4X2IA

Discovery of benzotriazolo diazepines as orally-active inhibitors of bet bromodomains: crystal structure of brd4 with cpi-13
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
126
structure length
126
Chain Sequence
GSTNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Discovery of Benzotriazolo[4,3-d][1,4]diazepines as Orally Active Inhibitors of BET Bromodomains.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 126
sequence length 126
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-11-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4x2iA01
4UIXA 4ALGA 4TT2A 5E9LA 4YYNA 4YYMA 5BT5A 5DLXA 4QSUA 4CURA 4NR4A 4ZQLA 4YH3A 5TCMA 4J0SA 5CPEA 2RFJA 4F3IA 5EP7A 5ENCA 5A5QA 4YBMA 3P1EA 4UIYA 3JVLA 3UVDA 4HXRA 5A5PA 3AQAA 3QZSA 5D26A 4ZW1A 5DKDA 4QSVA 5D0CA 4UIVA 5D3JA 3U5OA 5EPSA 5FE9A 3HMHA 4NR8A 5CQAA 4OUFA 2YW5A 3MULA 4LYWA 4HXKA 5IGNA 5LJ2A 3LQHA 5L98A 3QZTA 5EISA 5A5NA 4QSSA 5LKXA 4XYAA 5HELA 5DW1A 4LC2A 4TTEA 5G4RA 5A83A 2FSAA 2R0VA 4IR6A 5CQ7A 5DLZA 2DVRA 4CFLA 4NUDA 5FB1A 5E74A 4HXOA 4Z1QA 5I40A 5I88A 4RVRA 5EWWA 2E7OA 5E7DA 5AMFA 4TZ2A 4GPJA 3O33A 4LDFA 5EVAA 5EI4A 5DFDA 5DKCA 5CRZA 4LZRA 5HRVA 5COIA 3DWYA 2F6NA 4HXSA 5AMEA 5JI8A 4HBXA 4Q0OA 5CQ3A 5FFWA 2L5EA 4HXLA 4AKNA 4QEWA 5FG6A 5F25A 5CUAA 2YEKA 5E3GA 5I80A 4O77A 4HBYA 5II2A 5I1QA 5F36A 5G4SA 4HXNA 5FFYA 5C4QA 5CS8A 4MR6A 4UYEA 5AD3A 5H1UA 5FG4A 3UVXA 4NYWA 3LQJA 4QYDA 2GRCA 5E9YA 5FH7A 5I7YA 5E9IA 5D3TA 5D3PA 3UVYA 5F1LA 5FDZA 4J1PA 5ENIA 4Z1SA 5EPRA 2DVQA 1WUMA 3UV4A 3U5JA 2YQDA 4XY8A 3UV5A 5E73A 3QZVA 4NRBA 4BHWA 3FKMX 5C7NA 5ENBA 4NUEA 2RNXA 4MR4A 2I7KA 5CP5A 5I89A 2YYNA 4O7CA 5CQ5A 5F62A 2YEMA 3I3JA 5KO4A 4YAXA 5F60A 5L99A 4NYVA 4O75A 3S92A 4UYFB 4ZC9A 5LJ0A 5DYCA 4LRGA 4NRAA 3HMFA 4YH4A 5DBMA 4HXPA 3UV2A 5A5SA 4IR5A 3JVJA 