4OGJA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with the inhibitor tg-101348
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription/inhibitor
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
publication title Dual kinase-bromodomain inhibitors for rationally designed polypharmacology.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 127
sequence length 127
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4ogjA01
5FG5A 5E9VA 5A7CA 4TYLA 3GG3A 5HQ7A 1F68A 4QUUA 5CY9A 4LRGA 5D3NA 2WP1A 3P1DA 4IR6A 5CQTA 2DWWA 5CS8A 5A81A 3S92A 2L5EA 4QBMA 4CURA 4TS8A 5DFCA 5D3LA 1JSPB 4QSUA 4PY6A 5KTXA 4A9OA 5FG4A 5KTWA 5F60A 4QUTA 4MEOA 4BW1A 3HMHA 5F1HA 3K2JA 5FE8A 5H1TA 5KHMA 3U5OA 5F3AA 3O34A 3SVFA 4O74A 3P1FA 4MR4A 5FE7A 3QZSA 2R0VA 2R10A 4HXOA 3U5KA 4NRBA 5CUDA 5L96A 5I83A 4J0SA 3TLPA 5EWHA 4QSSA 2DVRA 4YC9A 2YEKA 1N72A 4Z6HA 5JWMA 4BW4A 3D7CA 5I7XA 4O7FA 4IR5A 5G4SA 4QNSA 4TT2A 5A82A 4NXJA 5A5PA 3O33A 5DKCA 5FB1A 3IU6A 4YYMA 4TT6A 4HBYA 5FE3A 4LZ2A 5I86A 5IGKA 5CUEA 5BT3A 5DKDA 4NRAA 5D24A 5C7NA 4NUCA 5FH8A 5CTLA 5C8GA 4PS5A 5LUUA 3NXBA 4CL9A 4KCXA 4QEUA 4QSXA 3LXJA 5DW2A 4O72A 5IBNA 5CQ5A 4C66A 4O7CA 5FH7A 5HJCA 4HXKA 2YELA 4LYWA 4NYWA 4PTBA 2R0YA 4BW3A 5FE2A 3SVGA 5EISA 4YYHA 5CQ4A 4YAXA 4CUQA 4Y03A 4YBTA 5AMFA 2RS9B 5ENGA 4UIVA 5KTUA 2MJVB 5D3HA 5EU1A 4O78A 5C87A 5I7YA 5G4RA 5DYXA 4O7EA 4ZC9A 4HXSA 5CQ7A 5TB6A 4KV1A 4NR8A 2YW5A 3LQHA 4BW2A 4DONA 5AD3A 5F36A 4IR3A 2E7OA 2YYNA 4HBXA 3LQJA 5E3DA 4NQNA 4YYKA 4MR3A 5HFRA 2DKWA 4O70A 5EWVA 4GPJA 5ETBA 4QSRA 2LSPB 5EWWA 4TT4A 4ALGA 4BJXA 4HXMA 3JVKA 3MXFA 4HBVA 4UYEA 4WHUA 5EK9A 5EQ1A 2RFJA 5F61A 4J3IA 4CFLA 5D25A 3P1CA 5EV9A 5AMEA 5K29A 3U5JA 5E74A 4TTEA 2L84A 5ENHA 2RNXA 4NR4A 2OSSA 1EQFA 3JVLA 4IOOA 2E7NA 1E6IA 4YATA 4C67A 5ENIA 5HENA 3O37A 5A5NA 4AKNA 5E73A 5LVRA 4PKLA 4XUBA 4A9NA 5I40A 5D3RA 4IORA 5CQAA 5LJ1A 5HCLA 3DWYA 2DVVA 4PCIA 4Z6IA 4TU6A 4YYJA 4UIWA 5C4QA 4QYDA 5A85A 5HRWA 2E3KA 4YYGA 