5FE9A

Crystal structure of human pcaf bromodomain in complex with compound sl1122 (compound 13)
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
RDPDQLYSTLKSILQQVKSHQSAWPFMEPVKRTEAPGYYEVIRFPMDLKTMSERLKNRYYVSKKLFMADLQRVFTNCKEYNPPESEYYKCANILEKFFFSKIKEAGLID
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Signaling protein
molecule keywords Histone acetyltransferase KAT2B
publication title Structure-Based Identification of Inhibitory Fragments Targeting the p300/CBP-Associated Factor Bromodomain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 109
sequence length 109
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.3.1.48: Histone acetyltransferase.
pdb deposition date 2015-12-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 5fe9A00
5H85A 4TU6A 5KTXA 4A9MA 5AMFA 5EA1A 5DYAA 4NR5A 5C89A 4UYFA 5CFWA 5K29A 5E73A 4YYDA 4UYEA 3U5KA 5BT3A 2RI7A 4HXRA 2E7NA 4QZSA 4O7FA 4IR6A 4XY9A 5FFYA 4YBSA 3P1CA 4NS5A 5DBMA 4UYHA 5D3LA 5I7YA 3LQIA 4O72A 4QSUA 3UVDA 4UYDA 3SVGA 4NR8A 5DW1A 5DKHA 5BT5A 5CY9A 4NR4A 4YYMA 3P1EA 2DVRA 5F3AA 4UIUA 5BT4A 5D24A 3FKMX 4QNSA 5AD3A 5TCMA 4O7CA 4YYKA 5E74A 4UIYA 5ENGA 4CFLA 4MENA 5E0RA 3JVMA 4HXKA 5L96A 5FB0A 5DLZA 4F3IA 4PCIA 5CZGA 3U5PA 5CUCA 5CRMA 5HFQA 5EV9A 5I83A 3O35A 2GRCA 5CPEA 5F5ZA 1ZS5A 2R0SA 3AQAA 4YH3A 5I40A 5ETBA 4UYFB 1F68A 4YABA 4N4HA 5DYXA 2WP2A 4A9LA 5LVQA 4O71A 4CUSA 4ALHA 5E3GA 3UV4A 4NUDA 4QBMA 4YY6A 4QEWA 5C7NA 5L8UA 4LZ2A 4QR3A 4NQMA 2YEKA 4XY8A 2KTBB 2RS9B 3Q2FA 4NRCA 5D0CA 4BJXA 4Z6HA 4E96A 3U5LA 5LVRA 4LZRA 5CUEA 3DAIA 3HMEA 4BHWA 3P1DA 5FE3A 5HFRA 3UVXA 5FH6A 2RFJA 4IR3A 4NR6A 4QSVA 4UIZA 4MR6A 5HJCA 3ONIA 4HXNA 2MJVB 5F62A 5DX4A 3U5MA 3LXJA 5E9MA 3UVWA 4C66A 3QZSA 5D3TA 4CUQA 5HENA 4CURA 2DVVA 3UW9A 4J0SA 4NQNA 5FE1A 5IIDA 4PKLA 4QSXA 3UVYA 2RNYA 5A5OA 5EM3A 2YEMA 4YBTA 4Z1SA 4ZQLA 5ENBA 2NXBA 5FG4A 4Y03A 5DYUA 3O36A 4O70A 5H1TA 5CQ6A 1JM4B 4HXOA 4QR5A 2YQDA 5C8GA 4QC3A 4QSWA 4TT2A 3U5JA 4MR5A 5L98A 2FSAA 4UIWA 5FE9A 5I88A 4A9IA 5FH7A 5A5RA 5HM0A 5AD2A 5CQ3A 5DY7A 3ZYUA 4O7BA 