4X2IA

Discovery of benzotriazolo diazepines as orally-active inhibitors of bet bromodomains: crystal structure of brd4 with cpi-13
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
126
structure length
126
Chain Sequence
GSTNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
source organism Homo sapiens
publication title Discovery of Benzotriazolo[4,3-d][1,4]diazepines as Orally Active Inhibitors of BET Bromodomains.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
total genus 41
structure length 126
sequence length 126
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4x2iA01
3UW9A 5JI8A 5E9IA 2OUOA 5HELA 5IG6A 4TZ8A 4BW1A 4IR3A 4BW2A 4IOOA 4RVRA 4QSSA 2YYNA 5EPRA 3O35A 5D3SA 5I86A 4NUEA 4PTBA 3UVDA 5C7NA 3D7CA 5CRMA 5DKHA 4NYXA 4TT6A 4O7AA 4Q0NA 5KTWA 5KTXA 2WP1A 4N4HA 4QSRA 5DYAA 5E3GA 2GRCA 4CUUA 3U5LA 2L85A 5ENBA 3RCWA 5E7DA 5FE9A 4NR5A 5CQ8A 4O74A 4MEPA 4A9IA 4PS5A 3Q2EA 5D3TA 5DYXA 4QUTA 5F25A 4QEUA 5ENCA 5L8UA 4HBWA 4ZQLA 5E0RA 5LKUA 3S92A 4TYLA 4NS5A 4LDFA 4UITA 5G4RA 5CGPA 4CUTA 4HBXA 5LVQA 4KCXA 3MQMA 4PY6A 3AADA 4IR6A 5L98A 2YELA 2H60A 2YEKA 3HMFA 5CTLA 3UV5A 4NUCA 5HQ5A 3G0JA 5CUEA 5CUAA 5ENFA 5II1A 4QR3A 4QR5A 5F36A 3SVHA 3NXBA 4YBTA 3U5PA 4YYIA 2E7OA 4N4IA 4NR9A 3O34A 5FE8A 2FSAA 4NQMA 5A82A 4QSUA 4XUBA 4YYKA 5A5PA 4PCEA 4XY8A 5L96A 2OO1A 5HRVA 3U5KA 1N72A 5A5NA 4OGJA 3SVFA 3FKMX 5DFCA 4KV1A 4QB3A 5EWDA 4NR8A 5EV9A 4N3WA 4MEQA 5EU1A 5H85A 5HFRA 5EPSA 5CQ5A 5HENA 5DBMA 5EWHA 5DKCA 2WP2A 4O7EA 5ETDA 5LUUA 3LQJA 5CQ6A 2N9GA 5HQ7A 2YW5A 4YY6A 5CQ7A 4HXSA 5LKZA 3LXJA 4QC1A 5CY9A 4HXOA 2RI7A 5KTUA 2L84A 2OSSA 5IBNA 4UIVA 4NRAA 3LJWA 4NR6A 5FB1A 5LJ0A 3O37A 4QZSA 4ALHA 5D7XA 5CZGA 4CURA 5LJ1A 5HCLA 5CQTA 3P5OA 4O70A 4NR7A 3UV4A 5ACYA 5E9LA 3TLPA 4QSVA 4HXRA 5I83A 4Y03A 5A5SA 2E7NA 4QYLA 5FG4A 4UYEA 2E3KA 2G4AA 3DAIA 4A9OA 4E96A 5F1LA 2I8NA 3JVLA 5I80A 4A9MA 5F5ZA 5EPBA 3U5NA 4O76A 5BT4A 5CUDA 4TT4A 4OGIA 5E9MA 4QBMA 5HQ6A 4O72A 4A9EA 5FE6A 5F60A 4O7FA 4HXMA 4O75A 2L5EA 5A7CA 