2RS9B 5I86A 4UYGA 4QBMA 4CUSA 4CFKA 4QNSA 2R0SA 4QY4A 3AADA 5L96A 5II1A 4XY9A 4QSPA 5L8TA 3S91A 4MR5A 4BW4A 5D3HA 5EWVA 5FG5A 2L84A 5D3LA 4Z6IA 5CQ6A 3SVFA 2E7NA 2DVVA 4IOOA 5EA1A 4NUCA 4Q0NA 4YY4A 4Z6HA 2MJVB 1ZS5A 4UIUA 3O37A 4PTBA 5ENEA 4HBWA 3MQMA 4QR3A 4IR3A 4YATA 5LVRA 4MR3A 4YBTA 4YBSA 4NS5A 2D82A 4PS5A 4UYHA 5CRMA 4A9HA 5AD2A 4NYXA 5LKUA 4XUBA 5LVQA 5FE6A 4QUTA 5IG6A 5KTUA 4A9EA 3G0JA 4YABA 2NXBA 4E96A 5EU1A 5K29A 3U5LA 4O7EA 5EGUA 3LQIA 4TS8A 4BW1A 5ETDA 5FB0A 5A81A 4IOQA 4MEOA 5C85A 5E0RA 4YYJA 5KTWA 2I8NA 4N4FA 4PCIA 3U5PA 4N4HA 1WUGA 5D25A 5ETBA 2RI7A 4NR5A 5DFCA 5EWHA 5D3SA 5H1VA 4OGIA 4BJXA 2DKWA 4QSQA 4QC1A 1JM4B 5EK9A 2R0YA 5EWDA 4Z93A 4A9JA 5L97A 4NQNA 4DONA 4X2IA 4Y03A 4QSRA 5EWCA 3DAIA 3UVWA 5HJCA 2DATA 5DY7A 5FE8A 5F3AA 5HFQA 3U5MA 2F6JA 4YYHA 5LJ1A 1E6IA 3P1DA 5FE0A 4QC3A 5KU3A 4QSTA 3O35A 4A9MA 5IBNA 4HBVA 5E3DA 3K2JA 5H85A 5J0DA 4YYGA 2H60A 2D9EA 5KTXA 4O70A 3ONIA 5CFWA 4CUUA 4IORA 5IGKA 3U5KA 5ENJA 5DYXA 4NQMA 3MB3A 2OSSA 2WP1A 3NXBA 4LYIA 4QEUA 2YDWA 4N4IA 4TT4A 5FH8A 4QEVA 4A9IA 5FE3A 4CUTA 4O72A 4O76A 4C67A 4J0RA 5C87A 4TYLA 3P1CA 4NR6A 5CU8A 2RO1A 3MB4A 4O7BA 4UIZA 3RCWA 5CUEA 5HEMA 5H1TA 5A5OA 3O36A 4FLPA 4WHWA 5CUBA 3Q2FA 5D3RA 5F5ZA 3TLPA 5FE2A 4NRCA 5F2PA 5HCLA 4TQNA 5ENGA 3O34A 1N72A 5E9VA 4YYIA 1EQFA 5CUDA 3LJWA 4UITA 4PKLA 3IU5A 4A9NA 4XUAA 5ENFA 4YYKA 4O7AA 3IU6A 5IIDA 4QYLA 5A85A 4C66A 4A9FA 4O78A 5IGMA 2E3KA 4LZ2A 5CTLA 5HRXA 4A9OA 5FFVA 5F63A 5I29A 5A7CA 4WIVA 5L8UA 5A5RA 2KTBB 5HQ6A 4QUUA 4NR9A 3D7CA 1X0JA 5HQ5A 5I7XA 4MEPA 4MENA 5C89A 3P5OA 5C8GA 3ZYUA 2LSPB 5EM3A 5FE7A 5CQ4A 4TT6A 4N4GA 4YY6A 2R10A 5CY9A 5CGPA 2DVSA 5LKTA 4J3IA 4UIWA 4NXJA 4TU6A 5DYAA 1JSPB 5EPBA 2WP2A 2YELA 5DKHA 4A9KA 3SVGA 4TU4A 4BW2A 2OO1A 5E9MA 4YK0A 4O74A 5JWMA 4CUQA 3GG3A 4O71A 5D7XA 5HENA 5A82A 3SVHA 