4OGJA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with the inhibitor tg-101348
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Dual kinase-bromodomain inhibitors for rationally designed polypharmacology.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription/inhibitor
total genus 41
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4ogjA01
4HXMA 5D3SA 2F6JA 5G4SA 2D82A 5HLSA 2I7KA 5KTXA 4IOOA 5J0DA 5FE3A 4TZ2A 5E9MA 4CUUA 4N4IA 3O35A 4ALHA 3U5PA 4NR6A 3D7CA 3O36A 4HXRA 4N3WA 4NR8A 5LKZA 3Q2FA 5F63A 3O34A 2NXBA 5LJ1A 2RFJA 5DLZA 4YH3A 5E3DA 5D25A 3HMEA 3U5MA 5H1TA 5FFYA 4LYIA 3LQHA 4O7CA 2N9GA 5A81A 5ENBA 4O78A 5A5RA 3U5NA 4MR4A 4LZSA 2E7OA 5LKTA 3LXJA 3JVKA 4C66A 4UIXA 5CUCA 5ENFA 5HQ5A 4TQNA 4NUCA 5KTUA 4NRCA 4NYVA 3JVJA 5F2PA 5HCLA 2R10A 2YYNA 4QR5A 5HQ6A 4QEUA 4IR3A 1WUMA 4WHWA 5D3JA 5DY7A 4HXOA 3P1CA 5L98A 4YYJA 2YDWA 5A5QA 3MXFA 4QYLA 4CURA 5CQTA 3UVXA 3NXBA 4QSQA 4HXKA 4KV4A 5CQ6A 4YYNA 4TT4A 3K2JA 5DFBA 1X0JA 3DAIA 2DKWA 4Z6IA 5FG6A 4CFKA 5I7YA 1JSPB 3MQMA 4XY9A 4CUQA 4UYEA 2WP2A 2FSAA 4XYAA 5KO4A 3LQJA 4IR4A 4LR6A 1EQFA 4N4FA 4O7EA 4QSRA 5DLXA 5AD2A 4QYDA 4BW3A 2OSSA 5EK9A 5FH8A 4YBSA 4YATA 4A9MA 5C4QA 4HBXA 4XUAA 5BT5A 4C67A 5D24A 5IGLA 4J3IA 3LQIA 2R0SA 4LYSA 4NQMA 5F61A 4TS8A 4BHWA 4PY6A 4A9EA 5IGNA 4J1PA 5F3AA 5ACYA 4TT6A 4LC2A 1F68A 5E7DA 5HFRA 4Y03A 5CQ7A 5I88A 5H1VA 4A9NA 5A5PA 3IU6A 4O74A 4QR3A 3QZVA 5CQ5A 5EICA 4QB3A 5CZGA 5L8UA 3P5OA 5HQ7A 4HXSA 4Q0NA 5CQ3A 5I7XA 4A9KA 4YYDA 2YELA 4N4GA 5FDZA 5DYAA 5BT3A 2DVVA 5AMFA 5EQ1A 2RS9B 4NUDA 4IORA 3P1EA 1WUGA 4UITA 3DWYA 4PS5A 4TYLA 5IGMA 4MEOA 5FE2A 4LRGA 5CQAA 4YYIA 5L96A 5FFWA 4AKNA 5HELA 2YEMA 5E9KA 4QEVA 4OGIA 4A9OA 5A85A 5HENA 5CUBA 2DVRA 3Q2EA 5H1UA 5CU8A 2H60A 2G4AA 5D3RA 3UV4A 1E6IA 2L84A 4MEPA 