4CL9A

N-terminal bromodomain of human brd4 with i-bet295
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription
molecule keywords BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 4
publication title The Structure Based Design of Dual Hdac/Bet Inhibitors as Novel Epigenetic Probes.
doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 43
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4cl9A01
5D0CA 4BJXA 4LR6A 4CFKA 4HXOA 2D82A 4Z1SA 5DLZA 4A9FA 5FFYA 4LC2A 5F1LA 3QZTA 2DKWA 5I7YA 3QZSA 5E3DA 4YK0A 5HELA 5TB6A 4YY4A 3U5KA 5FH7A 4QSXA 4F3IA 5E73A 4LRGA 4YY6A 5L99A 5CQAA 3O35A 4GPJA 5I1QA 5L97A 4IR3A 5DX4A 4UIVA 3IU5A 4MEOA 4NYVA 5CUEA 4YYGA 3G0JA 2MJVB 5ETDA 3GG3A 5FE9A 4ZQLA 4N4IA 3I3JA 2E3KA 2YELA 5CUBA 5D3TA 4A9MA 4NR4A 4O76A 4NS5A 5TCMA 3LQHA 5C4QA 4YH4A 3SVGA 4LDFA 3UVXA 4PCEA 4N4GA 2R0YA 4DONA 5LJ1A 5DBMA 3ONIA 4OGIA 4UIUA 5LUUA 3G0LA 3O36A 4YAXA 5A5OA 5F63A 5CZGA 4TTEA 4BW2A 5EK9A 2L84A 5II2A 5EWCA 4TZ2A 5I7XA 5D3LA 4YBMA 4YC9A 5A83A 4HXRA 5I29A 5CQTA 4NR6A 5D3JA 3U5JA 5L8UA 5CS8A 4BW3A 5FDZA 4CUTA 2I7KA 5COIA 4BW1A 5CY9A 5ENIA 2RFJA 5JWMA 4YABA 4IR5A 5CPEA 5A7CA 5K29A 4MR5A 5HJCA 1WUGA 5LKTA 2DWWA 2E7NA 5HRVA 4UYHA 3NXBA 4HXSA 4FLPA 1JM4B 4CUSA 5IGNA 4NUEA 4MEPA 4QB3A 5EWHA 4MENA 5LKUA 2F6JA 4OUFA 5CU8A 4C66A 5EPSA 5FE3A 4A9KA 5HQ6A 4C67A 4O71A 4LZRA 4NYXA 4XUBA 5IIDA 4TYLA 4QSWA 2LSPB 4HXLA 4NUDA 4O75A 5KHMA 2N9GA 5D26A 5II1A 4IOQA 3D7CA 5I89A 4QC1A 4Z6HA 2R10A 5ENBA 4LZSA 3AQAA 5I88A 5DKDA 5FB0A 5DLXA 5E9VA 4PY6A 5CQ8A 5HLSA 3UW9A 4TS8A 4YYNA 4A9EA 5C87A 4HBYA 2YEMA 3U5NA 2I8NA 3O33A 5HQ5A 5EQ1A 5EU1A 5ENCA 5EWDA 5F36A 1N72A 4J3IA 2OSSA 5E9IA 4O7FA 3S92A 3O37A 2D9EA 4NRCA 5FG6A 5DYXA 4UYEA 5L8TA 4Q0OA 4OGJA 3U5PA 4QSTA 5FH6A 5CGPA 5CUCA 1X0JA 4KCXA 5C8GA 3U5OA 4YH3A 2RI7A 4MR4A 4HXPA 5C7NA 4UIWA 5HEMA 4A9HA 4QZSA 3LJWA 5E0RA 5FH8A 5I80A 4XY8A 4XUAA 5D3PA 5FBXA 5ACYA 4CUQA 3MXFA 5F2PA 5LKZA 4X2IA 5LJ0A 5EP7A 3MB4A 3LXJA 5FG4A 