4IR4A 5DFDA 4HXPA 4LZRA 4LR6A 5F2PA 4A9FA 5CQ3A 4BHWA 4NR6A 5F1LA 5FB0A 5LKZA 5CPEA 5AD2A 5EWCA 5DKHA 5D3TA 4A9EA 5D26A 4O71A 4YY4A 4O77A 5LKUA 5EI4A 3O36A 4LC2A 5IIDA 5CFWA 5I29A 3HMEA 3MULA 4UYFA 5DYUA 4O7AA 4QYLA 5L8TA 3S91A 5L99A 5CZGA 4QR4A 5ETDA 5FE0A 4LYIA 4MR5A 4Q0OA 4O76A 4UIUA 2YQDA 5HELA 4CFKA 5A5SA 5FBXA 3P1EA 2OO1A 4CUPA 5HLSA 4NQMA 4UIZA 4UITA 5ENFA 2RO1A 5L8UA 4N4GA 4QY4A 2H60A 2WP2A 4QB3A 5FFWA 2D82A 4ALHA 5COIA 5EVAA 4MR6A 3QZTA 5CQ6A 2GRCA 2I8NA 1WUGA 5FE9A 4YABA 3JVMA 5LKTA 4XYAA 4HBWA 5CUAA 4QZSA 5EPBA 4CUTA 3UVDA 5EA1A 4YBSA 5A5RA 5EPSA 5D3PA 4Z1QA 2NXBA 4QSQA 3DAIA 4N3WA 5F25A 1WUMA 4KV4A 5E9IA 5FH6A 5D7XA 5CU8A 4YBMA 4QC3A 4QSPA 5EM3A 5A83A 5FG6A 5J0DA 4LDFA 5D3JA 5A5QA 3MB4A 5FE5A 3P5OA 5DYCA 5C89A 3MUKA 2OUOA 3AQAA 4LYSA 5I88A 4XUAA 2D9EA 4UIYA 5II1A 3UW9A 5DLXA 4UYHA 5DX4A 3O35A 5ENBA 4CUUA 3U5PA 4E96A 3UVXA 5E9YA 4O75A 4OGIA 5CQ8A 5BT5A 4RVRA 5LJ2A 4N4FA 4QEWA 3U5MA 2KTBB 4PCEA 1X0JA 5EICA 2DVSA 4HXRA 5E3GA 3QZVA 5FE1A 5KO4A 5I89A 4Z93A 4OGJA 3U5LA 5DY7A 4HXLA 4CUSA 4O7BA 5I1QA 5C85A 5IGNA 4MEQA 3LJWA 5IG6A 3RCWA 4QSWA 3ONIA 5E0RA 5BT4A 5F62A 4A9JA 3UVWA 5LKXA 4YK0A 5FE6A 4N4HA 4A9HA 2N9GA 2DVQA 5HFQA 2L85A 3UV2A 3SVHA 3I3JA 5FFYA 3Q2FA 5D0CA 5CGPA 5H1UA 2RNWA 4QR5A 5H1VA 2RNYA 5I80A 5KU3A 4MENA 4QR3A 5CUBA 4YH3A 4A9MA 4J1PA 5CRMA 2I7KA 5ENEA 4OUFA 4ZW1A 5ENJA 3UV5A 4LZSA 5CRZA 4Q0NA 4Z1SA 3UV4A 5LJ0A 4FLPA 5L97A 2YEMA 5DW1A 5TCMA 4YY6A 4QEVA 5HQ6A 3JVJA 4YYNA 4XY9A 4QSTA 5F5ZA 4UYDA 4A9KA 5LVQA 4NR5A 2G4AA 5HRXA 4F3IA 5E7DA 4HXNA 5E9KA 5ACYA 4YADA 4XY8A 5D3SA 4NYXA 2YDWA 4CLBA 3FKMX 3HMFA 3IU5A 3U5NA 5IGLA 5IGMA 5HM0A 4TZ8A 5DBMA 5DLZA 4TU4A 2DATA 4MEPA 5JI8A 5ENCA 4TQNA 3UVYA 3MB3A 5EP7A 5H85A 5DFBA 2RI7A 5II2A 4WHWA 4NR7A 4X2IA 3G0LA 5HEMA 5FE4A 5CP5A 5A5OA 4A9IA 5HQ5A 5EPRA 4YYDA 4UYGA 5DYAA 4NS5A 5L98A 2R0SA 2FSAA 3G0JA 4YH4A 4J0RA 4NUDA 4NYVA 2F6JA 4N4IA 5EGUA 5EWDA 5F63A 5CUGA 4QC1A 5FDZA 4IOQA 5CUCA 5E9LA 5E9MA 3AADA 4NUEA 2F6NA 