4C67A

Discovery of epigenetic regulator i-bet762: lead optimization to afford a clinical candidate inhibitor of the bet bromodomains
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Cell cycle
molecule keywords BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 4
publication title Discovery of Epigenetic Regulator I-Bet762: Lead Optimization to Afford a Clinical Candidate Inhibitor of the Bet Bromodomains.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 44
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4c67A01
5EPBA 5CUBA 5FE2A 5DYUA 4YBMA 3P5OA 5A7CA 5E74A 5CY9A 5EISA 5F25A 5I1QA 4MEPA 5ENHA 3UVDA 1F68A 4KV1A 4YYNA 4YYMA 5C85A 3S91A 3QZVA 4QR5A 1WUMA 5H1UA 5CRZA 4A9IA 4IR5A 4UYFB 4NRCA 5J0DA 5CUEA 4IORA 4A9OA 5KHMA 5EICA 4RVRA 5CQ6A 4NR7A 5CRMA 5AMFA 5EWDA 2YEKA 3UVWA 3P1FA 5H1TA 5DYAA 2YW5A 5FE6A 4PTBA 4TT2A 5E0RA 5HENA 4N4GA 5CQAA 3ONIA 5CQ3A 2RNYA 3MB4A 5E9KA 5ENEA 4UYDA 5FE8A 5D3HA 3UV5A 4O70A 5II1A 4YH4A 2RS9B 3AADA 3O35A 4YATA 4UYHA 4LZ2A 4NRAA 4OGJA 2WP2A 4CUTA 5FDZA 4CUSA 3QZSA 3JVLA 5EM3A 5II2A 4X2IA 4ALHA 4XYAA 5K29A 5KTWA 3GG3A 4C66A 4LYIA 5KU3A 5BT4A 4PS5A 4UYGA 3ZYUA 4BW2A 5CTLA 4UIWA 5C4QA 5FB0A 5ETBA 5LKZA 2G4AA 4LYWA 5FB1A 4ALGA 5F60A 5A83A 5LKUA 5EQ1A 5D3NA 5DFCA 4QR4A 5DKHA 2NXBA 2DVSA 5IGNA 2R0VA 3U5KA 4A9NA 4CUUA 3O36A 3O33A 2OSSA 4NR5A 2DKWA 4YYHA 4CUQA 5I83A 5D3LA 5TB6A 3MB3A 2L84A 3UV2A 4LC2A 4IR3A 4YY6A 5C7NA 5HEMA 2YDWA 4QY4A 3MUKA 5HQ6A 5ENIA 4Q0NA 4QZSA 5L8TA 4YYKA 5FFVA 2I8NA 3FKMX 5E3GA 5AMEA 5FH8A 3MQMA 4TU6A 5FH7A 4A9EA 4Q0OA 5I88A 5CUGA 5F1LA 5FE9A 4NR8A 5F36A 5EI4A 3LQHA 4HXSA 1WUGA 4YC9A 5D7XA 5EA1A 3IU5A 4ZW1A 5FBXA 5A81A 3HMFA 5FE0A 4YADA 5HRWA 2L5EA 4HBXA 2YQDA 4LYSA 4DONA 3U5JA 4HXPA 5A5PA 5FE5A 5F61A 5A85A 5D3TA 4J0RA 3D7CA 3JVMA 5TCMA 5ENBA 5C8GA 