2DVRA 4HBWA 5A5QA 5LKXA 4QEVA 5HENA 5JI8A 5E7DA 3DWYA 2YW5A 4QSPA 5HM0A 4KV1A 4LZ2A 4CLBA 5D3NA 5ENGA 2GRCA 5LVRA 4UYFA 5AMFA 4YYKA 5I83A 5FE4A 2KTBB 3DAIA 5C85A 3K2JA 4UYFB 5D7XA 2OO1A 4A9IA 5HCLA 2R0VA 3JVJA 4A9NA 4QYDA 4TT2A 5FB1A 4PCIA 5H1VA 5EVAA 5FG5A 2YDWA 4QYLA 5LVQA 4TU6A 5EM3A 1ZS5A 2NXBA 4HXNA 5CUAA 3O34A 4HBVA 3P1DA 5CQ7A 5BT5A 4YBTA 2WP1A 1F68A 5HRXA 1JSPB 3HMEA 5CRMA 5DY7A 3SVHA 4N3WA 2RO1A 4WHUA 4ALGA 5L98A 5HQ7A 4PTBA 5A5NA 3JVMA 4YYJA 4O7AA 2G4AA 4IR6A 3HMFA 4QBMA 4CUPA 4NRBA 4QUTA 4NR7A 2L85A 5J0DA 5E3GA 5A82A 4PKLA 4NR9A 4ZC9A 4CUUA 4YYMA 4O78A 5DYAA 4J1PA 5L96A 5CTLA 4UIXA 5AD2A 2RNXA 3QZVA 3S91A 1EQFA 4NRAA 5HRWA 4O72A 5G4RA 2E7OA 2YEKA 5A85A 4CFLA 5EISA 5A5SA 5CUDA 5BT3A 5D25A 5HFRA 5KU3A 3JVKA 4MR3A 4NQMA 3JVLA 2L5EA 5D3SA 5DFDA 5HFQA 4CURA 3UV5A 3MQMA 4WHWA 4YYIA 3Q2FA 3UVWA 4UYGA 5F1HA 4QR3A 4QSUA 4A9JA 2YQDA 5DYCA 4NQNA 5D3HA 4YBSA 2RNWA 5IGLA 4MEQA 4UIYA 3RCWA 5E9KA 5EWVA 3Q2EA 5IG6A 5A5PA 2DVVA 3HMHA 4UIZA 5FE8A 4HBXA 1E6IA 4UITA 5CFWA 4WIVA 5EWWA 3UV4A 4ALHA 4IR4A 4NR5A 4QSVA 4KV4A 4XY9A 5LJ2A 4NXJA 4TZ8A 4BW4A 5F3AA 3P5OA 4YADA 3UVYA 5A5RA 5FE7A 4QSQA 3AADA 5ENJA 5E9LA 2YYNA 5BT4A 2DVSA 5IGMA 3MUKA 5F60A 5KTUA 4QC3A 4A9LA 4Z1QA 3P1CA 5CQ4A 4QR5A 5EPRA 2H60A 3MB3A 5H85A 2DATA 5AMEA 3ZYUA 5CQ5A 3P1FA 5A81A 1WUMA 4QEUA 4NUCA 4O7BA 5DW1A 5F62A 5EPBA 4O7EA 4XYAA 4QUUA 2WP2A 2RS9B 4CL9A 5H1UA 4E96A 5EI4A 5IBNA 4N4FA 4YATA 4O70A 4N4HA 5DKHA 3P1EA 5AD3A 4QSSA 4Z6IA 5F5ZA 3U5MA 5CUGA 5E9YA 2RNYA 5FE1A 5DYUA 5FFVA 5FE0A 3MULA 5E9MA 2R0SA 5CP5A 4TT4A 5CQ3A 5EV9A 4HXMA 5DW2A 5CRZA 5KTWA 4IORA 4A9OA 4LYIA 3LQIA 3IU6A 4O7CA 5ENFA 5C89A 4QSRA 4LYWA 4NYWA 5G4SA 5DKCA 4IOOA 5F61A 5FE6A 5ENEA 5KO4A 5H1TA 5I40A 4QY4A 3UV2A 3LQJA 4TU4A 4O74A 5EA1A 5FE2A 3UVDA 5ETBA 3FKMX 5FE5A 4AKNA 4O77A 5E74A 2FSAA 4TQNA 5EGUA 5IGKA 4J0SA 4QEWA 4YYHA 2DVQA 2OUOA 5FFWA 5D3RA 4QNSA 5ENHA 3SVFA 4NR8A 4MR6A 4Q0NA 2F6NA 5EICA 5D24A 4LYSA 5DFCA 4Y03A 3TLPA 4TT6A 