5D3SA

First bromodomain of brd4 bound to inhibitor xd44
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
125
structure length
125
Chain Sequence
MNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title 4-Acyl Pyrrole Derivatives Yield Novel Vectors for Designing Inhibitors of the Acetyl-Lysine Recognition Site of BRD4(1).
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 43
structure length 125
sequence length 125
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-08-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5d3sA01
5CU8A 2R0YA 4TT6A 4MEQA 4BW4A 3NXBA 4O7CA 4WHWA 4QZSA 2DVRA 3HMFA 4PKLA 5AD3A 5CRZA 4NR4A 2NXBA 5F25A 4YYJA 5D24A 5EWWA 5DKHA 5IGKA 4PS5A 2KTBB 3QZVA 4N4IA 3DAIA 5E9IA 4A9HA 4F3IA 4YAXA 3QZTA 4MR3A 4Q0OA 5FH6A 4LZSA 5A81A 4KCXA 4Z1QA 2RNWA 4HXPA 2R0VA 5E9LA 5ETBA 4YYMA 5CQTA 4QSUA 4QR4A 5EISA 4YBMA 3U5JA 5E9YA 3U5OA 4UYDA 3S91A 4O76A 4IR4A 5LKXA 4QSRA 5L97A 4CUQA 5I80A 3MUKA 4HXMA 4UYEA 3GG3A 5CGPA 5LJ0A 4QC3A 4A9MA 4N3WA 4QSWA 4NQMA 5FFYA 2RI7A 4A9FA 3RCWA 2L85A 2F6NA 4C66A 2YELA 2RFJA 3ZYUA 5F3AA 3MULA 5ENJA 3MB3A 5I7XA 5DW1A 4YC9A 4O7FA 1EQFA 5L8TA 4O74A 4NUEA 4TQNA 5DW2A 5D0CA 5DLZA 5EM3A 4NRCA 5CQ3A 4ZQLA 5DFCA 5EWVA 2G4AA 5F60A 5EPSA 4XYAA 3LQIA 4LYSA 5L96A 2DWWA 5A7CA 2YW5A 5ETDA 4XY8A 4YY4A 1N72A 4YBSA 5E9VA 5HQ5A 2YDWA 5FE3A 5F1LA 4YYGA 4CL9A 3Q2FA 4HXLA 5II1A 4YADA 4LRGA 5LKUA 2F6JA 2L5EA 4GPJA 5F5ZA 3LQHA 5ENIA 5A5QA 2RS9B 5HELA 4E96A 3P1FA 4UYFB 4LYIA 5HRXA 5CUCA 4YYDA 4Y03A 4QSXA 4QSVA 4O77A 5DKCA 3AADA 5ENGA 4CLBA 5HJCA 5EPRA 4LDFA 4TU4A 4XY9A 4Z93A 3O36A 5FE0A 2RNXA 4CUUA 5HRWA 4PCEA 4QYLA 5FG5A 4KV1A 5EWDA 5JWMA 4PY6A 5TCMA 5CQ7A 5JI8A 5CQAA 5HM0A 4AKNA 5I86A 4NYXA 4QSPA 5DFDA 4NUDA 5CY9A 5EQ1A 4LYWA 3SVHA 5CRMA 4YY6A 5BT5A 5EPBA 3IU6A 4O72A 5CUEA 5FE1A 4QUUA 4LC2A 2H60A 4HXRA 5FDZA 5ENHA 4LR6A 4NR7A 5H85A 2DKWA 2FSAA 3G0LA 3LXJA 4O71A 3I3JA 4O70A 5D3LA 2WP1A 5HQ7A 5EU1A 5I1QA 5D7XA 2I8NA 3UVXA 3LQJA 5FE9A 4DONA 4TZ2A 1E6IA 1WUGA 