4CL9A

N-terminal bromodomain of human brd4 with i-bet295
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 4
publication title The Structure Based Design of Dual Hdac/Bet Inhibitors as Novel Epigenetic Probes.
doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 43
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4cl9A01
4YH4A 4YBSA 4LC2A 5JWMA 4NXJA 5L97A 4O7AA 5KU3A 4YYHA 4LYWA 5A5NA 3FKMX 3U5OA 4UYDA 5CUBA 4UITA 4UIZA 5FH8A 5EI4A 5H1VA 4RVRA 5FE9A 3LQIA 4O70A 4NUDA 5E73A 3QZSA 1ZS5A 2F6NA 5D0CA 2NXBA 5AD3A 5C89A 4A9MA 5EQ1A 5A5PA 3O33A 3QZVA 5E9YA 5HFRA 5CFWA 4HXKA 2R10A 3MUKA 4YYIA 5FFYA 3NXBA 5FDZA 4QB3A 1X0JA 4BJXA 5A5SA 5I83A 1WUMA 5EWHA 4YY4A 4TZ2A 5IGNA 5F36A 3O34A 3AQAA 3TLPA 4LYSA 2DVQA 4Q0NA 4TT2A 5ENGA 4KV4A 4HXLA 5I89A 4N4FA 5EWWA 5BT5A 5DKHA 5L8UA 4CUTA 4TS8A 5G4SA 5C85A 3ONIA 3HMHA 2RI7A 5CGPA 5CQ6A 4YYJA 5LVQA 5II1A 4NR7A 5CQ5A 4ZW1A 5HRXA 4O76A 5EVAA 4QEUA 4QR3A 5A81A 3UV2A 4NYXA 3SVGA 5DFBA 5FE5A 4LZ2A 3SVFA 4HBVA 4NRCA 5CQTA 5HQ7A 5EK9A 5HLSA 5EWVA 4UIVA 4Z93A 5ENBA 5LKUA 5I88A 5JI8A 4NYWA 5AMEA 3P1DA 4ALGA 5D7XA 5K29A 4QSPA 5LJ0A 4YADA 5CUDA 5FE8A 5AMFA 4PS5A 5LKTA 2F6JA 5D3HA 4A9HA 3MULA 5H85A 4BW4A 2I7KA 4J3IA 2R0YA 5D25A 5IGLA 1JM4B 3D7CA 4MR3A 5I1QA 5H1TA 2LSPB 4N4IA 4YABA 4YH3A 4LDFA 4ZQLA 5FBXA 3I3JA 4QNSA 4QYDA 4XY9A 4A9FA 4PKLA 5D3JA 5HFQA 5F5ZA 3Q2FA 5DLZA 3P5OA 5ETDA 4MR5A 5I86A 4ALHA 5CUGA 4MEPA 5CZGA 5CP5A 5E9KA 4XYAA 3S91A 4CLBA 5J0DA 3UVXA 2WP2A 5D3LA 5CUCA 4BHWA 4HXPA 5HCLA 2OSSA 5EPSA 4QEVA 4UYHA 5EA1A 2YEKA 4NR9A 4YYNA 2YYNA 4NR6A 4O77A 2YW5A 5A5QA 5CQ3A 4QY4A 3JVMA 4YYDA 3LJWA 3JVJA 4IR6A 5DKDA 5EV9A 5CQ8A 5DBMA 2GRCA 4QBMA 5CRZA 4E96A 5A82A 4HXSA 4TTEA 4CFLA 5BT3A 3O35A 4OGJA 5EPBA 5CY9A 3U5NA 2H60A 5ENCA 5DKCA 3ZYUA 4CUPA 4OUFA 3MXFA 4Z6IA 4A9JA 3JVKA 3UV5A 4ZC9A 3IU5A 4WHWA 4UYGA 4Y03A 5HM0A 5I80A 5EPRA 4CURA 3P1CA 5HQ6A 4Z6HA 4QSVA 3U5PA 2N9GA 4BW1A 5E9MA 5D24A 5EICA 2L85A 5ENEA 