4BW3A 5HRVA 4MR3A 3RCWA 3SVGA 5EVAA 5D24A 2DVQA 3TLPA 4LDFA 4TT6A 1N72A 4QSQA 4NUEA 4YYGA 2E7OA 5CQTA 5IGKA 4Z6IA 5DFBA 4NS5A 3O37A 4BW1A 5CUAA 5EV9A 5HRXA 1EQFA 4TTEA 4Z93A 4QYDA 4PKLA 5DW1A 5ENCA 5L99A 2DATA 4MR4A 4HXMA 4BW4A 5H85A 3IU6A 4QBMA 3MULA 5E9MA 4QC3A 4OGIA 5IGLA 3Q2EA 4TZ8A 5ETDA 3UW9A 5D3SA 5DYCA 2RNWA 4WIVA 5FE1A 3MXFA 4YBSA 5HQ5A 3U5MA 4N3WA 2DVRA 4NUCA 4MEOA 3QZTA 4QYLA 4LZRA 5D26A 5EWCA 5LJ2A 4UYEA 4NQMA 4NXJA 4LRGA 4YK0A 3I3JA 5I89A 5DW2A 4YYJA 5BT5A 3U5NA 5EP7A 4QR3A 5EWVA 5I7YA 4YABA 4IOOA 4A9KA 4CLBA 5ENJA 4PY6A 4NR9A 4QC1A 4N4HA 4WHUA 4Y03A 4QSVA 5LKXA 5HFQA 4YYIA 4O7FA 4BHWA 2OO1A 4CUPA 5IGMA 5LVQA 5CUDA 5HLSA 5JI8A 5A82A 4GPJA 3UVYA 2R0SA 3HMHA 2I7KA 4QNSA 4QEUA 5L97A 5IG6A 5CU8A 4J3IA 3P1DA 4O77A 5I40A 4QUUA 2RO1A 4O7EA 4QSRA 5D3JA 4UIXA 5E9YA 2L85A 3JVJA 5BT3A 4NYVA 2KTBB 3U5OA 2F6JA 4Z6HA 2OUOA 5EK9A 5ACYA 4HBVA 5CFWA 4A9LA 4O71A 5CP5A 4O74A 5A5OA 5A5RA 4IR6A 4QSUA 5I86A 2MJVB 5I80A 5DLXA 2GRCA 4A9MA 4BJXA 4QSXA 4UIVA 3JVKA 4UIYA 4YAXA 3G0JA 5I7XA 4QSPA 2E7NA 1JSPB 5HFRA 4NUDA 5FFYA 5LUUA 2E3KA 5CQ5A 5F62A 4Z1SA 4CL9A 5G4SA 5DKCA 4NR6A 4IR4A 2F6NA 4XUBA 5HJCA 4HXRA 4OUFA 4TQNA 4O7BA 5FG6A 3P1CA 1ZS5A 5KTUA 3SVFA 5FFWA 3HMEA 5DX4A 5CUCA 4YYDA 5LVRA 4TS8A 2R0YA 5F3AA 2LSPB 5HQ7A 3SVHA 4MR6A 5CQ8A 5LKTA 3LQJA 5F5ZA 5LJ1A 4CFKA 1E6IA 4J0SA 4MEQA 4PCIA 5A5SA 4J1PA 5CPEA 3DWYA 2FSAA 4IOQA 3UVXA 5COIA 5FE7A 3AQAA 5E9LA 5E9IA 4NQNA 5AD2A 4HXNA 5DKDA 5LJ0A 5AD3A 4QB3A 4NR4A 4ZC9A 5IIDA 4QEWA 1X0JA 5FG5A 1JM4B 4A9JA 2R10A 4FLPA 4AKNA 4N4FA 4MR5A 5CGPA 4UITA 5EU1A 3LXJA 5FE3A 5EWWA 5DFDA 5JWMA 5EPRA 4HXLA 4WHWA 5F2PA 5G4RA 4PCEA 2D82A 3U5PA 5D25A 4LR6A 3DAIA 5FE4A 4A9HA 4XY9A 4TU4A 5HM0A 2YYNA 2N9GA 3U5LA 4O7AA 5H1VA 4HBWA 4UIUA 5F1HA 5D3PA 4O78A 5CQ7A 5KTXA 3K2JA 4Z1QA 3LQIA 4HXOA 5F63A 