5IG6A 3UVYA 3SVFA 5A5RA 5F61A 4QSQA 4X2IA 4MEPA 4XUAA 4MR5A 4XUBA 5D3RA 2YEMA 5FBXA 3U5LA 2I7KA 4YYHA 4CUPA 5C87A 5LUUA 4UYFA 5D25A 3JVMA 2RO1A 5LVQA 4NR6A 1JSPB 4YH4A 3HMEA 5H1UA 5I7YA 5F2PA 4N4GA 4LZ2A 4UIWA 5EGUA 5FFVA 5KTXA 5C4QA 4NS5A 4BW2A 4IOOA 4NYWA 5AMFA 5CQ8A 4QYDA 5A85A 3O33A 3O34A 5AD2A 5CP5A 2DVSA 4IR6A 3ONIA 4C67A 4CUSA 5IBNA 5FFWA 2D82A 4HXSA 5CUGA 4N4HA 4RVRA 5CS8A 5IGMA 4QR3A 5EWHA 5I88A 4QR5A 5FE2A 5D3HA 5KU3A 4TYLA 5HLSA 4NXJA 2E3KA 3O35A 4IOQA 2D9EA 5E3GA 3U5PA 2DATA 4J1PA 4UIVA 4BW1A 5A82A 5FE8A 2WP2A 3P1CA 5G4SA 4TU6A 4YH3A 5TB6A 5BT3A 4BHWA 4YBTA 5ENCA 5EVAA 5LVRA 5A5NA 5H1VA 4QB3A 5DKDA 5ENEA 5E73A 5HFQA 5E74A 5CQ5A 4QY4A 4QEVA 5DLXA 5D3TA 5EP7A 3AQAA 5C7NA 2R0SA 3D7CA 5FE4A 4HXOA 4NR8A 5IIDA 3UV5A 3JVLA 5F63A 4NQNA 3O37A 4NUCA 5I89A 2R10A 2N9GA 4QBMA 5DBMA 4QEUA 4Q0NA 3UVDA 4A9EA 4UYHA 5E0RA 4J0RA 5D26A 4TTEA 3UV4A 5EI4A 4QNSA 3MQMA 4TS8A 4YYNA 4Z6HA 2OO1A 3P1DA 4WHUA 2GRCA 3MXFA 4BW3A 4O75A 5E9KA 5CUDA 4QC1A 5DYCA 5DFBA 4PTBA 4MR4A 4MEOA 5HEMA 4KV4A 4OGIA 2E7OA 4CFLA 5HFRA 5D3NA 4MENA 5CUAA 5DX4A 5KO4A 4YATA 1WUMA 5HQ6A 5C85A 4NRAA 5C89A 3K2JA 4MR6A 2DVQA 4N4FA 5L8UA 5I29A 4J0SA 4A9KA 5F62A 5E3DA 5F1HA 2DVVA 1F68A 4HBWA 4QUTA 2RNYA 3HMHA 4UIZA 5FE6A 4O7BA 5CTLA 4HBVA 4O7AA 5DYXA 1JM4B 3UW9A 5HRVA 5CUBA 4A9OA 2YQDA 5ENBA 1X0JA 5A83A 5ENFA 5EV9A 4YYKA 4IR5A 3S92A 5CPEA 4YABA 3LJWA 4HBYA 5FG6A 5C8GA 4QSTA 4TZ8A 5CQ6A 4NR5A 5D3PA 4QSSA 4Z6IA 5D3JA 2YEKA 4OGJA 5LKTA 4IR3A 5CQ4A 5A5SA 3QZSA 4UITA 4A9IA 5COIA 5L98A 3FKMX 4LZRA 5FE7A 5FH7A 5G4RA 5LJ2A 5EWCA 3TLPA 3MB4A 5AMEA 1ZS5A 2OUOA 5I83A 5D3SA 3SVGA 5FG4A 4PCIA 4HBXA 5IGNA 5FE5A 4UYGA 3P1EA 5EICA 5CFWA 3U5KA 3U5NA 5L99A 4O7EA 5LKZA 4CURA 4A9JA 4CUTA 5E9MA 2LSPB 4OUFA 4YK0A 4FLPA 4A9NA 4NYVA 5K29A 3UVWA 5IGLA 5BT4A 3U5MA 5LJ1A 2L84A 4ALHA 3G0JA 4J3IA 4ZC9A 5J0DA 5II2A 4IORA 5EA1A 4UIXA 4UIUA 4WIVA 5EK9A 5KTUA 3JVKA 5H1TA 2OSSA 5DYAA 5KHMA 4QEWA 5FB1A 5FB0A 4BJXA 5I40A 3JVJA 3UV2A 4UIYA 4CFKA 2YYNA 4Z1SA 4NRBA 2E7NA 