4C67A

Discovery of epigenetic regulator i-bet762: lead optimization to afford a clinical candidate inhibitor of the bet bromodomains
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Cell cycle
molecule keywords BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 4
publication title Discovery of Epigenetic Regulator I-Bet762: Lead Optimization to Afford a Clinical Candidate Inhibitor of the Bet Bromodomains.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 44
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4c67A01
3HMFA 4QEWA 5E9YA 4NR7A 4J0SA 5LVQA 4TYLA 2RNXA 5EU1A 2L5EA 5DFDA 5I89A 5KTWA 5EQ1A 4O7BA 2NXBA 4NR5A 5ENHA 3U5NA 4O72A 4N4GA 5KTUA 5ENCA 4O77A 4OUFA 5ENJA 5A5SA 5A5PA 4YBSA 2RFJA 5E74A 3MUKA 4C67A 3K2JA 5E73A 5EPBA 4YYDA 3DAIA 4YBMA 3U5MA 4Z1SA 5D3NA 4QNSA 2WP1A 5C89A 3NXBA 3O37A 5EVAA 4YYNA 4QBMA 4QEUA 5C87A 5HJCA 5FE9A 4A9OA 5F36A 4CL9A 5E9VA 5BT3A 5DBMA 4WHWA 3AADA 5HQ5A 5D3HA 4X2IA 5HLSA 3MQMA 4QYLA 5HRWA 5C8GA 5II1A 5E7DA 5IGMA 4CFLA 5DKDA 5DFCA 1WUGA 4UITA 5BT4A 5G4SA 5LKXA 4C66A 4J3IA 4ZW1A 3RCWA 4QY4A 4BW2A 4CUUA 5FG5A 4UIZA 4HBVA 3UVYA 2E7NA 4OGJA 4QZSA 4QSTA 5EI4A 2RO1A 4UIUA 5ENBA 5TCMA 4A9EA 4CURA 4YH3A 4ZQLA 5A7CA 4ALGA 3SVGA 4TU6A 5DX4A 5E3DA 3SVFA 2WP2A 4LZSA 5HCLA 3SVHA 4QC1A 3G0JA 5EISA 5CZGA 4WHUA 4PCEA 5ENGA 5FB0A 3UV5A 4PY6A 4BW3A 3UVXA 4E96A 4O76A 2LSPB 3GG3A 4O7AA 5EICA 4MR6A 4UYFB 5LJ0A 5E3GA 5CQ3A 5AMFA 5LKTA 3P1CA 5I7YA 2OO1A 4IR6A 5DLXA 4KV4A 4UYEA 5IIDA 3AQAA 5ETBA 5IGKA 4KCXA 4YYIA 5CQ5A 3UVDA 3Q2EA 4NYXA 4N4HA 5EM3A 4O7EA 4IOOA 3D7CA 3JVKA 5A5NA 5EWHA 3S92A 3MB4A 4Y03A 3G0LA 4QB3A 5COIA 3IU6A 3P1EA 4GPJA 2RI7A 4XYAA 5H1VA 5D3JA 5CQ6A 5ACYA 5J0DA 5FE6A 4NUCA 5CFWA 5HFQA 5DFBA 5F62A 5CQ8A 4PS5A 4KV1A 3TLPA 4ZC9A 5FE8A 5L97A 5LJ2A 5CQ4A 5FG6A 4HBXA 5HENA 5DYUA 4TT6A 4YADA 5IGNA 4QSRA 5CTLA 5HEMA 5EGUA 4UYDA 4O78A 4CUPA 4LRGA 3UVWA 3P1FA 4YYKA 5JI8A 5A85A 5HQ6A 5CGPA 5LKZA 2R0YA 4UIVA 5ENEA 4ALHA 4YYMA 4NS5A 3P1DA 4QSUA 5CRZA 5A82A 5EPSA 4A9JA 5EWVA 2H60A 2MJVB 4HXRA 4A9FA 5FFYA 5C4QA 2OSSA 4QSXA 2E7OA 4CLBA 5CP5A 5CUAA 1WUMA 5LUUA 4CUTA 2DVSA 5CRMA 1ZS5A 