4FLPA 5LVRA 3G0LA 5CRMA 4MR5A 4XUBA 5DYCA 5CY9A 4OGJA 2DATA 4N4HA 4QSWA 4YC9A 4UYHA 3QZTA 5DKHA 2MJVB 5F36A 4KCXA 4UYFA 4UIUA 3UW9A 5EWVA 4MR3A 4KV1A 3GG3A 5EWDA 5C89A 5G4RA 4A9IA 4TU6A 3RCWA 4QSUA 3U5LA 4GPJA 5E73A 5A7CA 4QSVA 5I89A 4TU4A 3UVYA 4HXNA 3MULA 5CUEA 5EI4A 5FBXA 4YYMA 4Q0OA 2OO1A 5TCMA 4NS5A 5EPBA 4YBTA 2F6NA 2R0VA 4DONA 4CL9A 5IGKA 3SVHA 3S91A 4CUSA 2R0YA 5KU3A 5HJCA 5H85A 4TZ8A 5FB1A 4TT2A 4NXJA 4BW1A 5LKXA 5EVAA 3S92A 3SVFA 3IU5A 3AQAA 5I40A 4QSTA 3UV2A 3FKMX 4NR9A 5AD3A 4OUFA 5DW2A 5EM3A 4YABA 4QSXA 3ZYUA 4CLBA 4J0SA 5HFQA 5CFWA 4YYHA 4O7BA 3ONIA 2KTBB 5LKUA 4HBVA 5I29A 5CQ8A 5CUGA 4QSPA 3I3JA 5IIDA 4QC1A 4ZW1A 2E7NA 4PCIA 5E9YA 2GRCA 5D3NA 3UV5A 4YH4A 4CFLA 5C7NA 2DVSA 5CUDA 4O70A 4A9HA 5JI8A 5K29A 4UYFB 5FE0A 2DWWA 4PTBA 5LVQA 4O75A 5CP5A 5FE9A 2E3KA 2YEKA 3HMHA 5LJ2A 4WHUA 5DKCA 5I86A 2YW5A 2RNYA 5HRVA 4BJXA 4XY8A 5L97A 4NYWA 2L5EA 4QY4A 5FE4A 3JVLA 4ZQLA 5E3GA 5FH7A 5FG5A 5ENEA 5EGUA 5F5ZA 4CUTA 2I8NA 2RI7A 5A5OA 2OUOA 4O7AA 5D7XA 4YAXA 4BW4A 5EWHA 3SVGA 5I80A 5F25A 4PCEA 5D26A 3MB4A 4QC3A 5D0CA 4QUTA 4WIVA 4QR4A 5DFCA 4O71A 5I1QA 5L99A 3O37A 4X2IA 5CRZA 3TLPA 3AADA 4UYGA 4RVRA 5CTLA 5D3TA 5D3PA 4A9LA 5C8GA 5KHMA 4QEWA 3UVWA 5C87A 4BW2A 4NR5A 4YY4A 3U5JA 5BT4A 2RNXA 5JWMA 5HEMA 4Z6HA 4HBYA 5ETBA 5DX4A 4UIVA 4LZ2A 4A9FA 5COIA 4UIWA 5CQ4A 5FFVA 5D3LA 4NRBA 5ENJA 4QSSA 4HXPA 4IR5A 4Z1QA 5EPRA 4O76A 5A5SA 5A82A 4NQNA 4UYDA 5DYXA 5KTWA 5ETDA 5DKDA 4YBMA 5EA1A 4Z1SA 5E9LA 5E9VA 5C85A 4PKLA 5FE5A 5ENCA 5DBMA 5EV9A 4UIZA 4YY6A 4O77A 4NR7A 4F3IA 4QNSA 5A5NA 3LJWA 4MEQA 3QZSA 4A9JA 5L8TA 3MB3A 3P1FA 5EPSA 4O7FA 5CS8A 4LZRA 4TTEA 2YQDA 5FG4A 5ENHA 5FE8A 4LYWA 3U5OA 4NRAA 5HRWA 5E74A 5ENGA 4MENA 2L85A 5F60A 5LUUA 5IBNA 4YYGA 4NR4A 5HRXA 5EISA 5EWCA 2RNWA 3UVDA 5I83A 5CPEA 