2MJVB 5F36A 5DYUA 5KTWA 3IU5A 4HXNA 5A5PA 3DWYA 4A9LA 3P5OA 5ACYA 5HCLA 5FH8A 4YYIA 5DY7A 3Q2EA 4NR9A 4TT4A 4O78A 5A5OA 5CZGA 5HENA 5E7DA 4ALGA 4HXKA 4ZW1A 4TT2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CU8A 2R0YA 4TT6A 4MEQA 4BW4A 3NXBA 4O7CA 4WHWA 4QZSA 2DVRA 3HMFA 4PKLA 5AD3A 5CRZA 4NR4A 2NXBA 5F25A 4YYJA 5D24A 5EWWA 5DKHA 5IGKA 4PS5A 2KTBB 3QZVA 1ZKRA 4N4IA 3DAIA 5E9IA 4A9HA 4F3IA 4YAXA 3QZTA 4MR3A 4Q0OA 5FH6A 4LZSA 5A81A 4KCXA 4Z1QA 2RNWA 4HXPA 3VKHA 2R0VA 5E9LA 5ETBA 4YYMA 5CQTA 4QSUA 4QR4A 5EISA 4YBMA 3U5JA 5E9YA 3U5OA 4UYDA 3S91A 4O76A 4IR4A 5LKXA 4QSRA 5L97A 4CUQA 5I80A 3MUKA 4HXMA 4UYEA 3GG3A 5CGPA 5LJ0A 4QC3A 4A9MA 4N3WA 4QSWA 4NQMA 5FFYA 2RI7A 4A9FA 3RCWA 2L85A 2F6NA 4C66A 2YELA 2RFJA 3ZYUA 5F3AA 3MULA 5ENJA 3MB3A 5I7XA 5DW1A 4YC9A 4O7FA 1EQFA 5L8TA 4O74A 4NUEA 4TQNA 5DW2A 5D0CA 5DLZA 3D1DA 5EM3A 4NRCA 5CQ3A 4ZQLA 5DFCA 5EWVA 2G4AA 5F60A 5EPSA 4XYAA 3LQIA 4LYSA 5L96A 2DWWA 5A7CA 2YW5A 5ETDA 4XY8A 4YY4A 1N72A 4YBSA 5E9VA 5HQ5A 2YDWA 5FE3A 5F1LA 4YYGA 4CL9A 3Q2FA 4HXLA 5II1A 4YADA 4LRGA 5LKUA 2F6JA 2L5EA 4GPJA 5F5ZA 3LQHA 5ENIA 5A5QA 2RS9B 5HELA 4E96A 3P1FA 4UYFB 4LYIA 5HRXA 5CUCA 4YYDA 4Y03A 4QSXA 4QSVA 4O77A 5DKCA 3AADA 5ENGA 4CLBA 5HJCA 5EPRA 4LDFA 4TU4A 4XY9A 4Z93A 3O36A 5FE0A 2RNXA 2EJNA 4CUUA 5HRWA 4PCEA 4QYLA 5FG5A 4KV1A 5EWDA 5JWMA 4PY6A 5TCMA 5CQ7A 5JI8A 5CQAA 5HM0A 4AKNA 5I86A 4NYXA 4QSPA 5DFDA 4NUDA 5CY9A 5EQ1A 4LYWA 3SVHA 5CRMA 4YY6A 5BT5A 5EPBA 3IU6A 4O72A 5CUEA 5FE1A 4QUUA 4LC2A 2H60A 4HXRA 5FDZA 5ENHA 4LR6A 4NR7A 5H85A 2DKWA 2FSAA 3G0LA 3LXJA 4O71A 3I3JA 4O70A 5D3LA 2WP1A 5HQ7A 5EU1A 5I1QA 5D7XA 2I8NA 3UVXA 3LQJA 5FE9A 4DONA 4TZ2A 1E6IA 1WUGA 5IG6A 3UVYA 3SVFA 5A5RA 5F61A 4QSQA 4X2IA 4MEPA 4XUAA 4MR5A 4XUBA 5D3RA 2YEMA 5FBXA 3U5LA 2I7KA 4YYHA 4AKIA 4CUPA 5C87A 5LUUA 4UYFA 5D25A 3JVMA 2RO1A 5LVQA 4NR6A 1JSPB 4YH4A 4AKGA 3HMEA 5H1UA 5I7YA 5F2PA 4N4GA 4LZ2A 4UIWA 5EGUA 5FFVA 5KTXA 5C4QA 4NS5A 4BW2A 4IOOA 4NYWA 5AMFA 5CQ8A 4QYDA 5A85A 3O33A 3O34A 5AD2A 5CP5A 