5E9KA 4KCXA 5CZGA 5EV9A 4PY6A 4KV1A 5F1HA 4KV4A 4A9LA 4OGJA 2L85A 5FE5A 5D24A 5HLSA 5IGLA 5HFRA 4CUPA 5FBXA 2DWWA 3Q2EA 2OUOA 4UYFA 5D3NA 5DFBA 2RNYA 4YC9A 4O7FA 5EICA 3JVKA 3MXFA 5CUCA 5HRWA 5DW2A 5F61A 5I83A 5CQ8A 5LKZA 4NR7A 5HM0A 4YADA 4QSWA 5FE4A 4PCEA 5DYUA 5TB6A 4YYDA 4BW3A 3JVMA 4TZ8A 4WHUA 4CLBA 4LR6A 3UW9A 4CL9A 5CQTA 4N3WA 4LYSA 5HQ7A 3MUKA 5BT4A 4QZSA 4HXMA 4QB3A 3G0LA 5FH6A 5DX4A 4ALHA 5ACYA 3HMEA 2G4AA 5FE1A 4QR5A 2N9GA 1F68A 4QR4A 4QSXA 5ENHA 5LUUA 2RNWA 4MEQA 4IR4A 5CUGA 5EQ1A 3U5NA 3LXJA 5BT3A 4LZSA 3P1FA 4UYDA 5KHMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4UIXA 4ALGA 4TT2A 5E9LA 4YYNA 4YYMA 5BT5A 5DLXA 4QSUA 4CURA 4NR4A 4ZQLA 4YH3A 5TCMA 4J0SA 5CPEA 2RFJA 4F3IA 5EP7A 5ENCA 5A5QA 4YBMA 3P1EA 4UIYA 3JVLA 3UVDA 4HXRA 5A5PA 3AQAA 3QZSA 5D26A 4ZW1A 5DKDA 4QSVA 5D0CA 4UIVA 5D3JA 3U5OA 5EPSA 5FE9A 3HMHA 4NR8A 5CQAA 4OUFA 2YW5A 3D1BA 3D1DA 3MULA 4LYWA 4HXKA 5IGNA 5LJ2A 3LQHA 5L98A 3QZTA 5EISA 5A5NA 4QSSA 5LKXA 4AKGA 4XYAA 5HELA 5DW1A 4LC2A 4TTEA 5G4RA 5A83A 2FSAA 2R0VA 4IR6A 5CQ7A 5DLZA 2DVRA 4CFLA 4NUDA 5FB1A 5E74A 4HXOA 4Z1QA 5I40A 5I88A 4RVRA 5EWWA 2E7OA 5E7DA 5AMFA 4TZ2A 4GPJA 3O33A 4LDFA 3VKHA 5EVAA 5EI4A 5DFDA 5DKCA 4AKIA 5CRZA 4LZRA 5HRVA 5COIA 3DWYA 2F6NA 4HXSA 5AMEA 5JI8A 4HBXA 4Q0OA 5CQ3A 5FFWA 2L5EA 4HXLA 4AKNA 4QEWA 5FG6A 5F25A 5CUAA 2YEKA 5E3GA 5I80A 4O77A 4HBYA 5II2A 5I1QA 5F36A 5G4SA 4HXNA 5FFYA 5C4QA 5CS8A 4MR6A 4UYEA 5AD3A 5H1UA 5FG4A 3UVXA 4NYWA 3LQJA 4QYDA 2GRCA 5E9YA 5FH7A 5I7YA 5E9IA 5D3TA 5D3PA 3UVYA 5F1LA 5FDZA 4J1PA 5ENIA 4Z1SA 5EPRA 2DVQA 1WUMA 3UV4A 3U5JA 2YQDA 4XY8A 3UV5A 5E73A 3QZVA 4NRBA 4BHWA 3FKMX 5C7NA 5ENBA 4NUEA 2RNXA 4MR4A 2I7KA 5CP5A 5I89A 2YYNA 4O7CA 5CQ5A 5F62A 2YEMA 3I3JA 5KO4A 4YAXA 5F60A 5L99A 4NYVA 4O75A 3S92A 4UYFB 4ZC9A 5LJ0A 5DYCA 4LRGA 4NRAA 3HMFA 