1N72A 4LDFA 5DYUA 1ZS5A 5D3HA 4HBWA 5IG6A 5TB6A 5EU1A 5FE6A 5A83A 4CUPA 4IOQA 5EP7A 4IR6A 5FE1A 5E0RA 5ENIA 3O33A 4NUEA 5FB0A 3JVMA 5DFDA 4Z93A 5CUAA 4E96A 4YADA 4YYKA 4UIYA 4QZSA 2DVQA 5F1LA 4QUUA 5II1A 4YK0A 2RO1A 5EWWA 4O72A 3MUKA 1JM4B 5FE7A 4NYXA 5CGPA 5LJ0A 2WP1A 4QBMA 4MR6A 4ALGA 4ZC9A 4J0RA 5F62A 5AMEA 2D9EA 5F1HA 3HMFA 3G0JA 5DW1A 5E9IA 5HM0A 3U5KA 5FH6A 3P1DA 2LSPB 4HXLA 5II2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HXMA 5D3SA 2F6JA 5G4SA 2D82A 5HLSA 2I7KA 5KTXA 4IOOA 5J0DA 5FE3A 4TZ2A 5E9MA 3VKHA 4CUUA 4N4IA 3O35A 4ALHA 3U5PA 4NR6A 4AI6A 3D7CA 3O36A 4HXRA 4N3WA 4NR8A 5LKZA 3Q2FA 5F63A 3O34A 2NXBA 5LJ1A 2RFJA 5DLZA 4YH3A 5E3DA 5D25A 3HMEA 3U5MA 5H1TA 5FFYA 4LYIA 3LQHA 4O7CA 2N9GA 5A81A 5ENBA 4O78A 5A5RA 3U5NA 4MR4A 4LZSA 2E7OA 5LKTA 3LXJA 3JVKA 4C66A 4UIXA 5CUCA 5ENFA 5HQ5A 4TQNA 4NUCA 5KTUA 4NRCA 4NYVA 3JVJA 5F2PA 5HCLA 2R10A 2YYNA 4QR5A 5HQ6A 4QEUA 4IR3A 1WUMA 4WHWA 5D3JA 5DY7A 4HXOA 1PUOA 3P1CA 5L98A 4YYJA 2YDWA 5A5QA 3MXFA 4QYLA 4CURA 5CQTA 3UVXA 3NXBA 4QSQA 4HXKA 4KV4A 5CQ6A 4YYNA 4TT4A 3K2JA 5DFBA 1X0JA 3DAIA 2DKWA 4Z6IA 5FG6A 4CFKA 5I7YA 1JSPB 3MQMA 4XY9A 3VKGA 4CUQA 4UYEA 2WP2A 2FSAA 4XYAA 5KO4A 3LQJA 4IR4A 4LR6A 1EQFA 4N4FA 4O7EA 4QSRA 5DLXA 5AD2A 4QYDA 4BW3A 2OSSA 5EK9A 5FH8A 4YBSA 4YATA 4A9MA 5C4QA 4HBXA 4XUAA 5BT5A 4C67A 5D24A 5IGLA 4J3IA 3LQIA 2R0SA 4LYSA 4NQMA 5F61A 4TS8A 4BHWA 4PY6A 4A9EA 5IGNA 4J1PA 5F3AA 5ACYA 4TT6A 4LC2A 1F68A 5E7DA 5HFRA 4Y03A 5CQ7A 5I88A 5H1VA 4A9NA 5A5PA 3IU6A 4O74A 4QR3A 3QZVA 5CQ5A 5EICA 4QB3A 5CZGA 5L8UA 3P5OA 3D1DA 5HQ7A 4HXSA 4Q0NA 5CQ3A 5I7XA 4A9KA 4YYDA 2YELA 4N4GA 5FDZA 5DYAA 5BT3A 2DVVA 5AMFA 5EQ1A 2RS9B 4NUDA 4IORA 3P1EA 1WUGA 4UITA 3DWYA 4PS5A 4TYLA 5IGMA 4MEOA 5FE2A 4LRGA 5CQAA 4YYIA 5L96A 5FFWA 4AKNA 5HELA 