4QEVA 5C4QA 5COIA 5F2PA 4KV4A 4NYXA 3MXFA 5F36A 5E9VA 5EGUA 5HEMA 4A9KA 3S91A 5IGKA 5DFCA 4CUPA 3IU6A 3P1FA 5A5NA 1WUGA 5F1LA 5EWCA 5FFVA 5EP7A 2H60A 4CLBA 5EI4A 2L84A 5I86A 5D3NA 4YYNA 4GPJA 5IGNA 2I7KA 4CUUA 4FLPA 4YC9A 5CP5A 4PCEA 5KHMA 4Q0NA 4MEQA 4A9OA 5HQ6A 3LQJA 5D3HA 5HCLA 5C87A 4XUBA 3DWYA 2D9EA 2RO1A 3MQMA 5ETDA 5FBXA 5EPSA 4ZW1A 5ENEA 4HXSA 5F1HA 4KV1A 4HXLA 4IR5A 2DVSA 4QUTA 4QEUA 3G0JA 1JSPB 4QSSA 2L5EA 5CQ7A 5CQ4A 3I3JA 5IG6A 5LUUA 4NR7A 2D82A 5DKDA 5I7XA 5TB6A 5HLSA 4NYWA 5A5SA 5ENIA 4QC1A 5G4RA 4A9NA 4BW3A 2WP1A 4TU4A 4O78A 4OUFA 2OO1A 4A9HA 5DKCA 4N3WA 4LC2A 4LYWA 3QZVA 4N4IA 4KCXA 4MR4A 4YYGA 4YYHA 5FFWA 2DVQA 5EPRA 5ENFA 5EU1A 4N4GA 3AADA 5EWVA 3MUKA 3MULA 3LQHA 2YYNA 5HRVA 5EK9A 5LKXA 4QSRA 4TYLA 4J0RA 5II1A 5A82A 5LJ1A 5FH8A 4YYIA 5EISA 5HELA 2E7OA 3SVHA 3JVLA 5F25A 5FE2A 5CQTA 5FE7A 4J3IA 3U5OA 2F6NA 4QYDA 4HBYA 5FE8A 5LKTA 5EWDA 4DONA 4QUUA 5A85A 4PTBA 4LR6A 5CRZA 5IBNA 4IOOA 5LKZA 5A5PA 4YY4A 5CUGA 4BW2A 5H1VA 3U5NA 4CUTA 4QYLA 5LJ2A 5E3DA 5DFBA 5FG5A 3K2JA 5DW2A 4IR4A 4N4FA 4CL9A 5I29A 4NRAA 4AKNA 4HXMA 5I89A 2DATA 5FDZA 5HQ5A 5LJ0A 4QY4A 4A9JA 4WHWA 4HBVA 3O34A 4Z6IA 4RVRA 4C67A 4YK0A 2LSPB 3G0LA 4J1PA 4PY6A 5KO4A 3MB3A 5CU8A 5CUDA 4NR9A 4LDFA 4QSTA 5CQ8A 2DKWA 4YYJA 4YAXA 2R0VA 4CFKA 3MB4A 5KU3A 4O75A 5FB1A 3D7CA 4BW1A 4WHUA 2L85A 4BW4A 5A81A 4HBXA 3Q2EA 4ZC9A 4NUEA 4PS5A 4O77A 5CUBA 3TLPA 5FE6A 2RNXA 5F61A 4UIXA 4ALGA 4LRGA 5L8TA 4XYAA 4YH4A 2G4AA 3IU5A 5D3PA 5ENCA 2I8NA 5E9KA 5CQ5A 5ACYA 3P5OA 5FG6A 1N72A 5AMEA 4LZSA 5D7XA 4YBMA 2F6JA 5CUAA 5CTLA 5F60A 5G4SA 4TZ8A 5L97A 5F63A 5DFDA 5CGPA 5HQ7A 3S92A 5CQAA 4MR3A 4NXJA 3JVKA 1X0JA 5A5QA 2YDWA 3SVFA 5II2A 2OUOA 3HMHA 4NRBA 3NXBA 4QSQA 4TZ2A 5EQ1A 5EVAA 5FE4A 4TT4A 5HRXA 4X2IA 5L99A 5IGMA 3UV2A 5E9LA 4O7AA 4QR4A 4A9FA 4WIVA 4IORA 5D3SA 5D25A 4UYGA 4UIVA 5KTWA 4UITA 5ENJA 5ENHA 5KTUA 5EWHA 3GG3A 5I1QA 5I80A 4HBWA 4Q0OA 2YW5A 5D3JA 2OSSA 4NYVA 5E7DA 4Z1QA 5FE0A 3O33A 5CS8A 4QSPA 5JWMA 4O74A 2YELA 3LJWA 3QZTA 3RCWA 5D3RA 4OGJA 1EQFA 2R0YA 5LKUA 4MEOA 5EICA 4O7EA 