5E3DA 2H60A 4QUTA 4MENA 4LZSA 5EPSA 4ZQLA 2DVVA 5ENFA 5I29A 5C89A 4O76A 5CQ4A 5DLZA 5CZGA 2RFJA 4NYWA 5E73A 4QSTA 5D0CA 4TZ2A 4HXKA 5CS8A 4YH3A 5ENGA 2RI7A 2YELA 3NXBA 5KO4A 5DBMA 2D9EA 5L98A 4C67A 4XUAA 4QSSA 4KCXA 4HBYA 4QEVA 4NRBA 2YEMA 5A5NA 4KV4A 3P1EA 4YBTA 4TYLA 4QSWA 4CFLA 4UIZA 5HELA 2DWWA 4YY4A 4O7CA 2RNXA 5DYXA 5HCLA 4E96A 5E7DA 3Q2FA 3O34A 4A9FA 3G0LA 4CURA 3LJWA 5L96A 4O72A 5L8UA 5FG4A 5EGUA 5D3RA 5FH6A 4XY8A 5IBNA 3S92A 4UYFA 5E9VA 4F3IA 5DY7A 5EWHA 2WP1A 5C87A 4TT4A 4O75A 4NYXA 5A5QA 3UV4A 4N4IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5EPBA 5CUBA 5FE2A 5DYUA 4YBMA 3P5OA 5A7CA 4AKHA 5E74A 5CY9A 1ZKRA 5EISA 5F25A 5I1QA 4MEPA 5ENHA 3UVDA 1F68A 4KV1A 4YYNA 4YYMA 5C85A 3S91A 3QZVA 4QR5A 2EJNA 1WUMA 5H1UA 5CRZA 4A9IA 4IR5A 4UYFB 4NRCA 5J0DA 5CUEA 4IORA 4A9OA 5KHMA 5EICA 4RVRA 5CQ6A 4NR7A 5CRMA 5AMFA 5EWDA 2YEKA 3UVWA 3P1FA 5H1TA 5DYAA 2YW5A 5FE6A 4PTBA 4TT2A 5E0RA 5HENA 4N4GA 5CQAA 3ONIA 5CQ3A 2RNYA 3MB4A 5E9KA 5ENEA 4UYDA 5FE8A 5D3HA 3UV5A 4O70A 5II1A 4YH4A 2RS9B 3AADA 3O35A 4YATA 4UYHA 4LZ2A 4NRAA 4OGJA 2WP2A 4CUTA 5FDZA 4CUSA 3QZSA 3JVLA 5EM3A 5II2A 4X2IA 4ALHA 4XYAA 5K29A 5KTWA 3GG3A 4C66A 4LYIA 5KU3A 5BT4A 4PS5A 4UYGA 3ZYUA 4BW2A 5CTLA 4UIWA 5C4QA 5FB0A 5ETBA 5LKZA 2G4AA 4LYWA 5FB1A 4ALGA 5F60A 5A83A 5LKUA 5EQ1A 5D3NA 5DFCA 4QR4A 5DKHA 2NXBA 2DVSA 5IGNA 2R0VA 3U5KA 4A9NA 4CUUA 3O36A 3O33A 2OSSA 3ERRA 4NR5A 2DKWA 4YYHA 4CUQA 5I83A 5D3LA 5TB6A 3MB3A 2L84A 3UV2A 4LC2A 4IR3A 4YY6A 5C7NA 5HEMA 2YDWA 4QY4A 3MUKA 5HQ6A 5ENIA 4Q0NA 4QZSA 5L8TA 4YYKA 5FFVA 2I8NA 3FKMX 5E3GA 5AMEA 5FH8A 3MQMA 4TU6A 5FH7A 4A9EA 4Q0OA 5I88A 5CUGA 5F1LA 5FE9A 4NR8A 5F36A 5EI4A 3LQHA 4HXSA 1WUGA 4YC9A 5D7XA 5EA1A 3IU5A 4ZW1A 5FBXA 5A81A 3HMFA 5FE0A 4YADA 5HRWA 2L5EA 4HBXA 2YQDA 4LYSA 4DONA 3U5JA 4HXPA 5A5PA 