2YEMA 5E9KA 4QEVA 4OGIA 4A9OA 5A85A 5HENA 5CUBA 2DVRA 3Q2EA 5H1UA 5CU8A 2H60A 2G4AA 5D3RA 3UV4A 1E6IA 2L84A 4MEPA 4FLPA 5LVRA 3G0LA 5CRMA 4MR5A 4XUBA 5DYCA 5CY9A 4OGJA 2DATA 4N4HA 4QSWA 4YC9A 4UYHA 3QZTA 5DKHA 2MJVB 5F36A 4KCXA 4UYFA 4UIUA 3UW9A 5EWVA 4MR3A 4KV1A 3GG3A 5EWDA 5C89A 5G4RA 4A9IA 4TU6A 3RCWA 4QSUA 3U5LA 4GPJA 2EJNA 5E73A 5A7CA 4QSVA 5I89A 4TU4A 3UVYA 4HXNA 3MULA 5CUEA 5EI4A 5FBXA 4YYMA 4Q0OA 2OO1A 5TCMA 4NS5A 5EPBA 4YBTA 2F6NA 2R0VA 4DONA 4CL9A 5IGKA 3SVHA 3S91A 4CUSA 2R0YA 3D1BA 5KU3A 5HJCA 5H85A 4TZ8A 5FB1A 4TT2A 4NXJA 4BW1A 5LKXA 5EVAA 3S92A 3SVFA 3IU5A 3AQAA 5I40A 4QSTA 3UV2A 3FKMX 4NR9A 5AD3A 4OUFA 5DW2A 5EM3A 4YABA 4QSXA 3ZYUA 1ZKRA 4CLBA 4J0SA 5HFQA 5CFWA 4YYHA 4O7BA 3ONIA 2KTBB 5LKUA 4HBVA 5I29A 5CQ8A 5CUGA 4QSPA 3I3JA 5IIDA 4QC1A 4ZW1A 2E7NA 4PCIA 5E9YA 2GRCA 5D3NA 3UV5A 4YH4A 4CFLA 5C7NA 2DVSA 5CUDA 4O70A 4A9HA 5JI8A 5K29A 4UYFB 5FE0A 2DWWA 4PTBA 5LVQA 4O75A 5CP5A 5FE9A 2E3KA 2YEKA 4AKIA 3HMHA 5LJ2A 4WHUA 5DKCA 5I86A 2YW5A 2RNYA 5HRVA 4BJXA 4XY8A 5L97A 4NYWA 2L5EA 4QY4A 5FE4A 3JVLA 4ZQLA 5E3GA 5FH7A 5FG5A 5ENEA 5EGUA 5F5ZA 4CUTA 2I8NA 2RI7A 5A5OA 2OUOA 4O7AA 5D7XA 4YAXA 4BW4A 5EWHA 3SVGA 5I80A 5F25A 4PCEA 5D26A 3MB4A 4QC3A 5D0CA 4QUTA 4WIVA 4QR4A 5DFCA 4O71A 5I1QA 5L99A 3O37A 4X2IA 5CRZA 3TLPA 3AADA 4UYGA 4RVRA 5CTLA 5D3TA 5D3PA 4A9LA 5C8GA 5KHMA 4QEWA 3UVWA 5C87A 4BW2A 4NR5A 4YY4A 3U5JA 5BT4A 2RNXA 5JWMA 3ERRA 5HEMA 4Z6HA 4HBYA 5ETBA 5DX4A 4UIVA 4LZ2A 4A9FA 5COIA 4UIWA 5CQ4A 5FFVA 5D3LA 4NRBA 5ENJA 4QSSA 4HXPA 4IR5A 4Z1QA 5EPRA 4O76A 5A5SA 5A82A 4NQNA 4UYDA 5DYXA 5KTWA 5ETDA 5DKDA 4YBMA 5EA1A 4Z1SA 5E9LA 5E9VA 5C85A 4PKLA 5FE5A 5ENCA 5DBMA 5EV9A 4UIZA 4AKGA 4YY6A 4O77A 4NR7A 4F3IA 4QNSA 5A5NA 3LJWA 4MEQA 3QZSA 4A9JA 5L8TA 3MB3A 3P1FA 5EPSA 4O7FA 5CS8A 4LZRA 