4ZQLA 4NRCA 1JM4B 1ZS5A 3Q2EA 4NR9A 4QSVA 3LQIA 4WIVA 3ZYUA 4YYIA 4UYFB 5HRVA 4A9LA 5FFVA 4UIXA 3MQMA 4TZ2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5FG5A 5E9VA 5A7CA 4TYLA 3GG3A 5HQ7A 1F68A 4QUUA 5CY9A 4LRGA 5D3NA 2WP1A 3P1DA 4IR6A 5CQTA 2DWWA 5CS8A 5A81A 3S92A 2L5EA 4QBMA 4CURA 4TS8A 5DFCA 5D3LA 1JSPB 4QSUA 4PY6A 5KTXA 4A9OA 5FG4A 5KTWA 5F60A 4QUTA 4MEOA 4BW1A 3HMHA 5F1HA 3K2JA 5FE8A 5H1TA 5KHMA 3U5OA 5F3AA 3O34A 3SVFA 4O74A 3P1FA 4MR4A 5FE7A 3QZSA 2R0VA 2R10A 4HXOA 3U5KA 4NRBA 5CUDA 5L96A 5I83A 4J0SA 3TLPA 5EWHA 4QSSA 2DVRA 4YC9A 2YEKA 1N72A 4Z6HA 5JWMA 4BW4A 3D7CA 5I7XA 4O7FA 4IR5A 5G4SA 4QNSA 4TT2A 5A82A 3VKHA 4NXJA 5A5PA 3O33A 5DKCA 5FB1A 3IU6A 4YYMA 4TT6A 4HBYA 5FE3A 4LZ2A 5I86A 5IGKA 5CUEA 5BT3A 5DKDA 4NRAA 5D24A 5C7NA 4NUCA 5FH8A 5CTLA 5C8GA 4PS5A 5LUUA 3NXBA 4CL9A 4KCXA 4QEUA 4QSXA 3LXJA 5DW2A 4O72A 5IBNA 5CQ5A 4C66A 4O7CA 5FH7A 5HJCA 4HXKA 2YELA 4LYWA 4NYWA 4PTBA 2R0YA 4BW3A 5FE2A 3SVGA 5EISA 4YYHA 5CQ4A 4YAXA 4CUQA 4Y03A 4YBTA 5AMFA 2RS9B 5ENGA 4UIVA 5KTUA 2MJVB 5D3HA 5EU1A 3D1BA 4O78A 5C87A 5I7YA 5G4RA 5DYXA 4AI6A 4O7EA 4ZC9A 4HXSA 5CQ7A 5TB6A 4KV1A 4NR8A 2YW5A 3LQHA 4BW2A 4DONA 5AD3A 5F36A 4IR3A 2E7OA 2YYNA 4HBXA 3LQJA 5E3DA 4NQNA 4YYKA 4MR3A 5HFRA 2DKWA 4O70A 5EWVA 4GPJA 5ETBA 4QSRA 2LSPB 5EWWA 4TT4A 4ALGA 4BJXA 4HXMA 3JVKA 3MXFA 4HBVA 4UYEA 4WHUA 5EK9A 5EQ1A 2RFJA 5F61A 4J3IA 4CFLA 5D25A 3P1CA 5EV9A 5AMEA 5K29A 3U5JA 5E74A 4TTEA 2L84A 5ENHA 2RNXA 4NR4A 2OSSA 1EQFA 3JVLA 4IOOA 2E7NA 1E6IA 4YATA 4C67A 1ZKRA 3D1DA 5ENIA 5HENA 3O37A 5A5NA 4AKNA 5E73A 5LVRA 4PKLA 4XUBA 4A9NA 5I40A 5D3RA 4IORA 5CQAA 5LJ1A 5HCLA 3DWYA 2DVVA 4PCIA 4Z6IA 4TU6A 4YYJA 4UIWA 4AKGA 5C4QA 4QYDA 5A85A 5HRWA 2E3KA 4YYGA 4IR4A 4HXPA 4LZRA 5DFDA 4LR6A 5F2PA 4A9FA 5CQ3A 4BHWA 4NR6A 5F1LA 5FB0A 5LKZA 5CPEA 5AD2A 5EWCA 5DKHA 5D3TA 4A9EA 5D26A 4O71A 4YY4A 4O77A 5LKUA 5EI4A 3O36A 4LC2A 5IIDA 5CFWA 5I29A 3HMEA 3MULA 4UYFA 5DYUA 4O7AA 4QYLA 5L8TA 3S91A 5L99A 5CZGA 4QR4A 5ETDA 