4LYSA 3O37A 3UV5A 4IOQA 4TS8A 5C85A 4O76A 1E6IA 2R10A 4MEPA 4XUAA 5H1UA 5FE5A 4YATA 5EWWA 4TT6A 4QB3A 5D26A 5A7CA 2RNWA 4OGIA 3HMFA 1WUMA 4NUCA 5A83A 3JVJA 4Z93A 5DLXA 4LYIA 4HXPA 4A9EA 5E9YA 4TTEA 5JI8A 5EPBA 5DYCA 5E9IA 5J0DA 2DWWA 5IGLA 4YADA 2E3KA 4TQNA 2N9GA 5HRWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5H85A 4TU6A 5KTXA 4A9MA 5AMFA 5EA1A 5DYAA 4NR5A 5C89A 4UYFA 3D1BA 5CFWA 3VKHA 5K29A 5E73A 4YYDA 4UYEA 3U5KA 5BT3A 2RI7A 4HXRA 2E7NA 4QZSA 4O7FA 4IR6A 4XY9A 5FFYA 4YBSA 3P1CA 4NS5A 5DBMA 4UYHA 5D3LA 5I7YA 3LQIA 4O72A 4QSUA 3UVDA 4UYDA 3SVGA 4NR8A 5DW1A 5DKHA 5BT5A 4AKIA 5CY9A 4NR4A 4YYMA 3P1EA 2DVRA 5F3AA 4UIUA 5BT4A 5D24A 3FKMX 4QNSA 5AD3A 5TCMA 4O7CA 4YYKA 5E74A 4UIYA 5ENGA 4CFLA 4MENA 5E0RA 3JVMA 4HXKA 5L96A 5FB0A 5DLZA 4F3IA 4PCIA 5CZGA 3U5PA 5CUCA 5CRMA 5HFQA 5EV9A 5I83A 3O35A 2GRCA 5CPEA 5F5ZA 1ZS5A 2R0SA 3AQAA 4YH3A 5I40A 5ETBA 4UYFB 1F68A 4YABA 4N4HA 5DYXA 2WP2A 4A9LA 5LVQA 4O71A 4CUSA 4ALHA 5E3GA 3UV4A 4NUDA 4QBMA 4YY6A 4QEWA 5C7NA 5L8UA 4LZ2A 4QR3A 4NQMA 2YEKA 4XY8A 2KTBB 2RS9B 3Q2FA 4NRCA 5D0CA 4BJXA 4Z6HA 4E96A 3U5LA 5LVRA 4LZRA 5CUEA 3DAIA 3HMEA 4BHWA 3P1DA 5FE3A 5HFRA 3UVXA 5FH6A 2RFJA 4IR3A 4NR6A 4QSVA 4UIZA 4MR6A 5HJCA 3ONIA 4HXNA 2MJVB 5F62A 5DX4A 3U5MA 3LXJA 5E9MA 3UVWA 4C66A 3QZSA 5D3TA 4CUQA 5HENA 4CURA 2DVVA 3UW9A 4J0SA 4NQNA 5FE1A 5IIDA 4PKLA 4QSXA 3UVYA 2RNYA 5A5OA 5EM3A 2YEMA 4YBTA 4Z1SA 4ZQLA 5ENBA 2NXBA 5FG4A 4Y03A 5DYUA 4AKHA 3O36A 4O70A 5H1TA 5CQ6A 1JM4B 4HXOA 4QR5A 2YQDA 2EJNA 5C8GA 4QC3A 4QSWA 4TT2A 3U5JA 4MR5A 5L98A 2FSAA 4UIWA 5FE9A 5I88A 4A9IA 5FH7A 5A5RA 5HM0A 5AD2A 5CQ3A 5DY7A 3ZYUA 4O7BA 4QEVA 1PUOA 5C4QA 5COIA 5F2PA 4KV4A 4NYXA 3MXFA 5F36A 5E9VA 5EGUA 5HEMA 4A9KA 3S91A 5IGKA 3ERRA 5DFCA 4CUPA 3IU6A 3P1FA 5A5NA 1WUGA 5F1LA 5EWCA 5FFVA 5EP7A 2H60A 4CLBA 5EI4A 2L84A 5I86A 5D3NA 4YYNA 4GPJA 5IGNA 2I7KA 4CUUA 4FLPA 4YC9A 5CP5A 4PCEA 5KHMA 4Q0NA 4MEQA 4A9OA 5HQ6A 3LQJA 5D3HA 5HCLA 5C87A 4XUBA 3DWYA 2D9EA 2RO1A 3MQMA 5ETDA 5FBXA 5EPSA 4ZW1A 5ENEA 4HXSA 5F1HA 4KV1A 4HXLA 4IR5A 2DVSA 4QUTA 4QEUA 3G0JA 