4TTEA 2YQDA 5FG4A 5ENHA 5FE8A 4LYWA 3U5OA 4NRAA 5HRWA 5E74A 5ENGA 4MENA 2L85A 5F60A 5LUUA 5IBNA 4YYGA 4NR4A 5HRXA 5EISA 5EWCA 2RNWA 3UVDA 5I83A 5CPEA 1N72A 4LDFA 5DYUA 1ZS5A 5D3HA 4HBWA 5IG6A 5TB6A 5EU1A 5FE6A 5A83A 4CUPA 4IOQA 5EP7A 4IR6A 5FE1A 5E0RA 5ENIA 3O33A 4NUEA 5FB0A 3JVMA 5DFDA 4Z93A 5CUAA 4E96A 4YADA 4YYKA 4UIYA 4QZSA 2DVQA 5F1LA 4QUUA 5II1A 4YK0A 2RO1A 5EWWA 4O72A 3MUKA 1JM4B 5FE7A 4NYXA 5CGPA 5LJ0A 2WP1A 4QBMA 4MR6A 4ALGA 4ZC9A 4J0RA 4AKHA 5F62A 5AMEA 2D9EA 5F1HA 3HMFA 3G0JA 5DW1A 5E9IA 5HM0A 3U5KA 5FH6A 3P1DA 2LSPB 4HXLA 5II2A
chains in the Genus database with same CATH topology
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 4HXM A;  5D3S A;  2F6J A;  5G4S A;  2D82 A;  5HLS A;  2I7K A;  5KTX A;  4IOO A;  5J0D A;  5FE3 A;  4TZ2 A;  5E9M A;  4CUU A;  4N4I A;  3O35 A;  4ALH A;  3U5P A;  4NR6 A;  3D7C A;  3O36 A;  4HXR A;  4N3W A;  4NR8 A;  5LKZ A;  3Q2F A;  5F63 A;  3O34 A;  2NXB A;  5LJ1 A;  2RFJ A;  5DLZ A;  4YH3 A;  5E3D A;  5D25 A;  3HME A;  3U5M A;  5H1T A;  5FFY A;  4LYI A;  3LQH A;  4O7C A;  2N9G A;  5A81 A;  5ENB A;  4O78 A;  5A5R A;  3U5N A;  4MR4 A;  4LZS A;  2E7O A;  5LKT A;  3LXJ A;  3JVK A;  4C66 A;  4UIX A;  5CUC A;  5ENF A;  5HQ5 A;  4TQN A;  4NUC A;  5KTU A;  4NRC A;  4NYV A;  3JVJ A;  5F2P A;  5HCL A;  2R10 A;  2YYN A;  4QR5 A;  5HQ6 A;  4QEU A;  4IR3 A;  1WUM A;  4WHW A;  5D3J A;  5DY7 A;  4HXO A;  3P1C A;  5L98 A;  4YYJ A;  2YDW A;  5A5Q A;  3MXF A;  4QYL A;  4CUR A;  5CQT A;  3UVX A;  3NXB A;  4QSQ A;  4HXK A;  4KV4 A;  5CQ6 A;  4YYN A;  4TT4 A;  3K2J A;  5DFB A;  1X0J A;  3DAI A;  2DKW A;  4Z6I A;  5FG6 A;  4CFK A;  5I7Y A;  1JSP B;  3MQM A;  4XY9 A;  4CUQ A;  4UYE A;  2WP2 A;  2FSA A;  4XYA A; 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