4XY8A 4YYMA 5COIA 3DAIA 4YK0A 5FE0A 5DLXA 5TB6A 4MEOA 4N3WA 2G4AA 4TT4A 4HBYA 5I29A 3MQMA 2E3KA 5ACYA 4A9EA 4NUEA 4YYGA 4KV1A 2OUOA 3LQJA 4WHUA 5DY7A 5CQ4A 5EISA 5FB1A 4UIUA 5ENJA 4LRGA 5FFWA 3O36A 4PCEA 5F62A 5I7XA 5KTXA 5LJ1A 5L96A 5FE6A 3AADA 4QSUA 3U5JA 3MB3A 5A5OA 3U5LA 5A7CA 2RO1A 4O74A 3K2JA 4IR5A 5F1LA 4MEQA 4QZSA 4XUBA 2FSAA 4QSXA 4IOQA 5DX4A 5LJ2A 5DW1A 4YBTA 2KTBB 5F25A 2I8NA 4CUSA 4UYFB 5FG4A 3LQHA 3HMEA 2D82A 5E9VA 4QR5A 2L5EA 5IIDA 4NR4A 4TZ8A 4LR6A 4TU4A 4A9IA 5HQ5A 4CUQA 4QSRA 4CL9A 5CQ7A 5ENHA 5FE4A 5F3AA 4IR3A 5IG6A 4HXRA 4NRAA 4DONA 4BW2A 4QC3A 4LZSA 5E9IA 2WP1A 4NS5A 2RNYA 5C7NA 4KCXA 5KTUA 5HELA 4OGIA 5DYCA 4QSQA 5HENA 5FH6A 2DVRA 5CQAA 3SVHA 4J1PA 4PY6A 1F68A 5HEMA 1N72A 4QEWA 1WUGA 5IBNA 4NQMA 5EP7A 2RFJA 5F63A 4YATA 3U5KA 5F61A 4GPJA 4CFKA 2DVSA 4Q0OA 5E3GA 4TYLA 5DYUA 2E7OA 2DVVA 4J0SA 4YBMA 3P1FA 3JVLA 5A5RA 4UIWA 5TCMA 4CUUA 5AD2A 3O37A 4UIXA 5FB0A 4O78A 5CUAA 4TU6A 3U5MA 5D3TA 4QSTA 4A9NA 5CU8A 4O7CA 2RNXA 4X2IA 4A9LA 5FE2A 4N4HA 5I7YA 4Z1QA 5ETBA 3UVYA 4Z1SA 4MR6A 4IOOA 4YAXA 5E9LA 3S92A 4NR8A 3LXJA 4LYIA 5EWCA 1E6IA 3UW9A 5CTLA 2DWWA 1JSPB 4MR4A 5L8TA 5HRVA 5I40A 5E74A 4AKNA 4O7EA 5II2A 4C67A 4MENA 4PTBA 3QZTA 4O72A 3DWYA 5FH7A 4N4GA 3UVWA 4O71A 4UIYA 5CPEA 5IGKA 4WIVA 5CUEA 5D3PA 5FG5A 5EWDA 5LKZA 2L84A 4NQNA 5D3NA 5E7DA 4C66A 3P1EA 5F1HA 2RS9B 4O75A 5F60A 4QSSA 5IGMA 4NR5A 4O7BA 5L98A 4QUTA 2OO1A 3GG3A 4PCIA 5EGUA 5FE3A 5D3SA 3RCWA 4IR4A 5C4QA 1EQFA 5FG6A 4F3IA 5D26A 4TT6A 3HMFA 4UYEA 5DYAA 5A85A 4YYKA 2RNWA 4XUAA 2DATA 5EM3A 5FE1A 4QC1A 5CS8A 5E3DA 2YQDA 5HJCA 5LKXA 4QUUA 5CRMA 5DFDA 5C87A 5ENIA 4A9OA 4HBWA 5E0RA 3Q2EA 3MB4A 4LZRA 4HBXA 4TQNA 4HXMA 4YY6A 4HXOA 5A83A 3G0LA 2YELA 3UVDA 3IU6A 2E7NA 5G4RA 2D9EA 5DW2A 4UYFA 5HRWA 5ENFA 4BW3A 4HXNA 4QR4A 4NRBA 3UV4A 5FFVA 2DKWA 4IORA 4A9KA 2MJVB 2R0SA 4O7FA 5DYXA 4NUCA 3G0JA 5KTWA 5KO4A 5FE7A 2YEMA 5LUUA 2YDWA 4J0RA 4YC9A 4QYLA 5DFCA 4NYVA 5C8GA 5LVRA 5EU1A 