA 5I40A 4TT4A 4QC3A 4QEUA 4NR7A 1JSPB 4O75A 3SVFA 3UV5A 5HM0A 4YH4A 3LQIA 5FE2A 3UVWA 5FE7A 4NR6A 5A7CA 5ENIA 5I7YA 5CZGA 5HJCA 4YYMA 5IIDA 2L5EA 5FB0A 4YYDA 4N3WA 3G0JA 4Z1QA 5AD2A 5E74A 5JWMA 4AI6A 4O78A 5CQ6A 3TLPA 1WUGA 1WUMA 5IG6A 5HCLA 5H1VA 4NQMA 2RNWA 4QSUA 5DKCA 5CGPA 4J0SA 3U5PA 4HXPA 5FFYA 5EQ1A 3GG3A 5EVAA 2RI7A 4QSWA 4IR3A 1ZS5A 4IR4A 5CUEA 1E6IA 4YBTA 4YBMA 5EK9A 5ENFA 5CP5A 4CL9A 4HBWA 5EPRA 5CQAA 5COIA 3O36A 3RCWA 4UIYA 5FE6A 5H1UA 1F68A 5I83A 2OSSA 5EP7A 5IBNA 2G4AA 5D3RA 4QBMA 2FSAA 2RS9B 4TU6A 3NXBA 4CFLA 5FG4A 3UVDA 4CUUA 4WHWA 5I29A 4BW3A 5DKDA 4IORA 4LZRA 3P1DA 4OUFA 4A9EA 4N4HA 5FE4A 2E3KA 5DKHA 5HRWA 4XYAA 4LYIA 4LZ2A 5DYXA 4NRBA 4YBSA 5C4QA 3O34A 5LKZA 5C7NA 5CY9A 4QB3A 4WHUA 5IGLA 2NXBA 5D0CA 4XY8A 4YYJA 2EJNA 5CU8A 5D3SA 3SVHA 5D3PA 4HXOA 3JVKA 3D1BA 4N4GA 5LVRA 3MQMA 2L85A 4HXRA 3S92A 5FH7A 5EGUA 2MJVB 3K2JA 4UIUA 4N4FA 5FE1A 4MR3A 2YELA 3HMEA 3MUKA 5ENCA 2GRCA 4CUSA 4YABA 4HBXA 3D7CA 4DONA 5LKXA 2YEKA 4UYFB 3UVYA 3Q2EA 5CQ8A 3MXFA 5F62A 4ZC9A 3U5MA 5A83A 3LQHA 3MB4A 5LJ0A 5E9LA 5LKUA 5EICA 4CUPA 4IR5A 5A81A 5HQ7A 5CUDA 4UIXA 5H1TA 4BW2A 5ENHA 5D3TA 5A5RA 5LUUA 4QSSA 5KTWA 5F60A 4TTEA 4QSPA 5I1QA 4QSTA 5CUGA 4QR5A 4KV1A 5L96A 3SVGA 5CTLA 1N72A 5FG6A 5CFWA 4TU4A 5D3HA 4OGIA 4UIZA 5FE5A 3G0LA 5CRMA 2WP1A 5HRVA 4MEQA 4NYXA 4XUAA 5E9KA 5DLZA 5TB6A 4E96A 3U5OA 5EISA 4C66A 5AD3A 4TZ2A 4YATA 4LR6A 4A9NA 5HQ5A 3HMFA 5D3LA 5I89A 4MR5A 3VKHA 4QYLA 4QEWA 5L8UA 4LC2A 4O72A 5JI8A 5L99A 5CQ4A 4PCEA 5FE9A 5E9VA 4TT2A 5ENGA 4NYVA 5FFVA 4UYDA 2N9GA 4CUTA 4NQNA 3P1FA 5FG5A 4GPJA 4AKGA 2E7NA 5EWHA 4F3IA 4Z93A 5L98A 3D1DA 3UV4A 5DYUA 5A82A 5F63A 5II1A 4UITA 2YQDA 5E9IA 2H60A 5DFBA 5D7XA 4TT6A 2E7OA 4CLBA 5F25A 5IGMA 2DVSA 4NR9A 4YK0A 3O33A 5F61A 4YY4A 2RO1A 4NRCA 5ETBA 4A9IA 3ONIA 4NR5A 2F6JA 4Q0OA 5D26A 4O7FA 5HELA 5C87A 4QR3A 4QR4A 4MEOA 5CQ3A 3P1EA 4XY9A 4NXJA 5EPSA 4NYWA 5LVQA 3IU5A 5IGKA 2DVRA 4FLPA 4IR6A 4J3IA 4LYSA 4PY6A 4UYHA 5EPBA 4LRGA 5L97A 5CRZA 2OUOA 4J0RA 2DATA 4O7BA 5FDZA 4AKNA 4QY4A 4J1PA 4CFKA 4A9FA 4QSQA 5BT5A 3MB3A 5KTUA 3U5KA 4O77A 3LQJA 4NUEA 3UW9A 4TS8A 5AMEA 5EWCA 5A5PA 5ENJA 5BT3A 4YC9A 4IOOA 4UYEA 5FE0A 2R0YA 5FB1A 5EWVA 3S91A 4NRAA 2YDWA 4BW4A 5EM3A 4MENA 4WIVA 4YYGA 5A5OA 5F1HA 5LJ2A 4BW1A 3DWYA 5HEMA 5CUAA 5CUCA 5ETDA 4QEVA 4YYHA 4NUCA 4AKIA 5A5QA 5CQ7A 4NS5A 5DY7A 2WP2A 4QC1A 5F36A 4UIWA 5ENEA 4YAXA 5HENA 2DWWA 5HQ6A 4Z6IA 5L8TA 4YADA 4ALGA 4AKHA 4UYFA 4Y03A 4YH3A 5I88A
chains in the Genus database with same CATH topology
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