1JSPB 4QSSA 2L5EA 5CQ7A 5CQ4A 3I3JA 5IG6A 5LUUA 4NR7A 2D82A 5DKDA 5I7XA 5TB6A 5HLSA 4NYWA 5A5SA 5ENIA 4QC1A 5G4RA 4A9NA 4BW3A 2WP1A 4TU4A 4O78A 4OUFA 2OO1A 4A9HA 5DKCA 4N3WA 4LC2A 4LYWA 3QZVA 4N4IA 4KCXA 4MR4A 4YYGA 4YYHA 5FFWA 2DVQA 5EPRA 5ENFA 5EU1A 4N4GA 3AADA 5EWVA 3MUKA 3MULA 3LQHA 2YYNA 5HRVA 5EK9A 5LKXA 4QSRA 4TYLA 4J0RA 5II1A 5A82A 5LJ1A 5FH8A 4YYIA 5EISA 5HELA 2E7OA 3SVHA 3JVLA 5F25A 5FE2A 5CQTA 5FE7A 4J3IA 3U5OA 2F6NA 4QYDA 4HBYA 5FE8A 5LKTA 5EWDA 4DONA 4QUUA 5A85A 4PTBA 4LR6A 5CRZA 5IBNA 4IOOA 5LKZA 5A5PA 4YY4A 5CUGA 4BW2A 5H1VA 3U5NA 4CUTA 4QYLA 5LJ2A 5E3DA 5DFBA 5FG5A 3K2JA 5DW2A 4IR4A 4N4FA 4CL9A 5I29A 4NRAA 4AKNA 4HXMA 1ZKRA 5I89A 2DATA 5FDZA 5HQ5A 5LJ0A 4QY4A 4A9JA 4WHWA 4HBVA 3O34A 4Z6IA 4RVRA 4C67A 4YK0A 2LSPB 3G0LA 4J1PA 4PY6A 5KO4A 3MB3A 5CU8A 5CUDA 4NR9A 4LDFA 4QSTA 5CQ8A 2DKWA 4YYJA 4YAXA 2R0VA 4CFKA 3MB4A 5KU3A 4O75A 5FB1A 3D7CA 4BW1A 4WHUA 2L85A 4BW4A 5A81A 4HBXA 3Q2EA 4ZC9A 4NUEA 4PS5A 4O77A 5CUBA 3TLPA 5FE6A 2RNXA 5F61A 4UIXA 4ALGA 4LRGA 5L8TA 4XYAA 4YH4A 2G4AA 3IU5A 5D3PA 5ENCA 2I8NA 5E9KA 5CQ5A 5ACYA 3P5OA 5FG6A 1N72A 5AMEA 4LZSA 5D7XA 4YBMA 2F6JA 5CUAA 5CTLA 5F60A 5G4SA 4TZ8A 5L97A 5F63A 5DFDA 5CGPA 5HQ7A 3S92A 5CQAA 4MR3A 4NXJA 3JVKA 1X0JA 5A5QA 2YDWA 3SVFA 5II2A 2OUOA 3HMHA 4NRBA 3D1DA 3NXBA 4QSQA 3VKGA 4TZ2A 5EQ1A 4AKGA 5EVAA 5FE4A 4TT4A 5HRXA 4X2IA 5L99A 5IGMA 3UV2A 5E9LA 4O7AA 4QR4A 4A9FA 4WIVA 4IORA 5D3SA 5D25A 4UYGA 4UIVA 5KTWA 4UITA 5ENJA 5ENHA 5KTUA 5EWHA 3GG3A 5I1QA 5I80A 4HBWA 4Q0OA 2YW5A 5D3JA 2OSSA 4NYVA 5E7DA 4Z1QA 5FE0A 3O33A 5CS8A 4QSPA 5JWMA 4O74A 2YELA 3LJWA 3QZTA 3RCWA 5D3RA 4OGJA 1EQFA 2R0YA 5LKUA 4MEOA 4AI6A 5EICA 4O7EA 4LYSA 3O37A 3UV5A 4IOQA 4TS8A 5C85A 4O76A 1E6IA 2R10A 4MEPA 4XUAA 5H1UA 5FE5A 4YATA 5EWWA 4TT6A 4QB3A 5D26A 5A7CA 2RNWA 4OGIA 3HMFA 1WUMA 4NUCA 5A83A 3JVJA 4Z93A 5DLXA 4LYIA 4HXPA 4A9EA 5E9YA 4TTEA 5JI8A 5EPBA 5DYCA 5E9IA 5J0DA 2DWWA 5IGLA 4YADA 2E3KA 4TQNA 2N9GA 5HRWA
chains in the Genus database with same CATH topology
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