5KHMA 5BT4A 5D3RA 5H1UA 4FLPA 2R0VA 5F2PA 5L99A 4QSWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4YH4A 4YBSA 4LC2A 5JWMA 4NXJA 5L97A 4O7AA 5KU3A 4YYHA 4LYWA 5A5NA 3FKMX 3U5OA 4UYDA 5CUBA 4UITA 4UIZA 5FH8A 5EI4A 5H1VA 4RVRA 5FE9A 3LQIA 4O70A 4NUDA 5E73A 3QZSA 1ZS5A 2F6NA 5D0CA 2NXBA 5AD3A 5C89A 4A9MA 5EQ1A 5A5PA 3O33A 3QZVA 5E9YA 5HFRA 5CFWA 4HXKA 2R10A 3MUKA 4YYIA 5FFYA 3NXBA 5FDZA 4QB3A 1X0JA 4BJXA 5A5SA 5I83A 1WUMA 5EWHA 4YY4A 4TZ2A 5IGNA 5F36A 3O34A 3AQAA 3TLPA 4LYSA 2DVQA 4Q0NA 4TT2A 5ENGA 4KV4A 4HXLA 5I89A 4N4FA 5EWWA 5BT5A 5DKHA 5L8UA 4CUTA 4TS8A 5G4SA 5C85A 3ONIA 3HMHA 2RI7A 5CGPA 5CQ6A 4YYJA 5LVQA 5II1A 4NR7A 5CQ5A 4ZW1A 5HRXA 4O76A 5EVAA 4QEUA 4QR3A 5A81A 3UV2A 4NYXA 3SVGA 5DFBA 5FE5A 4LZ2A 3SVFA 4HBVA 4NRCA 5CQTA 5HQ7A 5EK9A 5HLSA 5EWVA 4UIVA 4Z93A 5ENBA 5LKUA 5I88A 5JI8A 4NYWA 5AMEA 3D1BA 3P1DA 2EJNA 4ALGA 5D7XA 5K29A 4QSPA 5LJ0A 4YADA 1ZKRA 5CUDA 5FE8A 5AMFA 4PS5A 5LKTA 2F6JA 5D3HA 4A9HA 3MULA 5H85A 4BW4A 2I7KA 4J3IA 2R0YA 5D25A 5IGLA 1JM4B 3D7CA 4MR3A 5I1QA 5H1TA 2LSPB 4N4IA 4YABA 4YH3A 4LDFA 4ZQLA 5FBXA 3I3JA 4QNSA 4QYDA 4XY9A 4A9FA 4PKLA 5D3JA 5HFQA 5F5ZA 3Q2FA 5DLZA 3P5OA 5ETDA 4MR5A 5I86A 4ALHA 5CUGA 4MEPA 5CZGA 5CP5A 5E9KA 4XYAA 3S91A 4CLBA 5J0DA 3UVXA 2WP2A 5D3LA 5CUCA 4BHWA 4HXPA 5HCLA 2OSSA 5EPSA 4QEVA 4UYHA 5EA1A 2YEKA 4NR9A 4YYNA 2YYNA 4NR6A 4O77A 2YW5A 5A5QA 5CQ3A 4QY4A 3JVMA 4YYDA 3LJWA 3JVJA 4IR6A 5DKDA 5EV9A 5CQ8A 5DBMA 2GRCA 4QBMA 5CRZA 4E96A 5A82A 4HXSA 4TTEA 4CFLA 5BT3A 3O35A 4OGJA 5EPBA 5CY9A 3U5NA 2H60A 3D1DA 5ENCA 5DKCA 4AI6A 3ZYUA 4CUPA 4OUFA 3MXFA 4Z6IA 4A9JA 3JVKA 3UV5A 4ZC9A 3IU5A 4WHWA 4UYGA 4Y03A 5HM0A 5I80A 1PUOA 5EPRA 4CURA 3P1CA 5HQ6A 4Z6HA 4QSVA 3U5PA 2N9GA 4BW1A 5E9MA 5D24A 5EICA 2L85A 5ENEA 4XY8A 4YYMA 3VKHA 5COIA 3DAIA 4YK0A 5FE0A 5DLXA 5TB6A 4MEOA 4N3WA 2G4AA 4TT4A 4HBYA 5I29A 3MQMA 2E3KA 5ACYA 4A9EA 4NUEA 4YYGA 4KV1A 2OUOA 3LQJA 4WHUA 5DY7A 5CQ4A 5EISA 5FB1A 4UIUA 5ENJA 4LRGA 5FFWA 