5FE7A 5FFWA 4YATA 5D3LA 5CRZA 3JVMA 4QNSA 2KTBB 5E74A 5CPEA 5A85A 4TQNA 3U5OA 4FLPA 5CUGA 5FBXA 5F62A 5FH7A 4YYDA 2RNXA 4HBYA 5LJ2A 4YYHA 2RNYA 4HXNA 4MR6A 4A9LA 5KO4A 5C87A 5HEMA 5II2A 4Z6IA 4GPJA 5TB6A 1WUGA 4LZSA 3LQIA 2DVRA 2F6NA 4OUFA 5G4SA 3K2JA 5KHMA 4YYJA 5LVRA 5I29A 4LYSA 5C4QA 4AKNA 5C8GA 5EI4A 4UYDA 5E3DA 3U5JA 5H1VA 5AD2A 2DVSA 5ENHA 3UVWA 4NR4A 5H1TA 4J0SA 4O77A 5HFQA 5AMFA 4O7BA 4IR5A 4UYFB 5CU8A 1F68A 3P1DA 4TU6A 4XYAA 5FG5A 4J1PA 4TU4A 4CL9A 4QUUA 5HLSA 5EP7A 4A9KA 1X0JA 3HMHA 4LYWA 5E9VA 5CP5A 2RFJA 4UIXA 2F6JA 4PKLA 3P1EA 5CFWA 5C89A 4YABA 2D82A 4N4FA 4YH4A 4LR6A 5CUCA 5F63A 5L99A 5DLZA 4DONA 5A83A 5BT5A 5CUBA 3I3JA 4A9JA 4BW4A 3LQHA 5EWVA 5HJCA 4QSXA 5EWWA 3UVYA 5BT3A 4Q0OA 4Z1SA 5F61A 4CUPA 5LKXA 3JVJA 4O7CA 5H1UA 4O71A 1EQFA 5F2PA 4UYHA 4YH3A 5E9YA 5EISA 3S91A 4BJXA 3O36A 4QYDA 4MEOA 2R0YA 4HXPA 4NQNA 5A81A 5FE1A 4KV4A 3ZYUA 4ALGA 4CFLA 5ENEA 5FH8A 4QR4A 2I7KA 4NUDA 5D3JA 2DVQA 5IGKA 3P1CA 5FFYA 4BW3A 4HBVA 5L97A 5K29A 3QZTA 5EQ1A 4NYWA 5DFBA 2D9EA 4YBMA 4C67A 5FE2A 4YYNA 5I89A 5CQ4A 2DATA 5D3HA 4IR4A 5EK9A 4QC3A 5CQAA 4MR3A 5D0CA 1JSPB 5D3NA 3P1FA 4BHWA 4YAXA 5DW2A 5FH6A 5IIDA 3U5MA 4UIWA 3MULA 5IGLA 4MENA 4CUSA 4TZ2A 5LKTA 5F3AA 4QSWA 4NRBA 4XUAA 5DY7A 5EGUA 5D3RA 5HM0A 4QEWA 5TCMA 2RNWA 5DLXA 4LC2A 3UV2A 4MR4A 4CFKA 5JWMA 1WUMA 3SVGA 5FE4A 5I88A 4NXJA 4WHWA 5EA1A 3QZSA 3MB3A 4ZC9A 5AMEA 4YC9A 4TS8A 5DW1A 5J0DA 3MXFA 5HRWA 5DFDA 3HMEA 5FDZA 4LYIA 4HXLA 3O33A 4QSTA 4HXKA 4YK0A 4A9NA 5I7XA 4QSPA 4F3IA 3GG3A 5DYCA 5C85A 4UYGA 5D26A 4ZW1A 4LZRA 4XY9A 3MUKA 4Z93A 5FE0A 4NYVA 5FFVA 4CUQA 5F1HA 5A5RA 3Q2FA 5FE5A 2RO1A 5ENGA 5FG6A 2DVVA 4J3IA 5EVAA 3G0LA 5EICA 2NXBA 2RS9B 5COIA 5I7YA 5E73A 2YQDA 2MJVB 4YYGA 2LSPB 2R10A 1ZS5A 4PCIA 4CLBA 5D25A 4IORA 4YYMA 4LRGA 4A9HA 2R0VA 3IU6A 5KU3A 3UVXA 5EM3A 3DWYA 4YADA 1JM4B 4NRCA 1E6IA 4UIZA 3JVKA 4C66A 5AD3A 4YBSA 5IGMA 4O78A 5FE3A 4MR5A 5L8TA 5CS8A 5A5QA 5DX4A 5DKDA 2R0SA 3ONIA 4YY4A 3QZVA 3MB4A 5ETBA 4WHUA 2YDWA 5ENIA 4TT2A 4UIUA 4QSQA 5HRXA 