5F25A 5CQ6A 5I86A 4UYDA 5KTXA 4HXKA 4RVRA 4Z93A 4J0RA 4BHWA 4ZW1A 4PS5A 4YYDA 5DFBA 3U5LA 4QR4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5D0CA 4BJXA 4LR6A 4CFKA 4HXOA 2D82A 4Z1SA 5DLZA 4A9FA 5FFYA 4LC2A 5F1LA 3QZTA 2DKWA 5I7YA 3QZSA 5E3DA 4YK0A 5HELA 5TB6A 4YY4A 3U5KA 5FH7A 4QSXA 4F3IA 5E73A 4LRGA 4YY6A 5L99A 5CQAA 3O35A 4GPJA 5I1QA 5L97A 4IR3A 5DX4A 4UIVA 3IU5A 4MEOA 4NYVA 5CUEA 4YYGA 3G0JA 2MJVB 5ETDA 3GG3A 5FE9A 4ZQLA 4N4IA 3I3JA 2E3KA 2YELA 5CUBA 5D3TA 4A9MA 4NR4A 4O76A 4NS5A 5TCMA 3LQHA 5C4QA 4YH4A 3SVGA 4LDFA 3UVXA 3D1BA 4PCEA 4N4GA 2R0YA 4DONA 5LJ1A 5DBMA 3ONIA 4OGIA 4UIUA 5LUUA 3G0LA 3O36A 4YAXA 5A5OA 5F63A 5CZGA 4TTEA 4BW2A 5EK9A 2L84A 5II2A 5EWCA 4TZ2A 5I7XA 5D3LA 4YBMA 4YC9A 5A83A 4HXRA 5I29A 5CQTA 4NR6A 5D3JA 3U5JA 5L8UA 5CS8A 4BW3A 5FDZA 4CUTA 2I7KA 5COIA 4BW1A 5CY9A 5ENIA 2RFJA 5JWMA 4YABA 4IR5A 5CPEA 5A7CA 5K29A 4MR5A 5HJCA 1WUGA 5LKTA 2DWWA 2E7NA 5HRVA 4UYHA 3NXBA 4HXSA 4FLPA 1JM4B 4CUSA 5IGNA 4NUEA 4MEPA 4QB3A 5EWHA 4MENA 5LKUA 2F6JA 4OUFA 5CU8A 4C66A 5EPSA 5FE3A 4A9KA 5HQ6A 4C67A 4O71A 4LZRA 4NYXA 4XUBA 5IIDA 4TYLA 4QSWA 2LSPB 4HXLA 4NUDA 4O75A 5KHMA 2N9GA 5D26A 5II1A 4IOQA 3D7CA 5I89A 4QC1A 4Z6HA 2R10A 5ENBA 3VKGA 4LZSA 3AQAA 5I88A 5DKDA 5FB0A 5DLXA 5E9VA 4PY6A 5CQ8A 5HLSA 3UW9A 4TS8A 4YYNA 4A9EA 5C87A 4HBYA 4AKIA 2YEMA 3U5NA 2I8NA 3O33A 5HQ5A 5EQ1A 5EU1A 5ENCA 5EWDA 5F36A 1N72A 4J3IA 2OSSA 5E9IA 4O7FA 3S92A 3O37A 2D9EA 4NRCA 5FG6A 5DYXA 4UYEA 5L8TA 4Q0OA 4OGJA 3U5PA 4QSTA 5FH6A 5CGPA 5CUCA 1X0JA 4KCXA 5C8GA 3U5OA 4YH3A 2RI7A 4MR4A 4HXPA 5C7NA 4UIWA 1ZKRA 5HEMA 4A9HA 4AKHA 4QZSA 3LJWA 5E0RA 5FH8A 5I80A 4XY8A 4XUAA 5D3PA 5FBXA 5ACYA 4CUQA 3MXFA 5F2PA 5LKZA 4X2IA 5LJ0A 5EP7A 3MB4A 3LXJA 5FG4A 2DVRA 4HBWA 5A5QA 5LKXA 4QEVA 5HENA 5JI8A 5E7DA 3DWYA 2YW5A 4QSPA 5HM0A 4KV1A 4LZ2A 4CLBA 5D3NA 5ENGA 2GRCA 5LVRA 4UYFA 5AMFA 4YYKA 5I83A 5FE4A 2KTBB 3DAIA 5C85A 3K2JA 4UYFB 5D7XA 2OO1A 4A9IA 5HCLA 2R0VA 3JVJA 4A9NA 4QYDA 4TT2A 5FB1A 4PCIA 