3O36A 4PCEA 5F62A 5I7XA 5KTXA 5LJ1A 5L96A 4AKHA 5FE6A 3AADA 4QSUA 3U5JA 3MB3A 5A5OA 3U5LA 5A7CA 2RO1A 4O74A 3K2JA 4IR5A 5F1LA 4MEQA 4QZSA 4XUBA 2FSAA 4QSXA 4IOQA 5DX4A 5LJ2A 5DW1A 3VKGA 4YBTA 2KTBB 5F25A 2I8NA 4CUSA 4UYFB 5FG4A 3LQHA 3HMEA 2D82A 5E9VA 4QR5A 2L5EA 5IIDA 4NR4A 4TZ8A 4LR6A 4TU4A 4A9IA 5HQ5A 4CUQA 4QSRA 4CL9A 5CQ7A 5ENHA 5FE4A 5F3AA 4IR3A 5IG6A 4HXRA 4NRAA 4DONA 4BW2A 4QC3A 4LZSA 5E9IA 2WP1A 4NS5A 2RNYA 5C7NA 4KCXA 5KTUA 5HELA 4OGIA 5DYCA 4QSQA 5HENA 5FH6A 2DVRA 5CQAA 3SVHA 4J1PA 4PY6A 1F68A 5HEMA 1N72A 4QEWA 1WUGA 5IBNA 4NQMA 5EP7A 2RFJA 5F63A 4YATA 3U5KA 5F61A 4GPJA 4CFKA 2DVSA 4Q0OA 5E3GA 4TYLA 5DYUA 2E7OA 2DVVA 4J0SA 4YBMA 3P1FA 3JVLA 5A5RA 4UIWA 5TCMA 4CUUA 5AD2A 3O37A 4UIXA 5FB0A 4O78A 5CUAA 4TU6A 3U5MA 5D3TA 4QSTA 4A9NA 5CU8A 4O7CA 2RNXA 4X2IA 4A9LA 5FE2A 4N4HA 5I7YA 4Z1QA 5ETBA 3UVYA 4Z1SA 4MR6A 4IOOA 4YAXA 5E9LA 3S92A 4NR8A 3LXJA 4LYIA 5EWCA 1E6IA 3UW9A 5CTLA 2DWWA 1JSPB 4MR4A 5L8TA 5HRVA 5I40A 5E74A 4AKNA 4O7EA 5II2A 4C67A 4MENA 4PTBA 3QZTA 4O72A 3DWYA 5FH7A 4N4GA 3UVWA 4O71A 4UIYA 5CPEA 5IGKA 4WIVA 5CUEA 5D3PA 5FG5A 5EWDA 5LKZA 2L84A 4NQNA 5D3NA 5E7DA 4C66A 3P1EA 5F1HA 2RS9B 4O75A 5F60A 4QSSA 5IGMA 4NR5A 4O7BA 5L98A 4QUTA 2OO1A 3GG3A 4PCIA 5EGUA 5FE3A 5D3SA 3RCWA 4IR4A 5C4QA 1EQFA 5FG6A 4F3IA 5D26A 4TT6A 3HMFA 4UYEA 5DYAA 5A85A 4AKGA 4YYKA 2RNWA 4XUAA 2DATA 5EM3A 5FE1A 4QC1A 5CS8A 5E3DA 2YQDA 5HJCA 5LKXA 4QUUA 5CRMA 5DFDA 5C87A 5ENIA 4A9OA 4HBWA 5E0RA 3Q2EA 3MB4A 4LZRA 4HBXA 4TQNA 4HXMA 4YY6A 4HXOA 5A83A 3G0LA 2YELA 3UVDA 3IU6A 2E7NA 5G4RA 2D9EA 5DW2A 4UYFA 5HRWA 5ENFA 4BW3A 4HXNA 4QR4A 4NRBA 3UV4A 5FFVA 2DKWA 4IORA 4A9KA 2MJVB 2R0SA 4O7FA 5DYXA 4NUCA 3G0JA 5KTWA 5KO4A 5FE7A 2YEMA 5LUUA 2YDWA 4J0RA 4YC9A 4QYLA 3ERRA 5DFCA 4NYVA 5C8GA 5LVRA 5EU1A 5KHMA 5BT4A 4AKIA 5D3RA 5H1UA 4FLPA 2R0VA 5F2PA 5L99A 4QSWA
chains in the Genus database with same CATH topology
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