4QR3A 4NRBA 5CUGA 4Z6HA 4TT4A 2R0VA 4QSPA 5F25A 5DLZA 3UV4A 4LC2A 5TB6A 5H1TA 4QYDA 5F61A 5L96A 3DWYA 4HXLA 4Z1QA 5I1QA 5A5QA 1EQFA 5F63A 5CQAA 4NYVA 4HBWA 5EK9A 2L84A 4CUQA 5FG4A 2KTBB 4A9HA 4XY9A 4IR3A 3UV2A 4LYIA 2F6NA 4CUSA 4MR3A 2YYNA 3LQJA 4MEOA 4HXMA 5C7NA 5FDZA 4UYHA 2GRCA 3ZYUA 4UIXA 2OUOA 3LQHA 4MR4A 2I8NA 2YEMA 5D3TA 5HELA 4Z6IA 4A9MA 4IORA 4HXPA 4HXNA 4IOQA 4QEVA 5FE0A 4LR6A 4NUDA 5HQ7A 5CUDA 2YW5A 4YY6A 3QZTA 4MR5A 2FSAA 2YELA 5I83A 2YDWA 4UIYA 5CPEA 5E0RA 5I40A 5FE7A 5I7XA 4XUBA 5A5RA 2R0SA 5JWMA 5EA1A 2RNWA 5A81A 4BHWA 5HRXA 5L99A 3FKMX 5IBNA 4J0RA 4TZ8A 5E9IA 4O70A 2RNYA 5H85A 4HXSA 4NYWA 4DONA 3O36A 3LQIA 5CU8A 4NQMA 2DVRA 4Q0OA 4LDFA 4F3IA 5FE3A 3Q2FA 4UYFA 1X0JA 2D82A 4XY8A 4QC3A 5FFWA 5AD3A 5KTXA 5L8UA 4HBYA 4Q0NA 4MEQA 5CQ7A 2DWWA 5F1LA 3MULA 4A9LA 3O33A 4UIWA 5KU3A 2L85A 5LVRA 1E6IA 3LJWA 5FE1A 5KO4A 4NRCA 3MXFA 2RS9B 5DYCA 4HXKA 4NUEA 4O7CA 4TS8A 5F2PA 3U5KA 5KHMA 5G4RA 3U5LA 5E9MA 5AMEA 5A5OA 4A9NA 3HMHA 5FBXA 4AKNA 4TT2A 5CY9A 5DKHA 2YQDA 4QSQA 3JVJA 4J1PA 3JVLA 4WIVA 4YAXA 5I88A 3I3JA 5L98A 5CUEA 4NRAA 5L8TA 2DVVA 4YH4A 2DVQA 4PKLA 1JSPB 4NR4A 5DYAA 4BW1A 5FH6A 5EV9A 5EP7A 3IU5A 4IR4A 5IGLA 5LKUA 5F3AA 5A83A 4LZRA 5K29A 3QZVA 5BT5A 5IG6A 3O35A 3U5PA 5CUBA 4A9KA 4IR5A 5ENFA 5I86A 4PCIA 4LYWA 3LXJA 4NR6A 5DY7A 1N72A 5DKCA 3S91A 5EWWA 4NXJA 3O34A 5D0CA 2R10A 4YBTA 1F68A 5FH7A 5D3LA 5FFVA 4YYGA 5FB1A 5F60A 4Z93A 4TQNA 2DATA 2D9EA 5C85A 5I29A 4QSVA 3HMEA 4QR5A 5FE2A 5D3SA 4YC9A 4O7FA 4TU4A 4RVRA 4YY4A 5FE4A 2E3KA 5D26A 5EWDA 4TTEA 2N9GA 5ETDA 5D7XA 3P5OA 5F5ZA 4YK0A 5E9KA 4O75A 4NQNA 3U5JA 4QUTA 5CS8A 4LZ2A 5D24A 3ONIA 4NR8A 4YYHA 4FLPA 4TZ2A 5D3RA 5H1UA 4O71A 4QUUA 4QSWA 3MB3A 5CQTA 5FH8A 4MENA 4N3WA 4O74A 4XUAA 4UYGA 2DKWA 4OGIA 5ENIA 5EPRA 4BJXA 5AD2A 2YEKA 3JVMA 5LJ1A 2G4AA 2I7KA 4A9IA 4YATA 5CUCA 5D25A 4NR9A 4YYJA 4HXOA 4N4FA 4PTBA 4MEPA 5HM0A 3UW9A 4QR4A 5HFRA 1JM4B 5D3PA 5EWCA 4BW4A 3U5OA 3QZSA 4N4IA 5HRVA 5FE5A 4YABA 5DYXA 5E9LA 5DW1A 5DW2A 5F1HA 4CFKA 4LYSA 5I80A 4QSSA 2F6JA 5II2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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