5D3PA 4TTEA 4IOQA 4UIYA 5DYUA 3AQAA 5D24A 5EWCA 4X2IA 4Z6HA 4LZ2A 5IGNA 2YEMA 5ENJA 2DKWA 4UYFA 4QY4A 4WIVA 4A9FA 5CQ3A 5FB0A 4QEVA 5A5OA 4N4GA 5I1QA 5E9KA 4Z1QA 5I40A 3IU5A 2DWWA 4J0RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UW9A 5JI8A 5E9IA 2OUOA 5HELA 5IG6A 4TZ8A 4BW1A 4IR3A 4BW2A 4IOOA 4RVRA 4QSSA 2YYNA 5EPRA 3O35A 5D3SA 5I86A 4NUEA 4PTBA 3UVDA 5C7NA 3D7CA 5CRMA 5DKHA 4NYXA 4TT6A 4O7AA 4Q0NA 5KTWA 5KTXA 2WP1A 4N4HA 4QSRA 5DYAA 5E3GA 2GRCA 4CUUA 3U5LA 2L85A 3D1BA 5ENBA 3RCWA 5E7DA 5FE9A 4NR5A 5CQ8A 4O74A 4MEPA 4A9IA 4PS5A 3Q2EA 5D3TA 5DYXA 4QUTA 5F25A 4QEUA 5ENCA 5L8UA 4HBWA 4ZQLA 5E0RA 5LKUA 4AKGA 3S92A 4TYLA 4NS5A 4LDFA 4UITA 5G4RA 5CGPA 4CUTA 4HBXA 5LVQA 4KCXA 3MQMA 4PY6A 3AADA 4IR6A 5L98A 2YELA 2H60A 2YEKA 3HMFA 5CTLA 3UV5A 4NUCA 5HQ5A 3G0JA 5CUEA 5CUAA 5ENFA 3ERRA 5II1A 4QR3A 4QR5A 5F36A 3SVHA 3NXBA 4YBTA 3U5PA 4YYIA 2E7OA 4N4IA 4NR9A 3O34A 5FE8A 2FSAA 4NQMA 5A82A 4QSUA 4XUBA 4YYKA 5A5PA 4PCEA 4XY8A 5L96A 2OO1A 5HRVA 3U5KA 1N72A 5A5NA 4OGJA 3SVFA 3FKMX 5DFCA 4KV1A 4QB3A 5EWDA 4NR8A 5EV9A 4N3WA 4MEQA 5EU1A 5H85A 5HFRA 5EPSA 5CQ5A 5HENA 5DBMA 5EWHA 5DKCA 2WP2A 4O7EA 5ETDA 5LUUA 3LQJA 5CQ6A 2N9GA 5HQ7A 2YW5A 4YY6A 5CQ7A 4HXSA 5LKZA 3D1DA 3LXJA 4QC1A 5CY9A 4HXOA 2RI7A 5KTUA 2L84A 2OSSA 5IBNA 4UIVA 4NRAA 3LJWA 4NR6A 5FB1A 5LJ0A 3O37A 4QZSA 4ALHA 5D7XA 5CZGA 4CURA 5LJ1A 5HCLA 5CQTA 3VKGA 3P5OA 4O70A 4NR7A 3UV4A 5ACYA 5E9LA 3TLPA 4QSVA 4HXRA 5I83A 4Y03A 5A5SA 2E7NA 4QYLA 5FG4A 4UYEA 2E3KA 2G4AA 3DAIA 4A9OA 4E96A 5F1LA 2I8NA 3JVLA 5I80A 4A9MA 5F5ZA 5EPBA 3U5NA 4O76A 5BT4A 5CUDA 4TT4A 4OGIA 5E9MA 4QBMA 5HQ6A 4O72A 4A9EA 5FE6A 5F60A 4O7FA 4HXMA 4O75A 2L5EA 5A7CA 5FE7A 5FFWA 4YATA 5D3LA 5CRZA 3JVMA 4QNSA 2KTBB 5E74A 5CPEA 5A85A 4TQNA 3U5OA 4FLPA 5CUGA 5FBXA 5F62A 5FH7A 4YYDA 2RNXA 4HBYA 5LJ2A 4YYHA 2RNYA 4HXNA 4MR6A 4A9LA 5KO4A 5C87A 5HEMA 5II2A 4Z6IA 4GPJA 5TB6A 1WUGA 4LZSA 3LQIA 2DVRA 2F6NA 4OUFA 5G4SA 3K2JA 5KHMA 4YYJA 5LVRA 5I29A 4LYSA 5C4QA 4AKNA 5C8GA 5EI4A 4UYDA 5E3DA 3U5JA 5H1VA 5AD2A 