4YH4A 5DBMA 4HXPA 3UV2A 5A5SA 4IR5A 3JVJA 2RS9B 5I86A 4UYGA 4QBMA 4CUSA 4CFKA 4QNSA 2R0SA 4QY4A 3AADA 5L96A 5II1A 4XY9A 4QSPA 5L8TA 3S91A 4MR5A 4BW4A 5D3HA 5EWVA 5FG5A 2L84A 5D3LA 4Z6IA 5CQ6A 3SVFA 2E7NA 2DVVA 4IOOA 5EA1A 4NUCA 4AI6A 4Q0NA 4YY4A 4Z6HA 2MJVB 1ZS5A 4UIUA 3O37A 4PTBA 5ENEA 4HBWA 3MQMA 4QR3A 4IR3A 4YATA 5LVRA 4MR3A 4YBTA 4YBSA 4NS5A 2D82A 4PS5A 4UYHA 5CRMA 4A9HA 5AD2A 4NYXA 5LKUA 4XUBA 5LVQA 5FE6A 4QUTA 5IG6A 5KTUA 4A9EA 3G0JA 4YABA 2NXBA 4E96A 5EU1A 5K29A 3U5LA 4O7EA 5EGUA 3LQIA 4TS8A 4BW1A 5ETDA 5FB0A 5A81A 4IOQA 4MEOA 5C85A 5E0RA 4YYJA 5KTWA 2I8NA 4N4FA 4PCIA 3U5PA 4N4HA 1WUGA 5D25A 5ETBA 2RI7A 4NR5A 5DFCA 5EWHA 5D3SA 5H1VA 4OGIA 4BJXA 2DKWA 3ERRA 4QSQA 4QC1A 1JM4B 5EK9A 2R0YA 5EWDA 4Z93A 4A9JA 5L97A 4NQNA 4DONA 4X2IA 4Y03A 4QSRA 5EWCA 3DAIA 3UVWA 5HJCA 2DATA 5DY7A 5FE8A 5F3AA 5HFQA 3U5MA 2F6JA 4YYHA 5LJ1A 1E6IA 3P1DA 5FE0A 4QC3A 5KU3A 4QSTA 3O35A 4A9MA 5IBNA 4HBVA 5E3DA 3K2JA 5H85A 5J0DA 4YYGA 2H60A 2D9EA 5KTXA 4O70A 3ONIA 5CFWA 4CUUA 4IORA 5IGKA 3U5KA 5ENJA 5DYXA 4NQMA 3MB3A 2OSSA 2WP1A 3NXBA 4LYIA 4QEUA 2YDWA 4N4IA 4TT4A 5FH8A 4QEVA 4A9IA 5FE3A 4CUTA 4O72A 4O76A 4C67A 4J0RA 5C87A 4TYLA 3P1CA 4NR6A 5CU8A 2RO1A 3MB4A 4O7BA 4UIZA 3VKGA 3RCWA 5CUEA 5HEMA 5H1TA 5A5OA 3O36A 4FLPA 4WHWA 5CUBA 3Q2FA 5D3RA 5F5ZA 3TLPA 5FE2A 4NRCA 5F2PA 5HCLA 4TQNA 5ENGA 3O34A 1N72A 5E9VA 4YYIA 1EQFA 5CUDA 2EJNA 3LJWA 4UITA 4PKLA 3IU5A 4A9NA 4XUAA 5ENFA 4YYKA 4O7AA 3IU6A 5IIDA 4QYLA 5A85A 4C66A 4A9FA 4O78A 5IGMA 2E3KA 4LZ2A 5CTLA 5HRXA 4A9OA 5FFVA 5F63A 5I29A 5A7CA 4WIVA 5L8UA 5A5RA 2KTBB 5HQ6A 4QUUA 4NR9A 3D7CA 1X0JA 5HQ5A 5I7XA 4MEPA 4MENA 5C89A 3P5OA 5C8GA 3ZYUA 2LSPB 5EM3A 5FE7A 5CQ4A 4TT6A 4N4GA 4YY6A 2R10A 5CY9A 5CGPA 4AKHA 2DVSA 5LKTA 4J3IA 4UIWA 4NXJA 4TU6A 5DYAA 1JSPB 5EPBA 2WP2A 2YELA 5DKHA 4A9KA 3SVGA 4TU4A 