5FE5A 5F61A 5A85A 5D3TA 4J0RA 3D7CA 3JVMA 5TCMA 5ENBA 5C8GA 4BW3A 5HRVA 4MR3A 3RCWA 3SVGA 5EVAA 5D24A 2DVQA 3TLPA 4LDFA 4TT6A 1N72A 4QSQA 4NUEA 4YYGA 2E7OA 5CQTA 5IGKA 4Z6IA 5DFBA 4NS5A 3O37A 4BW1A 5CUAA 5EV9A 5HRXA 1EQFA 4TTEA 4Z93A 4QYDA 4PKLA 5DW1A 5ENCA 5L99A 2DATA 4MR4A 4HXMA 4BW4A 5H85A 3IU6A 4QBMA 3VKHA 3MULA 5E9MA 4QC3A 4OGIA 5IGLA 3Q2EA 4TZ8A 5ETDA 3UW9A 5D3SA 5DYCA 2RNWA 4WIVA 5FE1A 3MXFA 4YBSA 5HQ5A 3U5MA 4N3WA 2DVRA 4NUCA 4MEOA 3QZTA 4QYLA 4LZRA 5D26A 5EWCA 5LJ2A 4AKIA 4UYEA 4NQMA 4NXJA 4LRGA 4YK0A 3I3JA 5I89A 5DW2A 4YYJA 5BT5A 3U5NA 5EP7A 4QR3A 5EWVA 5I7YA 4YABA 4IOOA 4A9KA 4CLBA 5ENJA 4PY6A 4NR9A 4QC1A 4N4HA 4WHUA 4Y03A 4QSVA 5LKXA 5HFQA 4YYIA 4O7FA 3D1DA 4BHWA 2OO1A 4CUPA 5IGMA 5LVQA 5CUDA 5HLSA 5JI8A 5A82A 4GPJA 3UVYA 2R0SA 3HMHA 2I7KA 4QNSA 4QEUA 5L97A 5IG6A 5CU8A 4J3IA 3P1DA 4O77A 5I40A 4QUUA 2RO1A 4O7EA 4QSRA 5D3JA 4UIXA 5E9YA 2L85A 3JVJA 5BT3A 4NYVA 2KTBB 3U5OA 2F6JA 4Z6HA 2OUOA 5EK9A 3VKGA 5ACYA 4HBVA 5CFWA 3D1BA 4A9LA 4O71A 5CP5A 4O74A 5A5OA 5A5RA 4IR6A 4QSUA 5I86A 2MJVB 5I80A 5DLXA 2GRCA 4A9MA 4BJXA 4QSXA 4UIVA 3JVKA 4UIYA 4YAXA 3G0JA 5I7XA 4QSPA 2E7NA 1JSPB 5HFRA 4NUDA 5FFYA 5LUUA 2E3KA 5CQ5A 5F62A 4Z1SA 4CL9A 5G4SA 5DKCA 4NR6A 4IR4A 2F6NA 1PUOA 4XUBA 5HJCA 4HXRA 4OUFA 4TQNA 4O7BA 5FG6A 3P1CA 1ZS5A 5KTUA 3SVFA 5FFWA 3HMEA 5DX4A 5CUCA 4YYDA 5LVRA 4TS8A 2R0YA 5F3AA 2LSPB 5HQ7A 3SVHA 4MR6A 5CQ8A 5LKTA 3LQJA 5F5ZA 5LJ1A 4CFKA 1E6IA 4J0SA 4MEQA 4PCIA 5A5SA 4J1PA 5CPEA 3DWYA 2FSAA 4IOQA 3UVXA 5COIA 5FE7A 3AQAA 5E9LA 5E9IA 4NQNA 5AD2A 4HXNA 5DKDA 5LJ0A 5AD3A 4QB3A 4NR4A 4ZC9A 5IIDA 4QEWA 1X0JA 5FG5A 1JM4B 4A9JA 2R10A 4FLPA 4AKNA 4AKGA 4N4FA 4MR5A 5CGPA 4UITA 5EU1A 3LXJA 5FE3A 5EWWA 5DFDA 5JWMA 5EPRA 4HXLA 4WHWA 5F2PA 5G4RA 4PCEA 2D82A 3U5PA 5D25A 4LR6A 3DAIA 5FE4A 4A9HA 4XY9A 4TU4A 5HM0A 