5H1VA 5EVAA 5FG5A 2YDWA 4QYLA 5LVQA 4TU6A 5EM3A 1ZS5A 2NXBA 4HXNA 4AKGA 5CUAA 3O34A 4HBVA 3P1DA 5CQ7A 5BT5A 4YBTA 2WP1A 1F68A 5HRXA 1JSPB 3HMEA 5CRMA 5DY7A 3SVHA 4N3WA 2RO1A 4WHUA 4ALGA 5L98A 5HQ7A 4PTBA 5A5NA 3JVMA 4YYJA 4O7AA 2G4AA 4IR6A 3HMFA 4QBMA 4CUPA 4NRBA 4QUTA 4NR7A 2L85A 5J0DA 5E3GA 5A82A 4PKLA 4NR9A 4ZC9A 4CUUA 4YYMA 4O78A 5DYAA 4J1PA 5L96A 5CTLA 4UIXA 5AD2A 2RNXA 3QZVA 3S91A 1EQFA 4NRAA 5HRWA 4O72A 5G4RA 2E7OA 1PUOA 2YEKA 5A85A 4CFLA 5EISA 5A5SA 5CUDA 5BT3A 5D25A 5HFRA 5KU3A 3JVKA 4MR3A 4NQMA 3JVLA 2L5EA 5D3SA 5DFDA 5HFQA 4CURA 3UV5A 3MQMA 4WHWA 4YYIA 3Q2FA 3UVWA 4UYGA 5F1HA 4QR3A 4QSUA 4A9JA 2YQDA 5DYCA 4NQNA 5D3HA 4YBSA 2RNWA 5IGLA 4MEQA 4UIYA 3RCWA 5E9KA 5EWVA 3Q2EA 5IG6A 5A5PA 2DVVA 3HMHA 3ERRA 4UIZA 4HBXA 1E6IA 5FE8A 4UITA 5CFWA 4WIVA 5EWWA 3UV4A 4ALHA 4IR4A 4NR5A 4QSVA 4KV4A 4XY9A 5LJ2A 4NXJA 4TZ8A 4BW4A 5F3AA 3P5OA 4YADA 3UVYA 5A5RA 5FE7A 4QSQA 3AADA 5ENJA 5E9LA 2YYNA 5BT4A 2DVSA 5IGMA 3MUKA 5F60A 5KTUA 4QC3A 4A9LA 4Z1QA 3P1CA 5CQ4A 4QR5A 5EPRA 2H60A 3MB3A 5H85A 2DATA 5AMEA 3ZYUA 5CQ5A 3P1FA 5A81A 1WUMA 4QEUA 4NUCA 4O7BA 5DW1A 5F62A 5EPBA 4O7EA 4XYAA 4QUUA 2WP2A 2RS9B 4CL9A 5H1UA 4E96A 5EI4A 5IBNA 4N4FA 4YATA 4O70A 4N4HA 5DKHA 3P1EA 5AD3A 4QSSA 4Z6IA 5F5ZA 3U5MA 5CUGA 5E9YA 2RNYA 5FE1A 5DYUA 5FFVA 5FE0A 3MULA 5E9MA 2R0SA 5CP5A 4TT4A 5CQ3A 5EV9A 4HXMA 5DW2A 5CRZA 5KTWA 4IORA 4A9OA 4LYIA 3LQIA 3IU6A 4O7CA 5ENFA 5C89A 4QSRA 4LYWA 4NYWA 5G4SA 5DKCA 4IOOA 3VKHA 5F61A 5FE6A 5ENEA 5KO4A 5H1TA 5I40A 4QY4A 3UV2A 3LQJA 4TU4A 4O74A 5EA1A 5FE2A 3UVDA 5ETBA 3FKMX 5FE5A 4AI6A 4AKNA 4O77A 5E74A 3D1DA 2FSAA 4TQNA 5EGUA 5IGKA 4J0SA 4QEWA 2EJNA 4YYHA 2DVQA 2OUOA 5FFWA 5D3RA 4QNSA 5ENHA 3SVFA 4NR8A 4MR6A 4Q0NA 2F6NA 5EICA 4LYSA 5D24A 5DFCA 4Y03A 3TLPA 4TT6A 5F25A 5CQ6A 5I86A 4UYDA 5KTXA 4HXKA 4RVRA 4Z93A 4J0RA 4BHWA 4ZW1A 4PS5A 4YYDA 5DFBA 3U5LA 4QR4A
chains in the Genus database with same CATH topology
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