4BW2A 2OO1A 5E9MA 4YK0A 4O74A 5JWMA 4CUQA 3GG3A 4O71A 5D7XA 5HENA 5A82A 3SVHA 5E9KA 4KCXA 5CZGA 5EV9A 1PUOA 4PY6A 4KV1A 5F1HA 4KV4A 4A9LA 4OGJA 2L85A 5FE5A 5D24A 5HLSA 5IGLA 5HFRA 4CUPA 5FBXA 2DWWA 3Q2EA 2OUOA 4UYFA 5D3NA 5DFBA 2RNYA 4YC9A 4O7FA 5EICA 3JVKA 3MXFA 5CUCA 5HRWA 5DW2A 5F61A 5I83A 5CQ8A 5LKZA 4NR7A 5HM0A 4YADA 4QSWA 5FE4A 4PCEA 5DYUA 5TB6A 4YYDA 4BW3A 3JVMA 4TZ8A 4WHUA 4CLBA 4LR6A 3UW9A 4CL9A 5CQTA 4N3WA 4LYSA 5HQ7A 3MUKA 5BT4A 4QZSA 4HXMA 4QB3A 3G0LA 5FH6A 5DX4A 1ZKRA 4ALHA 5ACYA 3HMEA 2G4AA 5FE1A 4QR5A 2N9GA 1F68A 4QR4A 4QSXA 5ENHA 5LUUA 2RNWA 4MEQA 4IR4A 5CUGA 5EQ1A 3U5NA 3LXJA 5BT3A 4LZSA 3P1FA 4UYDA 5KHMA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4UIX A;  4ALG A;  4TT2 A;  5E9L A;  4YYN A;  4YYM A;  5BT5 A;  5DLX A;  4QSU A;  4CUR A;  4NR4 A;  4ZQL A;  4YH3 A;  5TCM A;  4J0S A;  5CPE A;  2RFJ A;  4F3I A;  5EP7 A;  5ENC A;  5A5Q A;  4YBM A;  3P1E A;  4UIY A;  3JVL A;  3UVD A;  4HXR A;  5A5P A;  3AQA A;  3QZS A;  5D26 A;  4ZW1 A;  5DKD A;  4QSV A;  5D0C A;  4UIV A;  5D3J A;  3U5O A;  5EPS A;  5FE9 A;  3HMH A;  4NR8 A;  5CQA A;  4OUF A;  2YW5 A;  3MUL A;  4LYW A;  4HXK A;  5IGN A;  5LJ2 A;  3LQH A;  5L98 A;  3QZT A;  5EIS A;  5A5N A;  4QSS A;  5LKX A;  4XYA A;  5HEL A;  5DW1 A;  4LC2 A;  4TTE A;  5G4R A;  5A83 A;  2FSA A;  2R0V A;  4IR6 A;  5CQ7 A;  5DLZ A;  2DVR A;  4CFL A;  4NUD A;  5FB1 A;  5E74 A;  4HXO A;  4Z1Q A;  5I40 A;  5I88 A;  4RVR A;  5EWW A;  2E7O A;  5E7D A;  5AMF A;  4TZ2 A;  4GPJ A;  3O33 A;  4LDF A;  5EVA A;  5EI4 A;  5DFD A;  5DKC A;  5CRZ A;  4LZR A;  5HRV A;  5COI A;  3DWY A;  2F6N A;  4HXS A;  5AME A;  5JI8 A;  4HBX A;  4Q0O A;  5CQ3 A;  5FFW A;  2L5E A;  4HXL A;  4AKN A;  4QEW A;  5FG6 A;  5F25 A;  5CUA A;  2YEK A; 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