2YYNA 2N9GA 3U5LA 4O7AA 5H1VA 4HBWA 4UIUA 5F1HA 5D3PA 4O78A 5CQ7A 5KTXA 3K2JA 4Z1QA 3LQIA 4HXOA 5F63A 5E3DA 2H60A 4QUTA 4MENA 4AI6A 4LZSA 5EPSA 4ZQLA 2DVVA 5ENFA 5I29A 5C89A 4O76A 5CQ4A 5DLZA 5CZGA 2RFJA 4NYWA 5E73A 4QSTA 5D0CA 4TZ2A 4HXKA 5CS8A 4YH3A 5ENGA 2RI7A 2YELA 3NXBA 5KO4A 5DBMA 2D9EA 5L98A 4C67A 4XUAA 4QSSA 4KCXA 4HBYA 4QEVA 4NRBA 2YEMA 5A5NA 4KV4A 3P1EA 4YBTA 4TYLA 4QSWA 4CFLA 4UIZA 5HELA 2DWWA 4YY4A 4O7CA 2RNXA 5DYXA 5HCLA 4E96A 5E7DA 3Q2FA 3O34A 4A9FA 3G0LA 4CURA 3LJWA 5L96A 4O72A 5L8UA 5FG4A 5EGUA 5D3RA 5FH6A 4XY8A 5IBNA 3S92A 4UYFA 5E9VA 4F3IA 5DY7A 5EWHA 2WP1A 5C87A 4TT4A 4O75A 4NYXA 5A5QA 3UV4A 4N4IA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5EPB A;  5CUB A;  5FE2 A;  5DYU A;  4YBM A;  3P5O A;  5A7C A;  5E74 A;  5CY9 A;  5EIS A;  5F25 A;  5I1Q A;  4MEP A;  5ENH A;  3UVD A;  1F68 A;  4KV1 A;  4YYN A;  4YYM A;  5C85 A;  3S91 A;  3QZV A;  4QR5 A;  1WUM A;  5H1U A;  5CRZ A;  4A9I A;  4IR5 A;  4UYF B;  4NRC A;  5J0D A;  5CUE A;  4IOR A;  4A9O A;  5KHM A;  5EIC A;  4RVR A;  5CQ6 A;  4NR7 A;  5CRM A;  5AMF A;  5EWD A;  2YEK A;  3UVW A;  3P1F A;  5H1T A;  5DYA A;  2YW5 A;  5FE6 A;  4PTB A;  4TT2 A;  5E0R A;  5HEN A;  4N4G A;  5CQA A;  3ONI A;  5CQ3 A;  2RNY A;  3MB4 A;  5E9K A;  5ENE A;  4UYD A;  5FE8 A;  5D3H A;  3UV5 A;  4O70 A;  5II1 A;  4YH4 A;  2RS9 B;  3AAD A;  3O35 A;  4YAT A;  4UYH A;  4LZ2 A;  4NRA A;  4OGJ A;  2WP2 A;  4CUT A;  5FDZ A;  4CUS A;  3QZS A;  3JVL A;  5EM3 A;  5II2 A;  4X2I A;  4ALH A;  4XYA A;  5K29 A;  5KTW A;  3GG3 A;  4C66 A;  4LYI A;  5KU3 A;  5BT4 A;  4PS5 A;  4UYG A;  3ZYU A;  4BW2 A;  5CTL A;  4UIW A;  5C4Q A;  5FB0 A;  5ETB A;  5LKZ A;  2G4A A;  4LYW A;  5FB1 A;  4ALG A;  5F60 A;  5A83 A;  5LKU A;  5EQ1 A; 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