2DVSA 5ENHA 3UVWA 4NR4A 5H1TA 4J0SA 4O77A 5HFQA 5AMFA 4O7BA 4IR5A 4UYFB 5CU8A 1F68A 3P1DA 4TU6A 4XYAA 5FG5A 4J1PA 4TU4A 4CL9A 4QUUA 5HLSA 5EP7A 4A9KA 1X0JA 3HMHA 4LYWA 5E9VA 5CP5A 2RFJA 4UIXA 2F6JA 4PKLA 3P1EA 5CFWA 5C89A 4YABA 2D82A 4N4FA 4YH4A 4LR6A 5CUCA 5F63A 5L99A 5DLZA 4DONA 5A83A 5BT5A 5CUBA 3I3JA 4A9JA 4BW4A 3LQHA 5EWVA 5HJCA 4QSXA 5EWWA 3UVYA 5BT3A 4Q0OA 4Z1SA 5F61A 4CUPA 5LKXA 3JVJA 4O7CA 5H1UA 4O71A 1EQFA 5F2PA 4UYHA 4YH3A 5E9YA 5EISA 3S91A 4BJXA 3O36A 4QYDA 4MEOA 2R0YA 4HXPA 4NQNA 5A81A 5FE1A 4KV4A 3ZYUA 4ALGA 4CFLA 5ENEA 5FH8A 4QR4A 2I7KA 4NUDA 5D3JA 2DVQA 5IGKA 3P1CA 5FFYA 4BW3A 4HBVA 5L97A 5K29A 3QZTA 5EQ1A 2EJNA 4NYWA 5DFBA 2D9EA 4YBMA 4C67A 5FE2A 4YYNA 5I89A 4AKHA 4AKIA 5CQ4A 2DATA 5D3HA 4IR4A 5EK9A 4QC3A 5CQAA 4MR3A 5D0CA 1JSPB 5D3NA 1PUOA 3P1FA 4AI6A 4BHWA 4YAXA 5DW2A 5FH6A 5IIDA 3U5MA 4UIWA 3MULA 5IGLA 4MENA 4CUSA 4TZ2A 5LKTA 5F3AA 4QSWA 4NRBA 4XUAA 5DY7A 5EGUA 5D3RA 5HM0A 4QEWA 5TCMA 2RNWA 5DLXA 4LC2A 3UV2A 4MR4A 4CFKA 5JWMA 1WUMA 3SVGA 5FE4A 5I88A 4NXJA 4WHWA 5EA1A 3QZSA 3MB3A 4ZC9A 5AMEA 4YC9A 4TS8A 5DW1A 5J0DA 3MXFA 5HRWA 5DFDA 3HMEA 5FDZA 4LYIA 4HXLA 3O33A 4QSTA 4HXKA 4YK0A 4A9NA 5I7XA 4QSPA 4F3IA 3GG3A 5DYCA 5C85A 4UYGA 5D26A 4ZW1A 4LZRA 4XY9A 3MUKA 4Z93A 5FE0A 4NYVA 5FFVA 4CUQA 5F1HA 1ZKRA 5A5RA 3Q2FA 5FE5A 2RO1A 5ENGA 5FG6A 2DVVA 4J3IA 5EVAA 3G0LA 5EICA 2NXBA 2RS9B 5COIA 5I7YA 5E73A 2YQDA 2MJVB 4YYGA 2LSPB 2R10A 1ZS5A 4PCIA 4CLBA 5D25A 4IORA 4YYMA 4LRGA 4A9HA 2R0VA 3IU6A 5KU3A 3UVXA 5EM3A 3DWYA 4YADA 1JM4B 4NRCA 1E6IA 4UIZA 3JVKA 4C66A 5AD3A 4YBSA 5IGMA 4O78A 5FE3A 4MR5A 5L8TA 5CS8A 5A5QA 5DX4A 5DKDA 2R0SA 3ONIA 3VKHA 4YY4A 3QZVA 3MB4A 5ETBA 4WHUA 2YDWA 5ENIA 4TT2A 4UIUA 4QSQA 5HRXA 5D3PA 4TTEA 4IOQA 4UIYA 5DYUA 3AQAA 5D24A 5EWCA 4X2IA 4Z6HA 4LZ2A 5IGNA 2YEMA 5ENJA 2DKWA 4UYFA 4QY4A 4WIVA 4A9FA 5CQ3A 5FB0A 4QEVA 5A5OA 4N4GA 5I1QA 5E9KA 4Z1QA 5I40A 3IU5A 2DWWA 4J0RA
chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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