5FE0A 4LYIA 4MR5A 4Q0OA 4O76A 4UIUA 2YQDA 5HELA 4CFKA 5A5SA 5FBXA 3P1EA 2OO1A 4CUPA 5HLSA 4NQMA 4UIZA 4UITA 3ERRA 2RO1A 5ENFA 5L8UA 4N4GA 4QY4A 2H60A 2WP2A 4QB3A 5FFWA 2D82A 1PUOA 4ALHA 5COIA 5EVAA 4MR6A 3QZTA 5CQ6A 2GRCA 2I8NA 1WUGA 5FE9A 4YABA 3JVMA 5LKTA 4XYAA 4HBWA 5CUAA 4QZSA 5EPBA 4CUTA 3UVDA 5EA1A 4YBSA 5A5RA 5EPSA 5D3PA 4Z1QA 2NXBA 4QSQA 3DAIA 4N3WA 5F25A 1WUMA 4KV4A 5E9IA 5FH6A 5D7XA 5CU8A 4YBMA 4QC3A 4QSPA 5EM3A 5A83A 5FG6A 5J0DA 4LDFA 5D3JA 5A5QA 3MB4A 5FE5A 3P5OA 5DYCA 5C89A 3MUKA 2OUOA 3AQAA 4LYSA 5I88A 4XUAA 2D9EA 4UIYA 5II1A 3UW9A 5DLXA 4UYHA 5DX4A 3O35A 5ENBA 4CUUA 3U5PA 4E96A 3UVXA 5E9YA 4O75A 4OGIA 5CQ8A 5BT5A 4RVRA 5LJ2A 2EJNA 4N4FA 4QEWA 3U5MA 2KTBB 4PCEA 1X0JA 5EICA 2DVSA 4HXRA 5E3GA 3QZVA 5FE1A 5KO4A 5I89A 4Z93A 4OGJA 3U5LA 5DY7A 4HXLA 4CUSA 4O7BA 5I1QA 5C85A 5IGNA 4MEQA 3LJWA 5IG6A 3RCWA 4AKHA 4QSWA 3ONIA 5E0RA 5BT4A 5F62A 4A9JA 3UVWA 5LKXA 4YK0A 5FE6A 4N4HA 4A9HA 2N9GA 2DVQA 5HFQA 2L85A 3UV2A 3SVHA 3I3JA 5FFYA 3Q2FA 5D0CA 5CGPA 5H1UA 2RNWA 4QR5A 5H1VA 2RNYA 5I80A 5KU3A 4MENA 4QR3A 5CUBA 4YH3A 4A9MA 4J1PA 5CRMA 2I7KA 5ENEA 4OUFA 4ZW1A 5ENJA 3UV5A 4LZSA 5CRZA 4Q0NA 4Z1SA 3UV4A 5LJ0A 4FLPA 5L97A 2YEMA 5DW1A 5TCMA 4YY6A 4QEVA 5HQ6A 3JVJA 4YYNA 4XY9A 4QSTA 5F5ZA 4AKIA 4UYDA 4A9KA 5LVQA 4NR5A 2G4AA 5HRXA 4F3IA 5E7DA 4HXNA 5E9KA 5ACYA 4YADA 4XY8A 5D3SA 4NYXA 2YDWA 4CLBA 3FKMX 3HMFA 3IU5A 3U5NA 5IGLA 5IGMA 5HM0A 4TZ8A 5DBMA 5DLZA 4TU4A 2DATA 4MEPA 5JI8A 5ENCA 4TQNA 3UVYA 3MB3A 5EP7A 5H85A 5DFBA 2RI7A 5II2A 4WHWA 4NR7A 4X2IA 3G0LA 5HEMA 5FE4A 5CP5A 5A5OA 4A9IA 5HQ5A 5EPRA 4YYDA 4UYGA 5DYAA 4NS5A 5L98A 2R0SA 2FSAA 3G0JA 4YH4A 4J0RA 4NUDA 4NYVA 2F6JA 4N4IA 5EGUA 5EWDA 5F63A 5CUGA 4QC1A 5FDZA 4IOQA 5CUCA 5E9LA 5E9MA 3AADA 4NUEA 2F6NA 4ZQLA 4NRCA 1JM4B 1ZS5A 3Q2EA 4NR9A 4QSVA 3LQIA 4WIVA 3ZYUA 4YYIA 4UYFB 5HRVA 3VKGA 4A9LA 5FFVA 4UIXA 3MQMA 4TZ2A
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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