2DVSA 4IR6A 3ONIA 4C67A 4CUSA 5IBNA 5FFWA 2D82A 4HXSA 5CUGA 4N4HA 4RVRA 5CS8A 5IGMA 4QR3A 5EWHA 5I88A 4QR5A 5FE2A 5D3HA 5KU3A 4TYLA 5HLSA 4NXJA 2E3KA 3O35A 4IOQA 2D9EA 5E3GA 3U5PA 2DATA 4J1PA 4UIVA 4BW1A 5A82A 5FE8A 2WP2A 3P1CA 5G4SA 4TU6A 4YH3A 5TB6A 5BT3A 4BHWA 4YBTA 5ENCA 5EVAA 5LVRA 5A5NA 5H1VA 4QB3A 5DKDA 5ENEA 5E73A 5HFQA 5E74A 5CQ5A 4QY4A 4QEVA 5DLXA 5D3TA 5EP7A 3AQAA 5C7NA 2R0SA 3D7CA 5FE4A 4HXOA 4NR8A 5IIDA 1PUOA 3UV5A 3JVLA 5F63A 4NQNA 3O37A 4NUCA 5I89A 2R10A 2N9GA 4QBMA 5DBMA 4QEUA 4Q0NA 3UVDA 4A9EA 4UYHA 5E0RA 4J0RA 5D26A 4TTEA 3UV4A 5EI4A 4QNSA 3MQMA 4TS8A 4YYNA 4Z6HA 2OO1A 3P1DA 4WHUA 2GRCA 3MXFA 4BW3A 4O75A 5E9KA 5CUDA 4QC1A 5DYCA 5DFBA 4PTBA 4MR4A 4MEOA 5HEMA 4KV4A 4OGIA 2E7OA 4CFLA 5HFRA 5D3NA 4MENA 4AI6A 5CUAA 5DX4A 5KO4A 4YATA 1WUMA 5HQ6A 5C85A 4NRAA 5C89A 3K2JA 4MR6A 2DVQA 4N4FA 5L8UA 5I29A 4J0SA 4A9KA 5F62A 5E3DA 5F1HA 2DVVA 1F68A 4HBWA 4QUTA 2RNYA 3HMHA 4UIZA 5FE6A 4O7BA 5CTLA 4HBVA 4O7AA 5DYXA 1JM4B 3UW9A 5HRVA 5CUBA 4A9OA 2YQDA 5ENBA 1X0JA 5A83A 5ENFA 5EV9A 4YYKA 4IR5A 3S92A 5CPEA 4YABA 3LJWA 4HBYA 5FG6A 5C8GA 4QSTA 4TZ8A 5CQ6A 4NR5A 5D3PA 4QSSA 4Z6IA 5D3JA 2YEKA 4OGJA 5LKTA 4IR3A 5CQ4A 5A5SA 3QZSA 4UITA 4A9IA 5COIA 5L98A 3FKMX 4LZRA 5FE7A 5FH7A 5G4RA 5LJ2A 5EWCA 3TLPA 3MB4A 5AMEA 1ZS5A 2OUOA 5I83A 5D3SA 3SVGA 5FG4A 4PCIA 4HBXA 5IGNA 5FE5A 4UYGA 3P1EA 5EICA 5CFWA 3U5KA 3U5NA 5L99A 4O7EA 5LKZA 4CURA 4A9JA 4CUTA 5E9MA 2LSPB 4OUFA 4YK0A 4FLPA 4A9NA 4NYVA 5K29A 3UVWA 5IGLA 5BT4A 3U5MA 5LJ1A 2L84A 4ALHA 3G0JA 4J3IA 4ZC9A 5J0DA 5II2A 4IORA 5EA1A 4UIXA 4UIUA 4WIVA 5EK9A 5KTUA 4AKHA 3JVKA 5H1TA 2OSSA 5DYAA 5KHMA 4QEWA 5FB1A 5FB0A 3D1BA 4BJXA 5I40A 3JVJA 3UV2A 4UIYA 4CFKA 2YYNA 4Z1SA 4NRBA 2E7NA 2MJVB 5F36A 3VKGA 5DYUA 5KTWA 3IU5A 4HXNA 5A5PA 3ERRA 3DWYA 4A9LA 3P5OA 5ACYA 5HCLA 5FH8A 4YYIA 5DY7A 3Q2EA 4NR9A 4TT4A 4O78A 5A5OA 5CZGA 5HENA 5E7DA 4ALGA 4HXKA 4ZW1A 4TT2A
chains in the Genus database with same CATH topology
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